Orthocoronavirinae

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para el virus que la causa, véase SARS-CoV-2.
Symbol question.svg Orthocoronavirinae
Electron micrograph of two coronaviruses.jpg
Clasificación de los virus
Dominio: Riboviria
Grupo: IV (Virus ARN monocatenario positivo)
Reino: Orthornavirae
Filo: Pisuviricota
Clase: Pisoniviricetes
Orden: Nidovirales
Suborden: Cornidovirineae
Familia: Coronaviridae
Subfamilia: Orthocoronavirinae
Géneros1
Alphacoronavirus
Betacoronavirus
Gammacoronavirus
Deltacoronavirus
[editar datos en Wikidata]
Orthocoronavirinae, comúnmente conocidos como coronavirus, es una subfamilia de
virus ARN monocatenario positivos perteneciente a la familia Coronaviridae. Se
subdivide en los géneros Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus y
Deltacoronavirus.23 Estos incluyen genogrupos filogenéticamente similares de virus
con una nucleocápside de simetría helicoidal con envoltura cuyos viriones pueden
medir entre aproximadamente 50 y 200 nm de diámetro. Su material genético es el de
mayor tamaño dentro de los virus de ARN, con genomas que van desde los 26 a 32
kilonucleótidos.45 Se les llama coronavirus por la corona de puntas que se ve
alrededor de la superficie del virus. Fue descrito por primera vez en 1965.6

Los coronavirus pueden infectar aves y mamíferos produciendo una serie de

enfermedades respiratorias y digestivas, muchas de ellas letales trayendo como
consecuencia serios perjuicios en la avicultura y la ganadería; también pueden
infectar al ser humano causando enfermedades que van desde el resfriado común hasta
enfermedades más graves, como bronquitis, bronquiolitis, neumonía, el síndrome
respiratorio de Oriente Medio (MERS), el síndrome respiratorio agudo grave (SARS) y
el COVID-19, entre otras. La mayoría de las personas se infectan con estos virus en
algún momento de su vida.2738

Hasta la fecha se han registrado cuarenta y cinco especies de coronavirus.1 Varias

especies son de reciente investigación8 debido a que varias cepas particulares no
habían sido identificadas previamente en humanos.9 Existe poca información sobre la
transmisión, gravedad e impacto clínico9 y no existen tratamientos aprobados hasta
la fecha,8 sin embargo se pueden tratar varios de los síntomas, las opciones
terapéuticas dependen del estado clínico de cada paciente.8

El género Alphacoronavirus —anteriormente conocido como Coronavirus grupo 1 (CoV-1)

— incluye los subgrupos 1a y 1b, cuyos integrantes más representativos son el
coronavirus humano 229E (HCoV-229E) y HCoV-NL63, así como la nueva especie
alfacoronavirus 1 —incluyendo virus de la gastroenteritis transmisible porcina
(TGEV)—, respectivamente. El género Betacoronavirus —anteriormente Betacoronavirus
grupo 2 (Cov-2)— incluye varios subgrupos. Los más prominentes (subgrupos 2a y 2b)
tienen como especies tipo las especies de coronavirus murino —incluido el virus de
la hepatitis de ratón (MHV)– y el SARS-CoV, respectivamente. Los géneros
Alphacoronavirus y Betacoronavirus provienen del pool genético que tiene a
murciélagos como huésped. El género Gammacoronavirus incluye todos los coronavirus
aviares identificados hasta 2009.1011

Índice
1 Historia natural
2 Estructura
3 Replicación
4 Humanos
4.1 Síndrome respiratorio agudo grave
4.2 Síndrome respiratorio de Medio Oriente
4.3 SARS-CoV-2
5 Veterinaria
5.1 Listado de los coronavirus de animales domésticos
6 Taxonomía
7 Véase también
8 Bibliografía
9 Referencias
10 Enlaces externos
Historia natural
El ancestro común más reciente del coronavirus se ha encontrado en el siglo IX a.
C. Estudios realizados durante 1990 lograron datar los ancestros comunes más
recientes de los géneros:

