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ANALISIS DE SECUENCIA REPETITIVA

Se ha identificado la secuencia de cientos de genomas humanos donde se cuenta de


herramientas de bioinformática que permiten identificar la secuencia del DNA para
identificar a los efectores recientes para la subtipificación patógena, como son las
secuencias repetitivas que se encontraron en diversas especies los cuales se denominan
numero variable de repeticiones en tándem (VNTR).

Cada locus de VNTR es definido por la unidad que se repite y el número de copias
repetidas lateralmente donde se encontraron en regiones que regulan la expresión génica
dentro de marcos abiertos de lectura.
Existe un método de genotipificación que utiliza PCR, llamado análisis de VNTR en
múltiples loci, que aprovecha los niveles de diversidad generados por las variaciones en el
tamaño de las unidades repetidas y el número de copias en determinados loci
caracterizados. Ha resultado ser especialmente útil para la
subtipificación de ciertas especies monomorfas como Bacillus anthracis, Yersinia pestis y
Francisella tularensis.

RNA ribosómico

El ribosoma tiene la función fundamental en la síntesis de las proteínas para todos los
organismos. Al comparar la secuencia de nucleótidos el RNA ribosómico 16S de un
espectro de fuentes biológicas, se observaron relaciones evolutivas entre organismos muy
divergentes, con lo que se descubrió un reino nuevo, las arqueobacterias. El árbol
filogenético basado en la información del RNA ribosómico (rRNA) muestra la división de
las bacterias, arqueobacterias y familias eucarióticas, los cuales son los tres dominios
principales de vida biológica como se conocen en la actualidad.

DESCRIPCION DE LAS PRINCIPALES CATEGORIAS Y GRUPOS DE BACTERIAS

Categorías principales y grupos de bacterias patógenas en seres humanos como


parte de un esquema de identificación descrito en el Bergey’s Manual of
Determinative Bacteriology, 9th ed.

1. Eubacterias gramnegativos con 2. Bacterias grampositivas con


paredes celulares pared celular
 Espiroquetas  Cocos grampositivos
 Bacterias aerobias/microaerofila, móviles  Bacilos y cocos grampositivos
helicoidales/vibroides gramnegativos
 Bacterias curvas inmóviles formadores de endosporas
 Bacilos y cocos gramnegativos  Bacilos grampositivos regulares no
aerobios/microaeofilos formadores de esporas
 Bacilos gramnegativos anaerobios  Bacilos grampositivos irregulares
facultativos
no formadores de esporas
 Bacilos gramnegativos, anaerobios, rectos,
curvos y helicoidales  Micobacterias
 Bacterias desasimiladoras de sulfato o  Actinomicetos
reductoras de azufre
 Cocos gramnegativos anaerobios
 Rickettsias y clamidias
 Bacterias fotótrofas anoxígenas
 Bacterias fotótrofas oxígenas
 Bacterias aerobias quimiolitótrofas y
microorganismos variados
 Bacterias con apéndice o yemas
 Bacterias envainadas
 Bacterias deslizantes no fotosintéticas y no
formadoras de grupos fructíferos
 Bacterias deslizantes formadoras de
grupos fructíferos: mixobacterias
3. Eubacterias sin pared 4. Arqueobacterias
celular:micoplasma o millicutes
 Micoplasmas  Metanógenos
 Arqueorreductores de sulfato
 Arqueobacterias excesivamente
halófilas
 Arqueobacterias sin pared celular
 Metabolizadores excesivamente
termófilos y metabolizadores de
azufre excesivamente termófilos

Existen dos grupos de organismos procarióticos: eubacterias y arqueobacterias. Ambos


son organismos unicelulares pequeños que se multiplican en forma asexual. Las
eubacterias se refiere a las bacterias carecen de un núcleo verdadero, poseen lípidos
característicos que forman sus membranas, tienen una pared celular de peptidoglucano y
una maquinaria para la síntesis de proteínas y ácidos nucleicos que se puede inhibir en
forma selectiva por medio de antimicrobianos. Mientras que las arqueobacterias no
poseen una pared celular clásica de peptidoglucano y tienen muchas características como
maquinaria para la síntesis de proteínas y multiplicación de ácidos nucleicos que son
similares a las de las células eucariotas.

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