Universidad de Córdoba QUÍMICA

COMPUTACIONAL

Archivos de
Entrada Gauss
Facultad de Ciencias Básicas View
Programa de Química

M.Sc. Walter J. Cuadro Bautista

Entradas Gauss View
 Entradas Gauss View

Parámetros de Molécula

Coordenadas Coordenadas Internas Coordenadas Internas

Cartesianas (Matriz Z) (Matriz Z - Compacta)
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Coordenadas Internas
Compacta
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Matriz Z: Coordenadas Internas Compacta

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Coordenadas Internas
Compacta
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Ejemplo 1: Matriz Z - Coordenadas Cartesianas

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Ejemplo 2: Matriz Z - Coordenadas Internas

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Ejemplo 3: Matriz Z - Coordenadas Internas Compacta

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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

1. Diseñar la molécula en el área

de trabajo de Gauss View.
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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

2. Ir al menú Calculate
3. Clic en Gaussian Calculation Setup….
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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

4. Se despliega este cuadro interactivo

5. Área donde se visualiza la configuración del archivo de entrada

6. Menú Tipo de Trabajo

7. Se escoge el tipo de cálculo

SP: Single point – Sólo Energía
OPT: Optimización
FREQ: Frecuencia
OPT + FREQ: Optimización + Frecuencia
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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

8. Menú Método: Escogencia del Modelo Químico

9. Se escoge el Método
MM: Mecánica Molecular
SE: Semi-Empírico
Hartree Fock (HF): Ab - Initio
DFT: Teoría de los Funcionales de la Densidad
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15. Visualización del nivel de teoría

11. Escoger
10. Método DFT Funcional

14. Funciones
12. Escoger 13. Funciones Polarizadas (*, **)
Conjunto Base Difusas (+, ++)
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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

18. Visualización del Titulo

16. Menú Titulo

17. Digitar un titulo (Opcional)

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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

19. Menú Link

20. Escoger Specify…. y rellenar 1 GB

21. Escoger Specify…. y rellenar con 1 ó más procesadores

si se tienen.
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Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

24. Se elimina palabras claves

22. Menú General

23. Desmarcar Conectividad

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

25. Clic en Edit.

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

26. Clic en Save.

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas)

27. Direccionar donde se va a

guardar el archivo de entrada

28. Digitar nombre del archivo… el

software asigna automáticamente
la extensión (*.gjf)

30. Clic en Save.

29. Desmarcar para Matriz Z (Coordenadas Internas)

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas)

32. Clic en Cerrar.

31. Clic en Cancel.

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas)

33. Direccionar donde se

guardo el archivo.

34. Clic derecho….. Abrir con….

Bloc de notas..
 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas)

35. Línea de ruta: En el bloc si se

desea se puede modificar esta línea
(adicionar o eliminar keyword). Y
archivo,.. Guardar…

36. Matriz Z (Coordenadas interna).

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

37. Sin haber cerrado Gauss View….

Clic en Calculate…. Gaussian
Calculatíon Setup….
 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

38. Los demás menús

mantienen la configuración
de la primera entrada.
Solo se hace una pequeña
modificación en el menú
General.

39. Desmarcar la Conectividad

40. Clic en Edit..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

41. Clic en Save..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

42. Direccionar donde se guardara

el archivo de entrada..

43. Digitar nombre diferente a la

entrada anterior (amina2).

45. Clic en Save..

44. Marcar para Matriz Z (Coordenadas cartesianas)..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

47. Clic en Cerrar.

46. Clic en Cancel.

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)
48. Direccionar donde se
guardo el archivo.

49. Clic derecho….. Abrir con….

Bloc de notas..
 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Cartesianas)

50. Línea de ruta: En el bloc si se

desea se puede modificar esta línea
(adicionar o eliminar keyword). Y
archivo,.. Guardar…

51. Matriz Z (Coordenadas Cartesianas).

 Entradas Gauss View

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Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

52. Sin haber cerrado Gauss View….

Clic en Calculate…. Gaussian
Calculatíon Setup….
 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

53. Los demás menús

mantienen la configuración
de la primera entrada.
Solo se hace una pequeña
modificación en el menú
General.

54. Desmarcar la Conectividad

55. Clic en Edit..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

56. Clic en Save..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

57. Direccionar donde se guardara

el archivo de entrada..

58. Digitar nombre diferente a la

entrada anterior (amina3).

60. Clic en Save..

59. Desmarcar para Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)..

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

62. Clic en Cerrar.

61. Clic en Cancel.

 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)
63. Direccionar donde se
guardo el archivo.

64. Clic derecho….. Abrir con….

Bloc de notas..
 Entradas Gauss View

Cómo Diseñar un Archivo de Entrada en Gauss View

Matriz Z (Coordenadas Internas Compacta)

65. Línea de ruta: En el bloc si se

desea se puede modificar esta línea
(adicionar o eliminar keyword). Y
archivo,.. Guardar…

66. Matriz Z (Coordenadas

Internas Compacta).
 Entradas Gauss View

Actividad: Diseño de Entradas con Gauss View

OPT
OPT- FREQ

Por cada molécula realizar los

tres (3) archivos de entrada:
Matriz Z:
Coordenadas Internas
Coordenadas Cartesianas
Coordenadas Inter. Compacta
SP: Energy
 Dudas y Comentarios

GRACIAS…