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El paciente era un varón de 58 años mitirán, según el caso, la amplifica- 5. Marín M. Utilidad de la biología molecular
que ingresó en abril de 2005 con fiebre ción de diferentes regiones del gen rrs en el diagnóstico de la endocarditis infecciosa.
En: Picazo JJ, Bouza E, editores. Infección.
y disnea de mínimo esfuerzo. Había y la obtención de segmentos génicos
Bilbao: Servisistem 2000; 2004. p. 11-25.
sido diagnosticado de hepatopatía cró- (amplicones) de diferente tamaño. Ge- 6. Rodicio M, Mendoza M. Identificación bacte-
nica alcohólica, no se conocía que pre- neralmente se utilizan iniciadores que riana mediante secuenciación del ARNr 16S:
sentara valvulopatía previa y no se permiten la amplificación de un frag- fundamento, metodología y aplicaciones en
encontraba bajo tratamiento antibió- mento de unos 500 pb del extremo 5⬘ microbiología clínica. Enferm Infecc Microbiol
tico. En la exploración presentaba del gen en el que se encuentra la Clin. 2004;22:238-45.
signos compatibles con sepsis e in- mayor variabilidad y cuya secuencia 7. Breitkopf C, Hammel D, Scheld HH, Peters
suficiencia cardíaca congestiva con aporta una adecuada información fi- G, Becker K. Impact of a molecular approach
to improve the microbiological diagnosis of in-
soplo de insuficiencia aórtica IV/VI. Se logenética6. Una vez purificado el co-
fective heart valve endocarditis. Circulation.
inició antibioterapia empírica con am- rrespondiente amplicón, se determina 2005;111:1415-21.
picilina (2 g/4 h) y gentamicina su secuencia genética. La secuencia 8. Bosshard PP, Kronenberg A, Zbinden R, Ruef
(80 mg/8 h) y se realizó un ecocardio- obtenida se compara, utilizando un C, Böttger C, Altwegg M. Etiologic diagnosis
grama transesofágico que mostró una programa informático, con aquellas of infective endocarditis by broad-range poly-
vegetación aórtica de 0,6 cm e insufi- depositadas en las bases de datos merase chain reaction: a 3-year experience.
ciencia aórtica grave. Los cuatro he- (bancos de secuencias) que existen en Clin Infect Dis. 2003;37:167-72.
mocultivos extraídos al ingreso fueron internet (EMBL, GenBank, RIDOM). 9. Millar B, Moore J, Mallon P, Xu J, Crowe M,
McClurg R, et al. Molecular diagnosis of in-
estériles. El paciente, que al sexto día Según el grado de homología entre la
fective endocarditis – A new Duke’s criterion.
presentó un cuadro compatible con secuencia incógnita y aquella de la Scand J Infect Dis. 2001;33:673-80.
embolia cerebral en el territorio de la base de datos se puede establecer la 10. Tak T, Shukla SK. Molecular diagnosis of in-
arteria cerebral media izquierda, fue identidad del microorganismo en estu- fective endocarditis: a helpful addition to the
intervenido quirúrgicamente con sus- dio. En casos de EI, la identificación Duke criteria. Clin Med Res. 2004;284:206-8.
