Capítulo 1
La naturaleza de los virus
Bosquejo del capítulo
Introducción: una breve historia de la virología animal
Características de los virus
Composición química de los ácidos nucleicos
virales del virión en el virión Proteínas virales en
el virión
INTRODUCCIÓN: BREVE HISTORIA DE LA
VIROLOGÍA ANIMAL
La historia del desarrollo humano ha sido moldeada por al menos tres elementos
recurrentes principales: (1) cambios ambientales; (2) conflictos humanos; (3)
enfermedades infecciosas. Las enfermedades infecciosas han afectado tanto a
los seres humanos como a nuestro suministro de alimentos. Los orígenes de la
medicina veterinaria tienen sus raíces en los esfuerzos por mantener la salud de
los animales para la producción de alimentos y fibras, y de los animales
esenciales para las actividades relacionadas con el trabajo. El control de los
brotes de enfermedades animales no fue posible hasta el trabajo pionero de fines
del siglo XIX que vinculó a los microbios con enfermedades específicas de
plantas y animales (ver Murphy, FA, 2012. Los fundamentos de la virología, para
una discusión detallada). Muchos atribuyen el comienzo de la virología al trabajo
de Ivanofsky y Beijerinck sobre la transmisión del virus del mosaico del tabaco.
Ambos científicos pudieron demostrar la transmisión del agente causante de la
enfermedad en las plantas de tabaco a través de filtros que retuvieron las
bacterias. Beijerinck también señaló que el agente filtrable podría recuperar su
"fuerza" a partir del material diluido, pero solo si se volvía a colocar en las plantas
de tabaco. El concepto de una entidad replicante en lugar de una sustancia
química o toxina tuvo su génesis con estas astutas observaciones. La era de la
virología veterinaria comenzó prácticamente al mismo tiempo que Beijerinck
caracterizaba la transmisión del virus del mosaico del tabaco. Loeffler y Frosch
aplicaron los criterios de filtración a una enfermedad en el ganado que más tarde
se conocería como fiebre aftosa. El paso repetido del filtrado a animales
susceptibles con la reproducción de una enfermedad aguda estableció
firmemente la naturaleza "contagiosa" del filtrado y proporcionó más evidencia de
un proceso que era inconsistente con las sustancias tóxicas. Estos
Virología veterinaria de Fenner. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-800946-8.00001-5
© 2017 Elsevier Inc. Todos los derechos reservados.
3 Lípidos de la membrana viral 10
7 Morfología viral 10
8 Taxonomía viral 13
8 Comparación filogenética de secuencias de virus dieciséis
9
Los primeros estudios proporcionaron la definición operativa esencial de virus
como agentes filtrables. Los estudios químicos y físicos revelaron la base
estructural de los virus casi 40 años después.
A principios del siglo XX, el uso de los criterios de filtración llevó a la
asociación de muchas enfermedades animales agudas con lo que luego se
definieron como infecciones virales: peste equina africana, peste aviar
(influenza aviar de alta patogenicidad), rabia, moquillo canino, anemia
infecciosa equina. , peste bovina y peste porcina clásica (cólera porcina) ( Cuadro
1.1 ). En
En 1911, Rous descubrió el primer virus que podía producir neoplasias (tumores), y por este
descubrimiento fue galardonado con el Premio Nobel. Esta primera fase de la virología estuvo
plagada de escepticismo e incertidumbre debido a las limitadas herramientas disponibles para
estudiar y caracterizar los agentes filtrables. Los experimentos que utilizaron filtros con diferentes
parámetros de retención demostraron la existencia de agentes filtrables de diferentes tamaños.
Algunos agentes se inactivaron con disolventes orgánicos, mientras que otros fueron resistentes.
Para la anemia infecciosa equina, las formas aguda y crónica de la enfermedad eran
desconcertantes y un enigma sin resolver. Este tipo de aparentes inconsistencias hizo difícil
establecer una descripción conceptual unificadora de los agentes filtrables. Para la investigación
de enfermedades animales, Los primeros trabajadores se limitaron a utilizar la inoculación animal
para evaluar el impacto de un tratamiento sobre cualquier agente causante de enfermedad
putativo. La logística podría resultar especialmente abrumadora para los estudios en bovinos y
equinos. La ayuda para dar definición a los agentes filtrables provino del descubrimiento de virus
que infectaban bacterias. Twort en 1915 detectó la existencia de un agente filtrable que podría
matar bacterias. Al igual que sus homólogos de plantas y animales, la fuerza de una solución
diluida del virus bacteriano podría recuperarse inoculando nuevos Twort en 1915 detectó la
existencia de un agente filtrable que podría matar bacterias. Al igual que sus homólogos de plantas
y animales, la fuerza de una solución diluida del virus bacteriano podría recuperarse inoculando
nuevos Twort en 1915 detectó la existencia de un agente filtrable que podría matar bacterias. Al
igual que sus homólogos de plantas y animales, la fuerza de una solución diluida del virus
bacteriano podría recuperarse inoculando nuevos
3
4 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica

TABLA 1.1 Momentos seleccionados en la historia de la virología

Año Investigador (es) Evento Año Investigador (es) Evento

1892 Ivanofsky Identificación de tabaco 1939 Ellis y Delbruck Curva de crecimiento de un paso

virus del mosaico como agente filtrable bacteriófago

1946 Olafson, MacCallum y Fox Sanford, Earle Virus de la diarrea viral bovina
1898 Loeffler y Frosch Enfermedad de pies y boca
1948 y Likely Cultura de aislados
causado por un agente filtrable
células mamíferas
1898 Sanarelli Virus del mixoma
1952 Dulbecco y Vogt Ensayo de placa para el primer virus

1900 Junco Virus de la fiebre amarilla animal: poliovirus

1900 Mcfadyean y Theiler Virus de la peste equina africana 1956 Madin, York y McKercher Aislamiento de bovinos

herpesvirus 1
1901 Centanni, Lode y Gruber Virus de la peste aviar (virus de la

influenza aviar) 1957 Isaacs y Lindemann Descubrimiento del interferón

1902 Nicolle y Adil-Bey Virus de la peste bovina 1958 Horne y Brenner Desarrollo de negativas
microscopía electrónica de tinción
1902 Spruell y Theiler Virus de la lengua azul

1961 Becker Primer aislamiento del virus de la influenza

1902 Aujeszky Virus de la pseudorrabia
aviar de un reservorio de aves silvestres

1903 Remlinger y Riffat-Bay Virus de la rabia

1903 DeSchweinitz y Dorset Virus del cólera porcino (virus de la peste 1963 Plummer y Waterson Virus del aborto equino 5
virus del herpes
porcina clásica)

1904 Carré y Vallée Anemia infecciosa equina 1970 Temin y Baltimore Descubrimiento del reverso

virus transcriptasa

1905 Spreull Transmisión de insectos de 1978 Carmichael, Appel y Scott Organización Parvovirus canino 2

virus de la lengua azul

1979 Mundial de la Salud La OMS declara la viruela

1905 Carré Virus del moquillo canino erradicado

1908 Ellermann y Bang Virus de la leucemia aviar 1981 Pedersen Coronavirus felino

1909 Landsteiner y Popper Poliovirus 1981 Baltimore Primer clon infeccioso de un virus de
ARN
1911 Rous Virus del sarcoma de Rous: primero

virus tumoral 1983 Montagnier, Barre-Sinoussi, Descubrimiento de humanos

y gallo virus de inmunodeficiencia

1915 Twort y d'Herelle Virus bacterianos
1987 Pedersen Inmunodeficiencia felina
1917 d'Herelle Desarrollo del ensayo de placa virus

1991 Wensvoort y Terpstra Aislamiento de porcinos

1927 Doyle Virus de la enfermedad de Newcastle reproductivo y respiratorio
virus del síndrome (PRRSV)
1928 Verge y Christofornoni Parvovirus felino (felino
Seifried y Krembs virus de la panleucopenia) 1994 Murray Virus Hendra aislado

