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Cisneros Niño, José Luis Copa Patiño, Juan Manuel
c/ Arroyo González-Triguero,
de Fontarrón, Raquel R. Gragera Martínez, Yolanda
271, 28030 Madrid
Loarce Tejada, Luis Andrés López Fernández, José Antonio
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Impreso en España–Printed in Spain
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Autores
6
Índice interactivo*
Interactivo*
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* Hacer click sobre los títulos de capítulos y epígrafes de primer nivel para ir al destino.
Prólogo .............................................................................................................................................................. 21
8
Índice
9
Métodos en biociencias
10
Índice
11
Métodos en biociencias
12
Índice
13
Métodos en biociencias
14
Índice
15
Métodos en biociencias
16
Índice
17
Métodos en biociencias
18
Índice
Índice
Índice de
de términos
materias ........................................................................................................................................... 393
393
19
Prólogo
Los aspectos técnicos y metodológicos de muchas caso los fundamentos y, a la vez, los rasgos diferen-
de las disciplinas que conforman el campo de las bio- ciales de cada método o de cada técnica.
ciencias se tratan de forma marginal en la mayoría de En la medida de lo posible se han incluido explica-
los manuales de dichas disciplinas. Es bastante usual ciones de tipo constructivo y operativo de numerosos
la existencia de algún capítulo al principio o de algún dispositivos, pues entendemos que el conocimiento
epígrafe al final del libro donde se abordan estos as- del funcionamiento de los dispositivos es esencial para
pectos, o incluso la presencia de notas al margen en entender y valorar los resultados que de ellos se ob-
aquellos apartados que necesitan incluir alguna ex- tienen. Además, en algunos capítulos se han incluido
plicación técnica para entender el tema tratado. Es epígrafes que, a nuestro juicio, podían ser interesan-
muy difícil encontrar manuales dedicados a ofrecer tes, bien por su uso rutinario, bien por su impacto
un tratamiento integral de los muy diversos métodos actual o por su posible aplicación futura; entre otros,
y técnicas en el campo de las biociencias. Este hecho los epígrafes dedicados a la fotografía digital, la genó-
es especialmente sorprendente cuando en muchos de mica forense, la farmacogenómica o la optogenética
los programas de grado incluidos en este campo exis- son buen ejemplo de todo ello.
ten asignaturas dedicadas al estudio de los métodos Este es nuestro primer intento de escribir un
y técnicas que les son propios. Por todo ello, nuestro libro que aborde de forma integral los aspectos téc-
objetivo ha sido incluir, en un único libro, los méto- nicos y metodológicos en el campo de las biociencias;
dos y técnicas que consideramos fundamentales en el es, por ello, susceptible de mejora. Nada nos agrada-
campo de las biociencias. Existen manuales muy es- ría más que recibir comentarios y críticas de nuestros
pecíficos para casi cada uno de los epígrafes de los lectores, que seguro nos servirán para ir mejorando
capítulos de esta obra, por ello no hemos pretendido esta obra en futuras ediciones.
hacer un estudio exhaustivo de cada aspecto tratado;
al contrario, nuestro objetivo ha sido ofrecer en cada Los autores
1.
Fraccionamiento celular
Sergio Ciordia
Figura 1.1: Estructura molecular de la pared celular bacteriana. En las bacterias Gram(+) la pared celular contiene una capa gruesa de
peptidoglicano además de ácidos teicoicos, que se unen al peptidoglicano y a la membrana citoplasmática. En las bacterias Gram(-) la
capa de peptidoglicano es relativamente �ina y se encuentra rodeada por una segunda membrana lípida exterior que contiene lipopolisa-
cáridos y lipoproteínas.
del análisis de sus componentes intracelulares (áci- el EDTA, que atrapa los iones metálicos divalentes
dos nucleicos, proteínas, etc.). Este primer paso (Ca2+ y Mg2+) que se requieren para la actividad de
conlleva la ruptura de las células o tejidos para ob- algunas de estas enzimas; o la presencia de iones
tener un lisado celular donde el componente de magnesio, en el caso del retículo endoplasmáti-
interés se encuentre en condiciones que permitan co, que ayudan a estabilizar la interacción entre las
su aislamiento. membranas y los ribosomas.
Por estos motivos, el medio y la técnica de ho-
mogeneización deben elegirse siempre en función
1.2.1. Medio de homogeneización del sistema biológico de interés.
Para preparar las células o tejidos para el fracciona-
miento celular, primero se deben suspender en un 1.2.2. Métodos de homogeneización
medio controlado. Este medio suele estar compues-
to de una solución isotónica –de sales o azúcares–, Una vez que las células o tejidos se encuentran sus-
con el pH regulado y a baja temperatura (general- pendidos en la solución isotónica, el proceso de
mente a 4 ºC) que previene de la ruptura de las homogeneización propiamente dicho se inicia con
membranas celulares por ósmosis y mantiene la in- la ruptura de la pared celular, de la membrana plas-
tegridad de los orgánulos y enzimas intracelulares mática o de ambas. La di�icultad de esta ruptura
durante el proceso. Habitualmente se emplea una depende principalmente de la naturaleza del mate-
solución isotónica de sacarosa 0.25 M tamponada a rial biológico. Así, de mayor a menor di�icultad de
un pH de 7.4-7.8. rotura se tiene:
Además de ser termolábil, este material bioló-
gico puede ser degradable por las propias proteasas Esporas > Gram(-) > Levaduras > Células
de degradación intracelular por lo que, para pre- vegetales > Gram(+) > Hongos > Células animales
servar las propiedades funcionales y estructurales
La presencia de pared celular en ciertos organismos
de las fracciones celulares de interés, suele ser ne-
(plantas, hongos, bacterias, algas, arqueas y levadu-
cesaria la presencia de aditivos en el medio de
ras) les con�iere una mayor resistencia a la rotura
homogeneización. Normalmente, para evitar dicha
y se requerirán métodos de homogeneización más
degradación se suele añadir al medio algún inhibi-
agresivos para romper la estructura de su pared ce-
dor de proteasas (por ejemplo, el reactivo PMSF o
lular (Figura 1.1).
�luoruro de fenilmetilsulfonilo). También, depen-
diendo del sistema biológico, puede ser necesaria la En general, esto se consigue empleando pro-
presencia de algún aditivo particular, por ejemplo, cedimientos mecánicos o químicos (generalmente
para el aislamiento de mitocondrias o ácidos nu- suaves o moderados), denominados de homogenei-
cleicos, suele añadirse algún agente quelante como zación (Cuadro 1.1).
24
Fraccionamiento celular
Cuadro 1.1: Métodos de homogeneización. Principales métodos de homogeneización atendiendo al mecanismo de acción. Estos métodos
pueden ser mecánicos, químicos o enzimáticos. Los métodos mecánicos se caracterizan porque son más agresivos que los no mecánicos.
Homogeneizador de esferas Trituración con bolas de acero Fuerte Células animales y vegetales
o vidrio
Mecánicos Homogenizador de aspas Mezclador con cuchillas Moderado Tejidos duros y blandos
Estos métodos rompen las paredes y mem- la rotura, la fragilidad de sus componentes y del ob-
branas celulares de forma controlada –lo menos jetivo del experimento.
posible– pero lo su�iciente para conseguir el tras-
vase al medio de todo el material contenido en las Métodos de homogeneización mecánicos
mismas.
Estas técnicas de homogeneización pueden di- Estos métodos implican someter el material bioló-
vidirse en dos grupos atendiendo al fundamento del gico a una deformación por acción mecánica tipo:
proceso de rotura celular, que puede ser producido fricción, colisión o presión; tanto en fase sólida
por: como líquida (Cuadro 1.1). Se pueden emplear a pe-
queña o gran escala (industrial). Estos métodos son
— Métodos mecánicos: molienda, picadura, más agresivos que los no mecánicos debido princi-
trituración, por presión, ciclos de conge- palmente a la generación de calor, que puede afectar
lación-descongelación, sonicación, etc. a los componente celulares de interés.
— Métodos químicos y bioquímicos: choque Entre estos destacan:
osmótico, permeabilización con disolven-
tes o detergentes, digestión enzimática, — Mortero con mazo. Es el método de rup-
etc. tura celular más convencional. Se basa
en la deformación de las células por fric-
La elección de la técnica de homogeneización de- ción (Figura 1.2a). Puede emplearse con
penderá de la naturaleza del material biológico materiales abrasivos como cuarzo, vidrio
(tejido duro o blando, cultivo celular, suspensión de molido, arena o materiales silíceos. La
bacterias, organismo vegetal, etc.), su resistencia a molienda puede realizarse en fase sólida
25
Métodos en biociencias
Figura. 1.2: Mortero con mazo (A) y homogeneizador Potter-Elvehjem (B). En (A), las células se rom-
pen por la fricción debida a la molienda con el mazo del mortero. En el caso de (B), el movimiento de
vaivén del émbolo rotatorio obliga al material biológico a penetrar en el espacio entre la pared del
tubo y el émbolo donde se producen las fuerzas de cizalladura que producen la ruptura celular.
–sobre el material previamente congela- dos como cerebro e hígado (por su acción
do en nitrógeno líquido–, o bien en fase suave).
líquida –sobre la masa celular suspendi- — Homogeneizador de esferas. Las células
da en un volumen de tampón y mezclada se rompen por la acción de choque de las
con medio moledor (en ratio 1:1 v/v). La esferas de vidrio o acero con el material
fricción sobre las células termina rom- biológico (Figura 1.3a).
piéndolas pero además genera calor que Las esferas pueden ser de distinto diá-
puede afectar a los componentes ce- metro dependiendo de la naturaleza del
lulares de interés como las proteínas. material:
Actualmente existen homogeneizadores
más so�isticados que emplean el mismo • 0.1 mm, para bacterias y esporas;
principio, pero que permiten controlar el • 0.5 mm, para hongos, levaduras, al-
nivel de fricción y la temperatura del pro- gas y células animales; y
ceso, son conocidos como potters. • 1-2.5 mm, para tejido (cerebro, mús-
— Homogeneizador de émbolo y tubo. Tam- culo, hojas, etc.).
bién llamado Potter o Potter-Elvehjem. En
este caso, las células se rompen con la La cantidad de esferas debe ser al menos el
ayuda de un émbolo rotatorio de te�lón 50% del volumen total (biomasa: líquido).
que se ajusta perfectamente a las paredes
de un tubo de cristal (Figura 1.2b). El te- — Homogeneizador de aspas. También lla-
jido debe estar previamente disociado y mado Polytron. Dispone de un sistema
suspendido en un volumen de medio en de cuchillas que giran a un número ele-
exceso (4-10 veces). El émbolo, además vado de revoluciones por minuto (rpm)
de rotar, realiza simultáneamente un mo- creando las fuerzas de cizalladura en un
vimiento de vaivén de arriba-abajo que volumen reducido (Figura 1.3b). Este mé-
obliga al material biológico a penetrar todo es más agresivo que los anteriores y
en el espacio entre el tubo y el émbolo se suele emplear con tejidos duros.
donde se producen las turbulencias del lí- — Homogeneizador de alta presión. El más
quido y las fricciones sobre el tejido que habitual es la Prensa de French. En este
producen la ruptura celular. La separa- caso, el material biológico se introduce
ción entre el émbolo y la pared de cristal en una cámara y se somete a altas pre-
está calibrada (0.1-0.15 mm) para pro- siones (~ 500 atm) con la ayuda de un
ducir homogeneizados con un tamaño de émbolo (Figura 1.4a). La presión produci-
partícula determinado. Se suele emplear da obliga a la suspensión a pasar primero
para el fraccionamiento de tejidos blan- a través de un cilindro de diámetro gran-
26
Fraccionamiento celular
Figura 1.4: Homogeneizador de alta presión (A) y homogeneizador ultrasónico (B). El material biológico se
somete a altas presiones y al atravesar una zona de reducción drástica del diámetro, se producen las fuerzas de
cizalladura que terminan rompiendo la célula (A). En (B), la aplicación de ondas de ultrasonidos dentro de la
suspensión celular produce en el medio un fenómeno de «cavitación gaseosa» que permite la ruptura celular.
27
Métodos en biociencias
Figura 1.5: Flujo osmótico en medio hipotónico (A), efecto osmótico sobre las células (B) y reacción de saponi�icación
debido al tratamiento alcalino (C). En una solución hipotónica (A), la concentración molar de solutos es menor que en
el interior de la célula, las células se hinchan por la entrada de agua y algunas terminan estallando como los eritrocitos.
En las células vegetales, debido a la pared celular, aumenta su turgencia pero no revientan (B). En un medio alcalino, los
lípidos de la bicapa lipídica se saponi�ican descomponiéndose en jabón y glicerina (C) que produce la ruptura de la mem-
brana celular.
28
Fraccionamiento celular
29
Métodos en biociencias
Figura 1.6: Proceso de permeabilización y ruptura celular por disolventes y detergentes (A); principales detergentes
empleados para lisar las células (B); digestión enzimática del peptidoglicano con lisozima (C). Los disolventes orgánicos
y detergentes a bajas concentraciones producen la permeabilización de la célula (esta sigue metabólicamente activa)
mientras que a altas concentraciones tiene lugar la ruptura celular por la disolución lipídica (A). Los principales de-
tergentes utilizados pueden ser iónicos (aniónicos y catiónicos) o no-iónicos (B). La lisozima degrada la pared celular
bacteriana al hidrolizar los enlaces -1,4 entre los residuos de ácido N-acetilmurámico y N-acetil-D-glucosamina del
peptidoglicano (C).
los peptidoglicanos (en bacterias), la ce- los métodos mecánicos descritos, permite garanti-
lulosa (en células vegetales) o la quitina zar la correcta extracción del componente de inte-
(en hongos y levaduras), que se hidroli- rés y las condiciones más idóneas que permitan su
zan con enzimas tales como la lisozima aislamiento posterior.
(Figura 1.6c), celulasa o la combinación
de quitinasa, glucanasas y mananasas res-
pectivamente. La susceptibilidad a esta 1.3. Filtración
técnica es relativa y depende principal-
mente del tipo celular. Así, por ejemplo,
Como resultado de la homogeneización, queda una
son más susceptibles a la acción de la li-
pasta �ina constituida de los restos celulares, orgá-
sozima las bacterias Gram(+) mientras
nulos y demás componentes intracelulares por se-
que las Gram(-) requieren además –de li-
parado denominada homogeneizado.
sozima– EDTA como agente quelante que
Habitualmente después de la homogeneización
ayuda a desestabilizar la membrana celu-
se suele realizar un paso de �iltración «gruesa» para
lar. Es un método suave, a la vez que muy
eliminar los restos del tejido (principalmente tejido
selectivo, pero de alto coste económico
conjuntivo) de las paredes celulares, fragmentos de
debido a las enzimas, lo que di�iculta su
membranas y células parcialmente rotas o intactas
uso a gran escala.
que no hayan sido desintegradas. Generalmente se
En la actualidad, para facilitar el lisado celular y la suele aplicar a grandes volúmenes.
extracción del contenido intracelular durante la ho- La �iltración es una técnica que permite se-
mogeneización, se suele emplear una combinación parar los sólidos presentes en una fase líquida en
de agentes caotrópicos (urea, tiurea y/o cloruro función de su tamaño de partícula, haciendo pasar
de guanidinio), detergentes (SDS o Triton X-100), esta a través de un medio poroso (denominado me-
agentes reductores (DTT o TCEP) e inhibidores de dio �iltrante) que permite separar dichos sólidos, y
proteasas. La utilización de estos agentes, junto con que se dispone sobre un dispositivo conocido como
30
Fraccionamiento celular
Figura 1.7: Sistema de �iltración con embudo Büchner (A); tipos de embudos y �iltros de papel utilizados (B).
El homogeneizado atraviesa el �iltro favorecido por la succión. Las partículas demasiado grandes quedan re-
tenidas en la parte superior del �iltro mientras que las más pequeñas pasan con el solvente (A). Tipos de �iltros:
Hirsch (arriba) y Büchner (abajo) (B).
soporte de �iltración, siendo el más elemental un (embudo de Hirsch) (Figura 1.7b). Normalmente
embudo de �iltración (Figura 1.7a). en este tipo de �iltración, y antes de pasar el homo-
La separación se realiza gracias a que los poros geneizado, se suele preparar una «cama especial»
del medio �iltrante son más pequeños que las partí- de �iltrado (de 2-3 mm de espesor) para retener las
culas a separar, de forma que en el medio �iltrante partículas más �inas que comúnmente escapan o
queda retenido el sólido que se desea separar del tupen el papel de �iltro. Este lecho está compuesto
líquido que lo atraviesa, que se denomina �iltrado. por una sustancia conocida como diatomita o tierra
En la práctica habitual de un laboratorio se em- de diatomeas que es un material inerte �inamen-
plean tres medios porosos: papel de �iltro (cónico te dividido de esqueletos silícicos de ciertas algas
o plano), placas �iltrantes de material cerámico, y unicelulares marinas. Esta técnica es útil para eli-
membranas de �iltración. La elección de uno u otro minar impurezas sólidas de una solución de interés
dependerá de la aplicación. aunque sean muy �inas, pero no permite recolec-
tar el sólido �iltrado, el cual evidentemente resulta
El paso del líquido a través del medio �iltran-
mezclado con la diatomita imposibilitando su ex-
te se puede conseguir de dos modos distintos: tracción.
�iltración por gravedad y �iltración por vacío o por
succión.
La �iltración por gravedad es la técnica más sen- 1.4. Fraccionamiento celular:
cilla de �iltrado, consiste en dejar escurrir el líquido centrifugación
por gravedad a través de un papel de �iltro colocado
apropiadamente en un embudo que retiene los sóli- El objetivo �inal de todo fraccionamiento subcelular
dos. Si el volumen a �iltrar es relativamente grande es aislar en fracciones puras o enriquecidas los dife-
(10 mL o más) se emplea un embudo con papel de rentes componentes celulares con sus propiedades
�iltro. Para pequeños volúmenes es más adecuado funcionales y sus características morfológicas intac-
usar una pipeta Pasteur con un poco de algodón o tas. Dado que no hay una célula prototipo, tampoco
de lana de vidrio taponando la salida. existe un método de fraccionamiento general.
La �iltración por vacío o por succión es la más Tras la etapa de homogeneización, en el medio
habitual. Permite acelerar el �iltrado por gravedad hay una mezcla de restos de tejido no homoge-
aplicando vacío mediante una bomba por debajo neizado, de las paredes celulares, fragmentos de
del �iltro, de forma que se favorece el paso del �luido membranas y células parcialmente rotas o intac-
a través del medio �iltrante. En este tipo de �iltra- tas que en parte son eliminados con el paso previo
ción, el medio �iltrante se coloca sobre un embudo de �iltración. Pero además contiene partículas sub-
de polipropileno o porcelana agujereada que puede celulares como núcleos, mitocondrias, lisosomas,
ser de fondo plano (embudo de Büchner) o cónico peroxisomas, retículo endoplasmático liso (REL) y
31
Donde f0 y f representan la fricción de una esfera perfecta y una partícula
Métodos en biociencias
biológica, respectivamente; η la viscosidad; y ρp y ρm la densidad de la partícula y
del medio respectivamente. Del análisis de la ecuación anterior es fácil observar
El objetivo final de todo (RER),
fraccionamiento
ribosomas subcelular esque la velocidad
aislar en fraccionesde sedimentación
(radio, puras
densidado y forma); depende de tres tipos de parámetros: (1) las
rugoso
enriquecidas losEn diferentes componentes
y material no particulado.
propiedades
celulares con susintrínsecas
propiedades de partícula (2) las características
(radio, densidad ydel forma); (2) las
esta etapa se obtienen las distintas fracciones medio (densidad y viscosidad); y (3) las condiciones
funcionales y sus características morfológicas características
intactas. Dado que del no haymedio una(densidad y viscosidad); y (3) las condiciones
subcelulares, reagrupando las partículas en función experimentales de velocidad angular y radio de giro.
célula prototipo, tampoco existe un de
de sus coe�icientes método experimentales
de fraccionamiento
sedimentación y mediante general.
las de velocidad angular y radio de giro.
En un medio de experimentación determina-
técnicas de centrifugación. un do,
En mezcla la velocidad
medio de sedimentacióndeterminado,
de experimentación de una partículala velocidad de
Tras la etapa de homogeneización, en el medio hay una de restos
sedimentación debiológica
una es el producto
partícula biológica dees laelaceleración
producto deangular
la aceleración angular
de tejido no homogeneizado, de las paredes celulares, fragmentos depor membranas
una constante que se designa como coe�iciente
1.4.1. Centrifugación:
y células parcialmente rotas o intactas principios
que en parte por
sonuna
básicos constante
eliminados conqueel se
paso designa como coeficiente de sedimentación (S), que
de sedimentación (S), que depende de sus propie-
depende
previo de filtración. Pero además contiene partículas subcelulares como de sus propiedades
núcleos, moleculares. De tal forma que,
La centrifugación es una técnica de separación de dades moleculares. De tal forma que,
mitocondrias, lisosomas, peroxisomas, retículo endoplasmático
muestras que consiste en la utilización de las fuer- liso (REL) y
rugoso (RER), ribosomas y material
zas centrífugas no particulado.
generadas En esta
en un rotor que etapa
gira, se obtienen las 2𝑟𝑟 ! (𝜌𝜌! − 𝜌𝜌! )
distintas fracciones 𝑆𝑆 = [1.2]
parasubcelulares, reagrupando
separar las partículas las partículas
en función de sus pro- en función de sus 9𝜂𝜂 (𝑓𝑓 𝑓𝑓! )
coeficientes de sedimentación y mediante las técnicas
piedades de sedimentación. de centrifugación.
Dichas propiedades
dependen de distintos factores entre los que se in- El coe�iciente de sedimentación es una constante
cluyen:principios
1.4.1. Centrifugación: tamaño, densidad
básicos y forma. Sin embargo, El coeficiente de sedimentación
característica de cada orgánulo es una oconstante
macromoléculacaracterística de cada
-1
tanto la forma como la densidad dependen en gran
orgánulo o macromolécula
(Cuadro 1.2)(Tabla 1.2) y sus
y sus unidades son unidades
segundos son
-1
, perosegundos
se , pero se
La centrifugaciónmedida
es unadetécnica de separación
la composición de muestras
de la solución en la
la queque consiste en la -13 -13
utiliza unidad utiliza
Svedberg (S) que
la unidad equivale
Svedberg (S) aque10equivale
segundos (1S = 10 s). De
a 10-13
utilización de las están
fuerzas centrífugaslas
suspendidas generadas en Las
partículas. un rotor que gira, segundos
partículas para separar -12
esta manera, una partícula(1S cuyo= 10 s). De esta
coeficiente
-13
de manera, una partí-
sedimentación es medido en 10 s
las partículas en función fundamentalmente
se separan de sus propiedades según ladevelocidad
sedimentación.
-13 Dichas
cula cuyo coe�iciente de sedimentación es medido
= 10x10 s.
de sedimentación
propiedades dependen de distintos(centrifugación
factores entrediferencial),
los que se el incluyen:
en 10tamaño,
-12
s = 10x10-13s.
tamaño (centrifugación zonal) o la densidad
densidad y forma. Sin embargo, tanto la forma como la densidad dependen en (cen-
gran medida de trifugación
la composiciónisopícnica).
de la solución en la que están suspendidas Grupo las Biomolécula S (Svedberg)
partículas. Las partículas se separan fundamentalmente según la velocidad de
Cuadro 1.2: Coe�icientes de sedimentación de algunas bio-
Coeficiente de diferencial),
sedimentación Proteínas Mioglobina 1.82
sedimentación (centrifugación el tamaño (centrifugaciónmoléculas. zonal) oCoe�icientes
la de sedimentación estandarizados a 20 ºC
y en medio acuoso de algunasHemoglobina
biomoléculas y orgánulos subcelula-4.1
densidad (centrifugación
El término isopícnica).
sedimentación designa el transporte y res en unidades de sedimentación (S). 1S = 10-13s.
agrupación de las partículas en solución bajo la ac- Ferritina Hasta 63
Coeficiente de sedimentación
ción de un campo centrífugo. Ácidos nucleicos RNAt 4
El término sedimentación designa el
Los principios transporte
básicos y agrupación
de la teoría de sedimen-de las partículas
Grupo en Biomolécula S (Svedberg)
Virus Bacteriofago-T7 30
solución bajo la acción
tación de un campo
derivan de la centrífugo.
ley de Stokes, que fue creada Proteínas Mioglobina 1.82
para medir la sedimentación de una esfera en un Orgánulo-célula Virus mosaico del tabaco 180
Los principios básicos de la teoría de sedimentación derivan de la ley de Hemoglobina 4.1
campo gravitacional, para así mostrar que la velo-
Stokes, que fue cidad
creadadepara mediralcanza
la esfera la sedimentación de una esfera
un valor constante y la en un campo Subunidad ribosomal eucariota
Ferritina Hasta 63
40, 60
Peroxisomas 4 x 103
Donde f0 y f representan la fricción de una esfera
perfecta y una partícula biológica, respectivamente; 13 Mitocondrias 1 x 104 – 7 x 104
la viscosidad; y p y m la densidad de la partícu-
Cloroplastos 105 – 106
la y del medio respectivamente. Del análisis de la
ecuación anterior es fácil observar que la velocidad Núcleos 106 – 107
de sedimentación depende de tres tipos de paráme- Células 107 – 108
tros: (1) las propiedades intrínsecas de partícula
32
Fraccionamiento celular
La fuerza centrífuga que se aplica sobre la En las ultracentrífugas, debido a la velocidad extre-
suspensión de partículas es una fuerza relativa, ya ma (hasta 100.000 rpm), es necesario un alto vacío
que está referida a la fuerza del campo gravitato- en la cámara de la centrífuga para evitar el calenta-
rio que también actúa. Por ello se utiliza el término miento del rotor y de la muestra.
de fuerza centrífuga relativa (FCR o g). La FCR está
relacionada directamente con la velocidad de cen-
trifugación en revoluciones por minutos (rpm) y la
distancia de las partículas al eje de rotación (r, en Cuadro 1.3: Tipos de centrífugas. Principales tipos de centrifugas
cm) de acuerdo a la ecuación: en función de la velocidad de rotación y su aplicación para el ais-
lamiento y puri�icación de un determinado componente subcelular.
FCR= 1.118 x 10-5 x r x rpm2 [1.3]
Baja Alta Ultra
Así, la fuerza centrífuga aumenta a medida que velocidad velocidad
las partículas bajan por el tubo de centrifugado.
Normalmente, a mayor fuerza centrífuga menor Velocidad máxima 13 28 100/150
rpm x103
tiempo de separación, sin embargo, la centrifu-
gación genera fuerzas hidrostáticas dentro de la Materiales
solución, que a velocidades extremadamente altas
Bacteria Si Si Si*
pueden destruir algunos componentes subcelulares
como por ejemplo, los ribosomas. Células animal/ Si Si Si*
vegetal
Los parámetros a tener presentes en cualquier
centrifugación, que determinarán las condiciones Núcleos Si Si Si*
de la misma son:
Precipitados Parcial Total Si*
— Volumen de solución a centrifugar, que Fracciones de Parcial Total Si
determinará el tipo de tubos y rotores a membrana
emplear.
Ribosomas/Polisomas - - Si
— Naturaleza química de la solución, que
determinará la naturaleza del tubo a em- Macromoléculas - - Si
plear (generalmente de vidrio o plástico). Virus - Total Si
— Diferencial de densidad entre la partícu-
* No utilizado
la a sedimentar y la densidad del medio * No utilizado frecuentemente
frecuentemente
en el que se encuentra. En general cuan-
to mayor sea esa diferencia antes (menor
tiempo y menor fuerza de aceleración)
sedimentará. Cuando el diferencial es
Los diferentes tipos de centrífugas desarrollados se
muy pequeño se pueden aplicar centrifu-
utilizan en diferentes aplicaciones (Cuadro 1.3):
gaciones de cientos de miles de g durante
horas. — Centrífugas de mesa o baja velocidad: se
utilizan para separar partículas grandes
Instrumentación como células o precipitados de sales in-
solubles.
Las centrífugas son instrumentos que permiten — Centrífugas de alta velocidad: se emplean
someter las muestras a intensas fuerzas que pro- en la separación de fracciones celulares
ducen la sedimentación rápida de las partículas que aunque no a su�iciente velocidad para ais-
tienen una densidad mayor que la del medio en el lar ribosomas, proteínas o virus.
que se encuentran. En general se clasi�ican en fun- — Ultra-centrífugas: capaces de separar par-
ción de los rangos de aceleración a que se someten tículas de pequeño tamaño. Hay dos tipos:
las muestras: centrífugas de mesa (de pocas g a
aproximadamente. 3.000 g), centrífugas de alta ve- a) Analíticas con las que obtener
locidad (de 2.000 g a 20.000 g) y ultracentrífugas datos precisos de propiedades de
(de 15.000 g a 600.000 g). sedimentación.
En las centrífugas se suele controlar la b) Preparativas para puri�icar
temperatura de la cámara para evitar el sobrecalen- partículas de bajo coe�iciente de
tamiento del homogeneizado debido a la fricción. sedimentación.
33
Métodos en biociencias
Figura 1.8: Distancia del radio efectivo (reff) según el rotor (A). Tipos de rotores (B). Cuanto mayor es el radio efectivo mayor es la
velocidad de sedimentación de la partícula. Existen tres tipos de rotores: de ángulo �ijo, basculantes y verticales (B).
34
Fraccionamiento celular
ción posterior. Por consiguiente, suele utilizarse diferentes tipos de partículas se encuentran distri-
para aislar y puri�icar células enteras, orgánulos buidos uniformemente. Al someterlas a un campo
celulares, macromoléculas, etc. Habitualmente, en centrífugo durante un tiempo determinado, las mo-
este tipo de técnicas se dispone de grandes cantida- léculas de mayor tamaño y de densidad más elevada
des de muestra. experimentan la mayor fuerza centrífuga y se mue-
Dentro de las técnicas de centrifugación pre- ven con mayor rapidez hacia el fondo del tubo de tal
parativa, en función del criterio de separación de manera que las diferentes partículas sedimentan a
las partículas, pueden diferenciarse: (1) la cen- distintas velocidades y pueden separarse a lo largo
trifugación diferencial, según la velocidad de del proceso de centrifugación (Figura 1.9).
sedimentación; (2) la centrifugación zonal, en fun- La centrifugación diferencial suele utilizar-
ción del tamaño; y (3) la centrifugación isopícnica, se en sedimentaciones sencillas y en la obtención
de acuerdo a su densidad. parcialmente pura de orgánulos subcelulares y ma-
En el caso de la centrifugación diferencial se cromoléculas. A partir de un homogeneizado, se
obtiene un líquido «sobrenadante» y un material realizan sucesivas centrifugaciones, incrementando
sedimentado («sedimento»). En los otros dos ca- cada vez el campo centrífugo aplicado y el tiempo
sos, las partículas se distribuyen en fracciones de de centrifugación, que permiten separar de mane-
diferentes densidades de un �luido líquido («centri- ra diferencial los distintos orgánulos de las células.
fugación en gradiente de densidad»). Al �inalizar cada etapa de centrifugación, se
habrá formado en la base del tubo un sedimento en-
Centrifugación diferencial riquecido con las partículas de mayor coe�iciente de
sedimentación –que está contaminado por cualquier
Para este tipo de centrifugación se suelen emplear soluto que haya podido llegar al fondo– y un sobre-
los rotores de ángulo �ijo. El principio de separación nadante con los solutos más pequeños y menos
se basa en la diferente velocidad de sedimentación densos que permanecen en suspensión. Cada se-
de las partículas en suspensión en función de su ta- dimento obtenido de esta manera se separa del
maño y su densidad. Inicialmente, en un tubo, los sobrenadante y se lava y centrifuga varias veces
35
Métodos en biociencias
con un solvente isotónico para eliminar los posi- quecidas son sometidas a un campo centrífugo en
bles restos de partículas de menor coe�iciente de un medio que presenta un gradiente de densidad
sedimentación. Cuando el sobrenadante se centri- cuya concentración aumenta desde la super�icie del
fuga nuevamente en condiciones de mayor tiempo tubo de ensayo hasta el fondo. Estos gradientes de
y campo centrífugo, las partículas más densas se- densidad evitan corrientes de convección y la difu-
dimentan nuevamente. Así, mediante la aplicación sión que pueden interferir en la separación de las
al sobrenadante de condiciones crecientes de partículas.
centrifugación, se van separando los distintos com- Además de utilizarse como método de sepa-
ponentes del homogeneizado inicial en fracciones ración, la centrifugación en gradiente de densidad
relativamente puras. también puede emplearse para hacer medicio-
La fuerza centrífuga a aplicar en cada una de nes analíticas como el análisis de los coe�icientes
estas etapas se determina de tal manera que en de sedimentación de partículas, medición de las
cada etapa se consiga la sedimentación de un com- densidades de �lotación aparentes, para estimar el
ponente especí�ico de la célula. Dependiendo de la tamaño o el efecto de tratamientos �ísicos o quími-
fuerza centrífuga aplicada, normalmente este tipo cos aplicados sobre la muestra, etc.
de fraccionamiento subcelular permite separar el Hay dos tipos de centrifugación en gradiente
homogeneizado en cuatro fracciones: de densidad: la centrifugación zonal (en función del
tamaño) y la centrifugación isopícnica (en función
— Nuclear (a 600 g/10’): sedimentan nú-
de la densidad).
cleos, células intactas o parcialmente rotas
y restos de tejido no homogeneizado. En ambos casos se emplea un elemento de su-
jeción de �luidos sobre el que se agrega la muestra.
— Mitocondrial (a 15.000 g/15’): se obtienen
Este �luido consiste en un soluto inerte, generalmen-
mitocondrias, lisosomas, peroxisomas y
te de bajo peso molecular, disuelto en un solvente
cloroplastos.
en el que también son solubles las partículas a se-
— Microsomal (a 100.000 g/60’): permite parar.
aislar la membrana plasmática, el retículo
endoplasmático, aparato de Golgi y pe-
queñas vesículas. Materiales utilizados para gradientes
— Soluble (a 600.000 g/120’): �inalmente Las principales propiedades que debe tener un so-
sedimentan ribosomas y polisomas, ma- luto para ser utilizado en la formación de gradientes
cromoléculas (proteínas, lípidos, etc.) y en centrifugación zonal o isopícnica son:
material no particulado en general.
— El soluto debe ser estable en solución y su
Cada una de estas fracciones no es homogénea y
rango de densidad su�iciente para cubrir
está contaminada no solo por los componentes de
el rango de densidades de �lotación de to-
menor coe�iciente de sedimentación sino también
das las partículas a separar.
por aquellos orgánulos cuyos valores de coe�iciente
— Tiene que ser hiperosmótico o hipoosmó-
de sedimentación solapan (por ejemplo mitocon-
tico, causando mínimas variaciones en la
drias y lisosomas) y que determina que las distintas
viscosidad, fuerza iónica y pH.
fracciones siempre estarán compuestas por varios
tipos de partículas. — Debe ser totalmente inerte con respec-
to al material biológico. Tampoco deberá
Esta heterogeneidad constituye el punto de
agregar o disgregar partículas biológicas
partida para continuar el proceso de puri�icación
o alterar actividades dependientes de su
de un orgánulo subcelular mediante otras técnicas
de separación, como la ultracentrifugación prepara- conformación o composición.
tiva en gradiente de densidad en sus modalidades — No puede absorber en el UV o en el ran-
zonal e isopícnica. go visible.
— Debe ser fácilmente eliminable de la solu-
ción de partículas puri�icadas.
Centrifugación en gradiente de densidad
— Tiene que ser esterilizable.
En este caso se suele emplean rotores basculan- — No debe ser agresivo con el rotor u otros
tes. Es el método más utilizado para la puri�icación elementos del equipo, ni in�lamable o tó-
de orgánulos subcelulares y macromoléculas. Las xico.
partículas del homogeneizado previamente enri- — Debe ser barato y fácilmente accesible.
36
Fraccionamiento celular
Figura 1.10: Esquema de la centrifugación en gradiente de densidad zonal. La muestra se deposita en forma de
capa en la parte superior del medio, el cual presenta un gradiente de densidad (continuo o discontinuo). En estas
condiciones y bajo la fuerza centrífuga, todas las partículas sedimentan a través del gradiente concentrándose
en zonas o bandas discretas que pueden recolectarse perforando la base del tubo de centrífuga.
En líneas generales, no existe un material de gra- nes de diferente densidad por lo que la densidad
diente que sirva para todos los tipos de ensayos. Son aumenta de forma escalonada desde la parte supe-
muy variados y pueden ser de distinta naturaleza: rior del tubo hasta el fondo del mismo (son siempre
(1) azúcares simples y polisacáridos como sacaro- preformados). Los gradientes continuos pueden
sa, glucógeno, dextranos o Ficoll, (2) polialcoholes ser autogenerados o preformados mediante un
como sorbitol o glicerol, (3) proteínas como albú- mezclador. Se crean incrementando linealmente
mina, (4) compuestos iodados como metrizamida la concentración del soluto inerte empleado en el
o nicodenz, (5) coloides derivados de sílice como gradiente a lo largo del volumen del tubo de cen-
Percoll y (6) sales de metales alcalinos como el clo- trifugación. Este último tipo de gradientes se utiliza
ruro de cesio (CsCl) o el sulfato de cesio (Cs2SO4). para establecer las condiciones óptimas de la cen-
trifugación isopícnica.
Formación del gradiente
Centrifugación zonal
Mientras que el intervalo de densidades de un gra-
diente se determina exclusivamente según el tipo La separación zonal o «de velocidad de sedimenta-
de centrifugación (zonal o isopícnica), su forma ción» aprovecha el tamaño y la masa de las partículas
–determinada por su per�il de densidad a lo largo en lugar de su densidad para la sedimentación. La
del tubo de centrifugación– puede ser modi�icada y muestra que se desea separar se deposita en forma
adaptada a las condiciones requeridas. de capa en la parte superior del medio donde se va a
Dependiendo de cómo se formen los gradien- realizar la separación (Figura 1.10), el cual presenta
tes, estos pueden ser autogenerados, como es el un gradiente de densidad (continuo o discontinuo).
caso de los basados en sales de metales alcalinos Este gradiente de densidad se diseña para que la
(CsCl) en los que la solución presenta una densidad densidad de las partículas sea mayor que la del me-
uniforme de partículas relativamente pequeñas y el dio de sedimentación. En estas condiciones y bajo
gradiente se va formando a la vez que se separan los la fuerza centrífuga, todas las partículas sedimen-
componentes de la muestra durante la centrifuga- tan a través del gradiente concentrándose en zonas
ción; o preformados, como es el caso de la sacarosa o bandas discretas.
o del percoll en los que el gradiente de densidad se Los componentes subcelulares tienen valo-
realiza antes de la centrifugación mediante un for- res de densidad relativamente pequeños y muy
mador de gradientes. similares (Cuadro 1.4), por lo que los gradientes de
Independientemente del proceso de forma- densidad que se pueden formar son muy suaves.
ción, la densidad de un gradiente puede aumentar Por este motivo, la velocidad de sedimentación (y,
de forma continua o discontinua desde la super�icie por tanto, el mecanismo de la separación) depen-
al fondo del tubo de centrifugación. En este sentido, derá principalmente del tamaño y de la masa de la
los gradientes discontinuos se consiguen apilando partícula. Típicamente se suele utilizar un gradien-
sucesivamente volúmenes homogéneos de solucio- te continuo de sacarosa (5-20%).
37
Métodos en biociencias
Cuadro 1.4: Rango de densidades de las partículas biológicas. fondo del tubo la densidad del medio ha de ser ma-
Rango de densidades de diferentes orgánulos celulares y macro-
moléculas.
yor que la del componente más denso.
En esta centrifugación lo más frecuente es
mezclar la muestra con el material que formará el
Orgánulo Densidad (g/mL) gradiente y generar un gradiente autoformado a
Membranas 1.1
la vez que se hace la separación. Esto requiere ve-
locidades muy altas (nivel de ultracentrifugación)
Mitocondrias 1.2 para que se forme el gradiente y tiempos de cen-
Lisosomas 1.2 trifugación lo su�icientemente largos (hasta 1 o 2
días). Al iniciar la centrifugación, cada componen-
Microsomas 1.2 te subcelular se desplaza hacia arriba o hacia abajo
Proteínas 1.3 hasta alcanzar una posición en la que su densidad
es igual a la de su entorno, es lo que se conoce como
Núcleo 1.3 situación de �lotabilidad neutra, isopícnica o de equi-
DNA 1.6 librio de sedimentación; y ya no se desplazará más.
En este tipo de centrifugación, las partículas nun-
Polisacáridos 1.7
ca sedimentan en el fondo, sino que alcanzan una
Ribosomas 1.7 posición estable intermedia en el gradiente, donde
se concentran en bandas discretas muy estrechas
RNA 2.0
(permite una mayor resolución), siendo las más
próximas al fondo del tubo las que contendrán las
partículas con mayor densidad.
Una vez que se alcanza este cuasi equilibrio, la
El gradiente debe tener una longitud su�icien- longitud de la centrifugación ya no in�luye en la mi-
te para separar los componentes de interés de la gración de las partículas. Un ejemplo común para
muestra pero la centrifugación debe terminar antes este método es la separación de ácidos nucleicos en
de que alguna de las partículas separadas llegue al un gradiente de CsCl.
fondo del tubo. Los componentes separados se reco- Por consiguiente, los criterios necesarios para
gen individualmente aspirando con mucho cuidado el éxito de la separación isopícnica son: (1) la den-
las diferentes bandas o bien perforando el fondo del sidad de las partículas de interés debe estar dentro
tubo y recolectando las diferentes fracciones sepa- de los límites del intervalo de densidades de los
radas por goteo de la solución. gradientes; y (2) el tiempo de ejecución debe ser
La separación zonal es ideal para separar su�iciente para que las partículas alcancen su pun-
partículas de tamaño de�inido –proteínas, RNA, ri- to isopícnico.
bosomas, anticuerpos, etc.– cuyas densidades son Con respecto a sus aplicaciones, la centrifu-
muy similares pero sus masas son muy distintas lo gación isopícnica se suele utilizar para separar
que permite la separación. Sin embargo, cuando las partículas similares en tamaño pero de diferente
partículas son del mismo tipo pero heterogéneas, la densidad como por ejemplo ácidos nucleicos (DNA,
RNA), proteínas, orgánulos celulares o tipos de cé-
separación por centrifugación zonal no es e�iciente
lulas. En la actualidad se emplea para separar todos
y es más apropiado separar las partículas en fun-
los tipos celulares sanguíneos en la estimación del
ción de otro parámetro como la densidad; por lo
hematocrito, ayuda a puri�icar espermatozoides
tanto se recurre a la separación isopícnica.
viables, separar células viables y no viables, etc.
38
Fraccionamiento celular
Figura 1.11: Esquema de la centrifugación en gradiente de densidad isopícnica. Las partículas son separadas
en función de su densidad de �lotación. Estas separaciones se llevan a cabo en un gradiente de densidad más pro-
nunciado que el de la centrifugación zonal, y que cubre todo el intervalo de densidades de los componentes de la
muestra. Cada componente subcelular se desplaza hasta alcanzar una posición en la que su densidad es igual a la
de su entorno (equilibrio de sedimentación o �lotabilidad isopícnica).
se elevadas fuerzas centrífugas. La instrumentación la muestra que sedimenta a una determinada longi-
que se utiliza no di�iere mucho de la empleada en tud de onda (); (2) Schlieren; y (3) interferencia.
las separaciones preparativas, pero requiere que se En estos dos últimos la lectura experimental se basa
utilicen sistemas de detección y observación de los en el índice de refracción. Cuando actúa el campo
resultados. centrífugo se forma un frente de sedimentación que
Para su utilización deben cumplirse unos re- avanza hacia el fondo del tubo y deja detrás una re-
quisitos: gión de disolvente. El método óptico de absorción
registra un incremento de absorbancia relacionado
— Las partículas de interés deben estar lo con el cambio de concentración, cuando el rayo óp-
más puras posibles. tico pasa a través del frente de sedimentación. En el
— Se deben emplear ultracentrífugas que método de Schlieren, el haz de rayos se desvía debi-
presentan una mayor capacidad de giro do al cambio del índice de refracción que varía con
(hasta 100.000 rpm). la concentración. En ambos casos, el sistema óptico
— En cuanto al rotor, se necesita que las convierte estas desviaciones en una curva de varia-
paredes del tubo se encuentren alinea- ción del gradiente de concentración.
das con el eje de rotación por lo que se Esta técnica se suele emplear para detectar y
emplean rotores verticales provistos de cuanti�icar interacciones macromoleculares (pro-
sistemas ópticos de observación y de re- teína-proteína, DNA-proteína, receptor-ligando,
gistro del desplazamiento capaces de etc.) así como la estructura cuaternaria y estados de
detectar la sedimentación de la partícula agregación de las proteínas.
en cada momento durante la centrifuga-
ción.
— Los tubos de centrífuga deben ser de 1.5. Caracterización bioquímica y
cuarzo para dejar pasar la luz visible y ul- morfológica
travioleta.
La con�irmación del aislamiento de un orgánulo y
El rotor consta de dos compartimentos o células la determinación del grado de pureza del puri�ica-
donde se coloca la solución problema y el disolven- do se realiza mediante un doble criterio bioquímico
te para equilibrar el sistema. Cada célula situada en y morfológico. Habitualmente el estudio de la mor-
un cilindro está formada por una pieza central y dos fología se realiza por microscopía electrónica (ver
ventanas que permiten el paso de la luz. A medida capítulo 8).
que el rotor gira, las imágenes de cada ventana son Para la caracterización bioquímica se utilizan
digitalizadas y almacenadas en un ordenador. enzimas y marcadores bioquímicos que están liga-
Los sistemas ópticos de análisis pueden ser de dos especí�icamente a un orgánulo intracelular y se
tres tipos: (1) absorción, que mide la absorbancia de evalúa su actividad (Cuadro 1.5).
39
Métodos en biociencias
Cuadro 1.5: Marcadores bioquímicos de las fracciones subcelu- — Fracción nuclear: se mide la concentra-
lares. Principales enzimas y marcadores bioquímicos especí�icos de
las distintas fracciones subcelulares obtenidas por centrifugación.
ción de DNA de las distintas fracciones.
La mayor concentración de DNA debe es-
tar en la fracción nuclear.
Orgánulo Marcador enzimático — Fracción mitocondrial: se mide la activi-
Membrana plasmática 5’-nucleotidasa
dad de la glutamato deshidrogenasa en
Fosfodiesterasa I
todas las fracciones, una mayor actividad
corresponde a la fracción mitocondrial.
Retículo endoplasmático Glucosa-6-fosfatasa — Fracción lisosomal: mayor actividad de la
NADPH diaforasa fosfatasa ácida o alcalina.
Mitocondrias Succinato deshidrogenasa — Fracción microsomal: mayor actividad de
Citocromo oxidasa la glucosa-6 fosfatasa.
— Fracción soluble: mayor actividad de la
Aparato de Golgi Galactosil-transferasa
lactato deshidrogenasa. No debe haber
Fucosil-transferasa
gran cantidad de actividad de las otras
Lisosomas -N-acetil-hexosaminidasa enzimas porque supondría que algunos
-galactosidasa orgánulos se han roto.
Peroxisomas Catalasa La presencia de actividad enzimática en una fracción
Urato oxidasa distinta de aquella en la que está localizada es una
Cloroplastos Clorofilas prueba que indica contaminación por otros orgá-
nulos. Cuando se utiliza un enzima como marcador
Ribosomas RNA
bioquímico se asume una distribución unimodal
Núcleo DNA de cada actividad enzimática, es decir, cada enzi-
Nucleósido-trifosfatasas ma está asociado a un determinado componente
intracelular pero en la práctica pueden darse distri-
Fracción citosoluble Lactato deshidrogenasa
buciones multimodales.
40
2.
Análisis de proteínas
Sergio Ciordia
Alberto Paradela
Figura 2.2: Niveles de organización de las proteínas. Las proteínas pueden presentar: una estructura primaria, for-
mada por la secuencia de aminoácidos; una estructura secundaria de la cadena polipeptídica, cuando los aminoácidos
interactúan a través de puentes de hidrógeno; una estructura terciaria por atracciones entre hélices-alfa y hojas ple-
gadas-beta; y, ocasionalmente, una estructura cuaternaria formada por varias cadenas polipeptídicas; por ejemplo, la
hemoglobina.
en torno al carbono beta se estabiliza mediante los nen. El término proteoma fue de�inido por Wilkins
puentes de hidrógeno intracatenarios formados (ver bibliogra�ía) por primera vez en 1994 como
entre el grupo -C=O del aminoácido n y el -NH del una analogía con el término genoma –el conjunto de
n+4. En la estructura hoja plegada-beta, la cadena genes de una célula–, y deriva de la fusión de «pro-
peptídica se encuentra casi totalmente extendida teína» y «genoma».
y los puentes de hidrógeno se forman en secciones Las técnicas proteómicas permiten obtener
paralelas de las cadenas polipeptídicas (intercate- una imagen dinámica de las proteínas expresadas
narios), y no entre residuos cercanos como en las por una célula en un momento dado y bajo unas de-
hélice-alfa. terminadas condiciones temporales y ambientales.
La estructura terciaria es la forma tridimen- Pero el estudio del proteoma de un organismo es
sional general donde las hélices-alfa o las hojas más complicado que el del genoma porque, mien-
plegadas-beta se pliegan como resultado de las tras que la información contenida en el genoma
interacciones entre residuos alejados en la estruc- es esencialmente constante, el proteoma es enor-
tura primaria; pueden, además, existir regiones memente dinámico y di�iere entre células y de un
de la proteína con una conformación desordena- momento a otro. Esto se debe a que cada tipo celu-
da. La estructura terciaria suele estabilizarse por lar expresa genes distintos, y por tanto el conjunto
la formación de interacciones hidrofóbicas, puen- básico de proteínas de cada célula también es dife-
tes de hidrógeno y puentes salinos, principalmente. rente. Un factor adicional de complejidad son las
Finalmente, en algunos casos, las proteínas pueden modi�icaciones o alteraciones que puede sufrir la
agruparse en multímeros para crear una unidad estructura o secuencia básica de la proteína. Dichas
funcional. La estructura global adoptada por varias modi�icaciones provienen básicamente de: el recor-
proteínas para formar dicho multímero es lo que se te o splicing alternativo de los mRNA que codi�ican
denomina estructura cuaternaria.. la proteína (Figura 2.3) y de las modi�icaciones
Las proteínas se sintetizan de manera estricta- postraduccionales (fosforilación, glicosilación, ace-
mente regulada en los ribosomas a partir de los RNA tilación, etc.) que modi�ican o modulan la actividad,
mensajeros (mRNA) transcritos a partir de los genes función o localización de la proteína en diferentes
que las codi�ican. Habitualmente su síntesis respon- contextos �isiológicos o metabólicos.
de a la presencia de señales o factores externos. Todas estas fuentes de complejidad incre-
mentan sustancialmente el número de proteínas
diferentes que pueden formarse a partir de los
2.1. Proteómica genes presentes en el genoma: se estima que a par-
tir de los 20.000-25.000 genes codi�icantes en el
El conjunto de las proteínas expresadas en un genoma humano pueden generarse entre 500.000-
determinado contexto espacial y temporal se de- 1.000.000 de proteínas diferentes.
nomina proteoma. La proteómica es la ciencia que La gran variedad de estructuras y funciones de
estudia, a gran escala, el proteoma; en particular la las proteínas ha estimulado el desarrollo de multi-
estructura y función de las proteínas que lo compo- tud de técnicas para su estudio, englobándose en su
42
Análisis de proteínas
Figura 2.3: Efecto de los procesos de splicing aternativo y las modi�icaciones postraduccio-
nales en el número de proteínas sintetizadas por una célula. Los procesos de corte y empalme
(splicing alternativo) durante la maduración del mRNA pueden generar diferentes combina-
ciones de exones. Esto, unido a las modi�icaciones químicas covalentes que sufren las proteínas
después de la traducción a nivel de los ribosomas, puede dar lugar a un número muy superior
de proteínas diferentes.
mayoría dentro de la proteómica. Esta ciencia es re- diferentes condiciones: proteómica de ex-
lativamente reciente y para su despegue de�initivo presión diferencial.
ha sido necesaria (i) la consolidación en los últimos — Estudios de interacción (proteína-proteí-
veinticinco años de la espectrometría de masas (MS, na o con otros ligandos).
mass spectrometry) como técnica aplicada al análisis
de biomoléculas y (ii) el crecimiento exponencial en
el número de entradas de genes y/o proteínas de- 2.2. Preparación de la muestra
positados en las bases de datos, fundamentalmente
como consecuencia del desarrollo tecnológico aso- La preparación de la muestra es un paso esencial
ciado al proyecto internacional Genoma Humano. en proteómica, y de ella depende la calidad y rele-
Estos hechos, combinados con el empleo de po- vancia de los datos obtenidos en el experimento. La
tentes métodos de fraccionamiento y separación recogida de la muestra, su transporte, manipulación
de péptidos y proteínas como la electroforesis bi- y almacenamiento, así como la extracción de pro-
dimensional en geles de poliacrilamida (2D-PAGE, teínas, son procedimientos tan importantes como el
polyacrylamide gel electrophoresis) y la cromatogra- posterior análisis mediante MS.
�ía líquida de alta e�icacia (HPLC, high-performance Como se describe en el capítulo 1, el origen de
liquid chromatography), han permitido consolidar la muestra utilizada en cualquier estudio de biolo-
la proteómica, desde mediados de los años 90 del gía celular o molecular puede ser muy diverso y las
siglo pasado, como ciencia para el análisis masivo fuentes desde las que extraer las proteínas celula-
de proteínas. res muy diferentes. Los más utilizados suelen ser
Las principales áreas de estudio de la proteó- los cultivos celulares, tejidos o �luidos biológicos.
mica son: Dada la gran variedad de fuentes biológicas
y de estructuras proteicas existentes es muy com-
— Identi�icación de proteínas. plicado el desarrollo de un método que permita la
— Caracterización de modi�icaciones, prin- extracción y posterior análisis de todas las proteínas
cipalmente postraduccionales. con igual e�icacia pero, en general, la preparación de
— Cuanti�icación de los niveles de expresión la muestra puede resumirse en los siguientes pasos
absolutos o relativos de las proteínas en (Figura 2.4):
43
Métodos en biociencias
Figura 2.4: Flujo típico de preparación de la muestra en cualquier estudio proteómico. La muestra es so-
metida a distintos procesos: (i) extracción-solubilización de las proteínas; (ii) una vez desnaturalizadas, las
proteínas se reducen y bloquean los puentes disulfuro; (iii) precipitación y concentración de las sustancias
interferentes; y (iv) digestión enzimática con proteasas especí�icas hasta sus péptidos resultantes.
Extracción-solubilización. Este primer paso implica solubilizarlas y evitar así la agregación y la activi-
la homogeneización de tejidos, lisis celular y rup- dad proteolítica que pueda presentar la muestra
tura de las interacciones que se producen inter- e (Figura 2.5).
intra-proteínas, tales como puentes de hidrógeno, Este proceso requiere la utilización combinada
fuerzas de Van der Waals e interacciones iónicas de agentes caotrópicos (por ejemplo, urea, tiourea o
e hidrofóbicas. Las proteínas extraídas son des- cloruro de guanidinio a concentraciones entre 2 y 9
naturalizadas y modi�icadas químicamente para M), detergentes (por ejemplo, SDS, CHAPS o Triton
X-100; a concentraciones que varían entre 1 y 4%)
e inhibidores de proteasas de amplio espectro como
el �luoruro de fenilmetilsulfonilo (PMSF) o el �luoru-
ro de bencenosulfonilo (AEBSF).
La utilización de estos agentes se suele combinar
con métodos �ísicos de homogeneización mecánica,
como el homogeneizador Potter-Elvehjem, sonicación
y procesos de congelación/descongelación.
44
Análisis de proteínas
Figura 2.6: Proceso de reducción-alquilación de proteínas. Habitualmente los puentes disulfuro entre cisteínas se rompen con la combina-
ción de un agente reductor (por ejemplo, ditiothreitol) seguido de un agente alquilante (por ejemplo, iodoacetamida).
tricloroacético, cloroformo/metanol, etanol, iso- controlada de las proteínas hasta sus péptidos resul-
propanol, etc. Los solventes orgánicos favorecen tantes. Aunque existen diversos métodos químicos
la precipitación porque disminuyen la constante para la hidrólisis de proteínas se ha generalizado
dieléctrica de la solución, lo que resulta en interac- el empleo de enzimas proteolíticas altamente es-
ciones más fuertes entre las cadenas polipeptídicas pecí�icas (Cuadro 2.1). La tripsina es la enzima más
y, además, reemplazan parte del agua que hidrata comúnmente utilizada dada su alta especi�icidad
las moléculas de proteína. El precipitado proteico para cortar en el extremo C terminal de residuos de
puede ser solubilizado nuevamente en el tampón
arginina y lisina. Tras la digestión, los péptidos tríp-
más apropiado para los siguientes pasos y en un vo-
ticos resultantes presentan típicamente dos cargas
lumen menor, lo que permite, además, concentrar la
positivas, lo cual favorece su ionización en el poste-
muestra. Como desventaja, estos métodos pueden
causar una pérdida parcial de muestra (de hasta un rior análisis de MS. Además, la tripsina es rentable
20%, en función del tipo de muestra y el método por bajo coste y alta e�iciencia.
empleado). La elección del método de preparación de
muestra depende del tipo y cantidad de muestra
Digestión enzimática. El análisis de proteínas me- inicial y de los procedimientos analíticos que se
diante MS requiere, en su formato más habitual emplearán en el estudio: electroforesis, métodos
(shotgun proteomics), la digestión o proteólisis cromatográ�icos y espectrometría de masas.
Cuadro 2.1: Principales proteasas utilizadas en experimentos de proteómica. En la columna de especi�icidad las letras mayúsculas repre-
sentan aminoácidos (código de una letra).
45
Métodos en biociencias
46
Análisis de proteínas
Las técnicas
2.3.2. Técnicas electroforéticas son herramientas ampliamente utilizadas para la
electroforéticas
separación, aislamiento, caracterización e identificación de biomoléculas. La
Las técnicas se
electroforesis electroforéticas son herramientas
basa en el movimiento ampliamente
de partículas cargadasutilizadas para la
bajo la influencia
separación,
de un campo aislamiento, caracterización
eléctrico controlado. e identificación
Las biomoléculas de biomoléculas.
cargadas se separan La en
electroforesis se basa en el movimiento de partículas cargadas bajo la influencia
función de su velocidad de migración, que depende a su vez de la carga eléctrica,
de un campo
el tamaño eléctrico controlado.
y la estructura Las biomoléculas cargadas se separan en
de cada partícula.
función de su velocidad de migración, que depende a su vez de la carga eléctrica,
el tamaño y la estructura
Fundamentos de cada partícula.
de la electroforesis
De acuerdo
Figura 2.7: Métodos de subfraccionamientoFundamentos a lasElleyes de la electrostática, la velocidad
implica lade migración (𝑣𝑣) de
una
celular de la
en proteómica. electroforesis
fraccionamiento de orgánulos subcelulares utilización de
alguna de las aproximaciones clásicas como:partícula es directamente
la centrifugación proporcional
diferencial (A), la centrifugación al producto
en gradiente de su
de densidad carga(B),
isopícnica efectiva
el (𝑞𝑞)
y al
fraccionamiento De
diferencial con detergentes (C) y de
métodos de inmunoa�inidadla(D).
gradiente de potencial eléctrico aplicado ( 𝐸𝐸 ); e inversamente proporcionaluna
acuerdo a las leyes la electrostática, velocidad de migración (𝑣𝑣) de al
partícula
coeficiente esde directamente
fricción (𝑓𝑓),proporcional
es decir, a la al resistencia
producto deque su opone
carga efectiva
el medio,(𝑞𝑞)y yque
al
gradiente de potencialdel
depende directamente eléctrico
tamaño aplicado
y forma de ( 𝐸𝐸la); molécula.
e inversamente proporcional al
coeficiente de fricción (𝑓𝑓), es decir, a la resistencia que opone el medio, y que
caracterización e identi�icación de biomoléculas. 𝑞𝑞𝑞𝑞
depende directamente del tamaño y forma 𝑣𝑣 = de la molécula.
La electroforesis se basa en el movimiento de par- 𝑓𝑓
tículas cargadas bajo la in�luencia de un campo 𝑞𝑞𝑞𝑞
eléctrico controlado. Las biomoléculas cargadas A partirsede esta ecuación
A partir 𝑣𝑣 =
de estaseecuación
establece que la movilidad
se establece electroforética (𝜇𝜇)
que la movi-
𝑓𝑓
separan en función de su velocidad es deun migración, lidad electroforética () es un
caso particular de la velocidad de migración de un ión cuandocaso particular de la se aplica un
Aelpartir
tama-de
campo eléctrico
que depende a su vez de la carga eléctrica, velocidad
de esta
1 V/cm de
ecuación migración
se establece
y su signo de
es igual alque un ión cuando
la carga
de la se
movilidad aplica
de laelectroforética
partícula. (𝜇𝜇)
ño y la estructura de cada partícula.es un caso particularunde campo eléctricode
la velocidad demigración
1 V/cm y su
𝑞𝑞 designo
un es cuando
ión igual al se aplica un
campo eléctrico de 1de la carga
V/cm y sude la partícula.
signo es𝜇𝜇 =
igual al de la carga de la partícula.
𝑓𝑓
Fundamentos de la electroforesis 𝑞𝑞
Así pues, la velocidad de 𝜇𝜇migración = electroforética depende de la
𝑓𝑓
densidad de
De acuerdo a las leyes de la electrostática, la carga
ve- de la molécula (relación carga/peso), del voltaje aplicado y de
la Así
porosidad pues,
del la velocidad
soporte de la de migración voltaje
electroforesis. electroforética depende de la
locidad de migración (v) de una partícula es Así pues, velocidad de El migración no se puede
electroforéti- incrementar
directamente proporcional al productodensidad
de carga
de su car- de la molécula (relación carga/peso),
ca depende de la densidad de carga de la molécula del voltaje aplicado y de10
la porosidad
ga efectiva (q) y al gradiente de potencial eléctrico del soporte de electroforesis. El voltaje
(relación carga/peso), del voltaje aplicado y de lano se puede incrementar
aplicado (E); e inversamente proporcional
al coe�i- porosidad del soporte de electroforesis. El volta- 10
ciente de fricción (f), es decir, a la resistencia que je no se puede incrementar indiscriminadamente
opone el medio, y que depende directamente del ta- porque genera un calor excesivo. En caso contrario,
maño y forma de la molécula. al aplicar un voltaje demasiado bajo, se puede cau-
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Métodos en biociencias
48
Análisis de proteínas
Esta técnica se suele emplear en los labo- sa, que se usa a concentraciones entre el
ratorios clínicos para separar las proteínas del 1 y el 3%.
suero: albúmina, inmunoglobulinas, lipoproteínas, — Electroforesis en gel de poliacrilamida
isoenzimas de la lactato-deshidrogenasa o la crea- (PAGE). Es el método de separación más
tinquinasa. ampliamente utilizado en química de pro-
teínas. Los geles de poliacrilamida se forman
(2) Electroforesis en gel por polimerización del monómero acrila-
mida (CH2=CH–CO–NH2) y el comonómero
Este tipo de electroforesis ha sustituido en gran entrecruzante N,N’-metilen-bisacrilamida
medida a la electroforesis en papel. Los geles, prin- (CH2=CH–CO–NH–CH2–NH–CO–CH=CH2),
cipalmente de agarosa y poliacrilamida, actúan inducida por la presencia de radicales
como soportes inertes que, además de evitar la di- libres. El persulfato amónico y la N,N,N’,N’-
fusión, permiten obtener diferentes porosidades tetrametiletilendiamina (TEMED) son los
modi�icando la concentración de los componentes responsables de catalizar la reacción de poli-
que los forman. Por lo tanto, la separación, además merización al actuar como agentes oxidante
de por diferencias de carga, se produce también por y reductor respectivamente (Figura 2.9).
diferencias de tamaño: el gel retarda el movimiento Las principales ventajas del uso de
electroforético de las moléculas grandes en compa- poliacrilamida son: la alta resolución o ca-
ración con las más pequeñas. pacidad de separación, la posibilidad de
Dentro de este tipo de electroforesis se pueden analizar moléculas relativamente gran-
distinguir: des (1x106 Da), la mínima interacción con
la muestra y la gran estabilidad. Su princi-
— Electroforesis en gel de agarosa. Se emplea pal inconveniente es que el monómero de
para separar por electroforesis moléculas acrilamida es altamente neurotóxico, por
grandes (>200 kDa); por ejemplo, áci- lo que debe manejarse con precaución.
dos nucleicos o complejos proteicos. Para Variando las concentraciones del mo-
separar estos compuestos se requieren nómero (A) y del comonómero (B) de
geles con un tamaño de poro muy grande entrecruzamiento se consiguen geles de
que, en el caso de geles de poliacrilamida, poliacrilamida con poros de tamaño de-
requiere emplear concentraciones muy terminado, cuya amplitud puede ajustarse
bajas (<2.5%), haciendo los geles muy para optimizar la separación de los com-
blandos y di�íciles de manipular. Esta di- ponentes de la muestra. Generalmente,
�icultad se soluciona reemplazando la las proporciones de A y B utilizadas son
acrilamida por un polisacárido, la agaro- del 5-15 % y del 2-4 % respectivamente,
Figura 2.9: Esquema de la electroforesis PAGE. Se emplea como soporte inerte un gel de poliacrilamida (A). La separación se produce
por diferencias de carga y por diferencias de tamaño (B). Adaptada de Berg y Freeman (ver bibliogra�ía).
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Métodos en biociencias
Figura 2.10: Esquema de la electroforesis MZE. En esta electroforesis se emplea un gel de poliacrilamida con dos zo-
nas: gel concentrador (superior) y gel separador (inferior). Adaptada de Voet (ver bibliogra�ía). En el carril izquierdo
de la imagen de la electroforesis se han incluido los marcadores moleculares.
para generar un tamiz que permite un ni- un tiempo su�iciente (30-90 min.) obliga
vel de resolución adecuado para proteínas a las proteínas a migrar a través del en-
entre 10 y 200 kDa. En términos genera- tramado del gel, separándose en forma
les la disminución del %A mejorará la de bandas discretas en función de su peso
resolución de proteínas de elevado peso molecular. Estos sistemas de electrofore-
molecular y viceversa, el aumento del %A sis emplean un gel uniforme y un tampón
proporcionará mayor resolución en el ran- homogéneo lo que reduce la capacidad de
go de bajo peso molecular (Figura 2.9b). resolución electroforética.
Una variante de esta técnica, los geles en — Electroforesis de múltiples zonas (MZE)
gradiente de acrilamida, proporciona un o de pH discontinuo. En la actualidad es
intervalo de separación y de estimación habitual utilizar este tipo de electrofore-
de masa molecular más amplio, así como sis discontinuas en vez de las anteriores
un nivel mayor de resolución debido a que u homogéneas. En este sistema se utili-
el tamaño del poro decrece progresiva- zan dos tipos de geles (Figura 2.10). En la
mente; por ejemplo, 4-20% de acrilamida parte superior un gel concentrador, o es-
en geles NuPAGE de Invitrogen. paciador, generalmente de menor altura,
Como resultado de la polimerización, el de menor porcentaje de poliacrilamida
gel forma una lámina rectangular delgada (por tanto de mayor tamaño de poro), en
en la que pueden analizarse y compa- el que se aplicará la muestra; y en la parte
rarse simultáneamente varias muestras, inferior un gel separador o de resolución,
dispuestas en calles paralelas. El tampón con mayor porcentaje de acrilamida y
de los reservorios y del gel es el mismo, menor tamaño de poro, donde ocurre la
y tiene un pH en torno a 9 para asegu- separación de las proteínas en función de
rar que la mayoría de las proteínas, con su carga y tamaño molecular.
puntos isoeléctricos comprendidos entre Esta técnica se fundamenta en que
pH 4 y 7.5, tengan carga neta negativa y los constituyentes iónicos de los tampo-
migren hacia el ánodo situado en el reser- nes utilizados en ambos geles son iguales
vorio inferior. La muestra se disuelve en (Tris-HCl), pero su pH es distinto (2 unida-
una solución densa de glicerol o sacaro- des inferior en el concentrador); además
sa y se coloca en pocillos preformados en el tampón de corrida empleado en los elec-
la parte superior del gel. La aplicación de trodos es diferente (Tris-Glicina). Cuando
una corriente continua (150-300 V) por comienza la electroforesis, en el gel espa-
50
Análisis de proteínas
ciador, las movilidades de los componentes (con una relación SDS/proteína máxima
de la muestra son intermedias por lo que de 1.4 g/g). La cadena alifática (dode-
se concentran en una zona muy estrecha cil) se sitúa en el interior de la proteína,
–unos pocos micrones de grosor– situada mientras que los grupos sulfato se ubican
entre las de los iones conductores (Cl-) y en la super�icie. La elevada carga negativa
los rezagados (glicina). Cuando la mues- que con�iere el SDS a las proteínas en-
tra concentrada llega al límite entre el mascara la carga intrínseca de la proteína
gel concentrador y separador ocurren (suma de las cargas asociadas a las cade-
cambios en la movilidad de los constitu- nas de aminoácidos que la forman) por
yentes por causa del pH, la fuerza iónica lo que todos los complejos SDS-proteína
y el efecto de tamiz del gel, lo que favo- presentan relaciones carga/masa idénti-
rece la separación en bandas discretas en cas y formas similares. En consecuencia,
el gel separador y un mayor poder de re- el factor determinante de la separación
solución. es el peso molecular, siendo la migra-
— Electroforesis en geles de poliacrilamida ción de los derivados SDS-proteína hacia
con dodecil sulfato de sodio (SDS-PAGE). al ánodo inversamente proporcional al
La electroforesis de proteínas en geles logaritmo de su peso molecular. Esta últi-
de poliacrialimida puede realizarse en ma característica permite estimar el peso
condiciones nativas, donde las proteínas molecular de las proteínas presentes en
mantienen su conformación nativa, o en la muestra, para lo cual es necesaria la
condiciones desnaturalizantes, donde se presencia, normalmente en un carril pa-
emplea un detergente (habitualmente ralelo, de un patrón o mezcla de proteínas
SDS, dodecil sulfato de sodio, CH3(CH2) de peso molecular conocido (marcadores de
n
-O-SO3- Na+) y un agente reductor (be- peso molecular) (Figura 2.10).
ta-mercaptoetanol, DTT, etc.) que rompe
los puentes disulfuro. (3) Isoelectroenfoque
El SDS a una concentración del 1%
desnaturaliza por completo las proteínas El isoelectroenfoque (IEF) es una técnica de separa-
y rompe las interacciones no covalentes ción electroforética que hace migrar los compuestos
implicadas en el plegamiento que forma anfotéricos, como las proteínas, en un medio con
su estructura secundaria, terciaria y cua- un gradiente estable de pH que se incrementa de
ternaria. El anión se une a las proteínas forma paulatina desde el ánodo hacia el cátodo en
por absorción no especí�ica a una propor- presencia de un campo eléctrico (Figura 2.11). Las
ción aproximada de una molécula de SDS moléculas se mueven hasta la zona en la que el pH
por cada dos residuos de aminoácidos es igual a su punto isoeléctrico. En ese punto la car-
Figura 2.11: Esquema del isoelectroenfoque. Se establece un gradiente de pH antes de cargar la muestra,
se somete a un campo eléctrico y las moléculas se mueven hasta la zona en la que el pH es igual a su pun-
to isoeléctrico. En ese punto, la carga neta de la proteína es cero y detiene su migración.
51
Métodos en biociencias
ga neta de la proteína es cero y la molécula detiene años 70 y, dentro de las técnicas electroforéticas,
su migración. De esta manera cada proteína se «en- es la más empleada en estudios proteómicos para
foca» en una banda estrecha alrededor de su punto separar mezclas complejas de proteínas utilizan-
isoeléctrico. do dos dimensiones. En la primera dimensión se
El gradiente de pH se crea por medio de unas emplea el enfoque isoeléctrico (IEF), donde las pro-
sustancias denominadas anfolitos, que son ácidos teínas se separan según su punto isoeléctrico, y en
poliaminocarboxílicos con pesos moleculares com- la segunda dimensión la SDS-PAGE, donde la sepa-
prendidos entre 300 y 1.000 Da. Estos anfolitos ración tiene lugar de acuerdo a la masa molecular
móviles pueden cubrir diferentes intervalos de pH, aparente de las proteínas (Figura 2.12). La alta re-
bien amplios (pH 3-10) o más estrechos (pH 7-8). El solución de la técnica se debe a que los dos tipos de
intervalo se elige de acuerdo con los puntos isoeléc- separación se basan en principios �isicoquímicos di-
tricos de las moléculas que quieran separarse. ferentes.
Bajo la in�luencia del campo eléctrico en Una importante innovación para la prime-
solución estos anfolitos migrarán cada uno a su co- ra dimensión de la 2D-PAGE fue la introducción de
rrespondiente punto isoeléctrico de manera que el gradientes de pH inmovilizados (IPG), generados
gradiente de pH se genera por la acción amortigua- mediante los llamados anfolitos inmovilizados o
dora de estos anfolitos y es mantenido por el campo inmovilinas. Estos son derivados de acrilamida quí-
eléctrico. micamente bien de�inidos unidos covalentemente
El enfoque isoeléctrico puede realizarse en gel a anfolitos amortiguadores con diferentes valores
de poliacrilamida, gel de agarosa o en membranas de pH (entre 1 y 13). Estos reactivos bifuncionales
de acetato de celulosa. Los sistemas más utilizados copolimerizan con la matriz de acrilamida del gel
para el enfoque isoeléctrico emplean geles hori- generando gradientes de pH muy estables, lo que
zontales sobre placas de vidrio, tiras de plástico o permite llevar a cabo enfoques isoeléctricos con
cilindros. mayor reproducibilidad. Las tiras IPG abarcan in-
tervalos de pH lineales y no lineales: amplios (pH
3-12), medios (pH 4-7) o estrechos (pH 4.5-5.5); y
(4) Electroforesis bidimensional de diferentes longitudes (7, 18, 24 cm).
La electroforesis bidimensional permite obte-
La electroforesis bidimensional en gel de poliacri- ner «mapas proteicos» en los que las coordenadas
lamida (2D-PAGE) fue descrita por O’Farrell en los de cada proteína vienen dadas por su punto isoeléc-
trico y su masa molecular. Según el tamaño del gel
y el gradiente de pH utilizado en la primera dimen-
sión, la 2D-PAGE puede resolver entre cientos y
miles de proteínas simultáneamente en un solo gel.
Las proteínas separadas pueden ser posteriormen-
te identi�icadas y caracterizadas sus modi�icaciones
postraduccionales mediante el análisis por espec-
trometría de masas. Finalmente, la comparación de
mapas proteicos correspondientes a diferentes si-
tuaciones �isiológicas o metabólicas puede facilitar
la detección e identi�icación de proteínas asociadas
a los procesos estudiados (proteómica diferencial o
comparativa).
Después de la electroforesis bidimensional las
proteínas separadas pueden detectarse median-
te distintos métodos de tinción. Entre estos están
la tinción con colorantes aniónicos como el azul
Coomassie; la tinción negativa con cationes metáli-
cos, como el zinc; la tinción con nitrato de plata; o
el marcaje �luorescente con SYPRO Ruby o los co-
Figura 2.12: Esquema de la electroforesis 2D-PAGE. Separación de lorantes de cianina (Cy2, Cy3, Cy5). El empleo de
un extracto de Escherichia coli por 2D-electroforesis. En la prime-
ra dimensión las proteínas se separan según su punto isoeléctrico colorantes �luorescentes aumenta la sensibilidad,
y en la segunda dimensión en función de la masa molecular apa- ofrece un intervalo dinámico lineal y permite la com-
rente de las proteínas. paración cuantitativa de los patrones en los geles.
52
Análisis de proteínas
53
Métodos en biociencias
54
Análisis de proteínas
55
Métodos en biociencias
Figura 2.15: Representación de la cromatogra�ía de fase inversa. Los péptidos y las proteínas se unen a esta fase en condiciones acuosas y
eluyen de la columna a medida que la fase se vuelve más hidrofóbica (aumenta el % de disolvente polar como el acetonitrilo). Primero elu-
yen los compuestos más hidro�ílicos (A). Cromatograma característico de un digerido tríptico separado por RP-HPLC (B).
56
Análisis de proteínas
Los intercambiadores de iones son redes tridi- sales de amonio cuaternarias o aminas. Estas matri-
mensionales de polímeros activados de resinas de ces intercambiadoras de cationes o aniones pueden
poliestireno, celulosa o poliacrilamida que contie- tener carácter fuerte o débil dependiendo del rango
nen en su estructura grupos funcionales cargados, de pH en que se mantengan cargadas.
generalmente ácidos o básicos. La e�iciencia de la separación dependerá del
La separación tiene lugar por la interacción de pH, la concentración de sal (generalmente NaCl) y
los componentes de la muestra con carga opuesta. del tipo de intercambiador iónico escogido. La fase
La elución ocurre por la adición de sales a la fase móvil en este tipo de cromatogra�ía suele ser una
móvil, donde el contraión de la sal compite con disolución acuosa (con cantidades moderadas de
los analitos por los sitios activos de la fase esta- metanol u otro disolvente orgánico miscible con
cionaria y desplaza al analito. El incremento de la agua) que contiene especies iónicas en forma, gene-
concentración iónica desplaza progresivamente a ralmente, de disolución reguladora del pH (variable
los componentes de la mezcla en función de la car- clave en la elución). La proteína de interés podrá
ga de cada uno de ellos (Figura 2.16). Cuanto mayor ser separada del intercambiador iónico con un tam-
es la a�inidad de unión de una proteína por el inter- pón de un pH y concentración de sal que reduzca la
cambiador iónico, tanto mayor será el retraso que a�inidad de la proteína por la fase estacionaria. La
experimente (incremento en el tiempo de elución). cromatogra�ía de intercambio iónico es muy versátil
y poderosa para la separación de péptidos y pro-
Existen dos tipos de cromatogra�ía de in-
teínas y además, tiene la ventaja adicional de que
tercambio iónico, de acuerdo a la carga de la fase
mantiene la conformación nativa de estas últimas.
estacionaria:
57
Métodos en biociencias
Figura 2.17: Representación de la cromatogra�ía de a�inidad. Cromatogra�ía de a�inidad de la concanavalina A por los
residuos de glucosa del soporte. La elución se logra con un tampón que contiene glucosa.
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Análisis de proteínas
59
Métodos en biociencias
— Sistemas especialmente diseñados para ción por desorción con láser (LDI), las de
hacer posible el acoplamiento de la sali- desorción por plasma, las de bombardeo
da de las columnas cromatográ�icas o de con átomos rápidos o las de ionización
electroforesis capilar al espectrómetro de por termonebulización.
masas.
Debido a que péptidos y proteínas pertenecen al
grupo de moléculas no volátiles y térmicamente
Fuentes de ionización inestables, el método habitualmente utilizado en
proteómica es la ionización por desorción, sobre
La ionización del analito es una etapa esencial en el
todo mediante ionización ESI y MALDI. Ambos tipos
análisis por MS. Existe una amplia variedad de méto-
de ionización se consideran «blandas» o «suaves»
dos, pero ninguno de ellos es de aplicación universal.
debido a que preservan intactas las moléculas, sin
La elección del tipo de ionización está normalmente
causar fragmentación incontrolada de las mismas.
determinada por la naturaleza de la muestra y el tipo
de información que se desea obtener. Dependiendo
del fundamento de la ionización estos sistemas o Ionización por electroespray
fuentes de ionización se clasi�ican en:
En la ionización por electroespray (ESI, electrospray
— Ionización en fase gaseosa. En este caso la ionization) la muestra es transportada en disolu-
muestra se volatiliza primero y posterior- ción por una fase móvil e introducida en la fuente
mente se ioniza. Estas fuentes se utilizan de ionización mediante una bomba inyectora o un
para compuestos térmicamente estables sistema de cromatogra�ía líquida. Las velocidades
y de pesos moleculares inferiores a 1.000 del �lujo suelen ser variables, dependiendo de la
Da. Dentro de ellas están las fuentes de con�iguración adoptada, estando los valores más
impacto de electrones (EI), las de ioniza- habituales en el rango 150-500 nL×min-1 (con�i-
ción química (CI) y las de ionización por guración nano) o 10-300 μL×min-1 (con�iguración
campo. micro) La fase móvil, conteniendo el analito disuel-
— Ionización por desorción. En este tipo to, pasa a través de un capilar metálico de acero
de ionización la muestra se transforma inoxidable o de cuarzo sílice con un revestimiento
directamente en iones gaseosos. Estos metálico al que se le aplica una elevada diferencia
sistemas son aplicables a muestras no vo- de potencial, habitualmente de 2.5 a 5 kV. Esto fuer-
látiles y térmicamente inestables. A este za la nebulización de las gotas cargadas en el capilar,
grupo pertenecen las fuentes de desor- con una carga super�icial de la misma polaridad que
ción por campo, las de ionización por el propio capilar, formando una nube o espray que
electronebulización (ESI), las de ioniza- se orienta hacia la entrada del analizador (MS). Con
60
Análisis de proteínas
la ayuda de una elevada temperatura (150-250 ºC) utilizados en ionización ESI; asimismo, el voltaje
en la fuente ESI y de un �lujo de gas inerte (nitró- aplicado para la ionización es inferior (1-2 kV). La
geno) enfrentado al espray, las gotas que forman gran ventaja de la ionización nanoESI es que la des-
el mismo reducen su tamaño de manera constante, orción-ionización es mucho más e�iciente, lo que
por evaporación del solvente (desolvatación). Esto incrementa la sensibilidad en varios órdenes de
origina un incremento de la densidad de carga su- magnitud.
per�icial conforme disminuye el radio de las gotas,
hasta llegar a un punto crítico en el cual es cinéti-
Ionización por desorción con láser
ca y energéticamente posible el paso a fase gaseosa
de los iones cargados transportados por la fase mó- La ionización por desorción con láser (LDI, laser
vil (Figura 2.20). desortion/ionization) es un modo de ionización di-
Esta técnica tiende a generar iones con múl- recto que permite obtener iones cargados en estado
tiples cargas del tipo [M+nH]n+ dependiendo del gaseoso utilizando radiación láser. Los dos proble-
número de residuos ionizables, lo que permite mas principales asociados a esta técnica son: la
que compuestos de peso molecular muy alto que- di�icultad de controlar la cantidad de energía trans-
den registrados con cargas múltiples en un rango ferida pudiendo provocar una degradación de la
m/z mucho menor. Se pueden determinar masas muestra por un exceso de calentamiento, y el hecho
moleculares de macromoléculas con una gran de que algunos compuestos no son capaces de ab-
precisión (± 0.005%). La ESI constituye la mejor sorber a la longitud de onda del láser, impidiendo
interfaz para el acoplamiento en línea de la MS con su ionización.
la cromatogra�ía de líquidos (LC) o la electrofore- Para solventar estos problemas se desarrolló
sis capilar (EC). la ionización MALDI (matrix-assisted laser desorp-
En proteómica se suele utilizar la ionización tion ionization), en la que la absorción de la energía
por nanoelectroespray (nanoESI), versión miniatu- asociada a la radiación del láser está controlada y
rizada del sistema de ionización por electroespray asistida por una matriz que absorbe la radiación y
convencional que permite operar a �lujos más ba- favorece la ionización sin que se produzca la frag-
jos (rango típico: 150 nL×min-1 a 1 μL×min-1). Esta mentación del analito. Normalmente la matriz está
variante utiliza un capilar con un recubrimien- formada por un ácido aromático de bajo peso mo-
to metálico y con diámetros muy inferiores a los lecular como el ácido α-ciano-4-hidroxicinámico
Figura 2.20: Esquema de la ionización por electroespray. Representación esquemática del proceso de ionización y nebulización en la
fuente ESI. Figura adaptada de LamondLab.
61
Métodos en biociencias
Figura 2.21: Representación esquemática del proceso de ionización asistido por matriz. El tiempo tardado en recorrer el tubo del anali-
zador (tiempo de vuelo) dependerá de la masa de la molécula.
(para péptidos) o el ácido sinapínico (para pro- ácido sinapínico) y se somete a un proceso de des-
teínas), que se mezcla con una disolución de la orción-ionización semejante a la ionización MALDI.
muestra en mayor proporción (10.000:1). La mez- En general ambos tipos de LDI permiten el
cla se deposita sobre una placa metálica de acero análisis de péptidos, proteínas y otras biomoléculas
inoxidable. Tras la evaporación del disolvente, la cuyas masas pueden llegar en ocasiones a exceder
mezcla muestra-matriz forma unos microcristales los 200 kDa, con una elevada sensibilidad (fentomo-
que a continuación se irradian durante algunos na- les–picomoles).
nosegundos con un haz láser de elevada potencia y
de pulsos cortos. La matriz absorbe gran cantidad
Analizadores de masa
de energía del láser y la trans�iere de forma con-
trolada a las moléculas de analito, permitiendo la La función de los analizadores de masa es separar
desorción de las moléculas que pasan a la fase ga- los iones de acuerdo a su relación m/z. Estos anali-
seosa como iones intactos (Figura 2.21). zadores pueden detectar diferencias de masa muy
Una de las principales ventajas de esta técnica pequeñas y permitir el paso de un número de iones
es que el proceso de ionización genera principal- su�iciente que produzca en el detector una señal de-
mente iones con una sola carga (M+H)+. El sistema tectable. Existen diversos tipos de analizadores de
MALDI se suele utilizar con un analizador de tiem- masa siendo los más utilizados: sector magnético,
po de vuelo (TOF, time of �light), y los equipos que cuadrupolo, tiempo de vuelo y trampa iónica.
utilizan esta combinación particular se denominan El analizador de sector magnético utiliza un
espectrómetros de masas MALDI-TOF. imán permanente o un electroimán para obligar a
Otra variante de LDI es la ionización/desor- que el haz de partículas cargadas procedente de la
ción con láser inducida en super�icie (SELDI, surface fuente de iones se desplace con una trayectoria cir-
enhanced laser desorption ionization). La diferencia cular a través de un tubo metálico. La intensidad del
principal con respecto a la ionización MALDI está campo magnético se puede variar haciendo posible
en que la muestra se añade sobre unos pocillos si- la separación de los distintos iones en función de
tuados en un chip en los que se ha dispuesto una su diferente energía cinética y su m/z (Figura 2.22).
fase sólida activa que puede presentar diferentes El analizador de cuadrupolo o analizador Q
selectividades: adsorción, reparto, interacciones (Q, quadrupole) consta de cuatro barras cilíndri-
electrostáticas o a�inidad; entre estos últimos pue- cas paralelas a las que se les aplican potenciales
den inmovilizarse anticuerpos, receptores de DNA opuestos y variables de corriente continua y de
u otras moléculas con a�inidad para determinadas radiofrecuencia (Figura 2.23). Esto induce un movi-
proteínas o péptidos. Posteriormente la super�i- miento ondulatorio en el haz de iones que atraviesa
cie sólida se cubre con la matriz (habitualmente el analizador sincronizado en cada momento con el
62
Análisis de proteínas
Figura 2.22: Esquema del analizador de sector magnético. Adaptada de Skoog (ver bibliogra�ía).
voltaje aplicado. Este analizador actúa como un �il- detector. El resto de iones ve desestabilizada su tra-
tro de iones ya que solo aquellos que presenten una yectoria lo su�iciente como para no poder atravesar
determinada relación m/z oscilan de una manera el analizador hasta llegar al detector.
moderada y son capaces de atravesar completa- En los analizadores de masas TOF los iones se
mente el canal central del analizador hasta llegar al producen de manera periódica mediante el bombar-
Figura 2.23: Esquema del analizador cuadrupolo. Adaptada de Skoog (ver biblio-
gra�ía).
63
Métodos en biociencias
deo de la muestra con pulsos cortos de electrones, desarrollado los analizadores de trampa de iones li-
iones secundarios o fotones generados mediante neal (LIT).
láser. Los iones así formados se aceleran median- En los últimos años, se ha comercializado un
te un pulso de campo eléctrico y pasan a un tubo nuevo tipo de analizador denominado Orbitrap.
analizador que no está sometido a ningún campo Está basado en un principio �ísico nuevo: la se-
(eléctrico o magnético), con una longitud de entre paración de los iones en un campo electrostático
1 y 2 m. A igualdad de carga, la velocidad que pre- oscilante equilibrado con fuerzas centrífugas. Este
sentan los iones dentro del tubo dependerá de su instrumento presenta unas prestaciones simila-
masa, llegando antes («tiempo de vuelo») al detec- res a los espectrómetros de masas de resonancia
tor los iones más ligeros (Figura 2.21). Muchos de ciclotrónica de iones con transformada de Fourier
estos analizadores incorporan un sistema de espe- (FT-ICR, Fourier transform ion cyclotron resonance)
jos electrostáticos tipo «re�lectrón» que permiten en términos de resolución y exactitud de la masa,
aumentar la resolución y mejorar la separación de pero sin necesidad de incorporar un magneto su-
los haces de iones. perconductor de elevado coste.
