Está en la página 1de 58

BIOESTADÍSTICA Y DISEÑO EXPERIMENTAL

UNIDAD IV
PROBABILIDAD
Dra. Inés Badano
Docente Investigador UNaM-CONICET
CONTENIDOS
■ Concepto de probabilidad condicionada.
■ Teorema de Bayes.
■ Aplicaciones en Salud.
– Validez de una prueba diagnóstica.
– Sensibilidad y Especificidad
– Valores Predictivos
■ Aplicaciones en Genética.
– Genética Forense
– Memoria, Verdad y Justicia.
PROBABILIDAD
CONDICIONAL
P(A|B)
La probabilidad de A dado que ha ocurrido B.
PROBABILIDAD CONDICIONAL
Probabilidad Condicional: Asume que ya sabemos algo, por
ejemplo: que ha ocurrido B.

Eventos Independientes: la probabilidad de que ocurra uno


de ellos (A) no depende de la ocurrencia o no del otro (B).

Eventos Dependientes: Se calcula restringiendo nuestro


universo a la situación cuando B ha ocurrido.
En un diagrama de Venn, se refiere a la probabilidad de que
ocurra A dado que B ya ha ocurrido.
SUCESOS INDEPENDIENTES
Dos sucesos A y B se dicen estadísticamente independientes cuando
la probabilidad de que ocurra uno de ellos (A) no depende de la
ocurrencia o no del otro (B).

En términos probabilísticos: P(A|B)= P(A)


P(B|A)= P(B)
Ejemplo: ¿Cual es la probabilidad de sacar un seis
y luego un cuatro?
P(A.B)= P(A) . P(B)
P(6,4)= 1/6 x 1/6 = 1/36
APLICACIÓN DE LAS REGLAS DE
PROBABILIDAD A LOS CRUCES DIHIBRIDOS
■ El cuadro de Punnett es una herramienta valiosa, pero no es la ideal para
todos los problemas de genética. Por ejemplo, para un cruzamiento
AaBbCcDdEe x AaBbCcDdEe se necesitaría un gráfico con 1024 cuadros.
■ Como ejemplo, imaginemos que cruzamos dos perros con
el genotipo BbCc.
■ Un método es dibujar un cuadro de Punnett de 16
cuadros.
■ Alternativamente, podemos utilizar una técnica más corta
en la que usamos dos cuadros de Punnett de cuatro cajas
y además usamos la regla del producto.

■ Probabilidades en genética (artículo) | Khan Academy


APLICACIÓN DE LAS REGLAS DE
PROBABILIDAD A LOS CRUCES DIHIBRIDOS
Dado un cruzamiento de dos heterocigotas para dos genes B y C
(BbCc x BbCc). Donde:
• el alelo dominante B especifica el
BC Bc bC bc
color negro del pelo y el b, color
BC BBCC BBCc BcCC BbCc
amarillo y,
• el alelo dominante C el pelo lacio y Bc BBCc BBcc BbCc Bbcc
el c pelo rizado. bC BbCC BbCc bbCC bbCc
Suponiendo que los dos genes se bc BbCc Bbcc bbCc bbcc
segregan independientemente y no
están ligados al sexo: ¿Cómo podemos predecir el número de
cachorros BbCc entre la descendencia?
En esta técnica,
descomponemos la
pregunta total en dos
preguntas más
pequeñas, cada una
referente a un evento
genético diferente y
aplicamos la regla
del producto.
SUCESOS ESTADISTICAMENTE
DEPENDIENTES
■ Cuando la probabilidad de que ocurra uno de ellos se ve afectada
por la ocurrencia del otro.
■ La probabilidad condicionada se puede definir como el cociente
entre los casos favorables y los casos posibles dentro de aquellos
que cumplen una condición.
B

■ Es la probabilidad de ocurrencia de un
fenómeno dentro de un subgrupo.
PROBABILIDAD CONDICIONAL
La probabilidad condicional se refiere a la probabilidad de que
ocurra un evento A, dado que otro evento B ya ha ocurrido.
Se denota como:

Donde:
•P(A) es la probabilidad de ocurrencia de A,
•P(B) es la probabilidad del evento B y es distinta de 0,
•P(A . B) es la probabilidad de la intersección entre A y B, es
decir, la probabilidad de que ambos eventos ocurran
(probabilidad conjunta).
TABLAS DE DOBLE ENTRADA
■ Una tabla de doble entrada permite resumir información entre dos
variables.
■ Se construye con las frecuencias correspondientes al combinar las
categorías de las variables de estudio.
Sea entonces el experimento: PRESENCIA DE TUMOR
E: “Extraer un animal al azar" .
a) ¿Cuál es la probabilidad de COLOR SI NO Total
que el animal elegido sea Alazán 220 80 300
de color zaino?.
b) ¿Cuál es la probabilidad de
Zaino 135 115 250
que el animal sea de color Tordillo 415 35 450
zaino dado que tiene tumor Total 770 230 1000
cutáneo?.
TABLAS DE DOBLE ENTRADA
■ Una tabla de doble entrada permite resumir información entre dos
variables.
■ Se construye con las frecuencias correspondientes al combinar las
categorías de las variables de estudio.
Sea entonces el experimento: PRESENCIA DE TUMOR
E: “Extraer un animal al azar" .
a) ¿Cuál es la probabilidad de COLOR SI NO Total
que el animal elegido sea Alazán 220 80 300
de color zaino?.
b) ¿Cuál es la probabilidad de
Zaino 135 115 250
que el animal sea de color Tordillo 415 35 450
zaino dado que tiene tumor Total 770 230 1000
cutáneo?.
a) En primer lugar se debe definir el suceso A = {animal de color zaino}
entonces P(A) = nA / n = 250/1000
Lo que indica que aproximadamente el 25% de los animales son de color zaino.

b) Interesa calcular la probabilidad condicional P(A|B) donde B = {animal que


presenta tumor}.
PRESENCIA DE TUMOR
La información adicional “presenta tumor
cutáneo" reduce el espacio muestral S al COLOR SI NO Total
subconjunto de animales con tumor Alazán 220 80 300
cutáneo (770), mientras que los casos
Zaino 135 115 250
favorables corresponden a los animales
que verificaron las dos condiciones "color Tordillo 415 35 450
zaino y presenta tumor ". Total 770 230 1000
PRUEBAS DIAGNÓSTICAS
PRUEBAS DIAGNÓSTICAS
■ Una prueba diagnóstica es una herramienta que nos permite
identificar sujetos enfermos de aquellos que no lo están.
■ En el campo de la salud, estamos interesados en la capacidad de
predecir correctamente la presencia o ausencia de una enfermedad.
– Conocimiento de los resultados de una prueba (positivos o
negativas)
– Estado de los síntomas (presentes – ausentes).
■ Las pruebas de detección no son infalibles.

Articula con Campo Profesional


PRUEBAS DIAGNÓSTICAS
■ El esquema más simple para analizar cualquier prueba
diagnóstica es el de una tabla en la que se cruzan los
posibles resultados (positivo o negativo) de la prueba
diagnóstica que se evalúa frente a la «verdad» valorada por
el criterio de referencia (es decir, si está presente o ausente).
TABLA DE DOBLE ENTRADA
Síntomas (D)

Resultado Test (T) Presente Ausente Total

POSITIVO a b a+b
NEGATIVO c d c+d
TOTAL a+c b+d n
SENSIBILIDAD Y ESPECIFICIDAD
■ La validez de una prueba de screening o de diagnóstico se evalúa a
través de su sensibilidad y su especificidad.
■ En términos matemáticos, la sensibilidad es la proporción de sujetos
con prueba positiva obtenidos de una muestra donde todos son
sujetos enfermos.

■ La especificidad de una prueba es la proporción de sujetos con


prueba negativa obtenidos de una muestra donde todos son sujetos
sanos.
SENSIBILIDAD
Es la probabilidad de un resultado positivo de
la prueba, dada la presencia de la enfermedad.