1930 Verde Encefalitis por zorro (canina 1999 El virus del Nilo Occidental entra en América del

adenovirus 1) Norte

1931 Shope Virus de la influenza porcina 2002 Respiratorio agudo severo

brote de síndrome
1931 Woodruff y Goodpasture Huevos embrionados para la propagación

de virus. 2005 Palase, García-Sastre, Reconstrucción del virus de la

Tumpey y Taubenberger influenza pandémica de 1918
1933 Dimmock y Edwards Etiología viral de los abortos
equinos 2008 Desarrollo de molecular
herramientas y software de computadora para la
1933 Andrewes, Laidlaw y Primer aislamiento del virus de la
"próxima generación
Herrero influenza humana
secuenciación ”y
1933 Shope Huésped natural porcino de análisis metagenómicos
pseudorrabia
2011 Organización Mundial de Declaración de erradicación
1933 Bushnell y Brandly Virus de la bronquitis aviar Sanidad animal (OIE) mundial de la peste bovina

1935 Stanley Cristalizó el virus del mosaico del tabaco 2012 Reconocimiento del síndrome respiratorio

(TMV); naturaleza proteica de Oriente Medio

de virus confirmados
2014 Reaparición del ébola en África

1938 Kausche, Ankuch y Ruska Primera microscopía electrónica occidental

imágenes — TMV

cultivos de bacterias. Felix d'Herelle también notó la muerte de bacterias por un
agente al que llamó "bacteriófago". Él definió el ensayo de placa para cuantificar
bacteriófagos, una técnica para enumerar partículas de virus en función de su
capacidad para matar células cultivadas y, por lo tanto, producir agujeros o
placas en la capa celular que se convirtió en la piedra angular para definir las
propiedades de los virus.
Los estudios iniciales sobre el virus del mosaico del tabaco permitieron
comprender mejor los "agentes filtrables", es decir, los virus.
Específicamente, la alta concentración de virus producida en plantas de
tabaco infectadas permitió la caracterización química y física del material
infeccioso. A principios de la década de 1930, existía evidencia de que el
agente que infectaba las plantas de tabaco estaba compuesto de proteínas y
que los anticuerpos producidos en conejos podían neutralizar el virus. El
virus del mosaico del tabaco se cristalizó en 1935, y en 1939 fue el primer
virus que se observó con un microscopio electrónico. La naturaleza
particulada de los virus era ahora un hecho establecido. Otro avance en
virología animal fue el uso de huevos embrionados para el cultivo de virus en
1931. Ese mismo año, Shope identificó el virus de la influenza en los cerdos; en
1933, el virus de la influenza se aisló de casos humanos. La identificación de la
cepa H1N1 del virus de la influenza en los cerdos podría considerarse la primera
descripción completa de una enfermedad "emergente" en los animales, es decir,
un virus que cruza la barrera de una especie y se mantiene como agente de la
enfermedad en la nueva especie. En un intento por alejarse de la experimentación
con animales grandes y proporcionar sistemas modelo para enfermedades
humanas como la influenza, los ratones y las ratas se convirtieron en
herramientas importantes para estudiar los virus animales. Estos avances dieron
lugar al nacimiento de programas de medicina animal de laboratorio que se han
convertido en una columna vertebral esencial de la investigación biomédica.
La década de 1938 48 fue testigo de importantes avances de Ellis,
Delbruck y Luria en el uso de bacteriófagos para investigar el mecanismo de
herencia de los rasgos fenotípicos de estos virus bacterianos. Los avances
en la comprensión de las propiedades de los virus progresaron mucho más
rápidamente con los virus bacterianos, porque el trabajo podría realizarse en
medios artificiales, sin ningún requisito de propagación laboriosa y lenta de
virus en animales o plantas. Un concepto clave en la replicación del virus, a
saber, el período latente, se definió utilizando experimentos de curva de
crecimiento de un paso con bacteriófagos (ver Capítulo 2: Replicación del
virus). Esta observación de la pérdida de infectividad durante un período
posterior al inicio de la infección dirigió la investigación para definir el modo
de replicación de los virus como algo totalmente distinto del de todas las
demás entidades replicantes.
Los estudios de virus animales hicieron un cambio dramático en el énfasis con el
desarrollo de in vitro cultivos de células animales (1948 55). Como resultado de los
intensos esfuerzos para controlar las infecciones por poliovirus, se definieron los
procedimientos de cultivo de células individuales, se estandarizaron los medios de
cultivo celular,
La naturaleza de los virus Capítulo | 1 5
se desarrolló una línea celular humana y se demostró el crecimiento de poliovirus
en una célula no neuronal. Todos estos avances permitieron el desarrollo de un
ensayo de placa para poliovirus 35 años después de que se definiera el concepto
de bacteriófago. Ahora era posible realizar estudios básicos sobre virus animales
que se veían obstaculizados por la necesidad de trabajar en sistemas animales. in
vitro, y los principios establecidos para los bacteriófagos podrían explorarse para
los virus animales. Había comenzado la era del cultivo celular de la virología
animal.
Los avances en virología impulsados por los esfuerzos de control de
enfermedades humanas fueron directamente aplicables a la virología animal. El
virus de la diarrea viral bovina se identificó como un nuevo agente causante de
enfermedades en el ganado en 1946 y, a fines de la década de 1950, se
consideraba la enfermedad económicamente más importante del ganado en
Estados Unidos. Los procedimientos de cultivo celular permitieron el aislamiento
del virus y la producción de una vacuna a principios de la década de 1960. El virus
de la influenza se detectó por primera vez en aves silvestres en 1961, lo que llevó
a la identificación de aves acuáticas y costeras como reservorio natural de los virus
de influenza A. Una aparente incursión entre especies de una variante del
parvovirus felino produjo la epizootia mundial del parvovirus canino a fines de la
década de 1970. De nuevo, estándar in vitro Los procedimientos de cultivo celular
identificaron el nuevo agente y pronto permitieron la producción de una vacuna
eficaz. Toda la familia de los arterivirus ( Arteriviridae) se identificó en la era del
cultivo celular de la virología, específicamente, el virus de la arteritis equina (1953),
el virus que eleva la lactato deshidrogenasa (1960), el virus de la fiebre
hemorrágica de los simios (1964), el virus del síndrome respiratorio y reproductivo
porcino (1991) y, más recientemente, virus de la zarigüeya tambaleante (2012). El
descubrimiento del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) en 1983 atrajo la
atención mundial, pero la identificación del virus de la inmunodeficiencia de los
simios (VIS) poco después puede ser, en última instancia, de igual importancia
para el eventual control de la infección humana por el VIH. El sistema de primates
ha proporcionado los modelos animales para estudios de patogénesis y desarrollo
de vacunas. Los análisis genéticos establecieron que el VIH-1 y el VIH-2 estaban
estrechamente relacionados con los VIS presentes en los primates del Viejo
Mundo, y que se derivaron de forma independiente a través de la transmisión entre
especies de estos virus simios.
Los inicios de la era molecular de la virología se remontan a finales de
la década de 1970 y principios de la de 1980. Aunque no está diseñado
específicamente para virus, el desarrollo de la reacción en cadena de la
polimerasa (PCR) en 1983 tuvo un impacto profundo en la investigación
de virus. La clonación de secuencias de ácidos nucleicos condujo al
primer clon molecular infeccioso de un virus (poliovirus) en 1981. El
impacto de las técnicas moleculares en la detección y el diagnóstico de
virus se demostró con la identificación del virus de la hepatitis C por
medios moleculares sin aislamiento y in vitro propagación del virus en
cultivo celular. Virus que no se pueden cultivar fácilmente in vitro —Como
papilomavirus, norovirus, rotavirus y ciertos nidovirus entre
6 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica
muchos otros, ahora podrían caracterizarse y detectarse de forma rutinaria mediante
pruebas que detectan específicamente el ácido nucleico viral. A
notablemente impresionante Con encabezado
Taubenberger y colaboradores fue la reconstrucción molecular de un virus
infeccioso a partir de fragmentos de ARN que representan la cepa pandémica
1918 del virus de la influenza A H1N1. Los sueños de recrear animales extintos
mediante técnicas moleculares pueden ser inverosímiles, pero estas técnicas
pueden identificar los primeros precursores de los virus que circulan actualmente.
Las estrategias de secuenciación de nucleótidos rápidas y económicas están
redefiniendo nuevamente la virología, y es probable que la secuenciación
genómica completa reemplace los procedimientos menos exactos para identificar
y caracterizar cepas y cepas de virus. Los análisis metagenómicos que identifican
todos los ácidos nucleicos en muestras biológicas, así como el agua y el suelo,
han identificado miríadas de nuevos virus, lo que deja a algunos estimar que los
virus pueden contener más información genética que todas las demás especies de
la tierra juntas.
En los primeros períodos de la virología, la disciplina dependía de los
avances en las ciencias químicas y físicas. Definir las características de
los “agentes filtrables” no fue posible simplemente observando el impacto
del agente en su anfitrión. Sin embargo, a medida que pasaba el tiempo,
los virus se convirtieron en herramientas con las que investigar los
procesos bioquímicos básicos de las células, incluida la transcripción y
traducción de genes. Los virus bacterianos ayudaron a definir algunos de
los principios básicos de la genética mediante el estudio de mutaciones y
la herencia de propiedades fenotípicas. A medida que se desarrollaron los
procedimientos químicos analíticos, se demostró que los virus contenían
ácidos nucleicos, y cuando Watson y Crick definieron la estructura del
ADN, los virus se convirtieron en actores clave en la definición del papel
de los ácidos nucleicos como base de datos de por vida. El progreso fue
tan rápido en el campo de la virología que, en la década de 1980, algunos
creían que el valor futuro de los virus sería simplemente como
herramientas para estudiar los procesos celulares. Sin embargo, la
aparición impredecible de nuevos virus como el VIH, la hepatitis C, Nipah
y Hendra, el coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo y el
coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio relacionado, y la
influenza H5N1 altamente patógena, junto con el resurgimiento de virus ya
reconocidos, como como el ébola en África Occidental, o su propagación
a áreas previamente libres, como el virus del Nilo Occidental en América
del Norte, el virus chikungunya en las islas del Océano Índico, Asia y las
Américas, el virus Zika en las Américas y los virus de la lengua azul y
Schmallenberg en Europa,
La virología veterinaria comenzó como una disciplina centrada en los
efectos de las infecciones virales en animales de importancia agrícola. El
control de estas infecciones se basó en los avances en la comprensión del
proceso de la enfermedad, en la caracterización de los virus, en el desarrollo
de los campos de la inmunología y las tecnologías de diagnóstico, y en la
establecimiento de regulaciones que controlen el movimiento de animales de
producción. Las experiencias iniciales confirmaron que la erradicación de
por algunas enfermedades infecciosas de áreas definidas podría lograrse con un
programa de prueba y sacrificio, incluso en ausencia de una vacuna eficaz.
Por ejemplo, la reciente erradicación mundial de la peste bovina se logró
mediante el sacrificio de animales infectados, la restricción del movimiento de
animales de áreas enzoóticas a zonas libres de la infección y la vacunación
de animales en regiones enzoóticas. En este tipo de programa de control, los
animales individuales podrían sacrificarse por el bien de la unidad de
producción. Con el aumento de la importancia de los animales de compañía
en la sociedad actual, los programas de control basados en la despoblación
de animales infectados no pueden utilizarse simplemente porque el animal
individual es la unidad importante, como en la medicina humana. Por lo tanto,
En la práctica veterinaria habitual, las infecciones por parvovirus canino no
pueden controlarse matando a los animales afectados y restringiendo el
movimiento de los perros, sino que deben seguir desarrollándose y
utilizándose vacunas eficaces para la inmunización profiláctica. Se deben
implementar pruebas de diagnóstico que puedan detectar rápidamente
agentes infecciosos en un marco de tiempo tal que los resultados de las
pruebas puedan dirigir el tratamiento. A medida que nos volvemos más
conscientes de la interacción entre los animales domésticos y la vida silvestre,
también debemos enfrentar la realidad de que existen virus transmitidos por
insectos vectores que no respetan las fronteras nacionales y cuya distribución
puede estar expandiéndose debido a los cambios climáticos. En el futuro será
necesario desarrollar continuamente programas de vigilancia mejorados,
estrategias de control nuevas y mejoradas y medicamentos antivirales.
Los virus se han considerado tradicionalmente en un contexto bastante
negativo: agentes productores de enfermedades que deben controlarse o
eliminarse. Sin embargo, los virus tienen algunas propiedades beneficiosas
que pueden explotarse con fines útiles. Específicamente, algunos virus (por
ejemplo, baculovirus) se han diseñado para expresar proteínas no virales
útiles o para expresar proteínas virales con fines de inmunización (por
ejemplo, vacunas vectorizadas por poxvirus y adenovirus). Los lentivirus se
han modificado con el fin de insertar genes de interés en las células con fines
de investigación y para su uso en terapia génica, al igual que los virus
adenoasociados (que en realidad son parvovirus). Los bacteriófagos se están
considerando en el contexto del control de ciertas infecciones bacterianas, y
los virus tienen el potencial hipotético de ser vectores que se dirigen
selectivamente a las células tumorales para controlar los cánceres. En el
contexto más amplio de los ecosistemas de la Tierra, los virus ahora se ven
en un sentido más positivo, ya que pueden ser un componente del control de
la población y quizás una fuerza en la evolución de las especies. Aunque
restringir la población de animales de importancia agrícola se considera
negativo desde la perspectiva humana, el ecosistema podría beneficiarse de
la reducción de una especie.