El analizador de trampa iónica (IT, ion trap) Estos analizadores de masas pueden emplear-
se tanto de manera individual como en tándem
consta de una cavidad central, formada por tres
(MS/MS). Aunque son posibles las más variadas
electrodos: uno anular y dos electrodos colectores
combinaciones de fuentes de ionización y de ana-
(de entrada y salida de los iones), donde los iones
lizadores de masas, la fuente de ionización MALDI
procedentes de la fuente se concentran, quedando
se suele acoplar a un analizador tipo TOF o TOF/
atrapados. Este espacio central está sometido a un
TOF mientras que la ionización ESI normalmente se
campo magnético y/o a un campo eléctrico tridi- combina con analizadores tipo Q, IT o instrumentos
mensional que varía dependiendo de los diferentes híbridos cuadrupolo-trampa iónica (Q-IT), cuadru-
voltajes y radiofrecuencias aplicados. Dependiendo polo-tiempo de vuelo (Q-TOF) y triple cuadrupolo
de la m/z de los iones con�inados y del campo apli- (QQQ).
cado estos iones circularán en órbitas estables o
inestables, siendo expulsados mediante cambios
graduales en los potenciales en la dirección axial del
Detectores
detector en orden creciente de m/z. Estos dispositivos transforman el impacto elec-
Los analizadores IT se caracterizan por tener trónico de los iones procedentes del analizador
una elevada sensibilidad pero una resolución limi- de masas en una señal eléctrica proporcional a la
tada y una capacidad relativamente baja de atrapar abundancia de cada ión con una relación m/z espe-
iones. Para minimizar estas limitaciones se han cí�ica. Esta señal puede ser procesada, almacenada
64
Análisis de proteínas
y mostrada de diferentes maneras con la ayuda de gas inerte (helio, nitrógeno o argón) presentes en
equipos informáticos y de tratamiento de datos. Los aquella. En la colisión, parte de la energía cinética
más habituales son los canales multiplicadores de se transforma en energía interna formándose pe-
electrones, la copa de Faraday y los detectores tipo queños fragmentos característicos denominados
centelleo. «iones producto». Estos entran en el segundo ana-
Los actuales espectrómetros de masas pueden lizador de masas donde son separados y detectados
detectar de manera rutinaria cantidades del orden en base a su relación m/z, generando un nuevo
de femtomoles (10-15 mol) o incluso de attomoles espectro de masas llamado espectro de fragmen-
(10-18 mol) de péptido, llegando a alcanzar resolu- tación. Este proceso se repite para cada uno de los
ciones superiores a 1.000.000, en el caso del equipo «iones determinados» detectados en el primer ana-
de FT-ICR más exacto. Esto signi�ica que estos equi- lizador (Figura 2.25a).
pos son capaces de distinguir una diferencia en la Al igual que otras moléculas orgánicas, los
relación m/z de entre 1.000,001 Da y 1.000,000 Da. péptidos se pueden fragmentar por múltiples sitios
por lo que se ha creado una nomenclatura especí-
Espectrometría de masas en tándem MS/MS �ica para indicar el tipo de fragmentos generados
(Figura 2.25b). En el caso de la fragmentación que
La espectrometría de masas en tándem MS/MS se tiene lugar a nivel de enlace peptídico se generan
basa en el acoplamiento en serie de dos o más anali- principalmente dos tipos de iones cargados posi-
zadores de masas para llevar a cabo múltiples pasos tivamente, denominados serie «b» y serie «y». Los
de análisis. Lo más habitual es que uno de los pasos iones tipo «b» son aquellos que contienen el extre-
de análisis implique el aislamiento selectivo de uno mo amino del péptido, mientras que los iones tipo
o varios de los iones detectados, seguido de su frag- «y» contienen el extremo carboxilo.
mentación o rotura controlada y del análisis de las Los espectros de fragmentación MS/MS
relaciones m/z de los fragmentos resultantes. Estos (Figura 2.25c) proporcionan información sobre la
analizadores pueden estar acoplados en el tiempo o identidad y posición de los aminoácidos en el pép-
en el espacio. tido. Por tanto es posible determinar la secuencia
Los analizadores acoplados en el tiempo uti- completa del péptido si el espectro de fragmenta-
lizan los iones atrapados en una misma cámara ción es de buena calidad; en otras ocasiones solo
o espacio �ísico para realizar múltiples etapas de se obtiene una secuenciación parcial del péptido.
análisis a lo largo del tiempo. Este tipo de proce- Sin embargo, en ocasiones incluso esta informa-
sos se pueden llevar a cabo con analizadores tipo ción parcial, acompañada por la masa del péptido,
IT, FT-ICR u Orbitrap. Los analizadores acoplados es su�iciente para identi�icar la proteína mediante
en el espacio están físicamente separados, pero búsqueda en bases de datos.
estrechamente conectados entre sí por un espacio
donde se produce la fragmentación de las molé-
culas. Este tipo de con�iguraciones se observa en 2.4.2. Aspectos metodológicos
instrumentos como el Q-TOF, TOF-TOF, o QQQ, en-
tre otros. Habitualmente, en proteómica, se utilizan dos estrate-
Entre los métodos de fragmentación que exis- gias distintas para la identi�icación y caracterización
ten el más utilizado en proteómica es el denominado de las proteínas presentes en una muestra: los mé-
de disociación inducida por colisión (CID, collision todos «bottom-up», o de abajo hacia arriba; y los
induced dissociation). En este método el primer métodos «top-down», o de arriba hacia abajo.
analizador sirve para generar el espectro de masas
correspondiente a los iones presentes en la mues- Métodos «bottom-up» o de abajo hacia arriba
tra y los generados en el sistema de ionización, y
para seleccionar una serie de «iones determinados» Estos métodos se basan en la información obteni-
que presentan ciertos requerimientos en lo que da a nivel de péptido, bien de masa y/o secuencia,
a intensidad y carga se re�iere. De todos los iones, para identi�icar una proteína. Esta metodología está
el analizador va seleccionando secuencialmente el muy consolidada y se utiliza de forma habitual, es-
ión correspondiente a un valor de m/z dado, que se pecialmente en investigación. Se puede aplicar a
denomina «ion precursor». Seguidamente este es proteínas puri�icadas o mezclas de proteínas. Su
acelerado por un potencial eléctrico para incremen- principal limitación es que solo permite identi�i-
tar su energía cinética. Al entrar el ión acelerado en car un porcentaje más o menos alto del total de los
la cámara de colisión choca con las moléculas de un péptidos de una proteína, alcanzándose raramente
65
Métodos en biociencias
Figura 2.25: Flujo de trabajo «product ion scanning», espectros MS/MS y series de fragmentación. En el �lujo tándem MS/MS, el primer
analizador sirve para generar el espectro de masas correspondiente a los iones presentes en la muestra y seleccionar el «ión precursor».
Seguidamente este ión es acelerado por un potencial eléctrico para incrementar su energía cinética y entra en la cámara de colisión, don-
de choca con las moléculas de un gas inerte. En la colisión se forman pequeños fragmentos característicos denominados «iones producto»,
que entran en el segundo analizador de masas donde son separados y detectados en base a su relación m/z (A). Se genera así un nuevo es-
pectro de masas, llamado espectro de fragmentación (C). Nomenclatura de fragmentación de péptidos (B).
66
Análisis de proteínas
Figura 2.26: Flujo de trabajo empleado para obtener la huella peptídica (PMF).
Cromatografía líquida acoplada a espectrometría tros MS/MS); esta colección de espectros MS/MS
de masas así obtenida es utilizada para identi�icar a las pro-
teínas presentes en la mezcla.
Para separar e identi�icar mezclas complejas de pro-
teínas es habitual recurrir a la separación mediante
cromatogra�ía líquida acoplada a la espectrometría Herramientas bioinformáticas
de masas (LC-MS) o masas en tándem LC-MS/MS. para la identificación de proteínas
La combinación de cromatogra�ía líquida
La identi�icación de proteínas a partir de la huella
(LC, liquid chromatography) y espectrometría MS/
peptídica (PMF) obtenida por MS y/o los espectros
MS permite la identi�icación de las proteínas que
de fragmentación son las aproximaciones basadas
componen un proteoma complejo, aumentando la
en espectrometría de masas más utilizadas para la
profundidad del análisis y el rango dinámico y pre-
cisión en las cuanti�icaciones realizadas respecto a identi�icación de proteínas. Actualmente es posible
los resultados obtenidos cuando se utilizan técnicas obtener cientos o miles de espectros de masas en
de MS unidimensional, por ejemplo PMF. lapsos de tiempo relativamente cortos cuya inter-
pretación manual no es una opción viable. Por ello,
Típicamente, en este tipo de aproximaciones,
se han desarrollado un gran número de aplicaciones
una mezcla compleja de proteínas se digiere con
y herramientas bioinformáticas, denominadas gené-
tripsina u otra proteasa y la mezcla de péptidos
ricamente «motores de búsqueda», que asisten en la
obtenida se fracciona mediante HPLC antes de ser
analizada en el espectrómetro de masas en tándem. identi�icación de proteínas y permiten la interpreta-
Estos dos sistemas suelen estar conectados en línea ción automatizada de los espectros MS y MS/MS.
de manera que la muestra fraccionada que eluye En el mercado están disponibles diversos mo-
del capilar del HPLC entra directamente en la fuen- tores de búsqueda, unos de código libre y otros de
te de ionización ESI. El espectrómetro de masas en pago, que pueden utilizarse para la interpretación
tándem (MS/MS) adquiere el espectro de masas co- de los espectros de masas, como: Mascot, Sequest,
rrespondiente a la mezcla de péptidos que eluye en Paragon, X!Tandem, etc., los cuales trabajan con dis-
un momento dado, seleccionándose a continuación, tintos repositorios públicos de bases de datos de
y normalmente de manera automática, algunos can- proteínas como Uniprot/SwissProt o el NCBI.
didatos para su fragmentación. Se genera así una Todas estas herramientas comparan el va-
colección de espectros de fragmentación (o espec- lor m/z experimental de cada péptido (PMF) o de
67
Métodos en biociencias
los iones producto (MS/MS) del espectro de masas cuando se desconocen simultáneamente la carga
con los valores m/z teóricos calculados mediante el y la masa, especialmente en el caso de iones con
procesado in-silico de las proteínas contenidas en múltiples cargas. Los estudios top-down requieren
las bases de datos. Todos estos programas asignan instrumentación del tipo ESI-FT-ICR con excitación
una puntuación, valor probabilístico o score esta- mediante ECD (electron capture dissociation) y ETD
dístico, que indica el grado de correlación existente (electron transfer dissociation). Este tipo de tecno-
entre los valores experimentales y los teóricos. logía proporciona unas medidas exactas de masa
A la hora de asignar un score a la identi�ica- combinada con alta resolución y, simultáneamente,
ción realizada mediante esta comparación se tienen preservando las modi�icaciones postraduccionales.
en cuenta diversos factores, entre los que se in- También se ha descrito el uso de espectrómetros
cluye la precisión con la que se corresponden los con analizador Orbitrap, con prestaciones similares.
valores experimentales a los teóricos, la intensi- Aunque se ha documentado el análisis de proteínas
dad de estos picos, la presencia de aminoácidos con pesos moleculares que superan los 50.000 Da,
modi�icados, la aparición de errores o puntos de el análisis en línea resulta aún bastante complica-
corte obviados o inespecí�icos durante la digestión do debido a la baja e�iciencia de ECD y ETD y a la
proteica, la exactitud de la calibración del instru- pobre capacidad de fraccionamiento a nivel de pro-
mento y otros parámetros. Debido a las diferencias teína de muestras complejas. Adicionalmente, la
existentes entre los algoritmos de búsqueda, los re- instrumentación es muy cara y son necesarios pa-
sos adicionales en el desarrollo de la bioinformática
sultados obtenidos pueden diferir ligeramente (son
asociada para que la metodología top-down pueda
complementarios) haciendo aconsejable validar los
generalizarse.
resultados obtenidos mediante distintos algoritmos
y/o usar métodos estadísticos que estimen la vali-
dez o signi�icado de las identi�icaciones realizadas.
Si no hay posibilidad de acceder al genoma 2.5. Técnicas de cuantificación
del organismo que se desea estudiar, el análisis me- de proteínas
diante secuenciación de novo de los espectros de
fragmentación permite la identi�icación de pépti- El análisis cuantitativo a gran escala de proteomas
dos cuya secuencia exacta no está́ disponible en las constituye uno de los retos más importantes de la
bases de datos. «proteómica de expresión diferencial». La determi-
nación de los niveles de expresión de las proteínas,
en diferentes tipos celulares y condiciones �isioló-
Métodos «top-down» o de arriba hacia abajo gicas, es un paso esencial para la comprensión de
los mecanismos implicados en la función celular, y
Por contraposición a la arriba mencionada es- es fundamental en el desarrollo de campos como la
trategia «bottom-up», en el caso de la estrategia biología de sistemas.
experimental «top-down» el análisis de MS se efec- En los estudios de proteómica cuantitativa se
túa sobre la proteína intacta, sin la etapa previa de puede distinguir entre cuanti�icación absoluta y
digestión proteolítica y, por tanto, su fragmenta- cuanti�icación relativa, siendo normalmente esta
ción se realiza en el espectrómetro de masas. Esta última la opción más utilizada. En la cuanti�icación
técnica permite la identi�icación y caracterización relativa, la abundancia relativa de las proteínas se
de modi�icaciones postraduccionales en proteí- estima por comparación entre las distintas condi-
nas altamente puri�icadas y generalmente de bajo ciones experimentales estudiadas. Sin embargo,
peso molecular así como la determinación de la también es posible determinar cantidades absolutas
masa molecular de una proteína intacta con una de proteínas mediante la utilización de concen-
exactitud de ± 2 Da. La identidad de la proteína traciones conocidas de un estándar de péptidos o
puede ser posteriormente con�irmada mediante proteínas, habitualmente marcados con isótopos
la obtención de un espectro MS/MS formado por estables (13C, 15N). Este formato «pesado» permite
iones de los fragmentos obtenidos a partir de la añadir directamente los péptidos estándar sobre la
proteína intacta. Para estos análisis se requiere muestra que se quiere estudiar y comparar la señal
un espectrómetro de masas de gran exactitud de obtenida frente a los péptidos endógenos o «lige-
masa y alta resolución. ros». Los métodos de cuanti�icación relativa usados
En MS/MS la cámara de fragmentación CID en los estudios de proteómica pueden ser dividi-
es ine�iciente para proteínas de alto peso molecu- dos en dos categorías: cuanti�icaciones basadas en
lar, siendo di�ícil determinar los iones producidos la electroforesis y cuanti�icaciones basadas en MS.
68
Análisis de proteínas
Cuadro 2.2: Características de las técnicas de tinción. Las proteínas separadas en geles de poliacrilamida desnaturalizantes (tanto SDS-
PAGE o 2D-PAGE), pueden ser teñidas para su cuanti�icación. En este cuadro se resumen las principales características de los métodos de
tinción más utilizados.
69
Métodos en biociencias
Figura 2.27: Flujo de trabajo utilizado en 2D-DIGE. Tras el marcaje, dos de las muestras a analizar y el estándar inter-
no son combinados y sometidos a electroforesis 2D-PAGE utilizando el mismo gel bidimensional. Gracias a las distintas
longitudes de onda de excitación y emisión que presentan los CyDyes se puede adquirir un mapa proteico bidimensio-
nal único para cada muestra.
para las muestras individuales analizadas. El están- tintos péptidos presentan distintas propiedades
dar interno presente en cada gel permite realizar el �ísico-químicas que afectan a su fraccionamiento,
análisis de correlación (superposición) de spots en- así como a su capacidad de ionización y volatiliza-
tre los distintos geles. En función de la intensidad ción durante el análisis de MS.
de la tinción de cada spot se determinan las abun- Los procedimientos para el análisis cuantita-
dancias o ratios relativos de los spots individuales tivo de proteomas por MS pueden dividirse en dos
frente a la de sus estándares internos. Esto permite grandes grupos en función de si son utilizados o no
comparar de manera precisa la abundancia proteica isótopos estables.
entre las muestras presentes en los diferentes ge-
les. El resultado �inal del análisis de imagen es una
lista de spots correspondientes a proteínas diferen- Cuantificación de proteínas por MS con isótopos
cialmente expresadas en las distintas muestras. Los estables
spots de interés se extraen del gel para su digestión Estas técnicas utilizan algún tipo de marcaje isotó-
enzimática y posterior identi�icación por MS. pico diferencial de los componentes presentes en
El principal inconveniente de esta técnica muestras diferentes que posteriormente permite su
viene dado por el alto coste de adquisición de los cuanti�icación relativa en un único análisis LC-MS/MS.
marcadores, del escáner necesario para la detección En el caso del llamado marcaje isotópico no
y del paquete informático asociado (DeCyderTM) con
isobárico, una de las muestras se marca con un com-
el que se realiza el análisis de imagen.
puesto en su versión ligera, mientras que la otra
se marca con la versión pesada correspondiente.
2.5.2. Cuantificación de proteínas basada Ambos compuestos son idénticos en todas sus pro-
en la MS piedades �ísico-químicas excepto en la diferencia de
masa asociada a la presencia de isótopos pesados
La medida de la abundancia de péptidos y proteí- o ligeros de determinados elementos constituyen-
nas en mezclas biológicas complejas no es una tarea tes (13C, 15N). Los péptidos así marcados producen,
fácil, ya que la espectrometría de masas per se no en el análisis de MS, parejas de picos con una dife-
es una técnica cuantitativa. Esto se debe a que dis- rencia de masa característica a la de los isótopos
70
Análisis de proteínas
Figura 2.28: Principales vías de incorporación isotópica utilizadas en proteómica cuantitativa basada en MS.
usados. La abundancia relativa de los péptidos pue- guir: marcaje metabólico a nivel del cultivo celular
de medirse por comparación de las intensidades o (por ejemplo SILAC); marcaje a nivel de la digestión
áreas descritas de estos picos. Por tanto, la cuanti- enzimática (por ejemplo el marcaje 16O/18O); o mar-
�icación se lleva a cabo a nivel de los espectros de caje a nivel de péptido por derivatización química
masas (MS1). Alternativamente, los péptidos pue- (por ejemplo ICPL, iTRAQ o TMT).
den marcarse mediante marcadores isobáricos, en
cuyo caso, los péptidos marcados tendrán la misma
Marcaje metabólico con isótopos estables
masa tras su marcaje pero, tras su fragmentación
CID, estos marcadores producen iones producto En la estrategia SILAC (stable isotope labeling by
distinguibles a nivel de los espectros MS/MS (MS2) amino acids in cell culture) las dos líneas celulares
que pueden ser usados para la cuanti�icación. (A y B) cuyos proteomas se quieren comparar se cul-
Las técnicas de marcaje (ICPL, ICAT o SILAC), tivan bien en medios normales o enriquecidos con
cuya cuanti�icación tiene lugar a nivel del espectro aminoácidos «pesados», marcados con isótopos es-
MS1, permiten el análisis simultáneo de un número tables (Figura 2.29). Tras varias divisiones celulares
limitado de muestras (generalmente 2 o 4); mien- (normalmente entre 8-10), los isótopos distintivos
tras que las técnicas de marcaje isobárico (iTRAQ, se habrán incorporado prácticamente en el 100%
TMT) ofrecen un número mayor de posibles cana- de las proteínas celulares y, una vez extraídas, pue-
les de cuanti�icación (de 4 a 10 análisis simultáneos, den ser combinadas, digeridas enzimáticamente y
dependiendo del reactivo). analizadas como una sola muestra. El hecho de po-
Dependiendo de la vía de incorporación del der combinar las muestras en un estadio temprano
marcaje isotópico (Figura 2.28) se pueden distin- del análisis experimental causa una mejora sustan-
71
Métodos en biociencias
cial en la precisión de la cuanti�icación realizada, al cisteínas, o también tienen a�inidad por los grupos
reducir la variabilidad artefactual que resultaría del carboxílicos (-COOH), entre otros.
tratamiento de las muestras por separado. Entre todos los reactivos disponibles existe
Los aminoácidos pesados pueden contener una predilección por las técnicas de marcaje con
los isótopos estables 2H, 13C o 15N, siendo frecuen- reactivos isobáricos. Esta estrategia de marcaje
temente utilizados 2H-Leu, 13C-Lys y 13C/15N-Arg. supone un gran avance ya que el marcaje se suele
La incorporación de estos aminoácidos proporcio- realizar a nivel de péptido, la e�iciencia de marcaje
na un incremento conocido en la masa del péptido es muy alta (casi del 100%) y tanto la identi�icación
frente a la versión ligera: 6 Da en el caso de usar como la cuanti�icación se efectúan a partir de los
13
C6-Lys, por ejemplo. En el análisis por MS cada espectros MS/MS. Además esta metodología per-
péptido aparece como un doblete en el espectro de mite comparar simultáneamente un mayor número
masas, correspondiendo el de menor masa (péptido de muestras (de 4 a 10, dependiendo del reactivo).
ligero) a la población A, mientras que el de mayor De todos los reactivos isobáricos en el mercado,
masa (pesado) corresponde a la población B. Al ser los dos más empleados son el reactivo iTRAQ (is-
ambos péptidos químicamente idénticos, di�irien- obaric tags for relative and absolute quanti�ication,
do únicamente en la masa, se comportan de forma de Sciex); y el reactivo TMT (tandem mass tags, de
igual en todos los pasos del proceso analítico, in- Thermo Fisher Scienti�ic). Ambos se basan en el
cluyendo la etapa de separación cromatográ�ica. mismo principio y químicamente son muy simila-
Por tanto, ambos péptidos eluirán y serán analiza- res, por lo que solo se tratará en este capítulo el
dos por el espectrómetro simultáneamente. De esta reactivo iTRAQ.
manera se pueden relacionar directamente las in- El reactivo de marcaje iTRAQ existe en dos ver-
tensidades de pico observadas en el espectro con siones: 4-plex y 8-plex, para el marcaje simultáneo
las abundancias relativas de las proteínas a las cua- de 4 y 8 muestras, respectivamente. Este marcaje
les pertenecen dichos péptidos en las poblaciones emplea moléculas isobáricas (de igual masa no-
celulares originales. minal) constituidas por tres partes funcionales
Sus principales limitaciones radican en el ele- denominadas: grupo reactivo, grupo de balanceo y
vado coste de los aminoácidos pesados y a que, en grupo reportero (Figura 2.30).
la práctica, su aplicabilidad se reduce a estudios de El grupo reactivo es un derivado de la
muestras provenientes de células en cultivo, siendo N-hidroxisuccimida y reacciona con el grupo ami-
imposible el análisis de proteínas procedentes de no terminal de los péptidos y el ε-amino de la
fluidos corporales o tejidos celulares. cadena lateral de las lisinas. El grupo de balanceo
compensa las masas de los distintos reactivos, de
Marcaje químico con isótopos estables manera que la masa total de cada reactivo sea in-
variable. El grupo reportero es un derivado de la
El marcaje químico de proteínas o péptidos se puede N-metilpiperacina que no afecta ni a la carga ni a
realizar con distintos marcadores isotópicos co- la e�iciencia de ionización del péptido marcado.
merciales que presentan distintas especi�icidades. Durante la fragmentación CID de estos péptidos, es-
Estos reactivos pueden reaccionan con: el grupo tos grupos se liberan de los mismos y aparecen en
amino (-NH2) presente en el extremo N-terminal el espectro MS/MS con una relación m/z de 113.1-
de las cadenas polipeptídicas y de la cadena lateral 121.1 Da (en la versión 8-plex) y de 114.1-117.1 Da
de las lisinas, con el grupo sul�hidrilo (-SH) de las (en la 4-plex). A partir de su intensidad relativa se
72
Análisis de proteínas
Figura 2.30: Estructura del reactivo iTRAQ en la versión 4-plex. El reactivo iTRAQ es un marcador
isobárico que presenta un grupo reportero, un grupo reactivo y una porción compensadora. El grupo
reportero presenta una relación m/z que varía de 114.1 a 117.1 Da en la 4-plex. Así, el grupo de ba-
lanceo compensa la diferencia que presentan entre sí los diferentes marcadores, por lo que su masa
va de 28-31 Da en la 4-plex. De esta manera, la masa de la región isobárica de todos los reactivos se
mantiene constante, siendo de 145 Da en la de cuatro.
estima la abundancia relativa de la proteína asocia- el rango bajo de m/z del espectro de fragmentación
da en las distintas muestras. de cada péptido.
Dado que la suma de los pesos moleculares de La mayor di�icultad de los experimentos iTRAQ
las tres partes de cada reactivo es constante, cuando radica en el manejo, almacenamiento y análisis de
un mismo péptido es marcado en todas las muestras las grandes cantidades de datos generados. Esto
y posteriormente estas se combinan, dicho pépti- hace necesario el desarrollo de programas informá-
do es detectado como un pico único en el espectro ticos que realicen los cálculos de las abundancias
MS1. Sin embargo, como cada grupo reportero di�ie- relativas de los péptidos marcados isotópicamente
re en su peso molecular, los fragmentos originados a y, a partir de ellas, de la abundancia relativa de las
partir de cada marcador tras la fragmentación se ob- proteínas de las que proceden.
servan como picos distintos en el espectro MS/MS. A
partir de la intensidad de estos grupos reporteros,
Marcaje enzimático con isótopos estables
se estima la abundancia relativa de los péptidos aso-
(marcaje 16O/18O)
ciados a una proteína y, por ende, la abundancia de
esta en las distintas muestras. En este caso, el marcaje con isótopos esta-
En un experimento iTRAQ (Figura 2.31) están- bles se realiza durante la digestión enzimática.
dar las diferentes muestras proteicas son digeridas Habitualmente, en el caso de la digestión con tripsi-
con tripsina y los péptidos resultantes en cada na, se utiliza 18O, aunque también se puede utilizar
caso se marcan por separado con los distintos re- con otras proteasas. Típicamente, las proteínas ex-
activos iTRAQ. Una vez marcadas, las muestras se traídas de dos condiciones distintas se digieren con
combinan y, opcionalmente, se fraccionan (por cro- tripsina empleando un tampón que incluye «agua li-
matogra�ía de intercambio catiónico o fase reversa gera», H216O, en un caso; y la forma pesada, H218O,
a pH básico, por ejemplo); las fracciones resultan- en el otro (Figura 2.32). Los átomos de 18O del agua
tes se analizan por LC-MS/MS. El espectro MS/MS se trans�ieren al extremo carboxilo C-terminal de
se usa tanto para la identi�icación de las proteínas los péptidos durante la reacción de digestión incre-
presentes mediante la búsqueda en bases de da- mentando su masa en 4 Da (2 Da por cada oxígeno).
tos, como para el análisis cuantitativo relativo de las Finalizada la digestión tríptica los péptidos de am-
mismas por comparación de las intensidades rela- bas muestras se combinan, fraccionan y analizan
tivas de los iones reportero, que son detectables en por MS/MS tal como se hace con los péptidos mar-
73
Métodos en biociencias
cados en experimentos SILAC o iTRAQ. Al igual que 2.5.3. Cuantificación de proteínas por MS
en el marcaje SILAC, cada par de péptidos prove- sin marcaje («label-free»)
nientes de cada una de las muestras se detecta como
un doblete en el espectro MS1. Por tanto, la medida Se trata de una metodología muy utilizada actual-
de la intensidad relativa de los pares de péptidos in- mente debido a que no requiere ningún tipo de
dica la abundancia de la proteína en las muestras. marcaje y evita el elevado coste de los reactivos
Los inconvenientes de esta técnica radican y/o la síntesis de péptidos estándar marcados iso-
en que, al igual que en el marcaje SILAC, se dupli- tópicamente. Permite determinar directamente la
ca la complejidad de la muestra; es por tanto más abundancia de las proteínas a partir de la intensidad
necesario que nunca un fraccionamiento metódico de las señales iónicas de los péptidos de la muestra.
de la misma. Adicionalmente, la reacción de incor- Al no haber modo de distinguir entre las muestras
poración del 18O durante la digestión no suele ser que se desea comparar, estas han de ser analizadas
completa en ocasiones, lo que complica la cuanti�i- por LC-MS separada e independientemente.
cación. Finalmente, la pequeña diferencia de masa Dentro de esta estrategia se han desarrolla-
(4 Da) entre los péptidos ligeros y pesados obliga, al do distintos métodos de cuanti�icación; uno de los
menos para los pares de péptidos multicargados (3 primeros fue el «recuento de espectros adquiridos»
y 4 cargas), a emplear instrumentación de alta re- (spectral counting), que se basa en la correlación
solución. directa existente entre la frecuencia con la que el
74
Análisis de proteínas
75
Métodos en biociencias
2.6. Interacción de proteínas con una sonda �luorescente, permite detectar las
interacciones entre la muestra problema y las pro-
Las técnicas proteómicas también pueden aplicar- teínas del microarray analizando directamente el
se en el análisis de la interacción entre proteínas: el microarray con un escáner de �luorescencia.
llamado interactoma. En este sentido se han desa- La función de la super�icie es proporcionar un
rrollado varias técnicas que permiten identi�icar y soporte de máxima unión sobre el cual queden inmo-
caracterizar estas interacciones. Entre ellas se pue- vilizadas las proteínas, idealmente manteniendo su
den destacar: las micromatrices de proteínas y la conformación nativa, integridad y actividad, orien-
captura por a�inidad. tando sus sitios de unión en la dirección apropiada
de modo que sean accesibles y proporcionando un
entorno hidró�ilico en el que la reacción de unión
2.6.1. Micromatrices de proteínas puede ocurrir.
La detección se puede realizar de dos for-
También llamadas microarrays o chips de proteí- mas distintas: mediante el marcaje directo de las
nas debido a su similitud con las micromatrices muestras con uno o dos �luorocromos (Cy3-Cy5 o
utilizadas para examinar la expresión génica. Se AlexaFluor 555-647) o mediante la técnica de sand-
desarrollaron en los años 80 en respuesta a las limi- wich con doble anticuerpo, uno de ellos marcado
taciones de uso de los microarrays de DNA debido para aumentar la especi�icidad y sensibilidad y dis-
a la escasa correlación entre los niveles de mRNA y minuir el ruido de fondo.
los niveles de expresión de las proteínas en la célula;
En términos generales, los microarrays de pro-
también con el objetivo de detectar las modi�icacio-
teínas pueden clasi�icarse (Figura 2.33) en:
nes postraduccionales, que a menudo determinan
la función de las proteínas. — Microarrays de proteínas funcionales o
Esta metodología surgió como un método de proteínas diana. En este caso los agen-
alto rendimiento utilizado para el seguimiento de tes de captura pueden ser de distinta
las interacciones y la actividad de las proteínas, y naturaleza (anticuerpos o proteínas re-
para determinar su función a gran escala, permi- combinantes de especi�icidad conocida,
tiendo cuanti�icar dichas interacciones en muy poco por ejemplo) que se inmovilizan sobre
tiempo. la super�icie del chip para luego incubar-
Los microarrays de proteínas son matrices for- se con la muestra de interés. Estos arrays
madas por cientos o miles de proteínas diferentes se emplean comúnmente para el estudio
inmovilizadas y colocadas ordenadamente (dis- de patrones diferenciales de expresión
puestas en �ilas y columnas) sobre un soporte (un proteica, de acuerdo a su a�inidad, es-
portaobjetos de vidrio, una membrana de nitrocelu- peci�icidad u otras características. No
losa o una placa de microtitulación), en forma de una obstante, pueden presentar algunas limi-
serie de «manchas», cada una de las cuales contiene taciones tales como reactividad cruzada
normalmente una proteína diferente. La incubación y/o pérdida de actividad de las proteínas
con la muestra problema, previamente etiquetada inmovilizadas.
Figura 2.33: Tipos principales de microarrays de proteínas. Pueden ser funcionales (por ejemplo de captura con anticuerpos), de fase
reversa (RPPA) o de proteínas in situ. Para detectar la interacción se puede emplear un anticuerpo con una sonda �luorescente o dos anti-
cuerpos (el secundario sería el marcado) (POI, protein of interest).
76
Análisis de proteínas
— Microarrays de fase reversa (RPPA). Se aporta indicios sobre las funciones de una proteína
generan mediante la inmovilización de cuya actividad es desconocida; también puede suge-
lisados celulares o provenientes de teji- rir la ubicación de posibles sitios activos y aportar
dos o �luidos corporales, para la posterior información sobre el modo por el que determinadas
detección de proteínas de interés me- moléculas interactúan con la proteína.
diante anticuerpos especí�icos contra El conocimiento de la estructura de una proteí-
las proteínas diana. Esta interacción an- na a menudo sugiere sitios diana para potenciales
tígeno-anticuerpo se visualiza mediante medicamentos que pudieran interactuar con ella.
el empleo de un anticuerpo secundario
Como la estructura aporta información funcional,
conjugado con una etiqueta que permita
uno de los objetivos de la proteómica es determinar
ampli�icar la señal de detección. En este
la estructura de cada una de las proteínas que se en-
caso, la intensidad de la señal será direc-
tamente proporcional a la especi�icidad, cuentran en la célula.
a�inidad y accesibilidad espacial entre Actualmente determinar la estructura de una
la proteína diana y el anticuerpo. Estos sola proteína puede llegar a ser una tarea ingen-
arrays se emplean para el análisis de mo- te que requiere años de trabajo. Habitualmente se
di�icaciones postraduccionales o para el utilizan dos procedimientos para resolver la estruc-
estudio de rutas de señalización. tura de las proteínas: (i) cristalogra�ía de rayos X, en
— Microarrays de proteínas in situ. Se basan la cual los cristales obtenidos a partir de la proteí-
en la síntesis in situ de proteínas (em- na son bombardeados con rayos X, utilizándose los
pleando sistemas de expresión libres de patrones de difracción obtenidos para determinar
células) a partir de bibliotecas de cDNA. su estructura; y (ii) resonancia magnética nuclear
La proteína naciente, marcada con GST, es (NMR) que, basándose en las propiedades magné-
capturada por un anticuerpo impreso ad- ticas de los núcleos, aporta información sobre la
yacente anti-GST, de manera que quede posición de átomos especí�icos dentro de la molé-
retenida sobre la super�icie. En ocasiones cula.
pueden sintetizarse diferentes versio-
nes de una misma proteína (por ejemplo
proteínas truncadas) con el objeto de es- 2.7.1. Cristalografía de rayos X
tudiar las diferentes regiones funcionales
de la misma. Esta estrategia es prome- Los rayos X son una forma de radiación electro-
tedora en cuanto a que reúne en un solo magnética de una longitud de onda alrededor de
soporte la expresión, puri�icación y alma- 0.1 nm (diámetro de un átomo de hidrógeno). Si se
cenamiento de las proteínas. A este grupo dirige un haz estrecho y paralelo de rayos X sobre
pertenecen: los PISA arrays (protein in una muestra de una proteína pura, la mayoría de
situ arrays), DAPA arrays (printing pro- los rayos X pasarán a su través. Sin embargo, una
tein arrays from DNA arrays) y NAPPA pequeña fracción de ellos será dispersada por los
arrays (nucleic acids programmable pro- átomos de la muestra. Si las proteínas de la muestra
tein arrays). están dispuestas de manera que forman un cristal
bien ordenado, las ondas dispersadas se reforza-
rán entre sí en ciertos puntos y aparecerán como
2.6.2. Captura por afinidad
un patrón de manchas de difracción cuando los ra-
En esta técnica se utiliza un anticuerpo para cap- yos X sean recogidos por un detector. La posición
turar la proteína de interés a partir de una mezcla e intensidad de cada mancha en el patrón contie-
compleja. La proteína capturada «arrastrará», en ne información sobre las posiciones de los distintos
principio, cualquier otra proteína que interactúe, átomos en el cristal.
fuerte o débilmente, con ella. Posteriormente, la La deducción de la estructura tridimensional
mezcla así obtenida (el interactoma) se analiza por de una gran molécula a partir del patrón de difrac-
MS para identi�icar las proteínas asociadas. ción de su cristal es una tarea compleja, aunque en
los últimos años esta tarea se ha automatizado signi-
�icativamente. El paso limitante es la producción de
2.7. Análisis estructural cristales de proteína adecuados. Este proceso requie-
re grandes cantidades de proteína muy pura y una
La estructura en alta resolución de una proteína optimización puramente experimental de las condi-
aporta gran cantidad de información útil. A menudo ciones de cristalización adecuadas (Figura 2.34).
77
Métodos en biociencias
78
Análisis de proteínas
proceso de unión a un sustrato. La principal limita- Domon B, Aebersold R. 2006. Mass Spectrometry and
ción de técnicas como la cristalogra�ía de rayos X o Protein Analysis. Science 312:212-217.
la NMR es que son técnicas demasiado lentas para Essentials of Chemical Biology. Structure and Dynamics of
determinar simultáneamente la estructura de las Biological Macromolecules. 2007.
miles de proteínas que pueden coexistir dentro de
Miller A, Tanner J. John Wiley & Sons. ISBN 978-
la célula. Como en los estudios del proteoma es ne- 0470845301.
cesario conocer las estructuras de cientos de miles Fundamentos de química analítica. 1996.
de proteínas, se espera que en un futuro se pueda
modelar o predecir la estructura a partir de las se- Skoog DA, West DM, Holler J. Editorial Reverte. ISBN
cuencias de aminoácidos solamente con la ayuda 8429175563.
de métodos automatizados y nuevas herramientas Manual de Proteómica. 2014.
bioinformáticas que aceleren la determinación de
estas estructuras. Sociedad Española de Proteómica. https://payhip.com/b/
FNt7.
Principios de análisis instrumental. 2000.
Berg JM, Tymoczko JL, Gatto GJ, Stryer L. McMillan Schena M (ed). Jones & Bartlett Publishers. ISBN
Education. ISBN 978-1464126109. 0763731277.
Bioquímica. 2006. Técnicas analíticas de separación. 1988.
Voet D, Voeth JG. Editorial Médica Panamericana. ISBN Valcárcel M, Gómez A. Editorial Reverte. ISBN 8429179844
978-9500623018. Técnicas de separación en Química Analítica. 2003.
79
3.
Análisis de ácidos
nucleicos
Luis Andrés López
Yolanda Loarce
Los ácidos nucleicos son biopolímeros forma- «Si no fuera por la variabilidad entre los individuos,
dos por nucleótidos y fueron descubiertos por vez la medicina podría considerarse una ciencia y no
primera en 1869 por Meischer. En la naturaleza un arte». Según esta frase y guardando las distan-
se conocen dos tipos de ácidos nucleicos, el ácido cias en el tiempo se podría decir que la genómica ha
desoxirribonucleico o DNA y el ácido ribonuclei- venido para hacer de la medicina más ciencia y me-
co o RNA. Sin embargo, no se tomó conciencia de la nos arte. En este capítulo se mostrará cómo aislar,
importancia de los mismos hasta que la estructura cuanti�icar, almacenar y trabajar con DNA y RNA, y
tridimensional del DNA fue descubierta en 1953 por también las aplicaciones fundamentales y técnicas
Watson y Crick. Desde entonces, el conocimiento de laboratorio de cada una de estas moléculas en el
de los ácidos nucleicos ha avanzado enormemente trabajo cientí�ico, centradas fundamentalmente en
revolucionando por completo la medicina y la bio- Biomedicina, aunque sin olvidar otras disciplinas.
logía, de tal manera que a la Medicina del siglo ��� Existen, obviamente, muchas más técnicas y mu-
se la conoce también por Medicina Genómica. Así, chas más aplicaciones con ácidos nucleicos, pero el
hoy en día se sabe que las pequeñas variaciones propósito de este capítulo es ofrecer una visión ge-
que se encuentran en el DNA de cada uno de noso- neral que sirva de orientación y ayuda a personas
tros son responsables, no solamente de gran parte que se inician en el mundo de la genética molecular.
de las enfermedades que sufrimos durante nuestra
vida, sino también de la variabilidad en la respues-
ta a los fármacos que se administran para curar 3.1. Ácido desoxirribonucleico
dichas enfermedades. Todo esto ha generado el
concepto de Medicina personalizada, según el cual El genoma es el conjunto de la información gené-
no hay enfermedades sino enfermos. La genómi- tica de un organismo que se encuentra en cada
ca está permitiendo ya de�inir subclases de cáncer, una de las células que lo componen y está formado
con peor o mejor pronóstico, donde antes se con- por moléculas de DNA (Figura 3.1). El DNA es una
sideraba un solo tipo de cáncer, mejorando de esta molécula polimérica formada por la unión de múl-
manera el tratamiento para cada subgrupo. Ya hace tiples desoxirribonucleótidos mediante puentes
más de 100 años William Osler fue capaz de decir fosfodiéster. Hay cuatro diferentes desoxirribonu-
Métodos en biociencias
82
Análisis de ácidos nucleicos
83
Métodos en biociencias
Figura 3.3: Imagen virtual de electroforesis de DNAs con distintos grados de degradación.
Fuente: página web de Agilent Technologies, http://www.genomics.agilent.com/campaign.
jsp?id=5300004.
84
Análisis de ácidos nucleicos
Figura 3.4: Tipos de RNA. Abreviaturas: mRNA, RNA mensajero; rRNA, RNA ribosómico; tRNA, RNA de transfe-
rencia; srpRNA, RNA de partícula de reconocimiento de señal; asRNA, RNA antisentido; lncRNA, RNA largo no
codi�icante; miRNA, micro RNA; piRNA, RNA de interacción con piwi; siRNA, RNA de interferencia pequeño; sn-
RNA, RNA pequeño nuclear; snoRNA, RNA pequeño nucleolar; RNasaP, ribonucleasa P; scRNAA, RNA pequeño
especi�ico de cuerpo de Cajal; TERC, RNA componente de la telomerasa.
acondicionar una zona para trabajar ex- nidinio, dodecilsulfato sódico (SDS) o fenol. Lo ideal
clusivamente con RNA o bien trabajar con es aislar el RNA en cuanto la muestra es recolectada
todas las moléculas como si se estuviera para evitar la acción de las ribonucleasas. Sin em-
trabajando con RNA. bargo, si esto no es posible, se pueden almacenar
— Las soluciones que se empleen en el ais- las muestras a -80 ºC y/o mantener la muestra en
lamiento de RNA tienen que estar libres soluciones que inhiban la acción de las ribonuclea-
de nucleasas. sas, como por ejemplo RNAlater.
— Emplear preferentemente material de De manera similar al DNA hay varios métodos
plástico libre de nucleasas (tubos, pun- para aislar RNA. Básicamente todos los métodos
tas) y, si es necesario, material de vidrio deben primero liberar el material citoplasmáti-
previamente horneado a 200 ºC durante co mediante una lisis celular. Esta lisis es química,
2 horas. aunque si se trata de membranas resistentes (como
por ejemplo la de las células vegetales) o tejidos se
puede acompañar con una disgregación �ísica por
3.2.3. Aislamiento de RNA ultrasonidos, presión o cuchillas. A partir de aquí se
pueden diferenciar 4 métodos:
Existen múltiples alternativas para el aislamien-
to de RNA de muestras biológicas. La elección del — Extracción orgánica. Es el más tradicional
método dependerá del material biológico original y y fue descrito por Chomczynski en 1987.
de la aplicación en la que se quiera emplear el RNA. Utiliza una solución fenólica que al com-
Durante el proceso de extracción el RNA va a estar binarse con cloroformo y centrifugarse se
protegido de la acción de ribonucleasas mediante separa en tres fases (Figura 3.4): una fase
compuestos que inhiben su acción o desnaturalizan fenólica en el fondo del tubo donde se van
las proteínas, como por ejemplo isotiocianato gua- a localizar las proteínas, una interfase
85
Métodos en biociencias
que queda como una nube blanca donde usualmente espectrofotometría. El RNA absorbe a
se encuentra el DNA, y una fase acuosa en la misma longitud de onda que el DNA. La diferen-
la parte superior donde se encuentra el cia para el RNA es que 1 U de absorbancia a 260 nm
RNA. Tras recolectar la fase acuosa el RNA corresponde a una concentración de 40 ng/µL. Las
es precipitado con isopropanol y recogi- condiciones de pureza son idénticas a las comenta-
do por centrifugación. Tras varios lavados das en el caso de DNA.
en etanol 70% se tendrá un RNA de cali- Debido a la inestabilidad del RNA por acción
dad para la mayoría de aplicaciones. de las RNasas es imprescindible medir la integri-
— Retención en membrana. Una vez realiza- dad del mismo. Para ello la técnica utilizada, al igual
da la lisis en una solución que no contiene que para el DNA, es la electroforesis. En una célula
fenol, el RNA es aislado por unión a una eucariota más del 95% del RNA es RNA ribosómi-
membrana de sílica que tras varios la- co 28S y 18S y en menor medida 5S, por lo que en
vados con etanol será eluído en un agua una electroforesis de un RNA íntegro lo que se va a
libre de ribonucleasas o un tampón con observar son las bandas correspondientes a estos
Tris. Para aplicaciones como microarrays RNA ribosomales (Figura 3.5). Debido a la facilidad
(a veces llamadas micromatrices) de de degradación del RNA durante la electroforesis en
expresión o secuenciación masiva se re- geles de agarosa y a que en muchos casos la can-
quiere un RNA de la máxima calidad por tidad de material de partida es muy escasa, en los
lo que se suele hacer una primera extrac- laboratorios donde se trabaja con RNA se va impo-
ción con una solución fenólica y el RNA es niendo la electroforesis en chip, ya que por escaso
posteriormente puri�icado mediante la tiempo que la muestra está migrando (1-1.5 minu-
unión a una membrana de sílica. De he- tos) no hay problemas de degradación. Además, la
cho, hay kits comerciales que combinan sensibilidad es muchísimo mayor que en una elec-
ambos métodos para obtener un RNA de troforesis convencional, pudiéndose detectar y
excelente calidad en menos tiempo. cuanti�icar concentraciones de pg/µL. Incluso exis-
— Separación magnética. Este método se ten algoritmos que ofrecen un valor numérico de la
basa en el uso de partículas paramagné- degradación de un RNA genómico como el RNA in-
ticas, normalmente esféricas, que en su tegrity number (RIN), que se ha convertido en un
super�icie presentan modi�icaciones ca- estándar de calidad del RNA y es requerido un mí-
paces de unirse a RNA, como por ejemplo, nimo para garantizar resultados concluyentes en
sistemas de unión estreptavidina/bioti- determinados procedimientos, como por ejemplo
na. Con la simple aplicación de un campo microarrays de expresión.
magnético tras la unión de las partículas El RNA se conserva en agua o en tampón TE
al RNA, este se puede aislar fácilmente (Tris-EDTA) libres de nucleasas a -20 ºC durante se-
tras unos cuantos lavados. Para puri�i- manas, y años a -80 ºC. Sin embargo, dependiendo
car mRNA es frecuente usar partículas del grado de integridad inicial, del tejido de parti-
paramagnéticas cubiertas de un oligonu- da o del método de extracción se pueden encontrar
cleótido dT18-20 dado que las moléculas de muestras que tras un año a -80 ºC están altamente
mRNA poseen una cola de adeninas en el degradadas. Otras vías de conservación más esta-
extremo 3’. bles, pero menos frecuentes, son la resuspensión en
— Lisis y estabilización. Este método se uti- formaldehido, o la precipitación en etanol/NH4OAc
liza cuando la aplicación no requiere un o en citrato sódico 1mM pH 6.4.
RNA de mucha pureza o el número de cé-
lulas es muy bajo. Simplemente se lisa la
muestra y posteriormente se estabiliza
con una solución que va a inhibir la ac- 3.3. Técnicas con ácidos nucleicos
ción de las RNasas.
3.3.1. Secuenciación
86
Análisis de ácidos nucleicos
Figura 3.5: Electroforesis en chip de muestras de RNA con distinto grado de degradación. A la izquierda
imagen virtual de la electroforesis de varios RNAs totales extraídos de linfocitos CD4+ humanos, dónde se
aprecian fundamentalmente dos bandas, correspondientes al RNA ribosómico 28S (superior) y 18S (infe-
rior). A la derecha, electroferograma de una de las muestras, dónde se representa el per�il electroforético de
un RNA, de�inido por la intensidad de la �luorescencia [FU], en el tiempo transcurrido de electroforesis ex-
presado en segundos [s].
13 años y costó más de 3.000 millones de dólares. sa que va a leer la secuencia e incorporar nucleótidos
En los últimos 10 años la tecnología de secuencia- complementarios por el extremo 3’OH y, �inalmen-
ción masiva se ha incrementado a un ritmo mucho te, de una mezcla de desoxinucleótidos (dNTPs) y
mayor, de tal manera que en la actualidad un geno- didesoxinucleótidos (ddNTPs) (Figura 3.6). Estos
ma se puede secuenciar en unos días y a un precio ddNTPs son la clave en la secuenciación por el mé-
algo superior a los 4.000 dólares (http://www.ge- todo de Sanger. Por un lado, no tienen el grupo OH
nome.gov/sequencingcosts/). La ingente cantidad en 3’, lo que impide que tras su incorporación a la
de datos generada por esta tecnología ha permiti- cadena de DNA naciente se incorpore ningún nu-
do identi�icar millones de variantes genéticas que cleótido más. Por otro lado, estos ddNTPs están
deben explicar por qué cada persona es distinta, marcados de alguna manera para poder visuali-
por qué se sufre una enfermedad, cuál es nuestra zarlos. Antiguamente venían marcados con algún
predisposición a sufrir una determinada enferme- elemento radioactivo; sin embargo, en la actualidad,
dad o por qué se responde de manera diferente a cada ddNTP va marcado con una molécula �luores-
medicamentos. No obstante, debido a su precio y cente diferente. Al �inal de esta reacción se tendrán
complejidad la secuenciación masiva sigue asociada fragmentos de todos los tamaños con un nucleó-
a grandes laboratorios y consorcios de genómica. tido �inal distinto. Esto permite que mediante un
Las variaciones genéticas más frecuentes son láser, y tras una electroforesis se pueda conocer la
los polimor�ismos de un único nucleótido (del in- secuencia del fragmento mediante la lectura de un
glés, SNPs). A esto hay que sumar deleciones, electroferograma (Figura 3.7).
inserciones, traslocaciones, inversiones, duplicacio- La secuenciación masiva o NGS (por next ge-
nes, etc. La mayoría se pueden detectar mediante la neration sequencing) se puede realizar por muchas
tradicional secuenciación por el método de Sanger, tecnologías diferentes y resultaría imposible re-
que sigue muy vigente. En él, básicamente, se parte sumirlas en un solo apartado. Las aplicaciones en
de una cantidad determinada del fragmento de DNA DNA de esta técnica van desde la secuenciación
a secuenciar (plásmido, producto de PCR, etc.), de de un panel de genes seleccionados hasta la se-
un oligonucleótido complementario a una región en cuenciación del genoma entero de un individuo, o
la zona 3’ de la secuencia que nos interesa conocer la secuenciación de todas las regiones codi�ican-
y que va a actuar como cebador, una DNA polimera- tes de un genoma, es decir, el exoma. En cualquiera
87
Métodos en biociencias
Tema 3, página 11
Anillamiento
72ºC Elongación
Taq$
Fluorocromos
Figura 3.6. Representación de una reacción de secuenciación por una TaqDNA polimerasa con
Figura 3.6: Representación
didesoxinucleótidos marcadosde una reacción de secuenciación
fluorescentemente. poren
Disponible una TaqDNA polimerasa con didesoxinucleótidos
color.
marcados �luorescentemente.
Figura 3.7: Resultados de una secuenciación automática. Electroferograma de resultados obtenidos. Polimor�ismo iden-
ti�icado en posición 311 dónde se pueden observar dos picos diferentes: verde (Adenina) y negro (Guanina). Disponible en
color.
88
imposible tratarlas todas en un único capítulo, pero sí que se ha
estuvieran reflejadas las más utilizadas tanto en genotipado de
estudios de expresión génica.Análisis de ácidos nucleicos
que lo desarrolla.
Una vez obtenidas las secuencias, estas deben
ser alineadas para generar la secuencia consenso.
Esta se compara con un genoma de referencia y se
anotan las variantes entre ambas. El paso más com-
plicado suele ser asociar las variantes con un efecto
biológico. Así, por ejemplo, en un exoma es fácil que Figura 3.8. Esquema representando un ciclo de PCR. Triángulos y cuadrados represen
se tengan más de 50.000 variantes. Para ello se re- Figura 3.8: Esquema representando un ciclo de PCR. Triángulos y cuadra-
dos representan nucleótidos.
quiere el uso de herramientas bioinformáticas y, Curvas de desnaturalización
normalmente, personal especializado.
Al igual que para el DNA, también se puede se- Otro concepto importante en PCR son las curvas de desnaturalizació
cuenciar masivamente las moléculas de RNA de una no
entreson masºC,que
94-96 la va
lo que representación
a proporcionar dela la cantidad de molécula
energía
determinada muestra. El �in de la secuenciación necesaria para
permanecen en romper
forma de losdoble
enlaces por puente
cadena de
en un rango de temperatur
masiva de RNA no es tanto conocer las secuencias, hidrógeno establecidos entre los nucleótidos com-
aquella temperatura en la que el 100% de moléculas está forman
sino identi�icar qué genes se están expresando en plementarios. La unión
un tipo celular o tejido y cuanti�icar el nivel de ex- hasta aquella en la quede elA100%
con Testá
se realiza a través
en forma de cadena sencilla. L
presión de los mismos. Para ello, el número de veces la que el 50% de las moléculas están en Cforma
de 2 puentes de hidrógeno mientras que la de con de hebra sencil
G es a través de 3 puentes de hidrógeno. Esto hace
que se secuencia una misma región de un transcrito temperatura de desnaturalización (Tm), o también temperatura de m
que la energía necesaria para romper un enlace A-T
es directamente proporcional al número de molécu- una molécula
sea menor de DNA
que para romper esundependiente
enlace G-C. Una delvez tamaño y de la c
las de RNA de ese transcrito que había en la muestra nucleótidos.
separadas las cadenas complementarias del DNA (G) o citosinas (C
Una elevada proporción de guaninas
original y, por lo tanto, una representación del nivel Tm
molde mayor ya que que
es necesario la interacción entre estos
los oligonucleótidos ceba-dos nucleótidos e
de expresión de ese gen. Técnicamente,
dores (comúnmente se puede detectar
conocidos la Tm
como mediante
primers, del agentes intercalan
doble
inglés)hebra, como
hibriden con por ejemplo homóloga.
la secuencia el SYBRGreen, Esta esque cuando está u
3.3.2. Reacción en cadena de la polimerasa hebra de anillamiento
la faseemite una intensa y suele darse a unas
fluorescencia, tempe-
mientras que cuando el DNA
raturas que oscilan entre 55 ºC y 65 ºC. Esta fase
se despega del mismo y emite una fluorescencia muy baja. De esta
La reacción en cadena de la polimerasa, o PCR de es crítica puesto que una temperatura demasiado
sus siglas en inglés, consiste en la ampli�icación de elevada podría hacer que no se obtuviera ampli�i-
un fragmento especí�ico de DNA mediante la suce- cación, y una temperatura demasiado baja podría
sión de ciclos de temperatura y tiempo variables. hacer que se consiguiera una ampli�icación ines-
Para ello se emplean dos oligonucleótidos de se- pecí�ica. La composición de bases y el tamaño de
cuencia idéntica al DNA molde que actúan como la pareja de oligonucleótidos determinará la tem-
cebadores y que de�inen los límites de la secuen- peratura de anillamiento óptima. Una vez que se
cia ampli�icada. La enzima capaz de leer la cadena produce el anillamiento, la Taq DNA polimerasa es
de DNA molde e incorporar los nucleótidos comple- capaz de reconocerlo y comienza a leer la secuen-
mentarios se denomina Taq DNA polimerasa. cia molde y sintetizar la cadena complementaria
En general, cada ciclo de la PCR tiene tres fases incorporando nucleótidos libres y uniéndolos a la
diferenciadas (Figura 3.8). La primera fase, deno- molécula naciente. Esta fase de extensión se produce
minada de desnaturalización, se va a llevar a cabo normalmente a 72 ºC, que es la temperatura óptima
89
Métodos en biociencias
90
Análisis de ácidos nucleicos
91
Métodos en biociencias
92
Análisis de ácidos nucleicos
SNaPshot
Con las técnicas descritas hasta ahora se puede de-
tectar un único SNP cada vez y en cada reacción. La
técnica de SNaPshot fue desarrollada para poder
identi�icar varios polimor�ismos (2-20) en una úni-
ca reacción a partir de nanogramos de DNA y con
un bajo coste. Uno de los kits desarrollado por Life
Technologies que cumple con los requisitos para su
aplicación en la investigación forense es el SNaPs-
hot® multiplex system for SNP genotyping, basado
en la técnica de extensión del cebador (primer ex-
tension) en una única base (Figura 3.12a). En primer
lugar, se realiza una PCR de las regiones del genoma B
donde se localizan los SNPs que se pretende iden-
ti�icar. Una vez obtenido el DNA molde, el usuario
diseñará oligonucleótidos en la región 5’ adyacente
a la posición cuya secuencia se analizará de tal ma-
nera que el siguiente nucleótido sea el que se quiere
conocer. Posteriormente, se realiza una PCR con el Figura 3.12: (A) Esquema de concepto de SNaPshot para
DNA ampli�icado, los oligonucleótidos, DNA poli- un único cebador. (B) Caso real de SNaPshot para deter-
minar el genotipo de 13 polimor�ismos distintos en el gen
merasa y didesoxinucleótidos trifosfato (ddNTPs) CYP2D6. Disponible en color.
marcados cada uno de ellos con un �lurocromo dife-
rente. Durante la reacción el oligonucleótido se une
a la cadena homóloga y a continuación la enzima
añade el ddNTP complementario a la primera base. dependiendo del tamaño total que origina la repe-
Al carecer este del grupo 3’-OH imprescindible para tición: DNA satélite (100 kb a varias megabases),
la formación del enlace fosfodiéster, la polimera- DNA minisatélite (repeticiones de 6 a 25 nucleóti-
sa no puede seguir añadiendo más nucleótidos y dos que originan regiones de 100 nucleótidos a 20
la reacción termina. Los fragmentos extendidos kb) y DNA microsatélite (repeticiones de 2, 3 o 4 nu-
marcados con el �luorocromo de la base recién cleótidos de tamaño no superior a los 150 pb). Las
incorporada se separan por electroforesis, revelán- técnicas empleadas en detectar estas variaciones
dose en forma de diferentes picos de color en un son múltiples.
electroferograma (Figura 3.12a). El DNA minisatélite o repeticiones en tándem
de número variable (VNTR), fue el primer mar-
Técnicas para detectar variación en el número de cador que se utilizó con �ines de identi�icación en
copias (CNVs) genética forense en la década de los 80. Para su de-
terminación se empleaba la técnica de Southern. La
Se estima que la diferencia entre la secuencia de unidad de repetición se utiliza como sonda fren-
nucleótidos del genoma de dos individuos varía en- te al DNA de las muestras digerido con enzimas de
tre el 0.1 y 0.4%, lo que supone más de 3 millones restricción. Tras la digestión enzimática los frag-
de nucleótidos diferentes. Esta diferencias se de- mentos de DNA se separan mediante electroforesis
ben principalmente a 2 tipos de variaciones: SNPs en geles de agarosa para posteriormente ser trans-
y CNVs (variaciones en el número de copias). A esta feridos por capilaridad a una membrana de nylon,
última clase pertenece el DNA repetido en tándem soporte estable al que se �ija el DNA, y al que se aña-
que consiste en bloques de DNA que se repiten de de el fragmento de DNA minisatélite marcado con
forma consecutiva, y que recibe distintos nombres P32, o digoxigenina. El revelado de la señal de hibri-
93
Métodos en biociencias
94
Análisis de ácidos nucleicos
mina retrotranscripción y es llevado a cabo por ta de comparar la expresión del gen problema con
retrotranscriptasas en presencia del RNA, desoxi- la de otro que se utilizará como referencia. En este
nucleótidos y un oligonucleótido que actúa como sentido, hay un grupo de genes, denominados de
cebador. En una retrotranscripción se pueden expresión constitutiva o housekeeping, cuya expre-
utilizar varios tipos de cebadores: oligo dT, que sión permanece con muy poca variación a lo largo
aprovecha que los mRNA en su extremo 3’ tienen de diferentes condiciones, que son frecuentemen-
una cola de adeninas; una mezcla de hexámeros o te utilizados como gen de referencia. En este grupo
decámeros degenerados, que como tienen múlti- se encuentran genes como GAPDH, RP18S, HPRT1 y
ples secuencias van a reconocer distintas zonas ACTB, entre otros.
de las moléculas de RNA, u oligonucleótidos espe- El método clásico de análisis es el 2-Ct. Para
cí�icos, si se quiere ampli�icar solo una secuencia entender este método de análisis hay que tener pre-
especí�ica. Como se trata de una PCR a tiempo real, viamente claros una serie de conceptos (Figura
se necesita una molécula �luorescente que permi- 3.15). Threshold o umbral es el punto en el que la
ta la cuanti�icación del RNA de los genes de interés. ampli�icación es exponencial y por lo tanto los datos
Tras la retrotranscripción, se obtendrá DNA, por comparables entre distintas muestras. Ct es el nu-
lo que los métodos de detección serán idénticos a mero o fracción de ciclo que para una ampli�icación
los mencionados anteriormente. Los más usuales determinada corta con la línea del threshold. Ct es
son el uso de �luoróforos inéspecí�icos, como SYBR la diferencia de Ct para una misma muestra entre
Green, o el uso de sondas especí�icas, tipo TaqMan. el gen de estudio y el gen de referencia. Ct es
La expresión de RNA por PCR a tiempo real se la diferencia en dos muestras diferentes entre dos
puede realizar de dos maneras, cuantitativa y se- Ct para el mismo gen usando el mismo gen de re-
micuantitativa. En la cuantitativa se determina el ferencia. Así, una diferencia de Ct de 1 signi�ica
número absoluto de moléculas de un determinado que para el gen X en dos muestras diferentes (con-
RNA. Para ello, hay que crear una curva estándar trol y problema) hay una diferencia normalizada
con diluciones de un RNA de concentración cono- de 1 ciclo, lo cual asumiendo que en cada ciclo de
cida y extrapolar el dato obtenido con la muestra ampli�icación se tiene el doble de producto ampli-
problema en la curva. En la semicuantitativa se tra- �icado, supone que en la muestra problema el gen
95
Métodos en biociencias
96
Análisis de ácidos nucleicos
3.4. Aplicaciones
97
Métodos en biociencias
utilizándose para diagnóstico molecular de tumo- no tiene la vía del gen KRAS dañada por variaciones
res y complementar el diagnóstico microscópico de un único nucleótido. Esta asociación es tan clara
realizado por patólogos, alcanzándose un grado de que es obligatorio determinar el genotipo de KRAS
diagnóstico impensable hace solo unos pocos años. previamente a la administración del fármaco, de
Así, por ejemplo, midiendo la expresión de un pe- modo que solo se autoriza a los pacientes sin KRAS
queño grupo de genes en una muestra tumoral se mutado. Igualmente, en otros campos como enfer-
puede calcular el riesgo de recaída de una manera medades infecciosas, hay marcadores genéticos que
mucho más precisa que únicamente con el análi- permiten, por ejemplo, identi�icar pacientes porta-
sis del corte histológico. De esta manera, se puede dores del virus de la inmunode�iciencia humana
conocer mejor el pronóstico de pacientes con algu- (VIH) que pueden tomar el antirretroviral abaca-
nos tipos de cáncer y elegir el mejor tratamiento vir sin ningún temor a desarrollar una reacción de
posible. Esta mejor caracterización del tumor está hipersensibilidad al fármaco, hecho que se da en el
cambiando el tratamiento que reciben muchos pa- 4-8% de los pacientes y puede llegar a ser mortal.
cientes evitando dar quimioterapia a quien antes se En hepatitis C existe un SNP (rs12979860) que de-
le daba y no lo necesitaba, y dándosela a quien tiene �ine a una población de pacientes con una mayor
un alto riesgo de recaída y antes no se le trataba. A probabilidad de resolver la enfermedad de mane-
nivel de investigación hay miles de estudios identi�i- ra espontánea, así como de responder a la terapia
cando marcadores de expresión génica para de�inir con interferón/ribavirina. Estos ejemplos no hacen
tanto el pronóstico de la enfermedad como la pre- más que crecer en todos los campos de la medicina
dicción de la respuesta al tratamiento, pero solo y en todos ellos las técnicas de genotipado que se
unos pocos han llegado en la actualidad a la prác- han tratado aquí son de gran utilidad.
tica clínica. Una de las aplicaciones más relevantes deriva-
El análisis genético también permite la iden- das del análisis del genoma es el de la identi�icación
ti�icación de microorganismos. Esto cobra especial de individuos llevada a cabo en Genética Forense. El
relevancia en medicina ya que se puede establecer genoma humano consta de unos 3x109 pb, de los
qué cepa está infectando a un paciente concreto y que únicamente alrededor del 1-2% codi�ica para
seleccionar el mejor tratamiento posible. Además proteínas funcionales. Por lo tanto, el genoma está
los análisis genéticos pueden ser más precisos y di- formado en su mayor parte por secuencias no co-
ferenciar cepas que de otra manera sería imposible di�icantes o no informativas en cuanto a la síntesis
o muy laborioso. de RNA. Este DNA no codi�icante tiene una menor
En los últimos años se empieza a hablar de presión selectiva y un número de copias por geno-
farmacogenómica que es la parte de la genética ma que es muy variable entre los individuos, lo que
que estudia las variaciones, tanto en la secuencia hace que sea una fuente de polimor�ismo de gran
de DNA como en la expresión de los genes, en re- utilidad en las pruebas de identi�icación forense.
lación en la respuesta a los fármacos. Se sabe que La determinación de microsatélites o STRs se
la mayor parte de los fármacos no son efectivos en ha convertido en el método más empleado para la
el 100% de los pacientes. De hecho, hay grupos de identi�icación genética generándose cada año millo-
fármacos, como los utilizados en oncología, cuya nes de per�iles de STRs con diversos objetivos, que
efectividad media está por debajo del 30%. Además, incluyen casos criminales, búsqueda de personas
la toma de medicamentos, que no dejan de ser un desaparecidas, desastres masivos, test de paterni-
elemento ajeno al organismo, provoca muy frecuen- dad, etc… A pesar del elevado número de regiones
temente efectos adversos que pueden llegar incluso STR en el genoma, solo es necesario el análisis de
a la muerte. Hoy se sabe que la genética del indi- 10 a 15 gracias a la alta heterocigosidad de este tipo
viduo y la enfermedad son factores fundamentales de marcador (>70%), con una alta proporción de
en la respuesta a los fármacos. La farmacogenética alelos posibles para cada una de las regiones y por
está cambiando el tradicional modelo empleado en tanto con un gran poder de discriminación. Actual-
la medicina durante siglos de «ensayo-error» por mente hay disponibles en el mercado numerosos
el de una medicina personalizada. Así, el análisis kits de identi�icación de STRs siendo el más co-
de ácidos nucleicos en los laboratorios de farma- nocido el desarrollado por el FBI estadounidense
cogenómica está permitiendo seleccionar el mejor basado en 13 STRs tetraméricos y que ha genera-
fármaco, a la mejor dosis para el paciente adecua- do una base de datos denominada CODIS (combined
do. Por ejemplo, en cáncer de colon, se utiliza un DNA index system). Cuando se obtiene el per�il gené-
fármaco, cetuximab, el cual se ha visto que única- tico de un individuo para los 13 loci STR del CODIS
mente bene�icia a aquellos pacientes cuyo tumor (26 alelos en total), la probabilidad de que alguien
98
Análisis de ácidos nucleicos
tenga la misma combinación es de 1 en 100 billo- Estas son solo algunas de las múltiples apli-
nes. El CODIS almacena per�iles obtenidos mediante caciones de las técnicas experimentales con ácidos
el método descrito anteriormente en dos bases de nucleicos que son ya hoy una realidad y una muy
datos diferenciadas; una con per�iles STR de indi- pequeña muestra de las que habrá en un futuro cer-
viduos condenados por casos criminales y otra con cano.
per�iles STR de casos sin resolver. Cuando se reali-
za un per�il STR con el método CODIS, el resultado
se compara automáticamente con los per�iles alma-
cenados en esta base de datos, de tal manera que en
caso de coincidencia se podría con�irmar la autoría
de un crimen. Bibliografía
El abaratamiento y la rapidez de las nuevas
técnicas de secuenciación genómica también han DNA Microarrays. 2008.
abierto la posibilidad de su uso en pruebas de iden- Schena M (ed). Scion Publishing. ISBN 978-1904842156.
ti�icación, ya que el conocimiento de la secuencia Forensic DNA Applications: An Interdiciplinary Perspec-
del genoma completo no ofrecería ninguna duda tive 2014.
sobre la identidad de la muestra analizada. Sin em- Primorac D, Schanfield M (eds). CRC Press. ISBN 978-
1466580220.
bargo la gestión y almacenamiento de la cantidad
Lewin Genes. Fundamentos. 2012.
ingente de datos generados es un problema todavía Krebs JE, Goldstein ES, Kilpatrick ST. Editorial Médica Pa-
sin resolver, aunque es un buen sistema para buscar namericana. ISBN 978-6077743385.
nuevos SNPs informativos para análisis de identi�i- Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 2012.
cación forense futuros. Green MR, Sambrook J. Cold Spring Harbor Laboratory
Los estudios genéticos se están extendien- Press. ISBN 978-1936113422.
do a otros ámbitos, como la seguridad y control de Next-Generation Sequencing: Current Technologies and
calidad de alimentos. Así, por ejemplo, se puede Applications. 2014.
identi�icar si hay trazas contaminantes de caballo Jianping X (ed). Caister Academic Press. ISBN 978-
1908230331.
en carne picada vendida como de ternera. Para ello
PCR. Methods Express. 2007.
solo se tiene que hacer una PCR con oligonucleóti- Hughes S, Moody A. Scion Publishing. ISBN 978-
dos que reconozcan una secuencia especí�ica en el 1904842286.
DNA de caballo. También se utilizan test genéticos Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. 2012.
para determinar trazas de alimentos transgénicos Altman RB, Flockhart D, Goldstein DB (eds). Cambridge
en productos que supuestamente no lo son. University Press. ISBN 978-0521885379.
99
4.
Cultivos celulares
Guillermo Bodega
Juan Manuel González-Triguero
José Luis Copa Patiño
Los estudios desarrollados con material biológi- teraccionar entre sí y acabar generando un órgano
co vivo fuera del propio organismo se denominan funcional lo más parecido posible al original; en el
estudios in vitro; por el contrario, aquellos que se cultivo histotípico el objetivo es generar un tejido.
desarrollan sobre animales o plantas enteros se con- En ambos casos se persigue la creación in vitro de
sideran estudios in vivo. Los estudios in silico son órganos o tejidos para utilizar en injertos o trans-
los que se realizan de forma simulada en un com- plantes; la disciplina que se ocupa de ello recibe el
putador, sin emplear material vivo o seres vivos. El nombre de ingeniería de tejidos. Por cultivo de cé-
término cultivo hace referencia a la técnica o proce- lulas se entiende el crecimiento y expansión in vitro
so que permite el mantenimiento y/o crecimiento de células obtenidas de un determinado tejido por
del material biológico. En el momento actual se pue- disgregación espontánea, mecánica o enzimática. Es
den de�inir cinco tipos de cultivos in vitro: cultivo de el modo más habitual de cultivo, por lo que será el
embriones, cultivo de órganos, cultivo de explantes, tipo de cultivo al que se dedicará mayoritariamente
cultivo organotípico/histotípico y cultivo de células. este capítulo. Los métodos y condiciones de cultivo
El cultivo de embriones tiene como objetivo per- de células animales, vegetales y microorganismos
mitir el desarrollo de embriones, ya sea con �ines son diferentes; por ello en los últimos epígrafes de
reproductivos, como suele ser usual en las técnicas este capítulo se analizarán las peculiaridades que
de fertilización in vitro, o para estudiar desarrollo conlleva el cultivo de material biológico de origen
embriológico. En el cultivo de órganos se mantie- vegetal y el de microorganismos.
ne vivo, fuera del cuerpo, un determinado órgano Los estudios in vitro se diseñaron como una
ya formado, por ello no se produce propagación ce- herramienta que habría de permitir la reproduc-
lular, y el crecimiento suele ser pequeño. El cultivo ción total o parcial de las condiciones existentes
de explantes consiste en colocar, en el dispositivo in vivo. El primer intento fue realizado por Roux
de cultivo, un pequeño fragmento de un órgano a en 1885 con células de embrión de pollo. Los tra-
partir del cual pueden crecer, migrar y expandirse bajos de Harrison (1907), utilizando explantes de
algunas de las células que forman parte de dicho ór- médula espinal de an�ibios, Carrel (premio Nobel de
gano. Los cultivos organotípicos son aquellos que Medicina y Fisiología en 1912) y Burrows (1913),
contienen diferentes tipos celulares que pueden in- y Rous y Jones (1916) fueron el cimiento que per-
Métodos en biociencias
mitió el despegue y desarrollo del cultivo celular en �lujo laminar, sistemas de esterilización, micros-
las décadas de los 50 y 60, donde destacan los tra- copio, dispositivos de enfriamiento (frigorí�icos y
bajos de Eagle (1955), Dulbecco (premio Nobel de congeladores), centrífuga y almacén de material
Medicina y Fisiología en 1975), Ham (1963) y Sato fungible de diseño exclusivo (altamente ergonómi-
(�inales de los años 60), dedicados principalmente co) que comprende material de disección, pipetas,
al establecimiento de las condiciones de cultivo y la botellas de vidrio con tapón, placas de cultivo Petri
formulación de medios de cultivo. y multipocillo (también llamadas de microtitula-
El aporte de las técnicas de cultivo celular ción, multiwell plates), frascos (�lasks), tubos tipo
en el campo de las biociencias ha sido capital en Falcon, �iltros, jeringas...
el desarrollo de muchas disciplinas; por ejemplo,
el conocimiento actual sobre el ciclo celular o las — Incubador de CO2. Es una cámara estan-
vías de señalización intracelulares en el campo de ca que permite la regulación exacta de la
la Biología Celular hubiese sido impensable sin la temperatura y de la concentración de ga-
ayuda de los cultivos celulares. La Embriología es ses con un dispositivo que moviliza estos
otra de las disciplinas donde las técnicas de culti- para conseguir una mezcla homogénea.
vo celular han tenido un gran impacto. Por último, La mayoría de los incubadores regulan
la aplicación de las técnicas de cultivo celular tam- únicamente la concentración de CO2, aun-
bién ha sido esencial en el desarrollo del campo de que hay algunos que regulan CO2 y O2. La
la reproducción asistida, de la terapia celular, o de la humedad necesaria se consigue intro-
biotecnología, ejemplo de este último campo son duciendo agua en la parte inferior de la
la obtención de anticuerpos monoclonales y el cámara con lo que la atmósfera está satu-
aislamiento y expansión de células madre. rada de humedad. Esta agua ha de incluir
algún producto para impedir el crecimien-
to de microorganismos. La temperatura
4.1. Cultivo de células animales para células de mamífero suele ser de
37° C y un 5% de CO2. La concentración
4.1.1. El laboratorio de cultivo de CO2 debe controlarse cuidadosamen-
te puesto que, además de corresponder a
La peculiaridad de las técnicas de cultivo aconse- la que están expuestas las células in vivo,
ja, siempre que se pueda, disponer de laboratorio determina la estabilidad del tampón del
y personal destinado exclusivamente a tal �in. Esto medio donde crecen las células. De acuer-
deja de ser aconsejable y pasa a ser obligatorio do con la ecuación inferior, un aumento
cuando se cultivan seres vivos o células con peligro de protones causado por el metabolismo
potencial o real. En este apartado solo se considera- de las células sería amortiguado por el bi-
rán las condiciones idóneas de trabajo para el caso carbonato del medio de cultivo.
de cultivos con una peligrosidad baja o nula, pues el
cultivo de células peligrosas está regulado por una CO2 + H20 ↔ H2CO3 ↔ H+ + HCO3-
normativa muy estricta que exige dar cumplimien-
to a unos requerimientos que no se atenderán en Un aumento brusco de CO2 provocaría
este capítulo. una bajada de pH pues desplazaría el
Si se dispone de un laboratorio dedicado exclu- equilibrio hacia la derecha y, al contrario,
sivamente al cultivo de células, este debería –como una brusca bajada de CO2 determinaría la
mínimo– disponer de un sistema de ventilación basi�icación del medio. Este último es un
propio, con presión positiva de aire para evitar su hecho fácil de comprobar, basta con sa-
entrada desde el exterior, una zona intermedia para car un recipiente de cultivo del incubador
cambiar de batas y evitar contacto directo entre el (5% CO2) y dejarlo al aire (0.5% CO2) e in-
exterior y el interior del laboratorio, y un sistema mediatamente el color del indicador de
de iluminación especial con lámparas germicidas; pH que lleva el medio de cultivo adquiere
además, el equipo necesario debería estar incluido tonos bermellones y violetas que indican
al completo en el laboratorio para evitar continuas un pH básico.
salidas y entradas de la sala, que incrementan el También existen estufas secas y sin
riesgo de contaminación y conllevan errores de ma- gas para otros tipos de cultivos, que no
nipulación y pérdidas de tiempo. son sino dispositivos en los que solo se
El equipamiento básico de un laboratorio de controla la temperatura. En este caso el
cultivos debe incluir: incubador de CO2, cabinas de recipiente donde se cultivan las células
102
Cultivos celulares
Figura 4.1: Esquema de diferentes tipos de cabinas: �lujo horizontal (A), clase I (B), cla-
se II (C) y clase III (D).
103
Métodos en biociencias
104
Cultivos celulares
Figura 4.2: Placas Petri y multipocillo (multiwell) de 6, 12, 24 y 96 pocillos (A). Flasks (B) y tubos Falcon (C) de
diferentes tamaños.
pues multitud de reactivos empleados en cultivo y la contaminación del operario. Entre todas
los cultivos han de almacenarse o guar- ellas se citan solo las más básicas:
darse a 4 °C o congelados (-25 y -80 °C).
Además, en el caso de preservar cultivos — Limpieza previa de manos con jabón o
por congelación, también es imprescindi- etanol de 70°.
ble el uso de sistemas de congelación por — Uso de bata, guantes y mascarilla (si es
nitrógeno líquido (-196 °C) o en atmósfe- necesario). Bata y mascarilla deben estar
ra de nitrógeno líquido (-170 °C). limpias y los guantes estériles.
— Centrífugas. Normalmente se usan de — Tener la certeza de que se usa material
baja velocidad, no más de 300g, pues no estéril; ante la duda se ha de considerar
es bueno centrifugar suspensiones celu- no estéril y desechar.
lares a más de 200g porque las células — Revisión y limpieza de los aparatos, espe-
corren el riesgo de dañarse al chocar con- cialmente cabinas de �lujo e incubador. En
tra el plástico o vidrio a gran velocidad, o relación con la cabina es necesario com-
de reventarse al comprimirse en el fondo probar periódicamente que el �iltro es
del tubo. Es importante que sean refrige- efectivo y no está contaminado, y que el
radas y que dispongan de un sistema de valor del �lujo de aire oscila entre 0.3 y 0.5
rotores o adaptadores que permitan cen- m/s. En relación con la estufa conviene
trifugar los distintos tipos de recipientes comprobar que los valores de temperatu-
–y de distintos tamaños– donde se cul- ra y concentración de CO2 indicados son
tivan y/o trans�ieren las células (tubos, correctos. La limpieza del interior de la
placas Petri y multipocillo, �lask…). cabina y del incubador se puede hacer
— Material. Hace algunos años el mate- con alcohol de 70° o, mejor aún, con pro-
rial que se usaba era de vidrio y tenía ductos especí�icos destinados a tal �in.
que ser lavado cuidadosamente y este- — Depuración en la técnica de rutina, es
rilizado; hoy día, sin embargo, la mayor decir, la manipulación del material o su
parte del material es desechable (placas colocación y distribución en la cabina de
Petri, placas multipocillo de 6, 12, 24 o 96 �lujo.
pocillos, pipetas, puntas para micropipe-
tas, �lasks, jeringas, �iltros... (Figura 4.2).
Normalmente todo ello es de plástico es- 4.1.3. El medio de cultivo
terilizado por radiación γ. El material
reutilizable más usual suele ser el de di- Composición y clasificación
sección y algunos recipientes de vidrio
El medio en el que crecen las células, llamado por
como las clásicas botellas con tapón.
ello medio de cultivo, va a tener una importancia
crucial por su triple objetivo: reproducir un am-
4.1.2. Técnica aséptica biente lo más parecido posible al que las células
tienen in vivo, permitirles crecer (aumentar en ta-
Consiste en un conjunto de reglas y modos de ope- maño) y proliferar (aumentar en número). Desde
rar que tiene como �in evitar la contaminación del un punto de vista �ísico existen medíos líquidos
105
Métodos en biociencias
y medios sólidos (geles), estos últimos son más yentes usuales e importantes del medio de cultivo,
utilizados en cultivos vegetales y de microorganis- y en algunos casos hay que añadirlas como suple-
mos por lo que se estudiarán al �inal del capítulo. mento, pero en otros ya están incluidas en el medio
Desde un punto de vista químico, el medio de cul- de cultivo, por lo que no deberían ser consideradas
tivo se puede de�inir como una disolución acuosa como tal.
que incluye material inorgánico (sales) y orgánico Los dos suplementos más importantes y ha-
(nutrientes fundamentalmente) a la que se puede bituales de un medio de cultivo son el suero fetal
y/o debe añadir diferentes suplementos. Por ello, la bovino (FBS, fetal bovine serum) y los antibióticos.
composición de los medios de cultivo es muy com- El empleo o no del suero provoca la aparición de dos
pleja y abrumador el número de medios de cultivo grandes tipos de medios de cultivos: los no de�ini-
distintos debido a diferencias cualitativas y cuanti- dos (con suero) y los de�inidos (serum-free media).
tativas en su formulación; sin embargo, todos ellos A los medios de cultivo con suero o no de�inidos se
poseen una serie de requerimientos básicos: les suele añadir 10-15% de FBS, pues aporta los nu-
trientes y factores que ayudan a las células a crecer
— El medio de cultivo ha de actuar como y, sobre todo, a proliferar. El término «no de�inido»
tampón (pH 7.2-7.6). Para ello suelen se aplica porque el FBS incluye multitud de produc-
llevar un tampón fosfato al que se aña- tos, no todos bien conocidos y de concentración no
de bicarbonato (2.2 g/L) y/o HEPES (20
determinada. A veces es usual utilizar el 10-15% de
mM), este último sobre todo cuando no se
FBS al inicio del cultivo, para ayudar a su expansión,
usa CO2.
y luego pasar a condiciones de baja concentración
— El medio ha de ser isotónico (310 mOsm de suero, 0.5-1.5% de FBS (serum reduced media).
en humanos). El compuesto más usa- El FBS suele ser descomplementado para inactivar
do para corregir la presión osmótica es factores del complemento que pudiesen afectar
el NaCl, aunque también se suelen usar a las células; esto se consigue calentándolo en un
el Ca2Cl y el KCl. Además, algunos de es- baño a 56° C durante 30 min.
tos iones también sirven para facilitar la
Los medios de�inidos, también llamados li-
unión de las células al sustrato o actúan
bres de suero, son aquellos que no contienen FBS,
como cofactores.
y existen distintos tipos: (a) los libres de suero pro-
— El medio de cultivo ha de ser fuente de
piamente dichos, que no incluyen FBS pero pueden
(1) energía, (2) aminoácidos y (3) lípidos.
tener extractos proteicos o lisados de origen ani-
Como fuente de energía se suele añadir
mal; (b) los medios libres de proteína (protein free
glucosa o derivados como el pirúvico; ga-
media), que no incluyen ni FBS ni proteínas de ori-
lactosa y fructosa también pueden ser
gen animal, aunque pueden contener hidrolizados
incluidas. Aminoácidos se añaden casi
de plantas y hongos, y (c) los medios químicamente
todos y de forma más abundante glutami-
de�inidos (chemically de�ined media), que no contie-
na (o algún derivado como el glutamax),
nen ningún producto de naturaleza y concentración
pues actúa como fuente principal de C y
desconocida. Los medios de�inidos suelen necesitar
N. Los lípidos más usuales son ácidos gra-
suplementos, en mayor o menor número depen-
sos y colesterol.
diendo del tipo de medio de cultivo, y entre ellos
— El medio de cultivo actúa como indicador
destacan las proteínas transportadoras (albúmina,
de pH. Para ello se le suele añadir rojo fe-
transferrina…), hormonas (insulina, glucagón, hi-
nol que torna hacia tonos anaranjados y
drocortisona…), factores de crecimiento (GF, growth
amarillos al irse acidi�icando y hacia ber-
factors), lípidos y/o aminas biogénicas como pu-
mellón y violeta si se basi�ica.
trescina.
Los suplementos, en sentido estricto, son aquellos Los antibióticos se añaden con un �in pre-
compuestos que han de ser añadidos al medio de ventivo pues el objetivo es evitar la infección del
cultivo para que este alcance su composición de- cultivo por microorganismos. Lo usual es utilizar
�initiva. Según este criterio no todos los medios una mezcla de penicilina, estreptomicina y algún
necesitan ser igualmente suplementados; ello de- antifúngico; gentamicina también es ampliamente
pende de la composición del medio de partida. Por utilizado pues afecta a micoplasmas.
ejemplo, algunas de las vitaminas del grupo B (tia- Clasi�icar los medios de cultivo no es fácil
mina (B1), ribo�lavina (B2), niacina (B3), ácido por su enorme diversidad, pero una clasi�icación
pantoténico (B5), piridoxina (B6), biotina (B7/B8), muy general puede hacerse considerando su ori-
ácido fólico (B9) o cobalamina (B12)) son constitu- gen como criterio inicial. Por su origen los medios
106
Cultivos celulares
Figura 4.3: Cultivo subcon�luente y con�luente (A1 y A2), y desarrollo de un clon (B1 y B2). A2 es un cultivo en masa, a
diferencia de B2, que lo es clonal.
107
Métodos en biociencias
Un cultivo en masa se obtiene cuando en el matriz extracelular y cortan las proteínas implica-
recipiente de cultivo las células crecen sin que sea das en mecanismos de adhesión celular. La mayor
posible establecer líneas de progenie entre ellas; sin abundancia de unas u otras enzimas depende del
embargo, en el cultivo clonal las células crecen en tipo de tejido escogido para obtener el cultivo pri-
pequeños grupos de modo que cada grupo deriva mario. El procedimiento ha de continuar con los
de una única célula progenitora. pases por pipeta y el �iltrado.
El cultivo en monocapa (2D) indica que las cé- Una vez obtenida la suspensión inicial es ne-
lulas solo se extienden por el sustrato formando una cesario saber el número de células viables que hay
única capa y no crecen unas sobre otras. Los esfe- en dicha suspensión y determinar su concentración,
roides son masas de células de formas redondeadas lo que permitirá sembrar un número determinado
y �lotantes; este modo de crecimiento es típico de de células en cada recipiente de cultivo. La viabili-
células tumorales. Los hemiesferoides –también lla- dad se analiza tomando una pequeña alícuota de
mados islas multicapa– son estructuras intermedias la suspensión y añadiéndole idéntica cantidad de
formadas por masas de células adheridas al sustra- azul tripán al 0.1%. De esta mezcla se toma una pe-
to donde las células pueden crecer unas encima de queña fracción que se usa para recuento y permite
otras. En los últimos años se han desarrollado estra- averiguar la concentración de células en la suspen-
tegias de optimización de cultivos en el campo de la sión. El procedimiento se detalla más adelante en
biotecnología que se denominan cultivos multicapa un apartado especí�icamente dedicado a recuento
o cultivos 3D, en este caso las células no crecen unas (ver epígrafe 4.1.9).
encima de otras pues, en realidad, son dispositivos Para establecer cultivos secundarios a partir
formados por monocapas paralelas. del primario es necesario, en el caso de cultivos ad-
herentes, despegar las células del sustrato. Para ello
Cultivo celular primario se suele usar un procedimiento enzimático que, bá-
sicamente, consiste en retirar el medio, lavar con
Es un cultivo originado directamente a partir de PBS y añadir una solución que incluye tripsina y
células de un órgano o tejido del individuo. Para EDTA, agente quelante que secuestra Ca2+ del me-
obtener las células se usan dos procedimientos bá- dio, lo que conlleva la desestabilización de uniones
sicos: la técnica de explantes y la de disgregación. intercelulares Ca-dependientes. Tras unos minutos
En el primer procedimiento se trocea el tejido en en el incubador de CO2 las células se despegan, se
pequeños fragmentos que se siembran sobre la su- añade entonces suero para bloquear la tripsina y
per�icie del recipiente de cultivo. Es usual que en se centrifuga la solución. Se elimina el sobrenadan-
este caso el medio de cultivo sea bastante rico y te, se lava (con PBS, o medio Hanks, por ejemplo) y
la concentración de suero bastante alta (40-50%). se vuelve a centrifugar. Finalmente se añade el me-
Con el tiempo las células van saliendo del fragmen- dio de cultivo, se dispersa el precipitado celular por
to (explante) y migran y se expanden. En el segundo medios mecánicos (pipeta) y se resiembra el núme-
procedimiento se trata de despegar y separar unas ro de recipientes a la concentración celular que se
de otras todas las células de pequeños fragmentos desee tras hacer un nuevo ensayo de viabilidad y
obtenidos de un órgano o un tejido hasta obtener recuento. Obviamente el establecimiento de culti-
una suspensión de células –aisladas unas de otras– vos secundarios a partir de cultivos en suspensión
que se empleará para generar el cultivo primario. es mucho más sencillo, basta con agitar, tomar una
Existen dos maneras básicas de obtener la suspen- alícuota, contar y resembrar a la dilución escogida.
sión: por disgregación mecánica y por disgregación
enzimática, aunque también es posible diseñar pro- Líneas celulares establecidas
cedimientos de disgregación mixtos e incluso existe
la posibilidad de disgregación espontánea, como Existen algunos miles de líneas celulares derivadas
ocurre en las biopsias de médula ósea. En la dis- de humanos y otros metazoos que pueden adqui-
gregación mecánica se trocea �inamente el tejido rirse y se denominan líneas celulares establecidas.
(habitualmente con tijeras) y mediante pases por La mayoría de ellas no son inmortales y tienen un
pipeta (absorciones y expulsiones repetidas) y el potencial de duplicación limitado, aunque las de
empleo de �iltros se acaba obteniendo la suspen- mayor interés son las que poseen un potencial de
sión celular. La disgregación enzimática requiere duplicación alto; pero existen otras que son capaces
una primera fragmentación suave y el tratamien- de reproducirse continuamente. Estas últimas se
to posterior con soluciones en las que se utilizan han desarrollado a partir de células normales por
enzimas como tripsina, colagenasa, elastasa, hia- modi�icación genética u obtenidas a partir de célu-
luronidasa, proteasas... que ayudan a deshacer la las tumorales. Existen instituciones que adquieren,
108
Cultivos celulares
preservan, autenti�ican y distribuyen estas líneas �lujo. Los hongos pluricelulares se reconocen bien
celulares, por ejemplo, la ATCC (American Type por presentar hifas alargadas y aspecto algodonoso
Culture Collection) y la ECACC (European Collection detectable a simple vista. Suelen diseminarse por el
of Cell Cultures). Para evitar errores conceptuales aire por lo que cuando aparecen es necesaria una
conviene aclarar que una línea inmortal no tiene limpieza especí�ica a fondo de la cabina y el incu-
por qué ser cancerosa; la inmortalidad solo es una bador. La contaminación por levaduras también es
de las muchas características que presentan las cé- frecuente y las más comunes suelen ser las del pan
lulas cancerosas. o la cerveza por lo que parece claro que derivan de
Cuando se solicitan células de estas líneas, las mala manipulación por parte del operador. Los mi-
células vienen congeladas en un medio que incluye coplasmas infectan a las células interiormente y son
un criopreservador. Para congelarlas se suele tomar di�íciles de detectar pues no afectan de modo ma-
1 mL que contenga de 1 a 5 millones de células, se ni�iestamente claro al cultivo, pero alteran algunas
le añade 5-10% DMSO y/o 10% de glicerol y se va funciones de la célula por lo que pueden falsear re-
congelando hasta –50° C a una velocidad de –1°C sultados. Es di�ícil detectar su origen, se cree que
por minuto, después se pasa a nitrógeno líquido. pueden derivar de otras líneas contaminadas traí-
Si no se dispone del dispositivo de bajada gradual das al laboratorio o del suero. Para su detección
de temperatura, suele bastar tenerlas 2 horas a 4 existen kits especí�icos.
°C seguidas de 2 horas a –20 °C, 24 horas a –70 °C El tratamiento de la contaminación por bacte-
y �inalmente en nitrógeno líquido. El descongelado rias, hongos y levaduras es sencillo y depende del
solo consiste en poner los viales en un baño a 37° grado de contaminación. Por ejemplo, si solo algu-
C y resuspender las células en el medio de cultivo. nas placas aparecen contaminadas y esto ocurre de
El desarrollo de estas líneas o estirpes celula- forma esporádica se eliminan estas y no suele haber
res tiene como objetivo su empleo en determinados mayores problemas. Si la contaminación es amplia
tipos de estudios; por ejemplo, la línea CHO-K1 conviene revisar material, comprobar medios y
(CRL 61) (CHO, chinese hamster ovary) es especial- limpiar incubador y cabina de �lujo. Si el problema
mente idónea para trabajos de ingeniería genética y persiste se deben fumigar los aparatos y el labora-
la MDCK (CCL 34) (MDCK, Madin-Darby canine kid- torio. En general ante una contaminación es mejor
hey) para estudios de transporte de membrana. El eliminar el cultivo y no tratar de arreglarlo usan-
código entre paréntesis es la nomenclatura o�icial do antibióticos, pues su uso es preferentemente de
estándar. La primera línea celular fue estableci- tipo pro�iláctico.
da por Gey en 1952 a partir de un cáncer de cuello Los virus también pueden provocar la conta-
de útero, y lleva el nombre de HeLa (CCL 2) en ho- minación del cultivo y, salvo algunos que producen
nor a la persona de la que se tomaron las células, alteraciones morfológicas peculiares en las células,
Henrietta Lacks. su existencia no se puede detectar con los micros-
copios ópticos que habitualmente se utilizan en los
laboratorios de cultivo pues su tamaño es inferior al
4.1.5. Contaminación poder de resolución de estos. En caso de ser nece-
saria, la con�irmación de la contaminación se suele
La extraordinaria riqueza nutritiva de los medios de
hacer por técnicas de biología molecular como la
cultivo les hace muy susceptibles a que otros seres
PCR, o usando técnicas de microscopía electrónica.
vivos de ciclo de vida más corto que la célula que se
La causa de contaminación más habitual es debida
cultiva se instalen en ellos y acaben siendo el ele-
al uso de animales infectados como origen de las cé-
mento predominante. Cuando esto ocurre se dice
lulas del cultivo o al uso de sueros contaminados.
que el cultivo está contaminado, situación que lo
En general hay que desechar los cultivos contami-
inhabilita para su estudio. Considérese que, en con-
diciones de cultivo, una duración razonable del ciclo nados por virus porque no existe posibilidad de
de vida de una bacteria es de 20 min y de una célula tratamiento.
eucariota de 20 horas.