titución valvular aórtica mediante bacteriana empleando la PCR univer-
prótesis biológica. El paciente comple- sal presenta una sensibilidad igual a
tó 6 semanas de terapia antibiótica in- la del hemocultivo en caso de microor-
travenosa con ceftriaxona (2 g/24 h). ganismos sin problemas de creci-
Fue dado de alta en situación clínica miento y superior al cultivo valvular,
estable pero falleció 2 meses después particularmente si el paciente está re-
Síndrome linfocutáneo por Nocardia
por un cuadro de hemorragia cerebral cibiendo o ha sido sometido a trata- brasiliensis en una paciente
no relacionada con la EI. miento antibiótico5,7,8. De hecho, se ha inmunocompetente
La válvula y la vegetación fueron propuesto que la PCR universal sea
enviadas al laboratorio de microbiolo- incluida como criterio mayor en los Sr. Editor: La nocardiosis es una
gía para su estudio microbiológico y criterios diagnósticos de Duke para la infección producida por especies del
los cultivos de ambas muestras resul- EI9,10. género Nocardia que puede ser loca-
taron negativos. Ante esta situación, De acuerdo con los resultados obte- lizada o diseminada. Son bacterias
se realizó la amplificación mediante nidos en este caso, S. agalactiae, un aerobias, grampositivas, parcialmente
reacción en cadena de la polimerasa agente etiológico poco frecuente de EI, ácido-alcohol resistentes, que originan
(PCR) del ADN extraído del material podría ser identificado mediante PCR formas filamentosas y/o ramificadas, y
valvular (DNeasy Blood & Tissue Kit, universal en aquellos casos que cur- que puede fragmentarse en elementos
QIAGEN). Se amplificó el gen que co- san con cultivos convencionales nega- cocobacilares muy pleomórficos. Las
difica el ARNr 16S bacteriano (PCR tivos. bacterias del género Nocardia se en-
universal) utilizando iniciadores pre- cuentran generalmente en el suelo y
viamente descritos4, y el producto ob- en la materia orgánica en descompo-
tenido (aproximadamente 1.500 pb) se sición. Se han detectado especies pató-
María Isabel Morosinia,
envió para la secuenciación automáti- genas de Nocardia (N. asteroides,
ca de ambas cadenas con los iniciado- Laura Hurtado-Carrillob, N. brasiliensis y N. otitidis ssp. cavia-
res empleados en la amplificación y Mario Rodríguez-Domíngueza rum) en el polvo, en arena de playa y
dos iniciadores internos4. Las secuen- y Pilar Martín-Dávilab en piscinas. Además, N. asteroides for-
cias obtenidas se compararon con las Servicios de aMicrobiología ma parte de la flora habitual de la ca-
existentes en la base de datos Gen- y bEnfermedades Infecciosas. vidad oral y el tracto respiratorio su-
Hospital Universitario Ramón
Bank NCBI (National Center for Bio- y Cajal. Madrid. España. perior1. Existen dos formas clínicas de
technology Information) y la alinea- presentación: la sistémica y la cutá-
ción correspondió, con un 100% de nea. La forma sistémica producida por
identidad, con S. agalactiae. Bibliografía N. asteroides en pacientes inmunode-
La identificación bacteriana me- primidos produce infección pulmonar
diante la PCR universal a partir de 1. Moreillon P, Que YA. Infective endocarditis. con diseminación frecuente al tejido
Lancet. 2004;363:139-49.
muestras clínicas consiste en la ampli- celular subcutáneo y al sistema ner-
2. Sambola A, Miró JM, Tornos JM, Almirante
ficación del gen rrs (o los genes rrs, ya B, Moreno-Torrico A, Gurgui M, et al. Strep-
vioso central. Las formas cutáneas lo-
que la mayoría de las bacterias tienen tococcus agalactiae infective endocarditis: calizadas y de partes blandas son poco
varias copias de dicho gen) que codifi- Analysis of 30 cases and review of the litera- frecuentes (sólo representan el 5% del
ca el ARNr 16S que forma parte de la ture, 1962-1998. Clin Infect Dis. 2002;34: total) y son causadas habitualmente
subunidad menor (30 S) del ribosoma 1576-84. por N. brasiliensis2. Suele haber una
bacteriano5,6. El ADN que se utiliza 3. Rollán MJ, San Román JA, Vilacosta I, Sarriá historia previa de inoculación traumá-
como molde en la reacción de amplifi- C, López J, Acuña M, et al. Clinical profile of tica directa a través de heridas super-
Streptococcus agalactiae native valve endo-
cación es extraído directamente de la ficiales con potencial contaminación
carditis. Am Heart J. 2003;146:1095-8.
muestra, utilizando, en la mayoría de 4. Gürtler V, Stanisich VA. New approaches to
con materia orgánica. Los casos de no-
los casos, equipos comerciales. En la typing and identification of bacteria using the cardiosis por N. brasiliensis descritos
PCR pueden utilizarse diferentes ini- 16S-23S rDNA spacer region. Microbiology. han sido fundamentalmente en zonas
ciadores (primers) que por tanto per- 1996;142:3-16. tropicales. En España la nocardiosis
58 Enferm Infecc Microbiol Clin 2008;26(1):56-61
Cartas científicas
abbreviated battery of tests. J Clin Microbiol. minó por PFGE tras digestión con la ciones y los patrones genéticos obteni-
2002;40:1346-51. endonucleasa SpeI. Las similitudes de dos por PFGE.