TABLA 1.2 Propiedades de los microorganismos unicelulares y propiedad de los virus
Bacterias Rickettsiae
300 nm de diámetro a 1 1
Crecimiento en medio inerte Fisión 1 2
binaria 1 1
ADN y ARN B 1 1
Ribosomas funcionales 1 1
Metabolismo 1 1
a Algunos micoplasmas y clamidias tienen un diámetro inferior a 300 nm y los mimivirus son superiores a 300 nm.
B Algunos virus contienen ambos tipos de ácido nucleico pero, aunque son funcionales en algunos casos, son un componente menor del virión.
si su éxito es a expensas de otros. Se considera que una infestación de insectos
restringida por baculovirus es beneficiosa, pero la pérdida de aves de corral por
infección por el virus de la influenza se considera desfavorable a pesar de que los
dos eventos pueden ser ecológicamente equivalentes. Ahora nos sentimos
completamente cómodos con el concepto de bacterias beneficiosas en el
ecosistema del cuerpo humano. ¿Tenemos que empezar a considerar que los
virus que han evolucionado con la especie también pueden tener propiedades
beneficiosas?
CARACTERÍSTICAS DE LOS VIRUS
Tras la definición operativa inicial de un virus como agente filtrable, se intentó
identificar las propiedades de los virus que los distinguieran de otros
microorganismos. Incluso desde los primeros tiempos era evidente que los
agentes filtrables no podían cultivarse en medios artificiales, y esta
característica particular ha resistido la prueba del tiempo, en el sentido de
que todos los virus son parásitos intracelulares obligados. Sin embargo,
todos los parásitos intracelulares obligados no son virus ( Cuadro 1.2 ). Los
miembros de ciertos géneros bacterianos tampoco pueden replicarse fuera
de una célula huésped (p. Ej.,
Ehrlichia, Anaplasma, Legionella, y Rickettsia). Estas bacterias "degeneradas"
carecen de vías metabólicas clave, cuyos productos deben ser proporcionados
por la célula huésped. Los virus, por el contrario, carecen de todas las
capacidades metabólicas necesarias para reproducirse, incluida la producción
de energía y los procesos necesarios para la síntesis de proteínas. Los virus no
poseen orgánulos celulares estándar, como mitocondrias, cloroplastos, Golgi y
retículo endoplásmico con ribosomas asociados. Sin embargo, los cianófagos
representan una excepción, ya que codifican proteínas involucradas en la
fotosíntesis que aumentan la aptitud viral al complementar los sistemas de la
célula huésped. De manera similar, ciertos bacteriófagos tienen genomas que
codifican enzimas involucradas en la ruta biosintética de nucleótidos. Fuera de
la célula viva, los virus son partículas inertes, mientras que, dentro de la célula,
el virus utiliza los procesos de la célula huésped para producir sus proteínas y
su núcleo.
La naturaleza de los virus Capítulo | 1 7
Micoplasmas Clamidias Virus
1 1 2
1 2 2
1 1 2
1 1 2
1 1 2
1 1 2
ácido para replicarse a sí mismo. Como se observará más adelante, la capacidad de
codificación proteica de los virus varía desde unas pocas proteínas hasta varios
cientos. Este rango de complejidad refleja los diversos efectos que tienen las
infecciones virales en el metabolismo de la célula huésped, pero el resultado de una
infección es el mismo: la producción de más virus descendientes.
Una segunda propiedad inviolable de los virus es que no se reproducen
por fisión binaria, un método de reproducción asexual en el que una célula
preexistente se divide en dos células hijas idénticas; en ausencia de sustrato
limitante, la población de células se duplicará con cada ciclo de replicación, y
en todos los puntos del ciclo de replicación existe una estructura que es
identificable como una célula intacta. Para los virus, el proceso de
reproducción se asemeja a una línea de ensamblaje en la que varias partes
del virus se unen desde diferentes partes de la célula huésped para formar
nuevas partículas de virus. Poco después de que el virus se adhiere a una
célula huésped, ingresa a la célula y la partícula de virus intacta deja de
existir. Luego, el genoma viral dirige la producción de nuevas macromoléculas
virales, lo que finalmente da como resultado el ensamblaje y la aparición de
nuevas partículas de virus de progenie. El período de tiempo entre la
penetración de la partícula de virus en la célula huésped y la producción de la
primera nueva partícula de virus se denomina período de eclipse, que varía
según la familia del virus. La interrupción de las células durante el período del
eclipse interrumpirá la liberación de importantes
números de infeccioso virus partículas.
De manera ininterrumpida, una sola partícula infecciosa puede replicarse dentro de
una sola célula susceptible para producir miles de partículas de progenie de virus.
A medida que se dispuso de técnicas analíticas más sensibles y se
identificaron más virus, algunos de los criterios que definían un virus se
volvieron menos absolutos. En general, los virus contienen solo un tipo de
ácido nucleico que transporta la información para replicar el virus. Sin
embargo, ahora está claro que algunos virus contienen moléculas de ácido
nucleico distintas de su ADN o ARN genómico. Para los retrovirus, los ARN
de transferencia celular (t) son esenciales para la
8 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica

reacción de transcriptasa inversa, y los estudios han demostrado que alrededor Ácidos nucleicos virales en el virión
de 50 100 moléculas de ARNt están presentes en cada virión maduro. De
Los virus exhiben una variedad notable con respecto a la composición del
manera similar, en los herpesvirus, las transcripciones virales y de la célula
genoma y en las estrategias para la expresión de sus genes y para la
huésped se localizan en la región del tegumento del virión maduro. Los primeros
replicación de su genoma. Si se considera la simplicidad de los viroides de
estudios definieron los virus por su diminuto tamaño; sin embargo, ahora se han
plantas de ARN (247401 nucleótidos) en un extremo y los pandoravirus
identificado virus "gigantes" que son físicamente más grandes que algunos
(2,47 megabases) en el otro, se podría concluir que los virus quizás han
micoplasmas, rickettsias y clamidia. Los mimivirus y pandoravirus que infectan a
explotado todos los medios posibles de replicación del ácido nucleico para
las amebas son excepciones notables a las reglas existentes: el virión de
una entidad a nivel subcelular. . El tipo y las características estructurales de
mimivirus es de aproximadamente 0,75 μ m (750 nm) de diámetro, con un
los ácidos nucleicos genómicos virales se utilizan para clasificar los virus.
genoma de ADN de 1,2 megabases (nucleótidos). Los pandoravirus son aún
Como los virus contienen solo un tipo de ácido nucleico con respecto a la
más grandes (hasta 1 μ m) con un genoma de hasta 2,5 megabases. Debido a su
transmisión de información genética, el mundo de los virus se puede dividir
tamaño de virión, estos virus grandes serían retenidos por filtros estándar de 300
simplemente en virus de ARN y virus de ADN ( Figura 1.1 ). Para los virus de
nm que se usan tradicionalmente para separar bacterias de virus. Los genomas
ARN, una distinción importante es si el ARN del virión es de sentido
de estos virus gigantes pueden incluir más de 1000 genes, incluidos los que
positivo o polaridad, directamente capaz de traducirse a proteína, o de
codifican proteínas potencialmente implicadas en la traducción de proteínas, la
sentido negativo o polaridad, lo que requiere la transcripción del genoma
reparación del ADN, la motilidad celular y la biogénesis de la membrana. Por
para generar equivalentes de ARNm. Dentro del grupo de hebra negativa,
ejemplo, los mimivirus codifican la aminoaciltRNA sintetasa que probablemente
hay virus de genoma completo de hebra única (p. Ej., Paramyxoviridae) y
proporciona cierta independencia de las vías de la célula huésped para la
virus de genoma segmentado (p. ej., Ortomixoviridae —Seis, siete u ocho
replicación del genoma viral. El descubrimiento de estos grandes virus ha
segmentos;
reavivado el debate sobre el origen de los virus. Además, los datos de secuencia
vinculan a los mimivirus con los virus nucleocitoplasmáticos de ADN grande,
específicamente los virus de las familias

Bunyaviridae —Tres segmentos; Arenaviridae —Dos segmentos). los Retroviridae

se consideran diploides, ya que el virión contiene dos ARN genómicos
completos de sentido positivo. Algunos virus de ARN poseen genomas
compuestos por ARN bicatenario. los Birnaviridae tenga dos
Poxviridae y Iridoviridae.

segmentos y el Reoviridae tienen 10, 11 o 12 segmentos, según el género

del virus. El tamaño de los genomas virales de ARN animal varía desde
Composición química del virión menos de 2 kilobases (kb) ( Deltavirus) a más de 30 kb para los virus de

La composición química de las partículas de virus varía notablemente ARN más grandes ( Coronaviridae).

entre las de las familias de virus individuales. Para los virus más simples,
como los parvovirus (familia Para los virus de ADN animal, la estructura general de los genomas

Parvoviridae), el virión está compuesto por proteínas estructurales virales es menos compleja, con una sola molécula de ADN monocatenario (ss) o

y ADN, mientras que en el caso de los picornavirus (familia Picornaviridae) una sola molécula de ADN bicatenario (ds). Para los virus dsDNA, la

comprende proteínas virales y ARN. La situación se vuelve más compleja complejidad varía desde el genoma circular superenrollado relativamente

con los virus envueltos, como los miembros de la Herpesviridae simple del Polyomaviridae y

y Paramyxoviridae familias. Estos tipos de virus maduran por gemación a través

Papillomaviridae ( 5 8 kbp) a la lineal Herpesviridae

de diferentes membranas de la célula huésped que son modificadas por la

(125235 kbp) con reordenamientos de secuencia variable. Los genomas

inserción de proteínas virales. En su mayor parte, las proteínas de la célula

virales del ssDNA son lineales ( Parvoviridae)

huésped no son un componente significativo de los virus, pero pueden estar

o circular Circoviridae y Anelloviridae), con tamaños que van desde 2,8 a 5

presentes cantidades menores de proteínas celulares en las membranas víricas y

kbp.
En general, el tamaño del genoma viral influye en la capacidad de
en el interior de la partícula del virus. El ARN de la célula huésped, como el ARN
codificación de proteínas del virus, pero no existe un cálculo simple que
ribosómico, se puede encontrar en los viriones, pero no hay evidencia de un
calcule de manera confiable esta relación. Partes del genoma viral son
papel funcional en la replicación del virus. Para los virus envueltos, las
típicamente elementos reguladores necesarios para la traducción de proteínas
glicoproteínas son el tipo principal de proteína presente en el exterior de la
virales, la replicación del genoma y la transcripción de genes virales
membrana. La existencia / presencia de una envoltura lipídica proporciona un
(promotores, señales de terminación, sitios de poliadenilación, sitios de
método operativo con el que separar los virus en dos clases distintas: los que son
empalme de ARN, etc.). Para obtener ejemplos específicos y una discusión
inactivados por disolventes orgánicos (envueltos) y los que son resistentes (no
más detallada, el lector puede consultar el Capítulo 2, Replicación de virus.
envueltos).
 La naturaleza de los virus Capítulo | 1 9

