MAESTRÍA EN MICROBIOLOGÍA

CLASE 10:
PRUEBA DE HIPÓTESIS DE DOS MUESTRAS
RELACIONADAS: PRUEBA RANGO SIGNADO DE
WILCOXON
Se utiliza:
 Cuando no se cumplen los supuestos de normalidad para el uso
de pruebas paramétricas (Z, t-test) y no aplica el teorema del
límite central (tamaño de muestra pequeño, menor a 30)
 Cuando la variable está en escala ordinal (scores o puntajes).
 Análogo a la t-student para muestras pareadas.
Supuestos
La muestra es aleatoria y representativa.
Las variables debe medida al menos en escala
ordinal. Nota: Algunos investigadores indican
que se requiere al menos una escala
intermedia entre ordinal e interválica llamada
escala métrica ordenada.
Las diferencias son mutuamente
independientes.
La distribución de las diferencias es simétrica
(no necesariamente normal).
Hipótesis
Se basan en la mediana de la diferencia entre pares de observaciones.

Las hipótesis estadística pueden enunciarse así:

a) H0: MD = 0 b) H0: MD ≥ 0 c) H0: MD ≤ 0

HA: MD  0 HA: MD < 0 HA: MD > 0
Cálculos
• El cálculo de la prueba de rangos con signo implica los siguientes
pasos:
• Calcular las diferencias en los n pares de observaciones.
• Eliminar todos los valores cero. Sea n el número de valores distintos
de cero.
• Listar los valores absolutos de las diferencias en orden creciente, y
asignar a ellos los rangos 1,. . . , N (o la media de los rangos para los
empates).
• Colocar el signo de cada diferencia en el rango correspondiente.
• Sumar los rangos con signo mas (T+) y los rangos con signo menos (T-
).
• Para una prueba de dos colas se rechaza la H0 si T+ o T- es menor o
igual al valor critico T(2),n de la distribución T de Wilcoxon.
Ejemplo
 En microbiología es común realizar el conteo de bacterias y virus.

 Esta tarea puede requerir personal altamente entrenado.

 El conteo de bacterias y virus representa un porcentaje

importante del tiempo que invierte el personal de laboratorio
como parte de sus labores.

 En la actualidad existen software que pueden ayudar al personal

de laboratorio a realizar el conteo de bacterias y virus pero como
toda técnica se necesita una validación antes de usarlas de
manera rutinaria.

 Un investigador desea evaluar si los resultados obtenidos para

un conteo de bacterias mediante el método manual son
similares a los conteos obtenidos con el sofware ImageJ. Para
ello cuanta con 10 placas Petri donde se inocularon muestras de
agua de rio y se hizo el recuento de bacterias mesófilas aerobias.
Los datos se muestran a continuación:
Los datos
 Verificación del supuesto de normalidad para las diferencias

swilk dif
Shapiro-Wilk W test for normal data

Variable Obs W V z Prob>z

dif 10 0.83497 2.543 1.770 0.03839

Decisión: Se rechaza la H0 que indica que la muestra de diferencia procede de una población normalmente
distribuida
 Hipótesis estadísticas

H0: La distribución de los conteos manuales es

igual a la distribución de los conteos usando el
software (𝑀𝐷 = 0)

HA: La distribución de los conteos manuales es

diferente a la distribución de los conteos
usando el software (𝑀𝐷  0)
 Procedimiento

Asignación de rangos a las diferencias:

Decisión:
Valor critico: 𝑇0.05 2 ,10 =8
Dado que T- < T0.05(2),10 ,
H0 es rechazada (p < 0.05)
La aproximación Normal a la prueba de Wilcoxon para muestras
apareadas
Calcule la media y la desviación estándar del estadístico 𝑊𝑅 (suma de rangos menor)
usando las fórmulas:

donde t representa el número de veces que ocurre el i-ésimo valor.

Cuando n es mayor de 16, se usa aproximación Normal para hallar el

valor p de la prueba de Wilcoxon para muestras apareadas
 signrank manual = software

Wilcoxon signed-rank test

sign obs sum ranks expected

positive 8 51 27.5
negative 2 4 27.5
zero 0 0 0

all 10 55 55

unadjusted variance 96.25

adjustment for ties -0.75
adjustment for zeros 0.00

adjusted variance 95.50

Ho: manual = software

z = 2.405
Prob > |z| = 0.0162
Exact Prob = 0.0117

Decisión: Se rechaza la H0
 Analizando las diferencias

tabstat dif, statistics( mean sd median iqr count )

variable mean sd p50 iqr N

dif 3.3 3.056868 4.5 3 10

¿Se puede afirmar que

se cumple
razonablemente el
supuesto de simetría de
las diferencias?
 La Prueba del Signos es la alternativa a la Prueba de
rango signado de Wilcoxon cuando no se cumple el
supuesto de las diferencias poblacionales distribuidas
simétricamente alrededor de la mediana (෥ 𝝁𝑫 )
 signtest manual = software

Sign test

sign observed expected

positive 8 5
negative 2 5
zero 0 0

all 10 10

Two-sided test:
Ho: median of manual - software = 0 vs.
Ha: median of manual - software != 0
Pr(#positive >= 8 or #negative >= 8) =
min(1, 2*Binomial(n = 10, x >= 8, p = 0.5)) = 0.1094

Decisión: No se rechaza la H0
Conclusión: El método manual y el método basado en el uso del
software para el conteo de colonia tendrían una distribución de
resultados similares (𝑀𝐷 = 0) con una probabilidad igual a 0.1094
Ejemplo 2: ungüento antiinflamatorio
• Los investigadores desean probar la acción antiinflamatoria de dos
ungüentos A y B. Y para ello aplican los productos en cada una de
dos patas de 45 ratones a quienes se les ha inducido un proceso
inflamatorio.
• En este caso, la actividad antiinflamatoria se mide utilizando una
escala de 10 puntos, a menor puntaje, menor inflamación.

