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DOMINIOS

En Biologa, dominio es cada una de las tres subdivisiones principales en que se clasifican los seres vivos: Archaea, Bacteria y Eukarya. Los dos primeros dominios incluyen a los organismos procariotas (clulas sin ncleo) mientras que el dominio Eukarya engloba a los organismos eucariotas (clulas con ncleo). Hasta principios de la dcada de 1990, el mayor nivel taxonmico era el de reino y los seres vivos se clasificaban en cinco reinos denominados Mneras, Protoctistas, Hongos, Plantas y Animales. Sin embargo, en 1991, el microbilogo estadounidense Carl Woese cre una nueva categora taxonmica, por encima de la de reino, denominada dominio, al poner de manifiesto que el grupo de organismos conocidos como arquebacterias, que hasta entonces se haban clasificado junto con las bacterias, tenan caractersticas fisiolgicas y genticas nicas. Los lpidos de las membranas de las arquebacterias difieren de los que poseen las clulas eucariotas y las eubacterias y la composicin de sus paredes celulares es distinta a la de las bacterias, porque carecen de peptidoglucano. Adems, la secuenciacin del genoma de una arquebacteria puso de manifiesto las enormes diferencias que existen entre ellas y las bacterias y entre ellas y los organismos eucariontes. Por esa razn, Woese propuso la clasificacin de estos microorganismos en un grupo o dominio de seres vivos llamado Archaea, distinto de los dominios Bacteria (tambin agrupa organismos procariontes) y Eukarya (organismos eucariontes). Los estudios genticos han puesto de manifiesto que los tres dominios tuvieron un ancestro procarionte comn y se cree que los representantes actuales del dominio Archaea comparten un ancestro comn ms reciente con los eucariontes que con las bacterias. Relacin entre los dominios

Archaea Pared Membrana Genoma pseudopeptidoglicano, o solo por protenas Lpidos: las cadenas hidrocarbonadas ramificadas estn unidas al glicerol por enlaces ter ADN nico, circular, presencia de plsmidos

Bacteria

Eukarya plantas (celulosa), animales peptidoglicanos (ninguna), fungi (quitina) lpidos: las cadenas de ac. grasos estn unidas al glicerol por enlaces ester ADN fragmentado en cromosomas mltiples

DOMINIO ARCHAEA
Archaea es uno de los tres Dominios propuestos por Woese & Fox en 1990. Segn esto, la vida en la tierra se categorizara en tres Dominios: Bacteria (Eubacteria), Archaea (Archaea), y Eukarya (Eukariota). Este sistema se basa en estudios de rRNA y reconoce las caractersticas nicas/diferentes de cada grupo. A pesar de que muchos representantes de este grupo eran conocidos desde hace bastante tiempo siempre se haba pensado que eran bacterias y como tales se haban clasificado. Vistos al microscopio no muestran demasiadas diferencias con las bacterias "clsicas", y considerando adems la extrema dificultad que representa cultivarlos en Laboratorio, es fcil entender porqu se ha tardado tanto en reconocer sus especiales caractersticas y aceptar que representan un grupo de microorganismos totalmente independiente al de las Bacterias. Dominio Archaea es pues un concepto relativamente moderno ya que se reconoci hace muy poco como un grupo importante e independiente de seres vivos, y, como ya hemos dicho, ello se debi sobre todo a los trabajos del citado Dr. Carl Woese y sus colegas de la Universidad de Illinois. A pesar de esto, Archaea no son simplemente un grupo de Eubacterias que se adapt a vivir en condiciones extremas. Las caractersticas que comparten con los Eucariotas son mucho ms significativas que las que comparten con las Bacterias. Archaeas y Eucariotas son grupos mucho ms cercanos de lo que pueda parecer, y divergen profundamente de las Bacterias. No obstante, los Archaea tambin comparten con las Bacterias ciertas caractersticas que no estn presentes en los Eucariotas. Los investigadores tambin han encontrado un nmero significativo de diferencias en las secuencias 16ssu rRNA de los tres grupos de organismos. Segn las ltimas investigaciones, Archaea son posiblemente los organismos ms antiguos en la Tierra y apareceran, casi con toda seguridad, hace unos 4 mil millones de aos, en el momento del origen de la vida en nuestro planeta. Pensemos que, desde esta perspectiva, Archaea evolucionaron bajo las condiciones de la Tierra primitiva (temperaturas altas, atmsfera anaerbica, salinidad alta) y stos siguen siendo, aun hoy, sus hbitats predilectos. Caractersticas generales de Archaea Fenotpicamente, Archaea son muy parecidos a las Bacterias. La mayora son pequeos (0.5-5 micras) y con formas de bastones, cocos y espirilos. Archaea generalmente se reproducen por fisin, como la mayora de las Bacterias. Los genomas de Archaea son de un tamao sobre 2-4 Mbp, similar a la mayora de las Bacterias. Sin embargo, la mayor parte de Archaea son termfilos (de hecho, muchos son sumamente termfilos). La mayora tambin son autotrficos o dependientes de azufre. Como los Eucariotas, Archaea tienen abundantes protenas similares a la histona y el ADN se empaqueta en forma de nucleosomas. La organizacin global de la membrana celular es similar a la encontrada en Bacterias y Eucariotas. Archaea puede alterar el espesor de su membrana incluyendo o quitando anillos pentacclicos en la estructura. Contienen cantidades grandes de lpidos no polares. Igual que los eucariotas, las paredes celulares de Archaea no contienen cido murmico y D-aminocidos (los "ladrillos" de peptidoglicano); algunas especies en particular pueden contener pseudopeptidoglicano (pseudomureina), polisacrido, glicoprotena o protena en sus paredes celulares, mientras las paredes celulares de eucariotas se basan en celulosa o quitina. As mismo, las membranas plasmticas de Archaea estn hechas de lpidos ramificados que se une al glicerol por medio de enlaces de ter. Los lpidos enlazados por ter son comnes a todos los Archaea. Glicerol diter y diglicerol tetrater son los tipos ms importantes de lpidos presentes en la membrana clula (Estos lpidos pueden usarse como firmas qumicas para detectar la presencia de Archaea en una muestra). Esto es muy diferente en eucariotas y en otros procariotas en los que los cidos grasos de las cadena se unen al glycerol por enlaces ster. Se