FIGURA 1.1 Representación esquemática del espectro de tipos morfológicos representados por virus animales. De King, AM, Adams, MJ, Carstens, EB, Lefkowitz, EJ, (Eds.), 2012. Taxonomía de
virus: Noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Elsevier Academic Press, San Diego, CA, pág. 20. Derechos de autor r Elsevier (2012), con autorización.

proceso de replicación, como la regulación de la expresión génica, la replicación

Proteínas virales en el virión
Los genomas de los virus animales codifican desde tan solo una proteína hasta
más de 100. Las proteínas que están presentes en los viriones (partículas de
virus maduros) se denominan proteínas estructurales, mientras que las proteínas
que se producen durante la infección pero no se incorporan en recién
ensamblados Las partículas de virus se denominan proteínas no estructurales.
Las proteínas no estructurales juegan un papel esencial en el virus.
del genoma, el procesamiento proteolítico de proteínas precursoras virales, la
facilitación del ensamblaje de partículas virales o la modificación de la respuesta
innata del huésped a la infección. Existe cierta ambigüedad para las enzimas
que son esenciales para las etapas iniciales de la replicación del virus, como las
ARN polimerasas para los virus de ARN de cadena negativa ( Paramyxoviridae,
Rhabdoviridae, etc.). Como primer paso en el ciclo de replicación, una vez que
la nucleocápside
10 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica

ingresa al citoplasma, se transcribe el genoma viral, lo que requiere que la
polimerasa sea parte del virión maduro. Es menos seguro si la polimerasa
tiene un verdadero papel estructural en la partícula madura además de su
actividad de transcripción. Numerosas otras proteínas virales que se
encuentran dentro de los viriones de virus complejos ( Poxviridae,
Herpesviridae, Asfarviridae) también parecen no tener un papel estructural
aparente.
Las proteínas de virión se dividen en dos clases generales: proteínas
modificadas y proteínas no modificadas. Las cápsides de los virus sin envoltura
están compuestas por proteínas con pocas modificaciones, ya que sus interacciones
directas de aminoácidos son esenciales para el ensamblaje de las capas proteicas.
La escisión proteolítica de las proteínas precursoras en la cápside naciente no es
infrecuente en los pasos finales del ensamblaje de las proteínas maduras de la
cápside. Las glicoproteínas se encuentran predominantemente en aquellos virus que
contienen una membrana viral. Estas proteínas estructurales pueden ser una
proteína de membrana integral de tipo I (exterior del extremo amino) (p. Ej.,
Hemaglutinina (HA) del virus de la influenza) o de tipo II (exterior del extremo
carboxilo) (p. Ej., Neuraminidasa del virus de la influenza). Los patrones de
glicosilación pueden diferir incluso entre virus que maduran en los mismos tipos de
células, porque NORTE- y O- los sitios de glicosilación enlazados en las proteínas del
virión varían entre las familias de virus. Las glicoproteínas involucradas en el
ensamblaje del virión tienen una cola citoplasmática que se comunica con las
proteínas virales en la superficie interna de la membrana para iniciar el proceso de
maduración para la producción de la partícula infecciosa del virus. Las proteínas
estructurales en la partícula de virus infeccioso tienen varias funciones clave: (1)
proteger el ácido nucleico genómico y las enzimas asociadas de la inactivación; (2)
para proporcionar sitios de unión al receptor para el inicio de la infección; y (3) para
iniciar o facilitar la penetración del genoma viral en el compartimento correcto de la
célula para la replicación.
El virión —es decir, la partícula completa del virus— de un virus simple
consiste en una sola molécula de ácido nucleico (ADN o ARN) rodeada por una
cápside morfológicamente distinta compuesta de subunidades de proteínas
víricas (polipéptidos codificados por virus). Las subunidades de proteínas
pueden autoensamblarse en unidades multiméricas (unidades estructurales),
que pueden contener una o varias cadenas polipeptídicas. Las estructuras sin el
ácido nucleico se pueden detectar y se denominan cápsides vacías. El
significado del término nucleocápside puede ser algo ambiguo. En sentido
estricto, una cápside con su ácido nucleico es una nucleocápside, pero para
virus simples como el poliovirus, esta estructura también es el virión. Para los
flavivirus, la nucleocápside (cápside 1 ARN) está encerrado en una envoltura
lipídica y la nucleocápside no representa el virión completo. Para los
paramixovirus, la nucleocápside se refiere a una estructura compuesta por una
sola hebra de ARN complejado con una proteína viral que se ensambla en forma
de α hélice. La nucleocápside se ensambla en un virión completo al obtener una
envoltura lipídica de las membranas de la célula huésped modificadas por la
inserción de proteínas virales.
Lípidos de la membrana viral
Para los virus que maduran por gemación a través de una membrana celular,
un componente principal del virión es una bicapa de fosfolípidos que forma la
base estructural de la envoltura viral. El sitio de maduración de los virus puede
ser la membrana plasmática, la membrana nuclear, el aparato de Golgi o el
retículo endoplásmico. Para los virus que brotan de la membrana plasmática, el
colesterol es un componente de la membrana viral, mientras que las envolturas
de los virus que brotan de las membranas internas carecen de colesterol. El
proceso de gemación no es aleatorio, ya que secuencias específicas de
glicoproteínas virales dirigen las partículas en desarrollo a la ubicación
adecuada dentro de la superficie de la membrana interna. En las células
polarizadas (células con uniones estrechas, que dan a la célula una superficie
apical y basal definida), la gemación del virus se dirigirá a una superficie sobre
la otra. Por ejemplo, en las células renales caninas de Madin Darby, el virus de
la influenza brota en la superficie apical, mientras que el virus de la estomatitis
vesicular brota de la superficie basal (v. fig. 2.13). El dominio transmembrana
de las glicoproteínas virales se dirige a regiones específicas de la membrana
celular para la gemación. En el caso del virus de la influenza, la gemación se
asocia con "balsas de lípidos", que son microdominios de la membrana
plasmática ricos en esfingolípidos y colesterol.
MORFOLOGÍA VIRAL
Los primeros intentos de caracterizar los virus se vieron obstaculizados por la
falta de tecnologías apropiadas. Un avance importante en la determinación de la
morfología del virus fue el desarrollo de la microscopía electrónica de tinción
negativa en 1958. En este procedimiento, se utilizaron tinciones densas en
electrones para recubrir las partículas del virus y producir una imagen negativa
del virus con una resolución mejorada ( Figura 1.2 ). Figura 1.1 describe el
espectro de tipos morfológicos representados por virus animales. Dada la
notable variación en el tamaño de los viriones de diferentes virus, desde hasta
1000 nm hasta tan solo 20 nm, no es sorprendente que se hayan observado
inconsistencias en los estudios históricos de filtración.
Los avances en la determinación de la morfología del virus a nivel
atómico provienen de estudios que inicialmente utilizaron cristalografía de
rayos X y luego combinaron esta técnica con otras técnicas estructurales
como la criomicroscopía electrónica (crio-EM). En este proceso, las
muestras se congelan rápidamente y se examinan a temperaturas de
nitrógeno líquido o helio líquido ( Figura 1.3 ). Cryo-EM ofreció la ventaja de
que las muestras no se dañan ni se deforman en el proceso de análisis de
la estructura, como ocurre con la microscopía electrónica de tinción
negativa y la cristalografía de rayos X. Sin embargo, las imágenes
individuales generadas por este proceso son de menor resolución que las
obtenidas con cristalografía. Críticos para estos análisis fueron los
desarrollos en hardware y software de computadora que
 La naturaleza de los virus Capítulo | 1 11

FIGURA 1.2 ( A) Modelo de partícula del virus del mosaico del tabaco (TMV). También se muestra el ARN, ya que se cree que participa en el proceso de ensamblaje. (B) Micrografía electrónica de
contraste negativo de partículas de TMV teñidas con acetato de uranilo. La barra representa 100 nm. De King, AM, Adams, MJ, Carstens, EB, Lefkowitz, EJ, (Eds.), 2012. Taxonomía de virus:
Noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Elsevier Academic Press, San Diego, CA, pág. Derechos de autor 1154. r Elsevier (2012), con autorización.