Betacoronavirus: 3300 a. C.
Deltacoronavirus: 3000 a. C.
Gammacoronavirus: 2800 a. C.
Alphacoronavirus: 2400 a. C.
De acuerdo a estos estudios, en ese entonces el factor principal de la fuente del
coronavirus era la sangre caliente, particularmente de los murciélagos y pájaros.
El coronavirus bovino se separó de la especie equina coronavirus al final del siglo
xviii. El coronavirus bovino y el coronavirus humano OC43 se separaron en 1899.
Otra estimación sugiere que el coronavirus humano OC43 divergió del coronavirus
bovino en 1890. El coronavirus bovino y el canino respiratorio con el coronavirus
divergieron de un ancestro común en 1951. El ancestro común más reciente del
coronavirus humano OC43 ha sido fechado en la década de 1950. El síndrome
respiratorio coronavirus de Oriente Medio, aunque relacionado con varias especies
de murciélagos, parece haber divergido de estos hace varios siglos. El coronavirus
de murciélago está más estrechamente relacionado con el coronavirus del SARS, del
que se separó en 1986.1213141516171819202122

Estructura

Animación de un virión representativo de Orthocoronavirinae, la sección transversal

indica los componentes y proteínas que pueden ser parte de su estructura
Las partes que conforman la estructura general de los coronavirus son, como en
todos los virus animales, la envoltura y la nucleocápside. En el caso de los
coronavirus, en la envoltura se encuentra una glucoproteína de membrana (M) de 20 a
35 kDa, que forma una matriz en contacto con la nucleocápside. Además se encuentra
en la envoltura la glucoproteína S, de 180 a 220 kDa,23 que forma las espículas,
espigas o peplómeros responsables de la adhesión a la célula huésped. En el caso
específico del coronavirus SARS, en sus espículas un dominio de unión para
receptores definidos dirigen la adherencia del virus a su receptor celular, la
enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE-2).24 Algunos coronavirus
(específicamente los miembros de Betacoronavirus subgrupo A, también llamado
subgénero Embecovirus25) tienen también en la superficie una proteína adicional más
corta llamada esterasa-hemaglutinina.26

Replicación
La replicación de los coronavirus comienza con la entrada en la célula, momento en
que pierde su envoltura, y el genoma de ARN se libera en el citoplasma. El genoma
del coronavirus tiene un caperuza metilada en el extremo 5' (extremo cap'), y una
cola poliadenilada (poly A) en el extremo 3', dándole un gran parecido al ARN
mensajero eucariota. Esto permite que al ARN se le adhieran los ribosomas
citoplasmáticos para su traducción. Los coronavirus tienen también una proteína
replicasa codificada en su código genético, que le permite generar nuevas copias de
su ARN sin necesidad de transcribirse a ADN, usando los recursos de la célula
huésped. Esta replicasa es la primera proteína que se sintetiza ya que una vez que
el gen que codifica la replicasa es traducido (síntesis proteica), el proceso se
detiene por un codón de parada.27 Esto se conoce como una transcripción anidada.
Cuando el transcrito de ARNm solo codifica un gen, se conoce como monocistrónico.
El genoma de ARN se replica a cadena negativa y de esta se forman copias positivas
de la que se traduce una larga poliproteína, que deberá ser escindida en las
distintas proteínas funcionales del virus. Los coronavirus tienen para ello una
proteasa denominada Mpro o 3CLpro28 que corta la poliproteína para dar lugar a las
proteínas víricas (maduración de la poliproteína). Esta es una estrategia vírica
para la economía genética, ya que le permite codificar un buen número de proteínas
con un número pequeño de transcritos a la vez que mejora la tasa de fallos durante
la ejecución de la ARN polimerasa.2927 Dicha proteasa es un objetivo de fármacos
para impedir la replicación del virus.30

