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SEMINARI DE BIOLOGIA MOLECULAR

1.-A partir de la siguiente secuencia:

5´―ATTGCTGAATCAA―3´

¿Cuál sería la carga eléctrica (número de cargas y signo) a pH 7, de la molécula de DNA


completa (doble hélice)? ¿Y si se modifica a un pH muy ácido la disolución en la que se
encuentra la molécula?

Esta cadena contiene 13 nucleótidos. El nucleótido que encontramos en el extremo 5’


(adenosina) tiene una carga de -2 ya que el fosfato solo forma un enlace éster con la ribosa de
dicho nucleótido. El resto de nucleótidos tienen carga de -1 ya que cada fosfato está formando
dos enlaces éster (enlace fosfodiéster); por tanto, la carga a pH 7 de una cadena de 13
nucleótidos es de -14 (el último fosfato está unido al azúcar del que proviene + al azúcar
anterior, no está libre, por tanto. Se pierde la segunda carga al unirse con el azúcar). Como la
molécula de DNA está formada por 2 cadenas con igual número de nucleótidos tendrá una
carga de -28.

Base nitrogenada + Sucre no tienen carga. ¡¡El fosfato del extremo libre 5’ tienen 2 cargas
negativas!! Per poder unir-se un altre nucleòtid ho ha de fer en forma trisfosfat, sempre
s’uneix a l’extrem5’

Si el pH se acidifica la alta concentración de H+ puede llegar a neutralizar las cargas negativas


de la molécula ya que los grupos fosfato se neutralizan a pH próximo a su pKa (aceptan esos
iones H+). La carga del ADN pues será neutra (de esta forma no se puede compactar con las
histonas)

2.-¿Cuáles son las principales funciones de los nucleótidos? Enuméralas y da un ejemplo de


cada función.

 Trasmiten información hereditaria.


 Función estructural: forman el ADN / ARN
 Reserva energética: almacenamiento de energía en los enlaces fosfato (ADP, ATP …)
 Segundos mensajero: AMPcíclico y CoenzimaA. Participan en las rutas de transducción
de señales de las células y en el transporte de grupos químicos respectivamente.
 Coenzimas: NAD+, NADP+, FAD+, FMN. Son moléculas transportadoras de sustancias.

3.-Considerando las siguientes secuencias de una de las cadenas de DNA, ¿cuál de estas
moléculas completas (doble hélice) se desnaturaliza más fácilmente?

 5´ ― ATGTATATGTGAT ― 3´
3’ ― TACATATACACTA ― 5’
 5´ ― GGGCCCCGTGGGA ― 3´.
3’ ― CCCGGGGCACCCT ― 5’
 5´ ― CCGGGAGCAGTGG ― 3´.
3’ ― GGCCCTCGTCACC ― 5’.

La pareja de bases A -T forma 2 enlaces por puente de hidrogeno, mientras que la pareja G-C
forma 3 puentes de hidrógeno. Así vemos que en la primera secuencia abundan más pares A-T
por lo que tendrá menos puentes de hidrógeno y será una secuencia más fácil de
desnaturalizar.

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Les burbujas de replicación se forman en secuencias de

4.- Defineix:

Gen: és una unitat d'informació en un locus d'àcid desoxirribonucleic (ADN) (un segment de
DNA) que codifica un producte gènic, ja sigui proteïnes o ARN. És la unitat molecular de
l'herència genètica, ja que emmagatzema la informació genètica i permet transmetre-la a la
descendència. Els gens es troben en els cromosomes, i cadascun hi ocupa una posició
determinada anomenada locus. El conjunt de gens duna espècie es denomina genoma.

Genoma: és la seqüència total d'ADN que té un organisme en particular. El genoma en


eucariotes comprèn l'ADN contingut al nucli cel·lular, organitzat en cromosomes, i el genoma
d'orgànuls cel·lulars, com els mitocondris i els cloroplasts.

5.-En la siguiente figura identifica y nombra los ácidos nucleicos que reconozcas. ¿Qué tipos
de RNAs conoces y en que procesos pueden estar implicados?

De izquierda a derecha y de arriba abajo:

1. DNA / RNA vírico


2. Ribozima (enzima de naturaleza no proteica)
3. DNA molde + primer RNA
4. Micro RNA
5. DNA
6. siRNA (small interference de RNA)
7. RNA mensajero (tiene una cabeza y una cola)
8. RNA de transferencia
9. RNA ribosómico

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miRNA y siRNA (por excelencia el mecanismo de defensa de los vegetales) son elementos
silenciadores, mecanismos de inhibición de la traducción. Se une al miRNA, recluta un
complejo proteico y los degrada. Son reguladores de la transcripción.

Son 2 moléculas de diferente origen. El miRNA está codificado por el mismo genoma.

6.-¿Cuál de los siguientes RNA no es normal de una célula?

a) RNA 1 (5´ ― AGUACAGAUCAU ― 5´).


b) RNA 2 (5´ ― AUCAUCUACGAT ― 3´).
c) RNA 3 (5´ ― UUUGCAGUCUGG ― 3´).