Los agentes contaminantes más habituales son 4.1.6. Aislamiento de un tipo celular
bacterias, hongos pluricelulares y unicelulares (le-
vaduras), y micoplasmas. Las bacterias se ven bien Un cultivo primario recién establecido suele incluir
en el microscopio de contraste de fases y, además, diferentes tipos celulares, re�lejo de la variedad ce-
enturbian y viran el color del medio a amarillo al lular del tejido u órgano a partir del que se obtuvo la
acidi�icarlo. Suelen aparecer por errores en la ma- suspensión de siembra. Sin embargo, en la mayoría
nipulación o mal funcionamiento de las cabinas de de los estudios es necesario utilizar cultivos puros,
109
Métodos en biociencias
110
Cultivos celulares
Clonación en agar
Es un método efectivo y sencillo, pero limitado,
pues numerosos tipos celulares no crecen en agar;
además, este método suele ir bien para células que
crecen en suspensión pero no para células adheren-
tes. La �iabilidad del clonado es mayor que la del
medio anterior, y permite sembrar a una densidad
celular más alta, lo que favorece el desarrollo de clo- Figura 4.5: Clonación en anillos. Imagen de una placa Petri con los
nes. Básicamente, se diluyen células, se mezclan con cilindros (anillos) de clonación (esquina superior izquierda). Una
vez establecidas las colonias (A), se aíslan unas de otras mediante
una solución de agar, se deja enfriar (30 min a tem- los anillos de clonación (B y C). C es la vista cenital de la imagen B.
peratura ambiente) para que solidi�ique el agar, y Las células del clon escogido se despegan mediante tripsina y se ex-
después se pasan a la estufa a 37° C. Entre 1 y 3 se- panden en otra placa (D).
111
Métodos en biociencias
112
Cultivos celulares
todos. Obviando las estimaciones de masa celular, lado) utilizados para contarlas. La multiplicación
el número de células de un cultivo se suele determi- por 2 se hace para corregir la dilución del azul tri-
nar por la observación al microscopio óptico de una pán, y por 5000 para referir la concentración a mL.
alícuota de suspensión celular, o bien de su recuen- El volumen de un cuadro de 1 mm2 es de 0.2 mm3 (1
to mediante un dispositivo eléctrico o por medio de mm de base x 0.2 mm de altura), lo que representa
un citómetro de �lujo. 1/5000avo de 1 mL; nótese que 0.2 mm3 multipli-
cados por 5000 son 1000 mm3, que equivalen a 1
cm3 (1 mL). Si la suspensión estuviese muy concen-
Recuento al microscopio óptico
trada y solo se utilizasen cuadrados pequeños es
El recuento se suele llevar a cabo en cámaras de re- necesario modi�icar la expresión anterior para ob-
cuento, también llamadas hemocitómetros (su uso tener la siguiente: C=(n/cp) x 2 x 80000, donde cp es
tradicional fue para contar células sanguíneas) o el número de cuadrados pequeños y 80000 el factor
vulgarmente cámaras cuenta glóbulos. Las cáma- de conversión a mL pues cada cuadro pequeño es
ras de Neubauer o Fuchs-Rosenthal son de las más 1/80000avo de 1 mL.
usadas, aunque actualmente existen cámaras dese-
chables cuyo recuento está automatizado. Una gota Recuento eléctrico
de una alícuota de la suspensión celular con azul tri-
pán (1:1 v:v) se coloca entre un cubre y un porta El más característico es el contador Coulter. El paso
que tiene una pequeña depresión y permite dife- de una célula por una pequeña abertura determina
renciar las células muertas (teñidas de azul) de las una caída en el potencial del sistema y esa caída es
vivas (refringentes). En la cámara Fuchs-Rosenthal proporcional al tamaño de la célula por lo que per-
(Figura 4.8) la depresión es de 0.2 mm de altura y mite no solo contar sino indicar el tipo celular por
en ella se traza una cuadrícula donde cada mm2 está tamaño (Figura 4.8).
delimitado por tres líneas y subdividido en 16 pe-
queños cuadrados, delimitados ahora por una única Recuento con el citómetro de flujo
línea. La concentración de células C (en céls/mL)
viene dada por la siguiente expresión C=(n/cg) x 2 El funcionamiento del citómetro de �lujo se estudia-
x 5000, donde n es el número de células contadas rá en el capítulo 6, dedicado completamente a tal
y cg el número de cuadrados grandes (de 1 mm de dispositivo.
113
Métodos en biociencias
114
Cultivos celulares
un sistema especial de rotores y unos dis- ta que se va a poner en cultivo. Según los objetivos
positivos que permiten ir separando las que se persigan el explante puede ser: meristemos,
células por tamaño y densidad (paráme- fragmentos de hojas, tallos, raíces, embriones, ór-
tros que varían a lo largo del ciclo) y su ganos completos, células haploides formadas tras
extracción independiente. el proceso meiótico, etc. Un requisito importante es
que el explante debe estar libre de virus, bacterias
u hongos por lo que suele ser necesario someter-
4.2. Cultivos vegetales lo a un proceso de desinfección. La desinfección del
explante es un paso crítico al iniciar un nuevo cul-
Los primeros intentos para cultivar células vege- tivo in vitro ya que de no conseguirse hará inviable
tales in vitro se realizaron a principios del siglo ��, el establecimiento del cultivo e impedirá cualquier
en concreto en 1902, cuando el �isiólogo alemán proceso posterior que se pretenda realizar. Algunos
Gottlieb Haberlandt consiguió mantener vivas en explantes, como son las espigas cuando aún no han
un medio nutritivo durante un mes células aisladas, salido de la vaina o los embriones de semillas inma-
que, aunque no llegaron a dividirse, sí incremen- duras, son muy fáciles de desinfectar. Sin embargo,
taron su tamaño y acumularon almidón. Además, en las raíces, tallos y hojas maduras puede resultar
Haberlandt propuso la hipótesis de que las células una tarea casi imposible, siendo escasos los traba-
vegetales son totipotentes y por tanto capaces de jos en los que se utiliza este tipo de material vegetal.
regenerar plantas completas. Veinte años más tarde
Cuando el explante aún no ha entrado en
Kolte y Robbins consiguieron cultivar in vitro raíces
contacto con el exterior basta con desinfectar las
y meristemos de tallo. A partir de este momento,
comenzó una intensa actividad de investigación re- super�icies externas mediante un tratamiento quí-
lacionada con el cultivo in vitro vegetal. mico con etanol de 70º durante 30-60 segundos, o
sumergir el material vegetal durante 10-20 minutos
El cultivo de células vegetales incluye todos
los aspectos del cultivo y mantenimiento de ma- en una solución entre el 0.5–5% de hipoclorito de
terial vegetal in vitro en condiciones asépticas, sodio, a la que se añaden unas gotas de detergente
empleando medios nutritivos adecuados y en un o de Tween-20 (0.01-0.1%) con el �in de aumen-
ambiente controlado. Inicialmente, los cultivos in vi- tar la tensión super�icial y facilitar el contacto con
tro se utilizaron como una herramienta en trabajos la super�icie que se desea desinfectar, seguido de 3
de investigación básica relacionados con la división a 5 enjuagues con agua estéril. Si el material vege-
de las células vegetales, su desarrollo, diferencia- tal está muy contaminado se utiliza algún método
ción, �isiología y bioquímica. Sin embargo, pronto más enérgico, como es la inmersión en una solución
se vio que podían tener aplicaciones prácticas, en- de cloruro de mercurio entre el 0.25-0.5 ‰ duran-
tre las que se encuentran la propagación vegetal, te 6 horas, aunque debido a la elevada toxicidad de
la sanidad vegetal para la obtención de plantas li- este compuesto se necesitan medidas especiales de
bres de virus, la producción de doblehaploides, protección durante su uso y la eliminación de los
etc., todas ellas con una importante repercusión residuos. También se puede emplear, tras el trata-
económica. Más recientemente, el cultivo in vitro miento con hipoclorito de sodio, la inmersión en
vegetal tiene nuevas aplicaciones. Así, se utiliza en una solución antibiótica que contenga penicilina y
los procesos de obtención de plantas transgénicas estreptomicina a una concentración de 1 mg/L du-
o biotecnológicas y en la selección de plantas tole- rante 2 horas. En algunos casos se añaden al medio
rantes a diferentes estreses abióticos, ya sea tras de cultivo sustancias biocidas como el PPM (plant
un tratamiento mutagénico (químico o mediante preservative mixture) que matan bacterias y hongos
radiaciones) o aprovechando la variación genética e incluso llegan a eliminar los organismos endó�itos
que de forma espontánea se puede producir duran- que están presentes en algunos tipos de explantes.
te el cultivo in vitro (variación somaclonal).
Cuando se trata de un nuevo tipo de explante,
y como regla general, se recomienda comenzar con
un tratamiento suave y, en caso de no conseguir la
4.2.1. Componentes del cultivo in vitro vegetal
desinfección, ir empleando tratamientos cada vez
Material vegetal más intensos hasta que no aparezca ninguna conta-
minación, aunque este tipo de tratamiento conlleva
El primer elemento del cultivo in vitro vegetal es el el daño del explante, pudiendo darse el caso de que
explante, es decir, el fragmento o parte de la plan- se dañe tanto que no se pueda iniciar el cultivo.
115
Métodos en biociencias
116
Cultivos celulares
117
Métodos en biociencias
centraciones entre 10-6 y 10-7 M. nitrógeno que es más fácil de asimilar por
No obstante, las giberelinas no las células que el nitrógeno inorgánico, lo
se emplean demasiado en el cul- que va a facilitar el crecimiento de los cul-
tivo in vitro ya que suelen inhibir tivos.
la organogénesis, sobre todo la ri- Una vez preparado el medio de cultivo
zogénesis, siendo su principal y antes de esterilizarlo, es necesario ajus-
aplicación la de incrementar el de- tar el pH, que va a ser ligeramente ácido
sarrollo de los callos. y oscila entre 5.5 y 5.8. Al no contener el
medio ningún tampón, es necesario ser
— Sustancias geli�icantes muy cuidadoso en el ajuste del pH, que se
Gran parte de los cultivos in vitro vege- realiza empleado soluciones entre 0.01 y
tales se realizan en medios semisólidos, 1M de HCl o KOH.
obtenidos mediante sustancias geli�ican- Se han utilizado centenares de distin-
tes. Se ha podido comprobar que el tipo y tas composiciones y, a modo de ejemplo,
concentración de estas sustancias pueden en el cuadro 4.1 se muestran cinco de las
in�luir de manera notable en el éxito del más habituales.
cultivo. Inicialmente se emplearon sus- — Esterilización del medio de cultivo
tancias naturales como el agar, la agarosa
o el alginato a concentraciones entre el El método más habitual de esterilización
0.5 y el 5%. Sin embargo, algunas de estas de los medios de cultivo es el autoclavado
sustancias pueden variar su composición durante 15-30 min a una temperatura de
según la empresa que las comercialice, 121 °C y a una presión de 15 psi. Si existen
además de contener elementos que in- sustancias que puedan verse alteradas
hiben el crecimiento de las células. Por por el calor hay que utilizar temperatu-
ello, se están empleando otras sustancias ras más bajas; por ejemplo, si el medio
como el «Phytagel» o la «Gelrite» obteni- contiene glucosa en lugar de sacarosa,
das por fermentación microbiana de la la temperatura hay que bajarla hasta los
glucosa que dan lugar a un polisacárido 110 °C con el �in de evitar su carameliza-
formado por glucosa, ácido glucurónico y ción.
ramnosa. Estas sustancias se pueden uti- Algunas sustancias (vitaminas, al-
lizar a concentraciones más bajas que el gunos reguladores de crecimiento, etc.)
agar o la agarosa y forman un gel rígido y no pueden someterse a temperaturas
transparente, lo que facilita la detección elevadas ya que se degradan total o par-
temprana de posibles contaminaciones, y cialmente. En estos casos se emplea la
además no contienen sustancias que inhi- esterilización por �iltración, utilizando �il-
ban el crecimiento del cultivo. tros con un tamaño de poro de 0.20 µm,
que es lo su�icientemente pequeño para
— Otros compuestos evitar el paso de hongos y bacterias. En
En el cultivo in vitro vegetal se han estos casos, se preparan dos soluciones,
empleado compuestos muy variados, al- una que se autoclava y la otra se �iltra ya
gunos inde�inidos, como son los extractos que contiene las sustancias termolábiles.
de hidrolizados de proteínas, leche de Si el medio contiene agar, este se añade a
coco, extracto de levadura, extracto de pa- la primera solución que, una vez autocla-
tata, etc. Aunque en algunos casos se han vada se espera a que baje su temperatura
lo máximo posible para que al añadir la
obtenido buenos resultados, se intenta no
segunda solución, no se produzca la geli�i-
utilizarlos debido a la inde�inición de su
cación del medio y dé tiempo a repartirlo
composición y a la falta de repetitividad
en los contenedores.
de los resultados. Hay otras sustancias
que sí se suelen añadir a los medios de
cultivo, y entre ellas destacan ciertos ami- 4.2.2. Desarrollo del explante
noácidos como L-glutamina (5-10 mM) y
glicina (2 mg/L). Estas sustancias van a El cultivo in vitro se inicia con la puesta del explan-
proporcionar a las células una fuente de te en un medio nutritivo. Dependiendo del tipo de
118
Cultivos celulares
Cuadro 4.1: Composición de los cinco medios más empleado en el cultivo in vitro vegetal.
Componentes del medio (mg/L) Murashige & Skoog Linsmaier & Skoog Gambord B5 Chu (N6) Nitsch & Nitsch
Macronutrientes
Macronutrientes
NH4NO3 1650 1650 720
KNO3 1900 1900 2500 2830 950
CaCl2.2H2O 440 332 150 125 166
MgSO4.7H2O 370 180.5 250 90.3 185
KH2PO4 170 170 400 68
(NH4)2SO4 134 463
NaH2PO4.H2O 150
Micronutrientes
KI 0.83 0.83 0.75 0.8
H3BO3 6.20 6.20 3.0 1.6 10.0
MnSO4.4H2O 22.30 3.33 25.0
MnSO4.H2O 16.90 10.0
ZnSO4.7H2O 8.60 8.60 2.0 1.5 10.0
Na2MoO4.2H2O 0.25 0.25 0.25 0.25
CuSO4.5H2O 0.025 0.025 0.025 0.025
CoCl2.6H2O 0.025 0.025 0.025
Na2EDTA 37.3 37.3 37.3 37.3 37.3
FeSO4.7H2O 27.8 27.8 27.8 27.8 27.8
explante, el medio nutritivo que se emplee y de las se les ha eliminado enzimáticamente la pared de ce-
condiciones ambientales en las que se incube, las lulosa) que en algunos casos se han empleado como
células que lo integran pueden seguir diferentes células diana en experimentos de transformación. A
caminos. Así, pueden comenzar a dividirse más o veces, los callos constituyen una etapa intermedia
menos rápidamente hasta dar lugar a una masa de en procesos posteriores de desarrollo.
células indiferenciadas denominada callo, con un Las células del explante también pueden se-
aspecto morfológico que va de acuoso a compacto, guir otras dos vías, que son las que van a permitir
y de translúcido a tonalidades amarillo-parduzcas la regeneración de plantas completas. Estas son la
(Figura 4.9a). En general estas estructuras no sir- organogénesis y la embriogénesis somática que se
ven para regenerar plantas, pero sí que pueden ser basan, como ya se indicó al inicio del apartado de
utilizadas como fuente para el cultivo de células ais- cultivo in vitro vegetal, en la totipotencialidad que
ladas y de protoplastos (células vegetales a las que poseen muchas células vegetales.
119
forma inducida, la duplicación de los cromosomas dando lugar a una planta
diploide y fértil.
Métodos en biociencias
Figura 4.9:
Figura 4.9.(a)
a) Callo
Calloacuoso
acuosocon
con estructuras
estructuras globulares
globulares procedentes
procedentes del cultivo
del cultivo in vitroindevitro de un embrión
un embrión in-
maduro de de
inmaduro trigo. (b) b)
trigo. Organogénesis directa
Organogénesis a partir
directa de hojas
a partir de violeta
de hojas africana
de violeta (Saintpaulia
africana ionantha).
(Saintpaulia (c)
ionantha).
Embriones somáticos en la super�icie de un callo obtenido a partir de un embrión inmaduro de trigo. (d)
Embriogénesis de la microspora. Se observan dos embriones haploides en la super�icie de una antera de cebada.
120
Cultivos celulares
Figura 4.10: Esquema de las diferentes vías de desarrollo que puede seguir un explante tras la
puesta en cultivo, según se parta de células diploides o haploides.
veces no se forma directamente un embrión haploi- polen de una especie silvestre relacionada que es H.
de, sino que hay una fase intermedia de callo y, a bulbosum. Tras la fecundación se produce un cigoto
partir del mismo, se produce un proceso posterior con la suma de los cromosomas de ambas especies
de organogénesis o de embriogénesis. pero, en las primeras divisiones, los cromosomas de
Aunque con mayor di�icultad, en ciertas espe- H. bulbosum se pierden quedando solamente el jue-
cies vegetales se puede inducir un desarrollo de tipo go de cromosomas aportados por H. vulgare y por
partenogenético a partir de óvulos sin fecundar. Para tanto dando lugar a un embrión haploide. En este y
ello se cultivan in vitro ovarios completos en medios en otros casos similares (cruzamiento trigo x maíz
nutritivos que contienen diferentes reguladores de o trigo x cebada, etc.) es necesario rescatar el em-
crecimiento para estimular las divisiones del óvu- brión haploide producido y cultivarlo in vitro para
lo, lo que dará lugar a estructuras embrionarias.
que pueda terminar su desarrollo y germinar para
En otros casos, se consigue estimular la división de
dar lugar a una planta haploide que será estéril, sal-
los óvulos fecundándolos con polen irradiado o con
polen de una especie diferente, dando lugar a un vo que se produzca, espontáneamente o bien de
embrión haploide, pues no se ha producido fecun- forma inducida, la duplicación de los cromosomas
dación o, si se ha dado, los cromosomas aportados dando lugar a una planta diploide y fértil.
por el parental masculino se pierden. Este es uno de En la �igura 4.10 se resumen las diferentes vías
los métodos de obtención de embriones haploides que puede seguir un explante vegetal una vez pues-
en Hordeum vulgare (cebada) en el que se emplea el to en cultivo.
121
Métodos en biociencias
4.2.3. Aplicaciones del cultivo in vitro vegetal en un sustrato (arena, compost, vermiculita, etc.)
hasta que transcurre un periodo de aclimatación en
Las técnicas de cultivo in vitro tienen numerosas invernadero que permite que la planta se endurez-
aplicaciones, entre las que se encuentran la pro- ca y pueda tolerar un ambiente normal.
pagación vegetativa de una variedad mediante En algunas especies, la etapa de regeneración
micropropagación o mediante semillas arti�iciales, también se puede producir mediante la inducción
el saneamiento del material vegetal, la obtención de de embriogénesis somática. Cuando esta opción es
nuevos materiales vegetales (producción de doble posible, permite evitar la fase de enraizamiento al
haploides), etc. En los siguientes apartados se tra- ser los embriones somáticos estructuras bipolares
tan algunos de estos aspectos. que germinan y dan vástagos y raíces simultánea-
mente.
Micropropagación
Semillas artificiales
La micropropagación, también denominada propa-
gación clonal, es un tipo de multiplicación asexual La embriogénesis somática tiene diferentes apli-
que permite obtener un conjunto de plantas (de caciones, entre las que se encuentra la obtención
unas pocas a millones) genéticamente idénticas a de semillas arti�iciales o sintéticas. Estas semillas
la planta de la que se ha obtenido el explante ini- se pueden conseguir de distintas maneras, pero
cial. Prácticamente cualquier parte de la planta se el procedimiento más utilizado es el que da lugar
puede utilizar como explante empleando medios de a embriones somáticos hidratados encapsulados
cultivo adecuados, siendo preferible que contenga en una cubierta protectora de alginato de calcio. El
células meristemáticas que sean capaces de dividir- procedimiento consiste en sumergir a los embrio-
se activamente y posteriormente diferenciarse en nes somáticos en una solución nutritiva que además
distintos órganos. contiene alginato de sodio al 2%. A continuación
La primera etapa de la multiplicación vege- se trans�ieren a una solución acomplejante de Ca
tativa es el establecimiento del cultivo en unas (NO3)2, 100 mM. Ello induce la formación de esferas
condiciones axénicas. La segunda etapa es la fase que contienen el embrión junto con un endospermo
de multiplicación, cuyo objetivo es mantener e in- arti�icial con las sustancias incluidas en el medio
crementar el número de propágulos con el �in de nutritivo. También se pueden recubrir las cápsu-
destinar una parte a continuar con nuevos ciclos las con alguna sustancia como el polioxietilenglicol
de multiplicación y otra parte a la siguiente etapa, para evitar la deshidratación de los embriones.
que es la de regeneración de plántulas siguiendo Lógicamente, para obtener semillas arti�iciales es
alguna de las vías de morfogénesis descritas ante- necesario contar con un protocolo de inducción
riormente. No existe un protocolo general, y para de embriogénesis somática muy e�icaz, que ade-
cada especie, e incluso para cada genotipo, es ne- más permita la producción sincronizada de los
cesario ensayar diferentes medios de cultivo hasta embriones y a una escala industrial. Actualmente
encontrar empíricamente las mejores condiciones. se obtienen semillas arti�iciales en especies como
Cuando la regeneración se lleva a cabo me- alfalfa, zanahoria y algunos árboles y especies de
diante la vía de organogénesis, en primer lugar se va propagación vegetativa, como la caña de azúcar y
a inducir la formación de vástagos unipolares, em- especies ornamentales. También resulta de gran
pleando medios nutritivos que contienen distintas interés la obtención de estas semillas en la propaga-
combinaciones y concentraciones de auxinas y cito- ción de ejemplares «élite» de especies arbóreas, que
quininas. La siguiente etapa es la de enraizamiento, tienen una propagación normal a través de semillas
en la que se van a formar raíces adventicias, para lo pero que son altamente heterocigóticas y, por tanto,
cual se emplean reguladores de crecimiento de tipo en su descendencia sexual se produce una segrega-
auxina como el IBA a concentraciones entre 1 y 10 ción génica muy grande, que no permite mantener
µM durante un breve periodo de tiempo (unas ho- la combinación de alelos de distintos genes que pre-
ras), o bien a concentraciones de entre 0.1 y 1 µM sentaba la planta madre.
durante periodos de varios días a una semana. Tras
el tratamiento con la auxina, los brotes se cultivan en Saneamiento vegetal
soluciones sin reguladores de crecimiento y en las
semanas posteriores se producen las raíces. Cuando Es la obtención de plantas libres de virus por cultivo
la planta alcanza un tamaño adecuado se extrae del in vitro de meristemos. La infección de las plantas
contenedor y del medio nutritivo y se transplanta por distintos patógenos reduce los rendimientos de
122
Cultivos celulares
Tema 4, página 34
123
Métodos en biociencias
los cromosomas se emplean distintas sustancias, hongos, se tratará de manera individualizada pos-
pero la más utilizada es la colchicina. El tratamien- teriormente.
to se da habitualmente sumergiendo durante 4 a
12 h las raíces de las plantas haploides en una so-
lución de colchicina entre el 0.01-0.1% con DMSO 4.3.1. Tipos nutricionales de microorganismos
(0.5%) para facilitar la entrada de colchicina en
Cultivar y mantener los microorganismos en el la-
las células, y a continuación hacer lavados prolon-
boratorio signi�ica conocer los requerimientos
gados de las raíces para eliminar la colchicina, que
nutricionales de los mismos. Los microorganismos,
es muy tóxica. En algunas de las células habrá ac-
y en general todos los seres vivos, se clasi�ican en
tuado la colchicina duplicándose los cromosomas,
función de tres requerimientos fundamentales: (1)
y las plantas o tejidos u órganos que se regeneren
la fuente de carbono, dividiendo a los microorganis-
a partir de estas células serán diploides y podrán
mos en autótrofos, cuando la fuente de carbono es el
dar lugar a semillas normales. La probabilidad de
CO2 , y heterótrofos, cuando la fuente de carbono son
encontrar dos plantas genotípicamente idénticas
moléculas orgánicas; (2) la fuente de energía, divi-
es prácticamente cero. Las plantas obtenidas son
diendo a los microorganismos en fotótrofos, cuando
de un enorme interés, y sirven para seleccionar usan la luz como fuente de energía, y quimiótrofos,
aquellas que muestren las características desea- cuando usan la energía derivada de reacciones de
das, con la gran ventaja de que en un solo paso se ha oxidación, y (3) la fuente de electrones, dividien-
conseguido �ijar las combinaciones alélicas en ho- do a los microorganismos en organótrofos, cuando
mocigosis, siendo genéticamente estables cuando la fuente de electrones es una molécula orgánica, y
se pasa de una generación a la siguiente a través de litótrofos, cuando son moléculas inorgánicas redu-
autofecundación. cidas (Cuadro 4.2). Cualquier microorganismo se
puede nombrar citando sus tres requerimientos,
es decir, hay microorganismos fotolitoheterótro-
4.3. Cultivo de microorganismos fos o, por ejemplo, quimiolitótrofos autótrofos. Los
microorganismos que son quimiolitoheterótrofos
Muchas de las técnicas y materiales utilizados en el reciben el nombre especial de mixótrofos. La capa-
cultivo de microorganismos son semejantes a los ya cidad metabólica de los microorganismos permite
explicados en el epígrafe de cultivos de células ani- encontrar cualquier tipo nutricional entre ellos, no
males de este mismo capítulo. Por ejemplo, el uso de como en el caso del metabolismo de animales y
cabinas de �lujo laminar es algo habitual, e incluso plantas, que queda reducido a quimioorganótrofos
necesario, cuando se trabaja con microorganismos heterótrofos o fotolitótrofos autótrofos, respectiva-
potencialmente patógenos, en este último caso, de- mente.
pendiendo del grado de riesgo del microorganismo, En un ambiente natural, la mayoría de los mi-
se usan cabinas de clase I, II o III, además de los sis- croorganismos se encuentran formando parte de
temas de contención correspondientes. Asimismo, mezclas de diferentes tipos de individuos, excep-
los sistemas de esterilización en el laboratorio son tuando, por ejemplo, los ambientes extremos de
básicos, hasta tal punto que todo el material de uso pH, temperatura o salinidad, donde puede apare-
común debe ser esterilizado, o si se adquiere y es de cer, cuando las condiciones son muy extremas, un
un solo uso, debe suministrarse esterilizado de for- solo tipo de microorganismo. Hoy en día se cuenta
ma industrial; esto es aplicable tanto a los medios con técnicas metodológicas que permiten estudiar
de cultivo como a cualquier material que se vaya a a los microorganismos en su propio ambiente, sin
usar. Igualmente, las técnicas de trabajo deben ir importar si hay poblaciones mixtas; sin embar-
encaminadas a evitar la contaminación de medios o go, el gran desarrollo de la microbiología vino de
materiales durante la manipulación de microorga- la mano de la puesta a punto de una técnica que
nismos, ya sean bacterias, hongos o virus, es decir, permitiera aislar los microorganismos y proceder a
se deben seguir unas normas rigurosas que contri- su estudio de manera individualizada. Esta técnica
buyan a trabajar en condiciones asépticas. tiene su base en el desarrollo de los medios de cul-
En cualquier caso, y debido a la peculiaridad tivo sólidos. A pesar de ello, y después de años de
que presentan las técnicas de cultivo de microor- estudio y perfeccionamiento de innumerables me-
ganismos, a continuación se indica de manera más dios de cultivo, solo se ha conseguido aislar un 1%
detallada como deben realizarse dichos cultivos. de los microorganismos presentes en los ambien-
Dado que el cultivo de virus exige una metodolo- tes naturales, por tanto, queda mucho por hacer en
gía algo diferente a la utilizada para las bacterias y este campo.
124
Cultivos celulares
Luz Fotótrofo
CO2 Autótrofo
En cualquier caso, y como se mencionaba cada uno de los componentes y su cantidad, permi-
anteriormente, conocer los requerimientos nutri- ten generar un gran número de medios distintos,
cionales de un microorganismo es muy importante adaptado cada uno de ellos a un microorganismo
para poder cultivarlo en el laboratorio. Además, hay en particular. En algunos casos, es necesario utili-
que tener en cuenta que el mundo microbiano zar medios elaborados con componentes naturales
es muy �lexible metabólicamente hablando, pues para intentar mimetizar el medio ambiente natu-
muchos microorganismos pueden cambiar sus ral y, de esta manera, favorecer el crecimiento de
requerimientos nutricionales en función de las con- microorganismos, que en otros medios, como los
diciones y nutrientes presentes en el lugar en que sintéticos, no crecerían. Una estrategia importante
medran, lo que les permite adaptarse rápidamente a la hora de preparar medios de cultivo, con objeto
a las variaciones que tienen lugar en sus ambientes de que crezca alguno de ese 99% de microorganis-
naturales. Esto puede ser de gran ayuda a la hora mos que forman la parte del mundo microbiano no
de buscar las mejores condiciones y composición cultivable, es la de ser imaginativo con las condicio-
del medio de cultivo para su crecimiento y mante- nes de cultivo y, sobre todo, con la composición de
nimiento. los medios.
Los medios de cultivo pueden clasi�icarse en
función de sus características químicas, �ísicas o
4.3.2. Medios de cultivo funcionales (Cuadro 4.3).
Un medio de cultivo se puede de�inir como una Atendiendo a sus características químicas
mezcla de nutrientes, generalmente en agua, que se puede hablar de medios sintéticos o de�inidos
permiten el crecimiento de los microorganismos. y complejos. Los primeros son medios de cultivo
En general, un medio de cultivo debe contener una donde se conoce la composición cualitativa y cuan-
fuente de carbono, una fuente de nitrógeno y otros titativa de los mismos, fundamentalmente por
elementos esenciales para los seres vivos como son: haberlos preparado pesando o añadiendo concen-
fósforo, azufre y otros minerales; la naturaleza de traciones conocidas de los distintos componentes;
Cuadro 4.3: Clasi�icación de los medios de cultivo microbianos atendiendo a sus características químicas, �ísicas y funcionales.
125
Métodos en biociencias
por tanto, la preparación de los mismos consiste en Atendiendo a sus características �ísicas, los
seguir una receta de�inida. Por el contrario, un me- medios de cultivo pueden ser líquidos, sólidos y
dio complejo es un medio de cultivo donde no se semisólidos. Los medios líquidos, como su propio
conoce exactamente la composición del mismo, ge- nombre indica, son medios preparados en agua,
neralmente porque alguno de los componentes es sin ningún componente que los espese o geli�ique;
complejo sin una composición exacta. Por ejemplo, suelen recibir también el nombre de caldos. Estos
un medio de cultivo con la siguiente composición: caldos pueden, como ya se ha mencionado anterior-
KH2PO4 (1 g), HNa2PO4.7H2O (4 g), NaCl (0.2 g), Ca mente, ser de�inidos o complejos. Un medio sólido
Cl2.2H2O (0.05 g), MgSO4.7H2O (0.2 g), glucosa (6 puede ser un caldo al que se le añade un compo-
g) y agua (1 L), sería un medio de�inido o sintéti- nente que lo geli�ica, usualmente agar. El agar es
co; sin embargo, si al mismo medio se le añaden 2 un polímero sin rami�icaciones, compuesto prin-
g de extracto de levadura, el medio se consideraría cipalmente por dos fracciones, una es la agarosa
complejo, ya que la composición exacta del extracto (cadenas de D-galactosa y 3.6-anhidro-L-galacto-
de levadura no es conocida e incluso, si se supiera, sa) y otra es la agaropectina (cadenas sulfatadas
podría variar según el lote de producción de di- de D-glucurónico); se extrae de las paredes celu-
cho extracto o del origen comercial del mismo. Al lares de algas rojas (Rhodophyta), principalmente
igual que el extracto de levadura, otros componen- de los géneros Gelidium y Gracilaria. Su uso signif-
tes como el extracto de carne, las peptonas (que có el despegue de la Microbiología, ya que desde su
son hidrolizados proteicos de diferentes fuentes), introducción, desarrollada por la escuela de Koch,
etc., tienen una composición no de�inida y suelen sistemáticamente se pudieron aislar individual-
ser compuestos muy ricos que aportan nutrientes mente microorganismos de una manera rápida, sin
como vitaminas, aminoácidos esenciales, ácidos or- necesidad de realizar diluciones y así proceder a
su estudio, cosa que en medio líquido no se podía
gánicos, etc., que permiten un buen crecimiento de
conseguir. Es importante destacar que cada colonia
la mayoría de los microorganismos cultivables. Si
obtenida en el medio sólido (también denominada
hubiera que añadir de manera individual cada uno
unidad formadora de colonia, UFC) correspondería
de los nutrientes que aportan los diferentes extrac-
al crecimiento, entendido como un aumento pobla-
tos, realizar el medio de cultivo sería un proceso
cional, de un solo tipo de microorganismo. El agar
complejo y costoso. A veces se habla de medios de
es un compuesto insoluble que se solubiliza cuando
cultivo enriquecidos, son medios comunes (aque-
se calienta por encima de 95 °C, y una vez solubili-
llos que llevan los componentes mínimos para
zado, se solidi�ica cuando se enfría por debajo de 45
permitir el crecimiento de microorganismos) a los
°C. El proceso se puede volver a repetir si se calienta
que se les añade algún componente especial que de nuevo por encima de 95 °C. El agar es un com-
permite el crecimiento de microorganismos muy puesto que muy pocos microorganismos pueden
exigentes en sus requerimientos nutricionales. Este degradar, convirtiéndolo en un componente ideal
tipo de componente puede ser sangre, suero, yema para solidi�icar los caldos de cultivo. La concentra-
de huevo… y, por lo tanto, también podrían ser con- ción utilizada de agar en estos medios es de 15 a
siderados como medios complejos. 20 g/L. Un medio semisólido es un medio en el que
En resumen, un medio de�inido o sintético es la concentración de agar es de 5 g/L y no se obtie-
un medio preparado para cultivo de un microorga- ne un medio de cultivo realmente sólido. Estos tipos
nismo o microorganismos concretos, de los cuales de medio de cultivo se suele utilizar para estudiar la
se sabe sus requerimientos nutricionales, y se usa movilidad de los microorganismos.
fundamentalmente para estudiar aspectos �isiológi- Atendiendo a sus características funcionales
cos de dichos organismos, añadiendo o sustituyendo se distinguen diferentes tipos de medios de culti-
diferentes componentes del medio. Los medios vo. Los medios de cultivo de enriquecimiento son
complejos, como ya se ha comentado, contienen medios diseñados para permitir el crecimiento de
ingredientes cuya composición es di�ícil de estable- microorganismos que se encuentran en baja pro-
cer, pero por su riqueza son utilizados cuando no porción con respecto a otras poblaciones y que, en
se conocen los requerimientos nutricionales de los el caso de usarse otro tipo de medios, serían muy di-
microorganismos a estudiar o se pretende que crez- �íciles de detectar, pasando desapercibidos. Es decir,
ca la mayor variedad posible de microorganismos. se trata de enriquecer el número y proporción de un
Este último tipo de medio de cultivo sería el elegido determinado tipo de microorganismo minoritario.
si, por ejemplo, se desea estudiar la diversidad mi- Un ejemplo podría ser el aislamiento de microorga-
crobiana presente en una muestra ambiental. nismos de muestras del suelo capaces de degradar
126
Cultivos celulares
127
Métodos en biociencias
el medio en los recipientes �inales y seguidamente es debido a que una gran cantidad de la biomasa
autoclavarlos. Este procedimiento suele realizar- del organismo, que se genera en el transcurso de
se cuando el medio de cultivo es líquido o cuando la incubación, permanece en suspensión. En deter-
es sólido y se reparte, por ejemplo, en tubos que se minadas condiciones los microorganismos pueden
inclinarán posteriormente para obtener tubos con aparecer adheridos a las paredes de los matraces,
cultivos sólidos en pico de �lauta. La segunda vía se esto es debido a un tipo particular de crecimiento
caracteriza por repartir el medio una vez esteriliza- denominado biopelículas.
do, por ejemplo, los medios de cultivo sólidos que Durante el crecimiento de un microorganismo
se reparten en placas Petri estériles. En este caso en un medio líquido se reconocen 4 fases, que se
el medio de cultivo se esteriliza también en el au- diferencian entre sí por la velocidad de crecimien-
toclave, pero en el mismo matraz donde se preparó to que poseen en dicha fase y que se traduce en un
y, posteriormente, una vez enfriado hasta tempe- signi�icativo aumento poblacional. Estas fases son
raturas que no estén por debajo de 45 °C (si no se similares a las ya comentadas en este tema para las
solidi�icaría el medio), se agita bien para homoge- células eucariotas (ver �igura 4.6).
neizarlo nuevamente y se reparte en las placas en La fase de latencia o retraso, en la que el nú-
un ambiente estéril (campanas de �lujo laminar). mero de microorganismos no aumenta pues el
Las placas, con su contenido, se dejan parcialmen- microorganismo está adaptando su maquinaria me-
te abiertas, para impedir que se acumule vapor de tabólica a la composición del medio de cultivo.
agua y, una vez que se solidi�ica el medio de culti- La fase exponencial o logarítmica, en la que el
vo, se cierran. Otra opción que realizan muchos microorganismo está dividiéndose a la máxima ve-
laboratorios cuando trabajan con medios sólidos locidad de crecimiento que puede desarrollar, de
destinados a preparar placas Petri, es repartir pre- acuerdo a la composición y las condiciones de cul-
viamente la cantidad adecuada de medio en tubos y tivo. La variación de las células o de biomasa en el
esterilizarlos. Los tubos se conservan a 4 °C y cuan- tiempo podría representarse usando la siguiente
do se necesitan placas se pone el número necesario ecuación: dN/dt = µN, donde N es la cantidad de cé-
de tubos con medio al baño María o en el microon- lulas o de biomasa, t es el tiempo y µ es la velocidad
das con objeto de licuarlos y, seguidamente, se de crecimiento.
añaden a las placas Petri. La fase estacionaria, en la que no se aprecia un
Si hay algún componente termolábil en la com- crecimiento poblacional de los microorganismos, y
posición del medio de cultivo, este debe añadirse en donde la variación del número de células o de
después de haber esterilizado el medio. En este caso biomasa con el tiempo es cero (dN/dt = 0). Esto es
hay que esperar a que se enfríe el medio a tempera- debido al agotamiento de los nutrientes del medio,
tura ambiente (o hasta 45 °C, si contiene agar en su o a que los microorganismos se estén muriendo y
composición) y añadir en condiciones estériles el dividiendo a la misma velocidad, o bien, simplemen-
componente termolábil, previamente esterilizado te, a que las células no se están dividiendo aunque
por �iltración usando el �iltro adecuado. Los medios son metabólicamente activas. Es una fase que se
de cultivo tanto líquidos como sólidos, una vez este- caracteriza por la producción de metabolitos se-
rilizados, se pueden conservar hasta su uso a 4 °C. cundarios por parte de algunos microorganismos.
Industrialmente esta fase tiene gran interés, dado
que los metabolitos secundarios pueden tener ac-
4.3.4. Cultivo de microorganismos tividades biológicas y tener importancia médica
(antibióticos, inmunomoduladores, anticanceríge-
El resultado visual �inal del cultivo de los microor- nos, etc.). Por otro lado se puede considerar que
ganismos en un medio líquido y en un medio sólido, esta fase es la más representada en los ambientes
independientemente de sus características quí- naturales, donde los microorganismos raramente
micas o funcionales, es lógicamente diferente. A pueden encontrar concentraciones óptimas de nu-
continuación se comenta como se visualiza el cre- trientes y las condiciones necesarias para crecer a
cimiento de microorganismos en ambos tipos de la máxima velocidad de crecimiento.
medio. La fase de muerte, en la que la velocidad de
muerte es mayor que la de división, observándose
Cultivo en medio líquido que la variación del número de células o de la can-
tidad de biomasa tiene una pendiente negativa, es
En un cultivo líquido el crecimiento de microorga- decir (dN/dt = (µ-k)N, donde k es la velocidad de
nismos da lugar a un aumento de la turbidez, esto muerte y se cumple que µ<k).
128
Cultivos celulares
129
Métodos en biociencias
Figura 4.13: (A) Siembra por extensión. UFC: unidad formadora de colonias. (B) Diluciones seriadas de una muestra con una alta concen-
tración de microorganismos; para calcular su número solo hay que multiplicar el número de colonias de una placa en la que no haya más
de 300 UFC por el valor inverso del factor de dilución de dicha placa y por el valor inverso del volumen de inóculo utilizado (N=c x 1/d x 1/i;
siendo «c» el número de colonias contadas, «d» la dilución de la que procede el inóculo y «i”»el volumen de inóculo utilizado).
130
Cultivos celulares
A B
Figura 4.14: Siembra por agotamiento. (A) Distintos patrones de líneas que se pueden utilizar. (B)
Ejemplo de siembra por agotamiento.
131
Métodos en biociencias
4.3.6. Factores físicos y químicos que afectan ganismos y los que pueden hacerlo se denominan
al cultivo de microorganismos extremó�ilos para el pH, presentando adaptaciones
bioquímicas y estructurales.
Existen distintos factores, tanto �ísicos como
químicos, que afectan al crecimiento de los mi-
Actividad de agua
croorganismos y, por tanto, a su cultivo; por lo que
a la hora de cultivar los microorganismos deben te- La actividad de agua (aw) es la relación entre la pre-
nerse en cuenta para preparar los medios de cultivo sión de vapor de la solución (Psol) y la del agua pura
e incubarlos en las condiciones óptimas que permi- (Pagua). Es decir Aw = Psol/Pagua. Es un concepto que
tan obtener un buen crecimiento. A continuación se indica la cantidad de agua disponible, y es esen-
comentarán los más importantes. cial para los microorganismos puesto que todos en
mayor o menor medida necesitan agua. El valor de
Temperatura aw puede variar entre 1, que sería el agua pura, y
0.6 representado por la miel o la leche deshidrata-
Todos los microorganismos tienen una temperatura da. A baja aw se observa una drástica disminución
óptima de crecimiento, así como una temperatura de la actividad metabólica, siendo en general más
mínima por debajo de la cual no crecen y una tem- sensibles las bacterias que los hongos (valores de
peratura máxima por encima de la cual mueren. 0.6 solo permiten el crecimiento de determinados
Esta relación con la temperatura viene motivada hongos). En los medios de cultivo, un valor bajo de
por las reacciones metabólicas que tienen lugar en aw puede estar relacionado con altas concentracio-
el microorganismo, ya que la velocidad de reacción nes salinas, con altas concentraciones de solutos no
va incrementándose a medida que aumenta la tem- iónicos (como azúcares) o con condiciones de des-
peratura, hasta alcanzar un valor a partir del cual hidratación. Este último caso ocurre cuando, una
se desnaturalizan las proteínas y el microorganis- vez preparados los medios de cultivo, se dejan de-
mo muere. No todos los microorganismos muestran secar en exceso por un mal almacenamiento. En
el mismo rango de temperaturas de crecimiento, de�initiva, la composición del medio de cultivo pue-
en este sentido los microorganismos pueden clasi- de condicionar el valor de aw de dicho medio, que a
�icarse de acuerdo a las mismas. Así se distinguen: su vez condicionará el crecimiento de los microor-
psicró�ilos (pueden crecer entre 0 y 15 °C), psicró- ganismos.
trofo (pueden crecer entre 0 y 35 °C), mesó�ilos
(pueden crecer entre 15 y 45 °C), termó�ilos (pueden Concentración de oxígeno
crecer entre 45 y 85 °C) e hipertermó�ilos (pueden
crecer entre 70 y 110 °C). Los microorganismos que Existen diferentes tipos de microorganismos aten-
pueden crecer a temperaturas extremas, tanto muy diendo a su necesidad o, visto de otra manera, a su
bajas (por debajo de 0 °C), como muy altas (por en- tolerancia al oxígeno:
cima de 100 °C), se denominan extremó�ilos para la
temperatura, presentando adaptaciones bioquími- — Aerobios, que a su vez pueden ser:
cas y estructurales para poder sobrevivir en dichas • Estrictos: necesitan oxígeno para
condiciones. crecer.
• Facultativos: no es necesario el
pH oxígeno, pero crecen mejor en pre-
sencia de él.
Al igual que sucede con la temperatura, existen
• Microaeró�ilos: es necesario el
rangos de pH en los cuales pueden crecer los mi-
oxígeno, pero a bajas concentra-
croorganismos, y por encima o por debajo de
ciones.
dichos rangos mueren rápidamente. No es de ex-
trañar que esto ocurra así ya que las reacciones — Anaerobios, que a su vez pueden ser:
metabólicas están muy in�luenciadas por el pH. Los
microorganismos atendiendo al pH que necesitan • Aerotolerantes: no es necesario el
en su entorno para poder desarrollarse, se dividen oxígeno, y si está presente no cre-
en: acidó�ilos (crecen entre pH 3 y 5.5), neutró�ilos cen mejor.
(crecen entre pH 5.5 y 7.5) y alcaló�ilos o basó�i- • Estrictos: el oxígeno es dañino
los (crecen entre pH 7.5 y 10). Por debajo de pH 3 para ellos y crecen mejor en su au-
y por encima de 10 crecen pocos tipos de microor- sencia.
132
Cultivos celulares
133
sido optimizada para obtener la máxima producción, va experimentando las fase
de crecimiento ya conocidas: latencia (que interesará que tenga una duració
Métodos en biociencias mínima), exponencial y al entrar en estacionaria, será cuando coincida con l
salida por la parte superior del fermentador.
fase de latencia, fase exponencial de crecimiento y
fase estacionaria. En las fermentaciones industria-
les interesa que la fase de latencia dure lo menos
posible y que el microorganismo entre rápidamente
en fase exponencial. Esto se logra mediante la pre-
paración de preinóculos del microorganismo, que
cuando están en fase exponencial se utilizan para
inocular el fermentador. La fermentación se suele
dar por concluida cuando el microorganismo entra
en fase estacionaria.
En general las fermentaciones discontinuas no
suelen durar más de 96 h; sin embargo,Figuraalguna de
4.17. Esquema de un fermentador continuo de flujo de tapón.
ellas puede durar algo más, intentado alargar el pe-
ríodo de producción de metabolitos primarios que Figura 4.17: Esquema de un fermentador
En la fermentación continua
continuo dede
�lujomezcla
de tapón. completa, como su propio nombr
se produce durante el crecimiento exponencial.
indica, se
Esto se logra añadiendo dos fuentes de carbono porproduce una mezcla entre el medio fresco que se añade al fermentado
las que el microorganismo tiene diferente a�inidad,de fermentación preexistente (Figura 4.18).
y el caldo
primero utilizará la que sea más fácil de consumir, dio con glucosa. De esta forma se logra, siguiendo el
experimentando una primera fase de crecimiento protocolo señalado, que el microrganismo utilice la
exponencial. Cuando el microorganismo entre en glucosa para obtener energía, pero sin dejar de pro-
fase estacionaria, en realidad será una fase de laten- ducir metabolitos secundarios, ya que una vez que
cia o de acomodación de su maquinaria metabólica el microorganismo alcanzó la fase estacionaria no
a la segunda fuente de carbono, que al utilizarla, volverá a entrar en fase exponencial. En de�initiva,
dará lugar a una segunda fase exponencial, con el se logra que el microorganismo entre rápidamente
consiguiente aumento de producción. A este tipo de en la fase estacionaria, y luego se le mantiene con
cultivo donde se generan dos fases exponenciales, pulsos de medio con glucosa para que mantenga la
separadas por una fase corta de latencia, se le de- producción de metabolitos secundarios.
nomina Diauxia, y el objetivo �inal, como ya se ha
comentado, es aumentar la producción de metabo-
Cultivo continuo
litos primarios.
Este tipo de cultivo o fermentación es de tipo
Cultivo discontinuo alimentado (Fed-batch) abierto. Esto signi�ica que continuamente estará
entrando medio de cultivo nuevo al fermentador a
Este tipo de cultivo o fermentación también es un una determinada velocidad y, a la misma velocidad,
cultivo cerrado pues, aunque durante la fermen- se irá sacando caldo de fermentación del mismo. Es
tación se añaden volúmenes de medio de cultivo decir, la velocidad de entrada de medio (V1) es igual
con una composición diferente del medio princi- a la velocidad de salida (V2). Se distinguen dos tipos
pal, no se saca medio de cultivo del fermentador. de fermentaciones continuas: las de �lujo de tapón y
Otros autores lo denominan «cultivo semiconti- las de mezcla completa.
nuo». El objetivo al añadir volúmenes de medio de En la fermentación continua de �lujo de tapón
cultivo, por ejemplo con otra fuente de carbono di- el medio de cultivo fresco y el inoculo se introdu-
ferente a la originalmente utilizada en el inicio de la cen por la parte de abajo y se recoge por la parte de
fermentación, es controlar determinados aspectos arriba, para posteriormente proceder a separar la
del metabolismo del microorganismo y así obtener biomasa del caldo de fermentación (Figura 4.17). El
una mejor producción. Se suele utilizar este tipo de microorganismo, según va ascendiendo a la veloci-
fermentación cuando el producto de interés es un dad que ha sido optimizada para obtener la máxima
metabolito secundario. Estos se producen en la fase producción, va experimentando las fases de creci-
estacionaria de crecimiento. El procedimiento se- miento ya conocidas: latencia (que interesará que
ría el siguiente: añadir al medio de cultivo principal tenga una duración mínima), exponencial y al en-
una fuente de carbono que no sea represora del ca- trar en estacionaria será cuando coincida con la
tabolismo, por ejemplo lactosa; el microorganismo salida por la parte superior del fermentador.
la usará, pero rápidamente entrara en fase esta- En la fermentación continua de mezcla com-
cionaria; posteriormente se añaden a diferentes pleta, como su propio nombre indica, se produce
tiempos pulsos (volúmenes pequeños) de un me- una mezcla entre el medio fresco que se añade al
134
En la fermentación continua de mezcla completa, como su propio nombre
indica, se produce una mezcla entre el medio fresco que se añade al fermentador
Cultivos celulares
y el caldo de fermentación preexistente (Figura 4.18).
135
Métodos en biociencias
4.3.8. Cultivo de virus Hay que señalar que, al igual que con las bac-
terias, hay una población viral no cultivable, y con
Para el cultivo de virus no pueden utilizarse medios este método solo se obtendrán calvas o placas de li-
de cultivos, ya sean de�inidos o complejos, ya que sis si los fagos tienen especi�icidad por la bacteria
son parásitos intracelulares obligatorios y siempre utilizada como célula hospedadora.
necesitan células hospedadoras. Las células hospe-
dadoras serán, obviamente, diferentes si se quieren
cultivar bacteriófagos, virus animales o virus de Cultivo de virus animales
plantas.
En este caso se puede optar por diferentes sistemas
para cultivar los virus.
Cultivo de bacteriófagos (fagos) Utilizando animales vivos, tales como rato-
nes, conejos, cobayas, etc. Además de estudiar los
El cultivo de fagos se realiza en placas Petri don-
efectos del virus, también se puede estudiar la res-
de se cultiva una cepa bacteriana en césped, es
puesta inmune del animal. Posteriormente, una vez
decir, cubriendo toda la placa, y que se ha mezcla-
que aparece la enfermedad, se sacri�ica el animal y
do previamente con el fago. Cuando un fago inicia
una infección va a originar una placa o calva de li- se puri�ica el virus a partir de los tejidos diana del
sis (si su ciclo es lítico), que se va a manifestar como virus.
una zona más clara en el conjunto del césped bac- Debido a la preocupación que suscita la utiliza-
teriano. Se considera que cada placa de lisis que ción de animales de laboratorio, se pueden utilizar
aparezca en la placa se ha originado a partir de una huevos embrionados. Es un método con menos
partícula viral. Además, este método de cultivar los problemas éticos y además es más barato. En este
fagos va a permitir realizar una cuanti�icación de los método, las distintas partes del interior del hue-
mismos al contar el número de calvas de lisis. Un vo se pueden inocular con el virus adecuado, por
procedimiento estándar de este tipo de cultivo im- ejemplo, se puede inocular la membrana corioalan-
plica varios pasos, que son: toidea, la cavidad alantoidea, la cavidad amniótica
o la bolsa de la yema. Es un método que se utilizó
— Preparar un cultivo de la cepa bacteriana. mucho para la obtención de partículas víricas y pos-
— Preparar una dilución seriada de la mues- terior obtención de vacunas, pero la aparición de
tra con el fago que se quiere cultivar. alergias a las proteínas del huevo ha llevado a aban-
— Mezclar la suspensión bacteriana con las donar este proceso o a realizar un posterior proceso
diluciones de fagos. de puri�icación, lo que encarece el producto.
— Verter la mezcla en placas Petri conte- El uso de cultivos celulares es el método de
niendo un medio de cultivo adecuado cultivo de virus que más se utiliza en la actualidad.
para la bacteria. Se trata de células animales aisladas de tejidos me-
diante diferentes métodos, hasta obtener líneas
Cuando un fago infecta una bacteria se produci-
celulares inde�inidas (inmortales) y cultivarlas
rá la lisis de la misma después de un corto período
como si de células bacterianas se tratara. Es de-
de tiempo, infectando las nuevas partículas víricas
resultantes a las bacterias que estén situadas cer- cir, se deben utilizar medios de cultivo adecuados,
ca de la primera; de esta manera se producen las que una vez inoculados con las células crecerán for-
ya mencionadas placas o calvas de lisis. Contando mando monocapas y posteriormente se añadirá el
el número de calvas, y sabiendo la dilución utiliza- virus. La multiplicación de los virus en las células
da y el volumen que se mezcló con las bacterias, se producirá diferentes tipos de daños, que podrán
puede conocer el número de partículas víricas via- ser observados macroscópicamente. Estos daños
bles presentes en la muestra que se quería analizar podrán ser la muerte celular, cambios morfológi-
y, al igual que se hablaba de UFC en bacterias, en cos o provocar la transformación de las células, es
este caso se habla de unidades formadoras de pla- decir, generar un efecto cancerígeno, observándo-
cas (UFP). Además de cuanti�icar, este método sirve se que las células crecen sin tener la inhibición por
para realizar aislamientos de cepas puras del virus, contacto característica de las células sanas. Los da-
puesto que si cada calva ha surgido de la multi- ños producidos se denominan efectos citopáticos.
plicación de una primera partícula viral, todas las La gran ventaja de este tipo de cultivos, frente a los
partículas virales dentro de una calva de lisis son anteriores, es que generalmente son homogéneos y
clónicas o genéticamente idénticas. Es decir, se ha- pueden ser fácilmente propagados y mantenidos de
brá obtenido una línea pura de fagos. manera similar a un cultivo bacteriano.
136
Cultivos celulares
137
5.
Inmunotécnicas
Guillermo Bodega
pia, y un inmunógeno es aquella molécula capaz de No obstante, previamente, con el �in de evitar cier-
inducir una respuesta inmune que incluye la produc- to caos terminológico, se de�inirán los conceptos
ción de anticuerpos. Sin embargo, es usual de�inir al de γ-globulina, inmunogloblulina (Ig) e inmunoglo-
antígeno como aquella molécula capaz de provocar bulina G (IgG). Las γ-globulinas son un conjunto de
la síntesis de anticuerpos, de hecho el término an- globulinas que aparece en última posición cuando
tígeno es la contracción de antibody generator. En se separan por electroforesis las proteínas del suero
cualquier caso conviene tener presente que todos sanguíneo (les preceden albúmina y α- y β-globuli-
los inmunógenos son antígenos, pero no todos los nas). Dentro de las γ-globulinas el tipo mayoritario
antígenos son inmunógenos; de hecho, algunas mo- de proteínas son las inmunoglobulinas o anticuer-
léculas, llamadas haptenos, por su pequeño tamaño, pos. A su vez, existen 5 tipos de inmunoglobulinas:
carecen de poder inmunogénico; en este caso, para A, D, E, G y M (alfa, delta, épsilon, gamma y mu); por
dotarlas de él, se les une a una molécula mayor que, tanto las inmunoglobulinas G (IgG) son un subti-
por sí misma, no es capaz de inducir una respues- po de anticuerpo. Es importante no confundir una
ta inmune. Por el contrario, las moléculas de gran γ-globulina con una inmunoglobulina γ (IgG). En la
tamaño pueden ser reconocidas por diferentes an- �igura 5.2 se incluye un esquema básico de su es-
ticuerpos, dependiendo de las diferentes regiones tructura.
de la molécula que pueden interaccionar con an- Desde el punto de vista de su aplicación en las
ticuerpos. A estas regiones especí�icas con las que inmunotécnicas, las características más importan-
interacciona el anticuerpo se les denomina deter- tes de los anticuerpos son tres: a�inidad, avidez y
minantes antigénicos o epítopos y pueden estar especi�icidad por el antígeno.
formados por secuencias de aminoácidos contiguas
o no contiguas. Conviene diferenciar entre antíge-
nos multi- y polivalentes, pues ambos poseen varios Afinidad
determinantes antigénicos: los de los primeros son La a�inidad se puede de�inir como la tendencia a in-
distintos y los de los segundos todos iguales, típico, teraccionar antígeno y anticuerpo. Esta interacción
por ejemplo, de polímeros formados por un único es reversible y no covalente, y, una vez que alcanza
tipo de monómero (Figura 5.1). el equlibrio, viene de�inida por la expresión Ka=[AB-
AG] / [AB] [AG], donde Ka representa la constante
5.1.2. Anticuerpo de a�inidad, [AB-AG] la fracción de anticuerpo (AB,
antibody) y antígeno (AG) unida, y [AB] [AG] el
Los anticuerpos son las moléculas que reconocen a producto de las concentraciones de anticuerpo y
los antígenos, y se unen a ellos por múltiples enlaces antígeno libres. La Ka para los anticuerpos oscila
de tipo no covalente como puentes de hidrógeno, entre los 10-5-10-12 L/mol. Desde un punto de vista
fuerzas de van der Waals, interacciones coulómbi- práctico, esta fórmula indica la cantidad de com-
cas y enlaces hidrofóbicos. Puesto que, como ya se plejo AG-AB que se puede encontrar en el punto
ha explicado al inicio de este capítulo, los anticuer- de equilibrio. El tiempo en que se alcanza el equili-
pos solo interesan como herramienta, únicamente brio no varía de un anticuerpo a otro; sin embargo,
se estudiarán las características que son de inte- en ese punto un anticuerpo de alta a�inidad habrá
rés desde el punto de vista de su aplicación técnica. formado más complejo AG-AB que uno de baja a�i-
140
Inmunotécnicas
Figura 5.2: Estructura de un anticuerpo. Está formado por dos cadenas pesadas y dos ligeras unidas por puentes
disulfuro (líneas de puntos que unen las cadenas), también existen puentes disulfuro intracatenarios responsa-
bles de su con�iguración espacial (no incluidos en el dibujo). Cada cadena tiene una región variable y otra cons-
tante, la primera encargada de interaccionar con el antígeno. El sitio especí�ico del anticuerpo que interacciona
con el epítopo del antígeno se llama parátopo. La rotura con la proteasa papaína genera dos fragmentos: el Fab
y el Fc, el primero incluye la región variable.
nidad. Dicho de otro modo, los anticuerpos de alta vocar fuertes variaciones en la avidez (Figura 5.3).
a�inidad completan su interacción con el antígeno En general, los anticuerpos de alta a�inidad poseen
antes que los de baja a�inidad. Todo ello hace que una alta avidez, como demuestra el hecho de que la
para conseguir, en un instante determinado, una vida media de un complejo AG-AB de alta a�inidad
concentración de AG-AB usando un anticuerpo de es mucho mayor que la de un complejo formado con
baja a�inidad sea necesario usar mayor concentra- un anticuerpo de baja a�inidad. En general, en una
ción de anticuerpo que si se usase un anticuerpo de inmunotécnica la a�inidad va a indicar la concen-
alta a�inidad. tración de anticuerpo que hay que usar (también el
tiempo de incubación para que interaccione con el
antígeno), pero la avidez va a ser la responsable del
Avidez
éxito de la inmunotécnica pues una baja avidez de-
La avidez indica la estabilidad general del com- terminará la desaparición del complejo AG-AB en
plejo AG-AB y es determinada por tres factores: la los sucesivos lavados de la técnica; hecho de suma
valencia de unión entre antígeno y anticuerpo, la importancia porque en la mayoría de las inmunotéc-
ordenación geométrica de los componentes que in- nicas se realizan numerosos y profundos lavados.
teractúan y la a�inidad. Los anticuerpos más usados
en las inmunotécnicas son IgG e IgM, los primeros Especificidad
son bivalentes, pues cada anticuerpo tiene dos sitios
de unión al antígeno; los segundos son decavalen- La especi�icidad hace referencia a la exclusiva in-
tes, pues se organizan como un pentámero. Estos teracción entre un anticuerpo y un determinante
últimos, en caso de interacciones con antígenos po- antigénico; hecho fundamental en las inmunotéc-
livalentes, pueden conducir a una estabilización tan nicas, pues es responsable de que un determinado
fuerte del complejo AG-AB que lo hacen irreversi- anticuerpo solo reconozca a un único antígeno (de-
ble. No obstante, la polivalencia no es fácilmente terminante antigénico). Cuando un anticuerpo
predecible pues, como la primera unión con el an- interacciona con más de un determinante antigénico
ticuerpo puede producir cambios estéricos en el puede terminar uniéndose a diferentes molécu-
antígeno, los demás sitios de unión pueden verse las, fenómeno que recibe el nombre de reactividad
afectados y no tener lugar más interacciones. La or- cruzada, y que termina por llevar a error. Otro tan-
denación geométrica, en particular la proximidad to ocurre cuando diferentes moléculas presentan el
de los determinantes antigénicos, o su concentra- mismo determinante antigénico. Siempre es nece-
ción, que igualmente determina la proximidad de sario comprobar la especi�icidad de la interacción
unos determinantes con otros, también puede pro- AG-AB y, como su importancia es capital, se dedi-
141
Métodos en biociencias
Figura 5.3: Esquema que ilustra el efecto de la disposición geométrica (izquierda) y de la concen-
tración (derecha) de los epítopos sobre la a�inidad. La proximidad de los epítopos –bien por efecto
de la estructura, bien por efecto de la concentración– permite dobles interacciones a los anticuer-
pos y provoca una mayor avidez.
cará a su estudio un epígrafe completo (5.6) dentro anticuerpos, cada tipo derivado de un clon de lin-
de este capítulo. focitos B, de ahí el nombre de policlonal. El origen
de esta mezcla de anticuerpos es doble, por un lado
está causado por la existencia de diferentes epíto-
5.2. El anticuerpo en la inmunotécnica pos dentro de la molécula utilizada como antígeno,
y por otro por la posibilidad de que un mismo de-
En una inmunotécnica, a los anticuerpos se les debe terminante antigénico pueda ser reconocido por
prestar una doble atención. En primer lugar por su diferentes anticuerpos. En este último caso es posi-
origen (anticuerpos policlonales y monoclonales) y ble que siempre exista algún anticuerpo con mayor
después por la posición que ocupan en la estructura avidez y a�inidad que el resto, pero la producción de
molecular que se genera en la inmunotécnica (anti- otros anticuerpos distintos capaces de interaccio-
cuerpos primarios y secundarios). nar con el antígeno con menor a�inidad y/o avidez
también tiene lugar. La posibilidad de que en di-
ferentes moléculas existan similares o parecidos
5.2.1. Anticuerpos monoclonales y policlonales determinantes antigénicos obliga a testar la especi-
�icidad del PAB, para comprobar que no tienen lugar
Por su modo de origen existen dos tipos de anti-
cuerpos: los policlonales (PAB, policlonal antibody) reacciones cruzadas con otras moléculas.
y los monoclonales (MAB, monoclonal antibody). El método clásico de obtención de MABs es
Para obtener PABs contra un determinado antí- por fusión de linfocitos B con una célula tumoral;
geno se suele seguir el siguiente procedimiento: se obtiene así un híbrido inmortal que produce ac-
inmunización, extracción de plasma, puri�icación, tivamente un único tipo de anticuerpo (Figura 5.4).
titulación y prueba de especi�icidad. Una vez aisla- Por su contribución al desarrollo de esta metodo-
do y puri�icado el antígeno se inyecta en un animal, logía Milstein obtuvo el premio Nobel de Medicina
normalmente conejo o cabra. Esta es la prime- y Fisiología de 1984. La primera fase del procedi-
ra inmunización, a la que le sigue una segunda (3 miento es la inmunización, normalmente de un
semanas después) y más tarde (6-8 semanas) una ratón, que se hace con el �in de aumentar el núme-
tercera inmunización. De este modo más del 90% ro de linfocitos B capaces de producir anticuerpos
de los anticuerpos que hay en plasma van dirigidos contra el antígeno escogido; si no se realizase la
contra el antígeno usado. Se extrae sangre, se obtie- inmunización sería mucho más di�ícil localizar lin-
ne el plasma, se hace una puri�icación para retirar focitos B cuyos anticuerpos pudiesen interaccionar
otras proteínas plasmáticas y se titula para saber con el antígeno escogido. Linfocitos B obtenidos
la concentración del anticuerpo. Este anticuerpo se del bazo del ratón inmunizado se fusionan con cé-
de�ine como policlonal pues lo que en realidad se lulas de mieloma, línea tumoral capaz de crecer en
tiene al �inal del proceso es una mezcla de distintos cultivo, para dotar al híbrido de la capacidad de pro-
142
Inmunotécnicas
liferación continua. Estas células tumorales carecen contra el antígeno seleccionado, pero en cada poci-
de la enzima HGPRT (hipoxantina guanina fosforri- llo solo habrá un único tipo de anticuerpo. Todas las
bosil transferasa), implicada en la síntesis de DNA. células de un pocillo derivan de un único hibridoma
Los procedimientos de fusión celular se estudia- por lo que son un auténtico clon; por ello todos los
rán en el capítulo 14, pero en este procedimiento anticuerpos de un pocillo son idénticos y reciben el
se utiliza PEG (polietilénglicol), y, en origen, el vi- nombre de anticuerpos monoclonales. Una vez se-
rus Sendai. Tras la fusión se siembran las células leccionado el pocillo con el anticuerpo más idóneo
y se aislan los hibridomas utilizando el medio se- se expande el clon escogido.
lectivo HAT (hipoxantina-aminopterina-timidina). Los MAB obtenidos con este modo de proce-
La aminopterina bloquea la síntesis de nucleótidos der se llaman MABs de primera generación pero,
de guanina, pero hipoxantina y timidina permiten posteriormente, utilizando tecnología de DNA re-
la activación de una vía sintética de rescate si se combinante, se obtuvieron MABs recombinantes,
dispone de la enzima HGPRT. Puesto que las célu- también llamados MABs de segunda generación.
las tumorales carecen de ella, no proliferan si no se Este nuevo procedimiento (que no se detallará)
fusionan. La eliminación de los linfocitos B no fu- evitaba la inmunización del animal pues lo que se
sionados tampoco es problemática pues no viven conseguía era inmortalizar genes productores de
mucho tiempo en cultivo. El procedimiento de se- anticuerpos en vez de inmortalizar células pro-
lección se hace por clonación a dilución límite (ver ductoras de anticuerpos. La tecnología del DNA
capítulo 4) de modo que en los diferentes pocillos se recombinante permitió obtener anticuerpos com-
generan clones a partir de un único hibridoma. Una pletos, tanto normales como quiméricos (formados
vez que se forman los clones se toma el medio de por genes de dos especies), pero también fragmen-
cultivo de diferentes pocillos y se testa la existencia tos de anticuerpos. Estos fragmentos son muy útiles
de anticuerpos contra el antígeno escogido. Es im- en las modernas técnicas de análisis masivo pues
portante tener en cuenta que puede haber diversos suelen ser mucho más estables y mucho más a�ines.
pocillos con hibridomas que producen anticuerpos Los tipos de fragmentos son muy variados: región
143
Métodos en biociencias
Fab, scFv (región variable de cadena sencilla), dí- de�inirlos conviene recordar que el fragmento Fab
meros y trímeros de scFv (diabodies y triabodies), es responsable de la interacción con el antígeno y el
minianticuerpos (minibodies) y proteínas de fusión, Fc es característico de cada especie.
que incorporan un fragmento del anticuerpo y otro El anticuerpo primario es el que reconoce al
fragmento de otra proteína. antígeno y el anticuerpo secundario el que reconoce
Una herramienta interesante son los mimé- la región Fc del primario e incorpora el marcaje. La
ticos de los anticuerpos, moléculas capaces de estequiometría de esta interacción es de 1 a 2 pues
interaccionar con antígenos pero estructuralmente a la región Fc del anticuerpo primario se le pueden
muy diferentes a los anticuerpos. Normalmente son unir dos anticuerpos secundarios (Figura 5.6).
péptidos y proteínas de diseño, y entre ellos des- El conocimiento de la terminología que sir-
tacan los af�ibodies, cuyo armazón molecular está ve para nombrar a estos anticuerpos es importante
basado en el dominio Z de la proteína A (ver apar- pues indica dos características fundamentales para
tado dedicado al marcaje con oro), cuyo dominio de todo anticuerpo: donde se ha sintetizado y contra
unión incorpora tres α-hélices y carecen de puen- qué va dirigido. Por ejemplo, si en un conejo se sin-
tes disulfuro. tetiza un anticuerpo contra un antígeno A humano
se dice que ese es un anticuerpo primario de cone-
5.2.2. Anticuerpos primarios y secundarios jo anti-A humano. El anticuerpo secundario ha de
reconocer la región Fc del primario y, obviamente,
En las inmunotécnicas se construye una estructura tiene que ser obtenido en una especie animal dife-
molecular a base de anticuerpos (a veces, con la in- rente de la que sintetizó el anticuerpo primario, por
corporación de otras moléculas) que relaciona un ejemplo, una cabra. En este caso, habría que utili-
antígeno determinado con una estructura capaz de zar como antígeno la región Fc de anticuerpos de
generar una señal, por lo que esta última recibe el conejo, e inmunizar con ellos a una cabra; por ello,
nombre de marcaje. En función de su posición en los anticuerpos obtenidos serán anticuerpos secun-
esta estructura molecular se dice que existen an- darios de cabra anti-Fc de conejo. Comercialmente
ticuerpos primarios y secundarios, pero antes de existe una gran variedad de anticuerpos secunda-
Figura 5.5: Esquema que ilustra el modo de interacción de los anticuerpos pri-
marios y secundarios. “M” representa el marcaje. La formas asociadas a la región
Fc que indican las �lechas discontinuas representan el hecho de que esta región es
característica de cada especie.
144
Inmunotécnicas
rios en función de la especie en que se sintetizan, usado es biotina (BIO), aunque también destacan
el tipo de marcaje que incorporan y el inmunógeno digoxigenina (DIG) y dinitrofenol (DNP). Sea di-
que se usa en su síntesis. En este último caso lo más rectamente el marcador, o sea el hapteno, la unión
usual es que, como ya se ha visto, sea la región Fc de cualquier molécula al anticuerpo puede produ-
del anticuerpo primario, pero a veces se usa el anti- cirse en tres lugares distintos del anticuerpo: (1)
cuerpo primario entero. grupos amino, normalmente de los restos de Lys,
(2) grupos sul�idrilo, en los lugares donde existen
puentes disulfuro, y (3) carbohidratos, normalmen-
5.3. Marcaje te localizados en la región Fc. El modo más habitual
de utilización de los grupos amino es a través del
El marcaje consiste en unir, habitualmente a los éster de NHS (N-OH-succinamida) (Figura 5.7),
anticuerpos y a veces a los antígenos, una molécu- método muy empleado para unir haptenos o �luo-
la que sea capaz de producir una señal. En el caso rocromos; otra posibilidad ampliamente usada es
de los anticuerpos, cuando el marcaje se incorpora el empleo de glutaraldehido como puente de unión,
en el anticuerpo primario se dice que es un méto- en este caso suele utilizarse para unir enzimas. Si
la molécula a unir posee grupos hidroxilo se pue-
do directo, y no es necesario utilizar anticuerpos
de unir al grupo amino del anticuerpo mediante un
secundarios; sin embargo, cuando se incorpora en
proceso conocido como aminación reductiva. El in-
el anticuerpo secundario, que es lo más habitual, se
conveniente de usar el grupo amino es que la unión
dice que es un método indirecto (Figura 5.6). La in-
puede tener lugar con las Lys que forman parte de
corporación del marcaje en el antígeno es común en
la región variable, hecho que puede afectar al meca-
pruebas inmunológicas donde lo que se suele que- nismo de interacción entre antígeno y anticuerpo.
rer detectar es la existencia de anticuerpos. Los grupos sul�idrilo se obtienen por reducción
El mecanismo molecular por el que la molécu- de los puentes disulfuro; en este caso se requiere
la que produce la señal se une al anticuerpo puede añadir un grupo (maleimida o iodoacetato) a la mo-
ser muy variado, entre otros motivos porque exis- lécula que se va a unir al radical sul�idrilo. Dado que
ten muy diferentes tipos de marcaje. Esta unión se puede seleccionar el puente disulfuro que se va a
puede ser no covalente, modo muy poco usado que utilizar es posible escoger aquellos cuya disrupción
no se considerará, o covalente, y en este último caso no termina causando efectos (o al menos los me-
puede tener lugar directamente o a través de hapte- nores posibles) sobre la unión con el antígeno. Los
nos. Los haptenos son pequeñas moléculas que no azúcares son especialmente interesantes pues se lo-
emiten señal, pero sirven de nexo de unión o como calizan en la región Fc y el impacto que provoca la
puente para anclar la molécula marcadora. El más unión de moléculas en esta zona prácticamente no
145
Métodos en biociencias
afecta a la interacción del antígeno con el anticuer- señal endógena. Aunque, en general, la anulación
po. En este caso se necesita que los grupos hidroxilo de señal endógena no es compleja; por ejemplo,
de los azúcares sean oxidados a aldehídos para re- la peroxidasa se inactiva incubando con H2O2, y la
accionar con grupos amino de la molécula a unir; fosfatasa alcalina con EDTA. Otra posibilidad, si se
aminación reductiva inversa a la vista anteriomen- trabaja con muestras de origen animal, es utilizar la
te (Figura 5.7). enzima glucosa oxidasa como marcador, pues es ex-
Existen diferentes tipos de marcaje en relación clusiva de vegetales. El marcaje enzimático es muy
con la naturaleza de la señal, y la elección de uno utilizado en inmunohistoquímica, immunoblotting y
u otro depende de bastantes parámetros. En lugar ELISA.
de hacer una consideración general sobre el crite-
rio de elección se irá informando sobre las ventajas
e inconvenientes de cada una de los diferentes tipos 5.3.2. Marcaje luminiscente
de marcaje conforme se vayan estudiando. Se consi-
derarán los siguientes tipos de marcaje: enzimático, Existen dos tipos: quimioluminiscencia y biolumi-
luminiscente, �luorescente, con oro, radiactivo, y niscencia, ambos variantes del método enzimático
por sonda enzimática. pues el anticuerpo también va marcado con una en-
zima, pero en este caso el producto que se añade es
una molécula que emite luz al ser modi�icada por la
5.3.1. Marcaje enzimático enzima. En el caso de la quimioluminiscencia la en-
zima empleada es la peroxidasa y el sustrato más
Determinadas enzimas pueden (1) ser acopladas a utilizado el luminol, que emite a 425 nm. Es un mé-
un anticuerpo o (2) ser reconocidas por él. Estas en- todo mucho más sensible que los colorimétricos,
zimas son puestas en contacto con un compuesto pero necesita técnicas fotográ�icas. Suele ser usado
que al reaccionar con ellas genera un producto colo- en immunoblotting, y para ello el papel que soporta
reado, por ello se dice que es un método de detección las proteínas es puesto en contacto con un negati-
colorimétrica. Las enzimas usualmente empleadas vo fotográ�ico que se revela una vez impresionado.
son peroxidasa (la más usada), fosfatasa alcalina, La bioluminiscencia consiste en marcar al an-
beta-galactosidasa y glucosa oxidasa. La peroxida- ticuerpo con una molécula de origen biológico que
sa, también denominada como HRP (horseradish causa la emisión de luz, como es el caso de la luci-
peroxidase) por su origen, es capaz de interaccionar ferasa. Para conseguir dicha emisión es necesario
y rendir color con diferentes productos: la diamino- añadir luciferina, ion Mg y ATP.
benzidina (DAB), probablemente el más usado, que
genera un precipitado marrón oscuro insoluble; el
4-cloronaftol (4-CN), que produce un precipitado 5.3.3. Marcaje fluorescente
azul soluble en alcohol; el aminoetilcarbazol (AEC),
que rinde un precipitado rojo soluble en alcohol; o el El modo más usual de llevarlo a cabo es acoplar
ABTS (2.2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sul- directamente una molécula �luorescente al an-
phonic acid)), que genera un producto verde soluble, ticuerpo, normalmente secundario. También es
muy usado en la técnica ELISA. Para la fosfatasa al- posible llevar a cabo acoplamientos indirectos al
calina se suele usar NABP (naftolbifosfato), que da conjugarlos con otras moléculas que pueden ser re-
un producto rojo insoluble, para la beta-galactosi- conocidas por anticuerpos como proteína A o con
dasa se suele usar BCIG (bromocloro indolil galacto moléculas como avidina capaces de interaccionar
piranósido), que genera un producto azul insoluble, con biotina, hapteno unido al anticuerpo. La diver-
y para la glucosa oxidasa se usa el NBT (nitro blue te- sidad de moléculas �luorescentes acopladas a los
trazolium chloride) que rinde un producto insoluble anticuerpos es tal que, para hacerse una idea, lo más
de color azul oscuro. conveniente es entrar en la red y, en cualquier bus-
El marcaje enzimático es fácil de realizar (y por cador, teclear «Alexa Fluor». No obstante puede ser
ello muy de rutina), barato y permite dobles y triples oportuno nombrar a los dos �luoróforos más clási-
marcajes; es decir, detectar simultáneamente dos o cos en las inmunotécnicas: �luoresceína y rodamina,
tres antígenos usando dos o tres anticuerpos y sis- o sus derivados más estables, FITC (�luorescein iso-
temas de color distintos. Uno de sus inconvenientes thiocyanate) y TRICTC (rhodamine isothiocyanate),
es que no siempre presenta una alta sensibilidad, y cuyo uso se inicia en la década de los 40. La apari-
el otro deriva de la existencia de las enzimas mar- ción de nuevos �luoróforos, los de tipo Cy (Cy2, Cy3,
cadoras en las células de muchos tejidos, por lo que Cy5…) en los años 90, y los Q-dots (quantum dots)
se puede generar señal de fondo, también llamada (nanocristales de metales pesados) en 2003, ha per-
146
moléculas en esta zona prácticamente no afecta a la interacción del antígeno con el
anticuerpo. En este caso se necesita que los grupos hidroxilo de los azúcares sean Inmunotécnicas
oxidados a aldehídos para reaccionar con grupos amino de la molécula a unir;
aminación reductiva inversa a la vista anteriomente (Figura 7).
Figura 7. Esquema
5.7: Esquemadedelala
reacción que
reacción queseseproduce
produceenenelelmétodo
métododel
deléster
ésterNHS
NHS(arriba)
(arriba) y en el
y en
el método
método de la aminación
de la aminación reductiva
reductiva (abajo).
(abajo). Tomado de la página
Tomado web de
de la página webThermo Scientific.
de Thermo Scienti�ic.
147
Métodos en biociencias
en caso de que estas sean de mayor tamaño. Puesto 5.3.6. Marcaje por sonda enzimática
que las partículas no permiten el paso de electro-
nes, en la pantalla del microscopio electrónico se Es una técnica muy poco usual cuyo objetivo es de-
aprecian puntos negros donde el anticuerpo mar- tectar la presencia de determinados anticuerpos,
cado se unió. Estas nanopartículas también pueden hecho de interés en el diagnóstico de enfermeda-
ser fácilmente detectadas con el AFM o con el SEM. des de tipo autoinmune. Sabiendo cuales son los
Son muchas las moléculas que se pueden unir péptidos más frecuentes contra los que se produ-
a una nanopartícula de Au y, además del mecanis- ce respuesta inmune en este tipo de enfermedades,
mo adsortivo que no implica el establecimiento de se generan péptidos sintéticos a los que se les aña-
enlaces químicos, en los últimos años se han de- de una actividad enzimática, por ejemplo, del tipo
sarrollado estrategias de unión covalente entre el peroxidasa o galactoxidasa. Al incubar este tipo de
anticuerpo y las moléculas que recubren a la na- proteína con la muestra de sangre del paciente, si
noesfera. En el caso de las inmunotécnicas, uno de este tiene anticuerpos contra el péptido en cues-
los procedimientos de unión más habitual se basa tión lo reconocerá y unirá, pudiendo ser fácilmente
en el empleo de la proteína A o la proteína G, que detectado posteriormente puesto que el antígeno
por un lado se unen a la nanopartícula y por otro in- unido al anticuerpo lleva el marcaje enzimático in-
teraccionan con la región Fc del anticuerpo (Figura corporado.
5.9), lo que hace que este último quede perfecta-
mente orientado. La proteína A es un constituyente
de la pared celular de Staphylococcus aureus y reco- 5.4. Arquitectura molecular
noce la región Fc de algunos tipos de IgG. La proteína
G la presenta el grupo G de Streptococcus y es me- Es posible considerar a una inmunotécnica como
nos especí�ica que la proteína A, por lo que se suele un modo de proceder que, utilizando anticuerpos,
utilizar una variante recombinante que solo interac- permite asociar una señal con la molécula objeto
ciona con la región Fc de las IgG que no reconoce la de estudio. En este proceso los anticuerpos y otras
proteína A. Las nanopartículas se pueden acoplar moléculas conforman unas estructuras moleculares
al anticuerpo primario, aunque lo usual es acoplar- (andamios moleculares) que hacen de puente entre
las al anticuerpo secundario. Como se puede marcar la molécula de estudio y la señal. Cada una de las
con nanoesferas de diverso diámetro, se pueden ha- piezas de este andamio tiene una posición exacta y
cer dobles y triples marcajes, y también se puede debe interaccionar con otra de forma especí�ica. Por
combinar con otro tipo de marcajes. todo ello parece lógico introducir el concepto de
Las nanopartículas de oro se forman por re- arquitectura molecular en las inmunotécnicas, en-
ducción de sales de Au (AuCl3 normalmente) en el tendiendo como tal las diferentes disposiciones que
solvente apropiado, al que se añade un estabilizante pueden adoptar las moléculas que sirven de nexo de
que rodea al núcleo de oro para prevenir la agre- unión entre la molécula de estudio y la señal.
gación de unas partículas con otras. Los diferentes En este epígrafe se hará una clasi�icación de
tamaños de las partículas se pueden obtener usan- los distintos tipos de inmunotécnicas, y, además, se
do diferentes agentes reductores. estudiarán los «andamios» moleculares de las dos
Figura 5.8: Nanopartículas de oro detectadas con el microscopio electrónico de transmisión (A), el microscopio
electrónico de barrido (B) y el microscopio de fuerza atómica (C). La barra de aumentos representa 50 nm.
148
Inmunotécnicas
Figura 5.10: Esquema que ilustra los tres tipos básicos de disposición molecular en la inmunotécni-
cas: captura de anticuerpo (A), captura de antígeno (B) y doble anticuerpo (C).
149
Métodos en biociencias
Figura 5.11: Esquema de la estructura molecular del método PAP (A), ABC (B) y LSAB (C).
150
Inmunotécnicas
Figura 5.12: Esquema de los métodos de ampli�icación MICA (A), EVS (B) y TSA (C).
de la señal obtenida suele muchas veces ser baja, lo basan en el empleo de sales de metales pesados,
que conlleva una pérdida de sensibilidad. normalmente cloruros de oro y cobalto o sulfatos
Para aumentar la intensidad de una señal co- de níquel y cobre, que provocan un oscurecimien-
loreada de origen enzimático se puede proceder to de la señal. La intensi�icación con plata es menos
en dos sentidos: con la misma cantidad de sus- usada. Generalmente, estos tratamientos se aplican
tancia coloreada conseguir una señal mucho más al �inal de la inmunotécnica, una vez formado el pro-
intensa (intensi�icación) o conseguir más sustan- ducto insoluble derivado de la DAB.
cia coloreada (ampli�icación). Ambos modos no son Los procedimientos de ampli�icación son más
excluyentes y cuando se combinan la ampli�icación complejos, y entre ellos destacan los métodos por
debe preceder a la intensi�icación. El estudio de es- crecimiento (build-up), el método MICA (mirror
tos dos procedimientos se sustanciará sobre un image complementary antibody), el método TSA
sistema de marcaje integrado por peroxidasa y DAB (tyramine signal ampli�ication), el método EVS (En-
(enzima y sustrato cromógeno) que es, de largo, Vision System) (Figura 5.12) o el método RCA (rolling
el procedimiento de marcaje enzimático más utili- circle ampli�ication) (Figura 5.13), este último para
zado en las inmunotécnicas. No obstante, también señales �luorescentes. Los métodos por crecimiento
se incluirá el método de ampli�icación por círculo se basan en ir incorporando moléculas marcado-
rodante, que se utiliza para ampli�icar señales �luo- ras por sucesivas y alternativas incubaciones, lo que
rescentes. provoca el crecimiento de la estructura molecular
Los procedimientos de intensi�icación más (de ahí el nombre). En el método de la PAP, partien-
usuales para el marcaje con peroxidasa y DAB se do del esquema de la �igura 5.11, consiste en volver
151
Métodos en biociencias
a incubar con un anticuerpo puente, posteriormen- La ampli�icación por círculo rodante, método
te hacerlo con el complejo PAP y así sucesivamente. RCA, consiste en utilizar un anticuerpo (primario
La ampli�icación en el método ABC es teóricamente o secundario) que lleva unido un oligonucleótido.
sencilla, si la peroxidasa va doblemente biotinilada, Una molécula de DNA circular hibrida con el oligo-
y una de las dos biotinas está libre, basta con incu- nucleótido pues posee repetidas veces su secuencia
bar con avidina y volver a incubar con peroxidasa complementaria. El oligonucleótido unido es am-
biotinilada y así sucesivamente. pliado utilizando el DNA circular como molde y, una
El método MICA es una variante de los mé- vez terminada esta ampliación, se produce la hibri-
todos de crecimiento y consiste en, una vez unido dación con sondas complementarias normalmente
el anticuerpo secundario, aplicar de nuevo el anti- marcadas con �luoróforos (Figura 5.13).
cuerpo primario, que se une al sitio de unión libre
del anticuerpo secundario, y volver a aplicar el an-
ticuerpo secundario marcado y así sucesivamente. 5.6. Control de la especificidad
El método TSA se aplica a inmunotécnicas basadas
en el método ABC o LSAB, y consiste en incubar con El problema principal de una inmunotécnica es
tiramina biotinilada en presencia de H2O2, esta mo- saber si la señal obtenida es correcta y no origi-
lécula es activada por la peroxidasa y se une a las nada de forma espuria, obteniendo entonces una
proteínas próximas a ella. La posterior incubación falsa señal o falso positivo. Básicamente, las seña-
con peroxidasa unida a avidina hace que se produz- les falsas pueden serlo por dos motivos: porque se
ca una mayor concentración de la enzima en la zona generan de forma endógena; es decir, las genera
próxima al antígeno. El método EVS, también lla- nuestra muestra y no el marcaje utilizado, o por-
mado marcaje polimérico, utiliza una molécula de que los anticuerpos no se unen de forma especí�ica.
dextrano (polímero rami�icado de glucosa) sobre la Otro posible error, de naturaleza contraria, es la no
que se asientan anticuerpos secundarios y numero- obtención de señal por fallos en el desarrollo de la
sas moléculas de peroxidasa. inmunotécnica.
En adelante se estudiarán estrategias y proce-
dimientos que sirven para garantizar la �iabilidad
del resultado obtenido en la inmunotécnica, inde-
pendientemente de que este pueda ser positivo o
negativo. Estas estrategias y procedimentos inclu-
yen: bloqueo, especi�icidad, curvas dosis-respuesta,
controles negativos y controles positivos. En gene-
ral, cuando se está poniendo a punto una técnica
es necesario llevar a cabo todos los tipos de con-
troles que aquí se describen; después, cuando se
repite la técnica, es obligatorio llevar a cabo algu-
no (control de la señal endógena y eliminación
del anticuerpo primario son los básicos), e in-
cluir alguno más si se utiliza algún reactivo nuevo.
5.6.1. Bloqueo
Existen dos tipos de bloqueo:
152
Inmunotécnicas
o fase sólida (cristal, tejido, plástico, nitrocelulo- primario se une al antígeno y el secundario al pri-
sa...), e incluso a otras moléculas. Los bloqueantes mario. Al igual que la comprobación del bloqueo de
más habituales son albúmina, gelatina, blotto-bu- la señal endógena, este tipo de control es obligato-
ffer o sueros pre-inmunes; es decir de animales que rio realizarlo siempre, en cada inmunotécnica.
no han sido inmunizados. En el caso de los sueros, La especi�icidad del anticuerpo primario se
el bloqueo ideal hay que realizarlo con suero de un suele comprobar de diferentes maneras, algunas
animal de la misma especie donde se haya sinteti- más concluyentes que otras. Una de las formas
zado el anticuerpo secundario, también se puede más utilizadas es mediante bloqueo del anticuer-
utilizar el de otras especies, pero jamás el suero de po primario; para ello, antes de su uso, es necesario
un animal de la misma especie donde se haya sin- incubar al anticuerpo primario con una concentra-
tetizado el anticuerpo primario pues entonces el ción alta de antígeno puro. De este modo se saturan
anticuerpo secundario se uniría a los anticuerpos los sitios de unión del anticuerpo y al añadirlo a la
del suero y a los anticuerpos primarios. La inten- muestra no puede interaccionar con el antígeno
sidad del bloqueo debe ajustarse en cada caso de incluido en ella, por lo que al completar la inmu-
forma empírica pues por defecto suele generar rui- notécnica no se obtiene señal. Otra posibilidad es
do de fondo y por exceso debilita la señal. llevar a cabo la inmunotécnica en una muestra don-
de, con absoluta certeza, no se encuentra el antígeno
Bloqueo de la señal endógena reconocido por el anticuerpo primario. Además, en
el immunoblot se suele añadir otro procedimiento
Antes de iniciar la inmunotécnica es necesario com- para el que hay que utilizar, al menos, dos carri-
probar, cualquiera que sea la naturaleza de la señal, les de la electroforesis, uno donde se ha inyectado
que la muestra a estudiar carece de señal endóge- la muestra biológica y otro al que solo se le ha in-
na, que es aquella señal producida por la muestra yectado el antígeno que se quiere estudiar. Una vez
biológica y no por el marcaje. Obviamente existen obtenida la señal se puede comprobar si en el carril
diversos procedimientos de bloqueo en función de la muestra se ha producido una sola banda y si
del tipo de muestra biológica y del marcador y se- esta coincide con la del carril donde solo se inyec-
ñal usados, pero, en general, para comprobar que tó el antígeno.
el bloqueo es efectivo y no hay señal endógena hay La especi�icidad del anticuerpo secundario se
que testar la existencia de señal sin haber inclui- suele comprobar realizando la inmunotécnica sin
do el marcaje. Por ejemplo, en un método indirecto incluir el anticuerpo primario y comprobando si
enzimático que usa la peroxidasa, lo usual es selec- hay señal. Puesto que el anticuerpo secundario solo
cionar unas muestras que no han sido incubadas puede unirse al anticuerpo primario y este no ha
con el anticuerpo secundario (lleva el marcaje) y sido incluido, si hay señal es debida a la unión ines-
añadir el cromógeno (DAB, por ejemplo). Si se ob- pecí�ica del anticuerpo secundario. Es importante
tiene señal la responsable de su aparición sería ajustar las concentraciones del anticuerpo secunda-
una peroxidasa endógena mal bloqueada. En las rio y su tiempo de incubación, pues concentraciones
técnicas con marcaje �luorescente, por poner otro elevadas de anticuerpo secundario y tiempos largos
ejemplo, lo usual es iluminar la muestra con la lon- de incubación suelen causar señales inespecí�icas
gitud de onda de excitación del �luorocromo antes en forma de ruido de fondo (background).
de haberlo añadido.
Especificidad de la señal
5.6.2. Especificidad
En una inmunotécnica se entiende por señal es-
En este apartado se considerarán las estrategias pecí�ica aquella originada única y exclusivamente
que se utilizan para comprobar que la unión de los por el sistema de marcaje propio de la inmunotéc-
anticuerpos es especí�ica, al igual que la aparición nica, independientemente de que el marcaje esté
de la señal. localizado en los anticuerpos o en el antígeno. El
procedimiento a seguir para comprobar la especi-
Especificidad de la unión de los anticuerpos �icidad de la señal es exactamente el mismo que el
seguido para comprobar que no existe señal endó-
Cuando se testa la especi�icidad de unión de los gena, y que, básicamente, consiste en no incluir la
anticuerpos lo que se trata de comprobar es si los molécula que lleva el marcaje cuando se realiza la
anticuerpos se unen correctamente; es decir, si el inmunotécnica.