supone que esta singularidad de la membrana plasmtica les ayuda a adaptarse a los ambientes extremos en los que les gusta vivir, incluyendo aqullos que aparecen a altas temperaturas, y elevada salinidad. A pesar de todo eso, las Archaeobacterias puede diferenciarse a menudo en trminos de tincin Gram (ya que esta tincin es una medida de aspectos fsicos de paredes de la clula que son compartidos por eubacteria y archaeobacteria). Hay Archaeas sin pared celular que viven a altas temperaturas (55-59C) Archaeas y Eubacterias carecen de ncleo verdadero y tienen genomas redondos y pequeos. La maquinaria de transcripcin de Archaea es generalmente como en Bacteria y Eukaria, con 70S ribosomas. Los genes se colocan en racimos co-transcritos llamados operones (los genes de Eukaryas se transcriben generalmente de forma separada en lugar de en racimos). Tambin como en las Bacterias, se unen transcripcin y translacin (es decir, ocurren simultneamente), y el fracaso de un mRNA al ser traducido causa que la ARN polimerasa aborte la transcripcin. Sin embargo, en muchos sentidos la traduccin en Archaea es como en Eukaria. La traduccin se comienza con metionina y es inhibida por la toxina de la difteria, como en los ribosomas de los eukarya, pero no es afectado por la mayora de antibiticos inhibidores de la traduccin bacteriana (Estreptomicina y Cloramfenicol). La ARN polimerasa es una enzima crucial requerida para la sntesis de nuevas molculas de ARN. Las Eubacterias tienen un solo tipo de ARN polimerasa para la transcripcin de todos los genes de la clula y utilizan Formilmetionina como iniciador para la sntesis de protena. Archaea, como las Bacterias, tienen una sola ARN polimerasa que transcribe todos los genes. Sin embargo, las ARN polimerasas de Archaea son como los de los eucariotas (contienen 3 o 4 subunidades grandes y muchas pequeos). Las ARN polimerasas de Archaea son similares en sucesin y antigenicidad a la ARN polimerasa II de eukaria. Slo algunos genes de Archaea contienen intrones en su DNA, en contraste con la falta completa de intrones en Eubacteria, y la presencia de intrones en todos los genes de los eucariotas. De muchas maneras, podemos pensar en Archaea como un "enlace perdido" entre bacterias y eukarias. El Dominio Archaea se subdivide en tres reinos: Crenarchaeota, Euryarchaeota y Korarchaeota. Como esta subdivisin an no es definitiva ya que estamos en plena comprensin de la filogenia procariota, en estos Hipertextos las consideraremos a todas dentro del reino Arqueobacterias. Las 200 especies de este reinos son bioqumicamente diferentes de las restantes bacterias. Una de las caractersticas ms llamativas es la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares. Incluyen tres grupos: Halfilas: viven en ambientes extremadamente salinos. Metanognicas: son anaerbias obligadas que producen metano a partir del dixido de carbono e hidrgeno. Son comunes en el tracto digestivo de animales y pueden vivir en ambientes pantanosos. Termoacidfilas: crecen en ambientes cidos, clidos, como las fuentes sulfurosas del Parque Yellowstone, con temperaturas de mas de 60 C y pH 1 a 2. Curiosamente, las arqueobacterias estn ms cercanas genticamente a los eucariontes que a las eubacterias, dado que hasta comparten ciertos genes. Se encuentran hoy restringidas a hbitats marginales como manantiales calientes, lagos de alta salinidad o reas de baja concentracin de oxgeno. Desde nuestro punto de vista son organismos extremfilos por los ambientes que habitan y que hoy asemejan a las condiciones primitivas de la Tierra (eran extremfilos en ese entonces...?)