Síntomas (D)
Presente Ausente Total
Resultado Test (T)
P (T|D) = a
(a + c)
POSITIVO a b a+b
NEGATIVO c d c+d
TOTAL a+c b+d n
SENSIBILIDAD
Es la probabilidad de un resultado positivo de
la prueba, dada la presencia de la enfermedad.

Síntomas (D)
Presente Ausente Total
Resultado Test (T)
P (T|D) = a
(a + c)
POSITIVO a b a+b
NEGATIVO c d c+d
TOTAL a+c b+d n
ESPECIFICIDAD
Es la probabilidad de un resultado negativo de
la prueba, dada la ausencia de al enfermedad

Síntomas (D)
Presente Ausente Total
Resultado Test (T)
P (T|D) = d POSITIVO a b a+b
(b + d)
NEGATIVO c d c+d
TOTAL a+c b+d n
ESPECIFICIDAD
Es la probabilidad de un resultado negativo de
la prueba, dada la ausencia de al enfermedad
P (T|D) = d
(b + d) Síntomas (D)
Resultado Test (T)
Presente Ausente Total

La especificidad es
especialmente importante POSITIVO a b a+b
cuando la enfermedad cambia la
vida del enfermo o tiene cierto
estigma, o cuando las
NEGATIVO c d c+d
consecuencias de un tratamiento
suponen un riesgo para el
enfermo (amputación, etc.).
TOTAL a+c b+d n
FALSOS POSITIVOS (FP)
Y FALSOS NEGATIVOS (FN)
■ Un falso positivo o negativo
puede tener consecuencias
psiquicas y sociales sobre el
individuo.
FP = 1 - S Falso +

Falso -
■ Un falso negativo también
podría llevar a la transmision
de la enfermedad.
FN = 1 - E
GOLD STANDARD
■ En la práctica, una nueva prueba diagnóstica se compara siempre
con la prueba que hasta el momento se considera con mejor
sensibilidad y especificidad para la clasificación de sujetos como
sanos o enfermos.
■ Para valorar la validez de una prueba, la condición sine qua
non es que se compare la prueba con un criterio de referencia
o patrón de oro (gold standard) que se utiliza como criterio de
verdad.
TEST DIAGNÓSTICOS
■ En bastantes ocasiones se requieren pruebas que cumplan las dos
exigencias de tener sensibilidad y especificidad altas. A veces es necesario
complementar pruebas.
■ Una prueba de screening (o tamizaje) debe ser barata, fácil de implementar
y de administrar al paciente, conllevar un mínimo riesgo y su resultado
debe ser válido, confiable y repetible.
■ Las pruebas diagnósticas también deben poseer características de validez,
confiabilidad y repetibilidad, pero a diferencia de los estudios de tamizaje,
pueden no ser baratos y conferir ciertos riesgos.
■ En este caso se admiten estas últimas características porque estamos
frente a una situación de diagnóstico que decide el futuro del paciente.
TEST DIAGNÓSTICOS

■ La decisión de aceptar una nueva prueba como válida


depende de un balance entre su sensibilidad y su
especificidad.
■ Aún con test de gran sensibilidad o especificidad
(cercanas al 100%), la prevalencia de una enfermedad, la
variación de usuario a usuario, y el tipo de muestra
pueden afectar su eficacia.
ANMAT (Administración Nacional de
Medicamentos, Alimentos y Tecnología
Médica)
■ Normas para el registro de productos para diagnóstico de
uso "in vitro". Disposición 2674/99
■ REFERENCIAS DEL PRODUCTO
– 5 — Método de evaluación del producto empleado por
el establecimiento elaborador nacional o extranjero y
resultados que expresen, cuando corresponda, las
características específicas de desempeño, tales como:
a) Sensibilidad. b) Especificidad.
Articula con Campo Profesional
Articula con Bioética y Legislación
DEFINICIONES DE PROBABILIDAD
■ Veremos dos tendencias principales de concebir la probabilidad
■ La definición frecuentista
■ El enfoque Bayesiano
TEOREMA DE BAYES
El Teorema de Bayes es una extensión de la probabilidad
condicional.
Se utiliza para calcular la probabilidad de un evento,
teniendo información de antemano sobre ese suceso.

