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Factoriales R
Factoriales R
FACTORIALES
ivans@lamolina.edu.pe - I.S.R
Objetivos
ivans@lamolina.edu.pe - I.S.R
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Factoriales DCA
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Ejemplo ..
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¿Factor,
tratamiento,U.E.
Variable
respuesta,
aleatorizacion,
por que dca?
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Factores: Norma de riego y clones
Tratamientos:C1N1,C1N2,C1N3,C2N1,C2N2,C2N3
U.E= RACIMO DE PLATANO
VR=PESO DEL RACIMO
ES DCA CON FACTORIAL!!!
CROQUIS EXPERIMENTAL:
C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1 C1N1
C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3 C1N3
C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1 C2N1
C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2 C1N2
C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2 C2N2
C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3 C2N3
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1. Realice el diagrama de cajas.
2. Realice la prueba de normalidad
3. Realice la prueba de homogeneidad de
variancias
4. Realice el ANVA
5. Realice la prueba Post ANVA
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Recuperando datos
data<-read.delim('clipboard')
View(data)
attach(data)
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DIAGRAMA DE CAJAS DE LA INTERACCION
boxplot(peso~clones*riego,xlab='Tratamiento',ylab='rendimiento',main
='diagrama de cajas de los tratamientos',col=c('yellow','pink','green'
,'orange','black','purple'))
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DIAGRAMA DE CAJAS DE LA INTERACCION
USANDO ggplot
ggplot(data,aes(x=factor(interaction(clones,riego),y=pe
so))+geom_boxplot(aes(fill=interaction(clones,riego)))
+theme_bw()+ggtitle("Diagrama de cajas de los
tratamientos")+xlab("Tratamientos")+ylab("peso")
(modificar)
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PRUEBA DE NORMALIDAD
facdca<-aov(peso~clones+riego+clones*riego)
shapiro.test(residuals(facdca))
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PRUEBA DE HOMOGENEIDAD DE VARIANCIAS
bartlett.test(peso~interaction(clones,riego))
install.packages("car")
leveneTest(peso~clones*riego)
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Otra forma de medir la normalidad
# instalar nortest
lillie.test(residuals(facdca))
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ANVA
summary(facdca)
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POST ANVA
TukeyHSD(facdca)
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POST ANVA con agricolae
# Con agricolae
HSD.test(y=facdca, trt=interaction(clones,riego), group=T,console=T)
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Graficos
interaction.plot(clones,riego,peso, main="grafico de
interaccion",xlab="clones",ylab="Promedio de peso",col=2)
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SI QUISIERA LOS EFECTOS PRINCIPALES??
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CON MINITAB …
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Boxplot of peso
42.5
40.0
37.5
35.0
peso
32.5
30.0
27.5
25.0
riego r1 r2 r3 r1 r2 r3
clones c1 c2
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Test for Equal Variances: peso vs clones; riego
clones riego
Bartlett’s Test
c1 r1 P-Value 0.000
r2
r3
c2 r1
Multiple Comparisons
0 1 2 3 4 5 6 7
c1 r1 P-Value 0.277
95% Bonferroni Confidence Intervals for StDevs Levene’s Test
r2 P-Value 0.393
r3
c2 r1
r2
r3
0 5 10 15 20 25 30
If intervals do not overlap, the corresponding stdevs are significantly different.
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Factoriales DBCA
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¿Factor,
tratamiento,U.E.
Variable
respuesta,
aleatorizacion,
por que bloque?
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Factores: Dosis de Biogras, Variedades de Caña.
Tratamientos :D1V1 (T1),D1V2(T3),D2V1(T2),D2V2(T4); (4
tratamientos).
U.E = una parcela de terreno.
Variable respuesta: Rendimiento
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1. Realice el diagrama de cajas.
2. Realice la prueba de normalidad
3. Realice la prueba de homogeneidad de
variancias
4. Realice el ANVA
5. Realice la prueba Post ANVA
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CARGANDO DATOS …
data<-read.delim('clipboard')
View(data)
attach(data)
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DIAGRAMA DE CAJAS
boxplot(rendt~varied*dosis,main='diagrama de cajas de variedades*dosis')
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PRUEBA DE NORMALIDAD
facdbca<-aov(rendt~bloq+varied+dosis+varied*dosis)
shapiro.test(residuals(facdbca))
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PRUEBA DE HOMOGENEIDAD DE
VARIANCIAS
bartlett.test(rendt~interaction(dosis,varied))
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ANVA
summary(facdbca)
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POST ANVA
TukeyHSD(facdbca)
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Graficos
interaction.plot(varied,dosis,rendt, main="grafico de
interaccion",xlab="tratamientos",ylab="Promedio de peso",col=2)
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CON MINITAB …
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Boxplot of rendt
76
75
74
73
72
rendt
71
70
69
68
67
dosis 1 2 1 2
varied 1 2
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Ho: El rendimiento se ajusta a la distribución normal
Ha: El rendimiento no se ajusta a la distribución normal
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Ho: Todos los tratamientos tienen variancias iguales(hay homogeneidad
de variancias)
Ha: No todos los tratamientos tienen variancias iguales (No hay
homogeneidad de variancias)
Bartlett’s Test
P-Value 0,620
1 1
2 1
0 2 4 6 8 10 12
95% Bonferroni Confidence Intervals for StDevs
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Coonclusion: Existe interacción entre las variedades de caña y las dosis
de Biobras en el rendimiento.
