Variantes de hCoV-

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BLGO. ROBERTO PINEDA CH.

http://sarscov2haplofinder.urp.edu.pe/
 International Committee on
Taxonomy of Viruses ICTV
• En microbiología y virología, el término variante o "variante genética" se utiliza
para describir un subtipo de un microorganismo que es genéticamente distinto
de una cepa principal, pero no lo suficientemente diferente como para
denominarlo una cepa distinta.
• En 2012 se dijo que "no existe una definición universalmente aceptada para los
términos 'cepa', 'variante' y 'aislado' en la comunidad virológica, y la mayoría de
los virólogos simplemente copian el uso de términos de otros". La falta de una
definición precisa continuó a partir de 2020; en el contexto de la versión Variant
of Concern 202012/01 del virus SARS-CoV-2, el sitio web de los Centros para el
Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de EE. UU. declara: "Por el
momento, en el contexto de esta variante, el [los términos "variante", "cepa" y
linaje "] generalmente se usan indistintamente por la comunidad científica"
PANGO lineages
La asignación filogenética de linajes de brotes globales con
nombre (PANGOLIN) es una herramienta de software
desarrollada por miembros del laboratorio Rambaut, y la
aplicación web asociada es desarrollada por el Centro de
vigilancia de patógenos genómicos en South Cambridgeshire.

https://cov-lineages.org/lineage_description_list.html
http://sarscov2haplofinder.urp.edu.pe/
https://www.gisaid.org/
Variante Danesa (ΔFVI-spike)
Gene Aminoacids
S Gene Y453F24​
69-70deltaHV2
Variante Británica (B.1.1.7) 
Variante Manaos (P1)
Variante Sudafricana(B.1.351)
Variante Andina (C37)
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.612432/full
It has been suggested that the D614G
change in the S1 domain that results from
the A23403G mutation generates
a more infectious virus, less spike shedding,
greater incorporation in pseudovirions
(Zhang et al., 2020), and higher viral load
(Korber et al., 2020).
How these effects occur at the structural
level remains unclear, although some
hypotheses have been put forward:
(1) We think that there is no evidence for
hydrogen-bond between D614 and T859
mentioned by Korber et al. (2020), and
distances between D614 and T859 are too
long for a hydrogen bond (Supplementary
Figure S13B), (2) distances between Q613
and T859 (Supplementary Figure S13C)
could be reduced by increased flexibility
due to D614G substitution, forming a
stabilizing hydrogen bond, and (3) currently
available structures do not show salt-
bridges between D614 and R646 (Justo et
al. 2020).