FIGURA 1.3 ( A) Reconstrucción de crioimagen de partículas recombinantes similares al virus Norwalk (NV) (rNV VLP). (B) Reconstrucción de imágenes criogénicas de calicivirus de primates. Se
marca un conjunto de ejes icosaédricos de cinco y tres ejes. (C) Sección transversal central de rNV VLP. (D) Representación electrónica del virus Norwalk. (E) Representación esquemática de una
estructura icosaédrica T53. (F) Micrografía electrónica de tinción negativa de partículas de calicivirus bovino. La barra representa 100 nm. De Fauquet, CM, Mayo, MA, Maniloff, J., Desselberger, U.,
Ball, LA, (Eds.), 2005. Taxonomía de virus: Octavo informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Academic Press, Nueva York, NY, pág. 843. Copyright r Elsevier (2005), con
autorización.
12 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica
Pudimos capturar, analizar y construir las imágenes tridimensionales a
partir de literalmente miles de determinaciones. Este proceso de
"promediado" solo puede funcionar si las partículas del virus son
uniformemente del mismo tamaño y forma. Para muchos virus, esta
uniformidad se logra al tener la simetría de un tipo de poliedro conocido
como icosaedro. Para las partículas virales intactas que muestran simetría
icosaédrica, se pudo identificar la ubicación física de los péptidos
individuales y se mapearon las áreas de los péptidos plegados que están
en la superficie del virión. Estas áreas podrían estar vinculadas a los
epítopos específicos reconocidos por los anticuerpos monoclonales. En
otros estudios, se mapeó el sitio de unión en el virión para el receptor
celular, lo que abrió la posibilidad de desarrollar medicamentos antivirales
dirigidos a estas áreas definidas. Figura 1.4 ). El impacto de las mutaciones
en el péptido HA en relación con los cambios en la unión de anticuerpos o
receptores de la célula huésped podría determinarse con estas
tecnologías avanzadas.
Los virus vienen en una variedad de formas y tamaños que dependen
de la forma, el tamaño y el número de sus subunidades de proteínas y la
naturaleza de las interfaces entre estas subunidades ( Figura 1.1 ). Sin
embargo, solo dos tipos de
FIGURA 1.4 Estructura cristalina de la proteína HA del virus
de la influenza 1918 y comparación con otras HA humanas,
aviares y porcinas. (A) Descripción general del trímero
18HA0, representado como un diagrama de cinta. Cada
monómero tiene un color diferente. (B) Comparación
estructural del monómero 18HA0 (rojo) con H3 humano
(verde), H5 aviar (naranja) y H9 de cerdo (azul) HA0. De
Stevens, J., Corper, AL, Basler, CF, Taubenberger, J.
K., Palese, P., Wilson, IA, 2004. Estructura de la
hemaglutinina H1 humana no escindida del extinto virus de la
influenza de 1918. Ciencia 303,
1866 1870, con autorización.
Se ha reconocido la simetría en partículas de virus: icosaédrico y helicoidal.
La simetría que se encuentra en los virus isométricos es invariablemente la
de un icosaedro; los viriones con simetría de icosaedro tienen 12 vértices
(esquinas), 30 aristas y 20 caras, con cada cara un triángulo equilátero.
Los icosaedros tienen simetría rotacional de dos, tres y cinco veces, con
los ejes pasando por sus bordes, caras y vértices, respectivamente ( Figura
1.5 ). El icosaedro es la solución óptima al problema de construir, a partir
de subunidades repetidas, una estructura fuerte que encierre un volumen
máximo. Los parvovirus representan uno de los diseños de cápside más
simples, y están compuestos por 60 copias de la misma subunidad de
proteína: tres subunidades por cara del icosaedro. La proteína se pliega en
una estructura denominada "jelly-roll" β- barril ”que forma un perfil en forma
de bloque con una extensión en forma de brazo que proporciona el punto
de contacto con otras subunidades para estabilizar las interacciones
proteína-proteína. En la disposición más simple, el tamaño de la subunidad
proteica determina el volumen de la cápside. Con una sola proteína de la
cápside de 60 copias, solo un pequeño genoma puede acomodarse dentro
de la cápside (parvovirus canino 5 5,3 kb ssDNA). Las explicaciones de las
formas en que los virus mantienen la simetría del icosaedro con unidades
estructurales repetidas están más allá del alcance de este texto.
 La naturaleza de los virus Capítulo | 1 13

FIGURA 1.5 ( A) Una cápside icosaédrica contiene 60 copias idénticas de la subunidad proteica (azul) marcada A; estos están relacionados por cinco (pentágonos amarillos en los vértices), tres (triángulos amarillos en las caras) y dos (elipses amarillos en los

bordes) elementos de simetría. Para una subunidad de tamaño dado, esta simetría de grupo de puntos genera el ensamblaje más grande posible (60 subunidades) en el que cada proteína se encuentra en un entorno idéntico. (B) Representación esquemática del

bloque de construcción de la subunidad que se encuentra en muchas estructuras virales de ARN y algunas de ADN. Tales subunidades tienen superficies interfaciales complementarias que, cuando interactúan repetidamente, conducen a la simetría del

icosaedro. La estructura terciaria de la subunidad es un barril de ocho hilos con la topología del jelly-roll. Los tamaños de las subunidades generalmente oscilan entre 20 y 40 kDa, con variación entre diferentes virus que se producen en el extremo C-terminal de

Nand y en el tamaño de las inserciones entre las hebras de la hoja. Estas inserciones generalmente no ocurren en el extremo estrecho de la cuña (giros BC, HI, DE y FG). (C) La topología de viral-barril, que muestra las conexiones entre las hebras de las hojas

(representadas por flechas amarillas o rojas) y las posiciones de las inserciones entre las hebras. Los cilindros verdes representan hélices que habitualmente se conservan. Los bucles CD, EF y GH suelen contener inserciones grandes. mostrando las conexiones

entre las hebras de las hojas (representadas por flechas amarillas o rojas) y las posiciones de las inserciones entre las hebras. Los cilindros verdes representan hélices que habitualmente se conservan. Los bucles CD, EF y GH suelen contener inserciones

grandes. mostrando las conexiones entre las hebras de las hojas (representadas por flechas amarillas o rojas) y las posiciones de las inserciones entre las hebras. Los cilindros verdes representan hélices que habitualmente se conservan. Los bucles CD, EF y

GH suelen contener inserciones grandes. De Mahy, BWJ, van Regenmortel, MHV, (Eds.), 2008. Encyclopedia of Virology, tercera edición, vol. 5, Elsevier, Oxford, pág. 394. Derechos de autor r Academic Press / Elsevier (2008), con autorización.

