UNIVERSIDAD NACIONAL FEDERICO VILLARREAL

FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES Y MATEMÁTICA

ESCUELA PROFESIONAL DE BIOLOGÍA

Hardy-Weinberg Equilibrium – II

Integrantes:

Azabache Odias, Ruth

Machare Coveñas, Jesús

Ore Cruz, Lita

Romero Avila, Yolanda

Profesora:

Mayanga Herrera, Ana Lucia

Curso:

Genética de Poblaciones – Practica

 1. Introducción

La infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) con su progresión clínica al SIDA se ha

convertido en una de las fatales enfermedades en el mundo. Más de 40 millones de personas en todo el

mundo están infectadas por el VIH. Se han hecho progresos durante la última década en la reducción de

mortalidad y morbilidad mediante el tratamiento de individuos infectados con terapia antirretroviral de

gran actividad (TARGA), que es una combinación de medicamentos dirigidos a uno o más pasos en el

virus ciclo de vida. Sin embargo, los regímenes de dosificación complicados de la actual terapia, junto

con los efectos secundarios de los fármacos componentes, han condujo a una disminución de la

adherencia. Muchos pacientes que no lograron supresión sostenida de la replicación viral y la aparición de

las cepas del VIH resistentes a los medicamentos se han convertido en problemas críticos en salud

pública. Por lo tanto, existe una necesidad apremiante de descubrir nuevos fármacos o dianas para la

intervención terapéutica (Palani y Tagat, 2006).

El receptor 5 de quimiocinas humanas (CCR5) funciona como un co-receptor para la infección por el

virus de la inmunodeficiencia humana (VIH-1). CCR5 es un receptor de superficie celular de siete

transmembranas. Recientemente, una mutación natural de CCR5, ccr5/Δ32, ha sido descrito (Benkirane et

al, 1997). El papel predominante de CCR5 para la entrada y replicación viral se ilustra por la resistencia a

la infección por VIH-1 de individuos que carecen de CCR5 debido a una deleción de 32 pb en el gen

CCR5. Heterocigotos para CCR5-D32 progresa lentamente en la infección, muy probablemente debido a

la reducción de los niveles de expresión de CCR5 en la superficie celular. La capacidad de los ligandos

modificados para regular a la baja los receptores de quimiocinas ha generado esperanzas de nuevas

estrategias antivirales, que promuevan la eliminación de los correceptores del VIH de la superficie

celular, y estimuló las investigaciones sobre los mecanismos que subyacen a la endocitosis y degradación

del receptor (Oppermann, 2004).

Varios estudios han demostrado que la CCR5/ccr5Δ32 el genotipo confiere una protección "relativa"

contra el SIDA con un retraso de 2 a 4 años en el inicio de la enfermedad (Benkirane et al, 1997). Es por
ello que es muy importante este descubrimiento para poder realizar una alternativa terapia génica, en este

informe se justificará y explicará los valores del índice de frecuencias génicas y alélicas por continente.

2. Marco Teórico

3. Receptor-c de citoquinas 5

También conocido como CCR5, es un receptor de transmembrana acoplados a la proteína G, se expresa

principalmente en células T, macrófagos, células dendríticas y células de la microglía. Su función como

receptor es actuar en la activación celular durante una respuesta inmunitaria para las quimiocinas MIP-1α

(CCL3), MIP-1β (CCL4) y RANTES (CCL5); como en la producción de anticuerpos (Sánchez, 2007;

CNB [Centro Nacional de Biotecnología], 2020). Además, se sabe que actúa como correceptor necesario

para la infección del VIH (Virus de Inmunodeficiencia Humana), uniéndose este a las células T CD4+

(CNB, 2020).

4. Estructura genética del CCR5

El gen del CCR5 está presente en el cromosoma 3 (Fig. 1), presentando como características una longitud

de 6kb de 3655 pb, 352 aminoácidos con un peso de 40,6 kDa y su región codificante se halla en el exón

3; también se localizan sus genes homólogos como CCR1, CCR2 y CCR3, siendo también receptores de

transmembrana (Sánchez, 2007).

