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https://www.elheraldo.co/colombia/la-cruda-realidad-de-los-campesinos-por-derrame-de-petroleo-en-santander-475468
Fuentes de contaminación
• Fuente puntual:
• Fuente no puntual:
Fuentes de contaminación
• Fuente puntual: tanques de petróleo que
se pueden derramar
• Fuente no puntual: aplicación de
pesticidas y fertilizantes sobre grandes
áreas
Ríos Aguas
subterráneas
90% 55%
90% 55%
90% 55%
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 381, Figura 17.1
Mineralización
• Cada etapa de la vía de degradación ocurre
gracias a una enzima (intra o extracelular)
• Enzimas extracelulares ¿?
• Si un contaminante tiene estructuras similar a
compuestos naturales, se degradarán más
fácilmente
• Entre más diferentes, no se degradarán: no
existen enzimas que las reconozcan y las
degraden
Mineralización
• Las vías de degradación pueden ser incompletas si
alguna enzima no se encuentra presente
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.2
Mineralización
• Las vías de degradación pueden ser incompletas si
alguna enzima no se encuentra presente
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.2
Mineralización
• Las vías de degradación pueden ser incompletas si
alguna enzima no se encuentra presente
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.2
Co-metabolismo
• Oxidación parcial del sustrato
• La energía derivada no se usa para crecimiento microbiano
• Enzimas no-específicas: degradación de sustrato y contaminante
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.3
Co-metabolismo
• Oxidación parcial del sustrato
• La energía derivada no se usa para crecimiento microbiano
• Enzimas no-específicas: degradación de sustrato y contaminante
Ciclo: metano
Quien lo realiza: MOs
metanotróficas
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.3
Co-metabolismo
• Oxidación parcial del sustrato
• La energía derivada no se usa para crecimiento microbiano
• Enzimas no-específicas: degradación de sustrato y contaminante
Ciclo: metano
Quien lo realiza: MOs
metanotróficos
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.3
Co-metabolismo
• Oxidación parcial del sustrato
• La energía derivada no se usa para crecimiento microbiano
• Enzimas no-específicas: degradación de sustrato y contaminante
Ciclo: metano
Quien lo realiza: MOs • Tricloroetileno (TCE)
metanotróficos • Solvente industrial
• Contaminante peligroso
habitual de la industria
• Posible carcinógeno
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.3
Co-metabolismo
• Oxidación parcial del sustrato
• La energía derivada no se usa para crecimiento microbiano
• Enzimas no-específicas: degradación de sustrato y contaminante
Ciclo: metano
Quien lo realiza: MOs • Tricloroetileno (TCE)
metanotróficos • Solvente industrial
• Contaminante peligroso
Primer paso de la oxidación habitual de la industria
Enzima no específica
• Posible carcinógeno
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 382, Figura 17.3
Capacidad de carga microbiana
• Aumento de la cantidad de C x agricultura o industria
• Cantidad en ambiente excede la capacidad de carga del
ambiente: nivel máximo de actividad microbiana que
se puede esperar en condiciones ambientales normales
Curva de
crecimiento de
MOs
Capacidad de carga microbiana
• Aumento de la cantidad de C x agricultura o industria
• Cantidad en ambiente excede la capacidad de carga del
ambiente: nivel máximo de actividad microbiana que
se puede esperar en condiciones ambientales normales
¿?
