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ÍNDICE
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Cuestiones..............................................................................................................................24
PRÁCTICA 5: EXTRACCIÓN Y DETERMINACIÓN CUANTITATIVA DEL ÁCIDO
DESOXIRRIBONUCLEICO.............................................................................................................26
Introducción...........................................................................................................................26
Materiales y reactivos............................................................................................................26
Método..................................................................................................................................27
Gráfica recta patrón e interpolación de resultados................................................................28
Resultados..............................................................................................................................28
Cuestiones..............................................................................................................................29
PRÁCTICA 6: REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR).................................................30
Introducción...........................................................................................................................30
Materiales y reactivos............................................................................................................30
Método..................................................................................................................................31
Resultados..............................................................................................................................32
Conclusiones..........................................................................................................................33
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Introducción
Los aminoácidos son sustancias que poseen un grupo amino básico y un grupo acido
en su estructura, ambos unidos a un carbono específico llamado “carbono-α”. Por
esto, se dice que todos los aminoácidos poseen características ácido-base.
Cada aminoácido se diferencia de los otros en su grupo radical o “R”. Esta cadena,
unida también al carbono-α, puede ser muy variada y otorga una gran diversidad a los
aminoácidos, pero generalmente no interviene químicamente en ningún proceso
químico.
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Materiales y reactivos
Materiales:
pHmetro
Vaso de precipitados
Agitador magnético
Probeta
Bureta
Reactivos:
Método
Resultados y discusión
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
60
50
40
mL gastados
30
20
10
0
0 2 4 6 8 10 12
pH
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
50
40
30
mL gastados
20
10
0
0 2 4 6 8 10 12
pH
Conclusiones
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Cuestiones
a) Calcula los milimoles que están en forma de Gly+ y los que estarán en forma
de Glyzw (pKa de la Gly = 2.3) utilizando la fórmula de Henderson-Hasselbach.
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
[ Gly zwitterion ] = x x + y = 2
[ Gly+ ] = y y = 2- x
[ Gly+ ] + [ Gly zwitterion ] =2
[ Gly+ ]
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
e) Ahora calcula los milimoles que estarán en forma de Gly - y los que estarán en
forma de Glyzw a un pH de 12 (pKb de la Gly = 9.6).
[ Gly− ] = X X+Y=2
[ Gly zwitterion ] = Y Y=2-X
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
[ Gly− ] = X X+Y=2
[ Gly zwitterion ]=Y Y=2–X
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
[ Gly+ ]
[ Gly zwitterion ] = 1
[ Gly+ ] = 1
pH = pKa = 2.3
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Introducción
Si el medio posee una alta fuerza iónica, las proteínas precipitaran, pudiéndose extraer
mediante una previa centrifugación y extracción del sobrenadante. Para aumentar el
poder iónico, se usa sulfato amónico. Esto hará que las proteínas de la clara del huevo
precipiten según su solubilidad a diferentes concentraciones de sulfato amónico.
Materiales y reactivos
Materiales:
Tubos largos
Agitador Vortex
Centrifugadora
Pipetas y pipeteadores
Espectrofotómetro
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Reactivos:
Método
5) Se desechó el sobrenadante
8) Se realizó la recta patrón en 6 tubos numerados (del 0 al 5), usando para ello
las siguientes cantidades con un volumen total de 0,5 mL: 0, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4 y
0.5 mg de proteína
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
13) Con esto realizaremos los cálculos para obtener los mg de proteína en 100 g de
clara de huevo.
Resultados y discusión
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Recta de calibrado
Usando los datos aportados anteriormente se realiza una recta de calibrado, en la que
posteriormente se extrapolarán los datos de las muestras para obtener los resultados
1
f(x) = 2.01514285714286 x − 0.00928571428571395
0.9 R² = 0.922998560992497
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6
Y= 2,0151X – 0,0093
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Cálculos
Para calcular en 100 g de clara de huevo, usamos una proporción, dando 0,9391 mg
proteína/100 g muestra.
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Introducción
La amilasa salivar es una enzima que cataliza las reacciones de hidrólisis que se
producen en la ruptura de los enlaces del almidón, y transformando este en maltosa
para su posterior uso energético. La estructura proteica de esta enzima se ve alterada
por factores físico-químicos como el pH y la temperatura.
Materiales y reactivos
Materiales:
Parafilm
Embudo
Tubos de ensayo
Papel indicador universal
Baño maría
Baño de hielo
Pipetas y pipeteadores
Reactivos:
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Método
Tubo 0 1 2 3 4 5
HCl 0,4 % 0 2 0 0 0 0
(mL)
NaOH 0 0 2 0 0 0
0,1N (mL)
Agua (mL) 0 0 0 2 0 2
CaCO3 1% 0 0 0 0 2 0
(mL)
Almidón 0 2 2 2 2 2
1% (mL)
Saliva 2 2 2 2 2 0
diluida
(1:10)
(mL)
10. Se realizó la prueba del i2/KI, en la cual se añadió a 0,5 mL de cada tubo 2 gotas
de I2/KI y se observó la presencia o ausencia de almidón ( ver resultados)
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
15. Se prepararon 5 tubos limpios y numerados con 0,5 mL de HCl 0,4% y dos gotas
de I2/KI
21. Se compararon las velocidades de la reacción enzimática entre los tres casos
Resultados
Medición de pH con papel indicador universal
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
5 Verde Neutro
Prueba de Fehling
Conclusiones
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Cuestiones
1) Las enzimas se inactivan de muchas formas. Indica las cuatro formas en que has
inactivado la amilasa salival
2) Indica otras cuatro formas distintas que podrías haber empleado para inactivar
esa enzima.