Veremos 2 ejemplos de sus aplicaciones:


• Pruebas Diagnósticas.
• Valores Predictivos Positivos
• Valores Predictivos Negativos
• Genética Forense.
TEOREMA DE BAYES
El Teorema de Bayes es una extensión de la probabilidad
condicional.
Se utiliza para calcular la probabilidad de un evento,
teniendo información de antemano sobre ese suceso.

Veremos 2 ejemplos de sus aplicaciones:


• Pruebas Diagnósticas.
• Valores Predictivos Positivos
• Valores Predictivos Negativos
• Genética Forense.
VALORES PREDICTIVOS POSITIVOS y NEGATIVOS
■ Además de tener en cuenta la validez de una prueba, hay que
evaluar la credibilidad de su resultado.
■ La credibilidad del resultado se valora a través de los que se
denomina valor predictivo positivo y valor predictivo negativo del
resultado de la prueba.
■ Aquí lo que es objeto de duda es el valor del resultado de la prueba
y no la prueba en sí misma, aunque ambas cosas estén
íntimamente relacionadas.
■ Como la prueba no es perfecta, clasifica algunos sujetos sanos
como positivos (falsos positivos). En casos donde la enfermedad
tenga baja prevalencia, el resultado positivo no será muy confiable.
VALORES PREDICTIVOS POSITIVOS y NEGATIVOS
■ La estimación del valor que predice la positividad o negatividad
de una prueba puede obtenerse a partir del conocimiento de la
sensibilidad y especificidad de la prueba y de la probabilidad de
la enfermedad relevante en la población general (prevalencia).

¨La prevalencia cuantifica


la proporción de individuos
enfermos en una población
y en un punto específico de
tiempo¨
EJERCICIO
■ La siguiente tabla muestra los resultados de la evaluación de la prueba de
detección en la que participaron una muestra aleatoria de 650 individuos con la
enfermedad y una segunda muestra aleatoria independiente de 1200 individuos
sin la enfermedad.
Resultado de la Prueba Presente Ausente Total

POSITIVO 490 70
NEGATIVO 160 1130
Total

a) Calcule la sensibilidad de la prueba


b) Calcule la especificidad de la prueba.
c) Si la tasa de la enfermedad en la población general es 0,002. ¿Cual es el
valor que predice la positividad de la prueba?.
EJERCICIO
■ La siguiente tabla muestra los resultados de la evaluación de la prueba de
detección en la que participaron una muestra aleatoria de 650 individuos con la
enfermedad y una segunda muestra aleatoria independiente de 1200 individuos
sin la enfermedad.
Resultado de la Prueba Presente Ausente Total

POSITIVO 490 70 560


NEGATIVO 160 1130 1290
Total 650 1200 1850

a) Calcule la sensibilidad de la prueba (490/650=0,75)


b) Calcule la especificidad de la prueba (1139/1200=0,94).
c) Si la tasa de la enfermedad en la población general es 0,002. ¿Cual es el
valor que predice la positividad de la prueba?.
EJERCICIO
a) Calcule la sensibilidad de la prueba (490/650=0,75)
b) Calcule la especificidad de la prueba (1139/1200=0,94).
c) Si la tasa de la enfermedad en la población general es 0,002.
¿Cual es el valor que predice la positividad de la prueba?.
d) Y si la tasa fuese del 0,34?
FP = 1 - S FN = 1 - E

VPP= 0,75 x 0,002 VPP= 0,75 x 0,34


0,75 x 0,002 + (1 – 0,94) x (1 – 0,002) 0,75 x 0,34 + (1 – 0,94) x (1 – 0,32)