Factores biológicos y fisicoquímicos que
influencian la biodegradación
• Relacionados con:
– biología de la comunidad
– estructura y propiedades fisicoquímicas del
contaminante
1. Potencial genético
2. Toxicidad
3. Estructura del contaminante
4. Biodisponibilidad
1. Potencial genético
• Biodegradación seguida de periodo de adaptación de
los MOs autóctonos
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 406, Figura 17.26
3.1. Efectos estéricos
• Presencia de grupos
funcionales o de
ramificaciones
• Cambian el sitio reactivo
• Puede afectar el transporte
del contaminante a través de
la membrana (sobre todo si
este depende de enzimas)
• Entre más grande sea el grupo
funcional más efecto tendrá
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 387, Figura 17.8
3.2. Efectos electrónicos
• Grupo funcionales pueden donar o(CH3) o remover(Cl):
electrones: cambia la electronegatividad del sitio de
reacción
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.9
3.2. Efectos electrónicos
• Grupo funcionales pueden donar o(CH3) o remover(Cl):
electrones: cambia la electronegatividad del sitio de
reacción
• A mayor electronegatividad hay menos degradación
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.9
4. Biodisponibilidad
• El primer paso es la absorción del compuesto
a la célula
• Los MOs obtienen sus sustratos de la fase
acuosa que los rodea
• Biodisponibilidad del contaminante depende
de:
– Solubilidad
– Sorción (al suelo)
4.1. Solubilidad y biodisponibilidad
• Contaminante soluble en agua:
• Biosufactante:
rimnolípido
• En agua: formación
espontánea de vesículas
• HC se asocian a la capa
hidrofóbica
• Estructuras HC-
rimnolípido son solubles
en agua
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 386, Figura 17.5
4.2. Sorción y biodisponibilidad
• Mecanismos de sorción débiles (fuerzas de
van der Waals, interacciones hidrofóbicas,
enlaces de hidrógeno): son reversibles:
quedan disponibles para ser usados por MOs
• Uniones fuertes (enlaces convalentes):
irreversibles: con el tiempo: proceso de
humificación
4.2. Sorción y biodisponibilidad
• Si el contaminante se difunde a micrositios de la matriz
que son inaccesibles a las bacterias debido a su tamaño
• Con el tiempo >400um 400-12um 12-
se vuelven más 0.4um
Grava Arena Limo
inaccesibles:
reducción de
biodegradación
Tamaño de poro
Grandes Medianos Finos
Arena
Marga
¿Nombre de
zonas del suelo?
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• ¿Por qué es importante para MOs?
Materia orgánica disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• Fuente de C para MOs heterótrofos
• Disponibilidad de O, materia orgánica dependen de la
zona donde este el contaminante
Materia orgánica disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• Fuente de C para MOs heterótrofos
• Disponibilidad de O, materia orgánica dependen de la
zona donde este el contaminante
Materia orgánica disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• Fuente de C para MOs heterótrofos
• Disponibilidad de O, materia orgánica dependen de la
zona donde este el contaminante
Materia orgánica disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• Fuente de C para MOs heterótrofos
• Disponibilidad de O, materia orgánica dependen de la
zona donde este el contaminante
Tasa de biodegradación disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
A. Materia orgánica
• Fuente de C para MOs heterótrofos
• Disponibilidad de O, materia orgánica dependen de la
zona donde este el contaminante
Tasa de biodegradación disminuye
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 388, Figura 17.10
B. Condiciones redox
• Tasas de degradación aeróbica son mayores
que las anaeróbicas
• HC de petróleo en áreas aeróbicas de lagos y
ríos: susceptibles a biodegradación
• HC acumulados en sedimentos anaeróbicos:
altamente persistentes
• Degradación del metano:
B. Condiciones redox
• Tasas de degradación aeróbica son mayores
que las anaeróbicas
• HC de petróleo en áreas aeróbicas de lagos y
ríos: susceptibles a biodegradación
• HC acumulados en sedimentos anaeróbicos:
altamente persistentes
• Degradación del metano: sólo
anaeróbicamente
C. Nitrógeno
• Al utilizar contaminantes orgánicos, se crea
una demanda por nutrientes
• Radio de biomasa C:N 5:1 a 10:1 dependiendo
del tipo de MO
• La biodegradación se puede mejorar al añadir
fertilizantes con N
E. Temperatura
• Degradación de HC se puede dar desde T° de
congelación hasta 30°C
• Cambios de T° estacional pueden interferir
con la biodegradación
