Resistencia genética a Tobamovirus en tomate

Luria, Neta et al PloS one (2017)

Seminario sobre Virus del genero Tobamovirus con énfasis

en el Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV)
Diciembre 5 2018
J. Alberto Romero-Navarro
Junior tomato breeder
Ideas principales
• Cuales son los tipos de resistencia genetica a viruses en plantas?

• Como se identifican fuentes de resistencia con fines de mejoramiento?

• Cuales fuentes de resistencia a tobamovirus se han usado en el

mejoramiento de tomate?

• Que resultados se han publicado respecto a los genes de resistencia a

tobamovirus frente al Tomato brown rugose fruit virus?
 Existen diferentes tipos de resistencia genética a viruses
en plantas
• “Resistencia” = mecanismos genéticos
heredables que permiten a las plantas resistir
los efectos negativos de enfermedades
• Resistencia de no-hospedero: Todos los
individuos de una especie son resistentes o
inmunes a un virus
• Intuitiva (no todos los viruses afectan a todas las
plantas), pero poco estudiada
• Relevante ante un patógeno emergente
• Resistencia de hospedero: Existe diversidad
dentro de una especie de planta, de forma que
algunos individuos de una especie no
manifiestan efectos negativos ante un virus, y
otros si Lanfermeijer, et al, 2003
La resistencia tipo hospedero se subdivide en 2 tipos

• Resistencia al patógeno
• Generalmente implica
resistencia a la enfermedad

• Resistencia a síntomas de
la enfermedad
• También conocida como
tolerancia a la enfermedad
• Existe carga viral con potencial
movimiento dentro del individuo,
pero no se observan síntomas Lesiones necróticas TMV, guía de enfermedades de tomate
de la enfermedad
 Hay diversas fuentes de resistencia en mejoramiento

• Tipo de germoplasma:
• Material mejorado
• Características agronómicas buenas
• Desarrollo de nuevas variedades en tiempo
relativamente corto
• Variedades tradicionales
• Algunas características buenas y otras malas
para contextos modernos de producción
(ejemplos: mala firmeza, rajado de fruto)
• Desarrollo de nuevas variedades tardado
• Especies silvestres
• Características agronómicas a menudo muy
poco o nada adecueadas para producción
(ejemplos: frutos muy pequeños,
autoincompatibilidad, mal sabor…)
• Desarrollo de nuevas variedades muy
tardado
Foto: UF/IFAS
Las resistencias pueden tener distintos mecanismos
genéticos de accion
Dominante Recesivo
• Monogénicos
• Un solo gen proporciona resistencia
• >80% de resistencias a virus reportadas
• Dominante
• Es suficiente si uno de los padres es resistente
• Recesiva
• Ambos padres deben ser resistentes
• Alta presión selectiva hacia el patógeno
• Evolución del virus para vencer la resistencia
• Poligénicos
• Muchos genes juntos proporcionan resistencia
• Cada gen puede tener acción dominante/recesivo
• Mas duradera que resistencia monogenica
• Mejoramiento es mas complicado
Las resistencias pueden tener distintos mecanismos
genéticos de accion
a a
• Monogénicos
• Un solo gen proporciona resistencia A Aa Aa
• >80% de resistencias a virus reportadas F1
A Aa Aa
• Dominante
• Es suficiente si uno de los padres es resistente
• Recesiva
• Ambos padres deben ser resistentes
• Alta presión selectiva hacia el patógeno
• Evolución del virus para vencer la resistencia
• Poligénicos
• Muchos genes juntos proporcionan resistencia
• Cada gen puede tener acción dominante/recesivo
• Mas duradera que resistencia monogenica
• Mejoramiento es mas complicado
Las resistencias pueden tener distintos mecanismos
genéticos de accion
a a
• Monogénicos
• Un solo gen proporciona resistencia A Aa Aa
• >80% de resistencias a virus reportadas F1
A Aa Aa
• Dominante
• Es suficiente si uno de los padres es resistente
• Recesiva a a
• Ambos padres deben ser resistentes
• Alta presión selectiva hacia el patógeno Retrocruza A Aa Aa
• Evolución del virus para vencer la resistencia 1:1 Resistencia a aa aa
• Poligénicos
• Muchos genes juntos proporcionan resistencia
• Cada gen puede tener acción dominante/recesivo
• Mas duradera que resistencia monogenica
• Mejoramiento es mas complicado
Nuevas fuentes de resistencia de identifican a través de
ensayos controlados