La nucleocápside de varios virus de ARN se autoensambla como una
estructura cilíndrica en la que las unidades estructurales de la proteína están
dispuestas como una hélice, de ahí el término
simetría helicoidal. Es la forma y la aparición repetida de interfaces de
proteína proteína idénticas de las unidades estructurales lo que conduce al
ensamblaje simétrico de la hélice. En las nucleocápsidas helicoidales
simétricas, el ARN genómico forma una espiral dentro del núcleo de la
nucleocápside. El ARN es el elemento organizador que alinea correctamente
las unidades estructurales. Muchos de los virus vegetales con
nucleocápsides helicoidales tienen forma de varilla, son flexibles o rígidos sin
envoltura. Sin embargo, con los virus animales, la nucleocápside helicoidal
se enrolla en una espiral secundaria y se encierra dentro de una envoltura
de lipoproteínas ( Rhabdoviridae; Figura 1.6 ).
Hay, inevitablemente, virus que no se ajustan a las simples reglas de
la morfología. Por ejemplo, los miembros de la
Poxviridae tienen simetría "compleja" (ver Capítulo 7:
Poxviridae). Del mismo modo, hay muy pleomórficos
virus en los que cada virión tiene su propia forma única (por ejemplo, miembros
de la Filoviridae, ver Capítulo 19: Filoviridae).
TAXONOMÍA VIRAL
Con el reconocimiento más temprano de que los agentes infecciosos estaban
asociados con un espectro dado de resultados clínicos, era natural que un
agente tomara el nombre de la enfermedad con la que estaba asociado o la
ubicación geográfica donde se encontró, ya que no había otros base para
asignar un nombre. Por lo tanto, el agente que causó la fiebre aftosa en el
ganado se convierte en "virus de la fiebre aftosa", o un agente que causó una
enfermedad febril en el Valle del Rift de África se convirtió en el "virus de la
fiebre del Valle del Rift". No es difícil en este momento de la historia ver por
qué este método ad hoc de nombrar agentes infecciosos podría generar
confusión y caos regulatorio, ya que pueden darse diferentes nombres al
mismo virus. Por ejemplo, el virus del cólera porcino existía en América del
Norte, mientras que en el resto del mundo
14 PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica

FIGURA 1.6 ( Izquierda) Diagrama que ilustra un virión de rabdovirus y la estructura de la nucleocápside cortesía de P. Le Merder, ( derecha) micrografía electrónica de contraste negativo de viriones de un
aislado del virus de la estomatitis vesicular de Indiana. La barra representa 100 nm. De King, AM, Adams, MJ, Carstens, E.
B., Lefkowitz, EJ, (Eds.), 2012. Taxonomía de virus: Noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Elsevier Academic Press, San Diego, CA, pág. 687. Copyright r Elsevier
(2012), con autorización.

se denominó virus de la peste porcina clásica, que no debe confundirse con el
virus de la peste porcina africana. Dentro del mismo animal, uno tenía el virus
de la rinotraqueítis infecciosa bovina (IBR) y el virus de la vulvovaginitis
pustulosa infecciosa bovina (IBPV), ambas entidades patológicas causadas
por el herpesvirus bovino 1. Incluso hoy en día, los documentos de
certificación de exportación pueden requerir pruebas para certificar animales
libres de IBR virus y Virus IBPV. Esta nomenclatura ligada a enfermedades no
podría cambiarse hasta que se dispusiera de herramientas para definir la
naturaleza física y química de los virus. Con la microscopía electrónica de
tinción negativa como tecnología fácilmente disponible, el tamaño y la forma
de los virus se convirtió en una característica para definirlos. Esto, junto con la
capacidad de definir el tipo de ácido nucleico en la partícula del virus,
proporcionó el comienzo de un sistema más racional de clasificación y
denominación de nuevos virus. Incluso con una forma definida y un tipo de
ácido nucleico, todavía existían ambigüedades en los sistemas de
clasificación que se estaban desarrollando. Los virus que fueron transmitidos
por insectos vectores se definieron vagamente como " arbovirus ”- virus
transmitidos por artrópodos. Sin embargo, había virus que "parecían"
arbovirus (togavirus, virus con un
membrana lipídica simétrica) y tenía el mismo ácido nucleico, pero no tenía
un insecto vector. Estos se convirtieron en togavirus "no transmitidos por
artrópodos". Estas ambigüedades se resolvieron cada vez más con el
acceso a las secuencias de nucleótidos de estos agentes. Así, por ejemplo,
los togavirus "nonarbo" se convirtieron en miembros del género Rubivirus,
Pestivirus, y familia Arteriviridae.
Mientras que los virus inicialmente se clasificaron según las enfermedades que
causaban, compartían propiedades físicas y químicas y reactividad cruzada
serológica, el advenimiento de las tecnologías de secuenciación de ácidos nucleicos
desarrolladas en la era molecular permitió comparaciones genéticas de diferentes
virus para facilitar las clasificaciones taxonómicas. En general, las relaciones
genéticas son paralelas a las establecidas previamente por los criterios más
antiguos. La secuenciación de virus también permite realizar comparaciones
filogenéticas para determinar el desarrollo evolutivo y la historia de las especies
virales. Esta es una herramienta poderosa para definir las ascendencias virales. Sin
embargo, una limitación importante de la clasificación basada en secuencias es que
las inferencias se ven comprometidas por la naturaleza variable de los virus,
especialmente para los virus de ARN altamente divergentes. A pesar de ello, las
filogenias que analizan los motivos más conservados de