8. Georghiou PR, Blacklock ZM. Infection with
los patrones de bandas se estimaron El alto porcentaje de resistencia a
Nocardia species in Queensland. A review of
102 clinical isolates. Med J Aust. 1992;156:
mediante el coeficiente de Dice y se quinolonas en nuestro ámbito, al igual
692-7. analizaron usando el programa Mo- que en el resto de Europa2, ha obliga-
lecular Analyst Fingerprinting (Image do a modificar las recomendaciones
Analysis System, Bio-Rad). para el tratamiento empírico de la in-
En nuestro hospital, la primera fección gonocócica3,4. La aparición de
Caracterización de cepas de Neisseria NGRQ (cepa 1) se aisló en 2004. El NGRQ y su brusco aumento en nues-
gonorrhoeae con alta resistencia aislado procedía de un paciente con tro hospital (del 64% en la actualidad)
a fluoroquinolonas aisladas en Vizcaya uretritis adquirida en Rumanía, con nos hizo pensar en que se estuviera
una CIM de 16 g/ml. Durante el pe- expandiendo una variante resistente.
Sr. Editor: En la actualidad, la alta ríodo 2004-2005 se aislaron 24 cepas El análisis molecular de estas cepas
prevalencia de cepas de Neisseria go- de gonococo, 8 de las cuales (33%) pre- ha mostrado mutaciones conjuntas en
norrhoeae resistentes a fluoroquinolo- sentaban resistencia de alto nivel a ci- gyrA y parC. Diferentes trabajos han
nas (NGRQ) constituye un problema profloxacino (CIM ⱖ 4 g/ml). No se correlacionado el nivel de resistencia
en muchos países, con gran repercu- aisló ninguna cepa con resistencia in- de los gonococos a quinolonas y el nú-
sión en el tratamiento de elección de termedia. La sensibilidad de estas ce- mero y localización de las mutaciones
la gonorrea1. En nuestro hospital, des- pas a la penicilina y la tetraciclina se en la QRDR de los genes gyrA y parC.
de su aparición en 2004, todas las muestran en la tabla 1. Todos los pa- Generalmente, las mutaciones en
NGRQ aisladas han presentado resis- cientes eran heterosexuales, con eda- gyrA son necesarias para el desarrollo
tencia de alto nivel (concentración in- des comprendidas entre los 22 y los de resistencia a fluoroquinolonas, y la
hibitoria mínima [CIM] ⱖ 4 g/ml). El 56 años. Dos pacientes (cepas 2 y 6) presencia simultánea de una o más
objetivo del presente estudio fue de- habían sido tratados días antes con ci- mutaciones en parC aumentan el ni-
terminar los mecanismos moleculares profloxacino, sin responder al trata- vel de resistencia5-7. El estudio gené-
presentes en estas cepas, y establecer miento. El análisis molecular mostró tico de las cepas por PFGE, junto al
la relación genética entre ellas me- diferentes patrones de mutaciones en estudio epidemiológico, indicó una di-
diante electroforesis en gel de campos los genes gyrA y parC en las 8 cepas versidad en los patrones encontrados.
