Interrogación 1 Bio238m 2021

17/5/2021 Interrogación 1 Bio238m 2021: Biologia Molecular de la Celul
Interrogación 1 Bio238m 2021

Fecha de entrega 14 de abr en 12:10 Puntos 70 Preguntas 12
Disponible 14 de abr en 10:10 - 14 de abr en 12:10 casi 2 horas
Límite de tiempo 120 minutos
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Intento Hora Puntaje
MÁS RECIENTE Intento 1 120 minutos 62 de 70
Puntaje para este examen: 62 de 70

Entregado el 14 de abr en 12:10
Este intento tuvo una duración de 120 minutos.
Pregunta 1 10 / 10 pts
Observe la estructura de la proteína A en un ambiente acuoso y conteste

las siguientes preguntas:
a) ¿Qué nivel estructural tiene la proteína A?
b) ¿Posee estructura/s secundarias? Si es así, ¿cuál/es? Sea específico,

indique el color de la estructura, el número y/o tipo de estructura/s y sub-
estructuras.
c) Qué indican los números 1 y 2. Sea específico para cada uno. Indique
qué elemento/s le permitió llegar a la respuesta.
d) ¿Qué características crees que tienen los amino ácidos ubicados en

las regiones de la proteína marcada con el número 3? ¿Y los
aminoácidos ubicados en las zonas marcadas con el número 4? En
ambos casos justifica tu respuesta
https://cursos.canvas.uc.cl/courses/25554/quizzes/61120 1/17
Su respuesta:
a) es una estructura terciaria
b) si tiene estructuras secundarias: las estructuras rosada es alfa hélice,

las estructuras amarilla es beta plegada
c) el numero 1 es el extremo carboxilo terminal y el 2 es el amíno, eso me

lo indica la direccion de las hebras betas en amarillo van de manera que
la base de la flecha esta en el extremo amino y la punta de la flecha en el
carboxilo.
d) los aminoácidos en la zona marcada con tres son hidrofóbicos y los

marcados con cuatro son hidrofílicos ya que en un ambiente acuoso los
aminoácidos hidrofóbicos van a tener una tendencia a ir hacia el centro
de la estructura y los hidrofílicos a los bordes de afuera de la proteína
a) 1/1 b) 2/2 c) 3/3 d) 4/4
Los siguientes 3 pares de aminoácidos no adyacentes forman

interacciones que estabilizan la estructura de una proteína. Utilizando la
tabla de estructuras de aminoácidos, indique el tipo de interacción (iónica,
hidrofóbica, puente disulfuro, puente de hidrógeno) entre los aminoácidos
de cada par, y si es covalente o no-covalente. Luego conteste la
pregunta d. (5 puntos)
a) cisteína-cisteína (1 punto)
b) isoleucina-valina (1 punto)
c) ácido glutámico-lisina (1 punto)
d) Si como resultado de una mutación, el aminoácido isoleucina cambia a

arginina, ¿habría consecuencias en la estructura y función de la proteína?
Justifique su respuesta. (2 puntos)
Su respuesta:
a) cisteina y cisteina es un enlace puente de disulfuro covalente
b) la isoleucina con la valina es una interaccion hidrofóbica no covalente
c) acido glutamico con lisina forma una atraccion electroestatica, ionica

no covalente
d) si habria consecuencias ya que estaría cambiando un aminoacido no

polar que es hidrofobico por uno polar con carga positiva que es
hidrofilico, por lo tanto cambia la estructura y funcion de la proteina
a. Bien b. Bien c. Bien d. Bien
Usted ha purificado DNA de 3 microorganismos diferentes y quiere saber

