El mundo microbiano

en la era genómica,
Bioética y niveles de
bioseguridad
EQUIPO 1

ALCÍVAR SALDAÑA LIZBETH 2133059393

CALDERÓN HERNÁNDEZ RAÚL 2142033174
GARCÍA ESTRADA ARIANA GRISEL 2132029480 SAMANTHA
MORENO JIMÉNEZ 2152028372
El mundo microbiano en la era
genómica
Antecedentes

 El primer genoma secuenciado fue el RNA de 3569 nucleótidos del virus MS2 en 1976
 El primer genoma de ADN en secuenciarse es el virus de ADN monocatenario X174 de 5386 nucleótidos
en 1977
 En julio de 1995, J. Craig Venter y Hamilton O. Smith, de la compañía Celera Genomics, y Claire M.
Fraser del The Institutfor Genomic Research (TIRG), publicaron la primera secuencia completa del
cromosoma de un microorganismo: Haemophilus influenzae cepa Rd
 El grupo de Fraser continuó con la secuencia del genoma de Mycoplasma genitalium, bacteria que tiene el
genoma más pequeño de las especies bacterianas conocidas.
 Posteriormente continuaron con el genoma de Methanococcus jannaschii, una extraordinaria
arquibacteria aislada de las costas de México a 2,600 metros de profundidad, a 200 atmósferas de presión,
que crece a 85°C, y es capaz de transformar el CO2 a metano y generar la energía para su metabolismo
 Ese mismo año la secuencia del genoma de S. cerevisiae, el primer eucarionte se completó
 Como una parte de las iniciativas para explorar la contribución de los microorganismos en el
secuestro global del carbono, el Instituto JGI (The Joint Genomic Institute) secuenció el
genoma de la bacteria Nitrosomonas europea.
 El segundo microorganismo que fue secuenciado por esta agencia fue Prochlorococ
cusmarinus y posteriormente el Rhodopseudomonas palustris
 Actualmente han sido publicadas 15 secuencias de arquibacterias, 59 de bacterias y sólo una
de eucariotes. En curso, no concluidas: 11 de arquibacterias, 261 de bacterias y 3 de
microorganismos eucariotes. Ejemplos de ellas son las secuencias de protozoarios como
Entamoeba hystolitica,Leishmania chagasi, Gardia lamblia, Plasmidium
falciparum,Plasmidium vivax, Toxoplasma gondii, de hongos como As-pergillus fumigatus,
Aspergillus nidulans, Candida albicans,Cryptococcus neoformans.
 La velocidad con que un genoma microbiano es secuenciado actualmente es muy grande,
gracias a dos metodologías que han acelerado notablemente el proceso: el empleo de
nucleótidos marcados con reactivos fluorescentes y las poderosas herramientas
computacionales utilizadas en la resolución de la secuencia.
 El tamaño de genomas bacteriano varia desde 0.5 a 13 megapares de bases y estos contienen
aproximadamente de 500 a 10000 genes que codifican proteínas.
 También se han secuenciado genomas de organismos superiores, como el genoma haploide
humano
 Los mayores genomas secuenciados hasta el momento, en cuanto a el numero total de genes,
son el populos trichocarpa, una especie de chopo de los bosques del oeste de Norteamérica, y
del protozoo trichomonas.
 SE han secuenciado también los de muchos patógenos, comparando las cepas de un mismo
patógeno que difieren de su virulencia
Genoma

 Genoma: es la totalidad de información genética de un organismo, incluido la variedad de genes que codifican
proteínas, RNA y secuencias reguladoras, así como todo el ADN no codificante que pueda estar presente. Nos
permite:
-saber como funciona un organismo
-historia evolutiva
-la secuencia completa de ADN y identificación de genes
-Estudia la expresión génica global
 Los avances en la genómica dependen en gran medida de las mejoras de tecnologías moleculares y el poder de la
informática los principales avances son:
-Automatización de la secuenciación del ADN,
-Miniaturización de las técnicas analíticas
-desarrollo de potentes métodos informáticos
 GENÓMICA.

 Genómica es la diciplina encargada de mapear, secuenciar, analizar y comparar genomas.

 El numero ira con aumento ya que con frecuencia aparecen nuevos avances.

 Hoy en día la limitación principal radica en el análisis y la visualización de la gran cantidad

de datos de secuencias de ácidos nucleicos
 Post genómica

 El transcriptoma: el repertorio delas moléculas de RNA mensajero que se expresan

 El proteoma: el análisis de las proteínas y su condición, ya sea normal o patológica.
 El gran reto para el futuro es definir las funciones de las proteínas del genoma y descifrar las
redes funcionales de regulación
 Los datos aportados actualmente indican que un microorganismo puede contener alrededor
de 1,000 a 5,000 genes, de los cuales 20-70% de ORFs son consideradas proteínas putativas
que son descritas como de función desconocida.
 El gran reto en el futuro es definir la función de las proteínas codificadas por el genoma,
incluyendo el gran número de nuevas proteínas de función desconocida, y descifrar las redes
funcionales de los genomas.
Los microorganismos
benéficos
 Probióticos

