UD9: CAPTACIÓN, PROCESO Y ARCHIVO DE

IMÁGENES
TÉCNICAS GENERALES DE LABORATORIO
Técnicas fotográficas microscópicas
Microscopia digital
IMAGEN DIGITAL
Digitalización: Descomposición de la imagen en una matriz de puntos en la que
cada uno tiene un valor proporcional a su nivel de luminosidad
Píxel: Cada elemento de la imagen (0 y 1)
Mapa de bits: Área de memoria donde se almacenan los píxels
CRITERIOS DE CALIDAD DE LA IMAGEN DIGITAL
Dimensiones de la imagen
- Píxeles en sentido horizontal y vertical (pantalla ordenador)
- Unidades convencionales de medida (cm o pulgadas) (imprimir en papel)
Densidad de píxeles (ppp o ppi)
Relación de píxeles y unidades de medida
Cantidad de píxeles en un área determinada

A mayor resolución más píxeles por pulgada

Resolución de un dispositivo (cámara)
Resolución espacial o de una imagen
Resolución del dispositivo de salida (impresora
ordenador)
Profundidad de color
Cantidad de información (en bits, 0 y 1) asignada a cada píxel para representar el
color
Bitmap: 1bit por píxel (mostrará B/N)
Escala de grises: 8 bits por píxel
Color real: mínimo 24 bits por píxel (8 verde, 8 rojo, 8 azul)
 CRITERIOS CALIDAD VIDEO DIGITAL
Vídeo: Imágenes sobrepuestas a velocidad constante
FPS (frames per second): unidad de velocidad (fotogramas por segundo)

Creación imágenes digitales microscópicas

CAPTACIÓN DE IMÁGENES
Cámaras digitales
- Objetivo (lente y diafragma)
- Cuerpo de la cámara
Enfoque
Manual o automático

Exposición
Cantidad de luz que llega al sensor
durante la captura de la imagen
- Ajustar tiempo de exposición
(obturador)
- Ajustar cantidad de luz que
entra en la cámara (abertura
diafragma)
Sobreexpuesta Correctamente expuesta Subexpuesta
 PROCESADO DE IMÁGENES
Corrección

Señalización
Retoque
Herramientas para el tratamiento de imágenes

¿cuáles conocéis? Adobe Photoshop, PICASA, Paint, GIMP….

Herramientas básicas:
pincel, aerógrafo, clonación,
recorte…
Filtros para correcciones:
brillo y contraste, ajuste de curvas
de color, tono,
saturación, luminosidad,
balance y nivel de color…
Capas (layers)
Edición de vídeos
¿cuáles conocéis? Sony Vegas, Movie Maker….
ARCHIVO DE IMÁGENES DIGITALES
Compresión de fotografías digitales
- JPEG: Imágenes suficientemente reales y gran nº de colores. Pierde calidad al comprimirse
- TIFF: Mayor calidad pero menor compresión (más peso). Para impresión
- RAW: Compresión sin pérdida de información (muy pesados). Software adicional
- BMP: No compresión ni pérdida (gran calidad, pero gran tamaño)
- GIF: Gran compresión (archivos de pocos kilobytes)
- PNG: alternativa al GIF
- PSD: Photoshop

Formatos de vídeo
- AVI: estándar para almacenar
- MPEG: estándar para comprimir
- MOV: vídeo y audio de Apple
- WMV: Microsoft
- FLV: Adobe Flash (internet)
 Microscopia digital
- Preparación digital (WSI)
- Captura de la imagen
(creación de la preparación
digital)
- Archivo en servidores
- Recuperación
- Visualización
- Compartición
CREACIÓN DE LA PREPARACIÓN DIGITAL
Sistemas de microscopia digital
Microscopios robotizados Escáneres de preparaciones
Consideraciones sobre la creación de la preparación digital

- Velocidad de digitalización
(no superior a 2’ en portas 1,5x1,5cm)

- Portaobjetos y tamaño máximo de la muestra

(25x75mm y 1mm grosor)

- Calidad de enfoque

- Digitalización en distintos planos

(para elementos 3D)
Paradoja piramidal
ARCHIVO DE LAS PREPARACIONES DIGITALES
Conjunto de ficheros de la preparación
Un único fichero (estructura piramidal)

Como solventar compatibilidad de archivos entre dispositivos diferentes:

- Software gratuito (AperioImageScope, Leica…)
- Exportar preparación digital a formatos estándar (JPEG2000 o TIFF)

Almacenamiento de la preparación digital

WSI: 1GB aprox
Sistema de almacenamiento estandarizado de imágenes (PACS)
RECUPERACIÓN DE PREPARACIONES DIGITALES
Puedes:
- Ampliar o reducir imagen utilizando el zoom
- Desplazarte por el eje Z para cambiar plano de la imagen y enfocar
- Desplazarte lateral y verticalmente para acceder a distintos planos de la imagen
Telepatología
Utilización de servicios de laboratorio a distancia

MODALIDADES PATOLOGÍA DIGITAL

Telepatología estática
Telepatología dinámica (streaming)
Preparaciones digitales
http://www.telepatologia.es/mscope-education/dashboard/displayDashboard.action

ESTÁNDARES EN TELEPATOLOGÍA
Almacenamiento estandarizado de imágenes (PACS)
Gestión de imágenes estándar (DICOM)
Comunicación entre distintos sistemas de información (IHE, estándar HL7)