si hay diferencias en el porcentaje de bases nitrogenadas entre ellos.
Para determinarlo , usted realiza experimentos de desnaturación de DNA.
En estos experimentos usted expone el DNA de cada organismo a
temperaturas crecientes y mide la fracción de DNA monocatenario (de
hebra simple) que se va formando a medida que aumenta la temperatura.
Los resultados obtenidos se muestran en el gráfico y a partir de él se
puede comparar la temperatura a la cual el 50% del DNA se ha
desnaturado en cada muestra.
a) ¿Cuál de los organismos contiene DNA con mayor porcentaje de AT?
b) Justifique su respuesta.
Su respuesta:
a) el organismo A
b) es el organismo A por que el enlace AT tiene solo dos puentes de

hidrogeno, por lo tanto para romper estos enlaces se necesita menos
energia de lo que se requeriria para otros enlaces, al requerir menos
energia va a necesitar menos temperatura, por lo tanto el organismo A es
el que tiene mayor concentracion de AT
Indique si cada una de las siguientes situaciones interfiere en el proceso

de replicación en una horquilla. Indique si: interfiere en la síntesis de la
hebra líder, en la síntesis de la hebra retrasada, en ambas o en ninguna.
(4 puntos)
a) Presencia de didesoxi-timidina
b) Ausencia de ligasa
c) Maquinaria del spliceosoma defectuosa
d) Primasa defectuosa
Su respuesta:
a) interfiere en ambas sintesis ya que no tiene un OH en el carbono 3´ por

lo tanto no se va a poder algun nucleotido nuevo por lo que el proceso no
podría seguir
b) la ausencia de ligasa afectaria a la hebra retrasada, ya que no se

podrian unir los fragmentos de DNA cuando se retire el primer
c) la maquinaria del spliceosoma no afecta a la replicacion ya que esta

maquinaria no participa en este proceso
d) la primasa defectuosa afecta a ambas cadenas ya que sin la primasa

no se podria sintetizar el partidor de RNA y no se podria dar inicio al
proceso de replicacion
bien !!! :)
Considere la siguiente burbuja de replicación en un cromosoma. (5

puntos)
En la región 1:
a) ¿En qué dirección ocurre la replicación? Hacia la izquierda o hacia la

derecha? (1 punto)
b) ¿qué hebra es el molde para la síntesis de la hebra adelantada o líder,

la de arriba o la de abajo? Justifique su respuesta. (2 puntos)
c) Si asumimos que un fragmento de la hebra retrasada es sintetizado a

partir de la región 1, ¿cuál sería la secuencia de este fragmento? Indique
los extremos. ( 2 puntos)
Su respuesta:
a) es bidireccional por lo tanto la replicacion va hacia ambos lados, la

hebra superior va a ser de derecha a izquierda y la de abajo de izquierda
a derecha
b) la hebra molde es la adelantada o lider que es la de arriba ya que

necesito una hebra que vaya de 3á 5´para poder sintetizar en sentido 5á
3ý esa es la de arriba
c) 5´-ATCGCCGAGT- 3´
a)0/1p. Izquierda b)2/2p. c)2/2p.
El siguiente esquema muestra la localización del 4 genes en un

cromosoma eucarionte (Gen 1, Gen 2, Gen 3 y Gen 4), incluyendo los
promotores correspondiente a cada uno (p1, p2, p3 y p4). Todos los
genes codifican para mRNAs.
Conteste las siguientes preguntas solamente para Gen 2 y Gen 4.
a) ¿La dirección de la transcripción para ambos genes es la misma?

Explique su opción.
b) Para cada uno de los genes indique si la transcripción es de izquierda

a derecha o de derecha a izquierda. Explique.
c) Para cada gen indique la hebra de DNA que se usa como molde para
la síntesis de los RNAs (hebra de arriba o hebra de abajo). Explique.
d) Indique si los RNAs sintetizados por el Gen 2 y el Gen 4 son

modificados post-transcripcionalmente.
Su respuesta:
a) es la misma direccion ya que para ambos genes el respectivo promotor

esta a la izquierda del gen.
b) ambos genes transcriben de izquierda a derecha ya que el primer esta

