ASIGNATURA: BASES MOLECULARES Y CELULARES DE LA MEDICINA III

CICLO: III
SEMESTRE ACADÉMICO: 2023- I
 UNIVERSIDAD PRIVADA SAN JUAN BAUTISTA
FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA
“Dr. Wilfredo Erwin Gardini Tuesta”

ACREDITADA POR SINEACE

RE ACREDITADA INTERNACIONALMENTE POR RIEV

AMINOÁCIDOS
DOCENTE RESPONSABLES DE LA ASIGNATURA

SEDE SAN BORJA : Mg. Roma Mallela Noriega Corrales

 Aminoácidos (AA)
• Molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) en un extremo y un
grupo carboxilo (-COOH) en el otro extremo
• 20 son los aminoácidos comúnmente encontrados en las proteínas.
• El 1er AA descubierto fue la asparagina en 1806 y el último fue la
treonina, en 1938.
• Todos los AA tienen nombres comunes o triviales
• La asparagina se encontró en el espárrago y el glutamato se
encontró en el gluten de trigo; la tirosina se aisló por primera vez del
queso (griego tyros = queso); y la glicina (griego glykos = dulce)
 AA CARACTERÍSTICAS ESTRUCTURALES COMUNES
• Los 20 AA estándar encontrados en proteínas son alfa-aminoácidos.
• Todos tienen un grupo carboxilo y un grupo amino unidos al mismo C

• Difieren por sus grupos R que son cadenas laterales y varían en

estructura, tamaño y carga eléctrica y esto influye en su solubilidad en
agua.

• Algunos AA son residuos que son modificados después de la

síntesis de la proteína;
• otros se hallan en organismos vivos pero no formas proteínas.
 ESTRUCTURA GENERAL DE UN AA.
• con una única excepción. (La excepción es la prolina, un AA cíclico.)
• A los AA estándar se les han asignado abreviaturas de tres
letras y símbolos de una sola letra
• para indicar de manera abreviada la composición y secuencia
de aminoácidos polimerizados en las proteínas
• abreviaturas las 3 primeras letras del nombre del AA
• código de 1 letra para la descripción de las secuencias de AA.
 EL ÁTOMO DE CARBONO ES UN CENTRO QUIRAL
• Debido al ordenamiento tetraédrico de los orbitales enlazados
alrededor del átomo de carbono estos 4 grupos diferentes pueden
ocupar 2 ordenamientos diferentes en el espacio, por lo que los AA
pueden aparecer en forma de 2 esteroisómeros.
• Al ser imágenes especulares no superponibles entre si (Fig. 3-3)
• las dos formas constituyen un tipo de estereoisómeros, los
enantiómeros (véase la Fig. 1-19).
• Toda molécula con un centro quiral es ópticamente activa, es
decir, hacen girar el plano de la luz polarizada
• FIGURA3-3 Estereoisomeria
en los alfa-aminoácidos.
• (a) Los 2 estereoisómeros de
la alanina, la L- y la D-alanina,
son imágenes especulares no
superponibles entre sí
(enantiómeros).
• (b, c) Dos formas diferentes
para mostrar la configuración
en el espacio de los
estereoisómeros.
• En la perspectiva (b) los
enlaces con forma de cuña se
proyectan fuera del plano del
papel; los enlaces a trazos lo
hacen por detrás.
Los enantiómeros tienen las mismas propiedades químicas y físicas, a excepción de su respuesta ante la luz
polarizada (actividad óptica). Por ello se los denomina isómeros ópticos. Las moléculas aquirales, sin estereocentros,
son ópticamente inactivas.
 COMO HALLAR AL CARBONO QUIRAL
1. Los carbonos adicionales del grupo R se designan comúnmente
como alfa, beta, gamma, delta, etc., empezando siempre a partir del
carbono alfa(quiral).
2. Se numeran a partir del extremo del grupo carboxilo del aminoácido
y este sería el C-1 luego el C-2 sería el quiral tal como se refleja en
la molécula de lisina
LOS RESIDUOS AA DE LAS PROTEÍNAS SON
ESTEREOISÓMEROS L
En general los compuestos biológicos con un centro quiral se presentan en
la naturaleza en una forma estereoisómera, sea la D o L.
• Pero los residuos AAs de proteínas son exclusivamente L-
estereoisómeros.
• Sólo se han encontrado D-aminoácidos en unos pocos péptidos,
pequeños presentes en las paredes celulares bacterianas
• En los sistemas vivientes, los isómeros D y L son tan diferentes como
la mano derecha y la izquierda, y las células son capaces de sintetizar
específicamente los isómeros L de los AA, gracias a que los centros
activos de los enzimas son asimétricos, lo que implica que las reacciones
que catalizan sean específicas.
 LOS AAs SE CLASIFICAN SEGÚN SU GRUPO
R estándar son de vital
• Las propiedades químicas de los AAs
importancia para la comprensión de la bioquímica.
• Y estos AAs se agrupan en 5 clases principales basadas en las
propiedades de sus grupos R
• Grupos R: apolares alifáticos, polares sin carga, cargados
positivamente, cargados negativamente, aromáticos
• La polaridad de los grupos R varía enormemente desde totalmente
apolar o hidrofóbico (insoluble en agua) a altamente polar o
hidrofílico (soluble en agua).
• Dentro de cada clase existen graduaciones de polaridad, tamaño y
forma de los grupos R.
 GRUPOS R APOLARES ALIFÁTICOS
• Los grupos R de esta clase de aminoácidos son apolares e hidrofóbicos.
1. Las cadenas laterales de la alanina, la valina, la leucina y la
isoleucina se a agrupan entre ellos en las proteínas, estabilizando las
estructuras proteicas a través de interacciones hidrofóbicas.
2. La glicina tiene la estructura más simple y aunque formalmente es
apolar, su muy pequeña cadena lateral no tiene una contribución real en
las interacciones hidrofóbicas.
3. La metíonina, uno de los dos aminoácidos que contienen azufre, tiene
un grupo tioéter apolar en su cadena lateral.
4. La prolina tiene una cadena lateral alifática con una estructura cíclica
especial y su grupo amino secundario (imina) tiene una conformación
rígida que reduce la flexibilidad estructural de las regiones polipeptídicas
que contengas a este AA.
 GRUPOS R POLARES SIN CARGA
• Estos AAs son solubles en agua, o hidrofílicos ya que contienen grupos funciónales que forman
puentes de hidrógeno con el agua.
• Son: la serina, la treonina, la cisteína, la asparagina y la glutamina.
La polaridad se estos AA de donde proviene
• la serina y treonina proviene del grupo hidroxilo
• La cisteína de su grupo sulfhidrilo
• y en la asparagina y de la glutamina de sus grupos amida.