El grupo ms antiguo, las arqueobacterias, constituyen un fascinante conjunto de organismos y por sus especiales caractersticas se considera que conforman un Dominio separado: Archaea. Fenotpicamente, Archaea son muy parecidos a las Bacterias. La mayora son pequeos (0.5-5 micras) y con formas de bastones, cocos y espirilos. Las Archaea generalmente se reproducen por fisin, como la mayora de las Bacterias. Los genomas de Archaea son de un tamao sobre 2-4 Mbp, similar a la mayora de las Bacterias. Si bien lucen como bacterias poseen caractersticas bioqumicas y genticas que las alejan de ellas. Por ejemplo: No poseen paredes celulares con peptidoglicanos Presentan secuencias nicas en la unidad pequea del ARNr Poseen lpidos de membrana diferentes tanto de las bacterias como de los eucariotas (incluyendo enlaces ter en lugar de enlaces ster).

Hoy se encuentran restringidas (bueno lo de restringidas, si se lee mas adelante, ya no parece un termino aplicable) a hbitats marginales como fuentes termales, depsitos profundos de petrleo caliente, fumarolas marinas, lagos salinosos (incluso en el mar Muerto...). Por habitar ambientes "extremos", se las conocen tambin con el nombre de extremfilas. Se considera que las condiciones de crecimiento semejan a las existentes en los primeros tiempos de la historia de la Tierra por ello a estos organismos se los denomin arqueobacterias (del griego arkhaios = antiguo). Membranas de las Archeae Los lpidos presentes en las membranas son nicos desde el punto de vista qumico, a diferencia de los eucariotas y las bacterias, en que los enlaces ster son los responsables de la unin entre los c. grasos y glicerol, los lpidos de las Archaea poseen enlaces TER para la unin del glicerol con cadenas laterales hidrofbicas. En lugar de ac. grasos poseen cadenas laterales formadas por unidades repetitivas de una molcula hidrocarbonada como el isopreno. Los principales tipos de lpidos son los diteres de glicerol. En algunos teres las cadenas laterales (fentanil) se unen entre s por enlaces covalentes formando una monocapa en lugar de la bicapa caracterstica de las membranas, siendo ms estables y resistentes, siendo habituales por lo tanto en las hipertemfilas. Paredes celulares Algunas arqueobacterias metanognicas poseen la pared celular formada por un compuesto similar al peptidoglicano de las bacterias, por lo que denomina pseudopeptidoglicano, con enlaces glucosdicos 1,3 en lugar de los 1,4 de los peptidoglicano. En otras archaeas la pared se compone de polisacaridos, glicoprotenas o protenas. El tipo de pared ms comn es la capa superficial paracristalina (capa S) formada por protena o glucoprotena, de simetra hexagonal. La pared celular impide la lisis celular y le confiere la forma a la clula. Las paredes de las Archaea son resistentes naturalmente a la lisozima, debido a la ausencia de peptidoglicano. La nica arqueobacteria que carece de pared es Thermoplasma.

rbol Filogentico de Archaea Sobre la base del anlisis de la subunidad pequea del ARN, las Archaea consisten en dos grupos filogenticamente diferentes: Crenarchaeota y Euryarchaeota. Se diferencias por el tipo particular de ARN que presentan y por el ambiente en que habitan. Las Crenarchaeota (crenotas) es un grupo fisiolgicamente homogneo de hbitats enteramente termoflicos. en cambio las Euryarchaeota (euryotas) son un grupo fenotpicamente heterogneo, que incluye a las metanognicas, halfilas, etc.

Basados en su fisiologa se distinguen: metanognicas procariotas que producen metano halofilas extremas viven en regiones con muy alta concentracin de sal (NaCl); requieren una concentracin de al menos 10% de cloruro de sodio para su crecimiento extremas (hiper) termfilas viven a temperaturas muy altas.

Adems de las caractersticas unificadoras de las arqueobacterias, (pared celular sin murena, lpidos de membranas con enlaces ter, etc.), estos procariotas exhiben atributos bioqumicos que le permiten adaptarse a estos ambientes extremos. Las Crenarchaeota son principalmente hipertermoflicos dependientes del sulfuro y los Euryarchaeota son metanognicos y halfilos extremos.

Metanognicas Son anaerobias obligadas que no toleran ni siquiera breves exposiciones al aire (O2). En ambientes anaerbicos son muy abundantes, incluyen sedimentos marinos y de agua dulce, pantanos y suelos profundos, tracto intestinal de animales y plantas de tratamiento de lquidos cloacales. Las metanognicas tiene un tipo increble de metabolismo que puede usar el H2 como fuente de energa y el CO2 como fuente de carbono para su crecimiento. En el proceso de construccin de material celular desde H2 y CO2, Las metanognicas producen metano (CH4) en un nico proceso generador de energa. El producto final, gas metano, se acumula en el ambiente, as se han creado la mayora de las fuentes naturales de gas natural (combustible fsil) utilizado con fines industriales o domsticos. Los procariotas Metanognicos son habitantes normales del rumen de vacas y rumiantes. Una vaca puede eliminar unos 50 litros de gas metano por da, en el proceso de eructacin. El metano es un importante gas del efecto invernadero que se acumula en la atmsfera a velocidad alarmante. Cuando se destruyen reas verdes y se reemplazan por ganado se produce un doble impacto en el efecto invernadero ( "double-hit"): 1. 2. menores cantidades de CO2 sern eliminadas debido a la remocin de las plantas CO2 y CH4 adicionales sern liberados por el metabolismo combinado del ganado y los procariotas metanognicos.