5. Variación de gen CCR5: ∆32 y el VIH

La

Fig. 1: Estructura del gen CCR5. Sánchez, 2007.

variación o mutación del CCR5 ∆32, fue descubierta en 1996 en individuos que no tenían contagio frente

al VIH (Ciencias Médicas, s.f.). Se descubrió que el exón 3, región codificante del CCR5, presenta

polimorfismo de inserción /deleción, por el cual, una deleción de 32 pb genera una proteína corta no
funcional, presentando una ausencia en las membranas (Sánchez, 2007; Ibarra, 2001). Los individuos que

presentan esta mutación no presentan un efecto a nivel fisiológico o síntomas clínicos relacionados

(Sánchez, 2001).

Los individuos homocigotos que presentan esta deleción, representada genotípicamente CCR5-∆32/∆32,

presenta una resistencia a la infección de cepas del virus VIH; a diferencia de los individuos

heterocigotos, CCR5-wt/ Δ32, que sus niveles de expresión del CCR5 son inferiores, por lo tanto,

presentan menor índices de infección en células (Sánchez, 2001; Ibarra, 2001 y Ciencias Médicas, s.f.).
 6. Problemas

Calcule las frecuencias genotípicas y las frecuencias alélicas para cada grupo poblacional (Tabla 1).

Se utilizo los siguientes parámetros:

Nº de individuos de un genotipo
Frecuencia genotipica=
Nº total de individuos

( Nº de individuos homocigotos × 2 ) +(numero de individuos heterocigotos)

Frecuencia alelica=
Nº total de individuos ×2

Figura 2
Distribución global del CRR5- ∆32

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

7.

Resultados

1. Población Europea

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

 Ashkenazí 26 16 1 20.39 43

Islandia 75 24 3 14.71 102

Bretaña 223 57 3 11.13 283

España: vasco 24 5 0 8.62 29

España: Cataluña 41 8 0 8.16 49

Italia 81 10 0 5.49 91

Irlanda 40 4 0 4.55 44

Chipre 77 7 0 4.17 84

Grecia 60 3 0 2.38 63

Total 674 134 7 788

Frecuencias genotípicas:

674
Frc .(CCR 5/CCR 5)= =0.855
788

134
Frec .(CCR 5/ Δ 32)= =0.170
788

7
Frec .(Δ 32/ Δ 32)= =0.008
788

Frecuencias alélicas:

( 674 ×2 ) +134
Frec .(CCR 5)= =0.94
788× 2

( 7 ×2 ) +134
Frec .( Δ32)= =0.093
788× 2

2. Población Oriente Medio

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

Caucasus: Daghestan 96 14 0 6.36 110

Arabia Saudita 231 10 0 2.07 241

Yemen 34 0 0 - 34

Total 361 24 0 385

Frecuencias genotípicas:

361
Frc .(CCR 5/CCR 5)= =0.934
385

24
Frec .(CCR 5/ Δ 32)= =0.062
385

Frec .(Δ 32/ Δ 32)=0

Frecuencia alélica:

( 361× 2 )+ 24
Frec .(CCR 5)= =0.96
385 × 2

( 0 ) +24
Frec .( Δ32)= =0.031
385 ×2

3. Población Asiática

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

Rusia 38 7 1 9.78 46

Gujarat 30 1 1 4.69 32

Pakistán 32 2 0 2.94 34

Sindh 28 1 0 1.72 29

Punjab 33 1 0 1.47 34

Bengala 25 0 0 - 25
 Hong Kong 50 0 0 - 50

Taiwán 83 0 0 - 83

Filipinas: Filipino 26 0 0 - 26

Filipinas: Negrito 30 0 0 - 30

Mongolia 59 0 0 - 59

Sri Lanka 37 0 0 - 37

Birmania 67 0 0 - 67

Tailandia 100 1 0 0.50 101

Borneo 151 0 0 - 151

Sumatra 72 0 0 - 72

Isla de Andamán 24 0 0 - 24

Total 885 13 2 900

Frecuencias genotípicas:

885
Frc .(CCR 5/CCR 5)= =0.983
900

13
Frec .(CCR 5/ Δ 32)= =0.014
900

2
Frec .( Δ32/ Δ 32)= =0.002
900

Frecuencia alélica:

( 885 ×2 ) +13
Frec . ( CCR 5 )= =0.991
900 × 2

( 2× 2 ) +13
Frec .( Δ32)= =0.009
900 × 2
 4. Población de África

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

Nigeria 110 1 0 0.45 111

Gambia 56 0 0 - 56

R. C. Africana 52 0 0 - 52

Kenia 80 0 0 - 80

Costa de Marfil 87 0 0 - 87

Malawi 80 0 0 - 80

Zambia 96 0 0 - 96

Kalahari San 36 0 0 - 36

Total 597 1 0 598

Frecuencia genotípica:

597
Frec . ( CCR 5/CCR 5 )= =0.998
598

1
Frec . ( CCR 5/ Δ32 )= =0.001
598

0
Frec . ( Δ32/ Δ 32 )= =0
598

Frecuencia alélica:

( ( 597 x 2 ) +1 ) 1195
Frec . ( CCR 5 )= = =0.99
598 x 2 1196
 ( ( 0 x 2 ) +1 )
Frec . ( ∆ 32 )= =0.00
598 x 2

5. Población de Oceanía

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

Costa de Nueva Guinea 96 0 0 - 96

French Polynesia 94 0 0 - 94

Aboriginal Australian 96 2 0 1.02 98

Guam 58 1 0 0.85 59

Fiji 17 0 0 - 17

Total 361 3 0 364

Frecuencia genotípica:

361
Frec . ( CCR 5/CCR 5 )= =0.991
364

3
Frec . ( CCR 5/ Δ32 )= =0.008
364

0
Frec . ( Δ32/ Δ32 )= =0
364

Frecuencia alélica:

( ( 361 x 2 )+ 3 )
Frec . ( CCR 5 )= =0.99
364 x 2

( ( 0 x 2 ) +3 )
Frec . ( ∆ 32 )= =0.004
364 x 2

6. Población Americana

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

 Nuu-Chah-Nulth 37 1 0 1.32 38

México 52 0 0 - 52

Brasil 98 0 0 - 98

Jamaica 119 0 0 - 119

Total 306 1 0 307

Frecuencia genotípica:

306
Frec . ( CCR 5/CCR 5 )= =0.996
307

1
Frec . ( CCR 5/ Δ 32 )= =0.003
307

0
Frec . ( Δ 32/ Δ32 )= =0
307

Frecuencia alélica:

( ( 306 x 2 ) +1 )
Frec . ( CCR 5 )= =0.99
307 x 2

7. Población de Primates

País CCR5/CCR5 CCR5/ Δ32 Δ32/Δ32 % CCR5 Δ32 Nº de individuos

Chimpancé 66 0 0 - 66

Total 66 0 0 66

Frecuencia genotípica:

66
Frec . ( CCR 5/CCR 5 )= =1
66
 0
Frec . ( CCR 5/ Δ 32 )= =0
66

0
Frec . ( Δ32/ Δ 32 )= =0
66

Frecuencia alélica:

( ( 66 x 2 ) +0 )
Frec . ( CCR 5 )= =1
66 x 2

( ( 0 x 2 ) +0 )
Frec . ( ∆ 32 )= =0.00
66 x 2

Tabla 8

Frecuencias genotípicas y alélicas de las poblaciones

ORIENTE
EUROPA ASIA AFRÍCA OCEANÍA AMERICA PRIMATES
MEDIO

CCR5/
0.855 0.934 0.983 0.998 0.991 0.996 1
CCR5
Frecuencia

genotípica CCR5/Δ32 0.170 0.062 0.014 0.001 0.008 0.003 0

Δ32/Δ32 0.008 0 0.002 0 0 0 0

Frecuencia CCR5 0.94 0.96 0.991 0.99 0.99 0.99 1

alélica Δ32 0.093 0.031 0.009 0 0.004 0.001 0

N° INDIVIDUOS 788 385 900 598 364 307 66

Tabla 9

Distribución global de CCR5/Δ32

Fuente: Martinson, Jeremy, et al. (2000)

 8. Discusiones

En la tabla 8, podemos observar que las frecuencias mayores son del genotipo homocigoto CCR5, siendo

los principales Asia, África, Oceanía, América y en primates; a diferencia del homocigoto y heterocigoto

de Δ32, que presentan menor frecuencia siendo Europa el más alto, con 0.008 y 0.170, respectivamente.