153
Métodos en biociencias
154
Inmunotécnicas
dicionantes más sobresalientes; en ningún caso se muestra, entre los que destacan: el tratamiento con
incluirán protocolos, tal cosa escapa al objetivo de detergentes como Tween20 o tritón X-100 (0.1-1%),
este epígrafe y de este capítulo. congelar y descongelar la sección repetidas veces,
el tratamiento con proteasas (similar al visto ante-
riormente) o el tratamiento con concentraciones
5.7.1. Inmunohistoquímica crecientes de etanol. El Tween20, a menor concen-
tración, se suele utilizar en la fase de incubación del
Básicamente, una técnica inmunohistoquímica anticuerpo primario y del secundario pues favorece
(IHC, immunohistochemistry) consiste en realizar la interacción de estas moléculas con sus respectivas
la inmunotécnica en secciones de tejido para poder parejas moleculares, el antígeno y el anticuerpo pri-
ser observadas con el microscopio óptico, lo que po- mario respectivamente.
sibilita la localización del antígeno, su distribución
El bloqueo de unión inespecí�ica se suele hacer
y hasta su semicuanti�icación. Los procedimientos
con suero preinmune de la especie de origen del an-
de obtención de estas secciones se estudian en el
ticuerpo secundario, pero se pueden utilizar otros
capítulo 7.
procedimientos. En cuanto al marcaje, lo más usual
La �ijación del tejido es uno de los procesos fun- es emplear métodos indirectos de tipo enzimático o
damentales de esta técnica ya que puede provocar con marcaje �luorescente. De hecho el primer pro-
cambios conformacionales en los antígenos que mo- cedimiento inmunohistoquímico fue realizado por
di�iquen su interacción con el anticuerpo. Por ello, el equipo de Coons en 1942 utilizando marcaje �luo-
las �ijaciones de tipo químico suelen ser suaves o rescente. Finalmente, en la inmunohistoquímica
incluso, en algunos casos, puede ser más idónea la es fácil la realización de dobles y triples marca-
crio�ijación. Dos de los �ijadores más usualmente jes, o incluso el contrastado de la sección, que es
empleados son el paraformaldehido y el etanol de la combinación de estas técnicas con procedimien-
70º. Algunas muestras, normalmente biopsias, se tos de tinción estándar (hematoxilina-eosina, azul
suelen �ijar siguiendo protocolos cuyo objetivo no de toluidina…) para facilitar la identi�icación de las
es la realización de pruebas de tipo inmunohistoquí- estructuras incluidas en la sección. La �igura 5.15
mico; esto, a veces, suele causar drásticos cambios incluye microfotogra�ías de secciones inmunoteñi-
en la antigenicidad de muchas moléculas, efecto que das.
se conoce con el nombre de enmascaramiento del
antígeno. Existen diversos procedimientos de desen-
mascaramiento de antígenos (antigen retrieval) cuyo 5.7.2. Inmunocitoquímica
objetivo es lograr que el antígeno pueda ser recono-
cido por el anticuerpo primario. Entre ellos destacan Aunque no existe un consenso de�initivo sobre la
dos: el tratamiento con proteasas (PIER, protea- utilización de los términos inmunohistoquímica e
se-induced epitope retrieval), entre las que destacan inmunocitoquímica, de hecho hay autores que los
pepsina, tripsina o pronasa; y el tratamiento con ca- engloban y solo consideran técnicas inmunohisto-
lor (HIER, heat-induced ER), sometiendo al tejido a químicas; en este capítulo se considerarán ambos:
90-100 ºC alrededor de 10-20 minutos. En un prin- la inmunohistoquímica en el campo de la micros-
cipio se hacía en tampones muy básicos, después se copía óptica, y la inmunocitoquímica en el de la
ha visto que algunos antígenos se desenmascaran microscopía electrónica. Bajo este prisma, el obje-
mejor en tampones ácidos, e incluso neutros. Proce- tivo principal de las técnicas inmunocitoquímicas
dimientos menos habituales son el tratamiento por es la localización de antígenos a nivel celular y sub-
incubación con ácido fórmico concentrado, urea (3 celular usando el microscopio electrónico. En la
M), cloruro amónico (0.5 M), sacarosa, borohidruro inmunocitoquímica existen dos diferentes modos
sódico o soluciones fuertemente alcalinas. de proceder en función del momento de realización
Otro aspecto importante en las técnicas inmu- de la inmunotécnica: las técnicas de pre-inclusión
nohistoquímicas es la capacidad de penetración de (pre-embedding), donde la inmunotécnica es previa
los anticuerpos. El grosor medio de las secciones a la inclusión, y las de post-inclusión (post-embed-
oscila entre 6 y 10 μm, y debido al entramado mo- ding), donde es posterior. En general, el método de
lecular de la sección y al tamaño de los anticuerpos pre-inclusión rinde mejores resultados pero, si es
(especialmente el secundario que es el que suele necesario usar muestras ya incluidas, el procedi-
llevar asociado el marcaje), solo los antígenos más miento idóneo es el método post-inclusión.
externos son susceptibles de interaccionar con los En un procedimiento habitual del método de
anticuerpos. Existen, al igual que en el caso ante- pre-inclusión, tras la �ijación, se obtienen, en el vi-
rior, diversos procedimientos para permeabilizar la bratomo, secciones de 25 hasta 100 μm de espesor
155
Métodos en biociencias
Figura 5.15: Secciones inmunoteñidas de tejido nervioso: (A) estriado; (B) hipocampo; (C) cerebelo (CM, capa molecu-
lar; SB, sustancia blanca). En A y B se observan astrocitos inmunoteñidos utilizando un anticuerpo anti-GFAP con peroxi-
dasa y DAB como sistema de marcaje. La sección A no está contrastada, la B ha sido contrastada con azul de toluidina. En
la sección C los núcleos de las neuronas de los granos aparecen inmunoteñidos con un anticuerpo anti-neuN asociado a
un marcador �luorescente. Cortesía de la Dra I. Suárez, Universidad de Alcalá. Disponible en color.
sobre las que se hace la técnica inmune, normal- metálicas que se obtienen en algunas de las técnicas
mente en �lotación y utilizando marcaje con oro de metalizado empleadas en microscopía electróni-
o enzimático. Debido al grosor de la sección sue- ca. Para ello hay que hacer una digestión muy suave
le ser necesario permeabilizarlas. Posteriormente, y controlada del material biológico sobre el que se
la sección se deshidrata e incluye en resina (es- ha realizado la réplica. Esto permite que algunas mo-
tos procedimientos se detallan en el capítulo 8), y léculas de la muestra queden ancladas a la réplica
con la ayuda de un estereomicroscopio se aísla un metálica y puedan servir de lugares de anclaje del an-
pequeño fragmento que es pegado a un bloque ex- ticuerpo primario. El anticuerpo secundario ha de ir
clusivamente de resina. Una vez así dispuesto se marcado con nanopartículas de oro (Figura 5.16c). A
corta en el ultramicrotomo, se prepara la rejilla y se veces, pueden quedar enzimas adheridas a la réplica
tiñe y contrasta con las sales usuales de metales pe- metálica y entonces es posible llevar a cabo técnicas
sados. Es importante no desperdiciar cortes pues histoquímicas (se detallan en el capítulo 10).
en los primeros (los más super�iciales) es donde se
consigue un marcaje más e�iciente. En el procedi-
miento post-inclusión lo que se hace es tratar las 5.7.3. Inmunoprecipitación
secciones montadas en las rejillas con productos
que eliminan el plástico de inclusión, y realizar des- La inmunoprecipitación (IP) también se puede con-
pués la inmunotécnica. siderar un tipo de inmunopuri�icación pues en el
El marcaje con nanopartículas de oro es proceso se consigue el aislamiento (puri�icación)
fácil de detectar pues las partículas de oro son fá- de un antígeno especí�ico del resto de moléculas
cilmente identi�icables como círculos electrodensos que van incluidas en la muestra biológica. El térmi-
(oscuros) de diferente tamaño, en función del ta- no precipitación hace referencia a que el anticuerpo
maño de la nanopartícula. El marcaje enzimático, va asociado a una estructura que, por su peso, arras-
usualmente peroxidasa con DAB como cromógeno, tra al complejo antígeno-anticuerpo unido a ella.
se presenta como manchas electrodensas (Figura Clásicamente, esta estructura ha sido una bola de
5.16a y b). agarosa (nombre comercial Sefarosa); sin embargo,
Una variante de estas técnicas llamada «deter- en los últimos años el empleo de estas bolas ha sido
gent digestion fracture-labeling technique» se emplea sustituido por esferas magnéticas. Esta técnica sir-
para localizar antígenos especí�icos en las réplicas ve para detectar (presencia/ausencia), cuanti�icar o
156
Inmunotécnicas
Figura 5.16: (A) Marcaje con nanopartículas de oro del canal de K en una neurona. La barra indica 1μm. Tomado de Du
et al., Neuroscience 84:37-48, 1998. (B) Célula plasmática. El RER aparece lleno de anticuerpos anti-HRP revelados tras
incubación con HRP y DAB. Tomado en «The FDC Network-Comcast.net». (C). «Detergent digestion fracture-labeling
technique». El esquema muestra el inmunomarcaje de moléculas adheridas a la réplica mediante nanopartículas de oro.
Con el �in de simpli�icar se ha optado por un marcaje directo.
Figura 5.17: Esquema de un procedimiento de IP con esferas paramagnéticas. El anticuerpo unido a la esfera se
mezcla con la muestra biológica (A) y, tras un periodo de incubación (B), se produce la unión del anticuerpo con su
correspondiente antígeno (C). Se aplica un campo magnético que retiene los anticuerpos y los antígenos unidos a
ellos (D) y se elimina el sobrenadante (E). Se retira el campo magnético, se añade un medio que separa las esferas
paramagnéticas de los anticuerpos (F) y se vuelve a aplicar el campo magnético para retener las esferas (G). El
sobrenadante se pasa a un nuevo tubo (H) con un medio que separa antígeno y anticuerpo. Las esferas quedan
aisladas y pueden ser reutilizadas (I). En las imágenes D y E se ha disminuido el tamaño de los complejos antíge-
no-anticuerpo para adaptarlos a la estructura que representa al imán que genera el campo magnético.
157
Métodos en biociencias
semicuanti�icar antígenos y, a la vez, permite su pu- uno de los mejores y primeros ejemplos de su apli-
ri�icación. cación fue el desentrañar la estructura de la red
El modo más habitual de unir el anticuerpo a proteica submembranosa del glóbulo rojo forma-
la esfera (tanto de agarosa como magnética) suele da, entre otras proteínas, por espectrina, anquirina
ser a través de la proteína A o la proteína G, aun- o banda III. El estudio del material precipitado me-
que también se puede hacer directamente si se diante electroforesis es necesario para demostrar
activan las esferas con algún radical que pueda in- la coprecipitación y ayudar a identi�icar el material
teraccionar con el anticuerpo. En algunos casos es coprecipitado.
el anticuerpo primario el que se une a la esfera (mé-
todo directo), en otros es un anticuerpo secundario 5.7.4. Immunoblotting
(método indirecto). La precipitación se consigue
por centrifugación en el caso de las esferas de aga- La terminología castellana para nombrar esta
rosa y por la aplicación de un campo magnético en técnica es confusa. Probablemente el término elec-
el caso de las esferas magnéticas. Tras la precipita- troinmunotransferencia sea el más correcto, pero
ción del complejo (esfera-anticuerpo-antígeno) se es muy poco utilizado. Lo usual es «castellanizar» a
elimina el sobrenadante y el precipitado se incu- medias, el término inglés immunoblotting y dejarlo
ba en un medio que, dependiendo de su naturaleza, en inmunoblotting. Otra posibilidad es utilizar di-
permite el desenganche de las esferas, la liberación rectamente el término inglés ya visto o el término
del antígeno o de todo el complejo (Figura 5.17). Western blot (WB), que es otra manera de nombrar
La aplicación de esferas magnéticas en la bio- esta técnica.
medicina es relativamente reciente; sin embargo, se La fase sólida del WB suele ser una membrana
han desarrollado numerosos tipos de esferas con el de nitrocelulosa o PVDF (polyvinylidene di�luoride),
�in de optimizar su aplicación. A veces se intercam- esta última más resistente y con mayor capacidad
bia el término esfera con el de partícula, en sentido de unión (150-160 μg/cm2 frente a 80 μg/cm2), su
estricto solo una partícula redonda es una esfera, lo único inconveniente es que su alta hidrofobicidad
que ocurre es que la mayoría de las partículas son obliga a mojarla previamente en metanol. El tama-
redondeadas. Por su tamaño existen nanoesferas ño de poro habitual de estas membranas es de 0.45
(<100 nm) y microesferas (100 nm a 0.1 mm), estas μm, su�iciente para retener con garantía proteínas
últimas más idóneas en mecanismos de aislamiento mayores de 20 kD; sin embargo, conviene usar mem-
celular (ver capítulo 4, «Aislamiento de un tipo ce- branas de 0.2 μm de poro para pesos moleculares
lular»). Por su comportamiento magnético existen menores. La �ijación de las proteínas a la membra-
esferas magnéticas y paramagnéticas, estas últimas na se produce mediante un proceso de transferencia
solo exhiben comportamiento magnético cuando es- que se estudia en el capítulo 2.
tán bajo la in�luencia de un campo magnético. Por su Una vez mojada la membrana se realiza la
composición química son muy variadas; pero las más inmunotécnica, en la que, probablemente, el pun-
habituales son las de ferrita, óxidos de Fe con otros to más peculiar sea la fase de bloqueo de unión
metales entre los que destaca la magnetita; o las que inespecí�ica de los anticuerpos. Debido a la alta
contienen diferentes metales, Pt o Co es lo más usual. capacidad de unión de estas membranas es nece-
Por su estructura lo más habitual es que tengan un sario realizar un bloqueo muy efectivo de los sitios
núcleo magnético recubierto de un material, grafe- de la membrana donde no se han unido las proteí-
no o polímeros plásticos, que sirve de estabilizante nas provenientes de la electroforesis. El bloqueante
y antiaglomerante, o un núcleo de algún polímero más universal es el tampón «blotto» (blotto buffer),
plástico recubierto de material magnético o para- que se suele preparar con 5% de leche desnata-
magnético, que puede volver a recubrirse de algún da en tampón fosfato salino (PBS) o TRIS salino
polímero para hacer la esfera más lisa. (TBS). Este mismo tampón al 1% suele emplearse
El término coinmunoprecipitación hace re- para incubar el anticuerpo primario. Los modos de
ferencia a un proceso de precipitación donde, marcaje más habituales son el enzimático median-
además de precipitar el antígeno reconocido por te peroxidasa utilizando como cromógeno la DAB,
el anticuerpo, es precipitada otra u otras molécu- la quimioluminiscencia o la �luorescencia, estas dos
las por su interacción con el antígeno. En este caso últimas por su mayor sensibilidad. En el marcaje
el complejo precipitado estaría formado por esfe- enzimático, en caso de señales débiles, suele ser útil
ra-anticuerpo-antígeno-otra molécula. Obviamente, seguir algún procedimiento de intensi�icación.
esta es una técnica cuyo objetivo es poner en evi- Debido a que las proteínas se colocan por su
dencia interacciones entre diferentes moléculas y peso molecular es posible analizar simultánea-
158
Inmunotécnicas
159
Métodos en biociencias
Figura 5.19: Esquema del método ELISPOT. Tras el anclaje de los anticuerpos y el bloqueo de la super�icie del pocillo
o placa (A) se siembran las células que secretan el producto especí�ico (rombos) para dicho anticuerpo (B), y que se
asocia a los anticuerpos más próximos a la célula. Una vez retiradas las células se incuba con un anticuerpo que lleva
asociado marcaje enzimático, representado por un cuadrado con una E en su interior (C). La molécula marcadora
añadida es modi�icada por la enzima y se transforma en un producto insoluble (círculos grises oscuros) que queda
en la zona donde estuvieron las células (D).
Figura 5.20: Esquema de las técnicas FRAP y FLIP. El cuadrado en la técnica FLIP representa la zona donde se
mide la señal inmunoreactiva. N: núcleo.
160
Inmunotécnicas
Figura 5.21: (A) Esquema que ilustra un proceso donde por la proximidad de las moléculas ocurre
FRET; F: �luoróforo. (B) Esquemas que ilustran la utilidad de la técnica FRET para detectar interac-
ción entre moléculas o cambios moleculares.
5.7.6. FRAP, FLIP, FLAP, FRET y FLIM movilidad, su capacidad de recambio o saber si su
transporte es por difusión o por un proceso activo.
La base de estas técnicas está relacionada con la Existe una variante llamada iFRAP (inverse FRAP)
�luorescencia, y un modo muy habitual de colocar donde se fotoblanquea toda la célula excepto un
el marcaje �luorescente en las moléculas a estudiar punto escogido, es especialmente útil en el caso de
suele ser utilizando una inmunotécnica, por ello movilidad de orgánulos.
todas estas técnicas han sido incluidas en este ca-
La técnica FLIP (�luorescence loss in photoblea-
pítulo. No obstante, también existe la posibilidad
ching) puede servir para el mismo objetivo que la
de hacerlo de otras maneras, por ejemplo, en estu-
técnica FRAP pero con un desarrollo diferente. Una
dios con proteínas se puede utilizar marcaje con GFP
vez marcada la proteína se hace fotoblanqueo conti-
(green �luorescent protein) incorporado a través de
mecanismos de transformación celular. nuo en un punto y se analiza el tiempo que tarda en
desaparecer el marcaje en otra zona de la célula. Un
La técnica FRAP (�luorescence recovey after
mayor tiempo de borrado del marcaje indica una me-
photobleaching) se diseñó para analizar la movili-
nor movilidad de esa molécula (Figura 5.20b). Esta
dad de proteínas de membrana y consiste en acoplar
(normalmente mediante anticuerpos) un marcaje técnica también permite saber si una proteína pasa
�luorescente a la proteína que se quiere estudiar. Se por un determinado punto, nótese que no desapa-
fotoblanquea entonces una pequeña super�icie con recerá el marcaje si se fotoblanquea un punto por
luz láser y se analiza el tiempo que tarda ese área donde nunca la pasa la molécula de estudio.
en recuperar la señal �luorescente; obviamente, La técnica FLAP (�luorescence localization after
tiempos más cortos de recuperación implican una photopleaching) consiste en marcar a la molécula
mayor movilidad de la proteína estudiada (Figura de estudio con dos �luorocromos y escoger un área
5.20a). La posibilidad de microinyectar moléculas donde se fotoblanquea uno de ellos. La posibilidad
�luorescentes ha permitido analizar la movilidad de de detectar al otro �luorocromo permite analizar di-
moléculas intracelulares y estudiar, además de su rectamente la movilidad de esa molécula. Nótese
161
Métodos en biociencias
que lo que se tiene es una pequeña porción de la polaridad, índice de refracción del medio, tempe-
molécula escogida marcada solo con un �luorocro- ratura… por lo que su análisis puede proporcionar
mo, y el resto con dos; lo cual permite diferenciar el información sobre las condiciones ambientales que
movimiento de la molécula que solo tiene activo un rodean a la molécula marcada. Este tipo de método
�luorocromo. necesita un microscopio de diseño especial capaz
La técnica FRET (Förster resonance energy de analizar los tiempos de vida media.
transfer) se basa en la transmisión de energía de
forma no radiactiva desde un �luorocromo excitado,
el donante, a otro no excitado, el aceptor. Pero para
5.7.7. Radioinmunoanálisis
que esta transferencia de energía ocurra se ha cum- El radioinmunoanálisis (RIA), por el hecho de em-
plir un requisito posicional: donante y aceptor han plear marcaje radiactivo, se estudia en el capítulo
de estar situados a menos de 10 nm, y otro energé- 11, dedicado exclusivamente a las técnicas que uti-
tico: la pareja de �luorocromos ha de ser compatible lizan radioisótopos como trazadores.
en el sentido de que la longitud de onda de emisión
del donante sea capaz de excitar al aceptor. Si no
hay FRET se visualiza la señal emitida por el donan-
te, si hay FRET se visualiza la emitida por el aceptor
(Figura 5.21).
La técnica FRET se ha utilizado con muy di-
versos propósitos, quizás los tres más usuales se
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longitud onda de excitación y de emisión es el otro 1859962084.
parámetro que permite caracterizar a un �luorocro- The Immunoassay Handbook. Theory and Applications of
mo. Estos tiempos de vida pueden ser modi�icados Ligand Binding, ELISA and Related Techniques. 2013.
por diferentes factores medioambientales como pH, Wild D (ed). Elsevier Science. ISBN 978-0080970370.
162
6.
Citometría de flujo
Julia Carracedo
José Antonio López García
Rafael Ramírez
La citometría de �lujo es una tecnología que permi- cas proporcionales y las digitalizará para su análisis
te determinar de forma cuantitativa y cualitativa computacional (Figura 6.1). Estos sistemas se van a
las características �ísicas de múltiples partículas revisar brevemente:
(normalmente elementos celulares o moléculas)
suspendidas en un �luido. Entre las característi- a) Sistema de �luidos. Transporta las
cas que se pueden determinar de forma simultánea diferentes partículas hasta la zona óp-
se incluyen el tamaño de las diferentes partículas, tica. Estos elementos de �luido están
la granulación o complejidad interna y, utilizando integrados por unas bombas que mueven
marcadores �luorescentes especí�icos, la intensidad la suspensión y unos tubos de conducción
que permiten que las partículas atravie-
de marcaje. Estas características son cuanti�icadas
sen los elementos ópticos alineadas de
utilizando una combinación de elementos ópticos
una en una, de forma que el haz láser in-
y electrónicos que analiza cómo cada partícula en
cide en una única partícula, por lo que el
suspensión capta y/o re�leja un haz de luz láser.
sistema de �luidos debe disgregar las di-
ferentes partículas de la suspensión. En
función de las características de estos sis-
6.1. Principios de la citometría de flujo: temas de �luidos se pueden determinar
sistemas de fluidos, detección partículas que oscilan en un rango de ta-
de la muestra y procesamiento maño aproximado entre 0.2 y 200 μm.
de la señal b) Equipo óptico. Está formado por una
o varias fuentes de emisión láser y un
En todos los citómetros se combinan: a) un siste- conjunto de �iltros ópticos acoplados a
ma de �luidos que introduce y limita el número de espejos detectores. En función de las ca-
partículas a analizar, b) un sistema óptico formado racterísticas de cada emisor láser se
por una o varias fuentes de emisión láser asocia- podrán excitar diferentes �luorocromos,
das a un conjunto de fotodetectores que recogen las capaces de proporcionar haces de luz con
señales luminosas, y c) un equipo electrónico que diferentes características de emisión y, en
convertirá las señales ópticas en señales electróni- consecuencia, se pueden utilizar de forma
Métodos en biociencias
Figura 6.1: El equipo óptico está formado por una o varias fuentes de emisión láser y un conjunto de �iltros ópticos acopla-
dos a los detectores. Las partículas que pasan de una en una por el sistema de �luidos se excitan por el haz de luz, emitiendo
señales ópticas que se trasforman en señales electrónicas. Estas son procesadas y almacenadas en un ordenador.
simultánea en una misma partícula. Junto forma simultánea diferentes �luorocromos en una
a esto, la dispersión del haz láser gene- misma muestra. Los �luorocromos ofrecen un mé-
rada al chocar con la partícula permitirá todo sensible para obtener información acerca de la
cuanti�icar el tamaño de la misma. Por úl- estructura, función y viabilidad celular.
timo, la cantidad de luz absorbida por la
partícula informará de la densidad de la
misma indicando su granulado o comple- 6.2.1. Sondas fluorescentes
jidad.
Habitualmente en citometría de �lujo, los �luoro-
c) Equipo electrónico acoplado al siste- cromos se utilizan unidos o conjugados a sondas,
ma óptico. Convierte las señales ópticas como un anticuerpo, que permiten identi�icar pro-
en señales electrónicas, que son procesa- piedades biológicas y bioquímicas en las diferentes
das y almacenadas en un ordenador. En
partículas.
algunos citómetros, el equipo electróni-
co permitirá separar las partículas. Estos
separadores celulares tienen las mismas 6.2.2. Fluorocromos útiles para citometría
prestaciones y posibilidades que los ci- de flujo
tómetros de �lujo, pero con la capacidad
adicional de separar y recuperar partí- Los �luorocromos con aplicación en citometría
culas selectivamente de la suspensión son muy numerosos, y continuamente se incorpo-
líquida en función de sus características ran nuevas moléculas �luorescentes que permiten
de tamaño y complejidad o marcaje. mejorar la precisión en el marcaje de partículas
y moléculas. Como ocurre para otras técnicas, en
citometría de �lujo inicialmente se utilizaron �luoro-
6.2. Fluorescencia y fluorocromos, cromos simples como el isocianato de �luoresceína
absorbancia y emisión (FITC), que ya era ampliamente conocido y utili-
zado en microscopía óptica de �luorescencia, cuya
Como se ha indicado en capítulos anteriores (ver excitación y subsecuente emisión se determina-
epígrafes 5.3.3 y 7.2.7), las moléculas �luorescen- ba de forma inmediata. Posteriormente se han
tes (�luorocromos) son, esencialmente, elementos incorporado �luorocromos en tándem que son pe-
de marcaje que captan la energía lumínica emitida queñas moléculas �luorescentes acopladas para
en una determinada longitud de onda (por ejem- producir una emisión en cadena. Esto ha permitido
plo la producida por un haz de luz láser) y, como incrementar el uso de los �luorocromos utilizados
respuesta, emiten una nueva descarga de energía y, como consecuencia, la detección simultanea de
lumínica susceptible de ser capturada y analizada varios parámetros en la misma muestra (detección
por fotocaptores especí�icos. Estos dos procesos co- multiparamétrica).
nocidos como excitación y emisión, son especí�icos Los �luorocromos ideales para ser utiliza-
para cada �luorocromo, y esto permite utilizar de dos en citometría de �lujo deben reunir una serie
164
Citometría de flujo
Figura 6.2: Para detectar varias características simultáneas en una misma muestra de ci-
tometría de �lujo se requiere que los �luorocromos utilizados tengan diferente longitud de
onda de emisión. Se pueden combinar FITC, PE, y PerCP para realizar una �luorescencia tri-
ple ya que emiten respectivamente en un espectro de emisión que va desde la zona del verde,
hasta el naranja y el rojo.
165
Métodos en biociencias
con el menor deterioro posible en sus caracterís- las células, y veri�icar que no han queda-
ticas morfológicas y funcionales. Por lo tanto, es do agregados. Por otro lado es necesario
importante considerar dos factores: la naturaleza tener en cuenta las limitaciones de es-
de la muestra y su estado de conservación. tos procedimientos, ya que el uso de los
métodos enzimáticos puede producir al-
a) Células en suspensión. En el caso de
teración de las características celulares
que se utilicen células en suspensión,
o de la expresión de antígenos de mem-
habitualmente es suficiente con mantener
brana y variar su efectividad según el tipo
las células a concentraciones apropiadas
de tejido. Si, por ejemplo, se quiere ana-
(máximo 106 células/mL) en soluciones
lizar un fenotipo de super�icie se deben
isotónicas y veri�icando previamente el
emplear solo métodos mecánicos o ase-
estado de viabilidad de la preparación en
gurarse de que los antígenos celulares no
el microscopio óptico. Simplemente, para
son destruidos por el procedimiento.
obtener esta información cuando se rea-
liza el recuento y ajuste del número de A partir de este punto, las células están prepara-
células puede añadirse una solución de das para su adquisición en el citómetro de �lujo.
un colorante vital como el azul tripán. Una de las ventajas de la citometría de �lujo es que
b) Tejidos o células adherentes. La puede ser utilizada tanto con células recién obteni-
obtención de células en suspensión con- das, «células frescas», como con células �ijadas. En
tinúa siendo el mayor obstáculo, y es la actualidad existen soluciones de �ijación que per-
absolutamente necesaria para estudiar miten mantener las características celulares hasta
sus características por citometría de �lujo un mes después de ser procesadas.
y relacionar o extrapolar los resultados a
fenómenos in vivo. En especial, para dis-
gregar un tejido sólido, se ha de tener 6.3.2. Tinción de la muestra
en cuenta que la mayoría de las células
de los organismos pluricelulares están Las técnicas de preparación de muestras para ci-
en relación con la intrincada trama de tometría de �lujo incluyen marcajes �luorescentes
macromoléculas que forman la matriz ex- directos o indirectos (véase también el epígrafe
tracelular. La suspensión celular obtenida 5.2.2). En efecto, el marcaje indirecto está basado
de la dispersión de un tejido sólido debe en las técnicas de unión antígeno-anticuerpo, exis-
cumplir una serie de requisitos que inclu- ten muchos reactivos (anticuerpos monoclonales
yen la alta calidad y su�iciente número de o policlonales u otras moléculas) que pueden
células, la existencia de pocos agregados y ser utilizados para citometría de �lujo y que pue-
restos celulares, y un bajo coe�iciente de den posteriormente ser determinados utilizando
variación. Las muestras deben además ser un anticuerpo secundario conjugado con distin-
representativas del tejido original, preser- tos �luorocromos. En relación al marcaje directo, se
vando las características del mismo. utilizan anticuerpos o moléculas conjugadas direc-
Aunque no existe una técnica adecuada tamente con �luorocromos. Esta última modalidad
y uniforme para todas las circunstancias, reduce considerablemente el tiempo de procesa-
y en cada muestra la elección de la téc- miento de las muestras.
nica va a depender de las características Se pueden realizar marcajes de estructuras
del tejido en cuestión, suelen utilizarse presentes en la membrana celular, o contenidas en
digestiones enzimáticas (tripsina, protea- el interior de la célula.
sas, colagenasas, hialuronidasas, DNasa
o mezclas de ellas, etc.), dispersiones
mecánicas (raspadores, bisturí, tijeras, 6.3.3. Marcaje de estructuras de membrana
aguja), o reactivos químicos y detergen-
tes (Nonidet P-40, Triton X-100, etc.). Lo El marcaje de estructuras de membrana se realiza
más común es utilizar una combinación utilizando soluciones isotónicas y únicamente hay
de dispersión mecánica y enzimática. que tener la precaución de utilizar soluciones para
En cualquier caso, y al igual que ocu- bloquear los receptores del fragmento constante
rría con las células en suspensión, antes (Fc) de las inmunoglobulinas, ya que habitualmen-
de proseguir con el protocolo, es impor- te se utilizan diferentes anticuerpos y antisueros
tante con�irmar mediante microscopía que pueden presentar una unión inespecí�ica com-
el estado de integridad y viabilidad de plicando e inter�iriendo en la interpretación de los
166
Citometría de flujo
resultados. Los protocolos de marcaje de �luorescen- garantice de forma óptima la calidad de los resul-
cia tienen como objetivo identi�icar subpoblaciones tados obtenidos. Para ello, además de las muestras
celulares, partículas o moléculas, para lo que es ne- «problema» que se tienen que estudiar, se deben
cesario utilizar reactivos especí�icos. introducir valores de referencia que permitan ex-
trapolar los resultados obtenidos; también resulta
necesario introducir controles negativos y positivos.
6.3.4. Marcaje intracelular
Los controles que se introducen para el estu-
Las moléculas intracelulares también pueden ser dio por citometría de �lujo son necesarios porque
reconocidas por anticuerpos monoclonales, pero reproducen resultados esperados (conocidos). Se
como estos no son capaces de atravesar la mem- usan para monitorizar las prestaciones o reproduc-
brana celular, la célula debe ser �ijada y después tibilidad de los reactivos y la calidad de los métodos
permeabilizada para permitir la entrada de los an- de preparación celular.
ticuerpos. Uno de los pasos más delicados es la En el protocolo de marcaje es necesario intro-
elección del �ijador que debe cumplir los siguientes ducir controles negativos para descartar la unión
requisitos: inespecí�ica del �luorocromo y seleccionar el um-
bral de auto�luorescencia. Como se ha comentado,
— Que penetre lo más rápidamente posible producen tinción inespecí�ica los fragmentos Fc
en las células. de las inmunoglobulinas, las células muertas y los
— Que acceda por igual a todos los compar- restos celulares. En ocasiones, cuando se procesan
timentos celulares. muestras que dan problemas para establecer el con-
— Que preserve la estructura celular y la an- trol negativo, es necesario intensi�icar el cuidado
tigenicidad. de las muestras preservando su viabilidad, utilizar
— Que permita la interacción de los anti- fragmentos F(ab´)2 o bien centrifugar el anticuerpo
cuerpos con los antígenos celulares. monoclonal para evitar agregados. Si con estas pre-
— Que no aumente la auto�luorescencia. cauciones no se establece bien el patrón del control
negativo, se pueden eliminar las células muertas
Los �ijadores más utilizados son el formaldehído utilizando un doble marcaje con ioduro de propidio
al 1% y el paraformaldehído al 4%. Una vez �ija- y diacetato de �luoresceína que re�lejan respecti-
da la célula se procede a su permeabilización con vamente muerte o viabilidad celular. Si a pesar de
disolventes o detergentes como lisolecitina (liso- todo se sigue obteniendo una distribución unimo-
fosfatidil colina) que reemplaza los fosfolípidos de dal con considerable superposición entre el control
la bicapa lipídica de la membrana plasmática res-
negativo y el control positivo, se puede asumir que
petando la con�iguración espacial que esta posee.
la tinción es especí�ica pero de baja intensidad.
Posteriormente a la permeabilización de la mem-
Otro control necesario que permite comprobar que
brana plasmática, anticuerpos y moléculas de
la técnica se ha realizado de manera correcta es el
marcaje pueden penetrar en el interior de la célula
control positivo. Si no se introducen controles posi-
uniéndose a las moléculas diana.
tivos en el protocolo, cuando se obtienen resultados
Por otro lado, también hay moléculas �luores-
negativos no esperados en una muestra nunca se
centes que se introducen en las células sin necesidad
sabrá si estos son por una alteración antigénica de
de realizar la permeabilización celular; esto es, pe-
la molécula que se está estudiando o por un fallo en
netran a través de membranas íntegras en ciertas
el marcaje.
condiciones. Esta opción de marcaje puede ser utili-
zada para obtener información relativa al contenido Los valores de referencia negativos y positivos
celular en células viables y con su actividad fun- adecuados permitirán cuanti�icar e interpretar los
cional conservada. Estas moléculas �luorescentes resultados de las muestras objeto de estudio.
resultan muy útiles en estudios de cinética, en los
que se monitorizan parámetros funcionales duran-
te el tiempo de adquisición de la muestra. 6.5. Adquisición de muestras
en el citómetro de flujo
6.4. Preparación del protocolo Una vez preparadas las muestras de manera ade-
para citometría de flujo cuada y con los controles necesarios para realizar
las valoraciones de las muestras, se introducen o
Previamente a la preparación de las muestras para adquieren en el citómetro de �lujo. Para ello, el ci-
su tinción es conveniente realizar un diseño que tómetro debe estar en perfectas condiciones de
167
Métodos en biociencias
limpieza para evitar «arrastrar» residuos de mues- alinear o calibrar las prestaciones del citómetro de
tras anteriormente adquiridas. �lujo. En general, cada citómetro, dependiendo de la
marca, utiliza sus propios patrones de normalidad,
aunque también se pueden establecer estándares
6.5.1. Alineamiento internos. Esta última opción puede ser necesaria
cuando se está desarrollando una aplicación nueva.
En el estudio mediante citometría los resultados
Los sistemas de calibración comercializados para
se ven condicionados por la linealidad y la estabi-
ajustes internos de los diferentes equipos resultan
lidad del haz de luz láser. Un desgaste en el mismo
necesarios para comprobar el buen funcionamiento
o su inestabilidad provocan �luctuaciones en la po-
de los equipos, pero también para introducir múlti-
tencia del haz lumínico y el desalineamiento de los
ples parámetros adicionales como cuanti�icación de
sistemas de lentes. Como consecuencia, la determi-
número de eventos, tamaño, intensidad de �luores-
nación de la intensidad de marcaje puede resultar
errónea, pudiendo verse afectados de forma ines- cencia, etc.
pecí�ica únicamente algunos rangos del espectro de
excitación, lo que di�iculta aún más la identi�icación 6.5.4. Compensación de color
de estos errores. Por tanto, las condiciones del equi-
po deben ser comprobadas ya que pueden sufrir Cuando se utilizan dos o más �luorescencias para
variaciones que pueden interferir en los resultados. la citometría de �lujo, nuestro objetivo es marcar
La utilización de estándares de alineamiento las células con �luorocromos distintos que re�le-
proporciona un buen método para detectar cambios jen las diversas propiedades celulares diferentes
y problemas en la con�iguración óptica y de la señal y detectar la señal proporcional a la primera �luo-
de un día a otro. Dependiendo del citómetro, las va- rescencia (FL1) en un detector y la de la segunda
riaciones diarias pueden ser muy pequeñas pero se (FL2) o progresivas �luorescencias (FL3, FL4…), sin
debe comprobar periódicamente la calidad de to- desviaciones producidas por interferencias de la se-
das las señales. El citómetro de �lujo se considera ñal. Los �luorocromos tienen espectros de emisión
alineado cuando se consigue una elevada �luores- que en ocasiones se superponen y los �iltros no son
cencia o señal con un bajo coe�iciente de variación. perfectos, por ello los citómetros poseen un siste-
ma informático de compensación o sustracción de
señal. Además, existen sistemas de calibración au-
6.5.2. Calibración (ajuste de escalas) tomatizados de las diferentes marcas de equipos de
Como los citómetros de �lujo ofrecen una informa- citometría que son especialmente útiles para �luo-
ción relativa, no absoluta, para poder cuanti�icar rescencias múltiples.
una muestra es necesario correlacionar los canales
de �luorescencia con resultados de muestras cono-
cidas. El método más sencillo consiste en ajustar el 6.6. Análisis de datos en el citómetro
voltaje del fotodetector (produce cambios exponen- de flujo: histogramas y ventanas
ciales o no-lineales de la señal) y/o las ganancias
(crecimiento lineal) para conseguir un pico de una Los citómetros pueden medir con alta sensibilidad
intensidad determinada de un estándar estable la dispersión de luz y la �luorescencia emitida por
cada día. Este ajuste equivale a una escala de inten- las células o partículas presentes en una mezcla he-
sidad relativa constante. También es útil hacer una terogénea. Como se ha comentado anteriormente,
calibración cruzada de escalas logarítmicas y linea- la dinámica de �lujo en el citómetro permite alinear
les. las partículas de forma que el haz de luz láser incida
sobre una única partícula. Antes de describir cómo
detecta y procesa las diferentes señales ópticas ob-
6.5.3. Patrones de normalidad: tenidas a partir de este momento, resulta necesario
uso de estándares comprender que ocurre cuando el haz de luz láser
golpea las partículas.
A la hora de determinar las características de la
muestra adquirida, es útil el uso de valores de re-
ferencia comerciales que permiten relativizar las 6.6.1. Dispersión de la luz
características de la muestra. Un estándar es un ma-
terial estable que tiene unos valores determinados Cuando el haz de luz incide sobre una partícula só-
de �luorescencia o dispersión de luz. Se usan para lida sufre desviaciones en todas las direcciones. La
168
Citometría de flujo
Figura 6.3: Cuando el haz de luz láser incide sobre una partícula sólida se desvía en todas las direcciones.
Esta desviación va a depender del tamaño de la partícula que produce una dispersión delantera (forward
scatter, FSC) y de la complejidad de la partícula cuando el haz de luz láser atraviesa la partícula y produce
dispersión angular (side scatter, SSC).
magnitud con la que esto ocurre depende de las por otro detector especí�ico, normalmen-
propiedades �ísicas de la partícula, principalmente te situado en un ángulo de 90 grados con
de su tamaño y complejidad interna. Por ejemplo, si respecto a la dirección de la luz del láser
se están estudiando células en suspensión, los fac- incidente. Por este motivo, a esta señal se
tores que afectan la dispersión del haz de luz serían le denomina SSC, que puede traducirse
el tamaño celular y el material intracelular (comple- como dispersión lateral. El estudio de la
jidad) (Figura 6.3). dispersión lateral proporciona informa-
ción sobre la complejidad de la partícula,
a) Dispersión delantera (forward scatter,
y es especialmente útil en el análisis de
FSC).
células. El núcleo celular o el contenido
El primer fotodetector suele estar si-
de vesículas y gránulos intracitoplasmá-
tuado prácticamente enfrente del haz
ticos varía en un mismo tipo celular en
emisor, de ahí su denominación FSC. Al
recoger la dispersión frontal, el grado de función de su actividad metabólica, por
dispersión proporcionará una informa- lo que, con el análisis del SSC, se puede
ción relativa del tamaño de la partícula incluso diferenciar células con diferente
que produce la dispersión. Además, al de- actividad dentro de una misma población.
terminar la dispersión frontal, se obtiene El estudio simultáneo de FSC y SSC
información sobre la homogeneidad de resulta útil para hacerse una idea de la
la muestra, ya que, si la muestra contie- variedad de partículas existentes en una
ne una mezcla de elementos con tamaños muestra. Por ejemplo, en el análisis de
diferentes, estos serán detectados con una muestra de sangre periférica el estu-
distinta magnitud de FSC. dio de FSS y SSC va a generar una imagen
b) Dispersión angular (side scatter, SSC). bidimensional de dispersión, que relacio-
Al atravesar el haz láser la partícula, na tamaño (FSC) con complejidad (SSC),
el contenido de la misma hará que los fo- haciendo posible discriminar subpobla-
tones sean dispersados hacia los lados en ciones dentro de una misma muestra que
ángulos muy abiertos. La luz proceden- compartan un tamaño y complejidad con-
te de este tipo de dispersión es recogida cretos.
169
Métodos en biociencias
170
Citometría de flujo
tículas en suspensión se puede seleccionar una metría una técnica prácticamente indispensable en
parte de las mismas para su análisis. Todas las par- cualquier estudio biológico.
tículas en suspensión que entran en la ventana del En biomedicina la citometría de �lujo se ha
haz de luz láser son procesadas en el citómetro de utilizado en diferentes áreas. Por ejemplo, en
�lujo; pero la transformación en señales electróni- Hematología para contaje de células, fórmula leuco-
cas permite realizar un análisis selectivo de aquellas citaria, contaje reticulocitario y análisis de médula
partículas que interesen. Esta selección se hace es- ósea; en Farmacología se puede utilizar en es-
tableciendo ventanas que de�inen características tudios de cinética celular; en Inmunología para
�ísicas (tamaño o complejidad) o de marcaje de una cuanti�icación de subpoblaciones linfocitarias, ti-
parte de la muestra. paje tisular, estimulación linfocitaria; en Oncología
Por ejemplo, en una muestra de sangre que para diagnóstico/pronóstico y monitorización de
contenga una población heterogénea de células tratamientos; en Microbiología en el diagnóstico
–polimorfonucleares, monocitos y linfocitos– es po- bacteriano y vírico, y sensibilidad a antibióticos; en
sible restringir el análisis solamente a los linfocitos. Genética se pueden realizar cariotipados, diagnósti-
Sobre la base de sus características en tamaño (FSC) co de portador o diagnóstico prenatal.
versus la complejidad (SSC) se establece una venta- La citometría de �lujo se puede emplear para
na que englobe esta población celular de forma que, estudiar características estructurales y funcionales
en el análisis posterior, el 100% de la muestra co- de células o partículas en suspensión. Las aplicacio-
rresponderá a los linfocitos, excluyéndose el resto nes fundamentales de esta técnica se dan en biología
de las células sanguíneas (Figura 6.5b) y medicina y son la identi�icación de antígenos celu-
lares mediante técnicas de inmuno�luorescencia y
el estudio del contenido de DNA y fases del ciclo ce-
6.7. Aplicaciones de la citometría de flujo lular (Figura 6.6).
Algunos usos de la citometría de �lujo incluyen
La inmensa capacidad de análisis de la citometría el estudio de:
de �lujo es utilizada en la actualidad para realizar
multitud de pruebas en diferentes especialidades. a) Elementos de membrana celular.
Si a esto se añade el que cada día surgen nuevos Probablemente el uso más extendido en
�luorocromos y moléculas de ayuda diagnóstica la citometría se asocia a su potencial para
y la posibilidad que aporta esta técnica para valo- analizar múltiples proteínas de mem-
rar múltiples parámetros de forma simultánea en brana, lo que ha permitido caracterizar
la misma célula, el resultado �inal hace de la cito- a las células en función de su patrón fe-
171
Métodos en biociencias
Figura 6.6: Entre las aplicaciones más comunes de la citometría de �lujo se encuentra la identi�icación de moléculas de la super�i-
cie celular. También pueden ser determinadas moléculas intracitoplasmáticas y nucleares. Además se pueden cuanti�icar moléculas
en suspensión externas a la célula.
172
Citometría de flujo
Por último, la posibilidad de estu- A continuación se verán con mayor detalle algunas
diar simultáneamente en la misma célula de estas aplicaciones con especial incidencia en el
la expresión de marcadores de super�i- campo de la biomedicina, ya que probablemente
cie y elementos intracelulares también esta sea el área en la que mayor número de estudios
permite realizar análisis que resultarían y aplicaciones se han desarrollado.
complejos con otras técnicas. Imagínese
determinar la producción de citoquinas
en una población heterogénea de lin- 6.8. Ejemplos de aplicaciones
focitos de sangre periférica. Sería muy de la citometría de flujo en biología
di�ícil conocer qué subtipo celular está celular y biomedicina
produciendo la citoquina, si solamente
se cuanti�ica la misma siguiendo los mé-
6.8.1. Determinación de la morfología celular
todos habituales; sin embargo, utilizando
la citometría se pueden fenotipar las di- Ya se ha destacado cómo las señales de dispersión
ferentes subpoblaciones de linfocitos, frontal (FSC) y lateral (SSC) del haz de luz incidente
e identi�icar de esta forma, no solamen-
dependen de la morfología celular. La mayor parte
te qué subpoblación celular esta activada
de las células, incluidas las células hematológicas
y produce citoquinas, sino que se puede
cambian su con�iguración (cambian su tamaño, sus
determinar que citoquina produce cada
características intracitoplasmáticas…) cuando se
elemento celular.
encuentran activadas; como consecuencia, analizar
d) Aislamiento de partículas (sorting). estos cambios permite realizar otros estudios. Un
Algunos equipos de citometría de �lu- ejemplo de ello sería el análisis de la activación de
jo (sorter) permiten la separación de las
las plaquetas pues, como consecuencia de su acti-
partículas adquiridas cuando han pasado
vación, el citoplasma plaquetario se reorganiza y la
por uno o más mecanismos detectores.
célula pierde su forma discoide, para tornarse esfé-
La separación se puede realizar en par-
rica y emitir pseudópodos.
tículas identi�icadas en función de unas
características determinadas mediante
una ventana o región de forma análoga 6.8.2. Determinación de proteínas de superficie
a como se ha descrito en los anteriores
apartados. Este sistema de separación Estos estudios utilizan principalmente anticuerpos
celular tiene menor potencia que las marcados para identi�icar moléculas de super�icie.
técnicas de separación masiva (centrifu- La producción de un número cada vez mayor de an-
gación, etc.), pero permite separaciones ticuerpos monoclonales dirigidos frente a epítopos
que estas técnicas no consiguen. El sor- antigénicos ha potenciado la utilización de la cito-
ter es capaz de separar células con alta metría de �lujo para la identi�icación y clasi�icación
pureza sobre la base de diferentes pará- de células tanto normales como patológicas.
metros lo cual es una ventaja ya que la En la actualidad, el uso combinado de anti-
mayoría de partículas separadas recogi- cuerpos para la caracterización del fenotipo celular
das cumplen los criterios seleccionados. es una herramienta habitual en el estudio de sub-
Los citómetros con sorter se caracteri- poblaciones hematológicas que se aplica en el
zan por su capacidad de recuperación diagnóstico y clasi�icación de las leucemias y lin-
de partículas o células separadas recogi- fomas. Asimismo, el empleo de esta tecnología ha
das en el colector del total de partículas demostrado ser de gran utilidad en otras áreas
activadas por el sorter. Dichas células son
como la detección de oncoproteínas o de receptores
separadas en condiciones que permiten
celulares para factores de crecimiento y hormonas.
su posterior uso en experimentos funcio-
nales.
El procedimiento de sorter resul- 6.8.3. Análisis de ciclo celular y aneuploidías
ta especialmente útil, por ejemplo, para
separar subpoblaciones celulares, para Las dos formas más utilizadas de cuanti�icar pro-
obtener poblaciones que expresan una liferación y ciclo celular se basan en determinar
proteína de interés o para realizar clo- antígenos asociados a la proliferación o �luorocro-
najes celulares; es decir, para seleccionar mos que presentan la capacidad de unirse a ácidos
una única célula. nucleicos en uniones estequiométricas. La prime-
173
Métodos en biociencias
174
Citometría de flujo
175
7.
Microscopía óptica
Guillermo Bodega
El microscopio óptico o fotónico recibe estos nom- nes que sufre la luz al interaccionar con la materia.
bres porque, en el primer caso, emplea lentes de Entre las alteraciones más frecuentes destacan: ab-
vidrio, y la ciencia que estudia el comportamiento sorción, re�lexión-dispersión, desfase, polarización,
de estas lentes es la óptica. El nombre de fotónico refracción y difracción (Figura 7.1).
es debido a que usa luz, y por tanto fotones, en su La absorción suele tener como efecto la trans-
funcionamiento. Básicamente, la función de un mi- formación de la energía absorbida; sin embargo,
croscopio óptico es generar una imagen del objeto desde el punto de vista de la microscopía óptica lo
mayor que el objeto en sí mediante un sistema de que interesa es la absorción selectiva que se produce
lentes ampli�icadoras. De hecho fue la fabricación cuando la materia absorbe alguna de las longitudes
de estas lentes y su ensamblaje lo que permitió la de onda de la luz y re�leja otras dando lugar al colo-
aparición de los primeros microscopios ópticos a reado de los objetos. La re�lexión se produce cuando
�inales del siglo ��� y principios del ����. Nombres la luz rebota al chocar contra un objeto, ya sea por
como Janssen (padre e hijo), Leeuwenhoek o Hooke la naturaleza del objeto y/o por el ángulo con que
están ligados a su construcción y a la aparición de incide; si el re�lejo es difuso o irregular se denomi-
los primeros estudios realizados con ellos. na dispersión. El desfase ocurre cuando la luz que
atraviesa la materia sufre un retraso en la fase de la
longitud de onda con respecto a la luz que no pasa a
7.1. La luz través de la misma. Una luz está polarizada cuando
la componente correspondiente al campo eléctrico
La luz se puede de�inir como la radiación electro- vibra en un único plano (el formado por los vectores
magnética percibida por el ojo humano y es un del campo, E, y el de propagación k), la luz no pola-
fenómeno de naturaleza dual (corpuscular-ondula- rizada, también denominada luz natural, lo hace en
torio) al que se le puede caracterizar por su longitud todos los planos posibles; en algunos casos la ma-
de onda, que oscila entre 380 y 780 nm aproxima- teria, por su ordenación, puede polarizar la luz o
damente. variar su plano de polarización. El cambio en la di-
La base del funcionamiento del microscopio rección que experimenta una onda al pasar de un
óptico es poner de relieve las diferentes alteracio- material a otro con una densidad óptica distinta
Métodos en biociencias
(distintas propiedades eléctricas y magnéticas) se dos grandes grupos; los estereomicroscopios y los
denomina refracción y se debe a la distinta veloci- de objetivo simple o comunes. Los estereomicros-
dad con que viaja la luz en cada medio; el índice de copios, comúnmente mal llamados lupas y a veces
refracción es la relación existente entre la velocidad microscopios de disección, son como un par de mi-
de propagación de la luz en el vacío y la que tiene al croscopios compuestos de bajo aumento montados
atravesar la sustancia que fuere. Huygens estable- en paralelo pues poseen dos objetivos por los que
ció un principio según el cual, cuando la luz choca entra simultáneamente la luz; el hecho de que no
con la materia, los puntos de choque se convierten entre exactamente la misma luz por cada uno de
en fuentes secundarias de ondas, emitiendo nue- ellos permite obtener imágenes estereoscópicas, de
vas ondas, denominadas ondas difractadas. Estas ahí su nombre. Este tipo de microscopio no invierte
nuevas ondas pueden solaparse y/o entrecruzar- la imagen al formarla, sirven para lograr magni-
se entre sí, fenómeno conocido como interferencia; �icaciones de 2x a 50x aumentos y su distancia de
pudiendo superponerse si están en fase (coheren- trabajo (la distancia existente entre la primera lente
tes) o anularse total o parcialmente si no están en del objetivo y la muestra) es grande por lo que son
fase (no coherentes). muy útiles para observar y/o manipular muestras
La mayoría de los microscopios ópticos uti- de gran tamaño; por ejemplo, realización de disec-
lizan luz visible; sin embargo, es cada vez más ciones (Figura 7.2). En los microscopios de objetivo
habitual el empleo de luz ultravioleta y en las úl- simple o comunes, la luz solo entra por un único ob-
timas décadas de luz infrarroja y luz láser (light jetivo, forman la imagen invertida, se utilizan para
ampli�ication by stimulated emission of radiation). magni�icaciones que oscilan entre 50x y 1000x
La luz láser es monocromática (una sola longitud de aumentos y la distancia de trabajo es pequeña. Mi-
onda) y coherente (toda en la misma fase), lo que croscopios de objetivo simple serán todos los tipos
evita dispersiones y permite producir rayos lumi- que se verán a continuación.
nosos de gran precisión.
7.2.1. Microscopio de campo claro
7.2. Tipos de microscopios ópticos Es el microscopio de uso más convencional y se basa
en el aprovechamiento de fenómenos de absorción
Desde el punto de vista de la óptica existen dos (cuali- o cuantitativa) para dotar de visibilidad al
tipos básicos de microscopios: simples y compues- objeto; por ello es muy válido para especímenes
tos. Los simples poseen solo una lente entre objeto que poseen alto contraste o para aquellos a los que
y ojo y no son otra cosa que las denominadas lu- se puede contrastar; por ejemplo, secciones histo-
pas. Los compuestos poseen como mínimo dos lógicas teñidas. El fondo de la imagen o campo se
lentes, objetivo y ocular, y se pueden subdividir en ve iluminado (de ahí su nombre), y la imagen del
178
Microscopía óptica
Figura 7.2: Estereomicroscopio Nikon SMZ645; en el recuadro delimitado por la línea discontinua se aprecian los dos objetivos (izquier-
da). Microscopio óptico Nikon Labophot (derecha).
espécimen aparece contrastada contra dicho fondo puede ser giratoria. El revólver cuelga del brazo y es
luminoso pues al pasar la luz por el campo óptico se una estructura circular sobre la que se atornillan los
generan dos tipos de rayos luminosos, los rayos mo- diferentes objetivos. El tubo óptico es el cilindro en
di�icados por el espécimen y los que no pasan por el que se acoplan por un extremo el objetivo y por
él y no se modi�ican. Los primeros compondrán la el otro extremo el ocular. En los microscopios muy
imagen del objeto y serán enfocados en el ojo del antiguos era un cilindro recto con una determinada
observador, los últimos formarán el fondo de luz del longitud, normalmente 160 mm (también 170 mm);
campo (Figura 7.3).
Son los microscopios más utilizados y han ser-
vido de base para el diseño de la mayoría de los
tipos de microscopios que han ido apareciendo des-
pués; por ello se hará una descripción detallada de
sus partes y se analizará el concepto de resolución.
Partes de un microscopio
Los elementos que componen un microscopio pue-
den agruparse en dos bloques: mecánicos, o de
soporte, y ópticos. Elementos mecánicos son: base,
brazo, sistema de enfoque, platina, revólver y tubo
óptico. Elementos ópticos son: fuente de ilumina-
ción, �iltros, diafragmas de campo y condensador,
condensador, objetivo, prisma y oculares. La base y
el brazo del microscopio son las estructuras sobre
las que se apoyan el resto de elementos. El siste-
ma de enfoque suele ubicarse en la parte baja del
brazo y lo suelen formar un tornillo de enfoque ma-
crométrico y otro micrométrico para conseguir un
enfoque más �ino. La platina es la pieza donde se
apoyarán las muestras y puede variar en forma (rec-
tangular o circular) y tamaño; en los microscopios Figura 7.3: Esquema de la formación
más so�isticados, además de los clásicos despla- de imagen en un microscopio de cam-
zamientos (derecha-izquierda, delante-detrás) po claro.
179
Métodos en biociencias
Figura 7.5. Diferentes tipos de bombillas usadas en los microscopios ópticos: de tungsteno (A), halógena (B), de
vapor de mercurio (C) y LED (D).
180
Microscopía óptica
Figura 7.6: Esquema del efecto del condensador sobre un haz de luz (línea discontinua) (izquierda).
Esquema de un condensador acromático. Tomado y modi�icado de la página web de Olympus (www.
olympusmicro.com) (derecha).
rriente, pudiendo ir desde el UV hasta el infrarrojo. que va a incidir sobre el condensador pues permite
Sus ventajas son múltiples pero destaca su dura- hacerlo de mayor o menor diámetro.
ción (hasta 100.000 horas), la no emisión de calor, El condensador. Este dispositivo va ubica-
el bajo voltaje al que trabajan y su bajo consumo: do debajo de la platina y su función es concentrar
más resistentes, más duraderos, más económicos (condensar) los rayos de luz que suben desde la
y más seguros. El hecho de emitir luz monocromá- fuente luminosa para formar un pequeño cono de
tica los hace especialmente útiles en �luorescencia. luz de mayor intensidad que ilumina una zona más
o menos reducida del espécimen convenientemente
En los microscopios de hace algunos años era muy
preparado. Es una lente convexa por abajo y plana
frecuente que asociados o próximos a la fuente de en la zona que da a la platina (Figura 7.6).
iluminación se localizaran diversos �iltros. Los más El área de iluminación del espécimen se
usuales solían ser los de color verde, para potenciar controla mediante el diafragma de campo (visto an-
el contraste de la fotogra�ía en blanco y negro; el de teriormente) y el diafragma de condensador, que va
color azul, para elevar la temperatura de color a la situado inmediatamente delante y debajo del con-
de luz de día; y los de grises neutros, para bajar la in- densador; ambos diafragmas generan un cilindro
tensidad de luz por igual a todos los colores, efecto luminoso cuyo diámetro debe ser lo más parecido
de gran utilidad si en la imagen hay contrastes de in- al área que se desea estudiar. El condensador ha de
tensidad de luz demasiado fuertes. La captación de estar ubicado a una distancia correcta de la mues-
imágenes en formato digital y su fácil tratamiento, tra, el procedimiento que permite situarlo en esta
posición es el método de Koehler (Köhler) cuyo �in
así como la incorporación de sistemas automáticos
es enfocar la zona de máxima luminosidad del haz
de corrección para el ajuste del blanco en las cáma-
de luz en el objeto y que el diámetro de este haz sea
ras digitales ha hecho desparecer la utilidad de los lo más parecido posible al área de captura del ob-
�iltros correctores, por lo que no se suelen montar jetivo. Es obvio que la iluminación de puntos cuya
en los microscopios actuales. Asociado a la fuente de observación no interesa puede hacer perder nitidez
iluminación se dispone un diafragma llamado dia- a la imagen por la existencia de fenómenos de dis-
fragma de campo, que sirve para ajustar el haz de luz persión y difracción.
Figura 7.7: Esquema que ilustra el efecto que causan las lentes sobre las diferentes longitudes de onda de la luz: aberración cromática (iz-
quierda). Efecto de la corrección acromática (centro) y esquema que explica el mecanismo de corrección (derecha).
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Métodos en biociencias
Figura 7.9: Izquierda. Especi�icaciones incluidas en el cuerpo del objetivo; tomado y modi�icado de la página
web www.microscopyu.com. Derecha. La columna de tres barras incluye los códigos de color de las letras de las
especi�icaciones en función de la óptica. DIC, óptica Nomarski; Ph, contraste de fases. La columna de 4 barras in-
cluye los códigos de color del medio de inmersión. Las columnas de cinco barras representan los códigos de color
de los aumentos. Disponible en color.
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Microscopía óptica
Resolución
La resolución puede ser de�inida como la capacidad
para, al aumentar una imagen, ver puntos vecinos
como entidades diferentes. La incidencia de la luz
sobre un objeto altera las relaciones de fase de las
ondas luminosas que llegan a él y produce comple-
jos efectos de interferencia y difracción, de modo Figura 7.11: El uso de aceite de inmersión de-
termina que la apertura numérica sea mayor
que dos objetos puntuales próximos ofrecen imá- puesto que θ2 es mayor que θ1; y una mayor aper-
genes superpuestas (Figura 7.10), y por perfectas tura conlleva un menor valor de “r” y un mayor
que sean las lentes algo de este efecto siempre se poder de resolución.
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Métodos en biociencias
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Microscopía óptica
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Métodos en biociencias
Figura 7.15: Imágenes de un cultivo de células HeLa tomadas con un microscopio de contraste de fase negativo
donde se aprecia el halo de fase (izquierda), y con un microscopio de contraste por interferencia diferencial (de-
recha). Tomadas de la página web www.microscopyu.com.
Figura 7.16: Imagen de un microscopio invertido con contraste de fase (izquierda), en la esquina superior de-
recha se incluye la imagen del soporte de los anillos del condensador. Esquema de su sistema de formación de
imagen (derecha) Tomado y modi�icado de www.microscopyu.com.
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Métodos en biociencias
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Microscopía óptica
Figura 7.25: Desarrollo de un proceso de ablación fotónica (A) en un microdisector láser PALM acoplado a un mi-
croscopio invertido Olympus IX71 (Servicio de Microscopía Electrónica de la Universidad de Alcalá). La sección
corresponde a la zona más profunda de las criptas de Lieberkhün de un intestino de rata. La imagen A1 representa la
sección intacta, en la imagen A2 se observa el corte del láser y la imagen A3 muestra la sección una vez catapultado el
fragmento escogido. La imagen B es un dibujo de un proceso de catapultado del fragmento diseccionado hacia la tapa
de un tubo eppendorf. La imagen C representa un proceso de microdisección por fusión.
193
Métodos en biociencias
ratos requeridos en las distintas fases del proceder el valor de K para cada �ijador. Normalmente los va-
de cada apartado en cuestión. lores suelen oscilar entre 0.4 y 1.5 mm/h, la Vp del
formol es 1 mm/h.
La Vp es un fenómeno �ísico pero la velocidad
7.3.1. Fijación
de �ijación (Vf) lo es químico, e indica el tiempo
La �ijación es un proceso �ísico-químico que de- necesario para que las moléculas del �ijador interac-
termina la muerte de las células o del ser vivo por cionen con las de la muestra. En realidad informa
insolubilización de determinados componentes, y acerca de la velocidad con la que el �ijador estable-
cuyo objetivo es que la estructura y/o composición ce su interacción molecular con los componentes de
molecular de lo �ijado se mantenga prácticamente la muestra. Ambas, Vp y Vf, son determinantes para
igual a la que presentaba en vivo. De ello surgen los escoger el tamaño de la muestra a �ijar y el tiem-
conceptos de imagen histológica real (la que tiene el po que la �ijación ha de durar. Por ejemplo: el O4Os
tejido cuando está vivo) y equivalente (la obtenida tiene una Vp muy lenta y una Vf muy rápida, esto im-
tras la manipulación histológica). Además, el pro- plica piezas pequeñas y poco tiempo en �ijador; un
ceso de �ijación suele conllevar: a) la protección de ejemplo casi opuesto es el formol, lo que permite
la estructura del ataque de microorganismos, pues la posibilidad de �ijar piezas de cierto tamaño pero
ellos también resultan �ijados; b) la inhibición de la la necesidad de emplear tiempos de �ijación largos.
autolisis; y c) la preparación de las estructuras para
posteriores tratamientos. Coeficiente de endurecimiento
El proceso de �ijación puede ser muy variado
(tiempo, producto...) y depende de la naturaleza del Todos los �ijadores endurecen, lo cual puede di�i-
material a estudiar y del objetivo del estudio; por cultar la posterior obtención de cortes, pues los
ello no existe un método universal de �ijación y, en materiales muy duros se astillan al cortarlos. Existe
cada caso, será necesario poner a punto el método para cada �ijador un coe�iciente de endurecimiento
de �ijación adecuado. o de elasticidad; el etanol de 100º posee el coe-
En función del tipo de estudio a realizar so- �iciente con valor más alto. En general, aquellos
bre el material biológico hay dos grandes tipos de �ijadores que provocan una alta deshidratación ge-
�ijación: a) la �ijación histológica o citológica, que neran un mayor endurecimiento.
intenta preservar la estructura o arquitectura de
tejidos o células y se dedica sobre todo a estudios Variaciones de volumen y presión osmótica
de tipo morfológico o estructural; y b) la �ijación
histoquímica, que preserva la composición mole- Las variaciones de volumen que puedan derivar de
cular y/o funcionalidad del material para poder un proceso de �ijación pueden ser muy graves, es-
llevar a cabo estudios de carácter más �isiológico pecialmente desde el punto de vista estructural,
como son los que en su desarrollo emplean técnicas pues provocan retracciones o hinchamientos que
histoquímicas, histoenzimológicas, inmunohisto- modi�ican la estructura del tejido y, como muchas
químicas, histoautorradiográ�icas... Se estudiarán, a modi�icaciones no son homogéneas, el efecto es aún
continuación, algunos parámetros y características de mayor gravedad. En general es importante que
de interés en el proceso de �ijación. la Posm del �ijador sea igual a la de las células o a la
de la sangre del animal cuya muestra se quiere �ijar.
Velocidad de penetración y velocidad de fijación En mamíferos oscila entre 340 y 360 mOsm, equiva-
lente a la de una disolución al 9%o de NaCl (solución
La velocidad de penetración (Vp) del �ijador es un isotónica o isoosmótica). Para que la Posm del �ijador
parámetro regido por leyes �ísicas y su conoci- sea isoosmótica se suelen añadir al �ijador sales que
miento es útil para determinar la dimensión de la no afectan al proceso de �ijación, por ejemplo, NaCl,
muestra a �ijar y el tiempo idóneo que dicha mues- CaCl2. Existen fórmulas de cálculo de la Posm para di-
tra ha de estar �ijándose. De acuerdo con las leyes ferentes concentraciones de los �ijadores de mayor
de difusión, la Vp disminuye progresivamente a par- uso en distintos tampones. La existencia de halos de
tir del momento en que la pieza se sumerge en el retracción rodeando a las células o la vacuolización
�ijador; no obstante, el tiempo de �ijación se puede intracelular puede, a veces, ser debida al empleo de
calcular con una sencilla expresión: e=K x t, donde �ijadores con su Posm desajustada. El hinchamiento o
“e” es la penetración en mm; “K”, el coe�iciente de rotura de algunas células o estructuras suele estar
penetración en mm/h y “t” es el tiempo de �ijación causado por �ijadores hipoosmóticos, y la retrac-
expresado en horas. Existen tablas donde averiguar ción por �ijadores hiperosmóticos.
194
Microscopía óptica
Temperatura, pH y concentración del fijador cido pero sí se sabe como actúan algunos de ellos; por
ejemplo, el glutaraldehído produce puentes transver-
Lo más usual suele ser �ijar a temperatura ambien- sales que insolubilizan (precipitan) las proteínas, el
te aunque en algunos casos la �ijación se hace a 4 ºC formaldehído hace lo mismo pero los puentes que
con el �in de frenar procesos de tipo autolítico, pero establece son más débiles, el O4Os estabiliza los fos-
esto determina una disminución de la Vf. El pH del folípidos de membranas, y el alcohol o la acetona
�ijador no siempre se ajusta y de hecho existen nu- desnaturalizan proteínas. En general, en todos los
merosos �ijadores cuyo pH no es neutro ni próximo procesos de �ijación química es muy importante un
a la neutralidad; no obstante, si se puede, lo ideal intenso lavado tras la �ijación con el �in de parar el
es que el pH del �ijador sea lo más parecido posi- proceso de �ijación y eliminar restos del �ijador que
ble al pH �isiológico o cuando menos tamponarlo pudiesen tener efectos negativos sobre el procesado
para que alcance valores comprendidos entre 6 y posterior de las muestras.
8. Fosfato, bicarbonato, cacodilato o veronal son los La �ijación �ísica se hace fundamentalmente
tampones de más uso. La concentración del �ijador por congelación y se puede realizar mediante tres
normalmente es baja y, excepto para el etanol que variantes: crio�ijación, criodesecación y criosusti-
se suele usar al 70%, lo usual es que oscile entre el tución. La crio�ijación, o congelación instantánea,
0.1 y el 5%. Este no es un parámetro menor pues, consiste en bajar la temperatura hasta inhibir to-
en algunos casos, el uso de soluciones muy concen- talmente cualquier tipo de actividad biológica en
tradas puede acabar inutilizando la muestra para el tejido. La formación de un hielo amorfo, es de-
determinadas técnicas de estudio. cir, sin cristales, es muy di�ícil por rápida que sea
la �ijación. Esto es debido a que, como se congelan
Efecto de mordiente primero las partes más super�iciales, queda un nú-
cleo central donde el proceso de congelación es más
Se dice que un �ijador tiene efecto de mordiente lento y que puede permitir la formación de cristales
cuando alguno de los componentes del �ijador pro- que pueden dañar el material biológico. Por ello se
voca un efecto sobre el material �ijado que tiene suele utilizar la inmersión en isopentano (-50 ºC) de
como �in facilitar el proceso tintorial subsiguiente. piezas no muy grandes cuyo tiempo de congelación
En de�initiva, el �ijador va a tener sobre el material no exceda de 10 segundos. La inmersión en nitróge-
�ijado un efecto preparatorio que ayuda o es esen- no líquido no es tan aconsejable pues torna la pieza
cial en el proceso de tinción. muy quebradiza. La criodesecación o lio�ilización
consiste en �ijar instantáneamente en nitrógeno lí-
Tipos de fijación quido seguido de un proceso de desecación por
sublimación en una bomba de vacío. Este método
Los agentes �ijadores se clasi�ican en: �ijadores quí- suele aplicarse en el estudio de sustancias que pue-
micos y �ijadores �ísicos. La elección de uno u otro den difundir por los tejidos o que son fácilmente
tipo depende del estudio concreto y es importante metabolizables. La criosustitución consiste en sus-
considerar que la �ijación química, dada la interac- tituir lenta y progresivamente el agua congelada de
ción molecular del �ijador con la muestra, puede un tejido por �ijador. Para ello, una vez congelado el
provocar importantes modi�icaciones que, a su vez, material se pone en el líquido de sustitución, nor-
pueden invalidar el material para ciertos estudios; malmente una mezcla de alcohol etílico-acetona y
por ejemplo, algunos �ijadores puede llegar a en- propilénglicol enfriada a –40 ºC, temperatura a la
mascarar determinantes antigénicos provocando la que el líquido de sustitución no se solidi�ica.
imposibilidad de llevar a cabo estudios de tipo in- Desde 1970 también se ha empleado el calor
munohistoquímico sobre estas muestras. En el caso como método de �ijación y ha sido el microondas
de la �ijación química se pueden utilizar desde �ija- la fuente de calor empleada. En este caso lo que se
dores simples, normalmente disoluciones acuosas provoca es la desnaturalización de proteínas y, en
débiles de un producto químico como por ejemplo menor grado, el establecimiento de puentes entre
formaldehído, alcohol etílico, ácido acético, ácido ellas. Las temperaturas óptimas suelen rondar los
pícrico, ácido crómico, bicromato potásico, cloruro 50 ºC y en muchos casos suele ser útil un proceso
mercúrico... a mezclas �ijadoras más o menos com- de post�ijación química. Otra posibilidad es calentar
plejas que suelen llevar el nombre de quien las el �ijador químico mediante irradiación por microon-
diseñó, como es el caso de los �ijadores de Bouin, das para acelerar la �ijación química de modo que
Zenker, Altmann, Helly, Carnoy... El efecto molecular procesos de �ijación que duran horas pueden verse
de la �ijación química no siempre es totalmente cono- acortados a minutos. El empleo del microondas como
195
Métodos en biociencias
La fijación en la práctica
En general se pueden considerar dos tipos básicos
de �ijación: in toto o in vivo, en que la pieza o el espé-
cimen se sumergen directamente en el �ijador, y la
perfusión, que consiste en ir sustituyendo la sangre
del animal por el líquido �ijador. En el proceso de �i-
jación in toto solo es necesario tener dos aspectos
en cuenta: que el volumen de �ijador sea su�icien-
te para el tamaño de la pieza (1/10, volumen de la
muestra/volumen del �ijador, suele ser una buena
relación) y que, cuando menos al principio, el pro-
ceso se haga con agitación para evitar que alguna
de las caras de la muestra se pegue a las paredes Figura 7.26: Esquema de una perfusión transcardial.
del recipiente y en esa zona se produzca una �ijación Para facilitar el dibujo no se ha incluido la circulación
pulmonar y las venas cavas se han representado como
distinta al resto de la pieza. una única estructura.
El procedimiento más habitual de �ijación por
perfusión consiste en canular la aorta a través del
ventrículo izquierdo y mediante una bomba peris-
táltica introducir el �ijador (Figura 7.26). Una vez trada al órgano y romper la vena de salida. A veces,
iniciada la perfusión ha de romperse rápidamente es recomendable iniciar el proceso perfundiendo
la aurícula derecha para no provocar un gran au- con algún tampón lavador isotónico a pH �isiológi-
mento de presión sanguínea y permitir la salida de co antes de iniciar la perfusión con el �ijador. Una
la sangre. Es importante tener en cuenta que me- vez terminada la perfusión, el proceso de �ijación se
diante este sistema no se perfunde el pulmón; para continúa mediante una post�ijación por inmersión
perfundir este órgano hay que canular la arteria en el mismo �ijador.
pulmonar a través del ventrículo derecho y romper
la aurícula izquierda. El �ijador se ha de introducir 7.3.2. Inclusión
a la misma temperatura que el cuerpo del animal,
para evitar vasoconstricción, y se suele añadir he- Una vez �ijada la muestra biológica y eliminados los
parina para evitar trombos. Puesto que para ligar restos del �ijador mediante un lavado, se lleva a cabo
aorta hay que romper el diafragma, a veces se suele la inclusión. El objetivo principal del procedimiento
emplear respiración asistida mediante una bomba de inclusión es dotar a la muestra o espécimen de un
y traqueotomía. La velocidad de la bomba de per- soporte de su�iciente dureza para ser cortado; ade-
fusión es importante y hay que ajustarla en función más, al quedar la muestra formando parte de una
de la especie y del tamaño del animal, de modo que estructura rígida e inalterable también permite su
reproduzca lo mejor posible el �lujo cardiaco del conservación y almacenamiento. La estructura que
animal. Existe una variante para evitar la rotura del se obtiene al �inal del proceso de inclusión se deno-
diafragma y el colapso respiratorio que conlleva, y mina bloque y es en su interior donde se localiza la
es realizar la perfusión a través de la aorta ventral. muestra biológica. La inclusión debe de hacerse lo
El tiempo de perfusión oscila entre los 10-20 min más rápidamente posible después de la �ijación; si
y a veces se puede añadir un colorante para tener no fuese así, durante un tiempo corto las muestras
la certeza de que el �ijador ha alcanzado el órgano se pueden conservar en la solución de lavado a 4 ºC;
de interés. Una vez �ijado, el animal queda abso- para tiempos largos suele ser necesario el empleo
lutamente rígido. En muchos casos puede ser de de líquidos de conservación entre los que destacan
utilidad perfundir exclusivamente algunos órganos, el formol diluido, el butanol o la esencia de cedro.
por ejemplo: hígado, testículo, riñón... o embriones. El medio en el que las piezas �ijadas se van a
En este caso es necesario canular la arteria de en- incluir debe de ser lo más neutro posible, pues la
196
Microscopía óptica
Figura 7.27: (A) Procesador de tejidos Leica TP1020. (B) Estación de confección de bloques de para�ina Lei-
ca EG1150.
inclusión no se hace para rodear por fuera la pieza temperaturas altas pueden afectar a las propiedades
sino que la sustancia de inclusión ha de alcanzar el antigénicas de la muestra. Una vez in�iltrada la para-
interior de la muestra y, en consecuencia, llegar has- �ina se procede a la confección del bloque, para ello
ta el interior celular. Cuando el material de inclusión se emplean unas piezas metálicas (piezas Leukart)
queda por fuera de la muestra al procedimiento se o unos recipientes de plástico donde se introdu-
le denomina enclaustrar. El material de inclusión ce para�ina líquida, se coloca la muestra dándole la
suele ser insoluble en agua pues son ceras, resinas, orientación que se desee y se deja enfriar hasta la
plásticos o mezclas de estos componentes los com- solidi�icación del conjunto. En los centros donde es
puestos que se suelen emplear en la inclusión. Entre necesario procesar muchas muestras todo este pro-
todos ellos, la inclusión en para�ina o en una mezcla cedimiento puede automatizarse en lo que se conoce
de para�ina y plástico (paraplast) es el procedimien- como estaciones de procesado de tejidos e inclusión
to más usual. Al no ser estos productos miscibles en (Figura 7.27).
agua es necesario deshidratar la muestra biológi- En los procedimientos de enclaustrado, cuan-
ca. El proceso de deshidratación se suele hacer en do el material de inclusión no penetra en el interior
series crecientes de etanol hasta llegar al etanol ab- de la muestra sino que lo rodea por fuera, la obten-
soluto. El etanol tampoco es miscible con la para�ina ción de secciones ha de ser inmediata; y el material
enclaustrado no se puede almacenar pues al estar en
por lo que después de la deshidratación es necesa-
un medio normalmente acuoso es susceptible de de-
rio emplear un líquido intermedio que debe ser
gradarse y/o desecarse y terminar estropeándose.
miscible con el agente deshidratante (etanol) y con
Además de la inclusión en para�ina o para-
el producto de inclusión (para�ina). Benceno, toluol
plast, existen otros medios de inclusión no tan
y xilol son los líquidos intermedios más comunes y
habituales como son la celoidina y la gelatina. La
su uso debe hacerse con precaución pues suelen de-
celoidina es una mezcla de trío o tetranitratos de ce-
terminar un fuerte endurecimiento de la muestra.
lulosa soluble en alcohol-éter, solución que recibe el
Tras el paso por el líquido intermedio y con el �in nombre de colodión. Se recomienda para piezas de
de facilitar la penetración de la para�ina, la mues- gran tamaño, o muy duras o cuando se desean obte-
tra se introduce en soluciones con valor creciente ner cortes más gruesos. El proceso de inclusión se
de para�ina en líquido intermedio hasta �inalmen- hace por evaporación del alcohol-éter. La inclusión
te alcanzar el baño de para�ina pura. Estos baños en en gelatina solo se hace como método previo y en
para�ina se hacen en caliente, a la temperatura en situaciones muy especiales; por ejemplo, antes de
que la para�ina se encuentra en estado líquido. El incluir en para�ina con el �in de agrupar piezas muy
valor de la temperatura en cuestión dependerá del pequeñas. El procedimiento de inclusión es pareci-
punto de fusión de la para�ina, que suele ir desde do al anterior pues consiste en dejar deshidratar la
40 hasta 60 ºC. La elección de la para�ina en función gelatina hasta que solidi�ica. Puesto que la gelatina
de su punto de fusión es importante para trata- es hidrosoluble este método es de interés en el caso
mientos posteriores. Por ejemplo, las para�inas con de que los compuestos a estudiar puedan resultar
mayor punto de fusión suelen ser más duras cuan- afectados por alcoholes.
do solidi�ican y ello puede tener efecto en el proceso La inclusión por congelación necesita una con-
de obtención de cortes; además, baños de para�ina a sideración especial. Si nuestro procedimiento de
197
Métodos en biociencias
7.3.3. Corte
Los cortes son secciones delgadas de la muestra que
se suelen colocar y pegar en un soporte transparen-
te, habitualmente, una lámina de vidrio o porta (su
tamaño suele ser de 7.6 x 2.5 cm y su espesor de
1 a 1.2 mm). El objetivo es obtener una sección lo
Figura 7.28: Microtomo Leitz 1512. La imagen inferior es
su�icientemente delgada para que la luz pueda atra- un detalle de la zona del portamuestras y de la cuchilla.
vesarla. Es cierto que la obtención de cortes es el
método más empleado en histología; sin embargo,
para determinados tejidos son otras las maneras de
preparar la muestra para poder visualizarla. Una de más usado y especialmente idóneo para
ellas es la extensión o frotis, que consiste (valga la obtener secciones de muestras inclui-
redundancia) en extender la muestra biológica, que das en para�ina, permite obtener cortes
suele ser un líquido; por ejemplo, la sangre. La otra a partir de 4 μm de espesor. Se llama de
es la aposición o impronta (huella), que consiste en rotación porque el sistema de avance
pegar un porta limpio sobre el órgano o la muestra va asociado a un volante que gira (rota)
biológica fresca; al retirar el porta algunas células ya sea de forma manual o motorizada.
quedan adheridas a él y son arrastradas. Este mé- Cada vuelta del volante provoca un avan-
todo puede ser útil para estructuras blandas donde ce del bloque hacia la cuchilla, que está
las células no están muy ancladas al medio que las �ija. El portabloques no es otra cosa que
circunda; por ejemplo, el bazo o la médula ósea. Una una mordaza que sirve para sujetar �ir-
vez hecha la extensión u obtenida la impronta pue- memente el bloque, y se puede mover
de dejarse secar y después �ijar o �ijar directamente, en las tres direcciones del espacio con
sin secado. el �in de orientar la pieza. El portacuchi-
Los cortes se obtienen en unos aparatos espe- llas, por su parte, permite modi�icar el
ciales denominados microtomos, que tienen tres ángulo de corte de la cuchilla en relación
componentes fundamentales: el portabloques, el con la super�icie de corte. Elegir el ángu-
sistema de avance y la cuchilla con su soporte. En el lo correcto es de suma importancia en la
campo de la microscopía óptica es frecuente el uso obtención de cortes, pues ángulos no idó-
de los tipos de microtomos que se describen a con- neos pueden dar lugar al aplastamiento
tinuación. de la sección. El a�ilado de la cuchilla es
primordial para la obtención de buenos
— Microtomo de rotación, también llamado cortes; actualmente se emplean cuchillas
microtomo de Minot (Figura 7.28). Es el desechables pero hace algunos años se
198
Microscopía óptica
Figura 7.30: Izquierda: imagen de la zona superior de un microtomo Microm HM505E; la zona 1 del panel de control
sirve para ajustar las características del corte, y la zona 2 para ajustar la temperatura de la cámara de congelación
y la hora de eliminación de escarcha . Derecha: detalle de la cámara de congelación; el �iltro sirve para retener mate-
rial que pudiese resultar peligroso.
199
Métodos en biociencias
Figura 7.32: De izquierda a derecha; microtomo de serrado Leica SP1600, microtomo de desgaste Leica SP2600 y es-
quema que muestra el mecanismo de obtención de secciones en un microtomo de serrado.
200
Microscopía óptica
201
Métodos en biociencias
Figura 7.34: (A) Impregnación de una neurona bipolar de corteza cerebral de rata con nitrato de plata. La sal de pla-
ta forma una capa que recubre a la neurona por fuera. (B) Impregnación de células astrogliales de corteza cerebral
de rata con cloruro de oro. En este caso la sal de oro se deposita sobre los glio�ilamentos de las células astrogliales.
pos, suelen ser catiónicos por lo que presentan una Un método de contrastado diferente al colo-
gran avidez por estructuras ácidas, sobre todo gru- reado es la impregnación metálica, producida por la
pos sulfatos; de ahí su gran utilidad para colorear precipitación de sales metálicas por fuera o dentro
la matriz extracelular del tejido conjuntivo y deriva- de la célula. Este tipo de contrastado es especial-
dos, pues los proteoglucanos que forman parte de la mente útil en estudios de tejido nervioso y para
matriz poseen numerosos grupos sulfato en sus glu- evidenciar algunas �ibras de la sustancia intercelu-
cosaminglucanos. Normalmente el color emitido es lar. El precipitado metálico suele ser muy oscuro, o
de mayor λ que el color propio y la razón molecular negro, por lo que es de fácil detección. Las sales más
de este efecto parece ser la alta densidad de luga- utilizadas son el nitrato de plata, el carbonato de
res de unión al colorante y la orientación del mismo, plata y el cloruro de oro (Figura 7.34).
que termina produciendo su polimerización. Dos de
los cromotropos más conocidos son el azul de tolui-
7.3.5. Montaje
dina y el azul de metileno.
La coloración vital es aquella que permite colo- Una vez coloreada la sección se lleva a cabo el
rear la célula sin afectar a su estructura ni interferir montaje, cuyo objetivo primordial es preservar la
en su �isiología, y puede ser de dos tipos: intravi- sección. A veces, a la vez que se sigue el proceso de
tal y supravital. La primera consiste en introducir el montaje se pueden mejorar las propiedades ópti-
colorante a través del sistema digestivo, vascular… cas de la muestra. El procedimiento más usual de
y la segunda en aplicarlo sobre células o tejidos montaje es cubrir la sección con una �ina lámina
provenientes de un organismo vivo. En sentido de cristal denominada cubreobjetos o, más colo-
estricto, un colorante vital solo debería colorear cé- quialmente, «cubre». Los cubreobjetos pueden ser
lulas vivas; sin embargo, y esto es un oxímoron, el de muy diversos tamaños y de forma cuadrangular,
término también se aplica a colorantes que marcan rectangular o circular. Su grosor estándar es de 0.17
únicamente células muertas en tanto que permite mm, pero los hay de diferentes grosores; hecho que
diferenciar células vivas de muertas. Este tipo de ha de ser tenido en cuenta en función de la distancia
tinciones son especialmente útiles en la metodo- de trabajo del objetivo que se utilizará para obser-
logía del cultivo celular o la citometría de �lujo, y a var la muestra.
los colorantes empleados también se les denomina Al �inal del montaje, entre el porta y el cu-
colorantes de exclusión. El azul de tripano se em- breobjetos queda una delgada capa de medio de
plea en estudios de viabilidad en cultivos celulares montaje que penetra en la muestra y estabiliza todo
pues tiñe células muertas; en citometría de �lujo es el conjunto dotando a la sección de gran durabilidad
usual el empleo de ioduro de propidio, que también (Figura 7.35). Existen dos tipos básicos de monta-
marca células muertas. Un análisis más detallado de je: el hidrofóbico y el hidro�ílico; el primero de ellos
estos colorantes se realizará en los capítulos en los más estable y con mejores propiedades ópticas.
que se tratan estas metodologías. Dado que la gran mayoría de las tinciones se hacen
202
Microscopía óptica
203
8.
Microscopía electrónica
Guillermo Bodega
Julio Bodega
El microscopio electrónico puede de�inirse como un bases para el desarrollo de la técnica de micros-
dispositivo de observación que utiliza electrones, copía electrónica de transmisión. A partir de aquí,
en vez de luz, para crear las imágenes que de�inen Knoll y Ruska (1932) escribieron la primera pu-
a un pequeño objeto. El hecho de utilizar electro- blicación en la que se desarrolla la idea de lentes
nes, cuya λ asociada oscila entre 0.001 y 0.01 nm, electromagnéticas, y en 1936 se construyó en Gran
en vez de luz visible, cuya λ oscila entre 380 y 780 Bretaña el METROPOLITAN WICKERS EM1, primer
nm, hace que este tipo de microscopios posea un microscopio TEM comercial. Pero no fue hasta 1939
mayor poder de resolución que los microscopios cuando Siemens & Halske comenzaron lo que pue-
ópticos. Fue en la década de los años 30 donde se de denominarse como fabricación real de este tipo
sentaron las bases técnicas que concluyeron con de instrumentos. Tras la Segunda Guerra Mundial,
la aparición de los dos grandes tipos de microsco- otras casas comerciales como HITACHI, JEOL, PHI-
pios: los microscopios electrónicos de transmisión LIPS y RCA continuaron fabricando microscopios a
(TEM, transmission electron microscope) y los de gran escala. El desarrollo de las técnicas de prepa-
barrido (SEM, scanning electron microscope). La ración de las muestras biológicas para permitir su
aplicación de estas dos poderosas herramientas en observación en el TEM fue complejo y fundamen-
el campo de las biociencias fue un poco posterior talmente llevado a cabo por Claude y Palade en las
y no simultánea. Desde un punto de vista semán- décadas de los años 40 y 50; absolutamente todos
tico, la microscopía electrónica trajo de la mano los procedimientos de �ijación, tinción, inclusión y
la aparición de una nueva terminología cuyo ras- corte utilizados en microscopía óptica tuvieron que
go diferencial fue la aplicación del pre�ijo «ultra». ser rediseñados y adaptados. Los trabajos de Porter,
Por ejemplo, si un estudio morfológico con micros- Blum y Sjöstrand en la década de los años 50 fueron
copio óptico se considera análisis estructural de la la base del diseño de un aparato, el ultramicroto-
muestra biológica, un estudio con el microscopio mo, que permitió la obtención de cortes que por su
electrónico rinde conocimiento ultraestructural. extremada delgadez podían ser observados en el
En 1927, con los primeros experimentos so- TEM. En el campo de la metalogra�ía, Heidenreich,
bre difracción de electrones, se establecieron las en 1949, fue el primer investigador que estableció
Métodos en biociencias
206
Microscopía electrónica
modos de funcionamiento de cada tipo de micros- nica BF la formación de imagen se debe a un efecto
copio electrónico. De hecho, los detectores son la de oclusión: determinadas zonas de la muestra bio-
base y parte principal de lo que se conoce como dis- lógica, o de un determinado material, absorben o
positivos microanalíticos que se incorporan en los evitan el paso de los electrones primarios y les im-
microscopios electrónicos y que se verán a conti- pide formar imagen sobre la pantalla. En la técnica
nuación. En general los dispositivos de detección DF se usa una apertura de objetivo cuyo centro es
son de dos tipos: pantallas �luorescentes, dedica- opaco a los electrones, por lo que excluye a los elec-
das principalmente a estudios de tipo morfológico, trones del haz central y a aquellos que han sufrido
y detectores de electrones, fundamentalmente dise- una dispersión débil (inelástica); por tanto, solo los
ñados para obtener datos analíticos. electrones fuertemente desviados por la materia
(desviación elástica) impactarán en la pantalla y for-
marán imagen, por lo que el fondo de la misma será
8.2.1. El microscopio electrónico
oscuro, de modo análogo a la microscopía óptica de
de transmisión
campo oscuro. La técnica BF-TEM es la más común-
La técnica TEM se basa en analizar los diferentes mente usada en biociencias, aunque también puede
haces de electrones transmitidos a través de una usarse la técnica DF-TEM; por el contrario, los análi-
muestra que resultan de la interacción entre dicha sis SAD son más empleados en ciencia de materiales.
muestra y un haz primario de electrones acelerados En cualquier caso, en las tres técnicas la imagen se
bajo un elevado potencial eléctrico en condiciones forma cuando los electrones impactan con una pan-
de vacío. talla �luorescente. En comparación con la técnica BF,
En la �igura 8.1 se observan los tipos básicos la técnica DF-TEM permite obtener una gran me-
de electrones transmitidos a través de una delgada jora en la formación de imagen y es especialmente
capa de material que permiten, según se consideren útil para el estudio de moléculas con poco contraste,
unos u otros, realizar diferentes tipos de análisis. pues aumenta el contraste y la relación señal/ruido
De forma general puede decirse que la técnica TEM hasta el punto de que se obtienen excelentes imáge-
permite dos tipos de análisis: el análisis de imagen nes sin necesidad de teñirlas con metales pesados.
y el análisis de difracción. El análisis de imagen, que En la técnica de difracción, mediante control
no es otra cosa que la caracterización morfológi- de apertura en el plano de imagen posterior del
ca y ultraestructural de la muestra, utiliza dos tipos objetivo (selección del área de difracción, SAD) se
de electrones dependiendo de la técnica emplea- selecciona un área virtual de la imagen objeto (di-
da: los electrones del haz directo si la técnica es el fractograma) y, tras atravesar los haces electrónicos
campo claro (BF, brigth �ield), es decir, los electro- las lentes intermedias y proyectoras, se obtiene en la
nes que no han interaccionado con la materia, y los pantalla �luorescente un conjunto de puntos (spots)
electrones del haz dispersado elásticamente por la que representan a los planos cuasi-paralelos al haz
materia si la técnica es el campo oscuro (DF, dark que cumplen con la ley de Bragg. Las distancias y
�ield). El análisis de difracción (SAD o SAED, selec- disposición geométrica entre estos spots son un
ted area electron diffraction) también se basa en la indicador de la estructura cristalina del material ob-
detección de electrones dispersados elásticamente y servado. Por ello, esta técnica es muy utilizada en el
se verá en el último epígrafe de este tema. En la téc- análisis microestructural de materiales (Figura 8.2).