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variable | mean sd p25 p50 p75 min max N
---------+-----------------------------------------------------------------
dif | -1.356 3.031 -3 -1 1 -8 3 45
---------------------------------------------------------------------------
Diferencia = B - A

Hipótesis
H0: 𝑥෤ = 0 (la mediana de la diferencia es igual a 0)
Ha: 𝑥෤ ≠ 0 (la mediana de la diferencia es diferente a 0)

 Prueba de signo y rango de Wilcoxon

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. signrank armB=armA
Wilcoxon signed-rank test

sign | obs sum ranks expected

-------------+---------------------------------
positive | 18 338 510
negative | 22 682 510
zero | 5 15 15
-------------+---------------------------------
all | 45 1035 1035

unadjusted variance 7848.75

adjustment for ties -85.25
adjustment for zeros -13.75
----------
adjusted variance 7749.75

Ho: armB = armA

z = -1.954
19
Prob > |z| = 0.0507
Prueba del signo: Conclusión
• p=0.0507

• Decisión: Se rechaza la hipótesis nula

• Conclusión: Los ungüentos tienen diferente poder antiinflamatorio

(p=0.0507)

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. signrank dif=0
Wilcoxon signed-rank test Nota: La prueba de signos y la prueba de
signos y rangos se puede usar también
sign | obs sum ranks expected
para evaluar la hipótesis de una muestra
-------------+---------------------------------
contra un valor de referencia.
positive | 18 338 510
negative | 22 682 510
En este caso se compara la variable
zero | 5 15 15 diferencia (dif) se compara contra el valor
-------------+--------------------------------- de cero (0)
all | 45 1035 1035

unadjusted variance 7848.75

adjustment for ties -85.25
adjustment for zeros -13.75
----------
adjusted variance 7749.75

Ho: armB = armA

z = -1.954
21
Prob > |z| = 0.0507
Ejemplo 3: Cisticercosis
Se tienen las siguientes mediciones de cisticercos extraídos de una
muestra aleatoria simple de 15 ratones post-infección. Se desea
saber en base a los resultados si esta población de cisticercos tiene
una medida diferente de 5.05 mm/parásito (valor de referencia).

El promedio en nuestra muestra es 5.64 mm (DE: 1.99 mm)

La mediana en nuestra muestra es 5.8 mm (RIC: 4.64 – 6.74 mm)

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Prueba Wilcoxon: Pasos
1. Obtener las diferencias de los valores individuales y el valor de
referencia y sus signos. En el caso de dos muestras pareadas, sólo se
obtiene la diferencia y sus signos.
2. Ordenar los valores absolutos de las diferencias de menor a mayor
3. Asignar un rango a cada una de las diferencias que están en valores
absolutos
4. Identificar los rangos según el signo que corresponde
5. Sumar el valor de los rangos para los signos positivos y el valor de los
rangos para los signos negativos.

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Solución:
a.- Hipótesis (comparando contra un valor de referencia)
H0: 𝑥෤ = 5.05 (mediana igual a 5.05)
Ha: 𝑥෤ ≠ 5.05 (mediana diferente a 5.05)
b.- Cálculo del contraste T: (manualmente)
T = suma de positivos (ó T = suma de negativos)
c.- Cálculo de zT
Con:
n(n  1) n(n  1)(2n  1)
μT  σT 
4 24
T  μT
Luego : zT 
σT 24
Medición Dif (xi-5.05) Rango (|dif|) Signo y rango (dif)
Suma positivos (+) = 86
4.91 -0.14 1 -1
4.1 -0.95 7 -7
Suma negativos (-) = 34
6.74 1.69 10 10
𝑇 − 𝜇𝑇
7.27 2.22 13 13 𝑍𝑇 =
7.42 2.37 14 14 𝜎𝑇
7.5 2.45 15 15
𝑛(𝑛 + 1) 15(16)
6.56 1.51 9 9 𝜇𝑇 = = = 60
4.64 -0.41 3 -3
4 4
5.98 0.93 6 6
3.14 -1.91 12 -12 𝑛(𝑛 + 1)(2𝑛 + 1)
𝜎𝑇 = = 17.6
3.23 -1.82 11 -11 24
5.80 0.75 5 5
6.17 1.12 8 8 86 − 60
5.39 0.34 2 2 𝑍𝑇 = = 1.477
17.6
5.77 0.72 4 4 25
Prueba de Wilcoxon (Stata)
. signrank med=5.05

Wilcoxon signed-rank test

sign | obs sum ranks expected

-------------+---------------------------------
positive | 10 86 60
negative | 5 34 60
zero | 0 0 0
-------------+---------------------------------
all | 15 120 120

unadjusted variance 310.00

adjustment for ties 0.00
adjustment for zeros 0.00
----------
adjusted variance 310.00

Ho: medida = 5.05

z = 1.477
Prob > |z| = 0.1398 26
Prueba de Wilcoxon
• Decisión: No se rechaza la H0

• Conclusión: No hay suficiente evidencia para afirmar que la

mediana del diámetro de los cisticercos es diferente de 5.05 mm

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