VPP= 0,0015 VPP= 0,255


0,0015 + (0,06 x 0,998) 0,255 + (0,06 x 0,68) 0,2958

VPP=0,024 VPP= 0,86


EJERCICIO
a) Se esta interesado en exportar un Kit diagnóstico de Chagas desarrollado en
la Argentina.
b) Para ello se han establecido los siguientes valores de Sensibilidad y
Especificidad.

c) Calcule el Valor Predictivo Positivo para la prueba considerando las


prevalencias de Argentina.
d) Y para los Estados Unidos?.
e) Basado en sus resultados, cree que sería particularmente útil comercializar
este Test?
EEUU: 0,001
Argentina: 0,3
EJERCICIO
a) Sensibilidad de la prueba: 0,96
b) Especificidad de la prueba: 0,97
c) Prevalencia: 0,001.
d) Prevalencia: 0,3

VPP= 0,96 x 0,001 VPP= 0,96 x 0,3


0,96 x 0,001 + (1 – 0,97) x (1 – 0,001) 0,96 x 0,3 + (1 – 0,97) x (1 – 0,3)

VPP= 0,00096 VPP= 0,288


0,00096 + (0,03 x 0,999) 0,288 + (0,03 x 0,7)

VPP=0,03 VPP= 0,93


EJERCICIO
■ Un valor predictivo positivo
del 93% en una prueba
diagnóstica significa que si la
prueba da un resultado
positivo, hay un 93% de
probabilidad de que la
persona realmente tenga la
enfermedad.
■ En EEUU el VPP es de 3%, por
lo que exportar un test
diagnóstico de chagas no
parece ser una buena idea.
GENETICA FORENSE
■ La Genética Forense es la aplicación de técnicas utilizadas en la
Genética, para el análisis de evidencias e identificación de
individuos en base al ADN.
■ Entre sus aplicaciones se encuentra la obtención de un perfil
genético mediante el análisis del ácido desoxirribonucleico (ADN)
a partir de una muestra biológica, como saliva, semen, sangre,
pelo, y otros tejidos.
■ Permite identificar el material genético hallado en una evidencia
tomada en la escena del crimen o establecer vínculos biológicos
entre individuos en disputas filiatorias.
PREGUNTA CLAVE: CUAL ES LA FRECUENCIA
DEL PERFIL GENÉTICO EN LA POBLACIÓN?

37.4%
BASES DE DATOS GENÉTICOS
p2 + 2pq + q2
TEOREMA DE BAYES
■ En los casos criminales suele existir información no-genética adicional, como
testigos, antecedentes de violencia o agresiones, huellas dactilares, balística,
etc., lo cual debe integrarse al caso para que el juez genere su veredicto final.
■ Para ello se aplica el Teorema de Bayes que incorpora información a priori.
INDICE DE ABUELIDAD
Mary-Claire King
INDICE DE ABUELIDAD ¨index of grandpaternity¨
Abuelas aseguró que el único
método infalible para vincular a un
nieto o nieta con su familia de
origen es a través
del entrecruzamiento genético en
el Banco Nacional de Datos
Genéticos (BNDG).
RESUMEN
Probabilidad Condicional
Asume que ya sabemos algo, por ejemplo: que ha ocurrido B.
Se calcula restringiendo nuestro universo a la situación cuando B ha
ocurrido.
En un diagrama de Venn, se refiere a la probabilidad de que ocurra A
dado que B ya ha ocurrido.

El Teorema de Bayes es una extensión de la probabilidad condicional.


Se utiliza para calcular la probabilidad de un evento, teniendo
información de antemano sobre ese suceso (prior).
17 de Octubre
Primer Parcial
ICONOS
■ Sad icons created by Freepik
■ Love icons created by Freepik
■ Resfriado iconos creados por Eucalyp
■ Niña iconos creados por itim2101
■ Rico iconos creados por Freepik
■ Biología iconos creados por Freepik
■ Sospechar iconos creados por itim2101
■ Sospechar iconos creados por Freepik
■ Ciencia forense iconos creados por Eucalyp –
■ Población iconos creados por Freepik
■ Golden retriever iconos creados por Freepik

También podría gustarte