Figura 8.2: Imágenes TEM obtenidas de un mismo material cristalino (ZrCr2) tras aplicar las
técnicas BF, DF y SAD.
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Métodos en biociencias
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Microscopía electrónica
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Métodos en biociencias
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Microscopía electrónica
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Métodos en biociencias
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Microscopía electrónica
pueden ser analizados a varios niveles: un nivel cua- haz de electrones con la muestra. Dado que el haz
litativo, identi�icando los elementos del compuesto se enfoca sobre un punto de pequeño diámetro es
mediante sus energías características de emisión; necesario ir barriendo (escaneando) toda la mues-
un nivel semicuantitativo, que además de tener en tra con el haz. La señal proveniente de cada punto
cuenta las energías características, también con- de barrido es captada por los detectores y estará
sidera las intensidades de emisión a la hora de sincronizada con el sistema de formación de ima-
establecer una relación entre el elemento y su con- gen. Por ello habrá una correspondencia entre cada
centración; por último, un nivel cuantitativo, en el punto de escaneo de la muestra y cada punto de la
que, antes de analizar la composición del material, imagen. Con todo esto queda claro que el microsco-
se exige la aplicación de métodos de corrección con pio de barrido no es un instrumento óptico ya que
el �in de evitar el efecto que la matriz del material las lentes no forman imágenes, pero emplea la ópti-
causa en la intensidad de los rayos X emitidos por ca electrónica para formar el haz de electrones. La
cada uno de los elementos. imagen se forma con la utilización de detectores es-
Cuando se quiere determinar con precisión la pecí�icos.
composición de un compuesto es frecuente utilizar
la técnica denominada espectrometría de dispersión
de longitud de onda (WDS, wavelength dispersi- 8.2.3. El microscopio electrónico
ve spectrometry). Los fundamentos en que se basa de transmisión y barrido
esta técnica son los mismos que los expuestos para
EDX, y lo que únicamente cambia es el sistema de El STEM (scanning transmission electron microsco-
detección de rayos X del microscopio: en este caso pe) es una variante de los TEM convencionales que,
el sensor capta los rayos X difractados por un cristal en vez de abrir el haz de electrones para iluminar de
que cumplan con la condición de Bragg, por lo que forma simultánea todo el área de la muestra, lo que
la discriminación energética viene dada según la hace es utilizar una fuente de electrones tipo FEG
longitud de onda de la radiación emitida. Tanto las que genera un haz de electrones muy �ino (menos
técnica EDS como WDS pueden ser empleadas para de 0.2 nm) que va barriendo la muestra punto por
el análisis cuantitativo; sin embargo, en compues- punto. Ello le permite mezclar análisis ultraestruc-
tos en los que sus elementos constitutivos posean tural de imagen en modo TEM, ya sea en modo BF o
líneas de emisión de similar energía, resulta mucho DF, con datos cualitativos y cuantitativos obtenidos
más e�icaz utilizar WDS ya que con esta técnica no por los modos básicos de funcionamiento del SEM:
se necesita realizar correcciones para evitar las im- EDX, ADF y EELS. No es extraño encontrar de�ini-
precisiones surgidas por el solapamiento de picos ciones de este aparato considerándolo al revés: una
(la técnica WDS permite discriminar líneas con una variante del SEM al que se incluye la transmisión.
precisión de ~5 eV, frente a los ~150 eV de EDS). La microscopía electrónica de campo oscuro
También WDS ofrece una mayor precisión que EDX (DF) se puede implementar en el TEM, como ya se
en las medidas de composición de compuestos con ha visto anteriormente, y en el STEM. En este último
elementos ligeros, llegando a alcanzarse límites de caso es usual utilizar un detector anular de campo
detección comprendidos entre 300 y 30 ppm. oscuro (ADF, annular dark �ield) que tiene un aguje-
Por último, después de analizar con un cier- ro en su centro y capta los electrones dispersados
to detalle algunos de los detectores que incorporan elásticamente. Existen detectores anulares de cam-
los microscopios de barrido –y que también pueden po oscuro de alto ángulo (HAADF) cuyo agujero en
incorporar los de transmisión– es conveniente des- el centro es mayor. Esto permite colectar electro-
cribir de modo general el funcionamiento básico de nes con un gran ángulo de dispersión y obtener
uno de estos microscopios. El haz de electrones se imágenes donde el contraste depende del número
obtiene a partir de un �ilamento en condiciones ho- atómico del elemento que dispersó los electrones
mologables a la del TEM pues es necesario un alto (contraste Z). La técnica ADF-STEM genera imáge-
voltaje y un alto vacío. Una vez obtenido el haz de nes estructurales, pero además permite obtener
electrones, este es convenientemente enfocado so- imágenes basadas en datos analíticos llegando has-
bre un punto de la muestra mediante un sistema ta determinar la masa de moléculas pequeñas. Es
de lentes electromagnéticas. La muestra se ubica importante hacer notar que en la técnica DF-TEM el
en una cámara, llamada por ello cámara de mues- dispositivo que genera el campo oscuro está antes
tras, donde también se localizan los distintos tipos de la muestra pues es una apertura con su centro
de detectores diseñados para analizar los diferentes obturado; sin embargo, en la técnica ADF-STEM el
tipos de señales que se generan tras el impacto del detector está por debajo de la muestra.
213
Métodos en biociencias
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Microscopía electrónica
215
Métodos en biociencias
pleado en el capítulo anterior, donde se estudió la Antes de la obtención de los cortes de�initi-
obtención de secciones para su observación al mi- vos que se observarán en el TEM es usual realizar
croscopio óptico. cortes semi�inos. Estas secciones tienen un grosor
El proceso de �ijación, dado el nivel ultraes- entre 0.3 y 0.5 μm, se tiñen con azul de toluidina y
tructural del análisis, ha de ser optimizado y por se observan al microscopio óptico. El objetivo del
ello, siempre que se pueda, se utiliza la perfusión corte semi�ino es comprobar el estado de �ijación
transcardial. El �ijador más usado es el glutaral- del material, su orientación y lo que contiene, pues
dehído (entre 2.5 y 5%) en diferentes tampones el tamaño de las piezas suele ser de 2 o 3 mm y di�i-
(Milloning, Sorensen, cacodilato, fosfato...); también culta su orientación; además, el O4Os las ennegrece
son utilizadas mezclas de paraformaldehído y glu- y di�iculta la identi�icación de su contenido. Una vez
taraldehído. Tras la �ijación en el aldehído se suele escogida el área a observar se elimina el resto, es
post�ijar en O4Os ya que es un excelente �ijador para decir, se retalla el bloque. Con ello se consigue ob-
lípidos y, además, por su alta densidad electrónica, tener áreas de corte no mayores de 0.3 mm de lado,
con�iere buen contraste a las muestras. pues en super�icies mayores es di�ícil obtener bue-
Una vez eliminados los restos de �ijador sigue nos cortes ultra�inos. Las secciones de�initivas han
el proceso de deshidratación de la muestra; pero en de ser extremadamente delgadas para permitir el
lugar de hacerlo con alcohol se suele usar acetona, paso de los electrones a su través. El aparato que
que garantiza una mejor deshidratación. La deshi- permite la obtención de secciones de hasta 50 nm
dratación se termina con óxido de propileno como de espesor es el ultramicrotomo; los cortes semi�i-
líquido intermedio entre el agente deshidratante y nos también se obtienen en él.
el medio de inclusión. Las piezas han de incluirse El ultramicrotomo (Figura 8.11) tiene dos
en materiales más duros que la para�ina para que componentes esenciales: la cuchilla y el sistema de
permitan la obtención de secciones mucho más del- avance. La cuchilla puede ser de vidrio o de diaman-
gadas; normalmente son plásticos o resinas como te y lleva una balsa con agua donde se recogen los
araldita, lovicril, epon, vestopal, durcupan... La pre- cortes (Figura 8.12). La cuchilla y el bloque porta-
paración de estas resinas necesita la mezcla de dos muestras son orientables, y el sistema de avance es
o tres componentes: la base del polímero, acelera- de alta precisión; actualmente de tipo mecánico, a
dores y endurecedores. El procedimiento a seguir diferencia de los primeros microtomos donde era
está perfectamente indicado por la empresa que térmico. Por todo ello, el ultramicrotomo se colo-
comercializa el producto, y permite obtener dife- ca sobre mesas especiales que poseen dispositivos
rentes grados de dureza. Suelen ser inclusiones para evitar posibles vibraciones. Una vez seleccio-
largas pues la penetración es lenta, por lo que se nados los cortes �inos, proceso que se lleva a cabo
suelen ayudar con un calentamiento suave para por el color de los mismos, los cortes más gruesos
facilitarlas ya que el calor �luidi�ica el material de son eliminados de la balsa. Los cortes gris mate y
inclusión. Acabada la inclusión se deja polimerizar plateados son los más �inos, los dorados y púrpura
la resina o el plástico; este proceso se puede acele- son más gruesos.
rar utilizando procedimientos que dependen de la Los cortes seleccionados se estiran con vapo-
resina usada, entre ellos la exposición a luz UV, o el res de toluol para anular el efecto de compresión del
calentamiento a 60 ºC. corte y se recogen por contacto con una rejilla. Para
216
Microscopía electrónica
Figura 8.12: En la zona superior se incluyen imágenes con diferentes modelos de balsas tomadas de
diferentes páginas web de casas comerciales. La imagen de la derecha corresponde a una cuchilla de
diamante. En la zona inferior se incluyen dos imágenes de las piezas implicadas en la obtención de
secciones (www.wcbio.science.ru.nl). Las secciones obtenidas quedan �lotando en el agua de la balsa.
facilitar el proceso de recogida se aumenta el nivel Por la propia naturaleza del material biológi-
de agua de la balsa hasta formar una super�icie con- co y su extremada delgadez, el corte tiene muy poco
vexa de modo que los cortes se sitúan en la parte contraste. La �ijación con O4Os lo aumenta, pero el
más alta. Las rejillas suelen tener 3 mm de diáme- contraste de la muestra ha de ser mejorado para
tro y 18 μm de grosor, y el número de agujeros y su observación, por ello se ha de teñir el material
la estructura de la rejilla puede variar; el material que hay en la rejilla con sustancias electrodensas.
en que están construidas también pues pueden ser Las dos más utilizadas son el acetato de uranilo y el
de cobre, níquel (indicadas para inmunomicrosco- citrato de plomo. La preparación de estos produc-
pía electrónica), oro, molibdeno… Las más usuales tos y el proceso de tinción ha de ser muy cuidadoso
son de rejilla cuadrangular y de 100 o 200 agujeros para evitar la formación de precipitados o cristales
pero las hay de rejilla hexagonal o rectangular; tam- que podrían impedir la correcta visualización de la
bién las hay solo con barras o de un único agujero muestra. Una vez secas y tras eliminar los restos de
(Figura 8.13). Para evitar que las secciones o partes las sales de contraste mediante lavados, las rejillas
de ellas se puedan perder o doblar en los agujeros se pueden observar al TEM. Los puntos por los que
de la rejilla, especialmente si estos son grandes, se electrones atraviesan la muestra se proyectarán has-
cubre la rejilla con una �ina capa de un plástico lla- ta alcanzar la pantalla �luorescente donde se verán
mado formvar cuyo espesor suele ser de 1.7 nm. como puntos luminosos. Sin embargo, cuando los
Figura 8.13: Tipos de rejillas. (A) Rejillas de red cuadrada con diferente número de agujeros. (B) Rejilla de red
hexagonal. (C) Rejillas de barras. (D) Rejillas dobles (se pueden doblar) con diferente o igual número de agujeros
en cada cara. (E) Rejillas con un único agujero circular o alargado.
217
Métodos en biociencias
electrones del haz impactan contra las sales de La �ijación del material biológico ha de ser de
metales pesados utilizadas para contrastar, estas alta calidad; de hecho, el procedimiento de �ijación
impiden la transmisión de electrones y la proyec- de las muestras biológicas que lo requieren es muy
ción de esos puntos de la muestra en la pantalla, lo similar al modo de proceder en la técnica de rutina
que conlleva la aparición de puntos oscuros, pues del TEM. Tras la �ijación se sigue un procedimiento
en ellos no impactan los electrones. Dichos puntos de deshidratado y secado necesario para la poste-
serán más o menos oscuros en función de la con- rior metalización de la muestra. En un principio se
centración de dichas sales. La estructura trilaminar utilizaban series crecientes de alcohol o acetona y
de la membrana (2 regiones oscuras periféricas y secado �inal al vacío, procedimiento que causaba no
una clara o luminosa central) es un perfecto ejem- pocas alteraciones morfológicas en la muestra. Un
plo de este proceso de formación de imagen. El O4Os buen ejemplo para ilustrarlo es lo que ocurre cuan-
se deposita en la zona de las cabezas polares de los do se deja caer una gota de agua sobre un folio de
lípidos de membrana por lo que los electrones no papel: en el proceso de secado el papel se acaba on-
atraviesan esas zonas y generan dos bandas oscuras dulando y variando su forma en la zona donde se
externas. En la zona central de la membrana, donde depositó la gota. Estos cambios estructurales pare-
se sitúan enfrentadas las colas de los ácidos grasos cen ser ocasionados por el gradiente de fuerza de
que forman los fosfolípidos, no se depositan las sa- tensión super�icial tan alto que existe en la interfa-
les de contraste, se permite el paso de los electrones se entre zonas húmedas (mojadas por H2O) y secas.
y por ello aparece como una zona clara. Para evitar esto, Anderson (1951) diseñó la técni-
ca de secado al punto crítico (critical point drying).
8.3.2. Técnica de rutina en SEM Este procedimiento se realiza en una bomba de se-
cado (Figura 8.14) y en él se sustituye el agua del
Por técnica de rutina en el SEM convencional se tejido por un líquido deshidratante y después por
entiende la metalización de las muestras para su un gas bajo presión que está en fase líquida y que
análisis topográ�ico y la detección de electrones tiene una muy baja tensión super�icial. El líquido
secundarios para formar imagen. Las muestras bio- deshidratante, además de eliminar el agua, también
lógicas no son conductoras, hecho que va unido a actúa como líquido intermedio pues es miscible
una alta hidratación y una baja consistencia. Do- con el gas en fase líquida. Los líquidos deshidratan-
tarles de conductividad obliga a recubrirlas de una tes más usados son acetona, amilacetato, etanol y
película metálica (metalización), pero para ello han metanol. Una vez que la muestra está bañada por
de estar secas. Los datos que se obtienen con este el gas en fase líquida se le hace alcanzar el punto
modo de proceder son de tipo topográ�ico por lo crítico, que es aquel donde a una temperatura y
que es muy importante que las super�icies a obser- presión determinada este compuesto en fase líqui-
var no estén contaminadas por sustancias externas da se transforma en gas. El espécimen termina seco
y no hayan sufrido alteraciones al preparar la mues- sin distorsiones apreciables, pues bajo estas con-
tra. diciones la tensión super�icial de la fase líquida es
Figura 8.14: (A) Unidad de secado al punto crítico de la marca Polaron (CPD7501). (B) Unidad de metalización
de la marca Polaron (E5400); la �igura C es un detalle con la cámara de metalizado abierta para permitir la
visualización del cátodo y del portamuestras.
218
Microscopía electrónica
Figura 8.15: Esquema que ilustra un proceso de metalizado (parte superior) y otro
sombreado (parte inferior).
muy baja, en torno a cero. El gas más universalmen- pas más gruesas pueden hacer perder detalles de la
te empleado es CO2 (punto crítico 32 ºC, 74 bares), super�icie de la muestra.
pero también lo son el NO2 o el Freón 13. Uno de los La capa metálica que recubre la muestra bio-
problemas más comunes en el secado al punto críti- lógica recibe el nombre de réplica. En el caso actual,
co al utilizar CO2 es el colapso del material biológico dado que los electrones no han de atravesar la mues-
que se produce al someter la muestra a presión si tra, se suele dejar que réplica metálica y muestra
en su interior quedan burbujas de aire. Es necesa- biológica permanezcan juntas (Figura 8.15).
rio considerar que solo cuando toda la muestra está
perfectamente mojada, la presión en cualquier pun-
to de la misma es cero. 8.3.3 Sombreado
El metalizado se lleva a cabo para hacer con-
El sombreado (shadowing) se puede de�inir como un
ductiva la muestra biológica, pero también sirve
recubrimiento metálico no completo de la muestra
para dotarla de cierta consistencia pues el material biológica debido a que el �ilamento de metalización
biológico seco es, en muchos casos, bastante que- se encuentra lateralizado y la muestra no se mueve.
bradizo. La metalización consiste en recubrir total y Ello hace que la réplica metálica no sea continua ni
absolutamente toda la super�icie de la muestra con completa, pues las propias irregularidades de la su-
una �ina capa de metal, normalmente oro, oro-pa- per�icie de la muestra junto con la lateralización del
ladio o platino. El procedimiento se realiza en un �ilamento metalizador hacen que se generen zonas
aparato llamado metalizador (Figura 8.14), que de sombra donde no se produce la metalización; de
trabaja al vacío y posee un �ilamento del metal ele- modo análogo a una luz que ilumina lateralmente
gido para recubrir la muestra en posición cenital, un objeto rugoso genera en él zonas iluminadas y
de modo que al someterlo a un alto voltaje (3-5 kV zonas de sombra.
es un voltaje usual) se evapora y emite átomos de Esta técnica es muy útil para el estudio de
modo análogo a como funciona un spray de pintura. especímenes biológicos muy pequeños, como molé-
La muestra se sitúa en un soporte que permite mo- culas, estructuras subcelulares, virus... La muestra,
verla y ladearla para facilitar el metalizado. La capa una vez convenientemente preparada, se somete
de metal suele oscilar entre 5 y 20 nm de grosor, de al sombreado. No se considera el proceso de pre-
modo que garantice conductividad y estabilidad; ca- paración del material biológico, pues puede ser
219
Métodos en biociencias
220
Microscopía electrónica
cos usa inmunocitoquímica (el método más usado), diar el exterior como el interior celular. Básicamente
autorradiogra�ía, histoenzimología... El desarrollo consiste en añadir una fase de sublimado de hielo an-
básico de esta técnica es el siguiente. El material tes de la fase de sombreado en el procedimiento que
biológico, preferentemente no �ijado para luego fa- se sigue en la criofractura (Figura 8.17).
cilitar su disolución parcial, se congela, se fractura El material biológico es rápidamente congela-
y se sombrea para obtener la réplica de platino/ do sin �ijar. Una vez fracturado, el nivel de hielo de la
carbón. El material biológico subyacente a la répli- muestra se baja mediante sublimación al vacío su-
ca se descongela y se trata con detergentes (tritón biendo temperatura. Conviene tener presente que
X-100, SDS u octil-glucósido) que lo eliminan par- con un vacío de 10-7 bares el agua empieza a subli-
cialmente, pues dejan aquellas moléculas que están marse a -115 ºC a una tasa de 0.1 nm por segundo,
en contacto con la réplica. Finalmente, el material y una tasa de sublimación razonable va de 1 a 10
biológico pegado a las réplicas es marcado con me- nm por segundo. Si se subliman alrededor de 100
dios citoquímicos (ver capítulo 5, epígrafe 5.7.2 y nm de profundidad se denomina grabado normal
�igura 5.16). (normal-etching), si se hace hasta unos pocos μm es
grabado profundo (deep-etching). Las partes de la
célula o de la matriz extracelular expuestas por este
8.3.5. Criograbado proceso son sombreadas para hacer una réplica de
platino/carbono siguiendo un procedimiento idén-
El criograbado (freeze-etching) es una variante me- tico al visto en el apartado anterior. Las muestras
todológica de la criofractura que sirve especialmente así obtenidas permiten estudiar el interior de las
para el estudio tridimensional de la arquitectura de células y revelar su estructura tridimensional con
células y tejidos en el TEM, pues se usa tanto para estu- extraordinaria claridad. La aparición de las estruc-
221
Métodos en biociencias
turas celulares y extracelulares en el sublimado es habituales son ácido fosfotúngstico, acetato de ura-
un proceso comparable a la aparición de los obje- nilo o molibdato de amonio. La muestra también
tos sumergidos en un recipiente cuando su nivel de puede colocarse en la rejilla por medio de un spray.
agua va bajando. Al �inal del proceso, que ocupa solo unos pocos mi-
nutos, las sales de los productos de tinción quedan
sobre el formvar, o rodean a los especímenes, o se
8.3.6. Tinción negativa depositan en algunas de sus irregularidades estruc-
turales. La formación de imagen ocurre porque la
La tinción negativa es un método de análisis en muestra biológica deja pasar los electrones y las
modo TEM-BF cuya base es la tinción del medio que sales de los metales pesados los dispersan (Figura
rodea a la muestra biológica, que queda sin teñir. Es 8.18). Por ello la muestra se ve brillante y el fondo
el procedimiento inverso a la tinción positiva donde oscuro, obteniéndose una visión negativa. Este es
se tiñe la muestra y no el medio que la rodea, y sirve un método de desarrollo fácil y rápido, que genera
para el estudio de muestras biológicas de pequeño imágenes de alto contraste. Sin embargo, es necesa-
tamaño como macromoléculas, virus, ribosomas, rio tener presente que el procedimiento de secado y
fragmentos celulares, liposomas, orgánulos... la forma de pegado de la muestra biológica al form-
Existen dos variantes procedimentales bási- var puede artefactar su estructura; además, ciertas
cas: en la primera, una pequeña gota de la disolución partes de la muestra, por su morfología o forma de
que contiene las muestras biológicas (�ijadas o no) interacción con el formvar se pueden teñir mejor
se deposita sobre una rejilla cubierta de formvar y que otras. Es muy importante evitar la formación de
se deja secar, después se añade una gota del produc- precipitados que pueden disminuir la calidad de la
to de tinción y se vuelve a dejar secar. En la segunda, imagen. La resolución que se alcanza es de 2 nm y
el factor limitante es el tamaño de grano de las sales
se mezcla la muestra biológica con el producto de
empleadas para generar el contraste negativo.
tinción, se deposita una pequeña gota sobre la re-
jilla y se deja secar. Los productos de tinción más
8.3.7. Criomicroscopía electrónica
La criomicroscopía electrónica (Cryo-EM, cryo-elec-
tron microscopy) es un método de estudio en modo
TEM que analiza muestras congeladas con �ines es-
tructurales. Persigue causar a la muestra la menor
alteración posible en el proceso de preparación
para su observación, además de reducir el tiempo
empleado en el proceso, pudiendo llegar a permi-
tir la observación de especímenes hidratados, en su
estado nativo (sin �ijar, teñir o incluir), con una alta
resolución.
Se pueden observar tanto (1) criosecciones
ultra�inas como (2) capas �inas de suspensiones
acuosas de virus, ribosomas, agregados proteicos
(microtúbulos, micro�ilamentos...). La preparación
de estas suspensiones de especímenes es muy sen-
cilla, basta mojar la rejilla en la suspensión donde
se mantienen, eliminar el exceso (se forma una capa
�ina de la suspensión en el centro de la rejilla) e in-
mediatamente congelar en etano líquido (-160 ºC).
Esto produce la vitri�icación del agua, es decir, la
formación de hielo amorfo: sin cristales. La mani-
pulación de la rejilla para que no se caliente ni se
Figura 8.18: Esquema de un proceso de tinción nega- forme escarcha al ponerla al aire se realiza me-
tiva. Tras el secado, las sales acumuladas en las irre- diante un aparato llamado criotransfer, que incluso
gularidades de la muestra dispersan los electrones;
solo las zonas donde no se han acumulado las sales permite su introducción en la columna del TEM, que
permiten el paso de electrones que formarán imagen ha de estar al vacío y a -160 ºC. Las imágenes que
tras impactar en la pantalla del TEM.
se obtienen son bastante ruidosas pero al utilizar
222
Microscopía electrónica
223
Métodos en biociencias
bién pueden ser conseguida mediante la aplicación no así en la microscopía electrónica de barrido. El
de diferentes algoritmos. Los dos modos más usa- problema a la hora de ejecutar esta etapa es que un
dos son la retroproyección �iltrada y reconstrucción atacado excesivo puede transformar el material que
iterativa. Es muy importante tener presente que la se desea observar. Es importante indicar que cuan-
reconstrucción 3D no es la simple suma de las dis- do una muestra de material metalúrgico embutida
tintas proyecciones pues, por efecto del balanceo, en una resina ha de ser observada mediante micros-
las imágenes obtenidas no tienen el mismo tama- copía electrónica de barrido, previamente hay que
ño; por ello es necesario el desarrollo y mejora de metalizar la muestra junto a la resina, o, mediante
algoritmos que optimicen la obtención de la imagen la aplicación de una sustancia conductora, formar
3D �inal. unos contactos metálicos en la resina con el �in de
que la probeta pueda descargarse de la electricidad
estática generada por el impacto de los electrones.
8.5. Microscopía electrónica de muestras no
biológicas
8.5.2. Microscopía electrónica
En este último epígrafe solo se pretende incluir de transmisión
unas nociones básicas de la preparación de mues-
tras metalúrgicas. No existe una técnica general que Una de las mayores di�icultades que presenta la
pueda ser válida para todo tipo de muestras; por TEM es la preparación de las probetas. General-
ello, a continuación se describe un procedimiento mente, y al igual que en muestras biológicas, para
adaptado para el estudio de compuestos interme- que los electrones del haz primario puedan atrave-
tálicos. sar un metal, necesitan, además de un alto potencial
acelerador (generalmente de 200 kV), encontrarse
con grosores no superiores a los 100 nm. Obtener
8.5.1. Microscopía electrónica de barrido probetas tan delgadas no es tarea sencilla y su ma-
yor o menor di�icultad depende principalmente de
La microscopía electrónica de barrido, al igual que la las propiedades mecánicas (ductibilidad, dureza,
microscopia óptica, requiere un meticuloso proceso etc.) del material a analizar. Concretamente, si los
en la preparación de las muestras, cubriendo des- materiales son muy frágiles el proceso de adelgaza-
de el embutido del material a observar en resinas miento de la probeta se convierte en un auténtico
hasta el atacado �inal de su super�icie para alcanzar problema. El primer paso es cortar la muestra en
brillos especulares (el microscopio óptico para este láminas gruesas (entre 0.8 y 1.2 mm de espesor)
tipo de muestras trabaja con re�lexión). mediante, por ejemplo, una sierra de polvo de dia-
La muestra es embutida en resina líquida me- mante. Estas secciones se embuten en un molde con
diante un molde normalizado de 3 cm de diámetro. resina con el �in de dar resistencia a la probeta para
La resina líquida endurece en 24 horas aproximada- soportar los tratamientos posteriores, que empie-
mente y la muestra así preparada recibe el nombre zan con un pulido manual para obtener una cara
de probeta. Posteriormente es pulida manualmen- plana de referencia limpia y brillante mediante li-
te con lijas de carburo de silicio de 240. 600 y 1200 jas de carburo de silicio (300, 600 y 1200 mesh),
mesh. Es usual aplicar sobre las lijas una capa de y se continua para adelgazar la probeta hasta 150
cera de carnauba para evitar, en la medida de lo mm. Luego, utilizando una sierra circular de baja
posible, que las partículas abrasivas de la lija se velocidad angular, se realiza el corte en discos nor-
incrusten en el material, contaminándolo y provo- malizados de 3 mm de diámetro que permiten su
cando un rayado indeseable. El proceso sigue con introducción en el portamuestras del TEM. Por úl-
un pulido con polvo de diamante efectuado con la timo se realiza el electropulido, que consiste en el
ayuda de una pulidora mecánica. Se comienza con adelgazamiento selectivo de una zona de la pro-
polvo de gran calibre, por ejemplo, 6 μm, se conti- beta hasta conseguir su perforación. Así, en los
núa con calibres de 3 y 1 μm y se �inaliza con polvo bordes de dicha perforación se obtienen los espe-
de 1/4 μm. Generalmente, al �inal de esta etapa la sores requeridos para su observación (~100 nm).
muestra presenta una super�icie muy limpia no- El electropulido se realiza mediante eyección de un
tablemente brillante. El atacado es la última etapa electrolito sometido a un potencial eléctrico sobre
del proceso de pulido y con ella se pueden alcanzar las dos caras de la muestra; habitualmente una so-
brillos especulares en la probeta, condición funda- lución de ácido perclórico al 10% y metanol al 90%
mental para la observación en microscopía óptica, a una temperatura de -40 ºC. En determinados tipos
224
Microscopía electrónica
225
9.
Microscopía de barrido
por sonda
Guillermo Bodega
La microscopía de barrido por sonda (SPM, scan- tico de barrido (SAM, scanning acoustic microscope),
ning probe microscopy) es una metodología que que serán los que se considerarán en este capítulo.
permite estudiar las muestras por el rastreo (barri- La SPM se puede considerar como la micros-
do) de su super�icie con una sonda. El análisis de las copía de última generación. Por un lado, ha sido el
alteraciones que la sonda va sufriendo en su proce- último gran tipo de microscopía en aparecer: surge
so de rastreo permitirá obtener información sobre en la década de los 80, época que se puede conside-
la materia subyacente, y la naturaleza de esta in- rar relativamente reciente. Por otro lado, su modo
formación dependerá del tipo de interacción que de obtención de información se basa en un concepto
se establece entre sonda y materia. El tipo de in- totalmente diferente al desarrollado en los micros-
teracción puede ser muy variado y depende de la copios ópticos y electrónicos estudiados en los dos
sonda, del barrido y de la materia estudiada. Senci- capítulos anteriores. Los SPMs no necesitan lentes,
llas interacciones mecánicas y otras más complejas ni de vidrio ni electromagnéticas, por lo que su re-
como interacciones electrostáticas, magnéticas, de solución depende fundamentalmente del sistema
van der Waals o de Lennard-Jones, de enlace quí- de control de posición y movimiento, y de la sonda.
mico, capilares, térmicas… son algunos de los tipos Su diámetro, rigidez, proximidad y modo de inte-
de interacción que sonda y materia pueden esta- racción con la materia son factores que afectan a la
blecer. El hecho de que sonda y materia puedan resolución de los SPM, que en muchos casos alcan-
establecer tantos tipos diferentes de interacción ha za niveles atómicos pues su valor es inferior al nm.
sido la causa de aparición de más de una treintena El primer SPM que apareció fue el STM en el
de tipos de SPMs. Entre todos ellos destaca el mi- año 1981 y supuso la concesión del premio Nobel a
croscopio de efecto túnel (STM, scanning tunneling Binning y Rohrer en el año 1986. No deja de ser pe-
microscope) por ser el primer SPM que apareció. Por culiar el hecho de que ese mismo año también le fue
su aplicación en el campo de las biociencias son es- concedido el premio Nobel a Ruska por el desarrollo
pecialmente interesantes el microscopio de fuerza del TEM, hecho acaecido 50 años antes. El primero de
atómica (AFM, atomic force microscope), el micros- estos microscopios con una indudable aplicación en
copio óptico de campo cercano (SNOM, scanning el campo de la biociencia es el AFM, desarrollado en
near-�ield optical microscope), y el microscopio acús- 1985 por Binning, Gerber y Quate.
Métodos en biociencias
9.1. Microscopio de barrido entre 0.15 y 0.6 nm. Su resolución vertical puede lle-
de efecto túnel gar a 1 pm. La base del funcionamiento del STM es el
establecimiento de una diferencia de potencial –que
9.1.1. Estructura y funcionamiento va de mV a unos pocos V con intensidades en el rango
del nAmp– entre la muestra y la punta de la sonda, lo
El STM es el primer SPM inventado por lo que se que obliga a que sonda y muestra sean conductoras
puede considerar como el ancestro de todos los o semiconductoras. Cuando sonda y muestra están
demás. Por ello comparte con el resto de SPMs la muy próximas, normalmente a menos de 1 nm, y
presencia de algunos componentes estructurales dependiendo del valor del potencial, se produce el
como son la sonda, el sistema de escaneo y la unidad paso de electrones entre sonda y muestra o vicever-
de control informático, que dirige el escáner, mide sa en función de como estén cargadas cada una. Este
datos y los transforma en una imagen (Figura 9.1). paso de corriente eléctrica entre sonda y muestra es
El STM no es un microscopio que se use normal- medible y está afectado de forma exponencial por
mente en el campo de las biociencias pues, como se la distancia existente entre ellas: una variación del
verá en el siguiente párrafo, obliga a que las mues- 10% en la distancia induce un cambio de un orden
tras sean conductoras. Sin embargo, el hecho de ser de magnitud en la corriente, lo que dota al STM de
utilizado como modelo constructivo por otros SPMs una extraordinaria sensibilidad.
que utilizan muestras biológicas justi�ica su consi- Existen dos modos de funcionamiento del
deración en este tema. Por la razón ya expuesta no STM: altura constante y potencial constante (Fi-
se profundizará en el análisis de la sonda del STM; gura 9.2). En el modo altura constante la sonda se
sin embargo, se prestará una atención especial a desplaza en un plano horizontal por encima de la
los dispositivos que permiten ajustar la posición de muestra sin variar su altura. En su movimiento, la
sonda y muestra, y a los que controlan el movimien- distancia entre sonda y muestra varía en función de
to en el proceso de barrido, pues son componentes las irregularidades de la muestra, y esto hace que
esenciales en todos los SPMs. Aunque no se entrará el potencial establecido entre sonda y muestra tam-
en detalles de la arquitectura constructiva del STM bién varíe. Por tanto, la formación de la imagen de
conviene recordar que el funcionamiento del STM es cada punto de la super�icie de la muestra es función
extraordinariamente sensible a vibraciones, cambios de la variación de corriente detectada en cada pun-
de temperatura e interferencias acústicas y eléctri- to. A potencial constante el sistema utiliza un modo
cas; por ello la cámara del STM donde se realiza la de retrocontrol que va ajustando continuamente la
medida ha de estar muy bien protegida y preferente- distancia entre muestra y sonda para que el poten-
mente con alto vacío o átomos inertes. cial se mantenga constante. Aunque teóricamente
La sonda del STM, normalmente de platino/ se pueden desplazar tanto sonda como muestra, lo
iridio o tungsteno, es una aguja rígida y conducto- usual es que el desplazamiento lo realice la mues-
ra, y con una punta tan delgada que termina en un tra mediante un sistema de control piezoeléctrico.
átomo, por lo que la resolución lateral que puede al- En este caso, cada punto de la imagen se genera en
canzar el STM es de nivel atómico, es decir, puede función de la variación de altura del sistema sobre
diferenciar un átomo de otro que está a su lado; tén- el que se ubica la muestra, o más concretamente, de
gase en cuenta que el diámetro de los átomos oscila la energía que hay que suministrar al sistema pie-
Figura 9.1: Esquema de un STM (izquierda) con un detalle de la interacción entre muestra y sonda (derecha) donde los círculos represen-
tan átomos.
228
Microscopía de barrido por sonda
Figura 9.2: Esquema de los dos modos de funcionamiento del STM: altura constante (izquierda) y potencial constante
(derecha).
zoeléctrico que mueve la muestra para ajustar el Hay dispositivos puramente mecánicos y
potencial. eléctricos. Los primeros, por ser de menor preci-
Una visión muy general del funcionamiento sión, se usan para el preposicionamiento de sonda
podría concluir con la idea de que la sonda detecta y muestra; los segundos, mucho más precisos, sir-
cambios morfológicos en la super�icie de la muestra, ven para alcanzar posicionamientos más �inos y ser
pero, si se quiere ser más preciso, la realidad es que responsables del movimiento en el proceso de ba-
la imagen obtenida depende de la densidad electró- rrido. Entre los dispositivos puramente mecánicos
nica en cada punto de la super�icie y, de manera aún (Figura 9.3) destacan los sistemas de palanca, en los
más precisa, la imagen obtenida representaría la que amplios movimientos en un extremo se trans-
probabilidad de que en un punto determinado, a una forman en pequeños desplazamientos en el otro,
distancia y potencial dados, se produzca el salto de y los dispositivos tipo cantiléver, usualmente es-
un electrón. Por ello, variaciones del estado electró- tructuras elásticas alargadas y planas en las que un
nico en un punto o área determinada de la muestra extremo está �ijo y el otro libre; sobre ellos puede
pueden causar errores en estudios puramente to- apoyarse o no otro dispositivo elástico que permi-
pográ�icos: una super�icie absolutamente plana que te actuar sobre la posición del cantiléver. Entre los
presentase este tipo de anomalías podría formar dispositivos eléctricos destacan los motores paso a
una imagen con alteraciones en su super�icie. paso, que transforman pulsos eléctricos en impul-
sos mecánicos, y los motores piezoeléctricos, en los
que el movimiento es generado por una estructura
9.1.2. Sistemas de control posicional
piezoeléctrica (transforma la electricidad en vibra-
y de movimiento de sonda y muestra
ciones o movimiento).
Existen numerosos dispositivos que se pueden usar Los sistemas piezoeléctricos de control de
para conseguir posicionar correctamente muestra posicionamiento y movimiento son los más utili-
y sonda, y, además, permitir su desplazamiento; si zados por sus propiedades: provocan cambios de
bien unos son más so�isticados y precisos que otros. posición muy precisos, por debajo del nm, y a la
Los sistemas de control de movimiento durante el vez pueden generar fuerzas del orden de miles de
escaneo pueden asociarse a la sonda o a la muestra Newtons, son de respuesta rápida, no les afectan
y son los dispositivos de mayor precisión, pues tie- los campos magnéticos, son de muy bajo consumo,
nen que generar movimiento en escalas inferiores pueden trabajar en el vacío, no necesitan lubrica-
al nm en las tres direcciones del espacio. ción y están libres de desgaste por fricción.
Figura 9.3: Dispositivos de ajuste de tipo palanca y cantiléver. La �lecha del cantiléver sirve para ajustar la
posición de partida.
229
Métodos en biociencias
230
Microscopía de barrido por sonda
231
Métodos en biociencias
tante las variaciones en la de�lexión del cantiléver mo más utilizado. En el modo AAC un transductor
son retrocorregidas para mantener el cantiléver en piezoeléctrico se asocia a la pieza donde se sujeta
la misma posición. Para ello es necesario desplazar el cantiléver e induce la vibración. En el modo MAC
(subir o bajar) la muestra en el eje Z (altura) a la un cantiléver recubierto de material magnético es
vez que se va produciendo el barrido por los ejes X sometido a las oscilaciones de un campo magnético
e Y. Suele ser el modo de funcionamiento más ha- generado por un solenoide próximo a él.
bitual, pero la velocidad de escaneo está limitada El modo de operar con contacto intermitente
por la respuesta de retrocorrección. En este caso, es muy parecido al modo sin contacto pues tam-
la corriente aplicada al sistema piezoeléctrico en bién emplea un sistema vibratorio de medida; sin
cada punto es transformada en imagen mediante embargo, en este caso la aguja llega a tocar la mues-
el software correspondiente, por lo que la imagen tra y la amplitud es mucho mayor que en el modo
se obtiene a partir del sistema de control del movi- sin contacto pues es del orden de decenas de nm.
miento del escáner en vez del PSPD, tal como sucede El sistema funciona al detectar los cambios en la
en el modo de operar con altura constante. amplitud que tienen lugar durante el proceso de
Para obtener imagen el AFM opera de cuatro escaneo, y mueve la muestra para que dicha ampli-
maneras primarias (contacto, no contacto, intermi- tud se mantenga constante. Este modo de operar es
tente y resonancia de torsión) y numerosas maneras especialmente útil en el caso de las muestras bioló-
secundarias que derivan de estas; en ningún caso gicas pues reduce la mayoría de las limitaciones que
es necesario que la muestra sea conductora. En el presentan los modos con y sin contacto.
modo contacto a la muestra y al extremo de la aguja El modo de obtención de imagen por
solo los separa una distancia del orden del angs- resonancia torsional consiste en detectar el movi-
trom. En realidad, se considera que hay interacción miento cuasi-giratorio que sufre el cantiléver por
ente las nubes electrónicas de los átomos de sonda la aparición de fuerzas laterales que modi�ican su
y muestra, por lo que entre estos átomos se estable- desplazamiento, y para ello necesita PSPD de cuatro
cen fuerzas de carácter repulsivo. elementos. El sistema mide simultáneamente cam-
En el modo sin contacto la muestra y la pun- bios en el desplazamiento vertical del cantiléver
ta de la aguja se encuentran separadas por decenas (de�lexión) y en el lateral (torsión). Mediante este
de nm, por lo que las fuerzas interatómicas que sistema no solo se detectan cambios topográ�icos
se establecen entre ellas son de carácter atracti- sino que también pueden detectarse variaciones en
vo. Esto hace que tiren hacia abajo del cantiléver, otras propiedades de la muestra estudiada. Una va-
lo que obliga a utilizar cantiléver algo más rígidos. riante de este sistema la utiliza el microscopio de
Por otra parte, la magnitud de estas fuerzas es de fuerza lateral (LFM, lateral force microscope) que
varios órdenes menor que en el modo contacto, lo solo detecta variaciones en el desplazamiento la-
que unido a la mayor rigidez del cantiléver provo- teral del cantiléver, hecho que le permite poner en
ca una disminución en la señal. Debido a la menor evidencia transiciones composicionales en la su-
interacción entre sonda y muestra este modo de per�icie de la muestra (Figura 9.7). Otro modo de
operar es especialmente utilizado en el análisis de operar es la detección de fase (PDM, phase detec-
muestras blandas y/o elásticas. En el modo sin con- tion microscope), que forma imagen en función
tacto el cantiléver vibra a frecuencias próximas a su del desfase entre la señal de entrada que induce la
frecuencia de resonancia: entre 100 y 400 kHz con vibración del sistema y la señal de salida tras la in-
una amplitud de unos pocos nm. Antes de iniciar el teracción con la muestra (Figura 9.7). Este modo
de operar es especialmente útil para detectar cam-
escaneo se �ija la distancia de la aguja a la muestra
bios en elasticidad, adhesión y fricción, y es muy útil
y el modo de vibración del cantiléver seleccionan-
para analizar muestras biológicas. Una de las gran-
do una frecuencia y una amplitud. La variación
des ventajas del AFM es que la medida de muchos
de esta distancia que se produce en el proceso de
de los parámetros que sustentan los diferentes mo-
barrido afecta a la frecuencia y amplitud de la vi-
dos de formación de imagen se puede realizar de
bración. El modo de operar requiere ir ajustando
forma simultánea, de modo que no es necesario rea-
de forma continua la separación de la muestra (se
lizar nuevos barridos de la muestra.
sube o baja) hasta revertir las variaciones produci-
das en la amplitud. Ello hace que la distancia entre
muestra y aguja se mantenga constante. El sistema 9.2.2. Aplicación del AFM en el campo
alcanza resoluciones por debajo del angstrom en el de las biociencias
eje vertical. La vibración del cantiléver se consigue
de dos maneras, el modo AAC (acoustic amplitude Los AFM adaptados al estudio de muestras bioló-
constant) y el modo MAC (magnetic AC), este últi- gicas suelen incluir, como mínimo, un microscopio
232
Microscopía de barrido por sonda
Figura 9.7: Esquemas que ilustran los modos de operar del microscopio de fuerza lateral (LFM)
(A) y del microscopio de detección de fase (PDM) (B).
óptico que facilita la manipulación de la muestra nas de μm y puede impedir el análisis de muestras
y la elección del área de estudio. En cuanto a tipo muy rugosas, hecho relativamente frecuente en las
de muestra biológica, el AFM permite el análisis de muestras biológicas. En el caso de utilizar muestras
moléculas dispersas (proteínas, RNA, DNA…) agru- vivas también es necesario tener en consideración
paciones macromoleculares (cromosomas, �ibras, la duración del escaneo pues, dependiendo de la
membranas...), virus, orgánulos u otras estructuras magnitud del área a estudiar y del grado de resolu-
subcelulares, células e incluso tejidos (Figura 9.8). ción que se desee, puede oscilar entre unos pocos
Prácticamente no existen restricciones en relación minutos a algunas horas; por ejemplo, el análisis
con la preparación de las muestras pues en el AFM de alta resolución de 1 μm2 de la membrana de una
se puede estudiar material �ijado o sin �ijar, húme- célula puede durar hasta 3 horas debido a la baja
do o seco, e incluso hasta material vivo. Existe un velocidad del escaneo. Otra consideración intere-
curioso modo de procesamiento que permite obser- sante es la posibilidad de utilizar diferentes modos
var secciones histológicas en el AFM e implica una de operación de forma simultánea, lo que permite
mezcla de los métodos que se aplican en micros- la obtención de datos de muy diferente naturaleza;
copía óptica, TEM y SEM. En un ultramicrotomo se por ejemplo, en un único barrido de un área de la
obtienen secciones con un grosor de 500-700 nm membrana plasmática de la célula se pueden obte-
de material incluido en polietilenglicol, luego son ner datos morfológicos, datos sobre la viscosidad de
montadas en portas de vidrio, se retira el medio de la membrana y, si se ha realizado un inmunomar-
inclusión, se secan al punto crítico y pasan a ser ob- caje con oro-coloidal, también se puede estudiar la
servadas en el AFM. distribución de la molécula que hace de antígeno.
Un hecho importante a tener en cuenta es La posibilidad de manipulación de la son-
la limitación del desplazamiento de la muestra en da del AFM para modi�icar su modo de interacción
el eje vertical, pues solo suele alcanzar unas dece- con la materia abre fascinantes posibilidades en el
Figura 9.8: AFM. Imagen de una partícula de oro-coloidal de 10 nm depositada en una super�icie de
mica (izquierda). Imagen que muestra la variación de resonancia en función de la elasticidad de la
membrana de un astrocito cultivado (derecha).
233
Métodos en biociencias
Figura 9.9: Esquema que demuestra que cuando el punto de captación de luz de la sonda se sitúa
a distancias inferiores a la longitud de onda empleada para iluminar se aumenta el poder de reso-
lución. La intensidad de luz (I) captada por la sonda puede ser de�inida por la expresión I ≈ 1 / d2,
donde “d” es la distancia entre el punto emisor de luz y el punto de captación; por ello, en el punto
A de la imagen superior, I1 es mucho mayor que I2 (nótese que la intensidad es inversamente pro-
porcional al cuadrado de la distancia), exactamente al revés que en el punto B. La discriminación
entre los objetos de los puntos C y D es imposible pues las intensidades captadas por la sonda en
cada punto son muy similares. En la parte inferior de la �igura, al situar la sonda a una distancia
inferior a la de la longitud de onda, se consigue una mayor resolución, pues la diferencia de las in-
tensidades emitidas por cada punto y captadas por la sonda es mucho mayor, hecho que permite
diferenciar puntos más próximos, como ahora es el caso de los puntos C y D.
campo de la biología y también de la química. Por sondas magnetizadas o conductoras, han dado lu-
ejemplo, es posible acoplar anticuerpos a la agu- gar a la aparición de un sin�ín de microscopios de
ja de la sonda y de este modo localizar antígenos fuerza atómica a los que no se prestará atención
sobre la muestra ya que al interaccionar el anti- pues la gran mayoría no se aplican en el campo de
cuerpo con el antígeno se modi�ican muchos de los las biociencias.
parámetros que de�inen el comportamiento de la Las técnicas y modos de procesamiento del
sonda. Esto mismo se puede aplicar para cualquier material biológico para su estudio en el AFM han
molécula que mantenga con cualquier otra una in- avanzado mucho en los últimos años, como de-
teracción especí�ica, como por ejemplo, las lectinas muestra el hecho de la aparición de la metodología
con carbohidratos, secuencias complementarias de crio-AFM; sin embargo, queda todavía mucho cami-
nucleótidos o interacciones ligando-receptor. Mo- no que recorrer en este campo. En cualquier caso
di�icaciones de otro tipo, por ejemplo, preparar la posibilidad de simultanear análisis que permi-
234
Microscopía de barrido por sonda
235
Métodos en biociencias
un lado se pega la sonda y por otro un vibrador 9.4. Microscopio acústico de barrido
piezoeléctrico. Los cambios vibratorios que va ex-
perimentando la sonda al acercarse a la muestra El SAM (scanning acoustic microscope) se diseñó
sirven para ajustar la distancia entre ellas y permi- para observar el interior de estructuras biológicas
ten controlar el escaneo en el eje Z. Estos cambios no transparentes con el �in de causar en la muestra
se detectan mediante un láser enfocado sobre el ex- las menores alteraciones posibles. Sokolov en 1949
terior de la �ibra óptica de la sonda que re�leja luz a fue el primero en observar imágenes acústicas, pero
un PSPD, lo que también permite hacer un registro el primer SAM fue construido por Lemons y Quate
topográ�ico –simultáneo al análisis realizado con la en 1974. La formación de imagen en el SAM es debi-
luz– de modo similar a lo que ocurre en el modo no da sobre todo a la dispersión y re�lexión diferencial
contacto del AFM, donde cambios en los paráme- que los distintos tipos de materiales de la muestra
tros vibratorios generan imágenes topográ�icas. El causan sobre las ondas acústicas.
sistema vibratorio suele ir asociado a un sistema Las ondas ultrasónicas (>20.000 Hz) se
piezoeléctrico clásico que es el responsable del es- propagan mal en el aire pero lo hacen razonable-
caneo 3D del conjunto; aunque también es posible mente bien en medios líquidos y sólidos, y por ello
acoplar un sistema de barrido horizontal (plano se emplean en la formación de imágenes de ma-
X-Y) a la muestra y otro distinto para el vertical (eje terial biológico, y el ejemplo más familiar son las
Z). La otra posibilidad consiste en acoplar el extre- ecogra�ías. Los SAM usan frecuencias que van desde
mo de la sonda a un cantiléver triangular con un los 100 MHz (108 ciclos/s) hasta los 4 GHz (4x109
agujero en su extremo que permite acoplar la pun- ciclos/s) y por ello, en el mejor de los casos, su λ
ta de la sonda. En este caso el control del escaneo es alrededor de 0.3 μm, dato obtenido al aplicar la
lo hace el AFM del que forma parte el cantiléver tra- expresión l = c / ν, donde c es la velocidad de pro-
bajando en modo no contacto. pagación del sonido en el agua (1540 m/s) y ν la
frecuencia. Las longitudes de onda utilizadas en mi-
Desde un punto de vista constructivo y ope-
croscopía óptica también están en el rango de las
racional existen diferentes con�iguraciones de décimas de μm (0.4-0.7 μm), por lo que la capaci-
SNOM, las cuatro más básicas se esquematizan en dad de resolución del SAM podría ser similar a la
la �igura 9.11. del microscopio óptico. Sin embargo, el índice de re-
El SNOM presenta toda una serie de venta- fracción que mide la relación de propagación de la
jas sobre los microscopios vistos anteriormente, luz entre dos medios nunca es mayor de 1.9 y en el
y la primera de ellas es que prácticamente permi- caso de las ondas acústicas puede tener valores de
te trabajar bajo cualquier condición. Además, no es 10, lo que aumenta hasta casi 5 veces el poder de
una técnica destructiva, más allá del daño que pue- resolución del SAM. Otra ventaja a tener en cuen-
da causar la iluminación. Al utilizar señales ópticas ta es que en el SAM no se producen ni aberraciones
reales permite un procesamiento similar o igual esféricas ni cromáticas. Un modo más preciso de
al que se lleva a cabo en la microscopía óptica con calcular el límite de resolución para el SAM es uti-
el �in de obtener imagen, pero a diferencia de la lizar la expresión r = (0.6 x F x c) / (f x D), donde F
microscopía óptica, la de campo cercano puede me- es la distancia focal, f es la frecuencia, y D el diáme-
jorar hasta 20 veces la resolución. tro del focalizador.
236
Microscopía de barrido por sonda
Figura 9.12: Esquema de un SAM (izquierda). Esquema básico de un SAM que ilustra el
modo de escaneo tipo TOF (derecha); “t” representa el tiempo.
La capacidad de un determinado medio para ño punto de la muestra, para formar la imagen del
propagar ondas acústicas recibe el nombre de im- área a estudiar es necesario barrer o escanear la
pedancia Z y depende directamente de la densidad muestra. El sistema de control de barrido permite
del medio (ρ) y de la velocidad de propagación del hacer rastreos en los ejes X, Y y Z, y suele ser un dis-
sonido en él (Z = ρ x c), y es en los puntos donde positivo de tipo mecánico pues dada la resolución
Z varía donde se producen fenómenos de re�lexión de las ondas acústicas no tiene sentido utilizar sis-
diferencial. Otro efecto importante de la materia temas piezoeléctricos similares a los vistos en los
sobre las ondas acústicas es la atenuación del haz microscopios anteriores cuya resolución es de esca-
acústico a medida que este penetra en ella, debido la nanométrica o inferior.
en parte a fenómenos de dispersión y transforma- Existen dos modos básicos de captura de las
ción en calor. El coe�iciente de atenuación aumenta ondas aplicadas a la muestra: el de eco y el de trans-
con el cuadrado de la frecuencia, de modo que, por misión o directo. En el modo de eco se emplean las
ejemplo, utilizando 2 GHz la penetración del haz ondas re�lejadas por la muestra y el mismo conjun-
acústico será de aproximadamente 60 μm. Es obvio to que sirve para producir y enfocar los ultrasonidos
que las altas frecuencias mejoran la resolución pero es utilizado para captarlos y, haciendo el camino
pierden capacidad de penetración. inverso, generar una señal eléctrica que, una vez
El sistema que se encarga de producir, enfo- digitalizada, acabará formando imagen. El modo
car y captar las ondas acústicas está formado por de transmisión utiliza las ondas que se transmiten
cuatro componentes: pulsador, transductor, ele- a través de la muestra y dispone de un sistema de
mento focalizador y acoplante (Figura 9.12). El captación de ultrasonidos similar al que los produ-
pulsador o transmisor se encarga de producir pul- ce pero enfrentado a él.
sos de alto voltaje que inciden sobre el transductor, Los modos de escaneo más usuales en fun-
que es un sistema piezoeléctrico formado por una ción de los planos analizados son escaneos en B y
película de óxido de Zn, recubierta en ambas caras en C; es decir planos verticales Y-Z perpendicula-
por Au u otro metal, que va adosada a la parte pos- res entre sí y paralelos al eje de propagación de las
terior del focalizador. Este es una pieza de cristal de ondas acústicas (B-scan) o planos horizontales X-Y
za�iro (también silicio), que normalmente termi- perpendiculares al eje de propagación de las on-
na en una estructura esférico-cóncava que puede ir das acústicas (C-scan). Múltiples escaneos en C a
desde las decenas de μm a los mm de diámetro. Las diferentes alturas del eje Z (G-scan) son útiles para
ondas acústicas que atraviesan el focalizador con- reconstrucciones tridimensionales de la muestra.
vergen en un punto muy próximo a lo que sería el Un modo de escaneo interesante es el modo TOF
centro de curvatura de la esfera que generaría la (time of �light), que pone de mani�iesto las alteracio-
concavidad. El acoplante es un material que facilita nes o cambios existentes en cada plano analizado
el paso de las ondas acústicas desde el focalizador en función del retraso que se produce en la llegada
hasta la muestra y suele ser de naturaleza acuosa. de la onda acústica a su receptor. Este modo es muy
Como los ultrasonidos son focalizados en un peque- útil en el posicionamiento de las diferentes estruc-
237
Métodos en biociencias
turas que puede haber en el interior de la muestra viesan la muestra terminan chocando contra un
en relación con la super�icie delantera y trasera. Uti- cubreobjetos que está por encima de la muestra y
lizando la primera onda re�lejada al impactar con la que actúa como un detector de dichas ondas. La su-
materia también es posible realizar estudios topo- per�icie del cubreobjetos es rastreada por un láser y
grá�icos, obviamente combinables con estudios de re�lejada hasta un detector de modo que es posible
planos más profundos (Figura 9.12). formar una imagen con las variaciones que la onda
El SAM es un microscopio muy utilizado en acústica causa en el cubre.
ciencia de materiales ya que se usa para la detec- En algunos textos se suele incluir dentro de
ción interna de fracturas, grietas, delaminaciones, los microscopios acústicos a AFMs que operan en
burbujas, �isuras… sin necesidad de desmontar la modo no contacto con frecuencias vibratorias que
pieza a analizar. Las muestras biológicas son bastan- van de los 100 a los 400 KHz. Es cierto que estas fre-
te idóneas para observar con el SAM pues ofrecen cuencias también se usan en los SAM pero los SAM
alto contraste acústico y buena profundidad de pe- y los AFM son microscopios totalmente diferentes,
netración; sin embargo, en el campo de la biociencia basta comparar su modo de funcionar, su resolu-
todavía no es un microscopio muy utilizado, aunque ción o su modo de interacción con la muestra.
ya ha rendido espectaculares resultados en el estu-
dio de algunas estructuras intracelulares como el
citoesqueleto. La posibilidad de uso de todo tipo de
material biológico le hace interesante, pero el hecho
de poderlo utilizar con muestras vivas sin causar Bibliografía
daños le hace especialmente atractivo. Más concre-
tamente, los cultivos celulares son un material más
Acoustic Microscopy: Fundamentals and Applications.
que idóneo para su observación con el SAM, pues 2008.
con ellos se pueden utilizar las frecuencias más
altas sin alcanzar el límite de su capacidad de pe- Maev RG. Wiley-VCH. ISBN 978-3527407446.
netración. Atomic Force Microscopy for Biologists. 2009.
Una variante del SAM es el SLAM (scanning Morris VJ, Kirby AR, Gunning AP. World Scientific. ISBN 978-
laser acoustic microscope), que mejora la toma de 1848164673.
muestras a tiempo real del SAM y le hace espe- Atomic Force Microscopy in Liquids. Biological Applica-
tions. 2012.
cialmente idóneo para estudio en material vivo.
Normalmente trabaja con frecuencias que van des- Baró AM, Reifenberger G. Wiley-VCH. ISBN 978-
de 100 a 500 MHz, lo que permite el análisis de 3527327584.
muestras más gruesas pero, por el contrario, con Scanning Probe Microscopy. 2011.
peor resolución. Funciona aplicando, desde aba- Tomczak N, Goh KEJ. World Scientific. ISBN 978-
jo, ondas acústicas a la muestra de forma análoga a 8914324762.
como lo hace el SAM. Una vez que estas ondas atra- Scanning Probe Microscopy. The Lab on a Tip. 2004.
238
10.
Histoquímica
e histoenzimología
Raquel R. Gragera
Joaquín Plumet
Figura 10.1: Formación de compuestos de adición por reacción del reactivo de Schiff con aldehídos.
vestigar no es hidrosoluble, en su determinación profundas del propio corte histológico. Para faci-
histoquímica solo será necesario mantener dicha litar la penetración de los reactivos en los cortes,
insolubilidad. En el caso de ser hidrosolubles su estos pueden tratarse con dimetilsulfóxido (DMSO),
determinación histoquímica requerirá su precipita- un disolvente que aumenta la permeabilidad de las
ción in situ. La mayoría de las reacciones químicas membranas biológicas. Sin embargo, será necesario
son dependientes de la temperatura, teniendo lu- desarrollar paralelamente los controles adecuados,
gar a mayor velocidad al aumentar la temperatura para veri�icar su efecto sobre la estructura.
de la reacción. Teniendo ello en cuenta las reaccio- Una vez �inalizada la reacción histoquímica, los
nes histoquímicas veri�icadas a baja temperatura cortes histológicos deben ser lavados en soluciones
revelarán las localizaciones en las que existan las tamponadas y montados convenientemente, tenien-
mayores concentraciones de la sustancia que se in- do en cuenta que los medios de montaje no deben
vestiga. También puede resultar útil la reacción a alterar la estabilidad del producto �inal de la reac-
distintas temperaturas, identi�icando diferentes ción. En general los medios de montaje más usados
isoformas de una determinada enzima. son el bálsamo del Canadá, el CAEAX (bálsamo del
Las reacciones histoquímicas o las incu- Canadá sintético), el DePeX, la glicerina-gelatina,
baciones pueden llevarse a cabo sobre cortes la para�ina líquida o la para�ina espesa y el Fluoro-
histológicos adheridos a portaobjetos o �lotando pan®.
en un pocillo que contenga el medio de reacción
o incubación. Como muchas de ellas se desarro-
10.1.1. Determinación de radicales alifáticos:
llan a 37 ºC, será necesario evitar la evaporación aldehídos y cetonas
del medio en atmósfera húmeda o utilizando
pocillos cerrados herméticamente. Es aconsejable A excepción de las �ibras elásticas, resulta excepcio-
desarrollar las reacciones con agitación ligera o nal que los tejidos biológicos exhiban compuestos
vibración, facilitando así la impregnación de los aldehídicos y cetónicos libres, por lo que solo son
cortes y evitando que por gravedad se depositen en efectivos después de pretratamientos capaces de
el fondo del pocillo. originar estos grupos. El reactivo más utilizado es
El reactivo histoquímico debe ser difusible, el reactivo de Schiff, formado a partir de fuscina bá-
para penetrar rápidamente y llegar simultáneamen- sica que al reaccionar con grupos aldehído origina
te a las diferentes regiones del corte histológico. La compuestos de adición coloreados rojo/rojo-viole-
importancia es obvia: si su penetración es lenta, el ta tras la alteración del cromóforo generando una
producto de reacción formado puede impedir la pe- forma con conjugación extendida causante del co-
netración del resto del reactivo hacia zonas más lor (Figura 10.1).
240
Histoquímica e histoenzimología
Existe cierta controversia acerca de la estruc- — Protección del ácido carboxílico mediante
tura del producto �inalmente formado, con uno su esteri�icación con metanol en presen-
o dos restos aldehídicos incorporados, si bien la cia de un ácido (Figura 10.3), de forma
forma di-sustituida parece la más probable. El me- que el éster formado no reacciona con
canismo de esta reacción parece complejo y está colorantes básicos ni produce metacro-
aún sujeto a discusión. Sin embargo, en la prácti- masia.
ca histoquímica pocos son los casos en los que la — Inhibición de la metacromasia con pre-
reacción positiva con el reactivo de Schiff no sea in- tratamiento con acetato de uranilo.
dicativo de la presencia de aldehídos.
241
Métodos en biociencias
Se consideran dos tipos de reacciones histo- mático todo compuesto cíclico con dobles enlaces
químicas que sirven para poner de mani�iesto los conjugados y 4n+2 electrones deslocalizados en su
dobles enlaces: las reacciones de oxidación y las de estructura, siendo n un número entero igual o ma-
adición de halógenos. yor que 0.
Los principales sistemas aromáticos de interés
— Oxidación con formación de peróxidos y al- en Histoquímica (Figura 10.6) son el fenol (pre-
dehídos, utilizando reactivos como ácido sente en la tirosina, adrenalina, noradrenalina), el
perfórmico-reactivo de Schiff y ácido pera- indol, el pirrol (en el triptófano, serotonina y me-
cético-reactivo de Schiff. El proceso implica latonina), el imidazol (en la histidina), la pirimidina
la formación del epóxido por acción del (en la citosina, timina o uracilo) y la purina (en la
perácido, transformación del epóxido en adenina y guanina).
aldehído y determinación del mismo por
La determinación histoquímica se basa, en pri-
medio del reactivo de Schiff (Figura 10.5).
mer lugar, en la formación de sales complejas de
— Adición de Br2: la reacción con Br2 permi- hierro de color azul-violeta en presencia de una
te la identi�icación de dobles enlaces por la solución acuosa de cloruro férrico, neutra o débil-
desaparición del color violeta característi- mente ácida. Los procedimientos más especí�icos
co del bromo. En histoquímica la reacción son las reacciones de Millon y la azorreacción.
se realiza incubando los cortes histológicos
con una solución de bromo en cloroformo,
en ácido acético o tetraclorometano (Figu- Reacción de Millon
ra 10.5).
Se utiliza para evidenciar la presencia de tirosina en
las proteínas. Se basa en el tratamiento de los cortes
10.1.5. Determinación de compuestos aromá- con una sal de mercurio y nitrito sódico en solución
ticos muy ácida. En estas condiciones el nitrito sódico ge-
nera ácido nitroso que pierde agua para dar lugar
El concepto de aromaticidad y de compuestos aro- al catión nitrosonio. La reacción de este con el fe-
máticos está asociado a su estabilidad relacionada nol tiene lugar en posición orto proporcionando el
con su estructura electrónica. Esta estabilidad ex- correspondiente nitrosoderivado. Este último, en
plica que tiendan a experimentar procesos de equilibrio con su forma tautómera, reacciona con la
sustitución y no de adición, a �in de preservar su sal mercúrica formando un complejo mercurial de
estructura electrónica básica. Se de�ine como aro- color rojo. Esta reacción se produce con todos los
242
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.8: Reacción de copulación de los fenoles con una sal de diazonio
para dar un colorante azoico o azocolorante.
243
Métodos en biociencias
Figura 10.11: Reacción de reducción del ferricianuro férrico y algunas estructuras que pueden determinar-
se por este método.
244
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.14: Reacción de los aldehídos con hidrazinas sustituidas dando lugar a hidrazonas que se
revelan con sales de diazonio formando colorantes azoicos visibles microscópicamente.
245
Métodos en biociencias
10.1.8. Determinación de mucosustancias áci- Figura 10.16: Estructura del azul de me-
das (glicosaminoglicanos) tileno y del azur A.
246
Histoquímica e histoenzimología
dal
Los grupos ácidos libres de los tejidos tienen
a�inidad por el Fe3+ coloidal a pH=2.0. Esta deter-
minación comprende dos etapas: en la primera,
no visible a microscopía óptica, el hierro coloidal
reacciona con los grupos ácidos. En la segunda, el
compuesto formado se revela mediante la reacción
del azul de Prusia, usando HCl y ferrocianuro potá-
sico (Figura 10.19).
Método de la diamina
Figura 10.19: Técnica del hierro coloidal para el revelado de mucosustancias ácidas.
247
Métodos en biociencias
248
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.26: Método del cloruro de mercurio para la determinación de plasmalógenos, factor acti-
vador de plaquetas (PAF).
249
Métodos en biociencias
Figura 10.27: Técnica del PAN (ácido perclórico-naftoquinona) para revelar colesterol y derivados.
(Figura 10.25). Al ser el reactivo hidrosoluble, solo Técnica del resorcinol (1.3-dihidroxibenceno)
darán reacción positiva los fosfoglicéridos hidró-
�ilos. No reaccionan los es�ingolípidos porque el Se basa en la capacidad del resorcinol para reaccio-
nar con los aldehídos que se producen durante la
ácido graso se une a es�ingosina por un enlace ami-
hidrólisis con HCl del ácido neuramínico y del ácido
da no reactivo en las condiciones empleadas.
siálico. Como consecuencia de la reacción se forma
un producto �inal de color rojo.
Método del cloruro de mercurio
Se basa en la reacción entre el mercurio y los en- 10.1.14. Determinación del colesterol
laces éter , β-insaturados con formación de un y sus derivados
compuesto de adición mercurial. Este, al reaccionar
Técnica del ácido perclórico-naftoquinona (PAN)
con difenilcarbazona origina un quelato de color
azul-violeta (Figura 10.26). Se trata de una técnica muy especí�ica basada en la
reacción del colesterol, y otros esteroides de con-
�iguración 3-hidroxi-Δ5 ó 3-hidroxi-Δ3.7, con ácido
10.1.13. Determinación de glicolípidos
perclórico. En la reacción se forma colesta-3.5-die-
Técnica del PAS no que, en presencia de 1.2-naftoquinona-4-sulfato,
origina un pigmento azul oscuro (Figura 10.27).
Permite identi�icar la presencia de 1.2-glicoles
en las hexosas de los gangliósidos y cerebrósidos
Reacción de Lieberman-Schultz
mediante la reacción PAS positiva en cortes his-
tológicos tratados previamente con bromo (que Consiste en el tratamiento del colesterol y sus de-
bloquea los dobles enlaces) o tratados previamente rivados con alumbre de hierro o cloruro férrico,
con 2.4-dinitrofenilhidrazina (que bloquea los alde- seguido de tratamiento con una mezcla de anhí-
hídos originados a partir de los enlaces ole�ínicos drido acético y ácido sulfúrico (Figura 10.28) con
tras la reacción con ácido perfómico). formación de un producto �inal verdoso.
250
Histoquímica e histoenzimología
251
Métodos en biociencias
Figura 10.30: Esquema de la reacción que permite revelar los grupos amino de las proteínas cuando reaccio-
nan con aloxán.
Figura 10.32: Revelado de grupos amino de las proteínas mediante reacción con DNFB y una sal de dia-
zonio para formar un colorante azoico.
252
Histoquímica e histoenzimología
253
Métodos en biociencias
Figura 10.35: Estructura de las moléculas de verde de metilo y pironina Y usados en la reacción di-
ferencial para determinar ácidos nucleicos.
del pH, debido a las reacciones de ionización de las La metodología a seguir para efectuar un es-
bases. Es recomendable un pretratamiento con áci- tudio diferencial de cada ácido nucleico implica el
do tricloroacético en frío, eliminando del tejido las pretratamiento de algunas preparaciones con ribo-
sustancias que absorben en la misma longitud de nucleasa y la posterior reacción diferencial.
onda.
254
Histoquímica e histoenzimología
Son diversas las formas de nombrar las enzi- — Clase EC 5, Isomerasas. Catalizan la in-
mas: bien se les asignan nombres particulares, que terconversión de isómeros. Incluyen las
no obedecen a ninguna regla sistemática o nombres epimerasas, mutasas, racemasas, tauto-
sistemáticos, que consisten en un nombre con tres merasas, etc.
partes haciendo referencia al sustrato preferente, — Clase EC 6, Ligasas. Catalizan la unión de
el tipo de reacción catalizada y una terminación en
dos sustratos con la hidrólisis simultá-
–asa. La Unión Internacional de Bioquímica y Biología
nea de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP,
Molecular ha desarrollado una nomenclatura para
identi�icar a las enzimas basada en los denomina- etc.). Incluyen las carboxilasas, peptido-
dos Números EC (enzyme comission): así, cada enzima sintetasas, etc.
queda registrada por una secuencia de cuatro núme-
En histoenzimología, a diferencia de lo que ocu-
ros precedidos por las letras «EC». El primer número
rre con las enzimas ligadas a estructuras celulares
clasi�ica a la enzima según su mecanismo de acción.
(desmoenzimas), la determinación de las formas
En función de su actividad catalítica las enzi-
solubles de las mismas (lioenzimas) constituye un
mas se clasi�ican en seis clases:
inconveniente. El problema se complica ante la po-
— Clase EC 1, Oxidorreductasas. Catalizan re- sibilidad de que muchas de las enzimas asociadas a
acciones de oxidorreducción, es decir, de estructuras puedan desligarse de ellas por la acción
transferencia de hidrógeno o electrones de la propia técnica histoquímica. Para la inmovili-
de un sustrato a otro. Precisan la colabora- zación de las enzimas se han utilizado numerosos
ción de las coenzimas de oxidorreducción procedimientos, de los que solo los líquidos �ijado-
(NAD+, NADP+, FAD) que aceptan o ceden res de proteínas (aldehídos, alcoholes y acetona)
los electrones correspondientes. Tras la han demostrado ser verdaderamente efectivos.
reacción enzimática queda modi�icado
el grado de oxidación de las enzimas, por Es importante tener en cuenta que debe
lo que deben ser transformadas antes de veri�icarse la especi�icidad de las reacciones intro-
actuar de nuevo. Incluyen las implicadas duciendo en la preincubación o durante el curso de
en respiración y fermentación: deshi- la incubación enzimática inhibidores especí�icos.
drogenasas, aminooxidasas, deaminasas,
catalasas, etc.
— Clase EC 2, Transferasas. Trans�ieren un 10.2.1. Hidrolasas
grupo químico activo (obtenidos de la
ruptura de ciertas moléculas), diferen- Aunque pueden actuar también como transferasas,
te al hidrógeno, de un sustrato a otro. Su catalizando la transferencia de algún metabolito
clasi�icación se basa en la naturaleza quí- para formar nuevos enlaces éster o amida, o como
mica del sustrato atacado y del aceptor. enzimas de síntesis, desde el punto de vista histo-
Suelen actuar en procesos de intercon- químico, estas enzimas suelen ser identi�icadas por
versiones de azúcares, aminoácidos, etc. su actividad hidrolítica.
Incluyen las transaldolasas, transcetola-
sas, transaminasas, etc.
— Clase EC 3, Hidrolasas. Veri�ican reaccio-
nes de hidrólisis de enlaces C-N o C-O,
concomitantemente a la hidrólisis del
agua. Se clasi�ican en función del tipo
de enlace sobre el que actúan, de forma
que se incluyen en este grupo las gluco-
sidasas, lipasas, peptidasas, esterasas y
fosfatasas.
— Clase EC 4, Liasas. Catalizan reacciones
de ruptura de sustratos (enlaces C-C, C-O,
C-N y C-S) y raramente de soldadura, en
cuyo caso se denominan sintetasas. Inclu- Figura 10.36: Revelado de esterasas mediante el uso de acetato de
yen las aldolasas, las decarboxilasas, etc. 1-naftilo como sustrato y formación �inal de un colorante azoico.
255
Métodos en biociencias
Lipasas
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Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.41: Esquema de los tres pasos de la reacción de Koelle para la demostración de acti-
vidad colinesterasa.
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Métodos en biociencias
Figura 10.43: Método del colorante azoico para la demostración de fosfatasas ácidas.
258
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.46: Revelado de actividad fosfatasa ácida siguiendo el método del fosfato de plomo de Gomori.
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Métodos en biociencias
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Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.49: Esquema de las reacciones histoenzimológicas que tienen lugar en la demostración
de la actividad cis-aconitasa.
quinolina-β,D-glucurónido y una sal de diazonio, las endopeptidasas, las primeras actúan cerca de
formándose como producto �inal el correspondien- los extremos de las cadenas polipeptídicas: si ac-
te colorante azoico. túan en el extremo N-terminal se denominan
aminopeptidasas, y si lo hacen cerca del C-terminal
Disacaridasas carboxipeptidasas. Las endopeptidasas, sin embar-
Actúan hidrolizando disacáridos. Se demuestran in- go, actúan en las regiones internas de las cadenas
cubando en un medio que contenga el disacárido, polipeptídicas, y se clasi�ican en función de sus me-
glucosa-oxidasa, metosulfato de fenazina y una sal canismos catalíticos.
de tetrazolio (TNBT), formándose un formazano La identi�icación de estas enzimas en general
como producto �inal (Figura 10.48).
se realiza usando como sustrato proteinato de pla-
ta. La plata liberada durante la actividad enzimática
Peptidasas
se combina con bromo, formándose bromuro de
Son enzimas que hidrolizan enlaces peptídicos. plata, que se convierte �inalmente en plata metálica
Se reconocen dos subclases: las exopeptidasas y al efectuar una reducción con hidroquinona.
261
Métodos en biociencias
Figura 10.51: Esquema desarrollado en la reacción de Nadi para revelar citocromo oxidasa a través de la
formación de azul de indofenol.
262
Histoquímica e histoenzimología
comporta como un donador arti�icial de protones, También se utiliza la reacción de Burstone, que
sustituyendo al citocromo reducido. consiste en incubar los cortes con p-amino-N,N-di-
Una segunda técnica, la polimerización de fenilamina y p-metoxi-p-amino-N,N-difenilamina,
diaminas, se basa en la formación de políme- originándose polímeros capaces de quelarse con
ros osmió�ilos de diaminas cuando estas resultan
metales, como cobalto o plomo. El polímero quela-
oxidadas. Se utilizan como reactivos diaminas p-sus-
tituidas, como N-bencil-p-fenilendiamina (BPDA), do con cobalto puede, posteriormente, reaccionar
3.3´-diaminobencidina (DAB) o N,N´-bis(p-amino- con sulfuro amarillo de amonio, dando origen a sul-
fenil)-1.3-etilendiamina (BAXD). furo de cobalto negro, visible a microscopía.
Figura 10.54: Revelado de la actividad MAO a través de la formación de un producto �inal coloreado
formado en una reacción de acoplamiento de una peroxidasa exógena.
Figura 10.55: Esquema de reacción utilizado para revelar actividad histaminasa a través de una peroxi-
dasa exógena acoplada.
263
Métodos en biociencias
Figura 10.56: Esquema de la reacción usada en la demostración de la actividad urato oxidasa a través del acoplamiento de una
peroxidasa exógena.
264
Son oxidorreductasas que catalizan el transporte de electrones y protones desde un
sustrato donador hasta un aceptor, diferente al oxígeno molecular; si bien, en último
término pueden ser transportados por la cadena respiratoria hasta el oxígeno
Histoquímica e histoenzimología
molecular. El protocolo experimental que conduce a la demostración histoquímica de
estas enzimas se realiza siguiendo la figura 10.58.
Figura 10.58. Esquema de las reacciones necesarias para la detección histoenzimológica de las
deshidrogenasas anaerobias.
Figura 10.58: Esquema de las reacciones necesarias para la detección histoenzimológica de las
deshidrogenasas anaerobias.
265
Métodos en biociencias
266
Histoquímica e histoenzimología
267
Métodos en biociencias
Figura 10.61: Fase oxidativa de la vía de las pentosas y reacciones para demostrar la glucosa-6P-deshidrogenasa y
6-fosfogluconato deshidrogenasa, acopladas a la formación de formazanos.
cortes en medios que contengan etanol, nato deshidrogenasa, enzima esta última activada
NADH y una sal de tetrazolio. por iones Mg2+ ó Mn2+.
La reacción histoquímica consiste en incubar
Enzimas implicadas en la vía de las pentosas los cortes histológicos en un medio provisto del
sustrato especí�ico de cada enzima (glucosa-6-fos-
Una ruta alternativa al catabolismo glicolítico de la fato o 6-fosfoglucono-1.5-lactona respectivamente),
glucosa es la que se produce a través de la ruta de las NADP+, una sal de tetrazolio y, Mg2+ ó Mn2+ en el caso
pentosas fosfato, ruta del fosfogluconato o ruta de de la 6-fosfogluconato deshidrogenasa. La formación
Warburg. A través de esta ruta citoplásmica la glu- del formazano correspondiente será demostrativo
cosa se convierte en otros azúcares aprovechables de la actividad de la enzima (Figura 10.61).
en la obtención de energía; aunque su principal �i-
nalidad es la de producir NADPH para la biosíntesis Enzimas del metabolismo del glucógeno
reductora y ribosa-5-fosfato, precursor de nucleóti- y otros hidratos de carbono
dos y ácidos nucleicos. Esta ruta es particularmente
importante en tejidos en los que se produce una ac- El glucógeno, polímero rami�icado de moléculas de
tiva síntesis de ácidos grasos y colesterol. glucosa unidas mediante enlaces α(1→4), repre-
En esta vía se diferencian dos fases, una senta la principal forma de reserva de hidratos de
primera fase oxidativa en la que se forma ribu- carbono en las células animales. Dos son los proce-
losa-5-fosfato, CO2 y NADPH, y una segunda fase sos implicados en el metabolismo del glucógeno, su
no oxidativa. Son dos las enzimas de esta vía que síntesis, la glucogenogénesis, y su degradación, la
pueden demostrarse histoenzimológicamente: la glucogenolisis.
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa y la 6-fosfogluco-
268
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.63: Reacción acoplada con una sal de plomo para formar �inalmente sulfuro de plomo y revelar la actividad de
la ornitina transcarbamilasa.
269
Métodos en biociencias
270
Histoquímica e histoenzimología
Figura 10.65: Esquema del desarrollo de las reacciones con ferricianuro de potasio
o con el reactivo del Ellmans que permiten la demostración histoenzimológica de la
actividad acetilcolinesterasa.
posible estudiar la actividad de la glucógeno fosfori- cuerpos cetónicos (acetoacetato, acetona y β–hi-
lasa incubando los cortes en un medio que contenga droxibutirato).
glucosa-1-fosfato, ATP, Mg2+ y etanol, demostrán- Una de las reacciones clave de esta ruta es la
dose el glucógeno formado durante la reacción catalizada por la β-hidroxibutirato deshidrogenasa,
mediante la técnica del PAS. que rinde β-hidroxibutirato a partir de acetoa-
cetato, en presencia de NADH. Su determinación
histoquímica se realiza en presencia del sustrato de
Enzimas implicadas en la síntesis y degradación la enzima y una sal de tetrazolio.
de ácidos grasos
Todas las enzimas �lavínicas que intervie- Enzimas de la síntesis de las hormonas esteroi-
nen en la síntesis y degradación de los ácidos deas
grasos son susceptibles de ser investigadas his- Todas las esteroide-deshidrogenasas son depen-
toenzimológicamente, gracias a la formación de los dientes de NAD+ ó NADP+. En su demostración se
correspondientes formazanos, al incubar los cortes precisa incubar los cortes en medios que contengan
histológicos en medios que contengan el sustrato el sustrato apropiado de cada enzima, la coenzima
adecuado, un aceptor intermediario de electrones y y una sal de tetrazolio, visualizándose la actividad
protones y una sal de tetrazolio (Figura 10.62). enzimática a través de la formación del correspon-
diente formazano.
Enzimas de la cetogénesis
271
Métodos en biociencias
272
11.
Técnicas radiactivas
Guillermo Bodega
Lilian Puebla
Las técnicas radiactivas se basan en el empleo de ra- sótopos. Esto ha provocado que existan numerosas
dioisótopos como trazadores, entendiendo que un variantes metodológicas, lo que hace imposible
trazador es aquella sustancia que, de algún modo, abordar todas ellas en un libro como este, conce-
mani�iesta su presencia y permite al investigador bido con el propósito más especí�ico de estudiar
seguirla. El trazador ideal es aquel cuya presencia aquellas técnicas de uso más actual en el entorno
no causa efecto alguno sobre el sistema a anali- de las biociencias relacionadas con la biología ce-
zar y, en este sentido, los radioisótopos son uno de lular y molecular, la bioquímica, la genética o la
los mejores trazadores, especialmente para estu- �isiología. En consecuencia, se prestará atención a
dios a corto plazo; a largo plazo sus propiedades la histoautorradiogra�ía y a dos aplicaciones de la
radiactivas pueden causar efectos sobre el sistema espectrometría de centelleo: los experimentos de
biológico a estudiar. pulso y caza y el radioinmunoanálisis. Es importan-
El gran inconveniente de las técnicas radiac- te dejar constancia, desde un principio, que la gran
tivas es su peligrosidad, hecho que, además, se diferencia entre las técnicas autorradiográ�icas y las
ve agravado por el retraso en la aparición de sus espectroscópicas es el modo de detección de la ra-
efectos tóxicos. Sin embargo, con respecto a otras diación: en las primeras se utiliza una emulsión de
técnicas, tienen la ventaja de una altísima sensibili- tipo fotográ�ico, en las segundas se utilizan conta-
dad. En el apogeo de su uso, década de los 60 y 70, la dores/detectores. Por último, también se estudiará
sensibilidad de las pruebas químicas era del rango la radiometría, como método de datación paleon-
μM; sin embargo, con el uso de isótopos radiactivos tológica basado en la determinación de isótopos
la sensibilidad alcanzaba el rango pM. En cualquier radiactivos.
caso, como regla de elección, si alguna otra técnica En el ámbito de las técnicas radiactivas existen
puede ofrecer los mismos resultados o muy pare- dos términos, caliente y frío, que es necesario ex-
cidos a los que se obtienen usando una técnica que plicar por su uso cotidiano. La molécula caliente es
emplea isótopos radiactivos, conviene dejar a un aquella que incorpora el isótopo radiactivo, la fría
lado esta última. no lo lleva. Por ejemplo, en una técnica en la que se
En el campo de la biología existen numerosos estuviese usando 3H-Leu, se hablaría de Leu calien-
ámbitos donde se utiliza la detección de radioi- te si se hace referencia a la que incorpora el tritio, y
Métodos en biociencias
11.1. Radioisótopos
Para empezar, un poco de historia. Röntgen descu- 11.1.1. Tipo de emisión radiactiva
brió los rayos X en 1895 y Becquerel, un año más
tarde, demostró que determinados elementos, Fue Rutherford, entre 1898 y 1902, el primero en
uranio por ejemplo, emitían radiación de forma es- darse cuenta de que existían tres tipos principales
pontánea. El término radiactividad fue acuñado por de radiación nuclear: emisión de partículas α, emi-
Marie Curie (1898), y el matrimonio Joliot-Curie sión de partículas β y radiación γ (Figura 11.1), que
consiguió la producción de elementos radiactivos se pueden emitir de forma independiente o simul-
de forma arti�icial en la década de los 30. tánea. Estos tres tipos de emisión radiactiva son de
Todos los átomos de un elemento tienen el origen nuclear, a diferencia de los rayos X, que es
mismo número de protones (Z); sin embargo, no emisión radiactiva de origen cortical emitida cuan-
todos poseen el mismo número de neutrones (N). do los electrones cambian de órbita en un átomo.
También existe la emisión de neutrones, que tiene
A estos átomos con diferente número de neutrones
lugar en procesos de fusión o �isión nuclear, y no se
se les llama isótopos. En general, los isótopos son
considerarán en este capítulo pues se hará en el ca-
radiactivos cuando se produce una combinación
pítulo 13.
inestable de protones y neutrones. Por ejemplo,
en el caso del H, que puede poseer 0, 1 o 2 neutro- Las partículas α están formadas por dos pro-
nes, solo el último isótopo, llamado tritio (3H), es tones y dos neutrones por lo que tienen carga
positiva y masa; equivalen a un núcleo de Helio. La
radiactivo pues es el que posee esta relación más
detección de partículas α no es habitual pues al ser
desproporcionada.
absorbidas por la misma muestra se detectan mal
Cuando hay una combinación de protones y y, además, hay pocos radioisótopos que las emitan
neutrones inestable el núcleo tiende a liberar ener- que se puedan usar en el material biológico. Las
gía (desintegrarse) para alcanzar una con�iguración partículas β tienen una masa pequeña (la misma
más estable. La liberación de energía se suele dar que la del electrón) y su carga puede ser negativa o
en forma de emisión de partículas y/o radiación positiva. Las partículas β negativas son electrones
electromagnética. Llegados a este punto, conviene moviéndose a gran velocidad. Las partículas β posi-
de�inir radiactividad y radiación, pues son términos tivas o positrones se emiten cuando la relación N/Z
que, de forma incorrecta, se suelen intercambiar es menor que la estable. La energía que llevan aso-
habitualmente. La radiactividad es una propiedad ciada las partículas β emitidas por un radioisótopo
�ísica de la materia que implica la existencia de áto- concreto es muy diferente y la representación grá-
mos inestables y cuyo efecto es la radiación, que es �ica del porcentaje de partículas en función de su
la emisión de energía por parte de esos átomos; por energía es conocida como su espectro de emisión
ello, la radiactividad no se emite, se posee o no se de energía, especí�ico para cada radioisótopo. Dos
posee. parámetros importantes que derivan del espectro
Las características más importantes que de�i- de emisión de energía son la energía máxima y la
nen a un isótopo radiactivo son tres: (1) el tipo de energía media, que suele ser un tercio de la máxi-
emisión radiactiva, (2) la energía que lleva asociada ma (Figura 11.2).
dicha emisión y (3) su periodo de semidesintegra- La radiación γ es radiación electromagnéti-
ción. ca emitida en forma de quanta o fotones, que no
274
Técnicas radiactivas
Figura 11.2: Espectro de emisión de energía. Cuanto más inestable es un isótopo, mayor es la
probabilidad de su desintegración. El periodo de se-
midesintegración (t1/2) es el tiempo necesario para
que se desintegren la mitad de los átomos radiac-
tienen ni carga ni masa, y cuya energía es inversa- tivos de una muestra. Este parámetro no se debe
mente proporcional a la longitud de onda que llevan confundir con la «vida media» (τ), que es el pro-
asociada. Los fotones emitidos en este tipo de desin- medio de vida de un átomo antes de desintegrarse.
tegración no presentan un espectro de distribución Obviamente, ambos son conceptos diferentes, pero
de energía pues llevan asociados valores discretos. están relacionados, pues t1/2 = τ x ln 2.
Además de la vida media �ísica, otro paráme-
tro interesante en relación con los elementos que se
11.1.2. Poder de penetración emplean como radioisótopos es la vida media bio-
lógica, que hace referencia a la tasa de recambio
Las partículas α poseen un escaso poder de pene-
de dicho elemento en el organismo. La vida me-
tración ya que, debido a su tamaño, interaccionan
dia efectiva, parámetro que considera la vida media
fácilmente con la materia. Por el contrario, la radia-
biológica y la �ísica, es un dato de interés para anali-
ción γ posee un gran poder de penetración pues, al
zar la peligrosidad de un compuesto (Cuadro 11.1),
ser radiación electromagnética, su interacción con
y viene de�inida por la siguiente expresión, donde
la materia es menos probable. Las partículas β pre-
Ve es la vida media efectiva y Vb y Vf la vida media
sentan un poder de penetración bastante variable
biológica y �ísica respectivamente:
pues la energía que llevan asociada también puede
ser muy diferente. Por ejemplo, la partícula β del tri- Ve = (Vb x Vf) / (Vb + Vf)
tio solo viaja unos pocos μm y la detiene el vidrio,
275
Métodos en biociencias
Isótopo Emisión (Energía en MeV) Vida media Vida biológica Vida efectiva
3
H β- (0.017) 12.43 años 19 días 19 días
14
C β- (0.154) 5730 años 180 días 180 días
24
Na β- (1.39) γ (1.37 –2.25) 14 horas 19 días 14.64 horas
32
P β- (1.71) 14.3 días 3 años 14.1 días
35
S β- (0.16) 87.4 días 90 días 44.3 días
42
K β- (3.60 – 2.10) γ (1.50) 12 horas 16 días 11.4 horas
45
Ca β- (0.25) 164 días 73 años 163 días
59
Fe β- (0.27 – 0.46) γ (1.29 – 1.10) 45.1 días 3.4 años 43.5 días
60
Co β- (0.31) γ (1.17 – 1.33) 5.3 años 8.1 días 8.1 días
125
I γ (0.035) 60 días 138 días 42 días
131
I β (0.61 – 0.34)
-
γ (0.36 – 0.63) 8.04 días 156 días 7.7 días
276
Técnicas radiactivas
sólido y el contador de centelleo líquido. Los con- La desintegración de los átomos radiactivos dentro
tadores de centelleo se basan en la propiedad de de un recipiente genera una emisión de radiación
algunas moléculas, llamadas fosforescentes, cen- que es absorbida por una molécula �luorescente
telleantes o luminiscentes, de absorber parte de la (centelleante o luminiscente). La emisión de luz de
energía de la emisión radiactiva y liberarla en forma esta molécula es detectada, ampli�icada y su valor
de luz; por ello, el conjunto de técnicas que utilizan transformado en cuentas por minuto. Las muestras
este tipo de contadores también se denomina es- se preparan mezclando el material que incorpora
pectrometría de centelleo. los elementos radiactivos con las moléculas cente-
lleantes. Como el isótopo radiactivo y la molécula
�luorescente están en contacto muy íntimo o próxi-
11.2.1. El contador Geiger-Müller mas se puede medir la emisión de radiación aun en
los casos de emisiones de muy baja energía o muy
El contador Geiger-Müller sirve para detectar y me- bajo poder de penetración.
dir radiación ionizante ya que su fundamento se En los sistemas líquidos, el líquido de centelleo
basa precisamente en la capacidad de ionización de contiene: (a) un disolvente orgánico (normalmen-
algunos tipos de radiación. El contador Geiger-Mü- te tolueno o xileno), (b) un �luorescente primario
ller más usado es el llamado de ventana terminal ya (PPO, PBD, antraceno o naftaleno) y (c) un �luo-
que posee un tubo lleno de un gas inerte (He, Ne o rescente secundario (POPOP, dmPOPOP (dimetil
Ar) a baja presión que se ioniza por efecto de la ra- POPOP) o BBOT). Mezclas de uso habitual son las
diación que penetra a través de una ventana muy de los compuestos derivados del feniloxazol: PPO
delgada de mica, berilio o Mylar, por lo que en el (300-350 nm de λ de excitación-emisión), POPOP
interior del tubo se generan electrones e iones posi- (350-410 nm) y dmPOPOP (370-430 nm). La ener-
tivos. Los primeros impactan con un �ilamento que gía de las partículas β es absorbida por el disolvente,
existe dentro del tubo y que funciona como ánodo, excitando sus moléculas. La radiación liberada por
los segundos lo hacen con las paredes del tubo, que el disolvente es absorbida por el �luorescente pri-
funcionan como cátodo (Figura 11.4). Esta diferen- mario que la emite en el UV cercano. Esta emisión
cia de potencial inicial que se genera en el interior en UV no es bien captada por los fotocátodos y, por
del tubo induce la ionización de más átomos del gas, ello, se hace necesaria la presencia de un �luores-
proceso conocido como avalancha, generando una cente secundario que capta la radiación UV y emite
potente respuesta eléctrica (1 a 10 V), por ello fácil en el visible (Figura 11.5). Por esto, al �luorescente
Figura 11.5: Esquema del proceso de excitación que sucede en el medio líquido.