El 1 porque tiene 2 extremos 5, y el 2 porque tiene una timina

7.-¿Qué ventaja tiene el ATP frente al AMP como molécula transportadora de energía?

ATP presenta 2 enlaces fosfoanhídros y 1 enlace éster fosfórico, por lo que su hidrólisis liberará
más energía que al ser AMP que solo presenta el enlace éster fosfórico.

8.-El oligorribonucleótido 5´-GACTAGCCTA-3´ sólo podría formar una estructura de doble


hélice con: A

a. 5´-TAGGCTAGTC-3´.
b. 5´-CTGATCGGAT -3´.
c. 5´-CUGAUCGGAU-3´.
d. 5´-UAGGCUAGUC-3´.

9.-En la cèl·lula de la imatge, un nucleòtid d’una molècula de DNA ha patit una mutació. Si la
cèl·lula es divideix. Quantes cèl·lules mutants hi haurà a la 3ra generació? A la tercera
generació de 8 cèl·lules totals n’hi haurà 4 mutades, si està mutat només una fibra del
cromosoma. És a dir, una de les cromàtides serà normal i l’altre la mutada, per tant només la
meitat de les cèl·lules filles tindran la mutació. Fer un arbre de descendència*.

10.-Según las secuencias que aparecen a continuación y considerando que son moléculas de
DNA independientes y completas:

(1) 5’-TTAATTCCAATTAATT-3’

3
(2) 5’-GGGCCTTCCAAGGCCC-3’

¿cuál se podrá desnaturalizar más fácilmente?: Opción correcta: A

a. La secuencia (1) porque tiene menor número de puentes de hidrógeno.


b. La secuencia (2) porque tiene menor número de puentes de hidrógeno.
c. La secuencia (2) porque tiene más G y C que se unen más débilmente.
d. Ambas secuencias tienen el mismo número de nucleótidos por lo que se
desnaturalizarán igualmente.

11.-

Si se infecta por virus 1: DNA


beta (rojo) + proteínas beta
(rojo)

Si se infecta por virus 2: DNA alfa


(azul) + proteínas alfa (azul).

El material genético determinará


el tipo de proteínas.

12.-Nos dan la secuencia de las dos cadenas de un segmento de un gen y nos dicen
que puede contener zona codificante con la secuencia Metionina (Met) – triptofano
(Trp) – triptofano (Trp).

Siendo la secuencia:

1. 5’ CGGCCACCACATGGTAC 3’
2. 3’ GCCGGTGGTGTACCATG 5’

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Es cierto que:
a) Ninguna de las cadenas corresponde
b) La cadena 1 es la codificante
c) La cadena 2 es la codificante: Opción correcta
d) Ambas podrían ser la codificante
13.-Dado el siguiente ácido polinucleótido, razona si se trata de ADN o ARN y escribe
la secuencia de la cadena complementaria.

Se trata de ADN pues presenta una


base de timina.
Cadena complementaria: TCGA

14. Dado el siguiente esquema sobre la transcripción, explica lo siguiente:


a) ¿Cuál es la cadena molde y cuál la cadena codificante de ADN? Cadena
codificante: 1. Cadena molde: 2
b) ¿Contiene intrones el ARN de la figura? Sí, aún no se han eliminado los
intrones porque todavía no se ha producido el procesamiento. Hay
intrones tanto en eucariotas como en procariotas
c) ¿Es cierto que la cadena de ARN contiene la misma secuencia que la
cadena 2 cambiando Timinas por Uracilos? No, contiene la misma
secuencia que la cadena 1, la codificante (cambiando T por U), porque
se forma la complementaria a la cadena molde.
d) ¿Que modificaciones son necesarias para generar un RNAm? Se
necesitan en eucariotas mecanismos de control de la expresión génica:
Se eliminan intrones + Se añaden la cabeza y la cola.

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15. Nos dan la siguiente secuencia correspondiente a un pequeño gen sin intrones.
Este fragmento codifica para una pequeña proteína de 10 aminoácidos y contiene el
inicio y el final de la secuencia de aminoácidos.
Deduce razonadamente la secuencia de aminoácidos

5’ TTTTAC|ATG|GTT|CCC|TGA|GGG|ATG|GCC|CTG|TGC|ATG|CGC|CTC|ATG|CCC|CTG|
TGA|GCATGG 3’
3´AAAATGTACCAAGGGACTCCCTACCGGGACACGTACGCGGAGTACGGGGACACTCGTACC 5’

NH2 - Met-Ala-Leu-Cys-Met-Arg-Leu-Met-Pro-Leu-STOP - COOH


El missatger és tot, es a dir
transcriure seqüència d’ADN
completa (de 5’ a 3’) i desprès
només es traduiran els codons
necessaris.