• Tasas de biodegradación de hexadecano se
redujo 4.5 en invierno comparado con verano
F. pH
• Mayores tasas de biodegradación en pH +/-7
• Poblaciones pueden degradar a pH bajos (2,
3), pero son menos diversos que los que
degradan a 7
G. Salinidad
• Altos niveles de salinidad disminuyen la
degradación de HC
• MOs marinos están acostumbrados a degradar
HC (fisuras y derrames)
• Exhiben menor diversidad que los
biodegradadores de hidrocarburos en suelo
Biodegradación de contaminantes orgánicos
• Condiciones aeróbicas:
• Se degradan rápidamente
• Los n-alcanos de cadenas medianas (C10 a C18) se
utilizan más que los más cortos o más largos
• Solubilidades:
• C18 0.006mg/L
• C10 0.052mg/L
• C4 61.4mg/L: muy soluble en agua: tóxico porque
se absorbe más y se disuelve en la membrana
alterando su integridad
Biodegradación de alifáticos no halogenados
• Condiciones aeróbicas:
Un O2 al final de la cadena
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 394 Figura 17.12
Biodegradación de alifáticos no halogenados
• Condiciones anaeróbicas:
• A menor peso molecular se limita la biodegradación de
alcanos
• Excepción: degradación del metano
• A mayor peso molecular se necesita su ‘activación’
para que se de su degradación
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 95 Figura 17.14
Compuestos alifáticos halogenados
• Solventes clorinados como TCE y
percloroetileno (PCE)
• Condiciones aeróbicas:
• Alifáticos con 1 o 2 Cl se mineralizan
TCE
• A mayor número de halógenos,
decrece la biodegradación
• Reacciones se vuelven co-
metabólicas
PCE
• Compuestos con varios Cl son
recalcitrantes
Compuestos alifáticos halogenados
• Solventes clorinados como TCE y
percloroetileno (PCE)
• Condiciones aeróbicas:
• Alifáticos con 1 o 2 Cl se mineralizan
TCE
• A mayor número de halógenos,
decrece la biodegradación
• Reacciones se vuelven co-
metabólicas
PCE
• Compuestos con varios Cl son
recalcitrantes
Efectos electrónicos
Biodegradación de alifáticos halogenados
• Condiciones aeróbicas: 2 vías
• Remover el Cl
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 396 Figura 17.15
Biodegradación de alifáticos halogenados
• Condiciones anaeróbicas:
• Son degradados parcialmente, no son
mineralizados
• Alifáticos con dos o más Cl se transforman por
co-metabolismo (lento) o por halorespiración
(rápido)
• En general sucede una dehalogenización
reductiva
Biodegradación de alifáticos halogenados
• Condiciones anaeróbicas: dehalogenización reductiva
Para que transfiera electrones
al alifático halogenado Se libera un Cl
1 2
3 4
1 2
3
1
PCE a
TCE
Apertura
de anillo
Lactonización
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 399, Figura 17.18
Biodegradación de alicíclicos
• Condiciones anaeróbicas:
• Ocurre cuando alicíclicos se encuentran mezclados
en condensados de gas: mezcla de hidrocarburos en
gas natural crudo, contiene alifáticos C2-C12,
ciclopentanos, ciclohexanos, aromáticos
• Su biodegradación es limitada
Compuestos aromáticos
• Productos naturales (lignina)
• Se forman en incendios forestales
• Algunos pueden ser carcinogénicos
• Algunos pueden tener efectos tóxicos para MOs
http://nutricionanimal.mx/glosario-nutricion-animal/celulosa
Biodegradación de aromáticos
• Condiciones aeróbicas:
• Pueden ser degradados por diversas bacterias, hongos,
algas
• Aromáticos con menor peso molecular se degradan más
rápido
• Bacterias: usan una dioxigenasa para mineralizarlos
Entra al ciclo
del ácido
tricarboxílico
Intermediario
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 400 Figura 17.19
Biodegradación de aromáticos
• Condiciones aeróbicas:
• Eucariotas: usan una monooxigenasa.
• Proceso para detoxificar y excretar los compuestos resultantes
Intermediario
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 401 Figura 17.20
Biodegradación de aromáticos
• Condiciones anaeróbicas
• Se necesita de consorcios
microbianos
• Intermediario en la
degradación: benzoil-CoA
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 402, Figuras 17.21 y 17.22
Compuestos aromáticos con sustituciones
• Gasolina, solventes, preservativos de maderas (PCP),
compuestos parentales de pesticidas como DDT
• Son tóxicos para diversos MOs
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 403 Figura 17.23
Compuestos aromáticos con sustituciones
• Para aromáticos clorinados: dehalogenasas, monooxigenasas
• Para aromáticos metilados: se pasa por intermediario catecol
Pepper, I; Gerba, C; Gentry, T. (2014) Environmental Microbiology 3rd ed. pp 403 Figura 17.23