• En campo, algunos individuos escapan

enfermedad por azar
• Ensayos cuantitativos (medidas
precisas), controlados, con inoculación del
patógeno en condiciones de alta
reproducibilidad y bioseguridad
• Identificación de nueva resistencia genera
conocimiento de
• Tipo de germoplasma de procedencia
(material mejorado, variedades tradicionales,
variedades silvestres)
• Tipo de resistencia hospedero (resistencia al
patógeno, resistencia a la enfermedad)
• Mecanismo genético (monogenico Soosaar, et al, 2005
dominante, recesivo, poligenico)
 • S. peruvianum
• Photo by Scott Peacock
• Tomato Genetics Resource
Center

Ejemplo: Resistencia a Tomato

mosaic virus (ToMV)
J. Pelham, Euphytica 1966
La primer resistencia a TMV en tomates silvestres fue
reportada en 1939

• Dato curioso: TMV se acredita como el

primer virus reportado en 1886 por A. Mayer
mediante inoculación de tabaco. En 1898
Martinus Beijericnk en Holanda muestra que
los patógenos responsables de la
enfermedad de tabaco son de menor
tamaño que las bacterias y para
diferenciarlos llamo al nuevo tipo de
patógeno “virus” del latin veneno
• En 1939 Porte et al reportan que plantas de
accesión de la especie Lycopersicum
hirsutum eran asintomáticas a pesar de
presencia del virus en tejido. En 1946 se Solanum habrochaites = L. hirsutum
muestra que hibridos de L. hirsutum y Photo: Sandy Knapp
tomate son menos resistentes que el tomate
silvestre
En 1943 también se busca resistencia en otra especie
silvestre

• F.O. Holmes utiliza plantas de la especie

L. chilense, con cruzas iniciales en 1939
y en 1943 muestra que el hibrido, la
primera generación de retrocruza en
tomate domestico, y el silvestre son mas
resistentes que el tomate domestico
• Problema: Virus
• Solución: Cruza con L. chilense
• Problema: material derivado de la cruza
es estéril

L. chilense Wikipedia
El programa de mejoramiento de Hawaii empieza un
proceso de cruzas en 1941 a cargo de Frazier

• Meta de Frazier: Combinar resistencia a 8 enfermedades de

tomate importantes para la producion en Hawaii
• El programa realiza cruzas de varias especies silvestres, y
busca resistencia a TMV en cruzas L. esculentum x L.
chilense y L. hirsutum x L. esculentum proveídas por
investigadores de California y el Departamento de Agricultura
de Estados Unidos
• En 1947 reportan resultados de la búsqueda de resistencia en
cruzas usando L. peruvianum, L. pimpinellifoliu, L. hirsutum y
L. chilense y reportan alta tolerancia en algunas lineas
• En 1949 reportan líneas prometedoras con un marcado
retraso en los síntomas, resultado de cruzas usando L.
peruvianum, L. pimpinellifolium, L. hirsutum Solanum peruvianum
• El programa continua hasta 1961, la resistencia no parece ser Foto:David Haak
completamente dominante y aunque líneas útiles son
derivadas del proyecto, la especie original de cada gen de
resistencia queda incierta
Se encuentra una fuente monogenica de resistencia a
TMV
• Entre 1952-1954 Holmes reporta con
a a
segregación esperada en una retrocruza de
material derivado de los esfuerzos de Frazier
A Aa Aa
F1
• Sigue con el experimento de autopolinizar A Aa Aa
las plantas resistentes
• Esperaba resistencia 3:1
• Observa 2:1 a a
• Hipotesis: en tomate domestico el gen de
resistencia en estado homocigoto es no-viable
o muy raro
Retrocruza A Aa Aa
1:1 Resistencia a aa aa
• Resistencia: los individuos escapan infeccion
• El gen recibe el símbolo de Tm1
• Problema: Virus
• Solución: Material de Frazier
A a
• Problema: material homocigoto no es viable Autopolinizacion A AA Aa
• Se logra eventualmente tener líneas puras 3:1 Resistencia a Aa aa
Se encuentra una segunda fuente de resistencia a TMV