Humanos
Los coronavirus humanos fueron descritos por primera vez en la década de 1960 en
cavidades nasales de pacientes con un resfriado común. Estos virus fueron nombrados
posteriormente coronavirus humano 229E y OC43. Otros dos miembros de esta familia
han sido identificados, el HCoV-NL63 en 2004 y HKU1 en 2005. Los cuales circulan
globalmente en la población humana y causan aproximadamente un tercio de los casos
de resfriado común. Al igual que otros tipos de virus pueden causar enfermedades
más graves del sistema respiratorio como bronquitis o neumonía especialmente en
personas con factores de riesgo, ancianos, niños y pacientes inmunodeprimidos.
Además de afecciones respiratorias también pueden causar enfermedades intestinales
y neurológicas.31

Existen registros de siete cepas de coronavirus relacionados con enfermedades

respiratorias en humanos (HCoV):

Coronavirus humano 229E

Coronavirus humano OC43
SARS-CoV
Coronavirus humano NL63
Coronavirus humano HKU1
Coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV).
SARS-CoV-2 (COVID-19).3233
Después de la publicación del perfil de los brotes de SARS en 2003, resucitó entre
los virólogos un interés por los coronavirus. Durante muchos años, los científicos
sabían de solo dos coronavirus humanos (HCoV-229E y OC43-HCoV). El descubrimiento
de SARS-CoV añadió un tercer coronavirus humano. A finales de 2004, tres
laboratorios de investigación independientes informaron del descubrimiento de un
cuarto coronavirus humano, nombrado NL63, NL, y coronavirus de New Haven
simultáneamente por varios grupos de investigación. Los tres laboratorios siguen
discutiendo sobre cuál de ellos descubrió el virus en primer lugar y por tanto
tiene derecho a nombrarlo. A principios de 2005, un equipo de investigación de la
Universidad de Hong Kong informó del hallazgo de un quinto coronavirus humano en
dos pacientes con neumonía. Lo llamaron coronavirus humano HKU1. El brote de
neumonía 2019-20 en Wuhan, China, llevó al hallazgo de un coronavirus nuevo,
catalogado como 2019-nCoV por la OMS.34353233

Síndrome respiratorio agudo grave

Artículo principal: Síndrome respiratorio agudo grave
En 2003, tras el brote del SARS (síndrome respiratorio agudo grave), que había
comenzado en el año 2002 en Asia, y luego en otras partes del mundo, la
Organización Mundial de la Salud (OMS) emitió un comunicado de prensa indicando que
un coronavirus de nueva identificación por parte una serie de laboratorios era el
agente causante del SARS. El virus fue nombrado oficialmente como coronavirus del
SARS (SARS-CoV). Más de 8000 personas resultaron infectadas, alrededor del 10% de
los cuales murieron.26

Síndrome respiratorio de Medio Oriente

Artículo principal: Coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio
En septiembre de 2012, se identificó un nuevo tipo de coronavirus, llamado
inicialmente coronavirus nuevo 2012, y ahora con el nombre oficial coronavirus del
síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV). La Organización Mundial de la
Salud emitió una alerta mundial poco después. La actualización de la OMS el 28 de
septiembre de 2012 declaró que no parecía que el virus se transmitiese fácilmente
de persona a persona. Sin embargo, el 12 de mayo de 2013, un caso de transmisión de
humano a humano en Francia fue confirmado por el Ministerio de Asuntos Sociales y
de Salud de Francia. Además, los casos de transmisión de humano a humano han sido
reportados por el Ministerio de Salud de Túnez. Dos casos confirmados parecen haber
contraído la enfermedad de su difunto padre, quienes se enfermaron después de una
visita a Catar y Arabia Saudita. A pesar de esto, parece que el virus tiene
problemas para la difusión de humano a humano, ya que la mayoría de las personas
que están infectadas no transmiten el virus.363738394041

Para el 30 de octubre de 2013, había en Arabia Saudita 124 casos y 52 muertes.