16. Dada la siguiente secuencia de un fragmento de un gen correspondiente a una


proteína en el final de la zona codificante:
cadena molde: 5´GCGTCACCCGTGACA3´,
complementaria: 3´CGCAGTGGGCACTGT 5´
A partir de estos datos, indica la secuencia del extremo carboxiterminal de la
proteína

 5´G|CGT|CAC|CCG|TGACA3´: Arg-His-Pro-
 3´CGCAGT|GGG|CAC|TGT 5´: Cys-His-Gly-STOP (La correcta porque en la otra
nos queda un nucleótido sin codón)

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17. En la secuencia siguiente que codifica para un fragmento de una proteína de la
que se muestra la secuencia, se producen las 3 mutaciones que se muestran. Razona
cuál de ellas tendría consecuencias menos graves y cuál las más graves.

ATG|GCC|CTG|TGG|ATG|CGC|CTC|CTG|CCC|CTG
M A L W M R L L P L

 Mutación 1: ATG|GCC|GGC|TGT|GGA|TGC|GCC|TCC|TGC|CCC|TG inserción:


Met-Ala-Gly-Cys-Gly-Cys-Ala-Ser-Cys-Pro-TG: Las consecuencias más graves
pues camba toda la proteína a partir del nucleótido mutado

 Mutación 2: ATG|GCC|CTG|TGG|ATG|GGC|CTC|CTG|CCC|CTG mutación


puntual:
Met-Ala-Leu-Trp-Met-Gly-Leu-Leu-Pro-Leu: Solo cambia un aminoácido.

 Mutación 3: ATG|GCC|CTG|TGG|ATG|CGC|CTA|CTG|CCC|CTG mutación


puntual
Met-Ala-Leu- Trp-Met-Arg-Leu-Leu-Pro-Leu: Las consecuencias menos graves,
es una mutación silenciosa.
(las bases subrayadas y en negrita son las que se han substituido o insertado)

18.-Se aísla una porción de DNA correspondiente a un gen eucariota y otro


procariota. Se realiza un experimento de transcripción y traducción in vitro, y se
analizan las proteínas. Por una equivocación en el etiquetado de los tubos, no se
puede identificar a qué secuencia del gen corresponden los productos. Según estos
resultados, ¿podría ayudar a identificar qué productos corresponden al gen eucariota
y cuál al procariota?
GEN A GEN B
DNA 2.000 pb 1.200 pb
mRNA 300 bases 1.100 bases
Proteínas 80 aa 150 aa, 80 aa, 100 aa

El gen B es el procariota ya que un solo gen ha codificado 3 cadenas polipeptídicas, por


lo que es un operón. El gen A siendo eucariota podría codificar varias cadenas
polipeptídicas diferentes SI Y SOLO SI estamos hablando de tejidos diferentes.

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El gen A, además es el eucariota porque la eliminación de la región promotora baja el
nombre de bases del mRNA.
Recordar que los aminoácidos traducidos no pueden superar el número de los pares de
bases del mRNA

19.-Se aíslan y secuencian estas muestras de DNA bacteriano:


DNA 1: 5’ ― TACCTAGACAGTAG ― 3’
DNA 2: 5’ ― CCCGGAGCTCCGGG ― 3’
DNA 3: 5’ ― GCCGGTTACGACCG ― 3’
Para conocer si estas secuencias de DNA bacteriano tienen cierta homología con el
DNA humano, se hace una hibridación entre las muestras de ambas especies. Solo
una de las tres muestras de DNA bacteriano hibrida (complementa) con la siguiente
secuencia de DNA humano
5’ ― CGGTCGTAACCGGC ― 3’. ¿Podría decir a qué bacteria corresponde?
3’ ― GCCAGCATTGGCCG ― 5’ (DNA 3)

20.- Considerando el siguiente mRNA:


5’ ― GCGCUAUG|CCC|UUU|UCA|UAG|CCC|G ― 3’. Si se traduce en los ribosomas,
¿cuántos residuos de aminoácidos tendría el péptido resultante? ¿Cuál sería su

secuencia?
Met-Pro-Phe-Ser-STOP

21.-Aunque los intrones corresponden a material genético no codificante, se detecta


una mutación puntual en un intrón que afecta a la proteína normal, haciendo que
deje de ser funcional, y, además, sea de mayor tamaño. ¿Podría dar una explicación
a este hecho?
Si un intrón lleva una mutación puede no ser reconocido por las moléculas que lo
tienen que eliminar, por lo que la proteína que se forme será mutante.

22.-Fes un esquema de les principals diferències entre la replicació i la transcripció.

23.-Quines són les principals diferències entre la transcripció i traducció en


procariotes i eucariotes?

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24.-Fes un esquema de les principals característiques dels genomes eucariotes en
comparació amb els genomes procariotes.

25.-Quin és el mecanisme que permet compactar el DNA eucariota al nucli cel•lular?


Quines estructures es generen i quins elements tenen aquestes estructures?

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