• Se encuentra tambien en el material desarrollado

por Frazier por Soost reportado en 1958 Caso ideal
• Las progenies segregan de manera consistente a
un gen unico dominante
• Confiere mayor resistencia que Tm1, recibe
nombre de Tm2
• Problema: Virus
• Solución: Material de Frazier (L. peruvianum)
• Problema: ligamiento con gen recesivo “netted-
viriscent” nv , que causa problemas de desarrollo y
amarillamiento de las hojas en estado homocigoto
• Solucion: romper el ligamiento
• Problema: en 1962 Smith rompe el ligamiento,
pero se introduce un factor letal en el complejo
Tm2-nv
Se encuentra una segunda fuente de resistencia a TMV

• Se encuentra tambien en el material desarrollado

por Frazier por Soost reportado en 1958 Caso ideal
• Las progenies segregan de manera consistente a
un gen unico dominante
• Confiere mayor resistencia que Tm1, recibe
nombre de Tm2
• Problema: Virus Ligamiento
• Solución: Material de Frazier (L. peruvianum)
• Problema: ligamiento con gen recesivo “netted-
viriscent” nv , que causa problemas de desarrollo y
amarillamiento de las hojas en estado homocigoto
• Solucion: romper el ligamiento
• Problema: en 1962 Smith rompe el ligamiento,
pero se introduce un factor letal en el complejo
Tm2-nv
Se encuentra una segunda fuente de resistencia a TMV

• Se encuentra tambien en el material desarrollado

por Frazier por Soost reportado en 1958 Caso ideal
• Las progenies segregan de manera consistente a
un gen unico dominante
• Confiere mayor resistencia que Tm1, recibe
nombre de Tm2
• Problema: Virus Ligamiento
• Solución: Material de Frazier (L. peruvianum)
• Problema: ligamiento con gen recesivo “netted-
viriscent” nv , que causa problemas de desarrollo y
amarillamiento de las hojas en estado homocigoto
• Solucion: romper el ligamiento Factor letal
• Problema: en 1962 Smith rompe el ligamiento,
pero se introduce un factor letal en el complejo
Tm2-nv
Se usa la especie Solanum pennelli como fuente de
resistencia en 1961

• Problema: Virus
• Solución: Solanum
pennelli
• Problema: 3 genes
complementarios
dominantes necesarios
para la resistencia
En 1963 Alexander encuentra otra fuente de resistencia
en L. peruvianum

• Gen dominante sencillo

• Alelo de Tm2 (misma region del
genoma)
• Recibe de nombre Tm-22
• No tiene ligamiento con factores
letales ni gen nv
• Problema: Virus
• Solución: L. peruvianum

• Fin
Consideraciones de las resistencias anteriores

• Las resistencias anteriores no siempre se expesaban de igual manera en diferentes contextos

• Florida -> susceptible
• No siempre se observa dominancia
• A veces se observa tolerancia, a veces inmunidad
• Diferentes cepas de TMV fueron rompiendo las resistencias Tm1 y Tm2
• Se usan las resistencias para identificar las cepas
• A veces resistencias de S. pennellii eran major, a veces menos eficientes que los genes Tm1 y
Tm2
• Tm-22 muestra que el mecanismo de resistencia hacia dificil a los virus sobreponerse porque
mutaciones necesarias en el virus para sobreponerse eran normalmente detrimentales para el
virus mismo
• En resumen, los modelos biologicos son por naturaleza evolutivos, y la interaccion con el
ambiente hace muy importante validar de manera rigurosa los aspectos de resistencia,
inmunidad, suceptibilidad, y los contextos donde son mas prevalentes para cada fuente de
resistencia y contra cada cepa de virus
Resultados publicados frente al Tomato brown rugose
fruit virus

Enero 20, 2017

• Traduccion literal: Un nuevo aislado Israeli de Tobamovirus infecta plantas de tomate

que contienen el gen de resistencia Tm-22
• Traduccion contextual: Aguas! El gen mas común que se creía duradero no sirve ante
un nuevo virus
Que sigue sobre resistencia a Tomato brown rugose fruit
virus?

• 1. La búsqueda de fuentes de resistencia ha mejorado mucho en los últimos 60 años

• 2. Existen extensivas colecciones de especies silvestres y variedades tradicionales

• 3. Una vez encontrada una fuente de resistencia, las herramientas actuales permiten
desarrollar marcadores para incorporar genes en poco tiempo

• 4. El virus es muy reciente, aun hay muy poca información publicada respecto al
comportamiento del patógeno frente a variedades comerciales y silvestres