Después de que el Centro Médico Erasmus neerlandés secuenció el virus, le dio un
nombre nuevo, coronavirus humano-Centro Médico Erasmus (HCoV-CEM). El nombre final
para el virus es coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV).
En mayo de 2014 se registraron los dos únicos casos de infección con MERS-CoV en
los Estados Unidos, ocurrieron en trabajadores de la salud que trabajaron en Arabia
Saudita y luego se desplazaron a Estados Unidos. Ambos individuos fueron
hospitalizados temporalmente y luego dados de alta. En mayo de 2015, un brote de
MERS-CoV se produjo en Corea del Sur, cuando un hombre que había viajado a Oriente
Medio, visitó 4 hospitales diferentes en el área de Seúl para tratar su enfermedad.
Esto provocó uno de los mayores brotes de MERS-CoV fuera del Medio Oriente. En
diciembre de 2019, 2.468 casos de infección MERS-CoV habían sido confirmados por
medio de pruebas de laboratorio, casos de los cuales 851 fueron mortales, una tasa
de mortalidad de aproximadamente el 34,5%.42434445

SARS-CoV-2
Esta sección es un extracto de SARS-CoV-2.[editar]

Micrografía electrónica de transmisión de viriones de SARS-CoV-2, aislados desde un

paciente. Imagen coloreada, para resaltar los virus.
El coronavirus de tipo 2 causante del síndrome respiratorio agudo severo,46
abreviado SARS-CoV-2 (del inglés severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)47
o SRAS-CoV-2,46 es un tipo de coronavirus causante de la enfermedad por coronavirus
de 2019,484950 cuya expansión mundial provocó la pandemia de COVID-19. Inicialmente
fue llamado 2019-nCoV (en inglés, 2019-novel coronavirus, ‘nuevo coronavirus de
2019’) y también, ocasionalmente, HCoV-19 (en inglés, human coronavirus 2019).5152
Se descubrió y se aisló por primera vez en Wuhan, China. Se cree que tiene un
origen zoonótico, es decir, que se transmitió de un huésped animal a uno humano.53

Es un clado dentro de la familia de los Coronaviridae, género Betacoronavirus,

subgénero Sarbecovirus, especie virus SARS54(virus relacionado con el síndrome
respiratorio agudo severo o grave).55

El genoma del virus está formado por una sola cadena de ARN, y se clasifica como un
virus ARN monocatenario positivo. Su secuencia genética se ha aislado a partir de
una muestra obtenida de un paciente afectado por neumonía en la ciudad china de
Wuhan, aunque la falta de experimento de control doble ciego en la técnica de
secuenciación publicada puede poner en cuestionamiento la validez científica de la
técnica 56.5758596061 Se detectó por primera vez el 12 de noviembre de 2019. Puede
producir el contagio de una persona a otra mediante las gotas de saliva expulsadas
a través de la tos y el estornudo o al espirar (véase gotitas de Flügge).6263 Puede
provocar enfermedad respiratoria aguda y neumonía grave en los seres humanos.64

Aunque previamente no había ningún tratamiento específico aprobado oficialmente, ya

se habían desarrollado algunos antivirales existentes, así como el tratamiento con
plasma convaleciente y la dexametasona, que parecen tener una mayor eficacia en el
manejo de los síntomas o que parecen acortar el periodo de recuperación en
poblaciones especiales.6566 En diciembre de 2020 comenzó una campaña de vacunación
con las primeras vacunas aprobadas, que se prolongó durante 2021 y se mantendrá
durante 2022[cita requerida] Fue Pfizer - BioNTech, con la vacuna Comirnaty, los
laboratorios pioneros en patentar una vacuna67 y posteriormente, los laboratorios
Moderna y AstraZeneca se unieron a esta carrera por la vacuna.68
Veterinaria
Los coronavirus han sido reconocidos como causantes de condiciones patológicas en
veterinaria desde principios de 1970. A excepción de la bronquitis infecciosa
aviar, las principales enfermedades relacionadas tienen principalmente una
ubicación intestinal.