277
Métodos en biociencias
278
Técnicas radiactivas
poliacrilamida o papel de nitrocelulosa; también sección e irradiar el conjunto con rayos X. Tras el
puede servir como método de semicuanti�icación. procedimiento de revelado y �ijado, el material se
Básicamente, consiste en incorporar un compues- examina al microscopio óptico.
to marcado radiactivamente en el ser vivo, obtener La mayoría de los radioisótopos utilizados en
la muestra biológica que ha incorporado el elemen- estas técnicas emiten radiación β, y se suelen cla-
to radiactivo, recubrir la muestra con una emulsión si�icar en función de su energía asociada como de
fotográ�ica y, tras un tiempo de impresión, revelar alta (32P), media (14C y 35S) o baja energía (3H). De
la emulsión de modo que sobre la muestra apa- forma poco habitual también se usan radioisótopos
rece marcaje en los lugares donde se localiza el que emiten radiación α, como el Po y el Th.
radioisótopo marcador. El empleo de la emulsión
fotográ�ica se puede considerar un método tra-
El procesado del tejido
dicional pues gradualmente va siendo sustituido
por sistemas de detección más modernos que de- La molécula a estudiar (DNA, RNA, proteínas, lípi-
tectan la radiación y forman imagen utilizando dos…) siempre debe considerarse para elegir el
cámaras digitales, lo que conduce a una drástica �ijador, y el procedimiento de �ijación debe ser si-
disminución de los tiempos de exposición y a la eli- milar al que se sigue para microscopía óptica o
minación del trabajo en el laboratorio fotográ�ico. electrónica. Sin embargo, es interesante incluir en
El término autorradiogra�ía se debe a que la propia el �ijador el mismo compuesto que se utilizó como
muestra a estudiar actúa como emisor de radiación, marcaje pero frío (sin el elemento radiactivo), pues
a diferencia de las técnicas radiográ�icas, donde el provoca el lavado por arrastre de los compuestos
emisor no es la propia muestra. Lacassagne y Lattes marcados unidos de modo inespecí�ico. El lavado
(1924) fueron los primeros en desarrollar una téc- posterior también debe ser muy profundo para eli-
nica autorradiográ�ica usando polonio. El empleo minar todos los restos de �ijador.
de isótopos radiactivos en secciones histológicas se El grosor del corte ha de ser tenido muy en
debe a Bulliard, Grundland y Moussa en 1938. cuenta pues solo las 2 o 3 μm más periféricas de los
Aunque, como se ha visto, pueden existir di- cortes muy gruesos contribuyen a la señal, ya que la
ferentes técnicas autorradiográ�icas en función del radiación emitida por las zonas más profundas pue-
procesamiento del material biológico que incor- de ser absorbida por el material del propio corte,
pora el isótopo radiactivo, en este capítulo solo se especialmente si se emplea radiación α o β de baja
considerará la histoautorradiogra�ía. No se inclui- energía. En el caso de cortes muy �inos, 1 μm de es-
rán procedimientos de electroforesis pues, en el pesor, o cortes de microscopía electrónica (60 nm),
momento actual, el empleo de marcadores radiac- es conveniente prolongar los tiempos de exposición
tivos en técnicas electroforéticas está en desuso. La para aumentar la probabilidad de impacto de la ra-
peligrosidad, la mejora en la sensibilidad de otros diación con los cristales de la emulsión.
marcadores y la aparición de nuevas técnicas con
alta sensibilidad han sido los principales responsa-
bles de esta situación. Emulsiones
Son suspensiones de cristales de haluros (cloruros,
11.3.1. Histoautorradiografía ioduros y bromuros) de plata en gelatina; de hecho,
funcionan como las emulsiones fotográ�icas, aun-
Las técnicas histoautorradiográ�icas son aquellas que poseen una mayor concentración de sales de
que permiten la localización del radioisótopo en plata (hasta el 90%) que las emulsiones para foto-
secciones de tejido, tanto en microscopía óptica gra�ía de luz. Esta mayor concentración de sales de
como en microscopía electrónica. En la mayoría de plata tiene como �in facilitar su interacción con la
los casos se estudian secciones de órganos de ani- radiación.
males a los que previamente se les ha suministrado Para aplicar la emulsión se emplean dos téc-
el radioisótopo, pero también se pueden utilizar nicas fundamentales: el método en placa (stripping
secciones a las que se ha incubado con material ra- �ilm) y el método de la emulsión líquida (dipping o
diactivo, como puede ser el caso de la incubación coating �ilm). En el primer método se utilizan placas
con un ligando radiactivo para estudiar su receptor. de emulsión comerciales, cuyo grosor oscila entre
Incluso con las secciones de tejido también es po- 10 y 20 μm, que van pegadas a un soporte del que se
sible realizar técnicas historradiográ�icas, aunque desprenden fácilmente. Se corta el fragmento que
este modo de proceder esté totalmente en desu- se desee de la placa y, una vez despegada la emul-
so. Para ello hay que disponer la emulsión sobre la sión, se deja �lotando en un baño. La emulsión se
279
Métodos en biociencias
Figura 11.8: Método de la emulsión líquida (�igura izquierda) y método del asa (�igura de-
recha) para colocar la emulsión sobre la muestra.
pesca sumergiendo el porta de modo que, al sacar- El tiempo de exposición debe ser controlado, pues
lo, queda situada encima de la sección del tejido. El las exposiciones muy largas facilitan la difusión de
segundo método consiste en introducir el porta en la radiación por lo que su localización en la emul-
un recipiente que contiene la emulsión líquida (Fi- sión termina siendo menos precisa. En los cortes
gura 11.8). Una vez aplicada la emulsión, los portas gruesos, los radioisótopos más profundos gene-
se guardan en una cámara oscura y lugar fresco y ran marcajes más dispersos, y lo mismo ocurre si
seco durante un tiempo que viene determinado por la emulsión es demasiado gruesa. La dilución de la
el isótopo; por ejemplo, de 1 a 2 semanas para el 32P, emulsión evita el problema causado por el grosor,
entre 1 y 30 semanas para el 35S y entre 1 semana y pero conduce a una pérdida de sensibilidad.
1 año para el 14C. Por motivos de seguridad suele ser
aconsejable emplear una caja de paredes de plomo
Resolución
para mantener las secciones durante el tiempo de
exposición. El revelado de la emulsión hace que las La resolución de la histoautorradiogra�ía depen-
sales de plata reducidas por impacto de la radiación de del tamaño de grano de la emulsión, del tipo
queden como puntos negros, plata metálica. El res- de radiación y de la sensibilidad de la emulsión.
to de sales serán disueltas por el �ijador fotográ�ico, El tamaño de grano de la emulsión es el factor de-
por lo que quedarán como zonas transparentes. terminante del poder de resolución de la técnica.
En el caso de microscopía electrónica, uno de En las técnicas estándar de microscopía óptica el
los procedimientos más sencillos es sumergir la tamaño de grano revelado es de 0.2 μm, útil para
rejilla en una emulsión líquida; también se puede microscopía óptica pero no para microscopía elec-
cubrir la rejilla al tocar la emulsión que va coloca- trónica; piénsese que la membrana plasmática tiene
da en un asa de alambre. Métodos más so�isticados 7 nm de espesor y el grano 200 nm. Por ello fue ne-
pueden llegar a incluir la centrifugación de las re- cesario utilizar emulsiones de grano más pequeño y
jillas cubiertas de emulsión con el �in de conseguir reveladores especiales hasta alcanzar un poder de
capas de emulsión más �inas y homogéneas. resolución de 20 nm. El tipo de radiación también
En su interacción con la emulsión, las partícu- afecta a la resolución de modo que cuanto mayor es
las α suelen mantener trayectorias rectas y dan muy la energía de la emisión radiactiva menor es la re-
buena señal, pero no penetran más allá de 15 a 45 solución debido a que la partícula emitida puede
μm en ella. Las partículas β penetran mucho más, hacer un viaje más largo en la emulsión y los granos
especialmente las de alta energía, pero presentan de plata, siempre más abundantes al �inal del reco-
trayectorias más erráticas. rrido de la partícula, estarán más lejos de la zona de
emisión.
Localización del marcaje La sensibilidad viene de�inida por la energía
que se necesita para activar un cristal de haluro
La exactitud de la localización del marcaje depen- de plata de la emulsión, y también afecta a la reso-
de fundamentalmente de tres factores: el tiempo de lución. Una emulsión de menor sensibilidad tarda
exposición, y el espesor del corte y de la emulsión. más en interaccionar con la radiación y permite que
280
Técnicas radiactivas
la radiación se aleje del punto de emisión, lo que veces, y no es menos importante, se pueden produ-
acaba redundando en una menor resolución. cir cambios en la tasa de recambio de la molécula
en cuestión. En cuanto al movimiento de moléculas
Marcaje de fondo dentro de la célula, esta técnica, unida a la histoau-
torradiogra�ía, fue extraordinariamente útil para
Lo forman aquellos granos que no se forman por diseñar el mapa del proceso de biosíntesis de pro-
efecto de la radiación. Las causas de su aparición teínas. La incorporación de 3H-timidina en el DNA
son de origen muy variado: exposición accidental a fue, en su momento, el método más �iable de de-
la luz, existencia en la muestra de iones metálicos, mostrar la capacidad proliferativa de una célula;
el proceso de revelado, radiactividad de fondo, etc… sin embargo, el uso del marcaje con BrdU (bromo-
En general, se considera que este marcaje es fondo y deoxiuridina) lo ha sustituido en la actualidad.
no es señal especí�ica cuando la densidad de los gra- Básicamente, estos experimentos consisten en
nos no es mayor de 0.01 grano/μm2. suministrar un precursor marcado radiactivamente
durante un tiempo determinado (pulso), retirarlo,
Contraste tomar una muestra biológica a diferentes tiempos
(caza) y analizar después la evolución de la se-
En microscopía óptica es usual teñir las secciones ñal radiactiva. La muestra biológica puede ser una
para facilitar la identi�icación de los componentes sección de tejido o un extracto de tejido vivo o cul-
del tejido, y el proceso de tinción puede llevarse a tivado. Para explicar el desarrollo de esta técnica,
cabo antes o después de utilizar la emulsión. Para se tomará como ejemplo averiguar la vida media de
microscopía electrónica, las secciones, ya colocadas una proteína P en células cultivadas.
en las rejillas, se tiñen con citrato de plomo y aceta- El pulso se realiza retirando el medio normal y
to de uranilo y, una vez secas, se aplica la emulsión. añadiendo el medio de marcaje. Como la molécula
a estudiar es una proteína, al medio de cultivo se le
Doble marcaje añade un aminoácido marcado, por ejemplo 35S-Cys.
La duración del pulso (tiempo de incubación en
Aunque es muy poco habitual, en la histoautorra- el medio de marcaje) vendrá determinada por la
diogra�ía también es posible llevar a cabo técnicas abundancia de la proteína P en las células y por la
de doble marcaje. Un procedimiento usual es utili- cantidad de Cys que tiene dicha proteína, pero sue-
zar dos isótopos radiactivos con diferente energía le ir desde 30 min a algunas horas. Es importante
– 3H y 14C por ejemplo– y cubrir las secciones con tener en cuenta que la incorporación de Cys habrá
dos capas diferentes de emulsión y una capa de tenido lugar no solo en la proteína P, sino en todas
celoidina o gelatina entre ellas. El 3H, menos ener- las proteínas que se estaban sintetizando durante
gético, impresionará únicamente la primera capa el pulso. La concentración del isótopo radiactivo en
de emulsión, la más próxima al tejido, y el 14C, más el medio de incubación suele ser de 100-200 μCi/
energético, la capa superior, que suele prepararse mL. Una vez concluido el pulso, se retira el medio
con el doble de concentración de sales de plata que de incubación, se lavan las células y se añade medio
la primera. normal con Cys fría a muy alta concentración para
evitar que la Cys caliente que se va liberando en los
procesos de degradación de proteínas pueda ser re-
11.4. Experimentos de pulso y caza utilizada. De lo contrario, si hay reutilización de la
Cys caliente, no se detectará una caída en la señal
Los experimentos de pulso y caza (pulse-chase radiactiva. Comienza entonces el proceso de caza,
analysis) clásicamente se usan para estudiar (1) la que consiste en ir extrayendo muestras (placas de
vida media de algunas moléculas, (2) el movimiento cultivo en este caso) a diferentes tiempos. Si no se
de moléculas dentro de la célula o de células den- dispone de datos previos, la elección de los tiempos
tro del organismo, este último menos usual, y/o de caza se suele hacer teniendo en cuenta criterios
(3) la capacidad proliferativa de algunas células. La de funcionalidad; por ejemplo, proteínas citoes-
determinación de la vida media es de mucha utili- queléticas suelen ser mucho más estables que las
dad pues indica la tasa de recambio de la molécula implicadas en procesos de señalización. Las células
estudiada. Es cierto que, desde un punto de vista de la muestra de caza se lisan y se inmunoprecipi-
molecular, uno de los cambios más usuales en el ta la proteína P. La inmunoprecipitación es un paso
material biológico es aumentar o disminuir la con- absolutamente obligatorio pues permitirá detectar
centración de la molécula estudiada; sin embargo, a exclusivamente la señal que proviene de la proteína
281
Métodos en biociencias
11.5. Radioinmunoanálisis
282
Técnicas radiactivas
Figura 11.10: Representación esquemática de un radioinmunoanálisis con una curva patrón hipotética.
283
Métodos en biociencias
%B= (cpm tubo/cpm totales) x 100 ambos elementos va variando, hecho que permite
extrapolar la edad de los restos biológicos. El máxi-
frente al logaritmo de las concentraciones del antí- mo tiempo de datación de esta técnica es de 60000
geno frío (eje X). Es también habitual representar años. La evolución del modo de detección del 14C
%B/B0 = (cpm tubo/cpm del patrón 0) x 100. Al in- puede representar un paradigma de la evolución
terpolar en dicha curva el porcentaje de unión del de las técnicas de detección. En la década de los 50
antígeno de la muestra, se obtiene el logaritmo de su todo el C de la muestra se transformaba en gas y en
concentración y, de allí, su concentración y cantidad. la cuanti�icación del material radiactivo se usaban
contadores gaseosos. Este método fue desarrollado
por Libby y le supuso el premio Nobel de Quími-
11.6. Radiometría ca en 1960. Los contadores de centelleo líquido se
emplearon en la década de los 60 y, actualmente,
La radiometría es un método de datación absoluta se usan espectrómetros de masas (14C y 12C pueden
que consiste en la determinación de la presencia de diferenciarse por su distinta masa) ya que son mu-
isótopos radiactivos de una muestra biológica/pa- cho más sensibles y necesitan muy poca muestra.
leontológica con el �in de conocer su edad. Se basa La datación con 14C es muy �iable hasta 1950 pues
en el hecho de que determinados isótopos radiacti- se consideraba que hasta ese instante la concentra-
vos naturales, por efecto de la emisión de radiación, ción de 14C fue constante; sin embargo, los ensayos
se van transformando en otros compuestos quími- nucleares que se realizaron después provocaron un
cos. Al elemento inicial se le llama elemento padre aumento de 14C que puede provocar errores de me-
y elemento hijo al que se genera. Son muchos los dida. La existencia de �luctuaciones del contenido de
isótopos radiactivos que se pueden emplear, pero 14
C por otros motivos ha hecho necesario realizar un
entre los más usados destacan las transformaciones recalibrado de la concentración de 14C de los últimos
siguientes: U235 Pb207, Rb87 Sr87, K40 Ar40 y 15000 años con el �in de corregir posibles desvia-
C14 N14, donde el primero es el elemento padre y ciones.
el segundo el elemento hijo. La base del cálculo de la
edad es la determinación de la proporción relativa
de uno y otro en la muestra y la expresión que se usa
para ello es t = (1/λ) ln (1+ D/P). Donde t es el tiem-
po a determinar, λ la constante de desintegración del
elemento padre, y D y P el número de átomos del ele- Bibliografía
mento hijo y padre respectivamente. El uso de una u
otra serie de desintegración depende del tiempo es-
Autoradiography. A Comprehensive Overview. 1989.
timado que se quiere datar pues cada serie tiene un
periodo distinto de semidesintegración, 713 millo- Baker JRJ , Baker P. Bios Scientific Publishers. ISBN 978-
nes de años, 47 millones de años, 1.27 millones de 0198564225.
años y 5730 años son los correspondientes a las cua- Autoradiography for Biologists. 1972.
tro series citadas anteriormente. PB Gahan (ed). Academic Press. ISBN 978-0122732508.
Probablemente el isótopo radiactivo más usa- Handbook of Experimental Immunology. Volume 1 Immu-
do en la datación paleontológica sea el 14C. Para ello, nochemistry. 1986.
se utiliza una variante metodológica que consiste en
Weir DM (ed). Blackwell Scientific Publications. ISBN 0632
averiguar la proporción relativa de 14C y 12C presen- 014997.
te en los restos del material biológico. En un ser vivo Handbook of Radioimmunoassay. 1977.
esta proporción es la misma que hay en la natura-
leza (14C/12C ≈ 1.3 x 10-12) pues el ser vivo toma el Abraham GE, Dekker-University of Minnesota. ISBN 978-
C de ella. Una vez muerto, el isótopo 14C se va des- 0824764531.
integrando, pues es inestable, y la proporción entre Principles and Techniques of Practical Biochemistry. 2000.
284
12.
Técnicas
electrofisiológicas
Iván Rivera Arconada
José Antonio López García
Las técnicas electro�isiológicas se utilizan para el es- electroencefalogra�ía (EEG), que se utili-
tudio de los fenómenos eléctricos que tienen lugar zan para el diagnóstico clínico y también
en células y tejidos biológicos. Lo más excitante de en investigación.
estas técnicas es que nos permiten estudiar en di- 2) El segundo se ocupará de las técnicas
recto la actividad de células y tejidos mientras están que se utilizan sobre todo en células o te-
en funcionamiento. Aunque esta actividad eléctrica jidos aislados. Estas técnicas invasivas
no sea directamente perceptible por nuestros senti- permiten un estudio más detallado de los
dos, se dispone de dispositivos que permiten ver o fenómenos bioeléctricos, pero su uso está
incluso escuchar esa actividad. limitado al campo de la investigación. El
La electro�isiología abarca una amplia gama uso de esta tecnología en humanos está
de técnicas que se aplican al estudio de los fenóme- restringido por las obvias di�icultades éti-
nos eléctricos desde el nivel de una molécula, por cas que conlleva.
ejemplo un canal iónico, hasta el nivel de un órgano
completo como puede ser el encéfalo. La generación Pero antes de comenzar con el estudio de estas téc-
y el mantenimiento de los potenciales bioeléctricos nicas se hará una breve reseña explicando qué son,
por elementos biológicos requieren inevitablemen- cómo se originan y cuál es la importancia �isiológica
te la conservación de la integridad y funcionalidad de estos potenciales bioeléctricos.
de los tejidos. Esto se puede conseguir usando di-
ferentes tipos de preparaciones que se adecúan al
tipo de estudio que se pretende realizar. 12.1. Potenciales bioeléctricos
Para ordenar las explicaciones que siguen, este
capítulo se va a dividir en dos grandes bloques: El término «potenciales bioeléctricos» englo-
ba todas las formas de potencial eléctrico generado
1) El primero se centrará en las técnicas por estructuras biológicas, fundamentalmente cé-
que se realizan a nivel de un organismo lulas llamadas excitables. En casos extraordinarios
completo mediante aproximaciones no que se dan en algunos peces, estas células se agru-
invasivas. Se trata de técnicas, como la pan para formar órganos eléctricos capaces de
Métodos en biociencias
286
Técnicas electrofisiológicas
Figura 12.1: Ecuaciones de Nernst y Goldman.
alterarlo. Las células excitables, por el contrario, tie- potasio dependientes de voltaje y estos ayudan a re-
nen un potencial de membrana variable. polarizar la neurona.
La desviación más conocida del potencial de En �ibras musculares el potencial de acción
reposo es el potencial de acción que se da en �ibras puede durar algo más debido a la apertura de cana-
musculares y neuronas. El potencial de membra- les de calcio que tienen una cinética algo más lenta
na que en reposo se encuentra aproximadamente que los de sodio, pero en líneas generales la secuen-
a -65 mV pasa súbitamente a +20 o +40 mV. Inme- cia de acontecimientos es semejante.
diatamente después se recupera el potencial de
reposo de tal forma que el potencial de acción es
una despolarización transitoria que dura solo unos 12.1.3. Campos eléctricos y sincronía
milisegundos.
El potencial de reposo solo puede detectarse con
Se acaba de ver que el potencial de reposo es el
técnicas de registro intracelular, sin embargo, los
resultado de procesos bio�ísicos opuestos alcanzan-
do un equilibrio. El potencial de acción supone un cambios dinámicos de este potencial, como ocu-
desequilibrio transitorio que se debe a la apertura rre con los potenciales de acción, crean campos
de un conjunto de canales iónicos activos. Estos ca- eléctricos que, aunque débiles, pueden ser detec-
nales se encuentran normalmente cerrados pero se tados a una cierta distancia de su lugar de origen.
abren cuando la membrana sufre pequeñas altera- Así, los potenciales de acción pueden ser detecta-
ciones de su potencial de reposo. Así, por ejemplo, dos desde el exterior con un electrodo situado en la
una pequeña despolarización generada en una proximidad de una célula. Cuando un conjunto de
neurona al interaccionar con un neurotransmisor células tiene actividad eléctrica sincrónica, los cam-
puede ocasionar la apertura de canales iónicos ac- pos eléctricos se pueden sumar y viajar por el medio
tivos, abriendo una nueva puerta a iones que ahora extracelular hasta la super�icie del cuerpo. Estos
movidos por las mismas fuerzas �isicoquímicas in- campos eléctricos pueden ser detectados por elec-
tentarán encontrar un nuevo equilibrio. trodos de super�icie. La intensidad de estos campos
Los canales activos presentes en neuronas y �i- dependerá: (a) del tamaño de las estructuras que
bras musculares no son exactamente los mismos y, los originan (por ejemplo una �ibra muscular origi-
por tanto, la forma y curso temporal del potencial na un campo eléctrico mayor que una neurona), (b)
de acción no son idénticos. En neuronas los canales el número de células que intervenga (unas docenas
activos más típicos son los de sodio. Cuando estos se de células producen campos más débiles que unas
abren, el sodio tiende a entrar en la célula portando centenas o millares) y (c) del grado de sincronía con
carga positiva y despolarizando la membrana. el que cambie su potencial de reposo.
El potencial de acción se acaba debido a dos
factores: a) la apertura de los canales de sodio es
temporal, de tal forma que se abren durante una 12.2. Técnicas no invasivas
fracción de milisegundo y vuelven a cerrarse inme-
diatamente; b) la despolarización de la membrana Estas técnicas tienen una aplicación continua en el
ocasionada por la entrada de sodio abre canales de ámbito clínico. Nos aportan información proceden-
287
Métodos en biociencias
Figura 12.2: La imagen de la izquierda muestra electrodos desechables típicos para realizar electrocar-
diograma o electromiograma. La imagen de la derecha muestra un «casco de registro EEG» donde cada
punto blanco corresponde a un electrodo. Modi�icado de http://electroencefalogramacepi.blogspot.com.
es/2011/05/senales-biomedicas.html. Disponible en color.
288
Tema 12, página 7
Técnicas electrofisiológicas
Figura 12.3: Digitalización de señales analógicas.La primera grá�ica representa una señal sinusoidal
analógica cuya amplitud varía de forma continua a lo largo del tiempo con una frecuencia aproxima-
Figura
da de 80 Hz ya que tiene 2 ciclos 12.3. en
enteros Digitalización de señales
25 ms. La segunda analógicas.
gra�ica representa una digitalización
de
Lalaprimera
señal con un muestreo
gráfica de amplitud
representa cada
una señal 2 ms (500analógica
sinusoidal Hz). La última
cuyarepresenta una digitalización
amplitud varía de forma continua a
cada
lo 4 ms
largo del(250 Hz).con
tiempo Nótese
unacomo la �idelidad
frecuencia de la reproducción
aproximada de 80 Hz yadigital disminuye
que tiene conenteros
2 ciclos la frecuencia
en 25 ms. La
segunda grafica representa una digitalización de muestreo.
de la señal con un muestreo de amplitud cada 2 ms (500
Hz). La última representa una digitalización cada 4 ms (250 Hz). Nótese como la fidelidad de la
reproducción digital disminuye con la frecuencia de muestreo.
supone un paso más en el procesamiento de las se- adecuadamente el intervalo de tomas de muestra o
ñales: la conversión analógico-digital. frecuencia de muestreo. Se suele aconsejar que la
Las señales procedentes de los ampli�icado- frecuencia de muestreo sea unas 10 veces superior
res son analógicas, es decir continuas en el tiempo. a la frecuencia máxima de la señal que se va a estu-
Los ordenadores necesitan señales digitales. Para diar (Figura 12.3).
ello, la señal original debe ser muestreada a espa-
cios regulares de tiempo y para cada muestreo se
debe obtener un valor de amplitud en micro o mi- 12.2.3. Electroencefalografía
livoltios. De esta forma las ondas analógicas se
convierten en pares de números, el primero nos da De entre las técnicas de registro no invasivas, la
el dato de tiempo y el segundo, el valor de la ampli- electroencefalogra�ía (EEG) es la más compleja y
tud. Este proceso es delicado ya que debe elegirse la que más entrenamiento requiere. Esto se debe
289
Métodos en biociencias
a varias cuestiones. Primero los campos eléctricos polares comparan un electrodo activo (posicionado
generados por las neuronas son muy débiles y esto sobre el cuero cabelludo) con un electrodo neu-
hace que la obtención y tratamiento de los registros tro o de referencia, teóricamente a potencial 0. Una
sea técnicamente muy demandante. A esto se une la buena ubicación para este segundo electrodo es el
topogra�ía del cerebro, su complejidad intrínseca y lóbulo de la oreja o el mentón. En este tipo de deri-
su aislamiento de la super�icie corporal por una cu- vación cada canal de registro nos dará la diferencia
bierta ósea discontinua (el cráneo). de potencial en el tiempo entre un electrodo acti-
vo y el de referencia. Todos los electrodos activos
Posicionamiento de electrodos y montajes usan la misma referencia. En los registros bipolares
de registro (derivaciones) se miden diferencias de potencial entre parejas de
electrodos activos pero la interpretación de estas
Se usan electrodos de copa redondos autoadhesivos señales es más compleja.
o insertados en un gorro elástico como en la imagen
anterior. El número de electrodos es muy variable Tratamiento de las señales de EEG
dependiendo de los objetivos del estudio. Típica-
mente se usan de 8 a 20 pero pueden ser muchos Las señales biológicas se ampli�ican para poder me-
más en casos donde la localización de focos de acti- dir amplitudes entre 2 y 200 microvoltios que son
vidad requiere precisión y se cuenta además con la los límites típicos de amplitud para las ondas de
capacidad de analizar los registros de forma auto- EEG. En la fase de �iltrado normalmente se eliminan
mática por ordenadores. El posicionamiento de los frecuencias menores a 0.5 Hz y mayores de 35 Hz.
electrodos se realiza en lugares especí�icos cubrien- Debido a las características de los equipos de �iltra-
do todas las regiones craneales. La posición de cada do, las frecuencias por encima y por debajo de los
electrodo se nombra con una letra mayúscula que límites �ijados no se eliminan sino que se atenúan.
corresponde al hueso craneal sobre el que se sitúa Por esta razón se suele incorporar un �iltrado es-
(por ejemplo F de frontal o P de parietal) seguido pecí�ico de 50 Hz para reducir los ruidos eléctricos
de un número que indica más �inamente la posición ambientales. Para conocer con exactitud la ampli-
(Figura 12.4). Este código de nombre es esencial tud de las señales, los equipos de registro suelen
para identi�icar los canales de registro y saber de presentar un sistema de calibrado de tal forma que
dónde proceden las señales. hacen pasar por el sistema de registro una señal de
Las derivaciones o montajes de registro ha- amplitud y frecuencia conocidas. De esta forma se
cen referencia a cómo se usan los electrodos para puede conocer el impacto exacto que tiene el proce-
comparar el potencial eléctrico. Los registros mono- sado de la señal sobre la señal misma.
290
Técnicas electrofisiológicas
Beta:
13-30
Alfa:
8-13 Hz
(Ojos abiertos)
Theta:
4-8 Hz
Delta:
0.5-4
Espigas repetidas
procedentes de un
foco epiléptico
Figura 12.5: Ritmos básicos del EEG y espigas epilépticas. La barra vertical de calibración mide 200 micro voltios.
El ritmo alfa contiene tres ejemplos, uno de ellos obtenido con ojos cerrados. Modi�icado de http://www.trueim-
pact.ca/introduction-to-electroencephalogram-eeg/.
vigiles. El ritmo Alfa se registra con mayor amplitud Aplicaciones del EEG
de las zonas occipitales cuando se cierran los ojos
indicando que esta maniobra (cerrar los ojos) pro- La electroencefalogra�ía se usa sobre todo en si-
duce un aumento de la sincronía neuronal. tuaciones clínicas para diagnosticar epilepsias,
En un EEG real es muy común la aparición de situaciones de coma y también para asistir al diag-
ritmos más complejos que muchas veces corres- nóstico de algunos problemas del sueño.
ponden a la combinación de dos o más sinusoides El EEG es una herramienta fundamental para
con distinta frecuencia. Además de estos ritmos bá- clasi�icar las epilepsias. Ayuda a detectar la existen-
sicos es posible identi�icar fenómenos especiales. cia de focos y cuando se emplaza un número alto
Algunos de estos son típicos del sueño, otros dela- de electrodos sobre el cuero cabelludo y se combina
tan la activación de focos epilépticos. con un análisis computacional de las señales apli-
Hoy en día se dispone de complejos sistemas cando modelos topográ�icos de la cabeza, es posible
de análisis de señales por ordenador que permiten predecir la localización de los focos. Este tipo de aná-
hacer análisis muy detallados de las ondas y, cuan- lisis de localización espacial del foco es complejo y
do se combinan con un número alto de electrodos, de índole predictiva. En el caso de epilepsias farma-
nos permiten hacer inferencias bastante precisas de corresistentes e inhabilitantes cuya única terapia es
la localización de los generadores de la actividad re- la resección quirúrgica del foco, se comprueba que
gistrada. las predicciones hechas por estos modelos pueden
291
Métodos en biociencias
292
Técnicas electrofisiológicas
Este tipo de análisis permite estudiar la res- 12.3.1. Fabricación de electrodos de vidrio
puesta del cerebro ante estímulos de variada
naturaleza. Así se usan estímulos simples como el Para la fabricación de los electrodos de vidrio se ne-
�lash o la palmada para estudiar el procesamiento cesitan: capilares de vidrio, estirador de electrodos
cerebral de señales sensoriales y detectar cegueras y una solución salina conductora para rellenarlos.
o sorderas de origen central, es decir debidas a la Los capilares de vidrio más utilizados son de
malfunción de un núcleo cerebral. Por el contrario borosilicato debido a su menor coste. Los capila-
se pueden usar estímulos complejos como palabras res disponibles comercialmente abarcan diferentes
o frases unidos a tareas de discriminación o memo- diámetros tanto externos como internos, lo que
rización para estudiar el procesamiento cognitivo proporciona a su vez diferentes grosores de pared
de estímulos complejos. que pueden utilizarse para los diferentes tipos de
registro. Otro elemento importante de los capilares
es la posibilidad de dotarlos de un �ilamento ado-
sado a la parte interna de la pared, para facilitar el
12.3. Técnicas invasivas llenado del electrodo hasta la punta sin que aparez-
can burbujas de aire que impidan la conducción de
Esta segunda parte se irá introduciendo progre- las señales eléctricas. La solución de relleno es una
sivamente en el estudio de fenómenos eléctricos solución salina para permitir la conducción de las
cada vez más simples, pasando del nivel de siste- señales eléctricas registradas en la punta del elec-
ma-órgano hasta el nivel molecular. Para realizar trodo, aunque su composición especí�ica varía con
estos registros se emplearán técnicas cada vez más cada técnica.
especí�icas y complejas que se irán describiendo ha- El estirador de electrodos o puller es el apara-
ciendo hincapié en sus características principales, to utilizado para la fabricación de los electrodos de
su objeto de estudio, tipo de preparación más ade- vidrio, y permite conseguir electrodos con puntas
cuada y algunos ejemplos. �inas y reproducibles. Comercialmente existen va-
Una de las diferencias fundamentales con las rios modelos con disposición horizontal o vertical
técnicas no invasivas es que el electrodo se tiene donde se �ija el capilar por sus dos extremos a unas
que aproximar mucho o incluso introducir en las piezas móviles, dejando su porción central en torno
células que se quieren estudiar. Para llevar a cabo a un �ilamento metálico. Este �ilamento se calienta
estas aproximaciones es necesario introducir el de forma controlada por el paso de una corriente
o los electrodos a una profundidad variable den- eléctrica y es el encargado de fundir el capilar de
tro del tejido donde se va a registrar, para lo cual vidrio para permitir su moldeado. Controlando la
es muy útil que tengan forma a�ilada y una punta temperatura de fusión, la fuerza de estiramiento de
lo más reducida posible, causando así un menor las piezas móviles y el enfriamiento por aire en los
daño durante la penetración. Como en el caso an- equipos que disponen de esta posibilidad, junto con
terior los electrodos van a estar constituidos de un los intervalos de tiempo entre calentamiento-estira-
material conductor, bien siendo electrodos de mate- miento-enfriamiento, e incluso el tipo de capilar, se
rial conductor directamente (metálicos en general, puede conseguir una punta idónea para su utiliza-
pero más recientemente también se están desa- ción en cada una de las técnicas electro�isiológicas.
rrollando electrodos con nanotubos de carbono) o
bien capilares de vidrio moldeados a medida y re- 12.3.2. Elección del modelo experimental: pre-
llenos de una solución salina conductora. En el caso paraciones in vivo e in vitro
de los electrodos metálicos la ventaja fundamental
es su durabilidad frente a los de vidrio que son de Otro aspecto importante que conviene destacar en
un solo uso. En contraposición, los capilares de vi- este punto, dado que es de aplicación para el con-
drio permiten conseguir electrodos con diámetros junto de técnicas invasivas, tiene relación con el
en la punta de hasta 0.1 µm, lo cual es fundamen- tipo de preparación biológica donde se realiza-
tal a la hora de su aplicación para las técnicas de rán los registros electro�isiológicos. Las técnicas
registro intracelular, y son más económicos. Dado electro�isiológicas invasivas se pueden utilizar en
que la fabricación de los electrodos es un punto cla- preparaciones in vivo o in vitro, dependiendo del
ve para obtener unos registros adecuados, antes de tipo de estudio que se quiera realizar.
empezar a describir las técnicas invasivas se van a Las preparaciones in vitro (en vidrio) son
comentar algunos detalles acerca de la fabricación aquellas en las que el ensayo se realiza fuera del
de electrodos con capilares de vidrio. organismo, bien utilizando un cultivo celular o me-
293
Métodos en biociencias
diante el mantenimiento de un tejido, completo necesario el «uso de anestesia», lo que a su vez pue-
o seccionado, extraído de un animal (ex vivo). En de interferir en las señales objeto de estudio puesto
cambio, en las preparaciones in vivo se trabaja con que algunos anestésicos inter�ieren con los meca-
el animal completo. Dentro de las preparaciones in nismos responsables de las señales bioeléctricas.
vivo se puede a su vez distinguir entre: La ventaja fundamental de las preparacio-
nes in vivo estriba en la posibilidad de estudiar las
— Preparaciones agudas, en las que todo
«relaciones entre distintos órganos y sistemas», lo
el desarrollo experimental se realiza ne-
que permitiría, por ejemplo, estudiar la respuesta
cesariamente con el sujeto experimental
de una �ibra muscular frente a la activación de las
anestesiado debido a la severidad del tipo
neuronas motoras espinales o las relaciones entre
de procedimiento utilizado.
distintas estructuras dentro del sistema nervioso
— Preparaciones con animal intacto, en las
central.
que el sujeto experimental está despier-
to y consciente durante el experimento. También existen algunas di�icultades técnicas
Estas preparaciones solo sirven para ha- a la hora de realizar los ensayos con preparaciones
cer registros con técnicas no invasivas o in vivo. Como se explicará más adelante, para llevar
mínimamente invasivas como se vio más a cabo algunas de las técnicas invasivas es necesaria
arriba. una gran «estabilidad mecánica». Dentro de un ani-
mal vivo, el propio latido cardiaco y la respiración
— Preparaciones crónicas, en las cuales pre-
generan inestabilidad que di�iculta el mantenimien-
vio al estudio experimental se realiza una
to del registro. Además la facilidad de acceso con el
preparación del sujeto que requiere pro-
cedimientos de cierta severidad, por lo electrodo de registro y la posibilidad de visualizar
que se utilizará anestesia, pero que du- el elemento a estudiar son obviamente superiores
rante el ensayo utiliza procedimientos en una preparación mantenida in vitro que en un or-
leves que se realizan con el sujeto cons- ganismo completo.
ciente y despierto. Finalmente otro aspecto a considerar para la
elección de un modelo experimental u otro tiene
A la hora de la selección del modelo más adecua- relación con los «aspectos éticos y legales», pues-
do un aspecto fundamental que puede decantar la to que en la medida de lo posible se trata de tender
elección hacia un tipo de preparación u otro se basa hacia modelos in vitro para reducir el sufrimiento y
en las propias condiciones de ensayo que se pue- malestar animal.
den obtener. Si el elemento de estudio se encuentra En cada caso el investigador debe decidir qué
dentro de un organismo vivo tiene la ventaja de aspectos son fundamentales para su estudio y cuá-
que el «mantenimiento de la homeostasia» se lleva les son prescindibles a la hora de elegir un modelo
a cabo de una forma natural, aprovechando el lati- u otro, asumiendo los inconvenientes inherentes a
do cardiaco para la perfusión y los pulmones para cada uno de ellos.
conseguir el intercambio gaseoso, afectándose en
menor medida el ambiente y la estructura natural
del tejido y evitando en cierta medida procedimien- 12.3.3. Registros extracelulares
tos quirúrgicos lesivos para el tejido. Sin embargo,
esto supone también un inconveniente a la hora de Los registros extracelulares son aquellos en los cua-
aplicar fármacos o modi�icar las concentraciones les se registra la actividad eléctrica de una célula o
iónicas del medio. Los cambios de concentraciones un grupo de células desde el medio externo, siendo
se verán tamponados y los fármacos se verán ex- necesario que estas células sean excitables y pro-
puestos a los sistemas de degradación y eliminación duzcan señales eléctricas grandes que puedan ser
del organismo (hepática, renal), siendo di�ícil cono- registradas como cambios en el campo eléctrico
cer la concentración alcanzada en el tejido diana, en un área de un tejido («potenciales de campo»)
así como el momento en el que el fármaco acceda o o como potenciales de acción extracelulares de una
se elimine del tejido de interés. En cambio, en una «célula individual». Con esta técnica se va avanzan-
preparación in vitro, se pueden modi�icar las condi- do en complejidad y adentrándonos en un nivel de
ciones del medio y controlar la concentración y los estudio menor que con las técnicas no invasivas,
tiempos de aplicación de los fármacos de una mane- abarcando desde el nivel de órgano-sistema al nivel
ra precisa, sencilla y rápida. celular. Por ello, para estos registros se pueden uti-
En el caso de utilizar preparaciones agudas in lizar preparaciones in vivo agudas o crónicas donde
vivo que emplean técnicas invasivas será además se dispone del organismo completo, pero también
294
Técnicas electrofisiológicas
295
Métodos en biociencias
ejemplos que cubran distintas posibilidades para idea de la actividad individual de cada una de ellas
dotar al lector de una visión lo más completa posi- en las distintas situaciones experimentales. El aná-
ble de estas técnicas. lisis de estos estudios se basa en la cuanti�icación
del número y el patrón de disparo de las distintas
neuronas así como las relaciones temporales en-
Registros de neuronas individuales en la corteza
tre la actividad de varias neuronas entre sí (Figura
de ratas en movimiento (in vivo)
12.8b).
Para este tipo de aproximación se utiliza una pre- Esta aproximación es similar a algunas de las
paración crónica implantando electrodos metálicos que utilizaron los galardonados con el nobel de �i-
en una región del encéfalo. Los electrodos que se siología y medicina el año 2014 (May-Britt Moser y
utilizan en este caso pueden ser MEAs con un nú- Edvard I. Moser) para estudiar las neuronas encar-
mero elevado de sensores, que se �ijan al cráneo gadas del sistema de posicionamiento del cerebro.
por medio de cemento dental y pequeños torni- Esta estrategia aprovecha una técnica invasiva, que
llos (que a su vez pueden emplearse como tierra). permite estudiar la actividad eléctrica de grupos de
Una correcta �ijación de los electrodos que evite el neuronas en una región del cerebro, con una prepa-
desplazamiento es fundamental para (1) evitar el ración que permite realizar el estudio en neuronas
malestar y el sufrimiento del animal si el dispositi- que se encuentran en su ambiente y con unas co-
vo se mueve dentro del cráneo y (2) asegurar que el nexiones naturales, y además en un animal con
registro de la actividad de las neuronas sea estable libertad de movimientos, algo imprescindible para
mientras el animal se está moviendo (Figura 12.8a). estudiar los cambios de actividad de estas neuronas
Dado que se trata de una preparación crónica toda con los cambios de posición del animal consciente
la manipulación y la colocación de los electrodos se en el espacio.
realiza con el animal anestesiado y posteriormen-
te, cuando el animal se recupera de la anestesia,
Registros de potenciales de campo en rodajas
se puede registrar la actividad de esa población de
de tejido nervioso (in vitro)
neuronas con el animal despierto y con libertad de
movimientos. Una vez que el implante está colocado Para este tipo de aproximación se pueden utilizar
la presencia del investigador no es necesaria puesto secciones de tejido de una gran variedad de regio-
que la señal registrada puede enviarse por cable o nes del sistema nervioso, desde corteza cerebral
incluso por medios inalámbricos hacia el sistema de hasta médula espinal. La necesidad de realizar ro-
registro, eliminando la posible in�luencia del inves- dajas de tejido viene dada por la imposibilidad de
tigador sobre el comportamiento del animal. Puesto conseguir una perfusión adecuada in vitro cuando
que el registro con electrodos múltiples permite es- el tejido presenta un grosor excesivo. Mediante un
tudiar la actividad de muchos elementos de forma aparato especí�ico llamado vibratomo se consigue
simultánea, el sistema de registro en este caso va a secciones de tejido de diferente grosor por medio
utilizar algoritmos que permiten el reconocimien- de una cuchilla que va oscilando en el mismo plano
to y la clasi�icación de la actividad de las distintas del corte (ver epígrafe 7.3).
neuronas que se están registrando, para tener una Una vez que se dispone de la rodaja de tejido
esta se coloca en un baño de órganos o cámara de
registro adecuada, donde se �ijará para evitar el mo-
vimiento. Para optimizar las condiciones de registro
se pueden utilizar elementos que mejoren la esta-
bilidad mecánica (como mesas antivibración), así
como elementos para reducir la in�luencia del ruido
eléctrico (todos los equipos conectados a una buena
toma de tierra o una caja de Faraday).
Para esta técnica se suelen utilizar electrodos
de vidrio de baja resistencia rellenos de solución
salina (basada en NaCl por ejemplo), pero tam-
Figura 12.8: Disposición del sistema de registro sobre bién pueden usarse electrodos metálicos. Estos
el cráneo de un ratón (A) y agrupamiento-clasi�icación
de los diferentes potenciales de acción de un registro electrodos, mediante micromanipuladores, se pue-
en base a algoritmos (B). Modi�icado de Nat Neurosci. den situar en zonas especí�icas de la rodaja de
15(1):163-70 2011.
tejido, permitiendo el estudio de regiones o áreas
296
Técnicas electrofisiológicas
297
Métodos en biociencias
Figura 12.10: (A) la aplicación de un pulso de corriente a través del electrodo permite obtener información sobre el
avance del electrodo y la proximidad a las células. Este procedimiento se basa en la Ley de Ohm (a), si la magnitud del
pulso es constante (50 pA; c) la resistencia será directamente proporcional al voltaje registrado (b). A medida que el
electrodo se aproxima a la membrana de la célula (d) el voltaje se incrementa re�lejando un aumento de la resistencia.
(B) cuando el electrodo esta sobre la membrana la oscilación de este por la aplicación de una breve corriente (asterisco)
favorece la penetración, registrándose inmediatamente una diferencia de potencial, así como el disparo de potenciales
de acción (líneas verticales). Registros obtenidos por los autores.
como una mesa anti-vibración son fundamentales Con el electrodo dentro de la célula y la re-
para conseguir registros estables en el tiempo. sistencia del electrodo compensada se puede
calcular la «resistencia eléctrica» de la membrana
celular aplicando corriente a través del electrodo
Obtención del registro
(Figura 12.11). Al aplicar un pulso de corriente de
En el caso de que se trabaje con células aisladas intensidad conocida se registrará un cambio en el
en cultivo o incluso en rodajas de tejido se sue- voltaje proporcional a la resistencia eléctrica de la
len utilizar microscopios invertidos para facilitar membrana de la célula. Esta resistencia viene de-
la obtención del registro. Esto permite seleccionar terminada por la cantidad de canales pasivos que
la célula que se quiere estudiar y buscar aquellas tenga la célula (aquellos que se mantienen abiertos
que tengan un aspecto más saludable. Aunque en independientemente de la diferencia de potencial).
este caso la aproximación inicial se realiza median- Un mayor número de canales abiertos se corres-
te control visual, a la hora de la penetración es útil ponde con una resistencia eléctrica menor (dado
la aplicación de un pulso de corriente a través del que permite el �lujo de corriente) mientras que un
electrodo para saber el momento justo en el que se número menor de canales abiertos nos daría una
contacta con la célula. En el caso de trabajar a cierta resistencia mayor (porque la corriente encontraría
profundidad en el tejido, no es posible ese contacto más resistencia para atravesar la membrana). Este
visual a través el microscopio y se tiene que utili- parámetro se puede utilizar para obtener una indi-
zar desde el primer momento un pulso de corriente cación del tamaño de la célula dado que la densidad
para ir controlando el avance del electrodo a me- de canales pasivos dentro de un tipo celular concre-
dida que este penetra en el tejido. El proceso de to (por ejemplo neuronas) es similar. Por tanto una
obtención del registro guiado por el pulso de co- célula con más resistencia tendría menos canales de
rriente se muestra en la �igura 12.10a. este tipo y por tanto una super�icie de membrana
menor.
Parámetros de estudio Pero además, la aplicación de pulsos de co-
rriente puede ser útil en las células excitables
Cuando se consigue empalar una célula sin romper- porque va a permitir que se pueda despolarizar la
la, lo primero que se observa es un cambio súbito célula lo su�iciente para que se supere el umbral
en el potencial registrado (Figura 12.10b). Este va- de disparo y conseguir el disparo de potenciales
lor de voltaje constituye la diferencia de potencial de acción (Figura 12.11). Así se podrán estudiar
entre ambos lados de la membrana o «potencial de las «características del potencial de acción» en es-
membrana» (Vm). El potencial de membrana de una tas células: tiempo de subida y bajada, amplitud,
célula puede ser un parámetro de estudio muy in- duración y la presencia de despolarizaciones e hi-
teresante puesto que puede verse alterado en las perpolarizaciones después del potencial de acción.
diferentes situaciones �isiológicas y patológicas que También se pueden estudiar posibles cambios en
experimentan las células. los potenciales de acción a consecuencia de la apli-
298
Técnicas electrofisiológicas
Figura 12.12: Ejemplo de diferentes patrones de disparo obtenidos en neuronas super�iciales del asta dorsal de ra-
tón en respuesta a despolarización por aplicación de corriente intracelular. Registros obtenidos por los autores.
299
Métodos en biociencias
lor de voltaje que supere el umbral de activación de ñal-ruido excelente. Para entrar en contacto con el
los canales de sodio (por ejemplo -40 mV), estos se interior celular se tiene que conseguir en primer
abren y se genera una corriente de entrada que tra- lugar que la membrana de la célula se fusione con
taría de despolarizar aún más la neurona (incluso la punta de la micropipeta, proceso que se ve favo-
hasta valores positivos), para mantener �ijo el vol-
recido por la aplicación de una pequeña succión a
taje el ampli�icador debe aplicar una corriente de
través del electrodo. De esta forma se consigue la
la misma magnitud pero de signo opuesto que anu-
le el efecto de la corriente de sodio sobre el voltaje. formación de un sello de muy alta resistencia eléc-
Por tanto la corriente que aplica el ampli�icador es, trica (gigasello), que será lo que permita el registro
en este caso, la variable de estudio que indica la co- electro�isiológico reduciendo el ruido eléctrico de
rriente generada por la célula. Por convenio, una fondo. Después se puede conseguir el acceso com-
corriente producida por un ion positivo que entra pleto al interior celular (para estudiar las señales
en la célula tiene un signo negativo (si sale de la cé- producidas por todos los canales de la célula) o bien
lula positivo, y si el ion tiene carga negativa es justo trabajar con un pequeño fragmento de la membra-
al revés). na (para estudiar las señales producidas solo por
En un primer momento la �ijación de voltaje los presentes en ese fragmento). Además, como se
requería necesariamente la presencia de dos elec-
tiene acceso al interior celular, se pueden realizar
trodos, uno para medir el voltaje y otro para aplicar
la corriente. Esta disposición se conoce como �ija- también registros de �ijación de corriente como en
ción de voltaje con dos electrodos (two electrode los registros intracelulares. Con la ventaja de que
voltage-clamp). Esta técnica fue utilizada por Ho- gracias a estos electrodos se pueden realizar estos
dking y Huxley para desentrañar la naturaleza del estudios en células de pequeño tamaño, consiguien-
potencial de acción (descubrimiento por el que do además una mejor relación señal-ruido y mayor
fueron galardonados con el premio Nobel de me- capacidad de aplicar corriente. Esta técnica permi-
dicina y �isiología en el año 1963). Estos cientí�icos te gran variedad de aplicaciones, por lo que abarca
utilizaron el axón gigante de calamar para sus estu- estudios desde un nivel de sistema a estudios a ni-
dios dado que necesitaban utilizar electrodos muy
vel de molécula (canal). El tipo de preparación más
grandes que no era posible insertar en otro tipo de
preparaciones. El desarrollo posterior ha permitido adecuada, para poder conseguir la máxima reso-
que esta técnica se pueda llevar a cabo con dos elec- lución que permite esta técnica, serían los cultivos
trodos de vidrio, similares a los intracelulares que celulares donde las membranas de las células se en-
se comentaron anteriormente, lo que posibilita su cuentran más accesibles, sin embargo se pueden
utilización en algunos tipos celulares en cultivo. Sin obtener buenos registros utilizando preparaciones
embargo la mayoría de las células de mamífero no ex vivo y en menor medida preparaciones in vivo.
es posible empalarlas con dos electrodos a la vez, Como en las técnicas anteriores es fundamental la
por lo que la técnica de dos electrodos, se utiliza estabilidad mecánica y el aislamiento eléctrico para
solo en células muy grandes (por ejemplo en ooci-
conseguir buenos registros, por lo que se utilizan
tos de an�ibio).
micromanipuladores, mesas antivibración y cajas
Posteriormente se desarrolló un sistema que
de Faraday.
permitía realizar estos estudios con un solo elec-
trodo que realizaba las dos funciones de una forma Estos electrodos presentan un diámetro de
alternante (�ijación de voltaje discontinua o dis- punta relativamente grande, eso hace que el líquido
continuous voltage-clamp) y unos años después se de relleno de la micropipeta difunda al interior celu-
implementó el uso de electrodos de baja resistencia lar modi�icando el �luido interno, por lo que algunos
que permiten fusionar el electrodo y la membra- procesos celulares pueden verse alterados. Esta es
na, permitiendo registrar incluso la corriente iónica la razón por la que el relleno de las micropipetas se
generada por un único canal (en 1991 Neher y Sak-
realiza con un líquido con una composición lo más
mann fueron galardonados con el premio Nobel por
semejante posible a la que se espera encontrar en
estos estudios).
el interior celular. Aunque existe una grandísima
La utilización de electrodos de baja resisten-
cia, habitualmente entre 1 y 10 MΩ, supone un gran variedad de líquidos de relleno, en general suelen
avance en los estudios de �ijación de voltaje ya que presentar una elevada concentración de potasio,
permite realizarlos en células pequeñas y solo con moléculas energéticas como ATP y GTP, algún que-
un electrodo, consiguiendo además una relación se- lante de calcio y algún tampón como Hepes.
300
Técnicas electrofisiológicas
Figura 12.13: (A) El acercamiento progresivo de la punta de la micropipeta a la mem-
brana de una célula (a) provoca que la corriente necesaria para modi�icar el voltaje -1
mV (c) se reduzca progresivamente (b) re�lejando un incremento de la resistencia eléc-
trica (R= V/I). (B) cuando la micropipeta se encuentra sobre la membrana celular la
aplicación de una ligera succión favorece la formación del gigasello (nótese la ín�ima co-
rriente necesaria para modi�icar el voltaje -10 mV, izquierda). Una posterior succión más
explosiva genera la rotura de ese fragmento de membrana y el acceso al interior de la cé-
lula modi�icándose la lectura de corriente (derecha, registro de célula completa que se
explicará más adelante). Registros obtenidos por los autores.
Obtención del gigasello y configuraciones pendiendo del tipo de estudio que se quiera llevar
del patch-clamp a cabo. Si se mantiene esta disposición se pueden
realizar registros de los canales que se disponen en
A la hora de conseguir un registro con micropipetas esta porción de la membrana, esta con�iguración se
es importante identi�icar el momento en el cual la denomina «cell-attached». Esta disposición presen-
punta se sitúa sobre la membrana de la célula para ta la ventaja de que no se altera el funcionamiento
evitar empujarla en exceso, pero debiendo estar lo de la célula ni su composición interior, pero no per-
su�icientemente cerca para poder obtener el giga- mite un control de las condiciones de ensayo tan
sello mediante la aplicación de una ligera succión amplio como el resto de las con�iguraciones (Figu-
a través de la micropipeta. El proceso de obtención ra 12.14).
del gigasello se muestra en la �igura 12.13. Si desde la situación anterior se consigue tener
Cuando se consigue el gigasello (valores de acceso al interior de la célula, rompiendo o perfo-
resistencia superiores a 1-2 GΩ) se puede optar rando el fragmento de membrana donde se sitúa la
por diversas con�iguraciones de patch-clamp de- luz de la micropipeta, se estaría en la con�iguración
Figura 12.14: Con�iguraciones del patch-clamp y procedimiento para obtener cada tipo de regis-
tro, ver descripción detallada en el texto. La línea negra representa la cara externa de la membrana
y la gris la interna. Imagen basada en la descripción original publicada en P�lügers Arch 391:85-
100 1981.
301
Métodos en biociencias
de «célula completa» (whole cell recording), que fragmento de membrana dentro de la luz de la mi-
permite el estudio de las señales producidas por la cropipeta se mantiene y el resto es eliminado, pero
totalidad de canales presentes en la célula (Figu- en este caso la cara externa de la membrana queda
ra 12.14). El acceso al interior se puede conseguir hacia la luz del electrodo y la interna hacia el ex-
mediante la aplicación de una corriente intensa terior (con�iguración inside-out, Figura 12.14). Si
o con una succión breve puesto que en ambos ca- el retroceso del electrodo se realiza en un medio
sos se puede romper la región de membrana que se con calcio también se puede alcanzar esta con�igu-
encuentra en la luz de la micropipeta. Otra posibili- ración, pero en este caso se consigue arrancar una
dad para ganar acceso eléctrico al interior celular se porción de la célula con citoplasma y rodeada com-
basa en añadir al líquido intracelular de relleno de pletamente por membrana. Con la exposición al
la pipeta antibióticos (como nistatina, gramicidina aire se consigue que la parte de membrana que no
o anfotericina-B) que forman poros en la membra- está en la luz de la micropipeta se degrade alcan-
na permitiendo el registro, en este caso se estaría zando una situación similar que en el caso anterior.
hablando de patch perforado. La diferencia funda- En esta con�iguración hay que tener en cuenta que
mental entre utilizar la rotura de la membrana o la parte interna de la membrana queda expuesta al
su perforación con antibiótico estriba en la capaci- �luido del baño por lo que este debe ser un líquido
dad de difusión de sustancias entre el electrodo y que contenga los componentes del líquido intra-
celular, del mismo modo el líquido de relleno de la
el interior celular, alterando en mayor o menor me-
pipeta debe ser un líquido extracelular. En este caso
dida el medio intracelular. La utilización de poros
la ventaja fundamental estriba en poder estudiar
en la membrana permite el contacto eléctrico con
un canal iónico exponiendo su porción intracelular
una reducida capacidad de difusión y dilución de los
a diversas moléculas o segundos mensajeros que
componentes internos, preservando mejor el medio
puedan regular su funcionamiento.
interno de la célula, lo que resulta fundamental para
el estudio de canales que requieren la presencia de
moléculas intracelulares para funcionar correc- Registro de célula completa y aislamiento
tamente. Las posibilidades de la con�iguración de de corrientes macroscópicas
célula completa se explicarán detalladamente más
adelante. Con esta técnica se obtiene un registro intra-
celular con una baja resistencia eléctrica de acceso
Para el estudio de un «canal aislado» en un
que permite conseguir un control sobre el voltaje de
fragmento de membrana existen dos posibilidades.
la célula �ijándolo a los valores deseados y estudiar
En la primera de ellas, partiendo de la situación de las corrientes que genera la célula a esos volta-
célula completa, se puede retroceder la micropipeta jes. Para estos estudios el tipo de preparación más
arrastrando la membrana pegada a él, si la tensión adecuada sería un cultivo celular donde las células
es su�iciente se puede conseguir que la membrana presenten un aspecto esférico y no tengan prolon-
colapse, consiguiendo que se cierre sobre el electro- gaciones, con esta disposición la �ijación de voltaje
do formando un pequeño parche de membrana que es completa en todas las regiones de la célula. En
mantendrá su cara interna hacia la luz de la micro- el caso de utilizar preparaciones ex vivo las células
pipeta y la externa hacia el exterior (con�iguración pueden presentar geometrías complejas y por tan-
outside-out, Figura 12.14). En esta con�iguración se to cabe la posibilidad de que algunas regiones de la
puede obtener un registro de la actividad de uno o célula donde pueden encontrarse canales de interés
unos pocos canales que se sitúan en este fragmen- no se puedan �ijar al voltaje deseado, lo que puede
to de membrana. Mediante la �ijación del voltaje se confundir la interpretación de los resultados.
puede modi�icar la diferencia de potencial a ambos Esta técnica puede utilizarse para estudiar co-
lados de la membrana consiguiendo estudiar el fun- rrientes producidas por canales dependientes de
cionamiento de canales dependientes de voltaje, voltaje, como por ejemplo los canales de sodio que
también se pueden aplicar ligandos del canal en el producen el potencial de acción, o de ligando, como
caso de canales dependientes de ligando o se puede los receptores inotrópicos de glutamato presentes
exponer la cara extracelular del canal a diversos fár- en la mayor parte de las sinapsis excitadoras en el
macos para alterar su funcionamiento. sistema nervioso central. Hay que tener en cuenta
En la otra posibilidad, partiendo desde la po- que como se está registrando la corriente produci-
sición de gigasello, pero sin romper el parche de da por la totalidad de canales de la célula, va a ser
membrana, se retrocede el electrodo produciendo necesario aislar el tipo de corriente que se quie-
que la membrana se estire y colapse, si este estira- re estudiar para evitar la in�luencia del resto. En
miento se produce en un medio con bajo calcio la el caso de estudiar corrientes dependientes de li-
membrana no es capaz de fusionarse por lo que el gando, el aislamiento es más sencillo puesto que se
302
Técnicas electrofisiológicas
Figura 12.16: (A) Registro de corrientes de potasio transitorias y sostenidas utilizando un protocolo de pulsos de voltaje entre -80 y +50
mV (a) para activar ambos tipos de corriente, un prepulso hasta -10 mV consigue activar las corrientes transitorias y que se inactiven per-
mitiendo medir de forma aislada las corrientes sostenidas (b), �inalmente la corriente transitoria se aísla como la diferencia de las otras
dos señales al inicio del pulso (c). El aislamiento de estas corrientes requiere el bloqueo de las corrientes de calcio y de sodio utilizando
iones cadmio y tetrodotoxina, respectivamente. La grá�ica en (B) muestra una curva construida con los valores de corriente transitoria,
normalizados frente al máximo, respecto al pulso de voltaje utilizado, esta curva arroja un valor de V50 (voltaje al cual se consigue la mitad
de la corriente máxima) de aproximadamente -20 mV. Registro original obtenido de una neurona del asta dorsal espinal de ratón. Modi-
�icado de J Neurosci. 30(15):5376-83 2010.
303
Métodos en biociencias
porción intracelular del canal y se debe incorporar tiempo con el voltaje al que se analizan, dado que la
en el líquido intracelular de relleno de la micropi- cinética de algunos canales es también dependien-
peta, por ejemplo los iones cesio bloquean canales te del voltaje. Si los canales de estudio presentan
de potasio si se introducen en la célula, pero no si se inactivación, es decir, solo se mantienen activos
añaden al �luido extracelular. transitoriamente, también se puede caracterizar la
Una vez que la corriente de interés está ade- dependencia de voltaje de esa inactivación constru-
cuadamente aislada se pueden analizar toda una yendo curvas de corriente-voltaje.
serie de parámetros que caracterizan el funciona- En el caso de estar registrando una neurona
miento de los canales responsables. La intensidad situada dentro de un tejido también se pueden re-
de corriente para determinado voltaje se puede uti- gistrar las corrientes sinápticas. Si se dispone de
lizar directamente como valor de referencia o mejor una vía o tracto que aporte una entrada de infor-
utilizar como un valor relativo al tamaño de cada mación sináptica a la neurona de estudio se puede
célula utilizando la densidad de corriente (intensi- estimular esa vía desencadenando la respuesta si-
dad –pA– dividido por capacidad de la célula –pF–), náptica. Mediante un protocolo de voltaje adecuado
puesto que un mayor número de canales va a de- y herramientas farmacológicas se pueden estudiar
terminar una cantidad de corriente superior. Para las respuestas producidas por neurotransmiso-
las corrientes dependientes de voltaje, dentro de los res excitadores o inhibidores por separado (dado
parámetros más comunes se encuentra el voltaje de que ambos pueden con�luir en la misma neurona
activación o, lo que es lo mismo, a qué voltaje se co- en diferentes sinapsis). Por ejemplo, las corrien-
mienzan a abrir los canales responsables. Además tes mediadas por el neurotransmisor glutamato se
se pueden estudiar otros parámetros relacionados pueden aislar de la respuesta generada por neuro-
con la dependencia de voltaje de los canales, repre- transmisores inhibidores realizando los registros al
sentando la corriente obtenida a diferentes voltajes potencial de equilibrio para iones cloro, dado que
se pueden construir curvas donde obtener el valor los principales neurotransmisores inhibidores pre-
al cual se activa el 50% de la corriente (V50) que es sentan receptores ionotrópicos permeables para el
un parámetro muy utilizado (Figura12.16b). cloro, pero también se pueden utilizar bloqueantes
El análisis de las características cinéticas para estos receptores. En el caso de no disponer de
de la corriente también puede proporcionar un una vía de entrada de información sináptica que se
buen número de valores útiles para caracterizar el pueda activar, también se pueden estudiar las co-
funcionamiento de los canales responsables. De- rrientes sinápticas espontaneas que se producen
pendiendo del tipo de corriente se pueden estudiar por la activación y el disparo de potenciales de ac-
las constantes de tiempo de activación, inactiva- ción en elementos presinápticos al que se estudia
ción o desactivación, para obtener datos acerca de (Figura 12.17a) . Así se analizan el número y la am-
la velocidad de apertura de los canales o el tiempo plitud de los eventos producidos para obtener una
que tardan en inactivarse o desactivarse. Incluso se idea acerca del funcionamiento del circuito en el
puede estudiar la relación de estas constantes de que se encuentra el elemento de estudio.
Figura 12.17: Registros originales de neuronas espinales de ratón mos-
trando corrientes espontaneas excitadoras (A) y corrientes excitadoras en
miniatura después de la aplicación de tetrodotoxina (B). Los registros se
realizaron a -70 mV para minimizar la contribución de las corrientes inhi-
bidoras. Calibración 20 pA y 100 ms. Registros obtenidos por los autores.
304
Técnicas electrofisiológicas
Otra alternativa en línea con esta última apro- de ligando o de voltaje. En el caso de ser dependien-
ximación seria el estudio de corrientes sinápticas te de voltaje en ambas con�iguraciones es posible
en miniatura, que se consiguen cuando se abolen controlar la diferencia de potencial entre ambos
los potenciales de acción utilizando tetrodotoxina. lados de la membrana y es posible �ijarla al valor
En esta situación se produce la liberación estocás- deseado para controlar el funcionamiento del ca-
tica de vesículas sinápticas en algunos contactos nal. Sin embargo, en el caso de tratarse de un canal
sinápticos, de tal forma que se consigue registrar dependiente de ligando, es importante diferenciar
la corriente generada por la liberación de una úni- si se trata de un ligando intracelular o extracelular,
ca vesícula de forma aislada en un único contacto porque de ello puede depender la elección de una
sináptico (Figura 12.17b). Así se puede estudiar con�iguración u otra.
tanto la maquinaria presináptica de liberación de En el caso de tratarse de un ligando extra-
vesículas como el funcionamiento de los receptores celular, como por ejemplo un neurotransmisor
post-sinápticos. u hormona, el empleo de la con�iguración outsi-
de-out es en principio más adecuada porque facilita
la aplicación del ligando a la porción externa de la
Registro de canal único membrana y por tanto del canal (Figura 12.18A). En
esta con�iguración la parte interna de la membrana
Como se mencionó anteriormente, tras la obten-
quedaría hacia el interior de la pipeta conteniendo
ción del gigasello se puede aislar un fragmento de líquido intracelular, el recambio o adición de com-
membrana para realizar un registro de la corriente puestos al interior de la pipeta es harto complicado
generada por uno o unos pocos canales presentes mientras se está registrando, pero el líquido exter-
en ese fragmento. Tanto la con�iguración inside-out no se recambia adecuadamente porque está en el
como outside-out permiten estudiar estas corrien- baño, con lo cual esta con�iguración facilita el pro-
tes, pero en cada una de ellas se consigue una ceso de aplicación del ligando en la cara externa de
diferente disposición y accesibilidad de las porcio- la membrana, mientras que lo di�icultaría para ha-
nes intra- y extracelular de la membrana, debido cerlo en sobre la cara interna.
a esto una con�iguración puede resultar más con- Si se pretende estudiar la modulación de un
veniente que otra dependiendo del estudio que se canal por ligandos intracelulares, como por ejemplo
quiera realizar. Estos estudios son más fáciles de calcio o ATP, el �luido que se debería poder modi�i-
realizar en cultivos celulares porque requieren de car de una forma precisa sería el líquido intracelular,
un sellado excelente entre la membrana y el elec- en el cual se podría controlar la concentración del
trodo para conseguir que el ruido se reduzca al ligando. En este caso la con�iguración inside-out per-
mínimo y se puedan registrar las corrientes de pe- mite disponer de la porción interna de la membrana
queña magnitud (del orden de pA) generadas por (y del canal) expuesta hacia fuera del electrodo en
un único canal. contacto con un líquido con una composición seme-
A la hora de estudiar un canal iónico es impor- jante al �luido intracelular, mientras que la porción
tante diferenciar si se trata de un canal dependiente externa de la membrana quedaría hacia la luz del
305
Métodos en biociencias
306
Técnicas electrofisiológicas
307
13.
Técnicas de imagen
funcional
José Antonio López García
Elsa Cisneros
La visualización de la estructura interna del cuerpo Al mismo tiempo, estas tecnologías pioneras
sin necesidad de maniobras de disección laboriosas en su tiempo permitieron estudiar a un nivel mo-
e invasivas ha sido un sueño largamente perse- lecular la estructura tridimensional de grandes
guido por la ciencia médica. A �inales del siglo ��� moléculas como el DNA (por difracción de rayos X)
y principios del �� se establecieron las bases de la o realizar estudios farmacológicos de interacción
radiogra�ía gracias a los experimentos de Röntgen, entre ligandos y receptores (autorradiogra�ía).
Becquerel y los Curie. Estos pioneros descubrieron El último cuarto del siglo �� produjo avances
fuentes de radiación no visible que atraviesa la ma- importantes en la tecnología radiográ�ica que con-
teria y puede impresionar el papel fotosensible.
dujeron a las técnicas de tomogra�ía computarizada
Los rayos X y las radiaciones gamma, proce- (Figura 13.2 derecha). Estas técnicas han mejorado y
dentes de elementos como el uranio y el radio, son re�inado la radiogra�ía básica en varios sentidos. Pri-
radiaciones electromagnéticas de la misma natura-
mero incorporan fuentes de radiación más ligeras y
leza que la luz pero con una longitud de onda mucho
menos dañinas para los tejidos y segundo sustituyen
menor. Esta característica les permite atravesar la
el papel fotosensible por detectores electrónicos.
materia con mucha más e�iciencia que la luz, si bien
su gran energía rompe enlaces químicos en este Estas dos mejoras han conducido a la obtención
tránsito produciendo daños al tejido expuesto. Ade- de imágenes más ricas en las que se pueden dis-
más, la radiación es absorbida por la materia en un tinguir con claridad tejidos blandos de distintas
porcentaje que depende de su energía y de la densi- densidades. Finalmente, incorporando tecnología
dad de la materia. computacional, han conseguido generar modelos de
Estas propiedades permitieron hacer las visualización tridimensional del cuerpo.
primeras radiogra�ías, que son proyecciones bi- Todos estos avances han preparado el terreno
dimensionales de partes del cuerpo en las que se para el desarrollo de las técnicas de imagen fun-
visualiza con claridad el hueso frente a los tejidos cional, donde el foco cambia de la estructura a la
blandos (Figura 13.1 izquierda). Durante muchos función. La imagen funcional serviría por ejemplo
años se usaron para el diagnóstico de fracturas y para investigar qué parte del cerebro es respon-
malformaciones óseas. sable de la generación y control del movimiento
Métodos en biociencias
Figura 13.1: La imagen de la izquierda muestra una de las primeras radigra�ías conocidas (la mano de la Sra.
Röntgen). La imagen de la derecha muestra un máquina de tomogra�ía axial computarizada (TAC) moderna. Las
máquinas de PET y RMI tienen una apariencia semejante.
corporal. Para responder a una pregunta como esta 13.1. Tomografía de emisión de positrones
no basta con conocer la estructura del cerebro, se (PET)
necesita saber dónde se encuentran las neuronas
cuya activación sirve para para preparar o ejecu- La tecnología PET comenzó a desarrollarse en los
tar el movimiento. Pero, ¿cómo puede una técnica años 50 y se basa en el principio �ísico de la «emi-
óptica proporcionar información del estado de ac- sión por aniquilación» que se explica a continuación
tivación de una célula? Las técnicas que se discuten a un nivel puramente intuitivo, ya que la �ísica sub-
en este capítulo registran las señales ópticas que se yacente encierra una complejidad que supera los
producen como consecuencia de los cambios en el límites de este manual.
ambiente �ísico y químico de las células y que a su Los positrones son partículas subatómicas
vez correlacionan con su estado de activación. elementales que se caracterizan por ser la antipar-
Las células requieren energía para llevar a tícula del electrón: tienen su misma masa pero con
cabo sus principales funciones, así como los pro- carga positiva. Cuando un positrón y un electrón
chocan accidentalmente se aniquilan produciendo
cesos que permiten su mantenimiento. Puesto que
una radiación gamma en direcciones opuestas so-
el suministro y consumo de nutrientes y oxígeno
bre una misma línea.
está ajustado a la demanda energética de los teji-
En los años 70 se construyeron detectores de
dos, especialmente en el caso del tejido nervioso, su
radiación gamma formando anillos de tal forma que
medida constituye una manera indirecta de medir
el sujeto de estudio podía situarse en su interior.
la actividad celular. En este capítulo se discutirán
Allí donde ocurran choques de electrones y positro-
en detalle dos técnicas que se basan en este tipo de
nes se producirán radiaciones gamma. La posición
aproximación, la tomogra�ía de emisión de positro-
aproximada de la colisión podrá ser reconstruida
nes y la resonancia magnética funcional. ya que se detectarán dos radiaciones gamma simul-
Las técnicas de imagen funcional de nivel ce- táneamente en dos lugares del anillo de detección
lular suponen un método más directo para medir la electrónico. Esto nos permitirá establecer la línea
actividad puesto que se basan en la medida de los de origen. Si en el mismo lugar siguen ocurriendo
cambios que ocurren en las células excitables como choques, estos producirán distintas líneas de ori-
parte del proceso de activación, es decir, la varia- gen cuya intersección informará sobre el punto de
ción en el potencial de membrana, los cambios en origen.
las concentraciones de ciertos iones, o la liberación Los anillos de detectores pasarán información
de neurotransmisores. Aquí se verán en detalle las continua sobre los impactos detectados a un orde-
técnicas de imagen de calcio, las más utilizadas en la nador que será capaz de situar el foco de origen de
actualidad, y las técnicas de imagen de voltaje. los choques allí donde ocurren usando una tecno-
310
Técnicas de imagen funcional
Figura 13.2: La imagen muestra el proceso de aniquilación, la captación de radiación gamma, su con-
versión en señales digitales y la visualización en un ordenador. Modi�icado de http://www.slideshare.
net/tmhnehru/handout-rmnlectureapplication-of-radiationinmedicineandresearch30122013.
logía basada en la tomogra�ía (Figura 13.2) que en da para ser utilizados como trazadores biológicos,
última instancia nos permitirá generar imágenes por lo que deben ser incorporados a moléculas más
tridimensionales. complejas para dar lugar al radiofármaco en un la-
boratorio radiofarmacéutico. El radiofármaco más
utilizado actualmente en la PET es la (18F)-2-�luo-
13.1.1. Radiofármacos ro-desoxi-D-glucosa (2FDG). Sin embargo para
distintos propósitos pueden usarse otras combina-
Las colisiones entre electrones y positrones no ocu-
ciones de radionúcleo y compuesto de uso biológico,
rren de forma espontánea en los tejidos y esto hace
pueden marcarse por ejemplo grupos amonio o
necesario que a los sujetos experimentales haya
neurotransmisores.
que administrarles un radiofármaco.
Los radiofármacos se componen de un radio-
núcleo (componente emisor de positrones) y de 13.1.2. Administración y funcionamiento
una molécula usada de forma habitual por el orga- del radiofármaco
nismo, por ejemplo glucosa. Los radionúcleos son
isótopos radiactivos del carbono (11C), el nitrógeno El radiofármaco de elección se administra al sujeto
(13N), el �lúor (18F) u otros elementos. Los radionú- generalmente por vía intravenosa y luego se espe-
cleos se producen en ciclotrones y, debido a su corta ra aproximadamente 1 h para que este se distribuya
vida media de emisión, es necesario que el lugar de adecuadamente por los diversos compartimentos
uso se encuentre relativamente próximo al lugar de del organismo. En el caso de la 2FDG, esta es trans-
producción. Esto hace que estas técnicas sean más portada al interior celular de la misma manera que
rentables en grandes núcleos urbanos donde mu- la glucosa normal no marcada. Una vez dentro de
chos hospitales usan la producción de un ciclotrón la célula, es fosforilada y la forma fosoforilada ya
próximo. no puede abandonar libremente la célula, por tan-
Los radionúcleos producidos en los ciclotrones to se acumula en su interior. Las células más activas
no tienen la forma química y farmacéutica adecua- consumen más glucosa y por tanto concentran
311
Métodos en biociencias
más 2FDG. El radiofármaco irá perdiendo positro- plo a nivel pragmático, la escasa durabilidad de los
nes atrapado en su localización celular de tal forma radiofármacos así como su escasa disponibilidad
que en estas zonas de acumulación la probabilidad en lugares alejados del lugar de producción es una
de colisión y aniquilación aumenta extraordina- limitación clara. Además, aunque la técnica no es in-
riamente con respecto a las zonas donde no hay vasiva, al estar basada en radiación, su uso debe ser
acumulación del radiofármaco. Se calcula que por espaciado convenientemente para evitar una expo-
término medio, un positrón tras ser liberado se des- sición excesiva.
plaza aproximadamente 1 mm antes de colisionar En el plano técnico hay que hacer varias con-
con un electrón. La radiación liberada en este pro- sideraciones. La PET tiene una baja resolución
ceso servirá para detectar el origen de la emisión temporal ya que para completar un escáner se
como ya se ha explicado. requieren de 1 a 2 minutos. Por esta razón algu-
nos fenómenos que son muy dinámicos, como por
ejemplo la función cerebral, resultan di�íciles de ob-
13.1.3. Aplicaciones de la PET en clínica servar con esta técnica. Asimismo, la localización
e investigación espacial del foco de emisión tiene un error medio de
± 1 mm debido a que no todos los positrones emiti-
La tomogra�ía de emisión de positrones se utiliza de
dos colisionan con electrones a la misma distancia
forma intensiva en oncología. Una de sus aplicacio-
de la emisión. Finalmente, esta técnica es exclusi-
nes más común es la detección precoz de recidivas
vamente funcional y no proporciona información
de tumores que ya han sido extirpados previa-
anatómica. Esto obliga a realizar una tomogra�ía
mente. Puesto que las células tumorales tienen un
computarizada a los sujetos sin cambiar de posi-
crecimiento anormalmente rápido y por tanto un ción de tal manera que las imágenes funcionales
mayor consumo de glucosa, se utiliza la 2FDG para obtenidas se puedan superponer a las imágenes
detectar su presencia. La PET es extraordinaria- anatómicas para localizar el foco.
mente sensible, de tal forma que se puede detectar
un pequeño grupo de células tumorales antes de
que se produzcan metástasis, siempre y cuando los
13.2. Resonancia magnética funcional (fMRI)
escáneres se realicen de manera periódica.
También se usan estas técnicas en cardiología,
La tecnología basada en la resonancia magnética
psiquiatría y neurología. Se puede valorar la via-
constituye la forma más moderna y más promete-
bilidad del miocardio, detectar focos epilépticos o
dora de producir imagen anatómica y funcional de
ayudar en el diagnóstico de enfermedades neurode-
gran calidad de los órganos y tejidos del cuerpo.
generativas o incluso neuropsiquiátricas.
La tomogra�ía por resonancia magnética (o reso-
La PET permite, además, la obtención de imá- nancia magnética nuclear) es la técnica precursora
genes de la farmacocinética y farmacodinámica de esta familia y solo produce imagen anatómica.
de distintas drogas y fármacos. Pueden emplearse Posteriormente se desarrollaron procedimientos
como radiotrazadores los mismos fármacos mar- basados en la misma tecnología para producir ima-
cados con 11C o 18F, o bien puede medirse su efecto gen funcional (resonancia magnética funcional). La
sobre el �lujo sanguíneo, el metabolismo de la gluco- �ísica subyacente es muy compleja y una explicación
sa o la ocupación de receptores especí�icos. exhaustiva sobre estos aspectos está fuera de las in-
La investigación neurobiológica se ha servido tenciones de este libro. Por razones pedagógicas y
de esta técnica para estudiar la localización de fun- también biográ�icas, se empezará revisando la téc-
ciones cerebrales sobre la base de que las neuronas nica de resonancia magnética nuclear.
más activas durante la realización de una función
especí�ica consumen más glucosa. La miniaturiza-
ción de equipos PET ha permitido el uso de estas 13.2.1. Resonancia magnética nuclear
técnicas con pequeños animales de laboratorio im-
Los principios �ísicos de la resonancia magnéti-
pulsando su uso en investigación.
ca nuclear se estudiaron en los años 30 y 40 en el
entorno de la investigación militar y se han desarro-
13.1.4. Limitaciones de la PET llado en años posteriores para dar lugar a técnicas
como la espectroscopia, que sirve para estudiar fe-
Las limitaciones de esta técnica vienen dadas por nómenos �ísicos a nivel molecular y la generación
cuestiones puramente pragmáticas y también por de imágenes en biomedicina, tema que nos interesa
alguna de sus características técnicas. Así, por ejem- aquí. Las primeras imágenes basadas en resonancia
312
Técnicas de imagen funcional
Figura 13.3: Imagen de un escáner. La imagen en A muestra un escáner anatómico obtenido por medio de RMI. La imagen en B muestra
escáneres funcionales obtenidos con fMRI durante la realización de tareas. C muestra una reconstrucción tridimensional del cerebro con
imágenes de fMRI. El grado de activación neuronal en cada zona se muestra por un código de colores. Disponible en color.
313
Métodos en biociencias
del cuerpo de animales experimentales se obtu- magnéticas muy favorables. La utilización del hidró-
vieron en los años 70 y su creador, Paul Lauterbur geno permite obtener imágenes anatómicas de gran
obtuvo el premio Nobel por su trabajo en 2003. calidad y sensibilidad en planos tomográ�icos que
La resonancia magnética es un fenómeno �ísico permiten hacer reconstrucciones tridimensionales
por el cual algunos núcleos atómicos sometidos a un del objeto de estudio.
campo magnético pueden absorber y emitir radia- Para poder realizar una imagen de resonan-
ción electromagnética. Este fenómeno de absorción cia magnética, los pacientes son introducidos en un
ocurre a una radiofrecuencia dada a la que se llama escáner de MRI que genera un fuerte campo magné-
frecuencia de resonancia. La frecuencia de resonan- tico alrededor de la zona que se va a estudiar.
cia depende de la intensidad del campo magnético y Esta tecnología se usa de forma rutinaria hoy
de las propiedades del núcleo estudiado. en día en los hospitales para una gran variedad de
La obtención de imágenes por resonancia pasa funciones en servicios de oncología (detección de
por la siguiente secuencia de acontecimientos: tumores), neurología (detección de trastornos por
desmielinización, demencia, trastornos cerebro-
— Primero la muestra (o sujeto) de estudio vasculares, etc.), cardiovascular (diagnóstico de
debe someterse a un campo magnético, lo miocardiopatías) y se usa también para la detección
cual producirá el alineamiento (o polariza- y caracterización de lesiones de hígado, páncreas y
ción) de los núcleos atómicos polarizables. conductos biliares.
La tecnología para producir campos mag-
néticos de gran intensidad se ha mejorado
mucho, de tal forma que hoy se puede lle- 13.2.2. fMRI
gar a producir un campo magnético de
hasta 7 Tesla. Muchos equipos en uso en Esta técnica es un procedimiento que produce imá-
hospitales usan campos magnéticos de 1.5 genes de la actividad cerebral estimadas a partir de
a 3 Tesla. cambios en �lujos sanguíneos locales. La actividad
— Después el alineamiento es perturbado cerebral produce cambios de �lujo sanguíneo y de
por la emisión de un pulso de ondas de ra- oxigenación de la sangre. Cuando las neuronas de
dio. La frecuencia de estas ondas vendrá un área cerebral se activan, aumenta su consumo de
dada por el núcleo que se quiera observar oxígeno y esto provoca una respuesta hemodinámi-
y por la intensidad del campo magnético ca por la cual el �lujo local aumenta en esa área y la
al que está sometido (frecuencia de reso- sangre oxigenada desplaza a la desoxigenada.
nancia). Las ondas de radio son campos El mecanismo por el cual el sistema nervioso
magnéticos oscilantes y se aplican en una informa del aumento en sus necesidades de oxígeno
dirección perpendicular a la dirección del se relaciona con la liberación de neurotransmiso-
campo magnético estático. res (glutamato) cuando se producen potenciales de
— La terminación del pulso producirá un re- acción. El glutamato liberado en exceso es transpor-
torno de los núcleos al estado polarizado tado por los astrocitos, lo que genera un cambio de
original dentro del campo magnético es- concentración de calcio en su interior y esto a su
table. vez produce liberación de óxido nítrico que tiene un
— Los cambios electromagnéticos produci- efecto vasodilatador sobre las arteriolas.
dos por estos fenómenos de perturbación La respuesta hemodinámica producida por la
y realineación de los núcleos inducen co- activación neuronal consiste en una desoxigena-
rrientes eléctricas en antenas receptoras. ción instantánea de la sangre seguida por un pico
— Las señales inducidas en las antenas son de oxigenación que llega de 2 a 6 s después. Poco
convertidas en una imagen de densi- después de este pico de oxigenación, la sangre vuel-
dad del núcleo resonante a través de un ve a alcanzar su nivel normal de oxígeno, siempre y
complejo análisis computacional (�igura cuando la actividad neuronal se normalice también.
13.3). Si la actividad neuronal persiste, se mantienen los
niveles altos de oxigenación.
En principio son muchos los núcleos que se pue- La forma original de fMRI usa el contraste de-
den estudiar con esta técnica. En la práctica el más pendiente de la oxigenación de la sangre (BOLD
usado es el átomo de hidrógeno (protón). Es muy por sus siglas en inglés). El oxígeno es transporta-
abundante en el agua y otras muchas moléculas do en sangre por la hemoglobina y la hemoglobina
presentes en los tejidos y además tiene propiedades desoxigenada es paramagnética mientras que la oxi-
314
Técnicas de imagen funcional
genada no lo es. Esta propiedad paramagnética de pletamente inocuas, hoy en día se está poniendo
la desoxihemoglobina intensi�ica local y débilmente un gran interés en dilucidar los efectos especí�icos
el campo magnético estático producido por el equi- que produce la exposición a campos magnéticos de
po de registro alterando la resonancia magnética de gran intensidad. Se reportan casos de estimulación
la sangre y tejidos inmediatamente circundantes. de nervios periféricos, calentamiento del cuerpo y
Las primeras imágenes producidas en animales de riesgo carcinogénico en el largo plazo.
experimentación por este procedimiento las obtu- En condiciones normales se admite que la
vo Seiji Ogawa en 1990. En 1992 se obtuvieron las prueba puede producir una ligera incomodidad
primeras imágenes en seres humanos y hoy en día debido a ruidos y el efecto potencialmente claustro-
se utilizan de manera rutinaria en muchos laborato- fóbico que puede producir en algunas personas. En
rios y hospitales. todos los casos es necesario evitar la utilización du-
En resumen, estos cambios locales de oxige- rante los escáneres de objetos metálicos y la prueba
nación de la sangre y, por tanto, la activación de está contraindicada en sujetos con implantes de vál-
áreas cerebrales concretas se representan grá�ica- vulas cardíacas.
mente en planos cerebrales con un código de color
que muestra el grado de activación (Figura 13.3b y
c). Esta técnica es precisa en el espacio y puede lo-
calizar cambios pequeños con una precisión de 13.3. Técnicas de imagen funcional celular
milímetros, sin embargo su resolución temporal es
más pobre ya que la realización de un escáner re- Aunque técnicas como las descritas en el apartado
quiere varios segundos. anterior ofrecen la posibilidad de realizar medidas
Existen voces críticas que advierten que es- de la activación celular, estas no están directamen-
tas estimaciones de la actividad cerebral se basan te relacionadas con la actividad del tejido objeto de
en el supuesto acoplamiento entre los procesos de estudio y tienen una resolución temporal baja (del
activación neuronal y consumo de oxígeno. Además orden de segundos). Las técnicas que se detallan en
la respuesta hemodinámica es relativamente len- este apartado solventan estos problemas, además
ta con respecto de la activación neuronal. A pesar de presentar otras ventajas.
de estas críticas que deben ser tenidas en cuenta, Las técnicas de imagen funcional celular tie-
la fMRI es hoy en día una técnica de elección para nen su origen en las técnicas de imagen destinadas
la investigación neurobiológica en seres humanos. a visualizar especímenes histológicos que, gracias a
numerosos desarrollos tecnológicos, han evolucio-
nado hasta hacer posible el registro de los procesos
13.2.3. Limitaciones de la resonancia magnéti- que ocurren en las células vivas.
ca
El elemento fundamental en estas metodolo-
Las técnicas basadas en la resonancia magnética gías es el marcador exógeno, una molécula externa
son en general más convenientes que las de PET si al organismo capaz de actuar como reportera de los
bien es cierto que no siempre son intercambiables cambios moleculares o celulares que se producen
y hay problemas especí�icos que requieren PET. Sin como consecuencia de la activación celular.
embargo la fMRI no usa radiofármacos y por tanto Puesto que las técnicas de imagen funcional
no expone a los sujetos a radioactividad ni depen- celular se aplican fundamentalmente al estudio
de de la proximidad de los centros de fabricación de del sistema nervioso, este apartado se centrará en
estos. Además la fMRI es simultáneamente una téc- la obtención de imágenes funcionales en el teji-
nica funcional y anatómica simpli�icando mucho los do neural. La activación neuronal comienza con un
procedimientos. cambio en el potencial de membrana que se sucede
PET y fMRI comparten ciertas limitaciones de cambios en la concentración intracelular de cal-
referidas a la resolución espacial y temporal de cio o en la señalización sináptica. A continuación se
las imágenes. En el caso del análisis funcional del explicarán las técnicas de imagen que se basan en
cerebro donde estas limitaciones pueden ser res- el uso de marcadores de calcio, que son sensibles
trictivas, se compensan con diseños experimentales a los cambios de concentración de calcio intrace-
adecuados, por ejemplo usando repetición de tareas lular, y marcadores de voltaje, que son sensibles a
de tal forma que los escáneres se puedan repetir y los cambios en el potencial de membrana. Puesto
promediar para evitar errores. que los marcadores son moléculas exógenas es ne-
A pesar de que a las técnicas basadas en la cesario introducirlos en las neuronas. Los métodos
resonancia magnética se las ha considerado com- para cargar las neuronas varían tanto en función
315
Métodos en biociencias
del marcador, como de la pregunta experimental. sináptica en las dendritas y la regulación de la trans-
Una vez que los marcadores se han incorporado cripción génica en el núcleo. Todos estos procesos,
al interior celular o a la membrana plasmática, las además de ocurrir en diferentes compartimentos
señales que emiten, cambios en la absorbancia o celulares, tienen duraciones muy variables que van
emisión de �luorescencia, se registran mediante mi- de los microsegundos hasta las horas.
croscopios confocales o multifotónicos acoplados a Los marcadores de calcio varían la emisión de
dispositivos de captura de imágenes, normalmente �luorescencia en respuesta a los cambios en la con-
cámaras de video de alta velocidad. El uso de soft- centración de calcio en el interior de la célula, por
ware especí�ico hace posible la interpretación y lo que proporcionan información sobre el estado
cuanti�icación de las señales obtenidas. Gracias al de activación neuronal. Por otra parte, si se analiza
desarrollo de los marcadores y de las tecnologías la localización y la duración de las señales de calcio
óptica e informática, estas metodologías permi- también es posible inferir cuáles son los procesos
ten la visualización en tiempo real de eventos que celulares que están mediando.
ocurren durante amplias escalas de tiempo (desde El papel clave del calcio en la transmisión
microsegundos hasta horas) y en amplias escalas sináptica, y por tanto el procesamiento de la in-
de espacio (desde el nivel sub-celular hasta grandes formación en el sistema nervioso, ha motivado el
grupos de neuronas) con una elevada resolución esfuerzo que se ha realizado durante las últimas
espacial (20-50 µm) y temporal (por debajo del mi- cuatro décadas para desarrollar nuevos marcado-
lisegundo). Además, pueden aplicarse al estudio del res de calcio y la instrumentación necesaria para
funcionamiento de diferentes tipos celulares, en di- detectar sus cambios. Como resultado, la imagen de
versos organismos, in vitro (en cultivos celulares o calcio es la metodología más avanzada en imagen
rodajas de tejido) o in vivo (en animal anestesiado, funcional de nivel celular y se utiliza en muchos la-
o despierto y en movimiento), y en condiciones nor- boratorios de neurociencias en la actualidad.
males y patológicas.