Por otra parte gran cantidad de gas metano es producido durante el tratamiento de los lquidos cloacales, sin embargo normalmente es descartado en lugar de ser reciclado. Methanococcus jannischii fue originalmente aislada de una muestra tomada de una chimenea ( white smoker: fumarola blanca) a 2.600 metros de profundidad en el Pacfico Este. Puede crecer en un medio de cultivo mineral que contenga solo H2 y CO2 como fuente carbonada y en un rango de temperatura entre 50 86 grados. Estas clulas son cocos irregulares mviles, debido a la presencia de dos haces de flagelos polares insertos cerca del mismo polo . Halfilas extremas Viven en ambientes naturales como el mar Muerto, el Great Salt Lake (Colorado USA), o en estanques de evaporacin de agua salada, donde la concentracin de sal es muy alta (hasta 5 molar o 25 por ciento de NaCl). Estos procariotas requieren la sal para el crecimiento, sus paredes celulares, ribosomas y enzimas se estabilizan con el in Na+. Halobacterium halobium, la especie predominante en Great Salt Lake, se adapta al ambiente altamente salino por el desarrollo de una "membrana prpura", que toma esta coloracin por la presencia del pigmento del tipo de rodopsina llamado bacteriorodopsina que reacciona con la luz formando un gradiente de protones a lo largo de la membrana que permite la sntesis de ATP. Este es el nico ejemplo en la naturaleza de una fotofosforilacin sin clorofila. Estos organismos son hetertrofos y aerobios, la alta concentracin de ClNa en el ambiente limita la disponibilidad de O2 para la respiracin, por lo que usando bacteriorhodopsina aumentan su capacidad de producir a ATP, convirtindolo a partir de la energa lumnica.

Halobacterium salinarium es una halofila extrema que crece a 4 - 5 M NaCl y no crece por debajo de 3 M NaCl. La preparacin por criofractura muestra la estructura de la superficie de la membrana celular y revela pequeos parches de "membrana prpura" que contienen el pigmento bacteriorrodopsina embebidas en la membrana plasmtica, este pigmento expulsa un protn de la clula, creando as un gradiente de protones que puede ser usado para generar ATP.

Termfilas extremas (Termoacidfilas) Representan varias lneas filogenticas de Archaea. Estos organismos requieren temperaturas muy altas (80 105 grados) para crecer. Sus membranas y enzimas son inusualmente estables a estas temperaturas. La mayora de ellas requiere sulfuro para crecer, algunas son anaerobias y usan el sulfuro como aceptor de electrones en la respiracin, en reemplazo del oxgeno. Otras son litotrficas y oxidan sulfuro como fuente de energa, crecen a bajo pH (< pH 2) dado que acidifican su ambiente oxidando Su (sulfuro) a SO4 (c. sulfrico). Estos hipertermfilos son habitantes de ambientes calientes, ricos en sulfuro asociados a los volcanes, como los manantiales clientes, giseres y las fumaroles del Parque National de Yellowstone , en respiraderos termales ("smokers") y en fracturas del piso ocenico. Sulfolobus fue el primer Archeae hipertermoflicos descubierto por Thomas D. Brock de la Universidad de Wisconsin en 1970. Su descubrimiento, junto al de Thermus aquaticus en el Parque Yellowstone, iniciaron el campo de la biologa de los hipertermfilos. Thermus aquaticus, (fuente de la enzima taq polimerasa usada en la reaccin en cadena de la polimerasa , PCR), crece a 70 grados. Sulfolobus crece en ambientes rico en sulfuro, manantiales calientes, 90 grados y pH 1. Thermoplasma, tambin descubierta por Brock, es un termfilo nico, ya que es el representante exclusivo de una lnea filogentica de Archaea. Thermoplasma recuerda a las bacterias micoplasmas ya que carece de pared celular. Thermoplasma crece a 55 grados y pH 2; solo han sido encontradas en pilas calientes de carbn, los cuales son productos de desecho humanos.

Sulfolobus acidocaldarius (T.D. Brock) izq: MET X85,000, der: microfotografa por fluorescencia de clulas adheridas a cristales de sulfuro

Parque National de Yellowstone

Sulfolobus es un termfilo extremo que se encuentra en manantiales cidos productos de calentamiento por volcanes, y suelos con temperaturas entre 60 - 95 gradosC, y pH 1 a 5.