• La asparagina y la glutamina son las amidas del aspartato y el glutamato, respectivamentede que
también se encuentran en las proteínas y se hidrolizan fácilmente por un ácido o base.
• La cisteína se oxida con suma facilidad formando un aminoácido dimérico unido covalentemente
llamado cistina, estas 2 moléculas de cisteína se unen por enlace disulfuro, (S-S) que es
fuertemente hidrofóbicos (apolares).
• Los enlaces disulfuro desempeñan un papel especial en la estructura de muchas proteínas y
forman uniones covalentes entre partes de una molécula de proteína o entre dos cadenas
proteicas diferentes. Ejemplo la insulina
 GRUPOS R AROMÁTICOS.

• La fenilalanina, la tirosina y el triptófano, sus cadenas laterales

aromáticas son relativamente apolares (hidrofóbicos).
• Todos ellos participar en interacciones hidrofóbicas.
• La tirosina y el triptófano son significativamente más polares que
la fenilalanina debido al grupo hidroxilo de la tirosina y al nitrógeno
del anillo indólico del triptófano.
• El grupo hidroxilo de la tirosina puede formar puentes de
hidrógeno y constituye un grupo funcional importante en algunos
enzimas.
Los grupos R más hidrofílicos son aquellos que están cargados, sea
positiva o negativamente.
GRUPOS R CARGADOS POSITIVAMENTE (BÁSICOS)
• Son aquellos AAs que tienen una carga neta positiva mayor a pH 7.0:
• la lisina tiene un grupo amino primario adicional en su cadena
alifática
• la arginina tiene un grupo guanidino cargado positivamente
• y la histidina, que contiene un grupo imidazol.
• Es el único AA con una cadena lateral ionizable
• Los residuos de Histidina facilitan muchas reacciones
catalizados por enzimas al servir de dadores/aceptores de
protones.
 GRUPOS R CARGADOS NEGATIVAMENTE (ÁCIDOS)
• Estos AAs son el aspartato y glutamato ya que tienen un segundo grupo
carboxilo y una carga neta negativa menor a pH 7.0
 LOS AMINOÁCIDOS NO ESTÁNDAR TAMBIÉN TIENEN IMPORTANTES FUNCIONES
• Además de los 20 aminoácidos estándar, las proteínas pueden contener residuos
creados por modificación de los residuos estándar (Fig. 3-8a).
Entre los AAs no estándar están:
• la 4-hidroxiprolina derivado de la prolina y la 5-hidroxilisina derivada de la lisina.
• La primera se encuentra en la pared celular de plantas y ambas se encuentran en el
colágeno, proteína fibrosa del tejido conjuntivo.
• La 6 -N-metil-lisina es un constituyente de la miosina, proteína contráctil del músculo.
• El y-carboxiglutamato, que se encuentra en la proteína protrombina que interviene
en la coagulación de la sangre (función unir Ca+2)
• Más compleja es la desmosina, que es un derivado de 4 residuos diferentes de Lys,
se encuentra en la proteína fibrosa elastina.
• La selenocisteína es un caso especial. Este poco frecuente residuo es introducido
durante la síntesis de proteínas en lugar de ser creado a través de una modificación
postsintética.
• Contiene selenio en lugar del azufre de la cisteína. La selenocisteína, que proviene de
la serina, se encuentra sólo en pocas proteínas conocidas.
LOS GRUPOS FUNCIONALES EXTRA AÑADIDOS A TRAVÉS DE
REACCIONES DE MODIFICACIÓN SE MUESTRAN EN ROJO
 LOS AMINOÁCIDOS NO ESTÁNDAR TAMBIÉN TIENEN IMPORTANTES FUNCIONES
• (Fig. 3-8b) Algunos de los residuos AAs de una proteína pueden ser
modificados de forma transitoria para alterar la función de la proteína.
• La adición de grupos fosforilo, metilo, acetilo, adenililo, ADP-ribosilo u
otros a residuos aminoácidos específicos puede aumentar o disminuir la
actividad de la proteína.
• La fosforilación es una modificación reguladora muy común.