pulsantes (PFGE). resistentes a ciprofloxacino, si bien to- Los perfiles P1, P2 y P3, que podrían
Se analizaron 24 cepas de N. go- das ellas contenían de forma constan- ser considerados variaciones subclo-
norrhoeae aisladas consecutivamente te mutaciones en los codones Ser91 y nales dentro de un mismo genotipo,
en el período 2004-2005 en 22 varones Asp95 en gyrA. En parC las mutacio- sin embargo presentan distintas mu-
con uretritis y 2 mujeres, una con cer- nes afectaron a Asp86 o Ser87. Nin- taciones en el QRDR. La caracteriza-
vicitis y otra con enfermedad inflama- guna de las cepas estudiadas presen- ción molecular de estos aislamientos
toria pélvica (EIP). Se obtuvo informa- tó mutaciones en gyrB. El análisis de muestra una considerable diversidad
ción en el momento de la consulta los patrones obtenidos por PFGE mos- entre las NGRQ aisladas. Estos resul-
sobre edad, sexo, hábitos sexuales y tró seis patrones de bandas distintos tados parecen indicar que el rápido
lugar de adquisición de la infección. (tabla 1). Sin embargo, tres de estos aumento en la prevalencia de resis-
La determinación de la CIM a cipro- perfiles (P1, P2 y P3) presentaban una tencia a fluoroquinolonas en nuestra
floxacino, penicilina y tetraciclina se homología de un 85% entre sí y po- área no se debe a la expansión endé-
realizó mediante Etest (Biodisk, Sol- drían ser considerados variaciones mica de una o dos cepas, sino a la di-
na, Suecia) en medio GC agar base su- subclonales dentro de un mismo geno- seminación multiclonal de variantes
plementado (BioMeriéux, Francia). Se tipo. Estas cepas fueron aisladas de resistentes de cepas locales e impor-
utilizó N. gonorrhoeae ATCC 49226 pacientes que habían adquirido la in- tadas. El escaso número de casos de
como cepa control. Se identificaron las fección en Vizcaya. Dos cepas mostra- nuestro trabajo limita la extrapola-
mutaciones en los genes gyrA, gyrB y ron un patrón distinto a los anterio- ción de los resultados, pero la caracte-
parC de 8 NGRQ y 6 cepas sensibles res (P4) y fueron adquiridas también rización molecular de NGRQ es una
mediante reacción en cadena de la po- en nuestra provincia. Los patrones importante herramienta para el estu-
limerasa (PCR) y secuenciación de los P5 y P6 correspondieron a dos cepas dio de los posibles patrones de disemi-
productos amplificados que incluían adquiridas en Rumanía (caso 1) y Al- nación. La alta prevalencia de gono-
las regiones QRDR. El ADN genómico mería (caso 2). No se ha encontrado cocos con resistencia a antibióticos
de todas las cepas resistentes se exa- relación entre los patrones de muta- constituye un creciente problema sa-
TABLA 1. Sensibilidad y caracterización molecular de las cepas de Neisseria gonorrhoeae resistentes a fluoroquinolonas
Patrón CIM (g/ml) gyrA parC parC silente
Cepa
PFGE
CIP PEN TE Ser 91 (TCC) Asp95 (GAC) Asp86 (GAC) Ser87 (AGT) Tyr104 (TAT) Leu131 (CTC)
1 P5 > 16 0,75 3 Phe (TTC) Gly (GGC) Asn (AAC) Leu (CTG)
2 P6 > 16 0,5 2 Phe (TTC) Gly (GGC) Arg (CGT) Tyr (TAC) Leu (CTG)
3 P4 > 32 2 4 Phe (TTC) Gly (GGC) Asn (AAC) Leu (CTG)
4 P1 >4 0,25 1 Phe (TTC) Ala (GCC) Asn (AAT) Leu (CTG)
5 P1 > 16 0,38 3 Phe (TTC) Gly (GGC) Asn (AAC) Leu (CTG)
6 P2 >8 2 1,5 Phe (TTC) Gly (GGC) Arg (CGT) Tyr (TAC) Leu (CTG)
7 P4 >8 2 1 Phe (TTC) Gly (GGC) Arg (CGT) Tyr (TAC) Leu (CTG)
8 P3 > 16 1 2 Phe (TTC) Gly (GGC) – Arg (CGT) Tyr (TAC) Leu (CTG)
9-14 – ≤ 0,004 0,06-0,5 0,5-1 – – – – – Leu (CTG)
CIM: concentración inhibitoria mínima; CIP: Ciprofloxacino; P1, P2, P3, P4, P5, P6: patrones obtenidos por PFGE tras digestión con SpeI;
PEN: penicilina; PFGE: electroforesis en gel de campos pulsantes; TE: tetraciclina.