Se han utilizado secuencias de ARN polimerasa dependiente de ARN viral para
generar clasificaciones de orden superior que definen “supergrupos” virales y
establecen distinciones a nivel familiar. Por ejemplo, los análisis filogenéticos de
virus que incluyen retrovirus y hepadnavirus con actividad de transcriptasa inversa
han sido más informativos que las secuencias de polimerasa debido a un mayor
grado de conservación de la secuencia de genes de transcriptasa inversa. Los
nuevos métodos que se están desarrollando actualmente para eludir inferencias a
partir de secuencias incluirán comparar la organización del genoma (por ejemplo,
el contenido y el orden de los genes) así como la estructura secundaria de las
proteínas.
El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) se estableció en
1966 para establecer, perfeccionar y mantener un sistema universal de
taxonomía de virus. Dados los orígenes inciertos de los virus, el
establecimiento del marco inicial de este sistema de clasificación no estuvo
exento de controversias. Los subcomités y grupos de estudio se reúnen
periódicamente para evaluar los nuevos datos presentados por la comunidad
de investigadores para refinar el sistema de clasificación y colocar los nuevos
virus en su posición más lógica en el esquema de taxonomía. No fue hasta el
Séptimo Informe de la ICTV (2000) que se aceptó el concepto de especie de
virus como el grupo más bajo en los taxones virales. El advenimiento de la
determinación de la secuencia de nucleótidos tuvo un efecto dramático en
todos los sistemas de clasificación biológica, y en muchos aspectos ha
confirmado los elementos principales del sistema de clasificación. Dado que el
proceso de clasificación y definición de nomenclatura es continuo debido al
descubrimiento de nuevos virus y la generación de datos de secuencia sobre
aislados de virus históricos, es imposible que un libro de texto esté realmente
"actualizado". Este libro de texto utilizará la información presentada en el
Noveno Informe de la ICTV publicado en 2011, actualizado por el recurso en
línea de ICTV ( http://www.ictvonline.org/ index.asp ).
La jerarquía de taxones virales reconocidos es: orden; Familia;
(Subfamilia); Género; Especies. Por ejemplo, el virus sincitial respiratorio
humano A2 se encontraría en este sistema como: Mononegavirales ( orden);
Paramyxoviridae ( familia); Pneumovirinae ( subfamilia); Neumovirus ( género);las propiedades generales de familias de virus específicas pueden ayudar en la
Virus sincitial respiratorio humano ( especies). El informe de ICTV de 2011
enumera 2284 especies de virus y viroides distribuidos entre 349 géneros,
19 subfamilias, 87 familias y 6 órdenes. Para ser miembro de un taxón
superior a una especie, un virus debe tener todas las propiedades que
definen la clasificación. Por el contrario, las especies se consideran un clase
politética, en el que los miembros tienen varias propiedades en común pero
no todos tienen que compartir una sola propiedad definitoria. Para cada
género, se ha designado un especie tipo, que es una especie que crea un
vínculo entre el género y la especie. Esta designación generalmente se
otorga a las especies que requirieron la creación del género. La literatura de
virología publicada contiene obvias inconsistencias con respecto a si el
nombre de un virus específico es
La naturaleza de los virus Capítulo | 1 15
en mayúscula y / o en cursiva: Virus de la diarrea viral bovina versus el virus de la
diarrea viral bovina, por ejemplo. En todos los casos relacionados con la taxonomía,
el orden, la familia, la subfamilia y los nombres de género deben escribirse en cursiva
y en mayúscula. Al hablar de un virus en el contexto de la taxonomía a nivel de
especie, el nombre se escribe en cursiva y la primera palabra se escribe en
mayúscula: por ejemplo, Virus del moquillo canino es una especie del género Morbillivirus.
Sin embargo, cuando se escribe sobre un virus en términos de propiedades tangibles
como su capacidad para causar enfermedades, el crecimiento de ciertas líneas
celulares o sus características físicas, el nombre no se escribe en cursiva ni en
mayúscula a menos que el nombre contenga un nombre propio; por ejemplo, se
puede desarrollar el virus del moquillo canino o el virus del Nilo Occidental en células
de mono. Hay casos en los que el resumen (taxonomía) y los aspectos concretos de
un virus no están claros en el contexto de la oración. En este libro de texto
intentaremos utilizar las convenciones de ICTV cuando sea claramente apropiado,
pero como este texto trata principalmente de los aspectos tangibles de los virus, la
mayoría de los nombres de virus no estarán en cursiva.
Una pregunta básica que aún no se ha abordado es por qué deberíamos
preocuparnos por la taxonomía. Para algunos, parece haber una necesidad
humana de colocar las cosas en un sistema ordenado. Al caracterizar una
entidad y definir una nomenclatura, se puede lograr una comprensión básica del
tema en estudio. En un contexto más amplio, la taxonomía proporciona una
herramienta para comparar un virus con otro o una familia de virus con otra.
También permite asignar propiedades biológicas a un nuevo virus que está
temporalmente vinculado a una familia determinada. Por ejemplo, si uno tiene
una imagen micrográfica electrónica de un nuevo virus que respalda su
identidad como coronavirus, entonces el descubridor puede asumir que ha
identificado un virus de ARN monocatenario, de sentido positivo y no
segmentado. Además, se puede extrapolar que los coronavirus se asocian
principalmente con enfermedades entéricas, pero también puede causar
enfermedades respiratorias en huéspedes "atípicos" después de "salto de
especies". Como grupo, los coronavirus son difíciles de cultivar in vitro, y puede
requerir la presencia de una proteasa para potenciar el crecimiento en cultivo de
tejidos. Las secuencias conservadas, tal vez en la nucleocápside, podrían
proporcionar un objetivo para el desarrollo de una prueba de PCR. Por tanto, la
identificación de la morfología de un virus desconocido puede ser útil, ya que
interpretación de casos clínicos individuales. Por ejemplo, confirmar que un
alfaherpesvirus fue aislado de un caso particular, o su presencia identificada
mediante un análisis profundo de secuencia de material clínico, confiere
algunos conocimientos básicos sobre el virus sin tener que definir
explícitamente las propiedades de la especie de virus específica responsable.
Sin embargo, la taxonomía actual de virus no está exenta de confusión. Existe
una variación sustancial en cómo se clasifican los virus actualmente dentro de
familias individuales; por ejemplo, Flaviviridae
(género Flavivirus) todavía están agrupados de acuerdo con sus relaciones
serológicas, mientras que los virus en la familia
dieciséis PARTE | I Los principios de la virología veterinaria y zoonótica
Picornaviridae se subdividen cada vez más en géneros en función de la
secuencia y organización de su genoma. Además, la designación de una
"especie de virus" puede incluir una variedad de otros "aislados de virus" de
modo que, a pesar de sus propiedades biológicas y rango de hospedadores
muy diferentes (tropismo de especies), el virus de la panleucopenia felina y el
parvovirus canino 2 son representantes de Protoparvovirus carnívoro 1 ( ver el
Capítulo 12: Parvoviridae).
Las propiedades más detalladas de las familias de virus que incluyen
patógenos importantes de relevancia veterinaria se encontrarán en capítulos
específicos de la Parte II de este texto.
Comparación filogenética de secuencias de virus
Antes del advenimiento de la biología molecular, los virus se clasificaban según
sus relaciones serológicas. Las tecnologías de secuenciación desarrolladas en la
era molecular han permitido la comparación genética de virus, que generalmente
coinciden con las relaciones que se definieron previamente serológicamente. Las
filogenias son descripciones pictóricas en forma de árbol de la historia evolutiva de
una especie o familia de virus en particular, donde cada punta de rama representa
una secuencia de virus específica; estos "árboles" generalmente se generan
basándose en la comparación de secuencias de la región más conservada del
genoma viral (para ejemplos representativos, véanse las Figs. 17.1, 18.1 y 21.2).
Aunque las inferencias basadas en datos de secuencias virales se ven
comprometidas por la naturaleza variable de los virus, especialmente para los
virus de ARN altamente divergentes, filogenética ha demostrado ser útil para
generar clasificaciones de orden superior para definir "supergrupos" de virus. Más
allá de su importancia para la taxonomía de virus, el advenimiento de la virología
molecular marcó el comienzo de una nueva era para el estudio de la evolución de
los virus a través de comparaciones filogenéticas. Este enfoque se utilizó, entre
muchos ejemplos, para determinar que el VIH se originó a partir de VIS que
infecta a primates no humanos. A filodinámica El enfoque también se puede utilizar
para inferir los orígenes, la epidemiología y la dinámica de los virus durante las
epidemias. Al comparar las secuencias de genes de los virus y el análisis de
árboles filogenéticos, se puede obtener información valiosa sobre el crecimiento y
la disminución de la población de virus, el grado de subdivisión de la población y la
migración viral. Estos enfoques resultan especialmente útiles para los virus de
ARN que cambian rápidamente, lo que permite la resolución
de relaciones filogenéticas entre muestras obtenidas con solo días de
diferencia, por ejemplo. También se utilizan para documentar la dispersión de
virus específicos, como los virus de la influenza entre aves y humanos.
En la mayoría de los casos, las filogenias solo muestran el orden evolutivo y
no el tiempo entre dos secuencias, a menos que se apliquen modelos especiales
de reloj molecular. Para los virus que se recombinan o reagrupan, las filogenias
válidas también requieren
análisis de múltiple genómico regiones.
Los análisis filogenéticos pueden tomar muchas formas, aunque
invariablemente dan como resultado la generación de un árbol filogenético. Vecino
uniéndose los algoritmos de construcción de árboles calculan la distancia
genética, medida a través de una matriz, entre cada par de secuencias virales
que se comparan; la topología resultante minimiza la distancia entre vecinos
más cercanos. Este enfoque es rápido y, por lo tanto, se ve favorecido para
generar un árbol tentativo o para elegir el mejor árbol entre múltiples opciones,
pero dado que los datos de secuencia se reducen a una matriz de distancia al
principio, si la matriz es incorrecta, se puede producir un árbol falso. Máxima
parsimonia es un método estadístico no paramétrico para producir árboles
donde las ramas se colocan de la manera más simple posible para soportar un
cambio evolutivo mínimo. Los algoritmos de parsimonia se utilizan mejor
cuando los virus comparten una alta conservación genética y cuando el
número de secuencias que se analizan es bajo, ya que el método requiere
mucho tiempo. No siempre se garantiza que el enfoque produzca un árbol
verdadero con alta probabilidad, especialmente cuando la evolución es rápida.
Un tercer enfoque, máxima verosimilitud,
que utiliza un modelo estadístico paramétrico para proporcionar estimaciones de
los parámetros en el modelo y luego determina la probabilidad de observar la
topología del árbol dado el modelo, es incluso más lento que la parsimonia, pero
se favorece para confirmar árboles construidos con otros algoritmos,
especialmente con datos pequeños conjuntos, ya que se ve menos afectado por
el error de muestreo en comparación con los otros métodos. Los árboles
generados con los tres algoritmos se basan en análisis bootstrap, normalmente se
informa en los nodos de sucursal, para proporcionar soporte estadístico para sus
topologías. Los valores de arranque de 95 o más son estadísticamente robustos e
indican que si el árbol se reconstruyera 100 veces usando el mismo método, las
mismas posiciones relativas de las secuencias en el nodo ocurrirían 95 de cada
100 veces.