Yellowstone National Park, USA, izq: Octopus Spring, der: Obsidian Pool. A pesar que las Archaea son extremfilos por excelencia, tambin pueden encontrarse Bacterias, e inclusive algunos eucariotas en estos hbitat. Ninguna bacteria produce metano, pero existen algunas que creen en estos ambientes. Con respecto a la tolerancia cida, una bacteria: Thiobacillus, puede crecer a pH 0. Un alga, Cyanidium, tambin puede crecer a pH 0. En ambiente superclidos ( > de 100 C), los Archaea son exclusivos. Ninguna bacteria puede crecer en altas concentracin de sales.

DOMINIO BACTERIA
Reino Monera Es el reino ms primitivo, agrupa a organismos procariotas que carecen de un ncleo rodeado por membranas y de organelas. Incluye a todas las bacterias (tcnicamente las eubacterias) y las cianobacterias (llamadas anteriormente algas verdeazuladas) que son las formas ms abundantes de este reino. Las bacterias son unicelulares, de vida libre, y presentan diversidad de formas: Cocos, con forma de esferas Bacilos, como bastoness con extremos redondeados, como Escherischia coli Espirilos: clulas helicoidales Vibriones; con forma de coma,ej: Vibrio cholerae, causante del clera

Las bacterias (del griego bakterion = bastn) son organismos unicelulares que se reproducen por fisin binaria. Su tamao es del orden de los micrones e implica una relacin superficie volumen muy alta: aproximadamente 100.000. Las Bacterias se encuentran prcticamente en todos lo ambientes de la Tierra, desde las profundas fosas ocenicas o el interior de rocas slidas hasta las camisas refrigerantes de los reactores nucleares, ni que decir del resto de los hbitats. La mayora de ellas son capaces de una existencia independiente pero existen especies como Chlamydia y Rickettsia que son organismos intracelulares obligados. Se encontraron estructuras semejantes a las bacterias en un meteorito marciano con una antigedad de 3.000 millones de aos (el llamado ALH84001, encontrado en la Antrtida). De confirmarse la naturaleza de estas investigaciones, y si la descripcin de lo encontrado correspondiera realmente a restos fsiles, sera de presumir la existencia simultnea de vida bacteriana en Marte y la Tierra (en ese entonces?). Hasta el momento, la naturaleza celular de estas estructura no ha sido establecida. Para una ampliacin de este tema que se relaciona con el origen de la vida en la Tierra consultar este enlace. El Reino taxonmico Monera comprende, entre otras, a las eubacterias (las bacterias "verdaderas" y las cianobacterias, o bacterias fotosintetizadoras). Los organismos de este grupo no poseen organelas rodeadas por membranas (como las formas superiores de vida) y se conocen como procariotas. Procesos bioqumicos que en eucariotas ocurren normalmente en los cloroplastos o mitocondrias, tienen lugar en la membrana citoplasmtica. El cromosoma bacteriano esta constituido por ADN circular que se ubica en la regin denominada nucleoide Distribuidos en el citoplasma bacteriano se encuentran pequeos lazos de ADN conocidos como plsmidos. Los genes bacterianos se encuentran organizados en un sistema conocido como opern. Su pequeo tamao, velocidad de reproduccin (Escherichia coli se reproduce por fisin binaria cada 15 o 20 minutos), y la "ocupacin" de diversos hbitats y modos de existencia hacen de Moneras el Reino ms abundante y diversificado sobre la Tierra.

Una manera de clasificar las bacterias es subdividirlas de acuerdo a la forma en que adquieren su energa en: Son auttrofas, y obtienen energa de la oxidacin de compuestos inorgnicos como el amonio, los nitritos (a nitratos) o los sulfuros (a sulfatos). Convierten la energa lumnica en energa almacenada en carbohidratos. El grupo mas importante es el de las cianobacterias. Probablemente las primitivas cianobacterias formaron el oxgeno que se liber en la primitiva atmsfera terrestre. Poseen clorofila a y tambin el pigmento azul ficocianina y el rojo ficoeritrina. Los miembros de este grupo obtienen su energa de materia orgnica elaborada por otros organismos. Podemos sealar dos grandes grupos: las saprofitas y las simbiticas. Las saprofitas se alimentan de materia muerta o en descomposicin siendo por lo tanto importantes recicladores de nutrientes. Muchas de las que entablan relaciones simbiticas lo hacen en forma mutualstica y colaboran con su husped, ejemplo de ellos son las bacterias que en la vaca y otros rumiantes convierten la celulosa en glucosa asimilable por el animal. Otras entablan una relacin parasitaria y se constituyen en patgenas para su husped produciendo enfermedades tales como la fiebre reumtica, clera, gonorrea, sfilis. La patogenicidad puede derivar de causas tales como destruccin celular, liberacin de toxinas o la misma reaccin del cuerpo a la bacteria infectante. Las infecciones bacterianas pueden ser controladas, entre otros, por tratamiento con antibiticos. Los antibiticos son productos que interfieren en algn punto del procesos de divisin de las bacterias, son producidos por microorganismos tales como los hongos, que compiten con las bacterias por los recursos disponibles. Sin embargo el extendido uso de los mismos impuso una presin evolutiva de una intensidad antes inexistente que llevo, por el proceso de seleccin natural, a la expansin de cepas resistentes a los antibiticos. Esto en muchos casos lleva a frecuentes cambios de tratamiento de las enfermedades y a la necesidad de nuevos desarrollo de antibiticos.