a la izquierda y para que se sintetize en direccion 5á 3´ debe utilizar la
hebra de abajo que va de izquierda a derecha
c) en ambos genes se ocupa la hebra de abajo ya que el primer esta a la

izquierda del gen y para ir en sentido 5á 3´se ocupa la hebra de abajo
d) si porque ambos genes son eucariontes los cuales requieres

modificaciones post trascripcionales (para sacar intrones, etc.)
a) Bien, 2 puntos b) Bien, 2 puntos c) Bien, 2 puntos d) Bien, 2

puntos Muy bien sus respuestas y razonamientos (:
Pregunta 7 5.5 / 6 pts
La figura muestra la estructura del gen Mouse de ratón, con sus

secuencias reguladoras. El tamaño de los exones se muestra en pares de
bases (pb). Usted está estudiando la regulación de la expresión del gen
Mouse, para lo cual mide el nivel de expresión (cantidad) y el tamaño del
mRNA maduro que se produce en las células de varios tejidos de ratón.
En el caso de la cantidad de mRNA presente usted ha hecho controles
para asegurarse que ésta depende solamente de la síntesis de mRNA sin
interferencia de la degradación del mismo. Para este ejercicio no tenga

en cuenta la cola poliA. pb: pares de bases.
a) ¿Qué elemento/s reguladores estaría/n influyendo en los niveles de

expresión del gen Mouse en el hígado? Explique muy brevemente
b) ¿Cómo podría explicar el tamaño del mRNA maduro del gen Mouse en
el intestino?
Su respuesta:
a) el elemento regulador que influye en el higado seria el enhancer ya

que el nivel de expresion del higado es muy alta
b) se podria explicar el tamaño ya que se regula la expresion genica en

este caso por el spicing alternativo donde se eliminan o se dejan intrones
y exones por lo que esto explicaria el tamaño del mRNA maduro del
intestino
a. Bien b. Splicing alternativo del exón 3 y 4.
Se encuentra una mutación en un gen que codifica para un tRNA. El alelo

silvestre (normal) de este gen produce un tRNA que reconoce el codón
GAC y por lo tanto se une al aminoácido aspartato (Asp). El tRNA
mutante también se une al aspartato, pero el anticodón está mutado, de
forma que ahora reconoce el codón GUC.
a) ¿Qué efecto tendrá esta mutación en la traducción?
b) ¿Qué diferencia habrá en las proteínas que se produzcan?
c) ¿Es probable que se vean seriamente afectadas las funciones de las

proteínas?
Use la tabla del código genético y la tabla de estructura y clasificación de

aminoácidos.
Su respuesta:
a) la mutacion del anticodon va a provocar que cuando llegue un codon

GUC que deberia codificar para valina, lo va a reconocer como GAC y va
a sintetizar aspartato asi que si afecta a la traduccion
b) en la proteina va a haber mas aspartato y menos valina
c) se afecta ya que el aspartato y la valina tienen diferentes propiedades

al ser el aspartato polar y la valina apolar, asi que se genera una proteina
hidrofilica
a. Ojo, no es que se reconozca un GUC como GAC, ahora el tRNA

leerá GUC y tendrá adherido un Asp. Tampoco se "sintetiza" Asp
en esta parte, se incorpora a la cadena polipeptidica. b.
Dependerá de la cantidad de codones GUC que hayan, pero el
cambio será principalmente estructural por la identidad de los aa.
c. Puede o no afectar la función, dependerá de cuántos aa sean
intercambiados y dónde.
La figura muestra parte del gen A, el cual se expresa en células

epidermales de ratón. Parte del promotor está enmarcado. La
transcripción comienza e incluye el par de bases A/T que se muestra en
negrita y subrayado
a) ¿Qué hebra de DNA se utiliza como molde durante la transcripción?