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De acuerdo a la prueba de comparación (Tukey), el mejor
rendimiento se da con la dosis 2 de Biobras en la Variedad 1 de la
Caña.
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Ejemplo:
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Realice
a. Diagrama de cajas de la interacción,
efectos principales
b. Prueba de normalidad y homogeneidad
de variancias
c. ANVA
d. Post ANVA (Comparaciones y gráficos)
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Lectura de datos
data<-read.delim('clipboard')
View(data)
data$bloque<-as.factor(data$bloque)
data$d<-as.factor(data$d)
data$n<-as.factor(data$n)
attach(data)
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Diagrama de cajas
par(mfrow=c(2,2))
boxplot(rdt~d*n,xlab='Tratamientos',ylab='rendimimiento',main='diagrama de cajas de los
tratamientos',col=c('yellow','pink','green','orange','black','purple'))
boxplot(rdt~d,xlab='Dosis',ylab='rendimimiento',main='diagrama de cajas de Dosis',col=c('yellow','pink','green'))
boxplot(rdt~n,xlab='Nitrogeno',ylab='rendimimiento',main='diagrama de cajas de Nitrogeno',col=c('purple','orange'))
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Prueba de normalidad y homogeneidad de
variancias
facdbca<-aov(rdt~bloque+d+n+n*d)
shapiro.test(residuals(facdbca))
bartlett.test(rdt~interaction(d,n))
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ANVA
summary(facdbca)
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POST ANVA
TukeyHSD(facdbca)
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Realice
a. Diagrama de cajas de la interacción,
efectos principales
b. Prueba de normalidad y homogeneidad
de variancias
c. ANVA
d. Post ANVA (Comparaciones y gráficos)
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LECTURA DE DATOS
data<-read.delim('clipboard')
View(data)
attach(data)
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DIAGRAMA DE CAJAS
par(mfrow=c(2,2))
boxplot(rdt~d*v,xlab='Tratamientos',ylab='rendimiento',main='diagrama de cajas de los
tratamientos',col=c('yellow','pink','green','orange'))
boxplot(rdt~d,xlab='Densidades',ylab='rendimiento',main='diagrama de cajas de
Densidades',col=c('yellow','pink'))
boxplot(rdt~v,xlab='Variedades',ylab='rendimiento',main='diagrama de cajas de
Variedades',col=c('purple','orange'))
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PRUEBA DE NORMALIDAD Y HOMOGENEIDAD DE
VARIANCIAS
facdca<-aov(rdt~d+v+v*d)
shapiro.test(residuals(facdca))
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ANVA
summary(facdca)
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POST ANVA
TukeyHSD(facdca)
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INTERACCION
interaction.plot(v,d,rdt, main="grafico de
interaccion",xlab="variedades",ylab="Promedio de peso",col=2)
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Si se desea hacer un factorial en DCL, con
dos factores y dos niveles por factor.
a. Croquis
b. Datos
c. Cajas
d. Normalidad
e. Homocedasticidad
f. ANVA
g. Post ANVA
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A:a1,a2
B:b1,b2
Tratamientos:a1b1,a1b2,a2b1,a2b2
C1 C2 C3 C4 C1 C2 C3 C4
F1 a1b1 a1b2 a2b1 a2b2 F1 2 2 2 4
F2 a1b2 a2b1 a2b2 a1b1 F2 1 1 2 3
F3 a2b1 a2b2 a1b1 a1b2 F3 3 4 3 1
f4 a2b2 a1b1 a1b2 a2b1 f4 1 4 5 2
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faccl<-read.delim('clipboard')
attach(faccl)
View(faccl)
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#Diagrama de cajas
boxplot(resp~a*b,xlab='Tratamiento', main='diagrama de cajas de los
tratamientos',col=c('yellow','pink','green','orange'))
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#modelo
faccl_m<-aov(resp~f+c+a+b+a*b)
summary(faccl_m)
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