Villatoro (2019), menciona que las poblaciones con genotipos CCR5/Δ32 y Δ32/Δ32 presentan una

esperanza de vida menor a comparación de la población con genotipo CCR5/CCR5, siendo la población

homocigota Δ32 con menor porcentaje a la heterocigota.

En las frecuencias alélicas, se observa que las poblaciones de África y de primates no presentan este alelo

con mutación o deleción, a diferencia de las demás poblaciones, que, si bien no presentaban una

frecuencia en su genotipo homocigoto, si la presentan en el genotipo heterocigoto por el cual su alelo

presenta una frecuencia menor, siendo igualmente el más alto Europa.

El presente estudio refleja una realidad de 1998, se encuentra un nuevo estudio del 2000 lo que representa

la tabla 9 donde se observa la similitud encontrada en resultados con la tabla de 1998. La población

europea sigue siendo la más alta en CCR5/Δ32. Con respecto a América al tomar una región más amplia

de estudio comparado con 1998 se halla un aumento en la frecuencia. También se observa el análisis de

Hardy Weinberg en la tabla 9, el único continente que no cumple con el valor de p>0.005 es Asia según el

artículo puede deberse que el valor fue tan bajo en algunas poblaciones que ocasiono un sesgo en el chi

cuadrado.

9. Conclusiones

El número de individuos en primates es muy pequeño, se puede inferir que estos resultados expuestos en

la tabla no reflejan la realidad de la especie estudiada.

En la región Europa se encuentra mayor número de individuos con la mutación homocigota Δ32.

En todos los continentes se observa que hay heterocigotos para la mutación Δ32.
La población estudiada por cada continente es muy baja por lo tanto aún no hay certeza de cuan presente

está la mutación en la población mundial y cómo la diversidad de las razas puede estar afectada por su

genotipo en esta mutación.

10. Referencias

Benkirane, M., Jin, D. Y., Chun, R. F., Koup, R. A., & Jeang, K. T. (1997). Mechanism of transdominant

inhibition of CCR5-mediated HIV-1 infection by ccr5Δ32. Journal of Biological Chemistry,

272(49), 30603-30606.

Centro Nacional de Biotecnología [CNB]. (2020). Identificado el papel del receptor ccr5 en la formación

de anticuerpos y memoria inmune tras la vacunación.

https://www.cnb.csic.es/index.php/es/cultura-cientifica/noticias/item/1745-identificado-el-papel-

del-receptor-ccr5-en-la-formacion-de-anticuerpos-y-memoria-inmune-tras-la-vacunacion

Ciencias Médicas. (s.f.). SIDA: El origen de una mutación genética.

http://www.medisur.sld.cu/index.php/medisur/announcement/view/1592

Ibarra M., C. (2001). Factores inmunitarios protectivos del huésped contra la infección por el vih-1 y la

progresión a sida: quimiocinas y sus receptores. [para obtener doctorado de la Universidad de

Barcelona]. https://www.tdx.cat/bitstream/handle/10803/2153/TOL35.pdf?sequence=1

Martinson, Jeremy J.; Hong, Lilya; Karanicolas, Rose a; Moore, John Pa; Kostrikis, Leondios Ga. (2000).

Distribución mundial del haplotipo protector de la enfermedad del VIH-1 CCR2-64I/CCR5-

59653T. SIDA.

https://journals.lww.com/aidsonline/fulltext/2000/03310/global_distribution_of_the_ccr2_64i_ccr

5_59653t.3.aspx

Oppermann, M. (2004). Chemokine receptor CCR5: insights into structure, function, and regulation.

Cellular signalling, 16(11), 1201-1210.

Palani, A., & Tagat, J. R. (2006). Discovery and development of small-molecule chemokine coreceptor

CCR5 antagonists. Journal of medicinal chemistry, 49(10), 2851-2857.

Sánchez de la T., M. (2007). Estudio de la Variabilidad genética del huésped con relación a la infección

por VIH y ritmo de progresión a sida, genes VDR y CCR5. [para obtener doctorado de la

Universidad de Lleida]. 46-48.

Villatoro, R. (2019). La mutación CCR5-Δ32/Δ32 protege contra el SIDA pero podría reducir la

esperanza de vida. https://francis.naukas.com/2019/06/08/la-mutacion-ccr5-%CE%B432-%CE

%B432-protege-contra-el-sida-pero-podria-reducir-la-esperanza-de-vida/