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Pueden ser de origen mineral, vegetal, animal o mixto. Se forman a partir de procesos
naturales en los que la mano del hombre no interviene o interviene muy poco. Un ejemplo de
esto son los abonos a partir de estiércol de varios animales, yeso agrícola, residuos de cosecha,
la lombricomposta o composta. La mayoría son de acción lenta, pues proporcionan nitrógeno
orgánico que debe ser transformado en inorgánico por las bacterias del suelo, antes de ser
absorbido por las raíces, la rapidez de acción dependerá del terreno y condiciones adecuadas de
temperatura y humedad.
El cultivo combinado con leguminosas, que aportan nitrógeno por una simbiosis con bacterias rizobios, o la
azolla (planta acuática que fija nitrógeno) y el arroz
La inoculación con micorrizas u otros microbios (Rhizobium, Azotobacter, Azospirillium, etcétera), que
colaboran con la planta ayudando a conseguir nutrientes del suelo. Normalmente no es necesaria la
inoculación porque aparecen espontáneamente.
Dejar materia vegetal muerta, que sirve de mantillo que protege el suelo del sol y ayuda a mantener la
humedad. Al final se descompone.