Explique.
b) Escriba los primeros 15 nucleótidos de la secuencia de mRNA. No

olvide incluir los extremos 5’ y 3’.
c) Escriba los primeros 5 aminoácidos de la proteína codificada por el gen

A. Incluya extremos amino y carboxilo.
d) ¿Cuál será la consecuencia en la secuencia proteíca de una mutación

que cambia el par C/G, marcado con la flecha roja A, por el par T/A? ¿Por
qué?
e) ¿Cuál será la consecuencia en la secuencia proteica de una mutación

que elimina el par G/C marcado con la flecha roja B? ¿Por qué?
f) ¿Cuál podría ser la consecuencia de una mutación que elimina el par

A/T marcado con la flecha roja C? ¿Por qué?
Su respuesta:
a) se utiliza la hebra de abajo ya que el promotor esta a la izquierda por lo

que debe ocupar la hebra que va de 3á 5´(la de abajo) para poder
sintetizar en sentido 5á 3´
b) 5´-AGGGCUGCCGAAUGU-3´
C) 5´-AGGGCUGCCGAAUG-UGC-UGC-CAU-ACG
(NH3+) MET-CYS-CYS-HIS-THR (COOH-)
d) no cambia el aminoacido ya que es el tercer nucleotido que cambia de

UGC a UGU y ambas son cysteina por lo que seria una mutacion silente
e) no cambiaria el marco de lectura porque este nucleotido esta antes de

que empiece la traduccion, la cadena seria un nucleotido mas corta
f) podría ser que el promotor no reconosca el sitio de union y si no se

reconoce no se va a generar la transcripcion
a) Bien, 2 puntos b) Bien, 2 puntos c) Bien, 2 puntos d) Bien, 2

puntos e) Bien, 2 puntos f) Bien, 2 puntos Bien!
Pregunta 10 2.5 / 4 pts
La figura adjunta muestra un esquema de diversos mecanismos que

permiten la regulación del gen X y otras proteínas asociadas. Considere
que la proteína Z está activa cuando se fosforila y la proteína Y está
activa desfosforilada. Al respecto responda:
Datos: Los círculos corresponden a proteínas. El círculo amarillo con P

significa fosforilación.
a) ¿Qué efectos tiene sobre X la sobreactivación de la proteína H?
b) ¿Qué nivel de regulación representa la proteína Z?
c) ¿Qué esperaría encontrar en una célula que no posea el gen U?
Su respuesta:
a) si esta sobreactivada va a haber una mayor degradacion de mRNA asi

que hay menos proteina X
b) z degrada el mRNA x
c) no se activaria la proteina x
a)1.75/2p. b)0.25/1p. post transcripcional c)0.5/1p. aumenta X
Usted debe clonar un fragmento de DNA (que contiene el gen que está
estudiando) en un plasmidio (vector). El plasmidio fue cortado con la
enzima de restricción EcoRV, pero el fragmento ha sido generado por
corte con la enzima PstI. Los extremos del plasmidio son romos (sin
punta), mientras que los extremos del fragmento son cohesivos. La figura
muestra los sitios de reconocimiento de ambas enzimas y la forma de
corte.
Indique 1 estrategia para unir ambos fragmentos de DNA. Recuerde que

requiere 2 pasos.
Su respuesta:
cortar los extremos cohesivos para que queden romos luego con ligasa y
atp unir ambos fragmentos
Cómo se modifican los extremos cohesivos? En este caso la única

alternativa es usar una exonucleasa 3' - 5' para eliminar los
nucleótidos que sobran. 1/4
¿Qué tipo de microscopía es la que se aprecia en la siguiente imagen?
Su respuesta:
confocal
Puntaje del examen: 62 de 70

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17/5/2021 Interrogación 1 Bio238m 2021: Biologia Molecular de la Celul

Este examen fue bloqueado en 14 de abr en 12:10.