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Introducción
En esta práctica, se busca extraer el ADN mediante el método indicado y con el mayor
rendimiento posible. Para ello, mantendremos nuestra muestra de hígado de pollo en
ácido perclórico a 90ºC en un baño maría durante 20 minutos.
Se usará el espectrofotómetro a 260 nm, usando para ello una recta patrón preparada
anteriormente con concentraciones de ADN conocidas, y se medirán las absorbancias,
con las cuales seremos capaces de cuantificar las muestras y conocer la concentración
de ADN obtenido en ellas.
Para que la calidad de nuestra muestra de ADN sea buena, el cociente entre las
absorbancias a 260 y 280 nm debería ser mayor que 1.8.
Materiales y reactivos
Materiales:
Baño de hielo
Baño maría
Espectrofotómetro en región UV
Pipetas y pipeteadores
Mortero
Tubo de ensayo
Reactivos:
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Método
6) Se eliminó el sobrenadante
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
1.8
1.6
f(x) = 0.0031392 x + 0.0170000000000001
1.4 R² = 0.990677790968706
1.2
Absorbancias
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
0 100 200 300 400 500 600
Concentración ADN (µg)
Resultados
Tubo Absorbancia
0 0
1 0,405
2 0,884
3 1,111
4 1,609
Muestra 1 (1:10) 0,976
Muestra 2 (1:20) 0,455
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Tras interpolar el valor de las absorbancias de las muestras en nuestra recta patrón las
concentraciones quedan:
Cuestiones
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Introducción
En esta práctica realizamos una PCR (Polymerase Chain Reaction), la cual consiste en
una amplificación selectiva de una secuencia predeterminada de ADN, usando para
ello una enzima selectiva llamada ADN polimerasa.
Para realizar la PCR, añadiremos a la muestra de ADN: dNTP´s, 2 primers A1 y A2, Taq
polimerasa y el resto de agua ultrapura.
Se realiza una pre-desnaturalización del DNA a amplificar antes del primer ciclo y la
duración de la etapa de extensión del oligonucleótido del último ciclo se prolonga. Es
muy importante la elección adecuada de los oligonucleótidos para la especificidad de
la amplificación. Su longitud, generalmente próxima a 20 nucleótidos, permitirá una
hibridación rápida con una secuencia única.
Materiales y reactivos
Materiales:
Termociclador
Tubos eppendorf
Agitador Vortex
Baño maría y cubeta de hielo
Centrifugadora
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Reactivos:
dNTP´s
Oligonucleótidos A1 y A2
Taq polimerasa
Muestra de ADN extraída
Agua ultrapura
Método
9) En este tubo, se añadió los µL de cada elemento que formara parte de las
muestras y de los controles positivo y negativo. Para ello lo desarrollamos de la
siguiente forma:
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Resultados
Esta imagen nos muestra cuatro casos diferentes encontrados en esta práctica:
Caso 2) En este segundo caso, observamos que aparece lo mismo que en el caso 1 pero
aparece una banda en el control negativo. Esto nos hace ver que esta analítica no es
válida, ya que el control negativo no debería haber aparecido replicación del gen.
Puede haber estado provocado por una contaminación del control negativo o un error
técnico y/o humano.
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Prácticas de Laboratorio [ Miguel Galán Rubio 1º Enología]
Caso 3) En el tercer caso, vemos que ambas muestras aparecen con el gen replicado y
con su respectiva banda, pero no aparece banda en el control positivo. Esto hace que
este análisis no sea válido, ya que el control positivo es una muestra de la cual
tenemos conocimiento que se va a producir replicación del gen y por tanto una banda.
Esto puede haber sido provocado por varios factores siendo el más probable el error
humano al confundir las muestras de control positivo con la segunda muestra que
debería dar negativo.
Caso 4) En este último caso, se observa que únicamente ha aparecido una banda en el
control positivo, y puede llevar a error ya que la muestra 1 debería ser positiva.
Aunque los controles hayan funcionado, el gen de la muestra 1 no se ha replicado, y
puede ser debido a una mala configuración de las rampas de temperatura del
termociclador.
Hay que remarcar que la secuencia de bandas que aparece entre el caso 1 y 2 y entre
el caso 3 y 4 es un marcador de pesos moleculares, marcado en la imagen como MM.
Conclusiones
Se observó que la PCR es una técnica altamente fiable para detección de genes
específicos y su diversidad de utilidades.
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