Los coronavirus infectan principalmente el tracto respiratorio y gastrointestinal

superior de mamíferos y aves. Actualmente se conocen siete cepas del coronavirus
que infectan a los humanos. Se cree que los coronavirus causan un porcentaje
significativo de todos los resfriados comunes en personas adultas y niños. Los
coronavirus causan resfriados con síntomas importantes; por ejemplo, fiebre,
inflamación de las adenoides de la garganta, en los seres humanos principalmente en
las temporadas de invierno y primavera temprana. Los coronavirus puede causar
neumonía, ya sea neumonía viral directa o una neumonía bacteriana secundaria, y la
bronquitis, ya sea bronquitis viral directa o una bronquitis bacteriana secundaria.
El coronavirus humano más conocido fue descubierto en 2003, SARS-CoV que causa el
síndrome respiratorio agudo grave (SARS), tiene una patogénesis única porque causa
que infecciones de las vías respiratorias tanto superior como inferior. La
importancia económica y el impacto de los coronavirus como agentes causantes del
resfriado común son difíciles de evaluar debido a que, a diferencia de los
rinovirus (otro virus del resfriado común), los coronavirus humanos son difíciles
de cultivar en el laboratorio.6970

Los coronavirus también causan una serie de enfermedades en los animales de granja
y mascotas domesticadas, algunos de los cuales pueden ser graves y son una amenaza
para la industria agrícola. En los pollos, el virus de la bronquitis infecciosa
(IBV), es un coronavirus que afecta no solo las vías respiratorias, sino también el
tracto urogenital. El virus puede propagarse a los diferentes órganos del cuerpo de
la gallina. Los que tienen consecuencias económicamente significativas en los
animales de granja incluyen el coronavirus porcino (coronavirus de la
gastroenteritis transmisible, TGE) y el coronavirus bovino, el cual causa diarrea
en los animales jóvenes. Coronavirus felino: existen dos formas, el coronavirus
entérico felino es un patógeno de importancia clínica menor, pero la mutación
espontánea de este virus puede provocar una peritonitis infecciosa felina (FIP),
una enfermedad asociada con una alta mortalidad. Del mismo modo, hay dos tipos de
coronavirus que infectan a los hurones: el coronavirus entérico de hurón causa un
síndrome gastrointestinal conocido como epizoótica catarral enteritis (ECE), y una
versión sistémica más letal del virus (como FIP en los gatos), conocido en hurones
como coronavirus sistémico de hurón (FSC). Hay dos tipos de coronavirus canino
(CoVC), uno que causa la enfermedad gastrointestinal leve y uno que causa
enfermedad respiratoria. El virus de la hepatitis del ratón (MHV) es un coronavirus
que causa una enfermedad epidémica murina con una mortalidad alta, especialmente
entre las colonias de ratones de laboratorio.717273El virus de la
sialodacrioadenitis (sialo saliva, dacrio lágrima) es un coronavirus altamente
infeccioso de ratas de laboratorio, que puede transmitirse entre individuos por
contacto directo o indirectamente por las secreciones en aerosol. Las infecciones
agudas tienen una alta morbilidad y tropismo para las glándulas salivales,
lacrimales y harderiana.74

Uno relacionado con el coronavirus murciélago Rinolophus HKU2 llamado coronavirus

del síndrome de diarrea aguda porcina (SADS-CoV) (del inglés swine acute diarrhea
syndrome) causa diarrea en cerdos.75

Antes del descubrimiento de SARS-CoV, MHV había sido estudiado tanto in vivo como
in vitro, así como a nivel molecular. Algunas cepas de MHV causaron una encefalitis
desmielinizante progresiva en ratones a los que se ha utilizado como modelo murino
para la esclerosis múltiple. Importantes esfuerzos de investigación se han centrado
en dilucidar la patogénesis viral de estos coronavirus de animales, especialmente
por los virólogos interesados en las enfermedades zoonóticas y veterinarios.76