 Se estima que en el tracto gastrointestinal coexisten, en un delicado equilibrio, entre 500 y

1000 especies de microorganismos.
 Estos pueden conformar la microbiota local o ser microorganismos de tránsito
 Los microorganismos de los géneros Enterococcus, Lactobacillus y Clostridium son
colonizadores tempranos; con posterioridad se instalan Bacteroides, Bifidobacterium,
Streptococcus y distintos miembros de la familia Enterobacteriaceae, entre otros
 La microbiota aumenta la resistencia de un organismo ante la presencia de agentes
patógenos, ya que dificulta su acceso a la superficie intestinal. Además, cumple roles
importantes en la biodisponibilidad de nutrientes, el metabolismo de hidratos de carbono y
proteínas y en el desarrollo, maduración y mantenimiento de las funciones sensitivas y
motoras del tracto gastrointestinal, entre otros
 El interés científico por la microbiota intestinal ha impulsado investigaciones que demostraron la
existencia de microorganismos beneficiosos que podrían ser utilizados para influir en la actividad de
microorganismos que resultaran nocivos
 Los primeros estudios sobre este tipo de organismos fueron realizados en el año 1607 por el premio
Nobel Elie Metchnikoff, quien descubrió el efecto beneficioso de bacilos fermentadores presentes en
derivados lácteos (como Lactobacillus) y recomendó su ingestión
 Probióticos divididos a su vez en tres categorías:
-Probióticos presentes en alimentos o suplementos que no se utilizan con una finalidad específica
-Probióticos en alimentos o suplementos con un efecto específico sobre la salud del consumidor
-Probióticos como drogas o agentes bioterapéuticos
 Ejemplos

L.acidophilus LC1: Equilibra la flora intestinal y tiene efectos beneficiosos en el sistema inmunitario.
L.acidophilus NCFM: Contribuye a la reducción de actividades de las enzimas procancerígenas.
L.casei: Sirve de promotor del crecimiento y de la viabilidad de prebióticos.
S.boulardii: Contribuyen a la prevención de la diarrea y tratamiento de la colitis.
 Agricultura, alimentos, energía, medio
ambiente y industria.

 Agricultura: Bacterias que transforman el nitrógeno en amoniaco, lo que elimina la

necesidad de aplicar abonos nitrogenados e igualmente las bacterias que transforman los
compuestos tóxicos de azufre. También los microorganismos presentes en el rumen que
ayudan a digerir y fermentar la celulosa
 Alimentos: En el deterioro de los alimentos. La seguridad alimentaria requiere el constante
control para asegurar la ausencia de patógenos y la trazabilidad de los brotes de enfermedad.
En el procesos de fermentación (quesos, bebidas alcohólicas, encurtidos, panadería)
 Energía: producción de biocombustibles (gas natural, alcohol etílico, soja, metanol y etanol).
 Medio ambiente: Para el proceso de biorremediación
 Industria: antibióticos, enzimas y microorganismos modificados genéticamente
Bioética. Responsabilidad y
ética en el manejo y utilización
de microorganismos
 Bioética y desechos tóxicos

El constante progreso de la ciencia y la tecnología, en campos como la industria

farmacéutica, automotriz, entre otras, ha hecho que todo el material de desecho
deba eliminarse, ya sea por su desactivación, desintegración, o guardado en lugares
seguros para la seguridad del hombre.
Sin embargo, esto no se ha cumplido ya que se siguen desechando materiales
altamente contaminantes en ríos, mares y en la tierra sin una bioseguridad que
proteja a la ecología y la vida de las especies.
Los residuos biológicos-infecciosos son materiales que contienen microbios o gérmenes porque
han entrado en contacto o provienen del cuerpo de seres humanos o animales infectados o
enfermos; incluyen sangre, fluidos corporales, cadáveres y órganos extirpados en operaciones,
cultivos de microbios o virus usados con fines de investigación y objetos punzocortantes,
capaces de causar o contribuir significativamente a incrementar la mortalidad o enfermedades
crónicas y representar un peligro significativo.
• Se requiere aún de mayor congruencia entre las normas y la
ejecución de las mismas.

• No existe una normatividad ni número suficiente de

incineradores de alto costo y baja emisión de contaminantes
para eliminarlos.

• El desarrollo conduce a problemas por el manejo

inadecuado de los residuos peligrosos.
Este problema se agrava aún más, pues no existe una
legislación ni tampoco la ética en el manejo de los residuos
tóxicos, así como tampoco se tienen las medidas a adoptar
cuando existe una emergencia, tanto por autoridades como
por la sociedad.
Así mismo, se debe de actuar dentro de las normas éticas
en el manejo de los desechos tóxicos, ya que los derechos y
principios éticos de las personas se ven coartados.
Niveles de bioseguridad y
bioterrorismo