Quimiosintetizadoras Fotosintetizadoras

Heterotrfas

Descubriendo nuevos microbios En esencia el mtodo consiste en la extraccin de ADN de una muestra del medio ambiente, separar sus filamentos y mezclarlos con un "cebador" (una secuencia corta de ADN que se combinar con una secuencia complementaria del ADN de la muestra). Luego utilizando la el ADN de la muestra ser sintetizado (y amplificado...) comenzando en el punto donde se peg el cebador y continuando a lo largo de la cadena de ADN. Si se utiliza como cebador regiones altamente conservadas de los genes que codifican el ARNr de la (subunidad pequea de los ribosomas), los genes de los ribosomas de la muestra sern copiados y su secuencia comparada con la de los organismos conocidos. Toda secuencia nueva de genes representa un nuevo organismo, y puede representarse en el rbol filogentico construido a partir de la secuencia de los genes de la subunidad pequea de los ribosomas. De esta manera se descubrieron nuevos tipos de arqueobacterias en los ambientes marinos. Parecen ser bastante comunes y la abundancia de su ADN en las aguas superficiales costeras sugieren que pueden representar hasta el 34% de la biomasa correspondiente a los procariotas en ciertas pocas del ao. El registro fsil La evidencia fsil soporta la idea que el origen de la vida en la Tierra comenz en pocas tempranas: hace ya 3.500 millones de aos, en notacin cientfica un billn (o mil millones)= un Giga, Ga abrevia por Giga-aos. Los fsiles ms antiguos provienen de rocas marinas, como la piedra caliza y la piedra arenizca, formadas en el antiguo ocano.

J. William Schopf de la Universidad de California, Los ngeles (UCLA) descubri recientemente posibles procariotas fotosintetizadores en rocas de 3,5 Ga; y son de tal complejidad que el hecho sugiere que formas primitivas debieron existir antes. De rocas obtenidas de Groenlandia se obtuvieron posiblemente las ms antiguas clulas 3,8 (?) Ga. La roca ms antigua conocida en la Tierra tiene 3,96 Ga y proviene de la regin canadiense del rtico. Por lo tanto, a partir de estas evidencias podemos suponer que la vida en la Tierra comenz rpidamente luego del enfriamiento de la corteza y la formacin de la atmsfera y los ocanos. Recientes descubrimientos de la existencia de bacterias en las fosas marinas, en las cuales las placas tectnicas dejan lugar a fisuras. El calor y los materiales resultantes de esta circunstancia conforman un ambiente particular donde se desarrollan bacterias. Esto permite presuponer otro lugar donde la vida pudo haberse originado: en estas fosas marinas donde el calor y la roca derretida aflora a la superficie de la Tierra. Estromatolitos El curso de la evolucin puede ser reconstruido estudiando el registro fsil. Los fsiles son los restos mineralizados de organismos de perodos geolgicos previos, que proporcionan un registro de la historia geolgica de la tierra. Los fsiles microbianos se han encontrado en rocas compuestas por finas capas denominadas estromatolitos, formados por bacterias hetertrofas y fottrofas que vivan en un tipo de colonias. Las cianobacterias se encuentran en la superficie externa y otras bacterias fotosintetizadoras (anaerobias) se encuentran inmediatamente por debajo de ellas. Por debajo de las capas fottrofas se encuentran capas de bacterias hetertrofas. Las capas de los estromatolitos son alternativamente biognicas y sedimentarias en su origen. Los estromatolitos se siguen formando todava en la actualidad y son relativamente comunes en lagunas y aguas termales. Los fsiles microbianos mas antiguos son de hace unos 3500 millones de aos, casi tan antiguos como las rocas mas antiguas (3800 millones de aos). Composicin Qumica La clula bacteriana tiene un contenido en agua del 70 al 85%. El peso hmedo (masa hmeda) de los seres unicelulares se estima mediante centrifugacin y separacin de la masa celular de su medio de cultivo. El peso seco (masa seca) se estima luego de evaporar toda el agua, y estar comprendido por lo tanto entre el 15 al 30% del peso hmedo. Si las clulas contienen grandes cantidades de materiales de reserva (es decir, lpidos, polisacridos, polifosfatos o azufre) el peso seco es proporcionalmente superior. Los datos de la composicin elemental y la distribucin de los compuestos orgnicos integrantes del peso seco se dan en las tablas siguientes Forma y Tamao Las bacterias tpicamente tienen una de estas tres formas: 1. 2. 3. cilndrica (bacilos): esfrica (cocos), el dimetro de los micrococos es de solo 0,5 m espiralada (espirilos)

Son unicelulares y a menudo se agrupan formando agregados o filamentos. Generalmente son muy pequeas su tamao es del orden del micrn.