Ciclo de infección de los coronavirus77

Listado de los coronavirus de animales domésticos
Virus de la bronquitis infecciosa (IBV) causas infecciosa aviar bronquitis.
Porcino coronavirus (transmisible gastroenteritis coronavirus de cerdos, TGEV).
Coronavirus bovino (BCV), responsable de la profusa enteritis grave en los terneros
jóvenes.
Coronavirus felino (FCoV) provoca enteritis leve en los gatos, así como graves
peritonitis infecciosa felina (otras variantes del mismo virus).
Los dos tipos de canino coronavirus (CoVC) (una enteritis causando, la otra que se
encuentra en las enfermedades respiratorias).
Coronavirus aviar provoca enteritis en aves.
Ferret entérica coronavirus provoca enteritis catarral epizoótica en hurones.
Ferret sistémica coronavirus causa FIP-como el síndrome sistémico en hurones.
Pantrópicas coronavirus canino.
Coronavirus canino
Otra enfermedad veterinaria nueva, virus de la diarrea epidémica porcina (PED o
PEDV), ha surgido en todo el mundo. Su importancia económica es aún poco clara,
pero muestra una alta mortalidad en los lechones.787980

Taxonomía

Escultura coronavirus ubicada en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de la

UNAM, México
Los géneros, subgéneros y especies incluidas en Orthocoronavirinae son:81

Alphacoronavirus
Colacovirus
Coronavirus de murciélago CDPHE15
Decacovirus
Coronavirus de murciélago HKU10
Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
Duvinacovirus
Coronavirus humano 229E
Luchacovirus
Coronavirus de rata Lucheng Rn
Minacovirus
Hurón coronavirus
Mink coronavirus 1
Minunacovirus
Miniopterus murciélago coronavirus 1
Miniopterus murciélago coronavirus HKU8
Myotacovirus
Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
Nyctacovirus
Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
Pedacovirus
Virus de la diarrea epidémica porcina
Scotvilus murciélago coronavirus 512
Rinacovirus
Coronavirus murciélago Rhinolophus HKU2
Setracovirus
Coronavirus humano NL63
Cepa de coronavirus de murciélago relacionada con NL63 BtKYNL63-9b
Tegacovirus
Alphacoronavirus 1 - especie tipo
Betacoronavirus
Embevirus
Betacoronavirus 1
Coronavirus humano OC43 (miembro sin rango o subespecie)8231
Coronavirus Rattus de China HKU24
Coronavirus humano HKU1
Coronavirus murino - especie tipo
Hibecovirus
Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
Merbecovirus
Erizo coronavirus 1
Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio de Oriente Medio
Coronavirus murciélago Pipistrellus HKU5
Coronavirus murciélago Tyronycteris HKU4
Nobecovirus
Rousettus murciélago coronavirus GCCDC1
Coronavirus murciélago Rousettus HKU9
Sarbecovirus
Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo grave
Coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (variedad o subespecie)83
Deltacoronavirus
Andecovirus
Coronavirus Wigeon HKU20
Buldecovirus
Bulbul coronavirus HKU11 - especie tipo
Coronavirus HKU15
Coronavirus Munia HKU13
Coronavirus de ojo blanco HKU16
Herdecovirus
Coronavirus de garza nocturna HKU19
Moordecovirus
Coronavirus de la polla de agua común HKU21
Gammacoronavirus
Cegacovirus
Coronavirus de ballena Beluga SW1
Igacovirus
Coronavirus aviar - especie tipo
Véase también
Virus ARN
Coronavirus humano OC43
COVID-19
SARS-CoV-2
Pandemia de COVID-19
Pandemia de enfermedad por coronavirus de 2020 en España
Bibliografía
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