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Dominio
Reino
Filo o
división
Clase
Orden
Familia
Género
Especie
Categorías taxonómicas principales
Eukaryota Eukarya
Archaea
Prokaryota
Bacteria
Índice
6Véase también
7Referencias
dividen en dos imperios (procariotas y eucariotas) con los 5 reinos (bacterias en sentido amplio, con la misma
circunscripción que los procariotas; en los eucariotas Protista, Animalia, Plantae y Fungi) de Whittaker y
Margulis.11
Sistema de supergrupos[editar]
Una de las últimas hipótesis de árbol filogenético de la vida, mostrando los supergrupos de eucariotas (Excavata sensu lato,
Unikonta, a veces dividido en Opisthokonta y Amoebozoa, Chromalveolata, Rhizaria y Archaeplastida o Plantae sensu lato).11
Aspectos históricos[editar]
Varios autores han teorizado una categoría taxonómica superior a la de
los reinos biológicos. Algunos sistemas sobresalientes son los siguientes:
En 1735 Carlos Linneo crea el sistema de clasificación taxonómica y usa el
término "imperio" para referirse a la naturaleza, fuente de su estudio:
el Imperium Naturae dividido en los regnum
Animalia, Vegetabilia y Lapides (mineral).
El concepto procariota tiene su equivalente más antiguo en Ferdinand Cohn,
quien en 1875 reunió a los seres más pequeños: las bacterias y algas azul-
verdosas en un solo grupo, lo llamó Schizophyta y lo colocó dentro del
reino Vegetal.
Chatton introdujo los términos “procaryote” y “eukaryote” en 1925, para
diferenciar los microorganismos nucleados con los anucleados. En 1938
incluye a plantas y animales entre los seres eucariotas. En realidad Chatton
no aludía directamente a una clasificación con niveles taxonómicos
superiores a los reinos; sin embargo sentó las bases de la más conocida y
fundamental dicotomía biológica. El biólogo francés André Lwoff, discípulo de
Chatton y luego el microbiólogo canadiense Roger Stanier, difunden esta
categorización de los seres vivos desde mediados del siglo XX.16
Un avance notorio en el estudio filogenético procariota fue el análisis
ribosomal. En 1977 se descubrió que la mayor diferencia según el ARNr está
entre arqueas y bacterias.17 La comparación entre éstas y los eucariontes
permitió hacer una propuesta en tres reinos primarios: "eubacteria,
archaebacteria y urkaryotes",3 la cual constituye la base del actual sistema
en tres dominios.
Situación de los virus[editar]
Los virus fueron descubiertos técnicamente en 1899 cuando el microbiólogo
neerlandés Beijerinck los definió como un agente infeccioso que solo se
multiplica dentro de células vivas en división, pero como sus experimentos no
mostraban que estuviera compuesto de partículas, lo llamó contagium vivum
fluidum («germen viviente soluble») o «virus». En 1930 el botánico checo F.A.
Novák los define como un grupo de organismos no conformados por células
con el nombre de Aphanobionta y en 1931 se consiguen las primeras
imágenes con la invención de la microscopía electrónica.
En 1957 André Lwoff definió las principales diferencias entre virus y bacterias
basado en la estructura molecular y fisiología: "Los virus deben ser tratados
como virus, porque los virus son los virus."18 No hay entidades biológicas
que puedan calificarse como de transición entre un virus y un organismo
celular, y las diferencias entre ellos eran de una naturaleza tal que es
realmente difícil visualizar cualquier tipo de organismo intermedio. En 1962
Lwoff propone la primera clasificación taxonómica para los virus, la cual va
muy aparte de los organismos celulares.19
La mayoría de biólogos excluye a los virus de los sistemas de clasificación
biológica. De acuerdo con la teoría celular los virus no son seres vivos,
aunque solamente tienen la capacidad de evolucionar como las células.20
Filosóficamente se ha argumentado que los virus junto con los agentes
subvirales son elementos genéticos móviles debido a su comportamiento
replicativo y por ser vectores de genes; por tanto son más comparables a
los plásmidos que a las formas de vida celular. Otro factor importante es que
los virus no cumplían los requisitos necesarios para poder ubicarlos de una
fiable en el árbol de la vida: por ejemplo no tienen ribosomas, a todos les falta
un ácido nucleico, no tienen registro fósil, no existe ni un gen compartido
entre la mayoría de los grupos virales ya que son de nueva síntesis, la
mayoría de sus genes se mezclan con las de sus huéspedes y como último
las partículas virales no tienen un ancestro en común por lo que son un
conjunto polifilético.21 En consecuencia se ha decidido comparar a los virus
con los elementos genéticos móviles o secuencias celulares en análisis
filogenéticos.
Según estudios filogenéticos realizados por el Comité Internacional de
Taxonomía de Virus las entidades virales pueden dividirse en 7 dominios
basado en sus características proteicas o moleculares, Riboviria que incluye
a los virus de ARN y los virus de retrotranscripción, Ribozyviria que incluye
los virusoides, Viroidia que incluye
los viroides, Adnaviria, Duplodnaviria, Varidnaviria y Monodnaviria que
incluyen únicamente virus de ADN, a su vez estos dominios comprenden más
de 10 reinos. Además hay planes para crear más dominios que incluyan virus
de ADN no clasificados y agentes subvirales (virus satélite no clasificados).2
Dado que no se acepta que los virus y agentes subvirales se clasifiquen con
los organismos celulares, el ICTV usa el término "realm" para dominio, que
no tiene una traducción fija al español, ya que querían evitar confusiones con
los dominios de vida celular.
Cuando se incluyen a los virus junto con los organismos celulares por
ejemplo: en análisis proteicos los virus se ramifican en manera
complejamente parafilética con respecto a los tres dominios celulares,
inclusive usando modelos de evolución más realistas como máxima
parsimonia. Los virus nucleocitoplasmáticos de ADN de gran tamaño fueron
los más cercanos a los organismos celulares, seguido de los demás virus de
ADN y los virus de ARN junto con los virus de retrotranscripción, siendo la
familia Mimiviridae el grupo hermano de los organismos celulares.222324
Debido a que las proteínas virales no tienen homólogos con las células y
algunos genes únicos se han conservado en determinados linajes virales, se
ha sugerido que los virus pudieron originarse en protobiontes que se
separaron para dar origen a las células procariotas o de replicadores
del mundo de ARN. Varios virus que infectan arqueas y bacterias ya habrían
infectado al último antepasado común universal y los protobiontes.25 Una
hipótesis reciente propone que los virus, agentes subvirales, elementos
genéticos móviles, enzimas, secuencias celulares, etc fueron los replicones
del mundo de ARN y ancestros de las células.2627 Los virus pudieron servir
para mediar la transferencia horizontal de genes entre las comunidades
autorreplicantivas.28
Los diversos sistemas históricos basados en dominios (incluyendo los virus)
pueden resumirse en la siguiente tabla:
Linneo Chatton Novák Allsop Jeffrey Woese BioLib Ruggiero
173529 192530 193031 196932 197133 19901 200834 201535
1 imperio 2 grupos 3 grupos 2 superreinos 3 superreinos 3 dominios 5 dominios 2 superreinos
Naturae Eukaryote Karyonta Eucaryotae Eucytota Eukarya Eukaryota Eukaryota
Bacteria Bacteria
Procaryote Akaryonta Procaryote Procytota Prokaryota
Archaea Archaea
Nucleacuea
Aphanobionta Acytota
Aminoacuea