Tabla I Nombre de la bacteria Pseudomona aeruginosa Chromatium okenii Escherichia coli Thiospirillum jenense Epulopiscium fishelsoni Thiomargarita namibiensis Dimetro 0,4-0,5 m 5 m 1 m 3,5 m 250 m 0,75 mm Longitud 2-3 m 20 m 5 m 50 m

Las de forma bacilar generalmente tienen 1 m de dimetro y 5 m de largo, las de 20 o ms micras de largo se consideran "gigantes". Las bacterias gigantes son de crecimiento lento, la mayor de ellas es Thiomargarita namibiensis, bacteria esfrica cuyo dimetro puede alcanzar 0,75 mm. Al microscopio los miembros de los gneros Pseudomonas y Bacillus se observan como varillas (bacilos) rectos. El gnero Vibrio aparece como un bacilo curvado o forma de coma El gnero Corynebacterium tiene forma de maza y tendencia a cambiar de forma El gnero Mycobacterium presenta ramificaciones incipientes. El gnero Streptomyces puede formar un micelio El mtodo usual de divisin en procariotas es la fisin binaria. Tras el alargamiento de la clula construyen de afuera hacia dentro paredes transversales que van progresando, y las clulas hijas se separan. Sin embargo muchas de ellas en determinadas condiciones, permanecen unidas durante un cierto tiempo, dando origen a agrupaciones caractersticas. Segn el plano y nmero de divisiones pueden encontrarse en bacterias esfricas: Diplococos Estreptococos Estafilococos Sarcinas

Diferencias con Eucariotas Si bien la clula eucariota se describe in extenso es conveniente dejar planteadas aqu sus principales diferencias con la procariota.
Estructura/Proceso Membrana nuclear ADN Cromosomas Divisin celular Mitocondria Cloroplasto Ribosomas Pared celular Nuclolos Retculo endoplsmico rganos de locomocin en Eucariotas Presente Combinado con protenas (histonas) Mltiples Mitosis o Meiosis Presentes (con ribosomas 70S) Presentes en clulas vegetales (con ribosomas 70S) 80S(a 60S y 40S sus subunidades) Presente en vegetales constituida por celulosa Presentes Presente Cilios y flagelos que al corte transversal presentan una distribucin caracterstica de microtbulos: 9+ 2 en Procariotas Ausente Desnudo y circular nico Fisin binaria Ausente. Los procesos bioqumicos equivalentes tienen lugar en la membrana citoplasmtica. 70S(a 50S y 30S sus subunidades) Presente constituida por murena Ausentes Ausente Flagelos sin estructura 9+2

Especie bacteriana La definicin moderna de especie puede ser aplicada a la mayora de los eucariotas, incluyendo hongos, algas y protozoos, pero no es aplicable a los procariotas, ya que la reproduccin y el intercambio gentico no son esenciales en su ciclo de vida. Dado que los microbilogos necesitan identificar y clasificar las bacterias por diferentes razones prcticas, una especie puede definirse como una coleccin de cepas similares, que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas para asegurar su reconocimiento como unidad taxonmica bsica. Para ser exactos. una especie procariota podra definirse de manera precisa a partir de sus secuencia de ARNr. A pesar de no estar completamente aceptado, se ha propuesto que dos procariotas cuyo ARNr 16S tenga un 97% o mas de secuencias idnticas es muy probable que pertenezcan a la misma especie. Lo usual es que se defina una especie a partir de la caracterizacin de varias cepas o clones. Siendo CLON una poblacin de clulas genticamente idnticas derivadas de una (1) sola clula.