Puntaje para este examen: 62 de 70

Observe la estructura de la proteína A en un ambiente acuoso y conteste

a) ¿Qué nivel estructural tiene la proteína A?

b) ¿Posee estructura/s secundarias? Si es así, ¿cuál/es? Sea específico,

d) ¿Qué características crees que tienen los amino ácidos ubicados en

a) es una estructura terciaria

b) si tiene estructuras secundarias: las estructuras rosada es alfa hélice,

c) el numero 1 es el extremo carboxilo terminal y el 2 es el amíno, eso me

d) los aminoácidos en la zona marcada con tres son hidrofóbicos y los

a) 1/1 b) 2/2 c) 3/3 d) 4/4

Los siguientes 3 pares de aminoácidos no adyacentes forman

c) ácido glutámico-lisina (1 punto)

d) Si como resultado de una mutación, el aminoácido isoleucina cambia a

a) cisteina y cisteina es un enlace puente de disulfuro covalente

b) la isoleucina con la valina es una interaccion hidrofóbica no covalente

c) acido glutamico con lisina forma una atraccion electroestatica, ionica

d) si habria consecuencias ya que estaría cambiando un aminoacido no

a. Bien b. Bien c. Bien d. Bien

Usted ha purificado DNA de 3 microorganismos diferentes y quiere saber

a) ¿Cuál de los organismos contiene DNA con mayor porcentaje de AT?

b) es el organismo A por que el enlace AT tiene solo dos puentes de

Indique si cada una de las siguientes situaciones interfiere en el proceso

c) Maquinaria del spliceosoma defectuosa

a) interfiere en ambas sintesis ya que no tiene un OH en el carbono 3´ por

b) la ausencia de ligasa afectaria a la hebra retrasada, ya que no se

c) la maquinaria del spliceosoma no afecta a la replicacion ya que esta

d) la primasa defectuosa afecta a ambas cadenas ya que sin la primasa

Considere la siguiente burbuja de replicación en un cromosoma. (5

a) ¿En qué dirección ocurre la replicación? Hacia la izquierda o hacia la

b) ¿qué hebra es el molde para la síntesis de la hebra adelantada o líder,

c) Si asumimos que un fragmento de la hebra retrasada es sintetizado a

a) es bidireccional por lo tanto la replicacion va hacia ambos lados, la

b) la hebra molde es la adelantada o lider que es la de arriba ya que

a)0/1p. Izquierda b)2/2p. c)2/2p.

El siguiente esquema muestra la localización del 4 genes en un

Conteste las siguientes preguntas solamente para Gen 2 y Gen 4.

a) ¿La dirección de la transcripción para ambos genes es la misma?

b) Para cada uno de los genes indique si la transcripción es de izquierda

d) Indique si los RNAs sintetizados por el Gen 2 y el Gen 4 son

a) es la misma direccion ya que para ambos genes el respectivo promotor

b) ambos genes transcriben de izquierda a derecha ya que el primer esta

c) en ambos genes se ocupa la hebra de abajo ya que el primer esta a la

d) si porque ambos genes son eucariontes los cuales requieres

a) Bien, 2 puntos b) Bien, 2 puntos c) Bien, 2 puntos d) Bien, 2

Pregunta 7 5.5 / 6 pts

La figura muestra la estructura del gen Mouse de ratón, con sus

interferencia de la degradación del mismo. Para este ejercicio no tenga

a) ¿Qué elemento/s reguladores estaría/n influyendo en los niveles de

a) el elemento regulador que influye en el higado seria el enhancer ya

b) se podria explicar el tamaño ya que se regula la expresion genica en

a. Bien b. Splicing alternativo del exón 3 y 4.

Se encuentra una mutación en un gen que codifica para un tRNA. El alelo

a) ¿Qué efecto tendrá esta mutación en la traducción?

b) ¿Qué diferencia habrá en las proteínas que se produzcan?

c) ¿Es probable que se vean seriamente afectadas las funciones de las

Use la tabla del código genético y la tabla de estructura y clasificación de

a) la mutacion del anticodon va a provocar que cuando llegue un codon

a sintetizar aspartato asi que si afecta a la traduccion

b) en la proteina va a haber mas aspartato y menos valina