Marcadores de calcio
13.3.1. Técnicas de imagen de calcio
Indicadores de calcio bioluminiscentes
Señalización de calcio en las neuronas
Este tipo de indicadores fueron de los primeros en
Los iones de calcio generan señales intracelula- usarse. A �inales de los años 60 varios grupos uti-
res que median una gran variedad de funciones en lizaron como marcador de calcio la acuorina, una
prácticamente todos los tipos celulares de los se- foto-proteína derivada de la medusa luminiscente
res vivos. En las neuronas, cada potencial de acción, Aequorea victoria. La acuorina está compuesta por
por lo general, produce la apertura de los canales una apoproteína, la apocuorina, que contiene tres
de calcio dependientes de voltaje de la membrana lugares de unión al calcio y un cromóforo unido no
plasmática del soma y del árbol dendrítico. Como covalentemente, una combinación de coelenterazi-
resultado, hay un breve aumento de los niveles de na y oxígeno molecular. Tras la unión de los iones
calcio, que puede mediar procesos tan variados de calcio, la proteína sufre un cambio conformacio-
como la liberación de neurotransmisores desde el nal que resulta en la oxidación de la coelenterazina
terminal presináptico, la inducción de la plasticidad a coelenteramida. Esta última emite un fotón con
470 nm
O2
C + Ca
2+
C + CO2
CO2
316
Técnicas de imagen funcional
una longitud de onda de 470 nm como resultado tre 505-520 nm. Gracias a estas características, si se
del paso del estado excitado al estado basal (Figu- combina el uso de fura-2 con la microscopía confo-
ra 13.4). La relación señal-ruido obtenida con la cal es posible realizar una medida ratiométrica de
acuorina permite detectar variaciones en la con- la concentración de calcio en la neurona. La relación
centración de calcio de 10-7 a 10-3 M. La acuorina, al entre la emisión para cada longitud de onda de ex-
igual que otras proteínas bioluminiscentes, no re- citación es proporcional a la cantidad de calcio en
quiere iluminación externa, por lo que con su uso la célula y no depende de la cantidad de marcador
se evita la fototoxicidad, la pérdida de señal por so- o el tamaño de la célula. El fura-2 no permite reali-
breexposición, la auto�luorescencia y la activación zar medidas ratiométricas si se usa el microscopio
de procesos biológicos fotosensibles. Como contra- de dos fotones debido a su espectro de excitación.
partida, cada molécula lleva a cabo un solo ciclo de En este caso, se realizan medidas de la intensidad
emisión y su vuelta al estado excitado es lenta, de de la �luorescencia emitida, que disminuye cuando
manera que las señales obtenidas son débiles y con aumentan los niveles de calcio intracelular. Por otra
poca resolución temporal. Por otra parte, la acuori- parte, la microscopía de dos fotones ofrece buenas
na obtenida por extracción a partir de la medusa no secciones ópticas y permite realizar dobles mar-
atraviesa la membrana plasmática y debe microin- cajes de fura-2 con GFP, gracias a que sus picos de
yectarse. El clonaje de la proteína ha permitido su absorción están bastante separados (Figura 13.5).
expresión en una gran variedad de tipos celulares Las siguientes generaciones de indicadores
e incluso en compartimentos intracelulares de- sintéticos son excitables en un amplio rango del es-
�inidos. Además, se ha combinado con proteínas pectro. Las familias de marcadores Oregon Green
�luorescentes para aumentar la intensidad de emi- BAPTA y �luo-4, por ejemplo, se excitan a una úni-
sión. No obstante, en estos casos es necesario una ca longitud de onda (en torno a los 488 nm) y por
tanto no permiten realizar medidas ratiométri-
suplementación exógena de coelenterazina.
cas. Sin embargo, la elevada relación señal-ruido y
la compatibilidad con diferentes métodos de carga
Indicadores de calcio sintéticos convierten a estos marcadores en la mejor opción
para registrar señales de calcio in vivo. Los indi-
Los primeros indicadores de calcio sintéticos fue- cadores de calcio excitables a longitudes de onda
ron desarrollados por Roger Tsien en los años 80. largas, como Rhod-2, son muy útiles para medir el
Estos marcadores son el resultado de la hibridación calcio en tejidos con elevada auto�luorescencia.
de un quelante del calcio, como por ejemplo el EGTA Muchos indicadores están disponibles en la
o el BAPTA, con un cromóforo �luorescente. Durante forma éter acetoximetil (AM) y pueden atravesar la
las últimas décadas se han desarrollado numerosos
marcadores con diferentes a�inidades por el calcio y
diferentes propiedades espectrales.
La primera generación de indicadores de calcio
estaba formada por quin-2, fura-2, indo-1 y �luo-3.
Intensidad de fluorescencia
[Ca2] máxima
El marcador quin-2 fue el primer marcador
emitida a 510 nm
317
Métodos en biociencias
FRET 530 nm
480 nm
Figura 13.6: GECIs basados en FRET. Tras la unión de calcio a cameleon el dador ECFP y el aceptor Venus se aproximan. Esto permite que
se produzca el fenómeno de FRET, disminuyendo la emisión de �luorescencia de 480 nm (azul) y aumentando la de 530 nm (amarilla).
membrana. No obstante, en experimentos de larga por una proteína �luorescente cian mejorada
duración las formas AM de los indicadores pue- (ECFP), que actúa como dador, y la proteína Venus,
den translocarse a compartimentos intracelulares o que actúa como aceptor. Ambas proteínas están
unirse a proteínas, alterando la especi�icidad de las fusionadas por la proteína de unión al calcio cal-
señales obtenidas. La Rhod-2 AM, por ejemplo, se modulina y el péptido de unión a la calmodulina,
capta principalmente por las células gliales, por lo M13. En ausencia de iones de calcio domina la emi-
que no se usa en los estudios de imagen neuronal. sión de �luorescencia azul de la ECFP (480 nm).
Para solventar estos problemas se han desa- Tras la unión del calcio, un cambio conformacio-
rrollado indicadores acoplados a dextranos. Los nal intramolecular disminuye la distancia entre la
dextranos son polisacáridos hidro�ílicos, de baja ECFP y la proteínas Venus, que se excita y emite fo-
toxicidad e inertes biológicamente. Di�ícilmen- tones con una longitud de onda de 530 nm. Como
te pasan a los compartimentos intracelulares ni se consecuencia disminuye la �luorescencia azul y au-
unen a proteínas citosólicas. Además, los dextra- menta la amarilla (Figura 13.6). La señal de calcio
nos se transportan de manera activa por las �ibras se expresa como la relación entre la emisión de
nerviosas adultas y se retienen en los terminales �luorescencia de las dos proteínas. La calmoduli-
presinápticos, de forma que permiten monitorizar na de estos indicadores puede unirse a proteínas
la dinámica de calcio presináptica. endógenas. Para evitarlo, se han usado formas mu-
En resumen, los indicadores de calcio sintéti- tadas de la calmodulina o esta se ha sustituido por
cos proporcionan una buena relación señal-ruido, la troponina, que no tiene parejas endógenas en
tienen una cinética rápida, sufren poca saturación las neuronas.
de la señal cuando se excitan con dos fotones y no Una segunda familia de marcadores de este
tienen efectos farmacológicos colaterales. Su princi- tipo es la GCaMP que consta de tres elementos: la
pal desventaja es que son di�íciles de cargar en tipos proteína �luorescente verde mejorada (EGFP) �lan-
celulares especí�icos y no es posible usarlos en ex- queada por la calmodulina y por el péptido M13.
perimentos que requieren registros de duración de En presencia de calcio, la calmodulina y el
varios días. péptido M13 interaccionan y aumenta la cantidad
de �luorescencia emitida por la EGFP. Estos GECIs
Indicadores de calcio codificados genéticamente son los más usados en experimentos in vivo (Figu-
(GECIs) ra 13.7).
Los GECIs, en general, permiten realizar regis-
Los GECIs (genetic encoded calcium indicators) tros crónicos durante largos periodos de tiempo en
empezaron usarse hace más de 10 años. Pueden ba- poblaciones neuronales de�inidas e incluso en com-
sarse en el sistema de transferencia de energía de partimentos celulares determinados. Además, los
resonancia de Förster (FRET) o en la emisión de GECIs basados en el sistema FRET son los más indi-
�luorescencia de un único �luoróforo. cados para realizar experimentos in vivo, ya que las
Los primeros GECIs pertenecen a la fami- señales que emiten tienen poco solapamiento con
lia cameleon. Estos marcadores están formados la auto�luorescencia de los tejidos. Sin embargo, la
318
Técnicas de imagen funcional
a 2+
a
lmodulin Ca
lmodulin
Ca Ca 3
EGFP EGFP M1
M1
3
Figura 13.7: GECIs basados en un solo �luoróforo. La unión de calcio a GCaMP provoca un cambio conformacional que provoca una au-
mento en la intensidad de la emisión de �luorescencia a 515 nm.
cinética de los GECIs es lenta, su expresión a largo Carga por baño de indicadores sintéticos
plazo puede resultar citotóxica y pueden modi�icar que permean la membrana
de manera signi�icativa la concentración de calcio
intracelular cuando se expresan en altos niveles. Este tipo de carga sirve para marcar poblaciones ce-
lulares con indicadores sintéticos en forma AM.
Para la carga in vitro, las muestras se incuban
Afinidad de los indicadores por el calcio en una solución del marcador, que gracias a la natu-
raleza hidrófoba del grupo AM atraviesa fácilmente
La disponibilidad de marcadores con diferentes la membrana. Una vez en el interior de la célula, el
a�inidades es una característica importante pues- grupo AM se hidroliza por las esterasas intracelula-
to que el rango de concentraciones de calcio varía res, y el indicador queda retenido en el citosol. La
desde el nivel nanomolar (por ejemplo, en los com- concentración del colorante, tiempo de incubación,
partimentos celulares más grandes) hasta el nivel y temperatura deben determinarse empíricamente
micromolar (por ejemplo, en dominios de calcio ad- para cada preparación experimental. Una incuba-
yacentes a la membrana plasmática). Por otra parte, ción prolongada o a temperaturas elevadas puede
todos los indicadores de calcio, a excepción de la provocar la carga del marcador en los compartimen-
acuorina, actúan como tamponadores exógenos de tos intracelulares. Esto debe evitarse puesto que los
calcio, y por tanto pueden modi�icar la dinámica del cambios en la concentración de iones de calcio en
calcio intracelular. estos compartimentos no re�lejan con exactitud los
La a�inidad por el calcio se mide por la cons- cambios en la concentración de calcio citosólica.
tante de disociación (Kd). La Kd se mide en unidades Para la carga in vivo, los marcadores AM se
de molaridad y hace referencia a la concentración aplican usando una micropipeta que se descarga
de calcio necesaria para unir la mitad de moléculas mediante presión positiva de aire. Generalmente,
del indicador. La Kd varía en función de paráme- este método se usa para marcar el parénquima ce-
tros como el pH, la temperatura o la presencia de rebral y se consiguen teñir áreas de entre 300-500
otros iones. Las señales obtenidas con indicadores µm (Figura 13.8)
con baja a�inidad re�lejan de manera más precisa La e�iciencia de la carga por baño de los mar-
las variaciones en la concentración de calcio cito- cadores tipo AM depende de la edad, siendo más
sólico, pero producen señales menos intensas. Por elevada en las preparaciones de individuos jóvenes.
tanto, todos estos factores deben tenerse en cuen- Por otra parte, el marcaje mediante este método es
ta para elegir el indicador de calcio más adecuado inespecí�ico.
para cada tipo de experimento.
Microinyección
Administración de los marcadores de calcio
Sirve para marcar células individuales en cultivo
La carga de los indicadores de calcio en la neurona celular o en rodajas de tejido con los indicadores
depende del tipo de indicador, el tipo de prepara- bioluminiscentes o sintéticos que no atraviesan
ción y la pregunta experimental. la membrana celular (Figura 13.8). En los prime-
319
Métodos en biociencias
Microinyección
Marcadores bioluminiscentes
Marcadores sintéticos Baño
Marcadores-AM Electroporación
Marcadores sintéticos
GECIs
Carga retrógrada
Marcadores-dextrano
Figura 13.8: Resumen esquemático de los métodos de carga de los diferentes tipos de in-
dicadores de calcio en la corteza cerebral.
ros experimentos de imagen de calcio se usaban método se consigue un marcaje disperso. El área y
microelectrodos estirados. Actualmente está es- la especi�icidad del marcaje dependen de la edad
tandarizada la inyección mediante el uso de micropi- del embrión y de la con�iguración de los electro-
petas de whole-cell clamp ya que es común combinar dos. Tiene la ventaja de que no hay limitaciones en
los experimentos de registro de célula entera y la ad- cuanto al tamaño del DNA a introducir, y que se pue-
quisición de imágenes de calcio. de aplicar en especies en las que la transgénesis no
Para aumentar la especi�icidad celular, la mi- está disponible.
croinyección se puede realizar en animales en los
que una determinada población neural está marca- Carga retrograda
da mediante transgénesis o transducción viral.
En el caso de los indicadores acoplados a dex- Se utiliza para los marcadores sintéticos acoplados
tranos, se tranportan anterogradamente desde el a un dextrano y permite marcar poblaciones neuro-
soma hasta el axón. nales en preparaciones in vitro. Los indicadores se
aplican por presión positiva de aire con una micro-
pipeta sobre la super�icie de las �ibras axonales. Los
Electroporación
terminales captan el marcador que se transporta
Se usa para cargar indicadores sintéticos que no retrógradamente hacia los somas celulares y tam-
atraviesan la membrana o GECIs en una única cé- bién queda retenido en el terminal sináptico donde
lula o una población neural in vitro e in vivo (Figura permite estudiar la transmisión sináptica (Figura
13.8). En el primer caso, se coloca una micropipe- 13.8).
ta sobre la neurona de interés. En el segundo, la Este método de carga se ha usado con éxi-
micropipeta se coloca en la región de interés. La co- to para registrar señales del terminal sináptico de
rriente eléctrica cumple dos cometidos. Perturba neuronas del bulbo olfatorio, el cerebelo y la médu-
la integridad de la membrana plasmática de mane- la espinal de ratón.
ra transitoria permitiendo la entrada del marcador
dentro de la célula, y mueve las moléculas carga- Transducción viral y transgénesis
das del marcador hacia el interior de la célula. Este
método no es especí�ico, de manera que casi todas Estas dos estrategias son la principal manera de ex-
las células, neuronas y células gliales, bañadas por presar los GECIs en poblaciones neurales in vivo.
el marcador y sometidas a la corriente eléctrica, se La transducción viral permite expresar los GE-
cargan. CIs en dominios especí�icos del cerebro mediante
In vivo esta técnica se ha usado para marcar inyección estereotáxica o en determinados tipos
poblaciones neurales de la corteza cerebral, el bul- neurales usando promotores especí�icos. En la ac-
bo olfatorio y el cerebelo de ratón. tualidad los lentivirus y los virus adenoasociados
La electroporación in utero se usa para intro- son los vectores virales más usados. Los primeros
ducir GECIs en los precursores neurales. Con este pueden contener DNA de mayor tamaño. Ambos
320
Técnicas de imagen funcional
Figura 13.9: Ejemplo de registro de las señales de calcio en dendritas de células de Purkinje in vivo. Izquierda: imagen de �luorescencia de
dos células de Purkinje electroporadas con Oregon Green BAPTA-1 y dibujo esquemático en el que se delimitan las áreas de los árboles den-
dríticos de cada una de las células (arriba). Imágenes �ijas de las señales de calcio en dos puntos temporales. Para la interpretación de las
señales se asigna de manera arbitraria un color a una concentración de calcio. Así, las concentraciones más bajas de calcio se representan
en azul y las más altas en rojo (abajo). Derecha: curso temporal de las señales de calcio en los árboles dendríticos de las dos neuronas. Las
barras verticales se corresponden con las fotos �ijas de la izquierda. Los cambios relativos en la �luorescencia se expresan como ΔF / F. Ex-
traído de Göbel and Helmchen. J Neurophysiol. 2007. 98:3770-9. Disponible en color
tienen la capacidad de liberar varias copias de su La imagen de calcio obtenida mediante mi-
genoma por célula, por lo que proporcionan niveles croscopía confocal en rodajas de cerebro o cerebelo
de expresión elevados a largo plazo, y presentan po- ha servido para demostrar que las señales de calcio
cos efectos adversos. Para conseguir especi�icidad pueden estar restringidas a las espinas dendríti-
se pueden usar promotores especí�icos de tipo ce- cas. Además, la administración de bloqueantes de la
lular. Alternativamente, se pueden generar vectores transmisión sináptica durante este tipo de experi-
dependientes de la recombinasa e inyectarlos en mentos ha servido para identi�icar los mecanismos
líneas de ratones con la expresión de la Cre recom- moleculares responsables de activar la señaliza-
binasa bajo un promotor especí�ico. ción de calcio en las dendritas de diferentes tipos
La generación de ratones transgénicos está en celulares. Por otra parte, se ha demostrado que las
desarrollo. Varios de los intentos para generar lí- señales de calcio en las dendritas son fundamen-
neas transgénicas han resultado fallidos, puesto tales para que se den los procesos de depresión
que no se ha conseguido la expresión de indicado- sináptica a largo plazo en el cerebelo.
res funcionales. Actualmente hay disponibles unas El registro de las señales de calcio en el ter-
pocas líneas. Un ejemplo sería una línea de ratón minal presináptico de las neuronas piramidales de
que expresa GCamp2 en el bulbo olfatorio y que la corteza cerebral ha demostrado que un solo po-
muestra señales de calcio en respuesta a estímulos tencial de acción es capaz de provocar una señal de
olorosos. calcio en el terminal sináptico y que las señales de
calcio de mayor intensidad están localizadas princi-
palmente en los botones sinápticos.
Aplicaciones y limitaciones En los últimos años, la microscopía multi-fotó-
nica se ha combinado con la imagen de calcio para
Las técnicas de imagen de calcio se han usado prin- registrar la actividad en las espinas dendríticas in
cipalmente en mamíferos como la rata y el ratón, vivo (Figura 13.9). Una de sus aplicaciones ha sido la
pero también se han aplicado con éxito a inverte- investigación de la distribución espacial y temporal
brados, como Aplysia, Drosophila y el calamar, y de los inputs sinápticos en las neuronas corticales.
otros vertebrados como el pez cebra, la rana y la Recientemente, los experimentos de imagen en ani-
tortuga. males despiertos han permitido analizar las señales
Los marcadores de calcio se aplican de mane- de calcio en respuesta a estímulos determinados y
ra relativamente poco invasiva, son muy sensibles y establecer los mapas funcionales de los inputs si-
permiten analizar la función de las señales de calcio nápticos de una neurona especí�ica.
a nivel presináptico, en el terminal, o postsináptico, La imagen de calcio también se ha usado
en las dendritas. extensamente para monitorizar la actividad de po-
321
Métodos en biociencias
blaciones de neuronas interconectadas. Los primeros re�lejan �ielmente los cambios en el potencial de
experimentos a nivel poblacional se realizaron para membrana de la célula. Además, los marcadores de
estudiar la actividad sináptica en la corteza, el hipo- calcio pueden inducir cambios en la concentración
campo y la retina. En este tipo de experimentos a de calcio intracelular, afectando a las medidas ob-
partir de las señales de calcio somáticas se in�iere la tenidas.
actividad de disparo, de manera que se obtienen re-
gistros del disparo de cientos a miles de neuronas de
un circuito neuronal y a la vez, del disparo de cada
13.3.2. Técnicas de imagen de voltaje
neurona individualmente. In vivo se ha investigado El potencial de membrana sufre cambios rápidos
la respuesta de los barriles corticales al estímu- durante el transcurso de un potencial de acción así
lo de las vibrisas o la preferencia de orientación de como durante las oscilaciones subumbrales y por
las neuronas de la corteza visual. El desarrollo de ello se considera que los cambios de voltaje son la
minimicroscopios portátiles ha permitido analizar primera señal de interés y la forma más directa para
las señales de calcio en circuitos cerebrales de ani- monitorizar la actividad neural. Los marcadores
males despiertos que ejecutan tareas complejas. sensibles a voltaje son capaces de responder rápida-
Aunque este tipo de estudios se realiza principal- mente a los cambios en el potencial de membrana,
mente en roedores, su uso se ha extendido a otras aun cuando estos son de una amplitud muy baja,
especies, incluyendo a los primates. por lo que proporcionan señales de elevada especi-
Finalmente, la disponibilidad de modelos ani- �icidad y resolución temporal. Estas características
males de diversas enfermedades ha propiciado el hacen que esta técnica, pese a presentar importantes
estudio de las señales de calcio en condiciones pa- limitaciones, no se haya sustituido completamente
tológicas. por las técnicas de imagen de calcio.
Las técnicas de imagen de calcio tienen una
elevada sensibilidad y resolución espacial. No Principio general
obstante, su resolución temporal es limitada, no
permiten detectar los cambios subumbrales más Los marcadores sensibles a voltaje se unen a la
pequeños y, aunque sirven para monitorizar poten- super�icie externa de la membrana celular sin inte-
ciales de acción, no permiten cuanti�icar el número rrumpir el funcionamiento normal de la célula. En la
de espigas o la frecuencia de disparo. Por este mo- membrana celular actúan como transductores mole-
tivo esta metodología no ha podido sustituir a las culares transformando los cambios del potencial de
técnicas de imagen de voltaje. membrana en cambios en la absorción o emisión de
Por otra parte, las señales de calcio no solo res- �luorescencia. Las señales ópticas así obtenidas son
ponden al in�lujo de calcio a la célula a través de los pequeñas, pero correlacionan linealmente con los
canales de voltaje de la membrana plasmática, sino cambios en el potencial de membrana y con el área
que también varían por la entrada de calcio desde de la membrana de todos los elementos teñidos.
los compartimentos intracelulares, por lo que no La validez de las señales obtenidas con los
marcadores sensibles a voltaje quedó patente al
comprobar su elevada correlación con las señales
obtenidas mediante registros electro�isiológicos en
experimentos que combinaban ambas técnicas (Fi-
gura 13.10).
322
Técnicas de imagen funcional
Figura 13.11: Resumen esquemático de los mecanismos responsables de los cambios en las propiedades ópticas de los marcadores sensi-
bles a voltaje.
323
Métodos en biociencias
D A
I I I I
A D
l l l l
FRET
A D A
- + -D +
+ + + +
+ + + +
+ + + +
+ + + +
+ - + -
Fluorescencia sencilla FRET
ArcLight VSFP butterfly 1.2
Figura 13.12: GEVIs basados en la �luorescencia de una sola proteína o de un sistema FRET. D:
donador. A: aceptor.
los ANINEs, se excitan a longitudes de onda cortas y marcará las membranas de las células de alrededor,
tienen mayor solubilidad, por lo que se pueden apli- persistiendo el problema de inespeci�icidad.
car más fácilmente. El desarrollo de marcadores de voltaje adecua-
Los principales inconvenientes derivados del dos para la excitación con un fotón o dos fotones
uso de marcadores de voltaje orgánicos son los si- ha permitido obtener señales de elevada resolu-
guientes: ción óptica en medios de elevada dispersión óptica,
como el tejido de los mamíferos.
— Baja accesibilidad al tejido: no tiñen todas No obstante, ha sido el desarrollo de marca-
las células del tejido al que se aplican. Es- dores codi�icados genéticamente el que ha resuelto
tos marcadores difunden, de manera que varios de los problemas derivados del uso de los
se forma un gradiente desde el punto en marcadores de voltaje orgánicos.
el que se han aplicado.
— Falta de especi�icidad: tiñen diferentes
Indicadores de voltaje codificados genéticamente
elementos neurales, por lo que la detec-
(GEVIs)
ción e interpretación de las señales de
interés se ve di�icultada por la señal de Los canales iónicos y otras proteínas poseen sus
fondo de las células inactivas, o por las se- propios sensores de voltaje, que están localizados
ñales de células que no son el objeto de en la membrana y expuestos a su campo eléctrico.
estudio. Los primeros GEVIs (genetic encoded voltage
— Baja resolución espacial: mientras que indicators), como FlaSh, SPARC o VSFP1, se desarro-
en las preparaciones de invertebrados se llaron a partir de canales de potasio dependientes
puede llegar a registrar el potencial de ac- de voltaje, o sus dominios sensores de voltaje, sin
ción de una única neurona, en el tejido de modi�icar y fusionados a una proteína �luorescente.
mamíferos no es fácil obtener resolución La localización de estos marcadores en la membra-
celular. na es limitada, tienen una relación señal-ruido baja,
— Toxicidad su cinética es lenta y además son citotóxicos.
La siguiente generación de GEVIs (cuyos miem-
Para resolver los problemas de falta de especi�ici- bros se denominan genéricamente como VSFPs) se
dad y resolución espacial, los marcadores orgánicos diseñó usando el dominio sensor de voltaje de la
�luorescentes se pueden microinyectar en la célula fosfatasa de Ciona intestinalis (CiVSP) fusionado a
de interés de la preparación y la señal se puede ob- una sola proteína �luorescente o a un par de pro-
tener usando microscopía confocal o multifotónica. teínas. Los mecanismos de sensibilidad al voltaje
De esta manera es posible visualizar los potenciales di�ieren entre las diferentes modi�icaciones genéti-
de acción de las dendritas o las espinas dendríti- cas (Figura 13.12). En el caso más simple, el sensor
cas. No obstante, si el marcador se libera por error de voltaje o la molécula reportera sufren un cambio
fuera de la célula durante el proceso de inyección, conformacional que altera su espectro, como por
324
Técnicas de imagen funcional
325
Métodos en biociencias
gradiente desde la corteza hasta la sustancia blanca. La salamandra, la rana y el ratón fueron las
En ambos casos el marcador se capta desde el espa- primeras especies usadas para registrar in vivo la
cio extracelular y el marcaje es inespecí�ico. actividad del sistema olfatorio, visual y somatoseno-
rial respectivamente. Estos primeros experimentos
Carga retrógrada se realizaron con el animal anestesiado. En los úl-
timos años se han realizado registros de voltaje en
Se usa para cargar marcadores orgánicos en prepa- ratón y mono despiertos.
raciones in vitro como, por ejemplo, las rodajas de La técnica de imagen de voltaje ha permitido
cerebro. El marcador se puede aplicar en forma de realizar mapas cerebrales funcionales, tales como
solución con una micropipeta o en forma de cristal los mapas de orientación o de dominancia ocular,
solido sobre los troncos de los nervios. El marca- de alta resolución. Gracias a experimentos in vivo,
dor difunde a través de la membrana. El marcaje es se ha podido visualizar la dinámica espaciotem-
inespecí�ico. poral de la respuesta a estímulo sencillos, como la
estimulación de una vibrisa (Figura 13.14), o com-
Microinyección plejos, como una imagen en movimiento. Además,
la exploración de las conexiones intracorticales e
Este método se usa tras realizar experimentos de intercorticales ha permitido obtener información
registro intracelular. El marcador se introduce di- anatómica y �isiológica, además de funcional, de las
rectamente en la célula y difunde hasta unirse a la redes locales de la corteza visual.
membrana plasmática. Es más especí�ico que las La adecuada localización de los marcadores de
dos técnicas anteriores. voltaje en la membrana es un factor crítico para la
obtención de señales mediante estas técnicas. Si el
Transducción viral y transgénicos marcador no se integra en la membrana o su posi-
ción en esta no es la correcta las señales obtenidas
Se utiliza para los GEVIs. Se explica en el epígrafe de no re�lejarán con precisión los cambios en el vol-
«Técnicas de imagen de calcio» (13.3.1). taje de la membrana. Por otro lado, la membrana
es una estructura muy �ina, de unos pocos nanó-
Aplicaciones y limitaciones metros, cuya área en una imagen bidimensional es
signi�icativamente menor que la del citosol. Como
El procesamiento sensorial, la coordinación moto- consecuencia, las señales que se obtienen median-
ra y las funciones cerebrales superiores se llevan a te marcadores de voltaje son de menor intensidad
cabo por complejas redes neuronales formadas por que las obtenidas mediante indicadores de calcio.
millones de neuronas organizadas en columnas cor- Por tanto es necesario que los marcadores sean
ticales. Para poder registrar la actividad a este nivel muy e�icientes, utilizar fuentes de iluminación po-
es necesario una resolución de alrededor de 200 tentes o promediar, espacial o temporalmente, las
µm. Además, la comunicación en estas redes ocurre señales obtenidas para que la relación señal-ruido
en milisegundos. Las técnicas de imagen de voltaje sea la adecuada. La baja intensidad de las seña-
se ajustan a estos requisitos de resolución espacial les de los marcadores de voltaje es especialmente
y temporal, y por ello son la mejor opción para el es- problemática en los experimentos in vivo, donde la
tudio de la dinámica del procesamiento cortical. De auto-�luorescencia puede enmascarar las señales
hecho, junto con la imagen basada en señales intrín- especí�icas. La iluminación excesiva de la membra-
secas, es la técnica más usada para el estudio de la na para mejorar las señales de voltaje no resuelve
función cerebral in vivo. totalmente el problema, puesto que puede com-
Los primeros experimentos de imagen de prometer la integridad de la membrana e incluso
voltaje se realizaron en células en cultivo o en pre- provocar la muerte de la célula, razón por la que la
paraciones de invertebrado, como el ganglio de la imagen de voltaje ha caído en desuso y se ha susti-
sanguijuela o el axón gigante de calamar, con una re- tuido por la imagen de calcio.
solución celular. En el resto de casos, la técnica tiene Por otra parte, la membrana plasmática es solo
resolución de población neuronal. una porción de todas las membranas que contiene
In vitro, la técnica se ha usado principalmente la célula. Cualquier marcador que se una a las mem-
en rodajas de cerebro de ratón y hurón y su uso ha branas internas de la célula contribuirá a la señal
permitido registrar la actividad del hipocampo, la de fondo. Además, la membrana tiene una capaci-
corteza visual, la corteza somatosensorial y la cor- dad limitada para albergar moléculas de marcador.
teza auditiva. Si se sobrecarga, las propiedades de la membrana
326
Técnicas de imagen funcional
Figura 13.14: Activación de las células de los barriles corticales en respuesta a la estimulación de las vibrisas. En la parte superior de la
�igura se muestran las imágenes de voltaje a diferentes tiempos tras la estimulación de una vibrisa. Los cambios relativos en la �luorescen-
cia se expresan como ΔF / F. Las concentraciones más bajas de calcio se representan en azul y las más altas en rojo. Abajo a la izquierda
se muestra el mapa funcional resultante de estimular la vibrisa D2 y se delimitan cada uno de los barriles corticales. Abajo a la derecha se
muestra la intensidad de la respuesta en cada uno de los barriles corticales. Extraído de Wang et al Eng. J Neural Eng. 2012. 9:026008.
Disponible en color.
pueden alterarse, de manera que los resultados ob- cerebral agrupadas verticalmente que comparten
tenidos serán artefactuales. los mismos campos receptivos) y por tanto tienen
Finalmente, los elementos teñidos por los una escala de análisis mesoscópica.
marcadores sensibles a voltaje incluyen diferentes
tipos neurales (neuronas y células gliales), y dife-
13.3.3. Adquisición de imágenes funcionales
rentes compartimentos celulares (soma, axón y
celulares
dendritas). Puesto que es posible que todos estos
elementos se marquen por igual, hay que considerar Las señales que se generan mediante las técni-
que las señales ópticas tienen múltiples componen- cas de imagen celular se registran por medio de
tes. Las señales producidas por la glía son débiles, un dispositivo de captura de imagen acoplado a un
y lentas (se producen varios segundos después microscopio. Dependiendo de la aplicación, el mi-
del estímulo), por lo que es improbable que la ac- croscopio se acoplará a la fuente de luz adecuada.
tividad glial participe de manera signi�icativa en la La adquisición de las imágenes de prepara-
señal obtenida. En base a las diferencias en el área ciones in vitro se realiza mediante microscopios de
de los compartimentos celulares en la corteza cere- campo ancho o microscopios confocales invertidos
bral, es comúnmente aceptado que la señal óptica que permiten la perfusión de la muestra. Según los
en un pixel determinado procede principalmen- requisitos del experimento se usan junto con lám-
te de las dendritas de las células y por tanto re�leja paras de mercurio o xenón, que permiten cambiar
actividad post-sináptica. En cualquier caso, las se- fácilmente la longitud de onda de excitación. En los
ñales obtenidas mediante las técnicas de imagen de experimentos en los que se realizan medidas ra-
voltaje son complejas por lo que se han desarrolla- tiométricas es necesario alternar rápidamente la
do modelos computacionales para reproducirlas y excitación a dos longitudes de onda, por lo que se
analizarlas. Estos modelos suelen considerar que usan ruedas de �iltros. El uso de luz estroboscópi-
la unidad de procesamiento en el cerebro es la co- ca ha permitido alcanzar una elevada resolución
lumna cortical (conjunto de células de la corteza espacial, de manera que este parámetro está limi-
327
Métodos en biociencias
328
14.
Transferencia génica
Yolanda Loarce
Juan Manuel González-Triguero
La transferencia génica hace referencia a la intro- por Watson y Crick de que el DNA de todos los or-
ducción en una célula de moléculas de DNA foráneo. ganismos tiene la misma composición y estructura,
Este fenómeno se produce de forma natural tanto y el descubrimiento de las enzimas de restricción
en bacterias, durante los procesos de transforma- en bacterias, que las utilizan como mecanismo de
ción, conjugación y transducción, como en células defensa frente a la entrada de DNA extraño, degra-
eucariotas al darse algunos tipos de infección bac- dándolo.
teriana o viral, incluso se puede dar entre el DNA de Las enzimas de restricción son «tijeras mole-
orgánulos como las mitocondrias y/o los cloroplas- culares del DNA», y se caracterizan por reconocer
tos y el DNA nuclear. Una vez transferido el DNA, secuencias especí�icas en la doble hélice, por donde
este se puede integrar o intercambiar con el DNA cortan el DNA mediante la ruptura de dos enlaces
de la célula dando lugar a un DNA recombinante, fosfodiéster. Los blancos de las enzimas son se-
como resultado de la reunión de dos DNAs de dis- cuencias de DNA palíndrómicas con 4, 6 u 8 pares
tinta procedencia. de bases (pb), a las que se unen para cortar la do-
Este capítulo se va a centrar en los mecanis- ble hebra, generándose dos tipos de extremos tras
mos de transferencia génica empleados en los el corte, romo o cohesivo, dependiendo de si los en-
laboratorios de biología molecular, que son de gran laces fosfodiéster rotos se encuentran enfrentados
utilidad en estudios básicos, en biotecnología y te- o no en la molécula de DNA (Figura 14.1).
rapia génica. Además de las enzimas de restricción, las cé-
lulas cuentan con muchos otros tipos de enzimas
de modi�icación de ácidos nucleicos que participan
14.1. El DNA recombinante en los diferentes procesos biológicos. Estas proteí-
nas, una vez identi�icadas y caracterizadas, han sido
El desarrollo de la Ingeniería Genética o Tecnología aisladas y puri�icadas desde diferentes tipos celula-
del DNA recombinante en la década de los 70 del res o virus para su utilización in vitro. Una de estas
siglo �� proporcionó las herramientas que hacen enzimas de uso habitual en el laboratorio es la li-
posible la manipulación de los genomas. Dos des- gasa, que participa en la replicación promoviendo
cubrimientos fueron determinantes, el deducido la formación de los enlaces fosfodiéster entre los
Métodos en biociencias
Figura 14.1: Tipos de extremos de DNA generados por las enzimas de restricción. Dispo-ni-
ble en color.
fragmentos de Okazaki. La combinación de enzi- Por el contrario, las nucleasas son enzimas
mas de restricción con la ligasa permite la unión que degradan ácidos nucleicos ejerciendo su ac-
de fragmentos de DNA de diferentes procedencias. tividad de forma especí�ica sobre DNA o RNA,
Al cortar DNAs distintos con la misma enzima de rompiendo enlaces fosfodiéster en el interior de
restricción se generan fragmentos con las mismas la molécula (actividad endonucleasa) o a partir de
marcas en los extremos, que se pueden pegar fácil- un extremo (actividad exonucleasa 3’-5’ o 5’-3’).
mente por la acción de la enzima ligasa, dando lugar Algunas polimerasas tienen asociadas a su acti-
a una única molécula de DNA que recibe el nombre vidad de polimerización una o las dos actividades
de «DNA recombinante». Más adelante se indican exonucleasas. La 3’-5’ permite eliminar los aparea-
las características que deben reunir estas moléculas mientos incorrectos durante la síntesis, de ahí que
sintéticas para poder ser transferidas a las células se la denomine «actividad correctora de pruebas»,
para su clonación y expresión. resultando de gran interés en los casos en los que
es necesario sintetizar DNA con una alta �idelidad
de copia.
14.2. Enzimas de modificación de los ácidos Dentro del tercer grupo, se encuentran las
nucleicos enzimas que modi�ican los extremos de las molécu-
las de DNA, favoreciendo o impidiendo la unión de
En la actualidad se dispone de multitud de enzimas fragmentos en una reacción de ligación, actuando
que permiten modi�icar los DNAs in vitro para su sobre los elementos que participan en la forma-
ampli�icación, secuenciación, clonación y expresión ción del enlace fosfodiéster. Destacan las fosfatasas
en células u organismos. En general, las enzimas de responsables de la eliminación del grupo fosfato
modi�icación de ácidos nucleicos se pueden clasi�i- del extremo 5’, y las quinasas que añaden el gru-
car en polimerasas, nucleasas y un tercer grupo que po fosfato en el caso de moléculas defosforiladas.
recoge las no incluidas en las dos categorías ante- Otras enzimas como las metilasas, responsables
riores. de adición de grupos metilo (-CH3), o la transfera-
Las polimerasas son enzimas que sintetizan sa terminal, que se encarga de la incorporación de
DNA a partir de una molécula molde. Algunas tra- nucleótidos trifosfatos (dNTPs) a un extremo de la
bajan especí�icamente sobre DNA y otras lo hacen molécula, añaden elementos nuevos a las moléculas
sobre RNA (transcriptasas inversas). Una de sus para facilitar su análisis o caracterización.
principales características es que carecen de acti-
vidad primasa, por lo que no pueden sintetizar de
novo una molécula de DNA, sino que necesitan un 14.3. Clonación de DNA en bacterias
cebador que aporte un extremo 3’-OH a partir del
cual ir añadiendo nucleótidos en dirección 5’-3’ El análisis y caracterización estructural de un geno-
bajo la dirección de la cadena molde. ma requiere de su fragmentación y multiplicación
330
Transferencia génica
para tener cantidad su�iciente de cada fragmen- En el caso de fragmentos pequeños de DNA (menor
to obtenido. Una forma de mantener y multiplicar de 3 kpb) es habitual la utilización de los plásmidos,
(clonar) los fragmentos de DNA genómico (gDNA) o que son moléculas de DNA duplexo circular presen-
de DNA copia (cDNA) si proceden de la retrotrans- te de forma natural en muchas especies bacterianas,
cripción de una población de RNAs mensajeros es y que se replican de forma autónoma al genoma
mediante su introducción en bacterias, donde se re- bacteriano. Los plásmidos no son indispensables
plicarán y transferirán a las células hijas, proceso para la bacteria, pero pueden contener genes que
conocido como Transformación. Es importante que le aporten alguna característica de interés. Cuan-
el DNA transferido se mantenga sin degradar en el do se desea transformar bacterias con plásmidos
interior de la bacteria, se replique y se reparta du- recombinantes, es necesario tratar químicamente
rante la división. Para ello es necesaria la inclusión las bacterias para conseguir un estado �isiológico
del fragmento que se desea clonar en una molécu- de «competencia» durante el cual las bacterias son
la de DNA vector, de la que depende la replicación más permeables a la entrada de DNA del exterior.
autónoma dentro de la bacteria y el reparto entre Las bacterias competentes se mezclan con el DNA
las células hijas. La unión de los dos DNAs da lugar recombinante, y se les aplica un cambio brusco de
a una molécula de DNA recombinante, constitui- temperatura (choque térmico) o una corriente eléc-
da por el inserto (fragmento de DNA que se quiere trica (electroporación) de 1.5-1.8 Kv, procesos que
clonar) y el vector. El conjunto de clones que contie- favorecen la entrada del DNA en la bacteria.
nen en forma de fragmentos aleatorios el genoma A veces se utilizan vectores derivados de virus
completo en estudio, o los cDNA si se trata de los bacterianos (bacteriófagos o fagos), como es el caso
productos de expresión de un tipo celular parti- del fago λ, porque tienen la ventaja de que al infectar
cular, reciben el nombre de Genoteca o Librería las bacterias inyectan el DNA recombinante, aunque
genómica o de cDNA, respectivamente. estas no se encuentren en estado competente.
Se cuenta con diferentes tipos de vectores de Entre los vectores sintéticos se encuentran los
clonación, unos de origen natural y otros sintéticos. cósmidos, que reúnen características de los plásmi-
La elección de un tipo u otro depende fundamen- dos (el origen de replicación para su mantenimiento
talmente del tamaño del fragmento que se quiere en el interior de la bacteria) y de los fagos (mecanis-
clonar, generalmente mayores en las genotecas ge- mo de infección). Aunque los cósmidos son capaces
nómicas y menores en las de cDNA (Cuadro 14.1). de albergar fragmentos sensiblemente mayores que
Cuadro 14.1: Tipos de vectores utilizados en la clonación de fragmentos de DNA derivados de digestiones de genomas completos (genote-
cas genómicas) y de cDNA producto de retrotranscripción de una población de mensajeros (genotecas de cDNA).
Lambda pequeño
Lambda
331
Métodos en biociencias
los plásmidos y fagos, para la clonación de fragmen- marcadores de selección, el gen de resistencia al an-
tos genómicos muy grandes se recurre a otro tipo tibiótico ampicilina y el gen lac Z, que codi�ica para
de vectores como los BACs (cromosomas arti�icia- el extremo amino terminal de la proteína β-galac-
les bacterianos) y los YACs (cromosomas arti�iciales tosidasa y que le permite a la bacteria metabolizar
de levaduras). el galactósido X-gal que se añade al medio sóli-
Independientemente del tipo de vector elegido do de cultivo bacteriano. Este gen se localiza en el
para la clonación de un determinado fragmento de polylinker, por lo que su expresión dependerá de
DNA, todos deben tener una serie de características que en el sitio de clonación no se haya insertado
mínimas para ejercer su función: un origen de re- ningún fragmento de DNA, permitiendo diferenciar
plicación que permita la duplicación de la molécula colonias de las células transformadas por su color
de DNA recombinante y de forma independiente al blanco.
genoma bacteriano; un gen marcador que permita Hay que tener en cuenta que, a pesar de que
seleccionar las bacterias transformadas (ej. algún se optimizan las condiciones de la reacción para
gen de resistencia a antibióticos); y secuencias dia- fomentar la ligación del fragmento de DNA con la
na para distintas enzimas de restricción, que van a molécula de vector, además del DNA recombinante
cortar al vector por un único sitio (sitio de clona- hay moléculas de vector y del inserto que que-
ción). dan sin ligar y algunas moléculas del vector que
Con el tiempo, los vectores de clonación se vuelven a cerrarse. Todas estas moléculas son sus-
han optimizado. Actualmente se cuenta con vecto- ceptibles de transformar a las bacterias, pero el
res con orígenes de replicación modi�icados para crecimiento de las mismas en un medio selectivo en
obtener un elevado número de copias en el inte- presencia del antibiótico ampicilina sólo permitirá
rior de la bacteria, además contienen una región el crecimiento de las bacterias resistentes, es de-
con múltiples dianas de restricción únicas, que les cir aquellas que han adquirido DNA recombinante
proporciona una gran versatilidad para la clonación o DNA vector. Estas bacterias formarán colonias en
(polylinker). También pueden incluir sistemas de la placa de cultivo y se diferenciarán por su color, ya
detección que permitan una discriminación rápida que las colonias procedentes de bacterias con molé-
entre las bacterias transformadas con moléculas de culas de vector tienen el gen Lac Z intacto, pudiendo
DNA recombinante o con moléculas de vector o de metabolizar el galactósido del medio y serán de co-
inserto, de las no transformadas. lor azul. Sin embargo, en las colonias procedentes
Un ejemplo de plásmido mejorado es Blue- de bacterias transformadas con DNA recombinan-
script (Figura 14.2). Este vector cuenta con 2 genes te, el inserto incluido en el polylinker inactiva el gen
332
Transferencia génica
333
Métodos en biociencias
a las células para producir poros de nanómetros en luciferasa (color amarillo) y la cloranfenicol acetil
la membrana; la permeabilización de la membra- transferasa (CAT) que origina un producto de mi-
na con sales de litio y polietilén glicol y posterior gración diferencial en una cromatogra�ía de capa
choque térmico utilizado en levaduras; o la copreci- �ina, son utilizados exclusivamente en análisis de
pitación de DNA con fosfato de calcio con el que se expresión transitoria, por el mayor grado de toxici-
consigue que hasta un 90% de las células adquieran dad de las proteínas codi�icadas.
el DNA por endocitosis, aunque en menos del 5% En los ensayos de transferencia génica a célu-
se incorpora al genoma celular. Otras herramientas las eucariotas animales, los genes de selección que
con un alto porcentaje de éxito son el bombardeo incluyen los vectores suelen ser de dos tipos: a) ge-
y la microinyección. La primera utiliza partículas nes que con�ieren resistencia a antibióticos y b)
de oro o tungsteno recubiertas de DNA, que se dis- genes implicados en el metabolismo de las bases ni-
paran a gran velocidad mediante una descarga de trogenadas.
helio como si fuera una pistola, y la segunda co- Los genes que con�ieren resistencia a anti-
loca el DNA en el núcleo de células mediante una
bióticos más utilizados en transfección son: neo
microinyección, evitándose así la degradación cito-
(aminoglicósido fosforibosil transferasa) que con-
plasmática y lisosomal.
�iere resistencia a neomicina o a su análogo G418;
También hay mecanismos de introducción puro (puromicin acetil transferasa) que con�iere
del transgén mediados por vectores (liposomas, resistencia a puromicina; e higro (higromicina B
plásmidos bacterianos o virus). Los liposomas ca- fosfotransferasa) que con�iere resistencia a higro-
tiónicos se encuentran cargados positivamente e micina. Todos ellos actúan como genes de selección
interaccionan con la carga negativa del DNA, siendo positiva, es decir, las células que han captado el DNA
su principal ventaja la protección del transgén has-
recombinante, que incluye un gen de resistencia a
ta su llegada al núcleo, aunque presentan una baja
un antibiótico, serán las únicas capaces de crecer
e�iciencia de transfección. Los plásmidos bacteria-
en un medio de cultivo al que se le ha añadido di-
nos utilizados como vectores de transfección deben
cho antibiótico, que será inactivado por la acción
contener las secuencias que permitan la expresión
del producto del gen mediante la transferencia de
del transgén en la célula eucariota: promotor euca-
un grupo acetilo en el caso del gen puro, de un fosfa-
riótico, secuencias de poliadenilación, péptido líder
to como en el caso del gen higro, etc.
o secuencias que faciliten el posterior aislamien-
to de la proteína, etc. Especial atención requiere la Un segundo tipo de genes de selección son los
utilización de virus manipulados para aprovechar que intervienen en la síntesis de novo o en el reci-
la e�iciencia de la infección viral como método de clado celular de las bases púricas o pirimidínicas.
introducción de DNA, utilizándose actualmente vec- Los genes tk+ (timidinaquinasa) y hprt+ (hipoxantin
tores que carecen de casi todas las secuencias del fosforibosil transferasa) actúan reciclando nucleósi-
genoma vírico original, de los que se citarán algu- dos de timina y guanina respectivamente, mediante
nos ejemplos más adelante. la fosforilación. Para poder utilizarlos como genes
La introducción del transgén en el interior de marcadores, las células receptoras deben carecer
la célula eucariota ha de ser monitorizada de ma- de esta función génica (tk- y hprt-). El mecanismo
nera e�icaz. La mayoría de los genes introducidos de acción es el siguiente, tras la transfección, las cé-
no con�ieren a la célula ninguna característica espe- lulas se ponen a crecer en un medio de cultivo en
cial que las distinga de las células no transfectadas, presencia de aminopterina, compuesto que inhibe
por lo que junto al gen de interés hay que introdu- la síntesis de novo de las bases nitrogenadas. Una
cir genes marcadores. Se diferencian dos tipos de célula tk- o hprt- no podría crecer en presencia de
marcadores: a) genes señal que con�ieren una carac- aminopterina salvo que hubiera sido transfectada
terística diferencial a las células portadoras, como con un DNA exógeno portador del gen tk+ o hprt+.
puede ser un color distinto y b) genes de selección El gen hstk+ (timidina quinasa de herpes sim-
propiamente dichos, que con�ieren una venta- ple), funciona como un gen de selección negativa. En
ja proliferativa que permite eliminar las células no este caso las células hstk- que capturan el gen hstk+
portadoras. Entre los genes señal más utilizados se mueren en presencia del compuesto químico ganci-
encuentran el que codi�ica la proteína �luorescente clovir, que es un análogo de guanina, tóxico para la
verde (GFP) y la β-galactosidasa, responsables de la célula. La quinasa producto del gen hstk+ fosforila el
coloración verde y azul respectivamente de las célu- ganciclovir que se incorpora al DNA durante la re-
las en las que se expresan. Otros genes señal, como plicación causando la muerte celular (Figura 14.5).
los que codi�ican la β-glucurodinasa (color azul), la La aplicación de este gen de selección negativa se
334
Transferencia génica
Figura 14.5: Selección positiva (en presencia del antibiótico) y negativa (en presencia de ganciclovir) de célula
transfectadas. Disponible en color.
verá durante el proceso de obtención de ratones virus, que delimitan la región transcrita que se va a
knockout. empaquetar en las partículas víricas. Sin embargo,
el vector carece de los genes gag, pol y env, que co-
di�ican las proteínas que forman la cápside del virus
14.4.1. Vectores virales y la transcriptasa inversa, imprescindibles para la
formación de los viriones. Estos genes forman par-
El mecanismo de infección viral ha convertido a los
te del genoma de las células empaquetadoras donde
virus en el vehículo de DNA preferido en los ensa-
se producirán los virus defectivos.
yos de transfección. Están compuestos por un DNA
Los vectores virales más utilizados derivan
o RNA rodeados de una cubierta proteica y, en al-
de diferentes tipos de virus: Retrovirus (oncovirus
gunos casos, una envuelta lipoproteica, y durante el
murinus tipo C y lentivirus derivados del HIV-1),
ciclo biológico viral su genoma se puede integrar en
Adenovirus (serotipos 2 y 5), Adenoasociados y
el genoma de la célula a la que infecta. El genoma
Herpesvirus (herpes simplex HSV), etc.
del virus consta de todos los genes necesarios para
su replicación y empaquetamiento, por lo que tie-
ne que ser manipulado convenientemente para que 14.4.2. Transferencia génica para inactivación
pueda ser utilizado como vector. Los vectores vira- o modificación de genes endógenos
les deben prescindir de aquellas partes del genoma
que permitan su replicación en las células u orga- El análisis genético clásico está basado en la apa-
nismos infectados, y deben tener la capacidad de rición aleatoria de mutaciones que producen un
albergar el DNA de interés que se quiere transferir, cambio fenotípico detectable y heredable, que da
de ahí que reciban el nombre de virus recombinan- información sobre la función del gen responsable
tes defectivos. Se pueden diferenciar 4 etapas en el de ese fenotipo particular. Es decir, el fenotipo da
proceso de transfección mediado por vectores vi- información sobre el genotipo. Sin embargo, la Inge-
rales: 1) construcción del vector viral conteniendo niería genética ha proporcionado las herramientas
el gen que se quiere transferir; 2) transferencia del para abordar el análisis en sentido contrario, es
DNA recombinante a células empaquetadoras, que decir, los genes son modi�icados in vitro y se intro-
incluyen en su genoma los genes virales ausentes en ducen en células u organismos donde analizar las
el vector, pero que son necesarios para la construc- consecuencias de la modi�icación, proporcionando
ción de las partículas virales; 3) obtención de los pistas sobre la función del gen. Este tipo de análisis
viriones defectivos; y 4) infección con los viriones recibe el nombre de Genética reversa ya que el ge-
a las células diana trans�iriendo el DNA de interés. notipo nos da información sobre el fenotipo.
En la �igura 14.6 se muestra un ejemplo de transfec- Hay diferentes estrategias para la modi�ica-
ción mediada con un vector retroviral, portador de ción de los genes en el laboratorio, dependiendo
las secuencias LTR (long tandem repeats) del retro- de si la mutagénesis que se persigue es al azar o
335
Métodos en biociencias
dirigida a un sitio especí�ico. En general, se recu- Una vez introducido el DNA recombinante con el
rre a una combinación de enzimas de restricción, gen modi�icado en las células, este se puede integrar
polimerasas o nucleasas y ligasa que permiten la in- al azar en una región del genoma receptor median-
serción o deleción de nucleótidos de una molécula te recombinación heteróloga o, por el contrario,
de DNA clonada. También, el tratamiento del DNA producir el reemplazo del gen endógeno mediante
con algunos agentes químicos (Bisul�ito sódico) o recombinación homóloga. Este tipo de recombina-
análogos de bases (2-aminopurina, 5-bromouracilo, ción es muy frecuente en bacterias y levaduras pero
etc.), que producen cambios en los apareamien- muy rara en células de mamífero. La sustitución di-
tos de las bases durante la replicación, tiene como rigida de genes o «gene targeting» proporciona una
consecuencia la introducción de cambios tras un herramienta muy útil para inactivar genes, pero al
ciclo de síntesis in vitro. El principal problema de tratarse de un hecho raro (3.3x10-7 de las células
estos métodos químico-enzimáticos es que se pue- transfectadas) se han desarrollado estrategias para
den producir múltiples sustituciones en un único seleccionar o enriquecer las células transfectadas
mutante, lo que complica la interpretación de los en las que se ha producido la recombinación homó-
resultados. En la actualidad casi todos estos mé- loga. Una de estas estrategias denominada de Doble
todos han sido reemplazados por los que utilizan selección (positiva-negativa) es la que se utiliza
oligonucleótidos sintéticos de secuencia conocida. desde la década de los 80 del siglo pasado para la
Una forma sencilla de introducir la mutación es me- sustitución dirigida de genes en células madre em-
diante la utilización de cebadores que incluyan la brionarias (ES) de ratón, que pueden cultivarse de
sustitución en ampli�icaciones por PCR. Una única forma inde�inida en placas de Petri y están capacita-
modi�icación en la secuencia del cebador no impide das para originar cualquier línea celular.
su unión a la región homóloga, y una vez anillado y, El sistema de doble selección se basa en la uti-
siempre que la diferencia no se encuentre en la po- lización de dos genes marcadores de selección, que
sición 3’, la polimerasa lo utilizará para la síntesis forman parte de la molécula de DNA recombinante
de la nueva cadena. Esta cadena recién sintetizada portadora del gen de interés. Uno de los marcado-
incorpora el cambio y servirá de molde para la sín- res es un gen de selección positiva de resistencia a
tesis de nuevas cadenas en los siguientes ciclos de un antibiótico (neomicina) que se introduce en el
replicación por PCR. centro del gen de interés inactivándolo, y el segun-
336
Transferencia génica
do gen marcador es el hstk+ de selección negativa modi�icada, y, cuando alcanzan la madurez, pueden
que se sitúa en la molécula a continuación del gen producir esperma derivado de las células ES modi-
clonado. El primero permitirá la selección de cé- �icadas. Cruzando estos ratones con otros normales,
lulas transfectadas frente a las que no lo hicieron, se conseguirán descendientes heterocigotos para la
y el segundo permitirá discriminar entre aquellas mutación, es decir, portadores en todas sus células
en las que la integración en el genoma celular se de una de las dos copias del gen manipulado, pero
produjo al azar o en el sitio homólogo al gen clo- que serán sanos porque la segunda copia del gen,
nado. En la mayoría de las integraciones al azar intacta, seguirá funcionando correctamente. El cru-
la recombinación tiene lugar en los extremos de zamiento entre ratones hermanos heterocigotos
la molécula transfectada, por lo que los dos mar- permitirá la obtención de ratones homocigotos para
cadores se incorporan al genoma. Sin embargo, la la mutación (knockout), que exhibirán las anomalías
recombinación homóloga requiere del intercambio que revelan las funciones normales del gen sustitui-
con los fragmentos de DNA celulares homólogos, in- do en todas las células. La �igura 14.8 muestra un
corporándose de esta manera solo el marcador neo+ ejemplo de este procedimiento para la obtención de
y no hstk+. Por lo tanto, la doble selección en pre-
ratones knockout.
sencia del antibiótico y de ganciclovir (análogo a la
Los ratones knockout permiten estudiar efec-
guanina activado por el gen hstk+ nocivo para las cé-
lulas) asegura el crecimiento de las células en las tos de los genes cuyos productos génicos han sido
que se produjo la recombinación homóloga, ya que anulados, siempre que estos no sean vitales para
el ganciclovir matará las células transfectadas con el desarrollo del ratón. Para el análisis de la fun-
el DNA recombinante integrado al azar y que expre- ción de estos genes imprescindibles se recurre a
san hstk+ (Figura 14.7). la tecnología Cre/loxP que permite la generación
La posibilidad de manipular genéticamente de ratones knockout condicionales, en los que se
los ratones, organismos cuya organización genómi- induce la anulación de la expresión del gen en un
ca y �isiología es parecida a la de los humanos, ha tejido o momento particular del desarrollo. El me-
convertido al ratón en el organismo modelo prefe- canismo fue descubierto en el bacteriófago P1 y
rencial para el estudio de la función de los genes y se basa en la enzima Cre-recombinasa que catali-
de la causa de enfermedades compartidas (cáncer, za la recombinación entre dos sitios loxP, que son
diabetes, ansiedad…) y diferentes a las humanas, secuencias especí�icas de DNA de 34 pb. La coloca-
ya que la manipulación de sus genes puede llevar- ción y orientación de los sitios loxP a ambos lados
los a desarrollar otras patologías que naturalmente de una secuencia de DNA a recombinar determina-
no les afectan. Las células ES modi�icadas de ratón rán la región a escindir en el genoma, mientras que
se introducen en embriones muy jóvenes y se deja la disponibilidad de la enzima Cre establecerá cuán-
que se desarrollen a término. Estos ratones son una do y dónde se produce la recombinación al estar
quimera, dado que solo alguna de sus células estará bajo el control de un promotor especí�ico de tejido.
337
Métodos en biociencias
Gen de interés
inactivo
neoR
Vector hstk
retroviral
Transfección
CME de ratón
génica
Implantación en madre
Reimplante en
pseudopreñada
blastocisto
F1 ratones quiméricos
CME transfectada.
X
Recombinación homóloga
Retrocruces para la obtención de
ratones heterocigotos para el gen
inactivado
X
Figura 14.8: Procesos involucrados en la generación de ratones knockout. El vector con el gen knockout es transfectado
Fig.
1en4.8
células madre embrionarias (CME) de ratón. Las CME son cultivadas con neomicina, para seleccionar las células que in-
corporaron el vector (selección positiva) y con ganciclovir, el cual selecciona las células que realizaron una recombinación
homóloga (selección negativa). Las CME knockout son implantadas en un blastocisto de ratón y este, a su vez, es implan-
tado en una madre pseudopreñada; la descendencia corresponde a ratones quiméricos. Mediante retrocruces se obtienen
ratones homocigotos knockout para el gen inactivado. Disponible en color.
Normalmente, se desarrollan cepas de ratón del corte. Son necesarias dos moléculas ZFN unidas
Cre y cepas loxP por separado y se cruzan para ob- a dos secuencias diana contiguas separadas por 6pb
tener una cepa Cre-lox, que ante la presencia de un para que se produzca la rotura de la doble hélice. La
inductor inactivará el gen diana exclusivamente en frecuencia de recombinación homóloga mediante el
el tipo celular especi�icado por el promotor (Figu- uso de ZFNs es del 1-17% de las muestras, mucho
ra 14.9). más alta que la producida en ausencia de las enzi-
mas que ocurre con frecuencias entre el 0.01% y
0.001%. Este sistema se ha utilizado con éxito en
Edición genómica
la modi�icación dirigida (knockin) de distintos tipos
Una herramienta muy versátil para la modi�icación celulares en cultivo, incluidos las ES e IPS (células
genómica dirigida es el diseño de endonuclea- pluripotentes inducidas) humanas, y para modi�i-
sas que corten la doble hebra del DNA nuclear por car secuencias del genoma celular en el contexto de
secuencias predeterminadas, permitiendo la inte- la edición para terapia génica.
gración del transgén por recombinación homóloga, La edición genómica empleando las ZFNs es
siempre que esté �lanqueado por secuencias ho- técnicamente compleja. En los últimos años se ha
mólogas a las presentes en el sitio de inserción. Un comenzado a utilizar un nuevo método de edición
ejemplo de estas enzimas endonucleasas son las basado en un mecanismo inmunitario adaptati-
ZFNs (zinc �inger nucleases), moléculas híbridas vo de defensa presente en bacterias y arqueas, que
formadas por un dominio polimérico Zinc-�inger ha sido denominado CRISPR/Cas (clustered regu-
encargado del reconocimiento y unión especí�ica al larly interspaced short palindromic repeats/crispr
DNA diana, y un dominio nucleasa FokI encargado associated genes), y en el que las bacterias pueden
338
Transferencia génica
Figura 14.9: Ejemplo del procedimiento para la obtención de ratones knockout condicionales me-
diante la tecnología Cre/loxP.
339
Métodos en biociencias
fármacos. Sin embargo, las diferencias �isiológicas obtención de transgénicos son la inyección de len-
y metabólicas con el hombre son muy grandes, por tivirus defectivos portadores del transgén dentro
ello se iniciaron ensayos en otros organismos que del espacio perivitelino, y la transferencia de DNA
re�lejan mejor nuestra �isiología que la de los mo- vía esperma, proceso en el que el transgén se incu-
delos de roedores. Los modelos transgénicos de ba con el esperma para posteriormente inyectarlo
animales de granja han ido ganando importancia en al citoplasma del ovocito y que recibe el nombre
la experimentación biomédica y farmacéutica, pero de Inyección Intracitoplásmica de esperma (intra-
la transgénesis en especies domésticas es toda- cytoplasmic sperm injection, ICSI). La �igura 14.11
vía ine�iciente y cara, hecho que se irá solventando muestra un dibujo esquemático de cada una de las
según se vaya disponiendo de auténticas células técnicas mencionadas.
madre embrionarias de estos animales. Para que el transgén pueda integrarse en el
genoma nuclear, debe haber roturas de la doble he-
bra del DNA receptor (double strand breaks, DSBs).
14.5.1. Métodos de transferencia génica Aunque el DNA es una molécula muy estable, ciertos
factores introducen cortes en el DNA, ya sea por la
Los métodos comunes de transferencia génica uti- exposición natural a mutágenos �ísicos o químicos
lizados con animales domésticos son: la inyección ambientales (radiación de fondo, luz ultravioleta,
pronuclear (pronuclear injection, PNI) o citoplásmi- radicales de oxígeno) o bien por la acción de enzi-
ca de cigotos con DNA, y la transferencia de células mas codi�icadas por genes incluidos en el sistema
somáticas (somatic cell nuclear transfer, SCNT) de transferencia, que de forma ectópica catalizan
transgénicas a ovocitos previamente enucleados. la recombinación del transgén (sistemas de trans-
Otros mecanismos de transfección empleados en la posones, recombinasas, endonucleasas de diseño e
340
Transferencia génica
Oocito
Cigoto enucleado Cigoto/Oocito
Inyección Célula
capilar transgénica
Zona
pelúcida
Pronúcleos
Células de esperma
Cigoto cargadas con DNA
Fig. 14.11
integrasas víricas). Cuando la transgénesis no está Los transposones o «genes saltarines» se en-
dirigida por enzimas, el DNA foráneo se integra al cuentran en los genomas de todos los organismos, y
azar en el genoma y recibe el nombre de «transgé- aunque la mayoría de ellos no son funcionales, algu-
nesis pasiva» para diferenciarlo de la «transgénesis nos están activos (piggyBac, Tol2) y otros han sido
activa» dirigida por los sistemas enzimáticos men- modi�icados arti�icialmente para transferir genes
cionados. de forma activa (Sleeping beauty, SB). Normalmente
En el núcleo, las roturas de la doble hélice pue- se utiliza un sistema de transferencia con dos com-
den ser reparadas por dos vías distintas: sistema de ponentes. El primero de ellos consta de un vector
reparación ilegítima de los extremos rotos (non-ho- portador del transgén �lanqueado por las repeticio-
mologous end joining, NHEJ) que genera inserciones nes terminales invertidas (ITRs) presentes en los
o deleciones en el sitio de rotura; y por recombi- transposones, y el segundo por la transposasa, en-
nación homóloga (HR) a través de un DNA molde zima que se encarga del corte del transposón por
que produce una reparación perfecta de la secuen- el reconocimiento de las secuencias ITRs de los
cia, o un reemplazamiento de esta, si el DNA molde extremos, y de su integración en el genoma. La en-
utilizado incluye una modi�icación en la secuencia zima puede ir codi�icada en un segundo vector, o se
de nucleótidos. En el caso de transgénesis pasiva, puede inyectar directamente en el citoplasma del
es el sistema NHEJ el encargado de la integración cigoto en forma de mRNA o proteína. Aunque algu-
del transgén, con el inconveniente de que no se nos transposones tienen preferencia por motivos
integra una sola copia, sino varias de forma conca- de secuencia cortos, la integración del transgén en
tenada y en regiones del genoma susceptibles de el genoma se produce al azar, y es susceptible de su-
silenciamiento y modi�icaciones epigenéticas. Por frir «efecto de posición», es decir, que su expresión
el contrario, los sistemas de transgénesis activa in- dependerá de si la región donde se insertó es una
troducen una única copia del transgén por la acción región transcripcionalmente activa o no.
previa de las enzimas que producen los DSBs en el Un segundo sistema de trangénesis activa en
genoma. Además, alguno de estos sistemas enzimá- ovocitos y zigotos ha sido el de la transducción de
ticos como el de las Zinc-�inger nucleasas (ZFNs) y retrovirus y lentivirus (pertenecientes a la familia
el de CRISPR-cas pueden asociarse a sistemas de de los retrovirus complejos) mediante la deposición
reparación por HR, abriendo la posibilidad de la de partículas virales portadoras del transgén en el
modi�icación o sustitución dirigida de los genes nu- espacio perivitelino. Estos virus, manipulados ge-
cleares. néticamente para impedir la formación de nuevas
341
Métodos en biociencias
partículas víricas infectivas, son los responsables suponen menos problemas de bioseguridad y éticos.
de la retrotranscripción del RNA y de la integración Sin embargo, otros aspectos di�icultan u obligan a un
del transgén en el genoma en forma de episoma. estricto control sobre el proceso de puri�icación de
La principal ventaja de la transfección lentiviral es la proteína transgénica, como son la separación de
la alta proporción de transgénicos y la amplia va- la proteína sintetizada de su homóloga o equivalen-
riedad de especies a la que se puede aplicar, desde te animal y la posible contaminación con patógenos
pájaros, roedores domesticados y no domesticados, o priones, susceptibles de activarse en los pacien-
hasta animales de granja y primates no humanos. tes a los que será suministrada. También, pueden
Sin embargo, la baja capacidad de carga del trans- existir patrones diferenciales de glicosilación de las
gén (6-7kpb), el silenciamiento y la integración proteínas producidas por los diferentes animales,
preferencial dentro de las unidades de trancripción que podrían inducir una respuesta inmune en el re-
que aumentan el riesgo de mutagénesis en el sitio ceptor con efectos no predecibles. Debido a todos
de inserción, limitan el uso de la transgénesis len- estos posibles inconvenientes, existen normativas
tiviral. perfectamente reguladas desde las Administracio-
nes sobre el control de producción de las proteínas
de interés para su comercialización.
14.5.2. Proteínas farmacéuticas producidas El transgén, además de los motivos que deter-
por animales transgénicos minan su expresión, debe contener las señales que
indiquen el lugar, el nivel de expresión de la proteí-
La utilización de animales transgénicos como bio- na y la localización celular. Es decir, debe contener
factorías para la síntesis de proteínas de interés un promotor potente, activadores de la expresión, y
farmacéutico ofrece ciertas ventajas frente a la pro- la secuencia péptido señal responsable de su secre-
ducción de las mismas en bacterias o incluso en ción. Si se pretende que la proteína se secrete en la
plantas transgénicas. Entre estas ventajas se en- leche de un mamífero transgénico, el promotor del
cuentran el bajo coste, el alto rendimiento y la gran transgén deberá ser el de uno de los genes de las
calidad de las proteínas sintetizadas, ya que pueden proteínas de la leche, y si se pretende que la pro-
sufrir las modi�icaciones postraduccionales ade- teína de interés la produzcan gallinas transgénicas
cuadas para su correcto funcionamiento. Además, en los huevos, el promotor será el de la ovoalbú-
Cuadro 14.2: Comparación de los sistemas de producción utilizados para la producción de proteínas en animales transgénicos.
Glándula Larva de
Sangre Leche Huevo Semen Orina de seda Drosophila
Estabilidad del producto +++ ++++ ++++ +++ +++ +++ +++
342
Transferencia génica
Cuadro 14.3: Comparación del tiempo requerido para la obtención de proteínas recombinantes en diferentes especies de animales
transgénicos.
Meses de Gestación 1 4 5 5 9
mina. Es de esperar que la proteína se encuentre na como en conejos y cerdos, y son muy sensibles
exclusivamente en la leche o el huevo, aunque se ha a las enfermedades producidas por priones. En el
observado en algunos casos cierto grado de expre- cuadro 14.3 se muestran las diferencias en cuanto
sión en otros tejidos del animal, o unos bajos niveles al tiempo requerido para la obtención de proteínas
de expresión de la proteína in�luenciado por el sitio transgénicas de interés en los animales transgéni-
de integración del transgén en el genoma. cos mencionados.
Además de la leche y el huevo también se han
ensayado otros sistemas, como sangre, orina, se-
men, larvas de Drosophila y glándulas de la seda, 14.6. Transformación vegetal: plantas trans-
aunque son los primeros los empleados mayori- génicas
tariamente por las empresas biotecnológicas. Por
ejemplo, un alto contenido de proteínas recombi- La Mejora Genética Vegetal se inició de forma «in-
nantes biológicamente activas en la sangre, puede consciente» hace aproximadamente 12.000 años,
suponer un riesgo para la salud del animal, pero si cuando los hombres primitivos se hicieron sedenta-
la síntesis de la proteína se produce en las glándu- rios y agricultores. Durante un periodo de miles de
las mamarias y se localiza en la leche, este problema años se fueron seleccionando aquellas plantas que
dejará de existir. En el cuadro 14.2 se muestra una producían más, eran menos tóxicas, no perdían sus
comparativa de los distintos sistemas de produc- semillas tras la maduración, etc., lo que dio lugar a
ción utilizados. la aparición de variedades, algunas de las cuales se
Los animales utilizados para la producción han mantenido hasta nuestros días. A �inales del si-
de proteínas transgénicas en su leche son conejos, glo ��� y principios del �� comenzaron a hacerse
cerdos, ovejas, cabras y vacas, aunque muestran cruzamientos dirigidos entre distintos genotipos,
diferencias en cuanto al nivel de producción y sen- que mediante un proceso de selección dirigida, die-
sibilidad a los priones. Los conejos ofrecen varias ron lugar a las variedades cultivadas de las que la
ventajas: son muy fértiles y producen un gran nú- mayor parte de la humanidad se ha alimentado.
mero de descendientes transgénicos capaces de Para poder hacer este tipo de mejora es necesario
producir niveles aceptables de proteínas en la le- contar con variabilidad intraespecí�ica y, además,
che, y son insensibles a los priones. Los cerdos que los parentales que intervienen en los cruza-
transgénicos tampoco parecen transmitir enfer- mientos sean sexualmente compatibles.
medades severas a los humanos, y producen mayor Como se indicó anteriormente, en los años 70
cantidad de leche que los conejos. Los rumiantes del siglo �� se descubrieron las enzimas de restric-
son potencialmente las especies más apropiadas ción que, junto con otras enzimas como las ligasas,
para producir grandes cantidades de proteínas en polimerasas, etc., dieron origen a la Ingeniería ge-
su leche, pero su reproducción es relativamente nética, posibilitando la manipulación y alteración
lenta, la glicosilación de las proteínas no es tan bue- de los ácidos nucleicos y la obtención de DNA re-
343
Métodos en biociencias
combinante. Estas técnicas han contribuido al persigan, el promotor podrá ser: cons-
surgimiento de la denominada Biotecnología Mole- titutivo, permitiendo la expresión del
cular, dentro de la que se encuentra la obtención de transgén en todas las células de la planta;
plantas transformadas genéticamente o transgéni- especí�ico de tejido, con lo que el trans-
cas. Estas plantas son de gran utilidad para conocer gén solo se expresará en determinados
el funcionamiento, expresión y regulación de los ge- tejidos u órganos; inducible, de tal for-
nes, y además permiten introducir genes concretos ma que el transgén solo se expresará bajo
en variedades ya existentes, con el �in de mejorar ciertos estímulos como pueden ser la luz,
determinadas características agronómicas (produc- la temperatura, etc. El conjunto formado
ción, resistencia a patógenos, herbicidas, estreses por el promotor, la región codi�icante co-
abióticos, etc). Estas metodologías ponen a disposi- rrespondiente al transgén y la secuencia
ción de los mejoradores una poderosa herramienta de terminación, recibe el nombre de case-
y la diversidad genética de cualquier especie, al po- te de expresión y los diferentes elementos
der eludir las barreras sexuales que las aíslan. Una de este casete pueden tener distinta pro-
de las ventajas de la transformación vegetal es que cedencia biológica.
solo se ven implicados uno o muy pocos genes, al
b) Vector. El casete de expresión debe es-
contrario de lo que sucede cuando se realizan cru-
tar incluido en un vector, por ejemplo un
zamientos en los que se manejan miles de genes,
plásmido, que permite clonarlo en bac-
algunos no deseados, siendo prácticamente imposi-
terias y obtener su�iciente cantidad de
ble el seguimiento de cada uno de ellos. Las primeras
DNA (transgén y elementos reguladores)
plantas transgénicas fértiles se obtuvieron en 1983
para utilizarlo en el proceso de trans-
por tres grupos de investigación independientes,
formación. En algunos casos (p.ej. en la
empleando la bacteria Agrobacterium tumefaciens
para transformar plantas de tabaco y hacerlas re- transformación mediante Agrobacte-
sistentes a un antibiótico. rium), en el vector también se incluyen
otros genes y secuencias imprescindibles
El objetivo de la transgénesis vegetal es la in-
en el proceso de transferencia e inserción
serción en el DNA nuclear, y en algunos casos, en el
del transgén en la célula vegetal, intervi-
genoma de los cloroplastos, de uno o varios genes
niendo todos estos elementos de forma
foráneos que se expresen e�icazmente en la planta.
En la obtención de plantas transgénicas se requiere, más o menos directa en el proceso de
en primer lugar, la obtención de células transgéni- transformación.
cas que, aprovechando la totipotencia que muchas c) Gen de selección. Como se ha indica-
de las células vegetales poseen, y empleando me- do anteriormente, el vector en el que se
dios de cultivo de crecimiento y selección in vitro ha clonado el transgén contiene otros ele-
apropiados, darán lugar a plantas adultas y fértiles. mentos, entre los que se encuentra un gen
que va a permitir la selección de las célu-
las vegetales que han sido transformadas
14.6.1. Elementos necesarios para la obtención y que les va a conferir alguna ventaja o
de plantas transgénicas capacidad de supervivencia frente a las
células que no lo han sido. La selección
Algunos de los elementos son comunes a los trata- es positiva cuando el gen de selección
dos en apartados anteriores, pero se vuelve a incidir proporciona resistencia a sustancias tó-
sobre ellos atendiendo a las características especí�i- xicas como puede ser un antibiótico (p.
cas de las células vegetales.
ej. el gen npt II que con�iere resistencia a
a) El transgén que se desea introducir kanamicina; el gen hpt que con�iere resis-
en la planta está formado por la región tencia a higromicina) o un herbicida (p.
codi�icante, que en su extremo 5’ ha de ej. el gen pat o bar que con�iere resisten-
llevar un promotor al que se unirá la RNA cia a phosphinotricina o bialaphos; el gen
polimerasa para llevar a cabo el proce- cp4epsps que codi�ica la enzima 5-enol-
so de transcripción, y en su extremo 3’ piruvilsikimato-3-fosfato sintetasa que
una secuencia terminadora que no se con�iere resistencia a glifosato), elimi-
va a traducir y que contiene una señal nando aquellas células que no han sido
de corte y de poliadenilación. La elec- transformadas. Otra opción de selección
ción del promotor es muy importante, ya positiva permite a las células transfor-
que, dependiendo de los objetivos que se madas utilizar determinadas sustancias,
344
Transferencia génica
345
Métodos en biociencias
VirA
2
VirG Citoplasma
3
Región
Ti
vir Receptores
bacterianos
y de Núcleo
la planta
T-DNA CPN 8
7
Bi Bd
1 9
VirD1/D2 4
CPN
Cadena-T Complejo-T
VirD2 Canal de maduro
VirE2 comunicación
6 10 T-DNA
Complejo-T integrado
inmaduro
5
Agrobacterium Célula vegetal
Fig.
14.13
Figura 14.13: Esquema del proceso de transformación mediante Agrobacterium. El proceso se inicia con el re-
conocimiento y unión de Agrobacterium a una célula vegetal, a través de receptores bacterianos y de la planta
(1), junto con la unión a receptores especí�icos de la bacteria (VirA/VirG) de señales emitidas por la célula ve-
getal como consecuencia de haber sufrido algún tipo de lesión (2). La región vir del plásmido Ti se va a activar
(3) lo que hace que se produzca una copia del DNA-T en cuyos extremos se encuentran los bordes derecho Bd e
izquierdo Bi, y entre ellos los genes que codi�ican los oncogenes y las enzimas productoras de opinas. A conti-
nuación se produce una copia del DNA-T, a cuyo extremo 5’ se le unirá la proteína VirD2 (4), que ayudada por
otras proteínas Vir, permitirá el paso del DNA-T a través del canal de comunicación entre la bacteria y la célula
(5). Tras la asociación con la proteína VirE2 (6), el DNA-T penetrará en el núcleo de la célula (7) a través de los
poros nucleares (CPN). Una vez en el núcleo celular, el DNA-T se sitúa en alguna región del genoma nuclear (8),
en donde se desprende de las proteínas que lo han protegido durante el transporte, integrándose a continuación
en alguno de los cromosomas de la célula (9), pasando a formar parte del material hereditario de la célula (10),
en donde se expresará y replicará. Basado en Tz�ira y Citovsky, 2006. Disponible en color.
vegetales y les trans�iera el T-DNA a través de un ca- tores de opinas y sustituirlos por una secuencia de
nal producido por Agrobacterium, que viajará hacia DNA que codi�ique el gen o los genes que se deseen
el núcleo, en donde se integrará en el genoma de la introducir en la planta. Un nuevo avance fue la uti-
célula vegetal. En todo este proceso interviene un lización de vectores binarios en los que se emplean
número considerable de genes, muchos de los cua- dos plásmidos, que además se pueden replicar tan-
les se encuentran en el propio plásmido Ti (Figura to en E. coli como en A. tumefaciens. En uno de los
14.13). plásmidos, denominado «desarmado» ya que se ha
eliminado los genes que codi�ican las auxinas y las
Sin embargo, para la integración del T-DNA
opinas, se encuentran el borde izquierdo y el dere-
solo son necesarias dos secuencias repetidas direc- cho del T-DNA. Entre ambos bordes se encuentra un
tas de unos 25 pares de bases, que se encuentran polylinker que servirá para añadir el casete de ex-
en ambos extremos del T-DNA. Este descubri- presión del gen que se desea introducir, junto con
miento fue clave para poder utilizar el sistema de un gen de selección y/o marcador. En el segundo
Agrobacterium como procedimiento para la obten- plásmido denominado «helper» se incluyen los ge-
ción de plantas transgénicas, ya que se vio que se nes (vir) que están implicados en la transferencia
pueden eliminar los oncogenes y los genes produc- del T-DNA a las células vegetales.
346
Transferencia génica
Figura 14.14: Cañón de partículas para la transformación utilizando el método biolístico. La impulsión de la microopartículas
de oro o tungsteno recubiertas de DNA se realiza mediante helio a alta presión que, tras romper el disco de ruptura, impulsa una
membrana plástica (macrocarrier), en cuya parte inferior se encuentran pegadas las micropartículas (microcarriers) cubiertas
de DNA, que vuelan hasta impactar sobre las células vegetales. http://www.bio-rad.com/es-es/product/pds-1000-he-hepta-
systems. http://www.biochem.arizona.edu/classes/bioc471/pages/Lecture19.html.
347
Métodos en biociencias
Figura 14.15: Microfotogra�ías, realizadas con microscopio electrónico de barrido, de un tejido vegetal antes y
después de ser sometido a un disparo con micropartículas.
348
Transferencia génica
— Otros métodos �ísicos para la introduc- del cáncer. Según el tipo celular al que va dirigida
ción de DNA en las células vegetales son la terapia, se puede clasi�icar en terapia de célu-
el empleo de �ibras de carburo de si- las gaméticas y terapia de células somáticas. En el
licio y la microinyección. En el primer primer caso, la modi�icación genética se introduce
caso se trata de �ibras de entre 0.3 y 0.6 en las células germinales, en el cigoto o en embrio-
µm de diámetro y de una longitud de 10 nes de pocas células, por lo que se verán afectadas
a 100 µm que se añaden a un medio en todas o casi todas las células del individuo y, ade-
el que se encuentran en suspensión cé- más, el cambio genético se podrá transmitir a sus
lulas aisladas, proembriones, callos, etc., descendientes. Este hecho ha planteado problemas
junto con plásmidos conteniendo el case- ya que los efectos a largo plazo son impredecibles,
te de expresión y algún gen marcador y/o pudiendo ser peligrosos y éticamente reprobables,
de selección. Tras una agitación vigoro- por lo que, a día de hoy, no se utiliza para modi�i-
sa, se consigue que las �ibras atraviesen car genes nucleares. Sin embargo, recientemente si
las paredes y las membranas celulares se ha comenzado a aplicar este tipo de terapia en
arrastrando con ellas copias del plásmi- enfermedades mitocondriales, que son transmiti-
do, que de esta manera habrán pasado al das exclusivamente por vía materna. En este caso,
interior de las células. Una vez en el in- una de las opciones es la obtención de cigotos con
terior el DNA se podrá integrar en uno tres parentales: una mujer sin enfermedad mito-
o varios lugares del genoma, y tras las condrial, que aportaría un óvulo enucleado, una
correspondientes fases de selección y re- mujer afectada por una enfermedad mitocondrial,
generación, será posible obtener plantas que aportaría el núcleo haploide del óvulo y �inal-
adultas transgénicas. A pesar de la sen- mente un espermatozoide que contribuiría con otro
cillez y poco coste del método, aún no núcleo haploide, que al fecundar al núcleo del óvulo
constituye un procedimiento de elección dará lugar a un cigoto sin la enfermedad mitocon-
para la transformación vegetal por la baja drial. En el caso de la terapia de células somáticas,
e�icacia que se consigue, así como por solo se modi�ican determinadas células o tejidos,
la gran toxicidad de las �ibras de carbu- permaneciendo esta alteración en el individuo que
ro de silicio empleadas. En el caso de la ha sido tratado sin transmitirse a sus descendien-
microinyección se utiliza un micromani- tes. Aunque la terapia génica todavía no forma parte
pulador y pipetas con microcapilares que de la rutina de la práctica médica, ya se han apro-
permiten la introducción directa de DNA bado centenares de protocolos y en la página: http:
en el citoplasma o incluso en el núcleo de //www.genetherapynet.com/clinical-trials.html, se
las células. Permite introducir orgánulos puede encontrar una información permanentemen-
celulares como mitocondrias y cloroplas- te actualizada de los mismos.
tos e incluso cromosomas completos, por Las células somáticas que se utilizan en tera-
lo que es una técnica con una gran poten- pia génica se pueden modi�icar fuera del cuerpo
cialidad en programas de mejora genética (terapia ex vivo), o sin extraerlas del paciente (te-
vegetal. Sin embargo, tiene algunos in- rapia in vivo). En cualquiera de los casos, las células
convenientes como el manejo de una sola que se van a modi�icar deben reunir una serie de ca-
célula en cada inyección, y además se re- racterísticas, siendo la más importante que puedan
quiere personal altamente capacitado e permanecer vivas durante largos periodo de tiem-
instrumentación costosa. po, para que el gen que se les ha introducido y el
producto que codi�ica puedan ejercer un efecto te-
rapéutico en el paciente. Así, las células madre son
14.7. Terapia génica en la especie humana las más apropiadas para la modi�icación genética,
ya que pueden dividirse un gran número de veces
La terapia génica implica la modi�icación de la in- dando lugar a un clon de células modi�icadas y, en
formación genética de las células, con la �inalidad principio, sanas.
de corregir algún defecto genético o de dotarlas Los objetivos de la terapia génica van a depen-
de alguna nueva característica. Es uno de los tra- der del tipo de células a las que vaya dirigida. Así,
tamientos médicos más recientes para curar, o pueden ser células que presentan alguna mutación
al menos paliar, los síntomas de enfermedades en un gen, y lo que se persigue es «curar» ese defec-
hereditarias o de enfermedades que supongan alte- to; o bien el objetivo puede ser la eliminación de un
raciones de la información genética, como es el caso determinado tipo de célula, como es el caso de las
349
Métodos en biociencias
Figura 14.16: Principales estrategias empleadas en terapia génica humana. (a) Adición de una copia
normal del gen mutado, (b) adición de un gen que con�iere una nueva característica, (c) «knowdown»
de un gen utilizando el mecanismo de interferencia de RNA, mediante el empleo de siRNA, (d) edita-
do genético mediante el método de CRISPR-Cas, para introducir cambios especí�icos en el genoma.
células tumorales. En cualquier caso, la terapia gé- de los pacientes tratados consiguieron una buena
nica requiere la introducción de material genético recuperación del sistema inmunitario, pero algunos
en las células dañadas empleándose, como se indicó desarrollaron leucemia linfoblastoide aguda de cé-
anteriormente, diferentes vehículos y metodologías lulas T, debido a que la inserción del plásmido con el
(virus, plásmidos, liposomas, electroporación, etc). transgén activó al proto-oncogén LMO2.
En la �igura 14.16 se muestran esquemáti- El cáncer es una enfermedad genética, aun-
camente las estrategias básicas de manipulación que afortunadamente en la mayoría de los casos no
genética encaminadas a la terapia génica. hereditaria. Se están utilizando diferentes tipos de
La mayoría de los ensayos de terapia génica terapia génica para intentar eliminar las células tu-
que se están realizando están encaminados a tratar morales. Una de ellas consiste en la adición de un
enfermedades monogénicas, causadas por la pérdi- gen (Figura 14.16b) que va a permitir dirigir las
da de función de un gen concreto (Figura 14.16a). células del sistema inmunitario contra las células
Los primeros éxitos se consiguieron en enfermos tumorales. Por ejemplo, en pacientes con linfomas
con inmunode�iciencia combinada grave (SCID), de linfocitos B, se les extrajeron linfocitos T a los
en los que los linfocitos B y T presentan disfuncio- que se les trans�irió un gen quimérico que codi�i-
nes debido, en algunos casos, a una mutación en el ca para un receptor antigénico (CAR) que reconoce
gen IL2RG localizado en el cromosoma X, y en otros, el marcador CD19 de la super�icie de las células B.
a una mutación en el gen ADA que codi�ica para Los linfocitos T modi�icados expresaron el gen qui-
una adenosina desaminasa y que se encuentra lo- mérico y fueron reinsertados en el paciente, donde
calizado en el cromosoma 20. Para el tratamiento, produjeron una reversión en el avance del linfoma.
se extrajeron células madre de la médula ósea, se La adición de un nuevo gen en determinados tipos
transformaron empleando retrovirus portadores de celulares también puede utilizarse para combatir
la versión normal de uno u otro gen, y a continuación enfermedades infecciosas. Así, se han transformado
se reintrodujeron en los enfermos. La mayor parte células musculares con un gen que codi�ica un an-
350
proceso de degradación de moléculas de mRNA o bien impidiendo la traducción
del mRNA que tengan secuencias complementarias al siRNA. En la Figura 14.17,
se muestra un esquema del mecanismo de silenciamiento mediado porTransferencia
RNA. génica
Figura 14.17: Esquema de silenciamiento génico por RNA. (1) Formación de moléculas de
RNA con estructuras duplexas intracatenarias en el núcleo, que son procesadas por el complejo
enzimático drosha y son exportadas al citoplasma por la enzima exportina. Una vez en el cito-
plasma son procesadas por dicer a moléculas miRNA que son reconocidas por el complejo RISC,
que desnaturaliza el RNA duplexo y lo dirige hacia las regiones 3’UTR complementarias de los
mRNA, produciendo un bloqueo de la traducción. (2) Moléculas de RNA duplexo presentes en el
citoplasma son procesadas a siRNA por dicer siguiendo un proceso similar al anterior que �ina-
lizará con la unión a regiones complementarias de moléculas de mRNA, que serán degradadas.
ticuerpo contra ciertos patógenos. La secreción de complementarias de bases aparearán, o bien pue-
estos anticuerpos al torrente circulatorio produce
Figura 14.17. Esquema de silenciamiento génico den originarse
por RNA.tras 1. la transcripción
Formación de una de de
de moléculas las
una vigilancia permanente del sistema inmunitario, cadenas de una secuencia de DNA a una molécula
RNA con estructuras duplexas intracatenarias en el núcleo, que son procesadas por el complejo
que puede prevenir futuras infecciones por virus de RNA originada con secuencias complementa-
enzimático
como el HIVdrosha
o el dey la
son exportadas al citoplasma porrias
gripe. la enzima
invertidasexportina. Una vez en
que al aparearse denelorigen
citoplasma
a una
son procesadas
En el caso por
de quedicerunaa enfermedad
moléculas miRNA
genéticaque estructura
son reconocidas por el(duplexo-simplexo).
de tallo-lazo complejo RISC, que Las
desnaturaliza el RNA duplexo y lo dirige
se haya producido por una ganancia de función en hacia las regiones
moléculas 3’UTR
de complementarias
RNA duplexo son de los
cortadas mRNA,
por una
produciendo
algún gen, lounque
bloqueo
da lugar de alalatraducción.
aparición de 2.un
Moléculas
pro- de RNA duplexo
ribonucleasa presentes
denominada en el citoplasma
«dicer», formándoseson pe-
procesadas
ducto tóxicoa osiRNA
que está por dicer siguiendo
presente un proceso
en un momento del queños fragmentos de entre 20 y 22 nucleótidos
similar al anterior que finalizará con la unión a
desarrollo
regiones o tipo celular inapropiado,
complementarias de moléculas el de de te- queque
tipomRNA, constituyen
serán el siRNA. Estos fragmentos se unen
degradadas.
rapia que se realiza es la denominada de inhibición al complejo proteico inductor del silenciamiento del
o de bloqueo (Figura 14.16c), en la que o bien se RNA «RISC» (RNA induced silencing complexes) dan-
El siRNA se puede emplear do
impide la transcripción del gen, o bien se eliminan
eninicioterapia
al procesogénica, siguiendo
de degradación de moléculasdosde
procedimientos:
o se impide que actúen a) sus directamente,
productos. Una de para
las lo
mRNA cualo bienseimpidiendo
sintetizan artificialmente
la traducción del mRNA
opciones es emplear el mecanismo que tenga secuencias complementarias al siRNA. En
moléculas de RNA duplexodecon interferencia
un tamaño de 22 pb que tengan secuencias
por RNA (iRNA) que se ha encontrado en muchos la �igura 14.17 se muestra un esquema del mecanis-
complementarias
eucariotas incluyendoal los mRNA
mamíferos,derivado
y que causadel mo gen que se quiere
de silenciamiento mediadosilenciar.
por RNA. Estas
moléculas se incluyen en liposomas que podrán fusionarse con las en
silenciamiento génico. Se trata de un mecanismo de El siRNA se puede emplear membranas
terapia géni-
defensa innato que protege a las células de la inva- ca, siguiendo dos procedimientos: a) directamente,
celulares, y una vez alcanzado el citoplasmapara
sión de virus y también de un exceso de actividad de
delolas células, comenzarán a ejercer
cual se sintetizan arti�icialmente moléculas
sulosefecto los siRNA;
transposones. b) utilizando
Este mecanismo virus
se activa ante recombinantes
la de RNA duplexo para
con transformar
un tamaño de 22 laspbcélulas
que ten-
presencia de moléculas de RNA duplexas, que pue- gan secuencias
con una construcción (casete de expresión) que una vez integrada en el genoma y complementarias al mRNA derivado
den aparecer por transcripción de las dos cadenas del gen que se quiere silenciar. Estas moléculas
de una secuencia de DNA, que al tener secuencias se incluyen en liposomas, que podrán fusionarse
351
Métodos en biociencias
con las membranas celulares y una vez alcanzado que las células T modi�icadas han resultado ser re-
el citoplasma de las células comenzarán a ejercer sistentes a la infección del HIV en ensayos in vitro.
su efecto; b) utilizando virus recombinantes para Dado el gran avance que está habiendo en los
transformar las células con una construcción (ca- últimos años en la terapia génica se puede prever
sete de expresión) que, una vez integrada en el que, en un futuro no muy lejano, será una más de las
genoma y transcrita, dará lugar a una molécula de herramientas con la que cuente la Medicina para tra-
RNA con estructura de tallo-lazo que se procesará tar tanto enfermedades genéticas como infecciosas.
y dará lugar a siRNA, que silenciará el gen elegi-
do. Hay que tener en cuenta que el silenciamiento
nunca es total, de ahí que a este tipo de procedi-
miento se le denomine como knockdown. Una de
las enfermedades en las que se está ensayando esta
metodología es la Corea de Huntington, ya que si- Bibliografía
lenciando el alelo mutante del gen que codi�ica para
la huntingtina, se pretende disminuir el efecto tóxi- Garrels W, Ivics Z, Kues WA. 2012. Precision Genetic En-
co de la proteína alterada. gineering in Large Mammals. Trends in Biotechnology
La edición genómica es una estrategia más 30:386-393.
para la terapia génica (Figura 14.16d) y han co- Hourdebine LM. 2009. Production of Pharmaceutical Pro-
menzado a llevarse a cabo los primeros ensayos teins by Transgenic Animals. Comp Immun Microbiol Infect
en animales, para luego poder transferir los resul- Dis 32:107-121.
tados obtenidos a humanos. Así, en un modelo de Liu L, Fan XD. 2014. CRISPR-Cas System: A Powerful Tool
ratón con hemo�ilia debido a una mutación en el for Genome Engineering. Plant Mol Biol 85:209-219.
gen del factor IX de coagulación, se ha transferido Robl JM, Wang Z, Kasinathan P, KuroiwaY. 2007. Transgen-
un gen que expresa una ZFN (zinc �inger nucleases) ic Animal Production and Animal Biotechnology. Theriog-
junto con un DNA molde. En este experimento, y enology 67:127-133.
tras la correspondiente edición génica por adición Santiago Y, Chan E, Pei-Qi L, Orlando S, Zhang L, Urnov,
del DNA molde, se consiguió reconstruir la secuen- FD et al. 2008. Targeted Gene Knockout in Mammalian
Cells by Using Engineered Zinc-Finger Nucleases. PNAS
cia completa del gen del factor IX. Otra opción que
105:5809-5814.
permite la edición genómica es la inactivación de
Strachan T, Goodship J, Chinnety P. 2015. Genetics and
genes especí�icos que, por ejemplo, codi�ican pro-
Genomics in Medicine. Garland Science. ISBN 978-0-8153-
teínas que son necesarias para que se produzca una 4480-3.
determinada infección vírica. Así, para la infección Tzfira T, Citovsky V. 2006. Agrobacterirum-mediated Ge-
de los linfocitos T por el virus del sida, es necesario netic Transformation of Plants: Biology and Biotechnology.
que estos linfocitos expresen un co-receptor deno- Current Opinion in Biotechnology 17:147-154.
minado CCR5 (chemokine co-receptor 5). Mediante Wang D. 2014. State of the Art Human Gene Therapy: Part
la edición génica, empleando ZFN, se ha consegui- II. Gene Therapy Strategies and Clinical Applications. Dis-
do inactivar el gen que codi�ica para CCR5, con lo cov Med 18:151-161.