DOMINIO EUCARYA
En biologa, dominio es la categora taxonmica atribuida a cada una de los tres principales grupos o taxones en que actualmente se considera subdividida la diversidad de los seres vivos: arqueas (Archaea), bacterias (Bacteria) y eucariontes (Eukarya). As lo propone Carl Woese en 1990 al crear la nueva taxonoma molecular aplicada a ste su sistema de 3 dominios. Hasta hace poco tiempo, los seres vivos se clasificaban dependiendo de la ausencia o presencia de ncleo en las clulas que lo componen (procariota o eucariota), pero los nuevos estudios a nivel molecular de la estructura de los lpidos, protenas, genoma y sobre todo de la secuencia del ARN ribosomal 16s, muestran que dentro de las procariotas, las archaea son tan diferentes de las bacterias como stas de las eucariotas. En los dominios Archaea y Bacteria prcticamente slo se incluyen organismos unicelulares, morfolgicamente sencillos y aparentemente poco diversos, pero con una gran variedad de metabolismos y dependencias nutricionales. Todos los organismos de anatoma compleja, junto a otros ms sencillos o unicelulares, pertenecen al dominio Eukarya (los eucariontes), que incluye los reinos animal (Animalia), hongos (Fungi), plantas (Plantae) y protistas (Protista). Los virus son sistemas biolgicos totalmente dependientes, parsitos, que muchos prefieren considerar como no vivos y que se clasifican aparte. 1. Reino Protista (Protoctista) Es el primero de los reinos eucariotas, los organismos aqu agrupados (y todos los eucariotas...) poseen ncleo verdadero y organelas, lo cual implica una compartimentalizacin y la dedicacin de reas especficas a funciones tambin especficas. Los protistas se definen como aquellos organismos eucariotas que no son animales ni plantas ni hongos. La palabra PROTISTA remita a organismos unicelulares, sin embargo en este reino se incluyen las grandes algas marinas como Macricystes (100 m de long.) por lo que fue rebautizado como Reino PROTOCTISTA, , lo cierto es que en la prctica este trmino no es muy usado. Es el reino que mayor diversidad presenta: desde unicelulares microscpicos de 1 m de diametro como la pequea alga verde Micromonas, hasta las grandes algas marinas; incluye auttrofos fotosintticos, hetertrofos, parsitos , saprofogos (ingieren organismos muestos); pueden estar desnudos o cubiertos con paredes. A dieferencia de los otros 3 reinos eucariotas, no existe factores morfolgicos o fisiolgicos que unifiquen a los Protistas como un grupo natural. En este grupo se encuentran las algas, euglenoides, ciliados, protozoarios, y flagelados. Su importancia estriba, entre otras, en ser el "grupo de origen" de los tres Reinos restantes: Plantas, Animales, y Hongos.

La imagen de una diatomea (Protistas)

2. Reino Fungi Son organismos eucariontes, hetertrofos no fotosintticos, formadores de esporas y que carecen de movimiento en todas las fases de su ciclo de vida; poseen paredes celulares y absorben su alimento por digestin enzimtica externa. Este reino, conocido generalmente como Hongos, incluye en su mayora a organismos: pluricelulares (pero comprende tambin a las levaduras, entre ellas a Saccharomyces cereviseae, un importante hongo unicelular), hetertrofos (obtienen su energa de productos elaborados por otros organismos), en general poseen clulas con mas de un ncleo (multinucleadas, en oposicin a las mas comunes o uninucleadas). Desde el punto de vista ecolgico resultan importantes (al igual que ciertas bacterias) como descomponedores de materia y recicladores de nutrientes. Desde el punto de vista econmico los hongos nos proveen alimentos (intervienen, entre otras, en la fabricacin del pan y el vino y quesos tales como el Roquefort), antibiticos (la primera de estas drogas milagrosas, la penicilina, se aisl de un hongo: Penicillium), y por el otro lado parasitan animales, granos ..., produciendo perdidas millonarias.

Geastrum sp.

Dictiophora sp.

3. Reino Planta El reino Plantae incluye los musgos, helechos, conferas y plantas con flores, en una variedad que supera las 250000 especies, siendo el segundo grupo luego de los artrpodos. La principal caracterstica del reino es la presencia de clorofila, con la cual capturan la luz, produciendo compuestos carbonados, por esta caracterstica son auttrofos. Otra contribucin de las plantas es la formacin de los ambientes. Solamente las regiones rticas y las profundidades ocenicas carecen de plantas, el resto de los ambientes terrestres, desde los desiertos a las tundras y los bosques o praderas fueron producidos y moldeados por las plantas. Incluyen a organismos Desde el punto de vista ecolgico los integrantes de este reino, en unin a los fotosintetizadores de Monera y Protistas, son considerados productores, y se encuentran en la base de toda cadena alimenticia. Una cadena alimenticia es un concepto ecolgico que indica el flujo de energa a travs de un ecosistema. Desde el punto de vista econmico este reino no tiene competencia, la agricultura (relacionada con los orgenes de nuestra "civilizacin") inyecta millones en divisas a la economa de los pases agroproductores. Alimentos, maderas, papel, medicamentos, drogas (legales e ilegales), y las flores, son plantas o derivados de ellas.

cultivo de trigo

Cicas revoluta

Seibo (Eritrina crista-galli)

Girasol (Helianthus annuus)

4. Reino Animal Los animales son organismos hetertrofos multicelulares y su modo de nutricin principal es la ingestin y almacenan sus reservas energticas en forma de glucgeno o grasa. Sus clulas eucariotas carecen de paredes. Se caracterizan a dems por ser: multicelulares con capacidad (en algn punto de su vida) de movilizarse.

Desde el punto de vista ecolgico los integrantes de este reino ocupan el nivel de consumidores, que pueden ser subdivididos en herbvoros (consumidores de plantas) y carnvoros (consumidores de otros animales). Los Humanos, al igual que algunos otros organismos, somos omnvoros (capaces de funcionar como herbvoros o carnvoros). Desde el punto de vista econmico de los animales obtenemos (entre otros) carne, cuero, transporte; y tambin afectividad, compaa.....

Tortugas

Yacar

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