• Se han encontrado alrededor de 300 aminoácidos en las células los

cuales tienen funciones diversas, pero no todos forman parte de
proteínas.
• La ornitina y la citrulina (Fig. 3-8c) merecen mención especial porque
son intermediarios clave (metabolitos) en la biosíntesis de la arginina
(Capítulo 22) y en el ciclo de la urea (Capítulo 18).
 LOS AMINOÁCIDOS PUEDEN ACTUAR COMO ÁCIDOS Y COMO BASES
• (Fig. 3-9) Los grupos amino y carboxilo de los AAs, junto con los grupos R ionizables
de algunos AAs, actúan como ácidos y bases débiles.
• Cuando un AA sin grupo R ionizable se disuelve en agua a pH neutro, se encuentra en
forma de ión dipolar, o zwitterion (en alemán = ión híbrido), y puede actuar como
ácido o como base
• Estas sustancias duales (ácido-base) son anfóteras y a menudo se denominan
anfolitos (“electrolitos anfóteros”).
• Un alfa-aminoácido sencillo monoamínico y monocarboxílico, como la alanina, es un
ácido diprótico cuando está totalmente protonado; tiene dos grupos, el grupo -COOH y
el grupo -NH+3, que pueden liberar protones:
LOS AMINOÁCIDOS PUEDEN ACTUAR COMO ÁCIDOS Y COMO BASES
FIGURA 3-9
Forma no iónica y zwitterión de los AA.
• La forma no iónica no se encuentra
en cantidades significativas en
disoluciones acuosas.
• El zwitterion predomina a pH neutro.
• Un zwitterion puede actuar como
ácido (donador de protones) o como
base (aceptor de protones).
LOS AMINOÁCIDOS TIENEN CURVAS DE TITULACIÓN CARACTERÍSTICAS
• La titulación ácido-base implica la adición o eliminación gradual de protones (Capítulo 2).
• La Figura 3-10 muestra la curva de titulación de la forma diprótica de la glicina.
• Los 2 grupos ionizables de la glicina, el grupo carboxílico y el grupo amino, se titulan con una base fuerte
el NaOH.
• La gráfica tiene 2 etapas distintas, que corresponden a la desprotonación de 2 grupos diferentes de la
glicina.
PRIMERA ETAPA
• A pH muy bajo, la especie iónica predominante de la glicina es +H3N-CH2-COOH, la forma totalmente
protonada
• En el punto medio de la primera etapa de la titulación, el grupo -COOH de la glicina pierde su protón,
se encuentran presentes concentraciones equimolares del dador de protones(+H3N-CH2-COOH) y el
aceptor de protones (+H3N-CH2-COO-). Esto ocurre a pH 2,34 el cual es el punto medio de la glicina
• A medida que avanza la titulación se alcanza otro punto importante a pH 5,97. la eliminación del
primer protón es prácticamente completa y se ha iniciado la eliminación del segundo. A este pH la
glicina se encuentra mayoritariamente en forma del ión dipolar (zwitterion) +H3N-CH2-COO-

• El pka es una medida de la tendencia de un grupo a ceder un protón y disminuye si el pKa se incrementa.
SEGUNDA ETAPA DE LA TITULACIÓN
• corresponde a la eliminación de un protón del grupo -NH3 de la glicina.
El pH en el punto medio de esta etapa es 9,60
• Luego avanza a un pH 12 donde la titulación es prácticamente completa y
la forma predominante de la glicina es H2N-CH2-COO-

EN RESUMEN

• Las cargas opuestas en el zwitterion resultante tienen un efecto

estabilizante.

• Este efecto es debido en parte a los átomos de oxígeno electronegativos

del grupo carboxilo, que tienden a atraer electrones hacia ellos

• el grupo alfa-amino la tendencia del grupo amino a ceder un protón

FIGURA 3-10 Titulación de un aminoácido.
• Curva de titulación de glicina 0,1 m a 25 ®C.
• Las especies iónicas predominantes en puntos clave de
la titulación se muestran encima de la gráfica. Los
recuadros sombreados, centrados alrededor de pK1, =
2,34 y pK2 = 9,60, indican las regiones de máximo
poder tamponante. Observe que 1 equivalente de OH-
= 0,1 m NaOH
• añadido.