UNIVERSIDAD TECNICA DE MACHALA

FACULTAD DE CIENCIAS AGROPECUARIAS

GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR
Integrantes:
- John Kevin Miranda
- Jimmy Andrés Jaramillo
- Jeremy Xavier Orellana
- Erick Fernando Ortiz
- Richard Godoy
TAREA 5
Caracterice la secuenciación del genoma de planta objeto de estudio O AVANCES.
Los proyectos de caracterización de un genoma son muy complejos y van más allá de
determinar un solo genoma, es decir, de un individuo, de una variedad o de una muestra
seleccionada. La información más relevante, a largo plazo, surge cuando se comienza a
comparar genomas de diferentes variedades, diferentes poblaciones silvestres, etc. Es lo que se
conoce como resecuenciaciones genómicas, esto permite apreciar la diversidad genómica de la
especie. Distintos estudios mostraron que la variabilidad genética entre las variedades
de Capsicum annuum con frutos dulces y grandes es muy restringida y se ha sugerido que la
pérdida de la diversidad durante la transición de poblaciones silvestres a cultivadas ocurrió
inclusive en áreas de cohabitación. Los bajos niveles de diversidad en la principal reserva
genética del chile es una de las razones que han limitado el mejoramiento genético, otra más
ha sido la falta de un genoma de referencia.

El genoma del chile fue determinado por dos grupos en forma paralela, un chile chino (Zunla-
1) y un chile mexicano silvestre (chiltepín). Al estudiar y comparar los genomas de un chile
chino (Zunla-1) y un chile mexicano silvestre (chiltepín) se obtuvo información relevante sobre
la especie.
El estudio confirmó que el genoma del chile es de tres a cuatro veces más grande que el genoma
de sus parientes cercanos, el jitomate y la papa, también secuenciados recientemente. Por
ejemplo, el tamaño del genoma del C. annuum variedad Zunla-1 es de 3.26 Gb (Gb es una
unidad de medida igual a mil millones de pares de bases (pb))., es decir, contiene 3 billones 260
millones de pares de bases. El genoma de esta variedad china resultó ser solo un poco más
grande que el genoma del chiltepín, considerado como posible progenitor silvestre de las razas
de chiles domesticados en Mesoamérica, que tiene un tamaño de 3.07 Gb. El tamaño del
genoma de chile resultó ser similar al tamaño del genoma humano (3.2 Gb) y un poco más
grande que el del maíz (2.3 Gb). En contraste, el tamaño de los genomas de jitomate y papa
están en el rango de 0.8 a 0.9 Gb. La comparación de estos genomas se puede observar en la
siguiente tabla:

El tamaño de un genoma no necesariamente significa que ese organismo tiene más genes que
otro con un genoma más pequeño. Por ejemplo, las tres solanáceas mencionadas (chile,
jitomate y papa) tienen un número de genes muy similar, alrededor de 35 a 39000, aun cuando
los genomas difieren mucho en tamaño.

El género Capsicum se caracteriza por tener acumulación de capsaicina, componente

responsable del característico sabor picante de algunos chiles. Este componente es exclusivo
del género Capsicum. En el genoma del chile se identificaron 51 familias de genes implicados
en la biosíntesis de capsaicina. Un análisis filogenético mostró que hay duplicaciones
en 13 familias de genes que son únicas en chile. La divergencia de secuencia entre las
duplicaciones de genes podría haber llevado a adquirir nuevas funciones, promoviendo la
evolución de la biosíntesis de capsaicinoides en Capsicum. La expresión de los genes
involucrados en esta biosíntesis se observó en tejidos específicos y en diferentes estados de
desarrollo del fruto. En chiles no picantes la expresión de estos genes es muy baja o
indetectable, y algunos otros presentan mutaciones importantes que evitan su expresión.
Conforme se sigan secuenciando y estudiando más genomas de solanáceas se podrá determinar
con mayor exactitud cómo y cuándo surgieron en Capsicum los genes para esta importante ruta
que ha hecho únicos a los chiles.

BIBLIOGRAFÍA

 Diana Trejo-Saavedra, R. R.-B. (2018). El genoma del chile (Capsicum annuum). Obtenido
de https://books.openedition.org/irdeditions/30919?lang=es