352
15.
Optogenética
Carolina Roza Fernández de Caleya
La optogenética es una técnica mediante la cual es gún método que permitiera el estudio in vivo de
posible modi�icar el comportamiento de las neu- células individuales dentro de su contexto, algo cru-
ronas usando una fuente de luz. Esta herramienta cial para entender cualquier proceso biológico. En
comenzó a utilizarse a principios del siglo ���, sien- neurociencia destacan las aplicaciones en las que la
do mencionada como «el método del año» en 2011 activación de una neurona en particular es capaz de
por la revista Nature Methods (2011). La optoge- provocar un comportamiento complejo en un ani-
nética se de�ine como «la integración de técnicas mal despierto en movimiento, como hacer que se
genéticas y ópticas con objeto de activar o inhibir despierte súbitamente tras haberle inducido el sue-
una función especí�ica en un grupo concreto de cé- ño o provocar que se mueva en círculos al encender
lulas en tejidos vivos». Puede considerarse como la una luz que es capaz de iluminar un grupo especí�i-
técnica más novedosa en el campo de las biociencias, co de neuronas.
y si bien en la actualidad es utilizada fundamental- La optogenética es una técnica interdisciplinar
mente en Neurociencias, ofrece un gran potencial que requiere conocimientos de ingeniería genética,
en otras áreas de conocimiento en aproximaciones técnicas de iluminación y métodos capaces de de-
básicas y aplicadas. tectar los cambios inducidos.
La técnica se desarrolló a partir del descubri-
miento de ciertas algas unicelulares que poseían
unas proteínas en su membrana que se compor- 15.1. Origen
taban como canales iónicos en respuesta a luz. La
optogenética surge tras la introducción en células En el año 1979 Francis Crick sugirió en un trabajo
excitables –como neuronas– de genes microbianos publicado en Scienti�ic American que el mayor reto
exógenos que codi�ican dichas proteínas sensibles en neurociencia es la necesidad de conseguir el con-
a luz. El aspecto más llamativo de esta técnica es trol preciso de un grupo de neuronas sin alterar a
que permite, mediante la activación/inhibición de sus vecinas. Los métodos tradicionales basados en
una población discreta de neuronas especí�icas, un la aplicación de estímulos eléctricos carecen de la
control muy exacto de un proceso biológico en un precisión adecuada puesto que no son capaces de
sistema intacto. Hasta su desarrollo no existía nin- distinguir entre distintas poblaciones neuronales.
Métodos en biociencias
En diferentes conferencias Crick llegó a especu- nó porque las células de mamífero (y de todos los
lar que la luz podría ser un modo e�icaz dado que vertebrados) contienen de modo natural cantida-
podría ser aplicada a modo de pulsos controlados des su�icientes de trans-retinal (ver más adelante).
y usando un amplio rango de colores (longitudes Esto facilitó enormemente el desarrollo de la opto-
de onda) en localizaciones discretas. Si bien en ese genética, puesto que para que una neurona pueda
momento parecía imposible conseguir que una responder a la luz solo se requiere la inserción en
neurona de un cerebro de mamífero pudiera res- las células diana de un único componente genético:
ponder a un estímulo lumínico, en el campo de la la canalrodopsina.
microbiología ya se había identi�icado, en 1971, la Desde 2005, el número de herramientas op-
bacteriorodopsina, una bomba iónica bacteriana togenéticas y su aplicabilidad se ha expandido
que se activaba con la luz verde y que llevó, poste- enormemente tanto por el descubrimiento de nue-
riormente, a la caracterización de varios miembros vas opsinas (el alga Volvox carteri expresa una
de esta familia: halorodopsinas (1977) y las canal- canalrodpsina que responde a luz amarilla, VChR1)
rodopsinas (2002). La característica fundamental como por la modi�icación de las existentes de modo
de estas moléculas es que son proteínas únicas que, que se puedan activar con diferentes longitudes
en respuesta a un estímulo lumínico en espectro vi- de onda mejorando su penetración en los tejidos.
sible, permiten el �lujo de iones; es decir, combinan Incluso ha sido posible acoplar los dominios sensi-
un dominio sensible a luz y un dominio que permite bles a luz de las rodopsinas a receptores acoplados
el paso de iones a través de membrana (este domi- a proteínas G, de modo que se puede interferir en
nio se comporta de modo similar a cualquier canal el funcionamiento ya no solo de células excitables
iónico que se encuentra en células de mamíferos). (neuronas y células musculares) sino en otros even-
Si bien la solución al reto propuesto por Crick tos bioquímicos de cualquier tipo celular.
en los años 70 ya existía, tuvieron que pasar más de Este increíble desarrollo ha llevado a que, a
30 años para que ambos conceptos se unieran dan- día de hoy, sea posible evocar o inhibir compor-
do lugar a una nueva técnica: la optogenética. tamientos complejos en animales despiertos en
En el año 2000 tras la secuenciación del DNA movimiento.
del alga luminiscente Chlamydomonas reinhardtii
se observaron dos secuencias similares a la de bac-
teriorodopsina. Los grupos de Hegemann y Nagel 15.2. Bases moleculares
demostraron que la inserción de dichas secuencias
en oocitos de Xenopus fue capaz de codi�icar pro- La optogenética incluye el desarrollo e inserción
teínas funcionales capaces de permear cationes en dentro de células diana de genes que hagan a dichas
respuesta a la luz azul. Estas proteínas, conocidas células responder a estímulos de luz –canalrodpsi-
como Canalrodopsina-1 y 2 (ChR1 y ChR2, del in- nas–. Pero también requiere técnicas asociadas que
glés channelrhodopsin1 y 2), y fundamentales para
permitan la aplicación de luz en dichas células y he-
las respuestas a luz de Chlamydomonas, podrían
rramientas que permitan la «lectura» de los efectos
entonces insertarse en neuronas de diferentes ani-
derivados de su activación para poder interpretar la
males mediante técnicas de ingeniería genética. De
función de determinada población de neuronas en
este modo, al ser estimuladas con luz, se provocaría
un proceso neuro�isiológico determinado.
un cambio en el potencial de reposo de una neu-
En este capítulo se tratarán cada uno de estos
rona: es decir, ¡una respuesta! Sin embargo, para
aspectos.
llegar a este punto, había que tener en cuenta que
las células eucariotas no manejan fácilmente mate-
rial genético microbiano; por otra parte, el correcto 15.2.1. Canalrodopsinas
funcionamiento de las canalrodopsinas requiere
la presencia de trans-retinal, un cofactor químico Las canalrodopsinas son proteínas consistentes en
esencial para la absorción de fotones. un canal permeable a iones y un dominio activado
Finalmente, el equipo de Deisseroth en Stan- por luz. En la naturaleza son expresadas por una se-
dford consiguió introducir ChR2 en células de rie de microorganismos con diversas funciones: en
mamífero en cultivo mediante técnicas de trans- muchos procariotas, las canalrodpsinas sirven para
fección y ya fue capaz de provocar respuestas mantener el potencial de membrana y la homeos-
eléctricas y cambios en los impulsos nerviosos tasis iónica (necesaria para síntesis de ATP); otros
de dichas neuronas al aplicar pulsos de luz azul. microorganismos han desarrollado opsinas que, en
Contra todo pronóstico, el experimento funcio- respuesta a luz, modulan sus elementos motrices
354
Optogenética
Figura 15.1: (A) Estructura de un dímero de ChR2 en el que se aprecian 7 dominios transmembrana, extremos C y N-terminal y el domi-
nio de unión al retinal. Modi�icado de Kato et al. 2011. (B) La llegada de un fotón provoca la isomerización de todo-trans a 13-cis retinal.
El retinal, que se encuentra de modo natural en todas las células de vertebrados, se mantiene unido a las canalrodopsinas microbianas. La
reacción provocará un cambio conformacional en la proteína que determinará la apertura de un canal catiónico
para dirigirse a ambientes iluminados que favorez- (aminoácidos) determinantes de sus propiedades
can la fotosíntesis. Lo más fascinante es la sencillez tanto ópticas como de canal. Esto ha hecho posible,
de su estructura, en el sentido de que un único gen mediante técnicas de mutagénesis dirigida, alterar
codi�ica tanto el dominio sensible a luz como el do- la estructura de las canalrodpsinas (modi�icar su
minio efector responsable del movimiento iónico. espectro de absorción o propiedades cinéticas del
Para entender el funcionamiento de las canal) para optimizar su funcionalidad en diferen-
canalrodpsinas, hay que tener en cuenta las caracte- tes condiciones experimentales. En la �igura 15.1 se
rísticas de cada uno de estos dominios. En términos muestra la estructura cristalizada de ChR2.
generales, cuando se aplica un pulso de luz sobre
la canalrodopsina, la absorción de un fotón (en el 15.2.2. Dominios sensibles a luz
dominio opsina) provoca un cambio conformacio-
nal en la proteína que determinará la apertura del Cada opsina requiere la incorporación de retinal,
dominio canal. La estructura de los dominios opsi- un cofactor orgánico derivado de la vitamina A res-
nas determinará las propiedades relacionadas con ponsable de la absorción de fotones. El complejo
la absorción de luz (como longitud de onda, capaci- opsina-retinal da lugar a la rodopsina. Las opsinas
dad de absorción o sensibilidad a luz), mientras que se subdividen en dos subfamilias.
la estructura de los dominios canal determinará las Las opsinas animales (tipo II) se encuentran
propiedades cinéticas del canal iónico (tales como fundamentalmente en los fotoreceptores de las re-
apertura, inactivación, selectividad iónica o intensi- tinas de eucariotas donde son responsables del
dad de corriente). proceso de la fototransducción, y, por lo tanto, res-
La canalrodopsina mejor caracterizada es ponsables de la visión (aunque una pequeña fracción
ChR2; su cristalización ha sido fundamental para está implicada en regular los ritmos circadianos y la
entender su funcionamiento y establecer los sitios pigmentación). Las opsinas tipo II funcionan como
355
Métodos en biociencias
receptores acoplados a proteínas G y utilizan el 11- es púrpura, el más e�iciente para absorber luz verde
cis retinal. En conos y bastones, tras la absorción del (500-650 nm, óptimo en 568 nm). Las halobacte-
fotón, se produce la isomerización a todo-trans re- rias, o haloarchaea, se encuentran en ambientes
tinal; como este proceso implica su disociación de saturados en sal y expresan altos niveles de BR en
la opsina, para cada nuevo ciclo de activación debe- bajas condiciones de oxígeno, lo que les permite
rá reclutarse un 11-cis retinal. Este mecanismo de mantener un gradiente protónico para sintetizar
acción ha inspirado el diseño de opsinas sintéticas ATP en ausencia de respiración. BRs también se
para el control de eventos bioquímicos (activación encuentran en proteobacterias acuáticas (PRs) y,
de proteínas G con luz) en animales despiertos. en este caso, cada especie tiene su espectro de ac-
Las opsinas microbianas (tipo I) se encuentran ción ajustado según la profundidad del océano en
en procariotas, algas y hongos y utilizan el isómero la que habitan, pudiendo responder a longitudes
todo-trans-retinal, el cual isomeriza a 13-cis retinal de onda entre el azul y el verde. El estudio de es-
tras la absorción iónica, revirtiendo a todo-trans de tas BRs demostró que las variaciones en el espectro
modo muy rápido. Al contrario que en las opsinas de absorción están determinadas por cambios en
tipo II, durante este proceso el retinal se mantiene un único aminoácido. Si bien las BRs podrían expre-
unido mediante enlace covalente a la opsina, lo cual sarse en neuronas para provocar hiperpolarización
favorece y acelera ciclos de activación repetitivos y, por lo tanto, inhibir la actividad neuronal, se tu-
(~5 ms). Afortunadamente, los tejidos de mamífe- vieron que descartar porque provocan acidi�icación
ro examinados hasta la fecha contienen cantidades del medio extracelular.
su�icientes de retinal, con lo que no es necesario Otro tipo de bomba iónica es la halorodopsina
suplementar las células diana con este componen- (HR), la cual es capaz de mantener el gradiente de
te para asegurar un control óptico adecuado. Este membrana transportando iones cloruro (Cl-) desde
hecho fortuito ha sido fundamental para el rápido el medio extracelular al interior. Es activada con luz
desarrollo de la optogenética. amarilla. Una forma de HR descrita en Natronomo-
nas pharaones (NpHR), fue la primera canalrodpsina
Las opsinas microbianas, al igual que las
utilizada para de inhibir el comportamiento (expre-
animales, están formadas por siete dominios trans-
sada en C. elegans) por la hiperpolarización celular
membrana (Figura 15.1).
inducida con luz amarilla.
Su estructura incluye un dominio de unión a
retinal (dominio opsina) que determina sus carac-
terísticas espectrales (la longitud de onda óptima Canales activados por luz
de absorción viene determinada por el carácter hi-
Las canalrodopsinas son opsinas que permiten el
drofóbico de los aminoácidos en este motivo) y un paso pasivo y no selectivo a diferente tipo de catio-
dominio efector, que es capaz de provocar el mo- nes a través de la membrana plasmática. En ciertas
vimiento de iones a través de la membrana. Esto algas también median procesos de señalización ce-
puede ocurrir bien porque actúen como bombas lular a través de una extensión C-terminal. En la
iónicas, traslocando iones (de modo similar a la �igura 15.1, que muestra la estructura del cristal de
bomba Na+/K+/ATPasa) o como verdaderos canales ChR2, se observa que tiene dominios N y C-terminal
iónicos que permiten �lujo de iones. Si bien se deno- complejos, pero para las aplicaciones optogenéticas
minan dominios efectores, hay que tener en cuenta solo se utiliza el fragmento 7-TM, dado que en altas
de que trata de la misma entidad molecular –sigue condiciones lumínicas contribuye al 80% de la co-
siendo opsina– en la que se encuentra el dominio de rriente total.
absorción de luz. La primera canalrodposina descrita fue ChR1,
identi�icada en Chlamydomonas reinhardtii, un alga
Bombas activadas por luz verde unicelular de agua dulce y templada. Pos-
teriormente en el mismo organismo se describió
La primera bomba iónica microbiana descrita fue la ChR2. Ambas tienen cinéticas rápidas de activación
bacteriorodpsina (BR). Esta molécula es una proteí- y desactivación. Cuando se introducen en neuronas,
na transmembrana capaz de traslocar protones, en las ChRs se insertan en la membrana plasmáti-
contra de gradiente, en respuesta a luz desde el me- ca y evocan cambios en el potencial de membrana
dio intracelular al espacio extracelular. en reposo en respuesta a luz azul (máxima absor-
Cuando el todo-trans retinal absorbe el fotón ción 470nm). Cuando el todo-trans retinal absorbe
se produce un cambio de conformación en la proteí- un fotón se provoca un cambio conformacional de
na que permite el movimiento de H+. El color de BR la proteína-canal transmembrana que abre un poro
356
Optogenética
Figura 15.2: En el panel superior se presenta un esquema del funcionamiento de las moléculas de la optogenética. Las canalropodsinas
conducen cationes y despolarizan neuronas cuando son iluminados (ChR2 y VChR1). Las halorodopsinas transportan iones cloruro al inte-
rior celular provocando una hiperpolarización, cuando son iluminados con luz amarilla (NpHR). Las OptoXRs son quimeras de rodopsinas
acopladas a proteínas G, en respuesta a luz verde activan vías de segundos mensajeros. El panel inferior presenta el objetivo �inal de la op-
togenética: modular la actividad de una neurona por medio de la luz. En este caso, la iluminación con luz azul provocaría en la neurona
el disparo de potenciales de acción (entrada de cargas positivas a través ChR2) que serían inhibidos al iluminar la misma neurona con luz
amarilla (entrada de cargas negativas a través de NpHR).
de ~ 6 Å permeable a Na+, H+, K+ y Ca2+. En el orden Las propiedades distintivas de las opsinas bac-
de milisegundos, el retinal vuelve a la conformación terianas vienen dadas por diferentes características
inicial, cerrándose el poro. La principal desventaja en su respuesta a la luz y las propiedades cinéticas
de ChR2 es su alto nivel de desensibilización, ya que del canal.
tras la primera iluminación se reduce en un 80% su
conducción y requiere ~25 s para su completa recu-
Conductancia de los canales
peración en oscuridad.
Posteriormente se describieron canalrodopsi- La cantidad de cationes que �luyan a través de un ca-
nas como VChR1 que se excita con luz roja (535 nm) nalrodopsina determinará si la despolarización de
y que se expresa de modo natural en el alga Volvox su membrana es su�iciente como para alcanzar el
carteri. potencial umbral y provocar el disparo de potencia-
En la �igura 15.2 se muestra una imagen resu- les de acción. Ese �lujo de iones o «fotocorriente»,
men de las opsinas bacterianas que funcionan como viene determinado por la sensibilidad de la luz de
canales y bombas iónicas o como receptores acopla- la opsina (probabilidad de absorción y posterior
das a proteínas G. probabilidad de reacción), su espectro de absor-
357
Métodos en biociencias
ción (longitud de onda de la luz a la que responden) las ChR deben exhibir desensibilización mínima du-
y la intensidad de iluminación que reciba por uni- rante la iluminación y recuperarse rápidamente en
dad de área (mW/mm2). En condiciones óptimas, la oscuridad.
conductancia estimada de un canal único de ChR2
es inferior a 1 pS (Siemens), muy por debajo de la Respuesta al espectro
conductancia de cualquier otro canal de membra-
na. Esta conductancia va a determinar la efectividad En algunas ChRs, los componentes de las corrientes
de la despolarización inducida por luz. En una célu- máxima y del estado estacionario pueden tener pi-
la de 50 MOhm (valor típico de resistencia en una cos de excitación su�icientemente separados en el
neurona de cerebro) la presencia de 500.000 cana- espectro. En este caso, es posible utilizar una longi-
les funcionales que se abrieran simultáneamente tud de onda para abrir el canal y otra diferente para
provocarían una despolarización de ~15 mV, insu�i- cerrarlo, consiguiendo un control muy exacto de las
ciente para alcanzar el potencial umbral de disparo. fotocorrientes. A este tipo de canalrodpsinas se las
Por lo tanto, es imprescindible optimizar la expre- denomina de «función escalonada».
sión de los canales en las células diana.
Tráfico y localización en membrana
Selectividad Mientras que una baja expresión o una agregación de
ChR puede reducir la efectividad de la despolariza-
Todos los canales son permeables a H+, Na+, K+ y Ca2+ ción, una sobre-expresión de proteína exógena puede
y tienen un potencial de equilibrio (o potencial de re- ser tóxica o afectar las propiedades de membrana.
versión) de ~0 mV, con lo que las despolarizaciones
que se consiguen no son muy fuertes. Es importante
conseguir modi�icaciones que mejoren la selectivi- 15.2.3. Modificaciones genéticas
dad del canal y optimicen el �lujo de iones. de las canalrodopsinas
A día de hoy y a pesar de la cristalización de ChR2
Cinética –en su conformación en oscuridad–, todavía existen
muchas incógnitas sobre los motivos y residuos que
Tras abrirse, las ChRs, han de cerrarse rápidamente determinan los parámetros anteriores. Sin embar-
después para conseguir la repolarización de la neu- go, desde que ChR2 fuera descrita por primera vez
rona. La rapidez de apertura y cierre o «fotociclo» es se han desarrollado mutantes especí�icos, identi�i-
un factor crítico para conseguir una manipulación cado ChR en otras algas o construido quimeras que
precisa del potencial de membrana que, además, combinan varias ChRs con objeto de modi�icar su se-
determinará la frecuencia de disparo de dicha neu- lectividad de activación por luz, cinética o magnitud
rona (es decir, la velocidad para generar potenciales de las corrientes que evocan. Ciertas modi�icacio-
de acción). Teniendo en cuenta que ciertas neuro- nes puntuales aceleran su cinética, de modo que
nas son capaces de disparar a frecuencias de 200 serían capaces de seguir frecuencias de hasta 200
Hz, deberían ser capaces de completar fotociclos de Hz. Otras mutaciones consiguen retrasar el cierre
~5 ms. Sin embargo, existe una correlación nega- del canal después de su activación óptica de modo
tiva entre amplitud de fotocorriente y cinética del que se tiene ahora una canalrodopsina super sensi-
canal: a nivel termodinámico se explica porque la ble a luz azul cuyo cierre puede controlarse con un
estabilización del estado abierto del canal ralentiza pulso de luz verde o amarilla. Otras mutaciones son
el cierre del canal. capaces de aumentar la fotocorriente. Mutaciones
dirigidas a cambiar el espectro de activación permi-
ten que la expresión de diferentes canalrodopsinas
Desensibilización y recuperación en un mismo tejido pueda determinar modulacio-
nes dobles. La mayoría de estas mutaciones se han
En presencia de iluminación continua o inten- elegido en base a homologías de los dominios T3-
sa la respuesta de las ChR2 decae en un 80%. Esto T7 entre ChRs y BRs, dado que esta última es una
requiere la expresión de 5 veces más canales fun- de las proteínas de membrana mejor caracteriza-
cionales para conseguir una despolarización por das. Otras aproximaciones se basan en la búsqueda
encima del umbral tras la desensibilización y evitar de nuevas opsinas para llevar a cabo comparaciones
fallos en el disparo. Para ser capaces de evocar dis- genómicas que permitan entender las bases mole-
paros consistentes con pulsos de luz prolongados, culares de su funcionamiento.
358
Optogenética
Cuadro 15.1: En esta tabla se recogen algunos ejemplos de mutaciones que mejoran alguna de las características de las canalrodpsinas.
Modi�icada de Zhang et al. 2010.
359
Métodos en biociencias
Figura 15.3: Mutaciones dirigidas a mejorar las fotocorrientes de ChRs. En (A) se muestra el resultado de una mutación (en C 128) de ChR2
que aumenta la fotocorriente y disminuye la desensibilización cuando se expresa en un oocito. En (B) se muestran las respuestas, en forma
de potenciales de acción, evocadas por pulsos de luz azul a 40 Hz cuando ChR2 y diferentes mutantes se expresan en neuronas piramidales.
Nótese cómo la ChR2 salvaje (wt) solo es capaz de disparar durante los primeros segundos, y los diferentes mutantes (HR, TC y ET/TC) con-
siguen mejorar la precisión temporal del disparo (fotociclo más corto). Además, el mutante TC es mucho más sensible, puesto que es capaz
de responder a muy bajas intensidades de luz. Modificado de Berndt et al. 2011.
serción en membrana. Una vez que se ha clonado la la población de interés, lo cual se consigue funda-
opsina deseada (ChRs, VChRs, NpHR o variaciones mentalmente mediante tres abordajes.
de estas), es posible mejorar sus niveles de expre-
sión en neuronas de mamífero sustituyendo codones
microbianos por otros mamíferos (denominadas 15.3.1. Sistemas de expresión víricos
«ChRs humanizadas»). Otras modi�icaciones se ba-
El uso de vectores virales es el método más po-
san en la inclusión de los denominados motivos de
pular para la administración de herramientas
trá�ico, como los del retículo endoplásmico. Otra
optogenéticas en sistemas intactos. Los vectores
variante es conseguir que las opsinas se puedan in-
víricos basados en lentivirus y virus-adeno-asocia-
sertar en diferentes partes de la neurona añadiendo dos (AAV) han conseguido la expresión de opsinas
elementos de localización especí�icos. Por ejemplo, en un amplio rango de animales experimentales,
existen fusiones ChR2 con el dominio de unión mio- incluyendo primates. La expresión vírica tiene nu-
sina Va con la que se consigue la localización de las merosas ventajas, como puede ser la rapidez y
ChR2 en el árbol dendrítico de las neuronas. Una �lexibilidad de la implementación, elevada potencia
fusión con el dominio ankirina G de los canales de derivada de una alta copia de genes (> 109 unidades
Na+ dependientes de voltaje permitiría su localiza- de transducción/ml y >1012 copias genómicas/ml
ción en el segmento inicial de las neuronas (o sitio para lentivirus y AAV respectivamente) cuya expre-
donde se genera el potencial de acción tras el proce- sión funcional se consigue en ~2-3 semanas (si bien
so de integración somático). ChR2 unida al dominio en ocasiones pueden necesitarse periodos de ~6
PDZ (responsable de la agrupación de canales tipo semanas) y los altos niveles de expresión se man-
NMDA) permitiría una localización preferencial tienen durante largos periodos de tiempo (varios
post-sináptica. meses) sin que se hayan reportado efectos adver-
Ahora, para conseguir el control preciso de sos.
determinada población neuronal, es fundamental Lo más importante es asegurar la especi�icidad
expresar de forma especí�ica las canalrodpsinas en para su inserción en la población neuronal deseada.
360
Optogenética
Si bien existen virus que atacan de modo especí�ico varios factores de la opsina expresada: longitud de
poblaciones neuronales (por ejemplo, herpexvirus), onda, intensidad y duración de la luz y el estado tras
lo más frecuente es utilizar promotores especí�icos. la primera iluminación
El problema es que no se pueden utilizar fragmentos Cuando se iluminan células en cultivo a través
muy grandes de promotores para empaquetarlos de un microscopio la intensidad de luz azul (473
junto con las opsinas en un virus y a día de hoy sigue nm) necesaria para provocar la apertura de ChRs y
siendo un reto el encontrar fragmentos promotores manipular la actividad neuronal ha de ser de ~1-10
de tipos neuronales específicos lo suficientemente mW/mm2. Para un estudio en cultivo bastaría con
pequeños para ser empaquetados en cargas virales. dividir toda la intensidad de la luz emitida por el
Una de las estrategias que se han utiliza- área iluminada, pero si se aplica en una rodaja in
do para conseguir especi�icidad en la expresión es vitro o en un cerebro intacto hay que tener en cuen-
el diseño de vectores virales dependientes de re- ta la profundidad y el volumen de tejido que tienen
combinasa Cre, aprovechando el amplio banco de que ser expuestos a luz, dado que la luz proyecta-
ratones transgénicos que expresan recombinasa da sobre una rodaja declina exponencialmente al
Cre en diferentes tejidos y tipos celulares. De este aumentar la profundidad. La solución en este caso
modo, cuando un AAV portador de una ChR + re- no pasa por aumentar la intensidad, dado que tam-
combinasa Cre se inyecta en un ratón, dicha ChR bién aumentaría su difusión, pudiendo llegar, por
solo se expresará en aquellas células que contengan ejemplo, a la retina (lo que provocaría un efecto
recombinasa Cre. no especí�ico en estudios en animales despiertos
en movimiento). Un exceso de iluminación puede
provocar fototoxicidad en células vecinas e inclu-
15.3.2 Ratones transgénicos so aumentos locales de temperatura que podrían
dañar las células. Afortunadamente, las longitudes
Si bien es más complejo que la expresión vírica, la de onda más largas dispersan menos y, por lo tanto,
expresión de la opsina en el sitio deseado es más pueden llegar a zonas más profundas. Parte de las
�iable. Las líneas de ratones Thy1:ChR2-EYFP y modi�icaciones de las ChRs han tenido como objeti-
Thy1:NpHR-EYFP expresan ChRs bajo el promotor vo expandir su espectro de activación, consiguiendo
Thy1. Aunque Thy1 se encuentra de modo general ChRs activadas con luz roja. Finalmente, hay que te-
en todas las neuronas de proyección, la activación
ner en cuenta la posibilidad de cambiar según se
especí�ica de la neurona diana se consigue al esti-
requiera el tamaño de los pulsos de luz y la frecuen-
mular de modo preciso el lugar de interés.
cia de aplicación.
Las fuentes de luz que se usan son láser o
15.3.3 Electroporación LEDs. En cualquier caso, tienen que poder utilizar
diferentes longitudes de onda que abarquen el es-
Esta aproximación se utiliza en neuronas embrio- pectro de activación de diferentes opsinas. Además,
narias mediante la inyección in utero. Como se usan la intensidad de emisión debe ser ajustable, pues-
plásmidos desnudos, que permiten la inserción de to que pueden existir variaciones en la expresión de
DNA de cualquier tamaño, se pueden utilizar pro- las opsinas en diferentes condiciones experimen-
motores más largos que mejoren la especi�icidad de tales y debe mantenerse constante a lo largo del
la expresión experimento.
El uso de láser o LED vendrá dado por las re-
querimientos experimentales de cada laboratorio.
15.4. Aplicación de luz Hay cierta tendencia a inclinarse por fuentes LED,
dado que son más económicas, �iables y más fáci-
La optogenética se fundamenta en la aplicación de les de controlar que los láser. Además, existen LEDs
luz. Una vez que la opsina elegida se expresa en la de muchos colores (variedad en el espectro de emi-
célula de interés habrá que pensar cómo se apli- sión). Su pequeño tamaño permite su incorporación
ca la luz teniendo en cuenta cual es el objetivo del en implantes �ijos en animales de experimentación
experimento. No es lo mismo conseguir provocar que permiten la aplicación de luz sin cables. Sin em-
disparos rápidos en una preparación in vitro de ro- bargo, aunque un LED individual puede emitir hasta
daja de cerebro que evocar un comportamiento con 5 vatios de luz, esta se emite en todas las direccio-
la aplicación prolongada de luz en un animal des- nes en vez de en un haz coherente. Por lo tanto, al
pierto; en la inmensa mayoría de organismos la luz acoplarlo a una �ibra óptica se pierde la mayor par-
no alcanza el interior del cerebro. Ya se ha explica- te de esta intensidad, llegando al sitio de interés
do que la fotocorriente en una neurona depende de intensidades de pocos milivatios (insu�icientes para
361
Métodos en biociencias
Figura 15.4: Video-secuencia (1-6: fotogramas tomados a intervalos de 60 ms) de una larva mutante de pez cebra (que
expresa ChR2 en ciertas células del techo óptico) en natación libre que por efecto de estimulación lumínica en su campo
de natación, comienza a nadar marcha atrás . (Modi�icado de Fajardo et al. 2013). En 7 se muestra la superposición de
los 6 fotogramas anteriores, la línea horizontal representa la escala (1 mm).
activar ChR2). Los láser, sin embargo, no sufren este inserción de las opsinas tiene que ser suplementada
problema. con retinal) o pez cebra. Los estudios en estos orga-
nismos sencillos ofrecen la gran ventaja de que al
ser transparentes, la luz aplicada llega directamen-
15.5. Lectura optogenética te a sus neuronas. En la �igura 15.4 se muestra un
en diversos modelos animales
362
Optogenética
Bibliografía
ejemplo del control del comportamiento motor evo- Berndt A, Schoenenberger P, Mattis J, Tye KM, Deisseroth
cado por luz en una larva de pez cebra. K, Hegemann P et al. 2011. High-efficiency Channelrho-
dopsins for Fast Neuronal Stimulation at Low Light Levels.
A día de hoy, los estudios más llamativos son PNAS 108(18):7595-600. doi: 10.1073/pnas.1017210108.
los que se han llevado a cabo en ratones despiertos
Busskamp V, Duebel J, Balya D, Fradot M, Viney TJ, Siegert
y los que han generado mayor cantidad de publica- S et al. 2010. Genetic Reactivation of Cone Photoreceptors
ciones. Mediante la inserción de diferentes opsinas Restores Visual Responses in Retinitis Pigmentosa. Science
en estructuras especí�icas encefálicas, ha sido po- 329:413-7.
sible controlar circuitos neuronales implicados en Fajardo O, Zhu P, Friedrich RW. 2013. Control of a Specific
funciones superiores complejas. Para este tipo de Motor Program by a Small Brain Area in Zebrafish. Front
estudios es imprescindible conseguir la estimu- Neural Circuits. 7:67.
lación de las células diana mientras el animal se Kato HE, Zhang F, Yizhar O, Ramakrishnan C, Nishizawa T,
mueve libremente, de modo que el comportamien- Hirata K et al. 2012. Crystal Structure of the Channelrho-
dopsin Light-gated Cation Channel. Nature. 482(7385):369-
to evocado pueda relacionarse directamente con la 74.
activación especí�ica de un circuito (y no a manipu-
Lin JY. 2011. A User’s Guide to Channelrhodopsin Variants:
laciones del experimentador). Como se esquematiza Features, Limitations and Future Developments. Exp
en la �igura 15.5, esto se consigue mediante el im- Physiol 96 1:19:25.
plante crónico de �ibras ópticas en el cerebro de los Stamatakis AM. Stuber GD. 2012. Activation of Lateral
animales experimentales. Dichos implantes pueden Habenula Inputs to the Ventral Midbrain Promotes Behav-
363
Métodos en biociencias
Zhang F, Gradinaru V, Adamantidis AR, Durand R, Airan RD, En el sitio web, desarrollado por el laboratorio del Dr.
de Lecea L et al. 2010. Optogenetic Interrogation of Neural Deisseroth en Standford, se tiene acceso abierto a los
Circuits: Technology for Probing Mammalian Brain Struc- trabajos de revisión más relevantes de su laboratorio.
tures. Nat Protoc 5(3):439-56. doi: 10.1038/nprot.2009.226. Incluye una lista con la secuencia y propiedades de las
Epub 2010 Feb 18. diferentes ChR, protocolos para la preparación de vecto-
364
16.
La imagen digital
Guillermo Bodega
Julio Bodega
Una imagen puede de�inirse, de modo general, como pecialmente idóneos para las técnicas de fotogra�ía
una representación visual de los elementos �ísicos y vídeo. En los grá�icos la imagen se genera a partir
(objetos) que nos rodean. Estas representaciones de entes denominados vectores, que pueden con-
pueden ser realizadas mediante diferentes medios siderarse como conjuntos de puntos controlables
y técnicas: pinceles (pintura), buriles (grabados), mediante algoritmos matemáticos. Los vectores es-
cámaras (fotogra�ía, vídeo), etc. Cuando las imáge- tán formados por las denominadas curvas de Bézier,
nes son obtenidas, editadas y presentadas mediante que permiten mucha �lexibilidad a la hora de gene-
dispositivos digitales (cámaras fotográ�icas, vídeos, rar imágenes. Por ello se utilizan principalmente
ordenadores, escáneres, fotocopiadoras…) se les en diseño grá�ico y representaciones de dibujo in-
denomina genéricamente imágenes digitales. dustrial. Por último, los archivos de los grá�icos son
Según el modo de representación, las imá- de menor tamaño que los archivos de los mapas de
genes digitales pueden agruparse en dos grandes bits.
bloques:
Figura 16.1: Izquierda: melanocito de la escama de un pez. Derecha: imagen aumentada del
cuadro de la imagen del lado derecho. La cuadrícula se ha añadido para facilitar la visuali-
zación de los píxeles.
ción del espacio se hace dividiendo la super�icie de camente en �ilas y columnas, que llevan asociado un
la imagen en pequeñas unidades de super�icie per- número que representa un nivel de intensidad de
fectamente ordenadas en �ilas y columnas (Figura luz asignado a todos y cada uno de ellos; por tanto,
16.1). Cada unidad de super�icie recibe el nombre la imagen ya no es otra cosa que números (dígitos).
de píxel (picture element). Esta división es compara-
ble a la que puede presentar la super�icie del suelo
de una habitación, donde cada una de las baldosas
16.1.2. Tamaño de imagen y la resolución
sería equiparable a un píxel. El tamaño de una imagen digital lo determina el
La fragmentación de la luz, más correctamente número de píxeles que la componen, y se obtiene
de la intensidad de la luz, se hace mediante la gene- multiplicando el número de píxeles que hay en una
ración de niveles discretos de intensidad luminosa. �ila por los que hay en una columna. Por ejemplo,
En una imagen en blanco y negro la intensidad de si una imagen posee 40 píxeles por �ila y 30 píxeles
luz se podría representar como una función cuyos por columna, esa imagen tendrá 1200 píxeles
extremos son el blanco (máxima intensidad de luz) (40x30). En principio parece lo mismo indicar 1200
y el negro (ausencia de luz), con grises intermedios píxeles que 40x30; sin embargo, el 40x30 es más
que se distribuyen de forma continua. Para poder útil pues también informa del formato de la imagen;
facilitar la digitalización es fundamental dividir esta nótese que con 1200 píxeles pueden darse diferen-
luz continua en niveles discretos a los que se da un tes formatos (30x40, 60x20, 50x24...) que generan
valor numérico. Dado que en este caso se ha consi- imágenes más planas, más altas o más cuadradas.
derado una imagen en blanco y negro, estos niveles El píxel es la unidad de super�icie; sin embargo, es
discretos reciben el nombre de niveles de gris (Fi- adimensional hasta que la imagen no se sustancia
gura 16.2). en una super�icie, es en ese instante cuando el píxel
Recapitulando, la imagen digital no es otra adquiere una determinada dimensión y entonces es
cosa que un conjunto de píxeles, ordenados numéri- más correcto hablar de resolución.
Figu-
366
La imagen digital
Figura 16.3: Efecto de la resolución sobre el tamaño del píxel. Los cuadrados miden 1 pulgada
de lado (2.54 cm). En el cuadrado A (resolución de 5 ppp) el tamaño del píxel es de 50 mm, en el
cuadrado B (resolución de 10 ppp) de 2.5 mm, en el C (resolución de 20 ppp) de 1.25 mm, y en el
D (resolución de 40 ppp) de 0.62 mm.
La resolución de una imagen impresa es el nú- es bastante usual en los escáneres, y es razonable
mero de píxeles por unidad de longitud, donde la pues no genera una imagen demasiado grande e in-
pulgada (inch) es la unidad de uso más común y cluso permite un cierto grado de ampliación sin que
equivale a 2.54 cm (Figura 16.3). Por ello la resolu- se produzca el pixelado; nótese que a esa resolución
ción se abrevia como ppi (pixel per inch) o ppp (píxel se puede ampliar 1.57 veces (200/127) hasta que el
por pulgada).También se utiliza el cm como unidad píxel alcanza el tamaño de 200 μm. Cuando se tra-
de longitud (ppcm). Para transformar estas unida- ta con imágenes que van a utilizarse en internet la
des de resolución solo hay que realizar el cociente: resolución óptima suele ser de 72 ppp, valor sensi-
ppcm=ppi/2.54. Por ejemplo, 300 ppp equivalen a blemente menor que el de las imágenes impresas.
119 ppcm. El concepto de resolución permite saber
En numerosas ocasiones la representación y
lo que mide un píxel. Por ejemplo, para una reso-
edición de imágenes digitales se realiza mediante
lución de 300 ppp cada píxel mide 84.6 μm: solo
ordenadores personales, por lo tanto, es necesario
hay que dividir 25400 μm de una pulgada entre los
300 píxeles que tiene cada una. El poder de reso- tener siempre presente que la resolución de la ima-
lución del ojo humano ante una imagen impresa gen tratada está limitada por la de la pantalla del
es de 0.2 mm (200 μm), por lo que teóricamen- ordenador. Para aclarar esto considérese un orde-
te se podrían ver píxeles mayores de este tamaño. nador de 21.45 pulgadas (longitud de la diagonal),
A un tamaño de 200 μm por píxel le corresponde con resolución de pantalla de 1920x1080 píxeles
una resolución de 127 ppp, por lo que, teóricamen- (formato 16/9), lo que signi�ica que el ancho de la
te, resoluciones inferiores a este valor permitirían pantalla será de 18.7 pulgadas y su resolución de
distinguir los píxeles de una imagen, efecto que se 103 ppp (1920/18.7), por lo que ninguna imagen
conoce como pixelado de la imagen (Figura 16.4). representada en la pantalla podrá aparecer con una
El empleo de 200 ppp como resolución de escaneo resolución mayor que esa.
367
Métodos en biociencias
El número de píxeles de una imagen puede ser tivo para imprimir. Es necesario saber cuál será el
cambiado: reducido o aumentado. Si se aumenta se tamaño �inal de la imagen para saber cuál es la re-
dice que se está interpolando o remuestreando y solución de salida adecuada. Baste recordar que a
para ello hay que «inventarse» píxeles. Si se redu- menos de 127 ppp se empieza a notar el píxelado.
ce, se habla de interpolación a la baja o reducción. Dicho de otra manera, la resolución adecuada de
La interpolación genera nuevos píxeles y les adju- salida debe ser aquella en la que los píxeles de la
dica un valor de intensidad de luz en función de los imagen que se va a imprimir midan menos de 200
píxeles circundantes, aunque considerándolos de μm (poder de resolución del ojo humano).
diferente manera según el método. La interpolación La resolución de impresión hace referencia al
bilineal, bicúbica y de vecino más cercano (nearest número de puntos que la impresora pinta en cada
neighbor) son los métodos más habituales. pulgada de papel, y se suele indicar con el término
La resolución también puede ser modi�icada, «dpi» (dots per inch). Una buena calidad se obtiene
y hay dos maneras de hacerlo. (a) Sin interpolar, en a partir de 200 dpi o más, tal como hacen las im-
este caso solo varía la resolución pero no el tamaño presoras de tinta y las impresoras láser, pero no las
en píxeles de la imagen; por ejemplo, una imagen matriciales. El rango de dpi que los fabricantes indi-
de 10 x 5 cm con una resolución de 300 ppp tiene can en las impresoras de inyección de tinta suele ir
0.697 Mp, pero podría pasar a tener 400 ppp y el de 1200 a 9600 dpi, que parecen valores muy altos,
mismo tamaño (0.69 Mp) a cambio de hacerla más pero, en realidad, hacen referencia al número de go-
pequeña (7.5 x 3.75 cm). (b) Interpolando, en este tas de tinta por pulgada de papel (Figura 16.5). Una
caso se mantiene el tamaño y se modi�ica solo el nú- impresora necesita como mínimo 4 gotas para pin-
mero de píxeles al alza o a la baja; por ejemplo la tar un píxel (las gotas son redondas y los píxeles
imagen podría ser de 400 ppp o de 200 ppp pero cuadrados), si además utiliza el sistema CMYK (de
siempre de 10 x 5 cm; en el primer caso tendría 1.24 4 colores) tendrá que usar 16 gotas por píxel (4 go-
Mp y 0.31 Mp en el segundo. tas por cada color); luego, en realidad, un modelo de
El tamaño (número de píxeles) de una imagen 2880 dpi pintará a 180 dpi (2880/16).
es un parámetro a tener en cuenta dependiendo del
uso que se le vaya a dar, pues parece obvio que con-
viene adecuar el número de píxeles de una imagen 16.1.4. Bit. Byte. Sistema binario
teniendo en cuenta su formato �inal; por ejemplo,
El bit (b), acrónimo de binary digit, es la unidad de
no tiene mucho sentido utilizar imágenes con un
información, y un conjunto de 8 bits recibe el nom-
número muy alto de píxeles si el resultado �inal va a
bre de byte (B). A su vez, 1024 B son 1 KB, 1024 KB
ser una imagen de pequeño tamaño.
son 1 MB, 1024 MB son 1 GB, y así sucesivamente.
El empleo de 1024 obedece a que al trabajar en el
16.1.3. Resolución de entrada, de salida sistema binario se utilizan potencias de 2. Es relati-
y de impresión vamente frecuente la confusión entre píxeles y bits,
para evitarlo es importante tener en cuenta que los
La resolución de entrada hace referencia a dispo- píxeles son unidades de super�icie y los bits unida-
sitivos de captura de imágenes como pueden ser des de información. Además, para la cuanti�icación
cámaras o escáneres, y es la resolución de digita- de píxeles no se utiliza el sistema binario pues 1 Mp
lización de la imagen. El valor de la resolución de son 106 píxeles.
entrada puede ir de 50 a 6000 ppp, pero es nece- El uso del sistema binario ocupa mayor infor-
sario hacer algunas consideraciones. De copias mación; con el uso de dos bits en el sistema binario
fotográ�icas normalmente no se pueden sacar más solo se pueden generar 4 posibilidades (00, 01, 10,
de 400 ppp en el mejor de los casos, de negativos 11), pero al utilizar el sistema decimal se pueden
o diapositivas se puede ir por encima de los 1600 generar hasta 100 posibilidades (desde el 00 hasta
ppp. Por otra parte, los fabricantes suelen exagerar el 99). Entonces cabe hacerse la siguiente pregunta:
las características técnicas de los aparatos digita- ¿por qué usar el sistema binario si este ocupa más
les que ofrecen en el mercado. En muchas ocasiones información? La razón principal es que la notación
no aclaran los conceptos de resolución óptica (li- binaria es más segura: al existir solo dos posibili-
mitada por las lentes del dispositivo) y resolución dades es más di�ícil la producción de errores. En el
digital que aumenta el tamaño de la imagen pero no sistema binario si un dígito no es el 0 ha de ser for-
resuelve pues se consigue mediante interpolación. zosamente el 1; sin embargo, en el sistema decimal
La resolución de salida se re�iere a la que el existen 10 posibilidades, y si un valor no es 0 pue-
ordenador envía desde un programa a un disposi- de ser cualquiera de los otros nueve. Es interesante
368
La imagen digital
En
Figura 16.5: Diferencia entre punto y píxel. El cuadrado del lado izquierdo representa los píxeles de una imagen
digital. En el cuadrado del centro se han incluido círculos teñidos con diferentes niveles de gris que representan
los puntos de impresión. En el cuadrado del lado derecho se aprecian los puntos de impresión de una imagen real.
Figura 16.6. Imagen del melanocito de la figura 16.1 con 256 (A), 8 (B), 4 (C) y 2 (D) niveles de gris.
369
Desde un punto de vista fisiológico puede parecer excesiva la utilización
de 256 niveles de gris para una imagen pues se cree que, en el mejor de los
casos, el ojo humano puede distinguir sólo hasta 80 niveles de gris. Es obvio, y
Métodos en biociencias
Figura 16.6: Imagen del melanocito de la �igura 16.1 con 256 (A), 8 (B), 4 (C) y 2 (D) niveles de gris.
Desde un punto de vista �isiológico puede pa- 16.1.6. Archivos: tamaños y formatos
recer excesiva la utilización de 256 niveles de gris
para una imagen pues se cree que, en el mejor de los Puede de�inirse el formato como la forma en que se
almacena la información de la imagen en un archivo.
casos, el ojo humano puede distinguir solo hasta 80
A día de hoy existen más de 50 formatos diferentes
niveles de gris. Es obvio, y después se demostrará, pero solo algunos se han popularizado tanto que se
que el uso de 256 niveles conlleva un mayor tama- pueden considerar estándar.
ño en el archivo de la imagen; sin embargo, su efecto En principio, los formatos pueden clasi�icarse
puede considerarse despreciable dada la velocidad según la calidad de imagen que ofrecen, y así se dis-
de procesamiento y la capacidad de almacena- tinguirán los formatos sin pérdida de información
miento de los ordenadores actuales. No obstante, y los formatos con pérdida de información. Los pri-
en algunos casos puede ser muy razonable la utili- meros, generan �icheros muy grandes y «pesados»
ya que incorporan toda la información relativa a la
zación de lo que se llaman imágenes binarias pues
imagen; los segundos son más «livianos» ya que eli-
solo tienen blanco y negro. En este caso solo se uti- minan parte de la información de la imagen. Un gran
liza 1 bit por píxel en vez de 8, lo que conlleva una número de los formatos utilizados en la digitaliza-
disminución considerable en el tamaño del archivo. ción de imágenes suelen tener formato reducido. A
El uso de este sistema binario es especialmente útil continuación se enumeran algunos de los formatos
en el caso de imágenes de textos, como es el caso de más utilizados en el tratamiento digital de la ima-
letras negras sobre fondo blanco. gen:
En las imágenes en color se utilizan dos va- — RAW (palabra inglesa que signi�ica cru-
riantes: el sistema RGB (red, green, blue), que forma do, no procesado). Este formato suele
la imagen de color usando tres canales, y el siste- estar disponible en cámaras y elementos
ma CMYK (cyan, magenta, yellow, black), que la de captura avanzados. El formato RAW
forma utilizando 4 canales. Normalmente cada ca- es propio de cada fabricante y en los �i-
cheros que genera se almacena toda la
nal utiliza 1 B, por tanto la codi�icación de color en
información de la imagen «en bruto»
el sistema RGB es de 3 B, y de 4 B para el sistema (sin modi�icación de lo que se capturó).
CMYK. Dado que cada canal tiene 256 niveles, el Actualmente es el formato que se utili-
sistema RGB es capaz de generar 28 x 28 x 28 colo- za como negativo en la fotogra�ía digital.
res, alrededor de 16.7 millones de colores. Número En los �icheros raw se pueden utilizar
que parece más que su�iciente para obtener una profundidades de color de 48 bits. Con-
imagen �idedigna de la realidad. Obviamente, el sis- cretamente, en cámaras fotográ�icas, se
trabaja con una profundidad de color de
tema CMYK es capaz de generar un mayor número
12 o 14 bits.
de colores, alrededor de 4275 millones de colores.
— TIFF (tagged image �ile format). Este for-
En general, el uso del sistema RGB es útil en imáge- mato tampoco reduce la información de
nes cuya visualización se va a realizar en pantalla; las imágenes por lo que ofrece una muy
si, por el contrario, el �in de la imagen es ser impre- buena calidad de imagen. El formato
sa en papel se suele utilizar el sistema CMYK. TIFF tiene la ventaja de permitir el trat-
370
La imagen digital
amiento de las imágenes con multitud es conveniente indicar que el año 2000,
programas de edición estándar (Pho- The Joint Photographers Experts Group
toshop, Paint, Core, etc.). Sin embargo, creó un nuevo formato jpeg denominado
actualmente, está en desuso, sobre todo JPEG2000 (jpeg2), en el que se ha
en las cámaras digitales profesionales, ya alcanzado un compromiso óptimo entre
que los �icheros son excesivamente pesa-
el peso del �ichero y la calidad de imagen.
dos y su manejo requiere gran cantidad
de memoria y recursos. En los �icheros — PICT (picture imagen). Original de Mac,
tiff se puede trabajar con profundidades se utiliza en aplicaciones de grá�icos y de
de color que alcanzan los 64 bits. A pesar diseño de páginas de Mac OS como for-
de esta cifra, en los �icheros tiff que se mato de archivo para la transferencia de
generan en cámaras fotográ�icas se suele imágenes entre aplicaciones.
trabajar con 8 bits de profundidad de col- — GIF (graphics interchange format). Es un
or. formato utilizado habitualmente para
— PSD (Photoshop document). Se trata de representar grá�icos e imágenes de co-
un �ichero original de ADOBE y, al igual lor indexado en documentos HTML en
que el formato tiff, está catalogado como
internet y otros servicios en línea. Este
un formato sin pérdidas. Los �icheros
formato comprimido está diseñado para
psd también son muy extensos por lo
que pueden de�inirse como «pesados». minimizar el tamaño de los archivos y el
Este tipo de formato es muy utilizado en tiempo de transferencia electrónica.
el retoque fotográ�ico. La profundidad
Todo archivo de imagen lleva incluido, además del
de color de estos �icheros es de hasta 64
bits y poseen, prácticamente, la misma tipo de formato, su tamaño desde el punto de vis-
calidad que los de formato tiff. ta de unidades de información ocupadas; es decir, el
— BMP (bitmap). Este formato es original número de bits que ocupa. El valor del tamaño guar-
de Windows por lo que es el que utiliza da una relación directa con el número de píxeles de
ese sistema operativo para guardar sus la imagen y con el número de niveles de luz emplea-
imágenes. Los �icheros con este forma- dos. La expresión que permite obtener el «peso» de
to llegan a utilizar hasta 24 bits y se les una imagen es:
pueden aplicar compresiones sin pérdida
de calidad. Se utilizan, principalmente, en T=MxNxk
aplicaciones que requieran imágenes con
poco «peso», como pueden ser imágenes donde T es el tamaño en bits, M y N son el número de
decorativas en pantallas (escritorio, fon- píxeles por ancho y alto de la imagen y k el exponen-
dos), murales digitales, etc. te de 2 en la expresión L = 2k, donde L es el número
— JPEG. Es un formato original de The de niveles de luz. Lógicamente, para transformar el
Joint Photographers Experts Group. Es, tamaño en bytes solo hay que dividir entre 8.
quizá, el formato más conocido para la
compresión de fotogra�ías digitales; de
hecho, la mayoría de los dispositivos 16.2. Sistemas de análisis digital
digitales soportan este formato. Algunas de imagen
de sus principales características son
que los �icheros que se generan en este Los sistemas de análisis digital de imagen (DIAS, di-
formato son menos pesados que los de gital image analysis system) son sistemas capaces
los anteriormente citados y que dicho de digitalizar la imagen y llevar a cabo tratamientos
formato es compatible con internet (web).
posteriores con el �in de adecuarla para permitir su
El formato jpeg es comprimido por lo que
análisis. Es obvio que los tratamientos de adecua-
su calidad está limitada; no se aconseja
editar imágenes con soporte jpeg. No ción dependerán del tipo de análisis a realizar. En
obstante, cuando en un dispositivo se general el equipo esencial de un DIAS consiste en
genera un �ichero jpeg, el software ofrece un sistema de captación de imagen y un computa-
diferentes calidades de compresión. El dor con un programa de gestión de imágenes que
formato jpeg soporta 24 bits. Por último, permite su almacenamiento, tratamiento y análisis.
371
Métodos en biociencias
16.2.1. Sistemas de captación parte de la propia cámara (lo más usual) o disponer-
se fuera de ella. El tamaño actual de las fotocélulas
Un buen DIAS debe ser capaz de captar cualquier suele ser de 4-5 μm lo que les ha permitido alcanzar
imagen, sea cual fuere el soporte en el que esta se una resolución mejor que la de la antigua película
encuentra. A día de hoy, los sistemas más usuales de fotográ�ica, donde el tamaño de grano de la sal de
captación son las cámaras fotográ�icas o los escá- plata rondaba los 10 μm.
neres. Muy básicamente, una cámara está formada A continuación se explicarán algunas carac-
por un sensor o transductor sobre el que un sistema terísticas básicas de los sensores que afectan al
óptico (lente) enfoca la imagen. El sensor está for- proceso de captación de imagen como son sensibili-
mado por la agrupación de elementos fotosensibles dad, rango dinámico, gamma, resolución, respuesta
discretos llamados fotocélulas que convierten las espectral y el escalado de nivel de gris. Algunas de
señales luminosas en electricidad. En una clara ana- ellas son modi�icables y permiten variar la imagen
logía con el ojo de vertebrados, el cristalino sería la capturada de modo que pueda ser más idónea para
lente, la retina el sensor, y los conos y bastones re- conseguir el �in que se persigue.
tinianos las fotocélulas. Los escáneres, al menos los La sensibilidad de�ine la intensidad de luz mí-
de tipo plano que son los más usados, son dispositi- nima capaz de generar una respuesta electrónica en
vos que constan de un cristal que sirve para colocar la fotocélula. El rango dinámico determina la ampli-
la muestra, y debajo se ubica un brazo acoplado a un tud de respuesta considerada como la capacidad de
motor que sirve para hacer el escaneo. Asociado al responder de forma correcta a intensidades lumi-
brazo va un sistema de iluminación y el sensor. La nosas bajas y altas. La gamma hace referencia a la
luz re�lejada por la muestra es captada por el sen-
relación entre el estímulo luminoso y la respuesta
sor que funciona de modo análogo al ya visto en la
electrónica (Figura 16.7) y es un parámetro sobre el
cámara.
que se puede interactuar para conseguir respuestas
Las cámaras suelen nominarse en función del lineales o con mayor o menor contraste en determi-
tipo y modo de operar de sus sensores, y así tene-
nadas partes del espectro de intensidad luminosa.
mos cámaras CCD (charge coupled device), CMOS
(complementary metal-oxide-semiconductor) y CID La resolución viene determinada por el número
(charge injection devices). Estas últimas son las de de fotocélulas que incorpora el sensor, y será el fac-
mayor calidad pues, entre otras ventajas, corrigen tor limitante del número de píxeles que alcance la
mejor dos problemas que afectan a los sensores: la imagen capturada. La respuesta espectral viene de�i-
saturación por señales no muy altas y el blooming, nida por la diferente sensibilidad de las cámaras en
efecto ocasionado cuando una fotocélula recibe función de la λ de la luz incidente. El escalado del ni-
una luz muy intensa y la corriente generada pue- vel de gris hace referencia a la relación que hay entre
de afectar parcialmente a las fotocélulas vecinas. la respuesta electrónica de la fotocélula y el valor de
La señal eléctrica de la fotocélula es ampli�icada, gris asignado a cada píxel. Al igual que en el caso de
transformada y convertida después en una señal di- la gamma, lo mejor es que la respuesta de escalado
gital mediante un conversor analógico-digital (ADC, sea lineal; sin embargo, existen otras posibilidades
analog to digital converter). No confundir con un de escalado no lineales cuya representación genera
dispositivo DAC (digital to analog converter), que funciones de tipo logarítmicas, exponenciales, si-
opera exactamente al revés. El ADC puede formar nusoidales o de otros tipos (Figura 16.8).
Figura 16.7: A la izquierda, esquema que ilustra el efecto de la corrección gamma sobre el voltaje. A
la derecha, el efecto que dicha corrección podría generar sobre el brillo de los diferentes niveles de gris
a la hora de generar la imagen. En este caso el efecto se logra sobre los grises intermedios pues ambas
respuestas empiezan y terminan en los mismos puntos.
372
La imagen digital
Incluso se pueden llevar a cabo reasignaciones gen obtenida no necesariamente tiene que coincidir
arbitrarias al aplicar paletas (LUT, look up table). con la realidad y, además, puede seguir necesitando
Las LUT reasignan nuevos niveles de gris a los ya
existentes en función de criterios establecidos por todavía una serie de tratamientos que la capaciten
el diseñador de la paleta. También se pueden aplicar aún más para poder ser analizada.
paletas de color, que consiste en reasignar colores a
determinadas fases de gris (una fase es un conjun-
to de niveles de gris próximos). Una de las paletas
de color más comunes es la «rainbow» pues divide 16.2.2. Procesado de la imagen
los niveles de gris en 7 fases y a cada una de ellas le
asigna un color del arco iris (Figura 16.9). Algunos Es un conjunto de procedimientos que constituye
programas de análisis permiten el diseño de paletas
un tratamiento cuyo �in es la restauración, mejora
propias en función de las características de nuestra
imagen, herramienta muy útil en tanto que la paleta y/o preparación de la imagen con el propósito de
está confeccionada teniendo en cuenta las peculia- hacerla apta para su análisis. Existen dos grandes
ridades de nuestra imagen. En el fondo esto no es
más que una reasignación del nivel de gris total y tipos de operaciones: píxel a píxel, y por grupos de
absolutamente arbitraria con el �in de conseguir píxeles.
una imagen �inal más apta para su estudio o para
hacer mucho más evidente la zona donde se quiere
centrar la atención.
En principio, parece que lo ideal es que la ima-
gen captada y la realidad fuesen idénticas, pero en
el proceso de captación siempre se producen mo-
di�icaciones que causan diferencias entre la imagen
real y la captada. Algunas de los características vis-
tas no son modi�icables; otras, como la gamma y el
escalado de nivel de gris, sí lo son y permiten actuar
sobre el proceso de captación de imagen con el ob-
jeto de obtener una imagen con las características Figura 16.9: Aplicación de la paleta de color rainbow (imagen
más idóneas posibles en función del estudio que se inferior) a la imagen de una electroforesis con 256 niveles de gris
va a realizar sobre ella. Por ello esta primera ima- (imagen superior). Disponible en color.
373
Métodos en biociencias
Figura 16.11: Imagen del melanocito de la �igura 16.1: sin modi�icar (A), tras aplicar un �iltro de suavizado (B)
y tras aplicar uno de enfatizado (C).
374
La imagen digital
Figura 16.12: Imagen del melanocito de la �igura 16.1: sin modi�icar (A), tras detectar márgenes mediante un
operador laplaciano (B) y tras la aplicación de un operador cardinal de tipo sur (C).
de foco para obtener una imagen completamente rísticas, y píxeles sin interés analítico que, desde
enfocada. este punto de vista, al ser anulados es como si no
existieran. Conviene diferenciar entre una imagen
Operaciones con grupos de píxeles binaria desde el punto de vista de la segmentación
y una imagen binaria en relación con los niveles de
Este tipo de procedimientos se suelen llevar a cabo gris. En el primer caso se considera imagen binaria
para modi�icar aquellos píxeles que son muy distin- porque los píxeles útiles para el análisis se marcan
tos a sus vecinos; por ejemplo, los puntos conocidos como 1 y los que carecen de él como 0. Es por ello
como ruido de fondo que aparecen en muchas imá- una imagen binaria lógica en la que todos los da-
genes. Su eliminación se lleva a cabo mediante tos que llevan aparejados los píxeles marcados con
operaciones entre píxeles vecinos o los llamados 1 se mantienen, los de los píxeles marcados con 0
�iltros matriciales. Normalmente consiste en es- se pierden. En una imagen binaria en relación con
coger un pequeño grupo de píxeles, entre 9 y 49 los niveles de gris lo que ocurre es que solo hay dos
dependiendo de que la matriz sea de 3x3 hasta 7x7 niveles de gris: el 0 y el 256; por ello solo apare-
píxeles, y modi�icar alguno de ellos (normalmente cerán píxeles negros y blancos. La confusión entre
uno y en posición central) en función del valor de ambas imágenes binarias se suele producir porque
los demás que le rodean. Así se tienen los �iltros de en la imagen binaria lógica –obtenida en la segmen-
suavizado (el de la media, los gaussianos o el de la tación– a los píxeles marcados como 1 se les aplica
mediana) en los que se disminuyen las diferencias el nivel de gris 256 (blanco) y a los marcados como
de alguno con respecto a sus vecinos, o los de enfa- 0 se les asigna el nivel 0 (negro). Por ello, la imagen
tizado, que hacen lo contrario (Figura 16.11). binaria lógica resultante del proceso de segmenta-
ción también es una imagen binaria desde el punto
de vista de niveles de gris.
16.2.3. Segmentación
Todos los algoritmos que se usan en un pro-
El objeto de la segmentación es separar los ele- ceso de segmentación se basan en dos criterios:
mentos o componentes de interés del resto de la discontinuidad y similitud entre píxeles vecinos. El
imagen, por lo que podría considerarse como una criterio de discontinuidad se basa en detectar cam-
disección de la imagen digital. Sin duda alguna, el bios bruscos en el nivel de gris, y de este modo se
paso más importante en un proceso de segmen- pueden detectar puntos, líneas y bordes. El crite-
tación es precisar con exactitud los límites de los rio de similitud consiste en seleccionar áreas con
objetos que se quieren medir, de modo que estos píxeles cuyo nivel de gris es idéntico o similar, y se
queden identi�icados de manera clara. El resul- suele hacer por el procedimiento de crecimiento de
tado será una nueva imagen de carácter binario región o la umbralización. Desde un punto de vista
desde el punto de vista del análisis, pues solo con- más pragmático, los programas de tratamiento de
tendrá dos tipos de píxeles: píxeles con interés para imagen digital suelen ofrecer menús con distintos
el análisis, a los que se mantiene con sus caracte- métodos de segmentación. Los más usuales son: el
375
Métodos en biociencias
376
La imagen digital
Figura 16.14: Esquema de una operación de apertura y de una de cierre. Cedido por J.F. Pertusa, Universitat
de València (ver bibliogra�ía).
siempre está interconectado con otros 8: 4 por sus píxeles de valor lógico 0. La esqueletización es un
caras y otros 4 por sus vértices. proceso de erosión iterado, y se puede considerar
La dilatación consiste en la adición por cone- como un proceso de simpli�icación de la imagen
xión de un píxel o más a aquellos píxeles colocados
pues al �inal se obtiene un objeto conectado, cen-
en el exterior de la imagen de modo que ni un solo
punto exterior (ya sea cara o vértice) de los píxeles trado y que mantiene la forma original. El �in de la
de la antigua imagen quede sin cubrir. La erosión eliminación de bordes es suprimir los objetos que
es la operación conceptualmente opuesta. La di- contactan con los márgenes de la imagen. Es una
latación aumenta el área del objeto y la erosión la operación imprescindible en biología pues si no se
disminuye por lo que puede ser un buen procedi- hace se pueden medir objetos cortados que pueden
miento de eliminación de objetos con un número de
falsear resultados.
8 píxeles o inferior. Ambos procedimientos pueden
condicionarse direccionalmente pues se puede lle-
var a cabo el proceso por un lado de�inido por un
ángulo. La apertura y cierre se suelen usar para
juntar o separar objetos y resultan de la combina-
ción de un proceso de erosión seguido de dilatación
(apertura) o de dilatación seguido de erosión (cie-
rre) (Figura 16.14).
El rellenado se podría de�inir como una di-
latación interna y consiste en transformar de 0
a 1 aquellos píxeles encerrados en una estructu-
ra de píxeles con valor lógico 1. Puede ser de gran
ayuda para terminar procesos de segmentado de
estructuras tubulares o con huecos en su interior.
Al aplicar la operación conocida como contorno Figura 16.15: (A) Imagen segmentada de la �igura 16.13. Sobre
se seleccionan únicamente los píxeles más exter- ella se identi�ican los objetos (B) y se determina su área y su DOI
nos del objeto, aquellos que están en contacto con (tabla).
377
Métodos en biociencias
Fi-
a b AND OR XOR NOT a NOT b
gura 16.16: Distancia focal del objetivo de una cámara fo-
0 0 0 0 0 1 1
0 1 0 1 1 1 0
1 0 0 1 1 0 1
que, a su vez, resulta muy familiar a la mayoría de
1 1 1 1 0 0 0 las personas ya que se utilizará en diversas face-
tas de su vida cotidiana es el de la fotogra�ía digital.
El nacimiento de la tecnología digital y, consecuen-
16.2.5. Medida temente, la masiva aparición de las denominadas
cámaras digitales, han dado lugar a que la fotogra�ía
Una vez que, en función del objetivo que se persi- digital pase a ser considerada una técnica impres-
gue, la imagen binaria lógica está perfectamente cindible a la hora de obtener (capturar), editar y
preparada, se pasa al proceso de medida. Existen generar (imprimir) imágenes reales. Uno de los
dos grandes grupos de medidas: parámetros mor- ámbitos de aplicación de esta técnica también es
fométricos (topología del objeto) y parámetros el cientí�ico, y es por ello por lo que en este tema
densitométricos (intensidad lumínica). es conveniente, a nivel general, exponer algunos de
Entre los morfométricos destacan: número, sus fundamentos.
área y perímetro de objetos, diámetro, longitud y
anchura, feret, orientación, centro de masas, elon-
gación, rugosidad, distancia entre objetos… y entre 16.3.1. Conceptos generales de la óptica
los densitométricos destacan la densidad óptica y sistema de exposición de la cámara
(DO) y la DO integrada (DOI); muy útiles en biología
pues permiten calcular concentraciones o conte- Distancia focal. Tipos de objetivos
nidos de sustancias en función de su nivel de gris Puede de�inirse como lente o lentes objetivo al dis-
(Figura 16.15). La DO de un píxel viene de�inida por positivo óptico (y electro-mecánico) cuya misión
la fórmula: es captar la luz que proviene de los objetos que
DO = -log10 (255 / nivel de gris) componen una escena para formar con ella imáge-
La DO de un objeto representa la media de la DO de
todos los píxeles que forman parte del objeto. DOI
se obtiene al multiplicar DO por el área del objeto.
8 mm
20 mm
35 mm
Objeto 1 2 3 4 5 6 7 8 50 mm
85 mm
Área 153 152 154 147 216 143 196 159 200 mm
OBJETIVO 0º
DOI 133.62 105.72 121.16 110.24 138.33 95.76 135.6 95.96 12º
28º
46º
63º
94º
16.3. La fotografía digital 180º
Un campo en el que se aplica gran parte de los con- Figura 16.17: Variación de la distancia focal respecto al ángu-
ceptos que se acaban de exponer en este capítulo y lo de captación de imagen.
378
apertura de diafragma, menor profundidad de campo, y viceversa. Por ello
también interesa que un objetivo pueda cerrar mucho el diafragma lo que s
consigue si el objetivo dispone de valores de f altos.
La imagen digital
La figura 16.18 muestra una serie de diafragmas con diferentes aperturas
379
Métodos en biociencias
Sensor
Sensor
y enfoque correcto
medición Diafragma
Sistema de Visor
Obturador abierto
Espejo abierto
Pentaprisma
Obturador
MEDIDA Y ENFOQUE PROCESO DE CAPTURA
380
La imagen digital
Escena
Óptica
PROCESADO DE
IMAGEN
- Espacio de color
- Ajuste luminosidad Compresión JPEG
- Balance blancos (datos)
- Nitidez
- Contraste
forman la energía luminosa en energía eléctrica) lo que sus prestaciones se ven algo redu-
y que en el mercado aparece según dos diferentes cidas, si bien, cada vez incorporan más
tecnologías, CCD (charged coupled device), y CMOS ajustes con lo que se puede mejorar sus
(complementary metal oxide semiconductor). La se- prestaciones relativas a la creatividad.
ñal eléctrica recogida en cada una de las áreas (cada — Cámaras bridge o intermedias. Son algo
cuatro fotodiodos se obtiene la información de mayores en tamaño que las compactas
luz y color de un píxel: patrón de Bayer) que con- y, por lo tanto, también es algo mayor
forman el sensor es proporcional a la cantidad de el sensor, por lo que alcanzan mejores
luz (fotones) que ha incidido sobre ella, y ha de ser niveles de calidad de imagen. Estas cá-
transformada en una señal digital mediante un con- maras incorporan una mayor cantidad
versor de tipo A/D (ver epígrafe 16.5). de ajustes que las anteriores y su objeti-
El almacenamiento o carga de la información vo es de distancia focal variable y no es
en un soporte digital se realiza por medio de una intercambiable. La calidad de imagen de
memoria interna y una tarjeta de memoria. En el estas cámaras es sensiblemente superior
momento de capturar la imagen, la información a la las compactas. En el mercado, estas
de dicha imagen pasa a un chip de memoria inter- cámaras están dirigidas a un público a�i-
na, –circuito integrado de procesamiento– donde cionado.
permanece de forma temporal hasta que, poste- — Ré�lex o DSLR. Poseen un tamaño de sen-
riormente, es trasladada desde ese chip hasta una sor signi�icativamente mayor que las
tarjeta de memoria (Compact Flash, xD-Pictu- cámaras intermedias, de lo que se deri-
re Card, SDcard, etc.) donde queda almacenada de va una calidad de imagen muy superior
forma permanente. Las tres tareas descritas an- a las anteriores. Estas cámaras posibi-
teriormente pueden ser representadas según el litan el intercambio de objetivos con lo
esquema grá�ico de la �igura 16.21. que pueden captar cualquier situación o
escena. También, por el gran número de
funcionalidades de que disponen, per-
16.3.3. Tipos de cámaras miten muchas posibilidades creativas.
Un elemento característico de estas cá-
Existen multitud de criterios a la hora de clasi�icar maras es el visor de tipo ré�lex, que es el
las cámaras digitales: utilización (profesionales, a�i- que da nombre a la cámara, y constituye
cionado, etc.), por su aspecto constructivo y tamaño un elemento muy importante a la hora
(compactas, ré�lex, etc.), por el tamaño del sensor de obtener buenas tomas. El mercado de
(full-frame, 4/3, etc.), etc. En estas breves notas se este tipo de cámaras está orientado hacia
clasi�icarán las cámaras por sus prestaciones y ta- usuarios a�icionados avanzados y profe-
maño constructivo, ya que ambos criterios están sionales por lo que existe gran variedad
muy relacionados. Así se distingue entre: de modelos con diferentes funcionalida-
des y precios.
— Cámaras compactas. Están muy exten- — Cámaras EVIL (electronic view�inder inter-
didas en el mercado; tienen un tamaño changeable-lens). También denominadas
reducido por lo que son muy útiles para CSC (compact system cameras) o MILC
el viaje. Su principal inconveniente es que (mirrorless interchangeable-lens camera),
el sensor de imagen es muy pequeño por son cámaras de tipo compacto que permi-
Tema 16, página 27
COMPACTA
COMPACTA BRIDGE
BRIDGE EVIL
EVIL REFLEX
RÉFLEX
Figura 16.22. Diferentes
tipos de cámaras digitales en función de su tamaño y prestaciones
Figura 16.22: Diferentes tipos de cámaras digitales en función de su tamaño y
prestaciones
3.4. Modos de funcionamiento
383
Métodos en biociencias
Figura 16.25: Relación la temperatura de color y el color de emisión de diferentes fuentes de luz. Disponible en color.
384
La imagen digital
385
Métodos en biociencias
El ruido
Las cámaras digitales, a la hora de procesar las imá-
genes que capturan, generan de forma sistemática
variaciones indeseables en su información que se
traducen en cambios de brillo y color puntuales en
el mapa de píxeles que conforma la fotogra�ía. Este
Figura 16.29: Efecto del ruido sobre una imagen. efecto es el denominado ruido digital.
El ruido digital aparece por múltiples causas
intrínsecas al dispositivo de captura. Algunas son:
limitación �ísica del sensor (cuanto más pequeño,
Tono, brillo y saturación
más ruido puede generar), pequeñas variaciones
De una forma sencilla, se de�ine como tono de una de luminosidad en la imagen, calor generado en la
imagen u objeto a su color preponderante, si bien, propia máquina fotográ�ica (emisión de infrarrojo
sería más preciso de�inirlo como la longitud de onda que puede ser captada por el sensor), errores en la
de la radiación del color que domina dicha imagen. lectura realizada por el sensor (limitaciones en los
Los tonos generalmente se representan mediante componentes electrónicos), errores de redondeo
una posición angular en el denominado círculo cro- en la conversión A/D, condiciones de luz muy ba-
mático (Figura 16.27). jas (generan mucha aleatoriedad en la medida), etc.
Se de�ine como brillo, o luminosidad, de un El ruido aparece, generalmente, en capturas
objeto la cantidad de luz que emite o re�leja. Consi- realizadas sobre escenas con muy baja iluminación
derando el caso de un color concreto, el brillo puede ya que, en estas condiciones, hay que ampli�icar las
ser evaluado por la claridad u oscuridad que pre- señales eléctricas que capta el sensor y, por lo tanto,
senta. también se ampli�ican las señales indeseables que
Por último, la saturación indica el grado de pu- originan el ruido. El equivalente al ruido digital en
reza de los colores. La máxima saturación se da para las cámaras analógicas es el tamaño de grano de los
los colores puros (tonos vivos), y la mínima, para los haluros de plata utilizados en la película fotográ�ica:
tonos en gris (tonos muertos). cuanto mayor es el grano (ISO alto) mayor es la pro-
La �igura 16.28 muestra de modo visual estas babilidad de que dichos granos puedan visualizarse
tres cualidades del color. en la imagen dotándola de cierta granulosidad. Este
Actualmente, la mayoría de las cámaras digi- efecto a veces no tiene porqué resultar indeseable
tales, en su modo de EDICIÓN, permiten variar el cuando se trata de fotogra�ía artística o creativa.
tono, brillo y saturación en las tomas realizadas. Por último, indicar que el ruido puede ser eli-
También, existen cámaras
Tema 16, muy
página 33 avanzadas que ofre- minado mediante la utilización de �iltros, que no son
4. FOTOCÉLULAS
Bajo este término, pueden definirse aquellos dispositivos electrónicos,
386 en otra de naturaleza eléctrica. Su
capaces de convertir una señal luminosa
funcionamiento se basa en el denominado efecto fotoeléctrico. En los dispositivos
de captura de imagen para su posterior tratamiento digital, las fotocélulas son los
La imagen digital
más que programas informáticos que tratan la in- valor de sensibilidad alto posibilite la toma de fo-
formación de los píxeles que conforman la imagen, togra�ías con bajos tiempos de exposición, por lo
de forma que, para asignar el valor correspondien- que será aconsejable en fotogra�ías nocturnas o de
te al color y brillo de cada uno de ellos, ponderan su baja iluminación, si bien, como ha sido comentado,
valor y el de sus vecinos más próximos. siempre hay que tener presente el ruido.
En la �igura 16.29 se pone de mani�iesto la En la �igura 16.30 se muestra la relación entre
presencia de ruido en una imagen tomada de una el ruido y la sensibilidad correspondiente a diferen-
cámara digital. tes tomas de una misma escena capturada con una
cámara digital.
Sensibilidad
Puede de�inirse la sensibilidad de una cámara fo- 16.4. Fotocélulas
tográ�ica digital como la cualidad controlable por
el dispositivo para poder captar la luz que le lle- Bajo este término pueden de�inirse aquellos dis-
ga. Así, si se quiere realizar una toma fotográ�ica de positivos electrónicos capaces de convertir una
una escena con muy baja iluminación, se tendrá que señal luminosa en otra de naturaleza eléctrica. Su
ajustar en la cámara un valor de sensibilidad alto; funcionamiento se basa en el denominado efecto fo-
por el contrario, si la escena está muy bien ilumi- toeléctrico. En los dispositivos de captura de imagen
nada, no hará falta ajustar un valor alto, sino que para su posterior tratamiento digital, las fotocélu-
con valores bajos será su�iciente. Por las razones ya las son los elementos ordenados matricialmente
comentadas en la sección anterior, el aumento sig- que conforman el sensor de imagen. Existen dife-
ni�icativo de la sensibilidad en una toma conlleva
una notable pérdida de calidad de la imagen proce-
sada debido a la aparición del ruido digital en ella.
Por lo tanto la sensibilidad y el ruido son conceptos
contrapuestos.
Al igual que en las cámaras analógicas, las cá-
maras digitales ajustan la sensibilidad por medio
del valor ISO (normativa de la International Stan-
dard Of�ice) y con unas mismas escalas: 100, 200,
400, etc. En las cámaras digitales un aumento de
la sensibilidad se traduce en una mayor ampli�ica-
ción de las señales eléctricas que genera el sensor
de imagen, por lo que con pocos fotones incidentes
se pueden alcanzar notables valores en la ampli-
Figura 16.32: Comportamiento �ísico de un fotodiodo.
tud de la señal. Esto implica que la elección de un
387
Métodos en biociencias
Figura 16.33: (a) Filtro de Bayer: cada píxel recibe información de 4 fotocélulas. (b) Sensi-
bilidad del ojo humano hacia el color de la luz. Disponible en color.
rentes tipos de fotocélulas, pero para los sensores de que no se pierda en los bordes (zonas muertas).
de imagen se utilizan los denominados fotodiodos. En ningún caso, las microlentes tienen por objeto
Los fotodiodos son elementos electrónicos muy enfocar la imagen capturada pues esa misión ya ha
simples que están formados por una unión semi- sido encomendada y cumplida por las lentes obje-
conductora de tipo P/N (la letra P hace referencia tivo. Las fotocélulas son insensibles al color y, por
a que el semiconductor ha sido dopado o contami- ello, solo pueden cuanti�icar la cantidad de luz (in-
nado con un elemento cuyo efecto es el de reducir tensidad y no tono) que llega a ellas. Para conseguir
el número de electrones libres, o lo que es lo mismo saber la cantidad de fotones que con una determi-
favorecer un mayor número de huecos –ausencia nada frecuencia (color) llega a las fotocélulas, se
de electrones–; por el contrario, la letra N indica instala sobre ellas un �iltro de color (rojo, azul o ver-
que el material dopado dispone de mayor número de). Existen muchos tipos de �iltros pero uno muy
de electrones libres), en la que como material se- utilizado es el denominado �iltro o matriz de Bayer
miconductor de tipo P se suele utilizar silicio (Si) (Figura 16.33a), en el que para cada píxel se utilizan
dopado con boro (B), y para el tipo N se utiliza el cuatro fotodiodos sobre los que se han situado dos
fósforo (P) como dopante. Sobre las capas de semi- �iltros verdes, pues la luz verde es la que mejor per-
conductor se disponen sendos contactos metálicos cibe el ojo humano y, por tanto, la que mayor detalle
con el �in de poder utilizar la carga eléctrica que se de las escenas ofrece, uno rojo y otro azul, en una
genera en el dispositivo. La �igura 16.31 muestra la disposición tal que no haya ningún rojo y azul jun-
disposición de sus elementos constitutivos. tos (distribución homogénea) (Figura 16.33b).
Cuando la radiación luminosa incide sobre el Como se explicó anteriormente, cuando la luz
fotodiodo, una determinada cantidad de fotones llega al material fotosensible (zona de la unión P-N)
generan en la zona de transición de la unión semi- su energía se trans�iere a los electrones y en las ca-
conductora cierto número de pares electrón-hueco, pas del fotodiodo se genera un potencial eléctrico,
que, debido al campo eléctrico existente en dicha por desplazamiento de carga, proporcional al haz
de fotones incidentes (intensidad luminosa). Se-
zona, no se recombinan de nuevo (en las zonas P y N
gún transcurre el tiempo de exposición, cada una
sí lo hacen) sino que se separan generando un gra-
de las fotocélulas se va cargando eléctricamente en
diente de carga en ella y, por lo tanto, un potencial
función de la luz que reciben, variando dicha carga
entre los contactos de la fotocélula. Este potencial
desde un valor cero hasta el de saturación (máxima
es proporcional a la cantidad de luz incidente sobre
carga). Una vez transcurrido el tiempo de exposi-
el fotodiodo (Figura 16.32) y será el que se utiliza a ción, el sensor de imagen tiene almacenada en cada
la hora de cuanti�icar la luz que reciben todas las fo- una de sus fotocélulas toda la información de la
tocélulas del sensor de imagen. luz de la escena tomada mediante valores de car-
En el sensor, la luz proveniente de una determi- ga eléctrica estática. Para poder leer estos valores y
nada escena y que ha atravesado las lentes objetivo convertirlos en datos, de modo que a cada píxel de
de la cámara será concentrada en cada una de las la imagen se le pueda asignar un color, es necesaria
fotocélulas que lo componen, para lo que se utilizan una captura ordenada de los mismos según están
millones de microlentes, cada una dispuesta sobre dispuestos en la matriz del sensor. Para esta misión
cada fotocélula, y cuya misión es la de dirigir la luz existen dos tecnologías diferentes: CCD (dispositi-
hacia el centro de las fotocélulas con el propósito vo de carga doble, charged coupled device) y CMOS
388
La imagen digital
Figura 16.34: Sensor con tecnología CCD y sensor con tecnología CMOS.
389
Métodos en biociencias
390
La imagen digital
391
Índicede
Índice de términos
términos
A* Autótrofos 124
Auxina 117, 122, 123
Avidina 150
Aberración cromática 182 Azul de tripano, azul tripán 166, 202
Aberración esférica 182
Aberraciones, microscopía electrónica 209
Absorción (luz) 177
ABTS 146
B
Acetato de uranilo 217
Bacteriorodopsina 354
Acetilcolinesterasa 271
Bálsamo de Canadá 202
Ácido fosfotúngstico 222
Baño de órganos 295, 296, 302, 305, 306
Acidófilos 132
Basófilos 132
Acoplante, microscopio acústico de barrido 237
BCIG (bromocloro indolil galacto piranósido) 146
Actividad de agua 132
Beta-galactosidasa 146
Acuorina 316, 317, 319
Bioelectricidad 286
Adquisición, citometría de flujo 166, 167
Bioluminiscencia 146
Aerobios estrictos 132
Biorreactores 133, 145, 150
— facultativos 132
Biotina 306, 307
— microaerófilos 132
Birrefringencia 185
Agar 126
Bitmaps 365
Agrobacterium 344, 345, 346, 347
Bluescript 332, 333
Alcalófilos 132
BMP, formato 371
Alcohol deshidrogenasa 267
Bola de agarosa 156
Aldolasas 255
BOLD 314
Alexa Fluor 146
Bomba de secado 218
Álgebra de Boole, imagen digital 377
Bombas de vacío 210
Alineamiento, citometría de flujo 168
Bombillas 180
Aminoetilcarbazol (AEC) 146
Aminooxidasas 255
Amplificación (de señales eléctricas) 288-290, 292,
295, 297, 300 C
Anaerobios aerotolerantes 132
— estrictos 132 Cabinas de flujo laminar 103
Análisis cuantitativo 139 Callo 117, 119. 120
— de difracción 207 Calva de lisis (ver placa de lisis)
— de partícula única (single-particle cryo-EM) Cámara oscura 380
223 Cámara tipo bridge 382
— semicuantitativo 139 Cámara tipo evil 382
Androgénesis 123 Cámara tipo réflex 382
ANINEs 324 Cámaras CCD, CMOS y CID 372, 381, 388
Antígeno (stripping) 159 Cámaras compactas 381
Antígenos multi- y polivalentes 140 Cámaras de contaje (Neubauer o Fuchs-Rosenthal)
Apertura numérica 183 113
Aposición (impronta) 198 Cámaras estenopeicas 189
Araldita 216 Cameleon 318
Atacado, microscopía electrónica 224 Campo cercano-campo lejano 235
Autoclave 104 Campo claro, microscopía electrónica 207
Autótrofos 124
* En general, con el fin de evitar reiteraciones, los términos que aparecen en los epígrafes del índice no han sido incluidos en este glosario.
Métodos en biociencias
396
Índice de términos
Descomplementación 106
Desenmascaramiento de antígenos 155
E
Desfase (luz) 177
Deshidrogenasas 255 EDS (energy dispersive spectroscopy) 212
Desintegración 275 EDX (energy dispersive X-ray) 212
Desmoenzimas 255 Efecto «moiré» 191
Desolvatación 61 — fotoeléctrico 387
Desorción con láser 61 — citopático 136, 137
Desoxirribonucleasas 82 Electrocromismo 323
Despegado de células 108 Electrodo 287, 288, 290-300, 302, 305-307
Desplazamiento de Stokes 188 Electroespray 60
Detección multiparamétrica 165 Electroforesis 47, 83, 86, 87, 90, 92, 93, 94
Detector anular de campo oscuro 213 — bidimensional diferencial 69
— de electrones retrodispersados 212 — bidimensional 52
— de radiación 276 — capilar 53
— de rayos X 212 — de múltiples zonas 50
— Everhart-Thornley (ETD) 212 — en gel 49
— GDD 214 — en papel 48
Detergentes 29 — zonal 48
Determinantes antigénicos 140 Electroinmunotransferencia 158
Dextrano 318, 320 Electrones Auger 206
Diafragma, cámara fotográfica 378 — retrodispersados 206
Diaminobenzidina (DAB) 146 — secundarios 206
Diauxia 134 — transmitidos 206
Difractograma 207 Electroporación 331, 333, 348
Digestión enzimática 45 Electropulido 224
Digitalización 389 Elemento focalizador, (SAM) 237
Digoxigenina 145 Elemento hijo 284
Dilatación, imagen digital 376 — padre 284
Dilución seriada 131 ELISPOT 159
Dinitrofenol 145 Embriogénesis somática 119, 120
Disco de Airy 183 Emisión de campo 209
Disolventes orgánicos 29 — por aniquilación 310
Dispersión (luz) 177 — termoiónica 209
— angular 169 Enclaustrado 197
— delantera 169 Enfoque 380
— elástica 206 Enlace peptídico 41, 65
— inelástica 206 Enzima de restricción 329, 330, 332
— mecánica y enzimática 166 — de Schardinger 264
Distancia de trabajo 178 Enzyme Comission 254
Distribución unimodal 167 Epilepsia 291
DNA integrity number 83 Epimerasas 255
— microsatélite 93, 94 Epítopos 140
— minisatélite 93 Erosión, imagen digital 376
— satélite 93 Error de OFFSET 391
DNAsas 82 Escalado del nivel de gris 372
Doble haploide 112, 123 Escáner 372
Dot blot 159 Esferas magnéticas 158
Dot-plot 170 — paramagnéticas 158
Dots per inch 368 Espectrometría de dispersión de longitud de onda
Duplicación de biomasa 129 213
— de células 129 — de masas 59
397
Métodos en biociencias
398
Índice de términos
399
Métodos en biociencias
400
Índice de términos
401
Métodos en biociencias
402
Índice de términos
Transaminasas 255
Transcetolasas 255
V
Transcriptasa inversa 330, 335
Variación somaclonal 115
Transductor (SAM) 237 VChR1 (Volvox canalrodpsina 1) 357, 359, 362
Transductor molecular 322 Velocidad de dilución 135
Transferasas 255 Ventana, citometría de flujo 168, 170, 171
Transferencia de energía de resonancia de Förster Vibratomo 199
162, 318, 324, 325 Vida media 275
Trazador 273 Vida media biológica 275
TRICTC 146 Visor óptico 380
Tripsina 45 Voltage-clamp 300
Tubo de rayos catódicos 212 Vóxel 190
— fotomultiplicador 278 VSFP 324, 325
— óptico 179
Turbidostatos 135
W
U Western blot 158
403