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Silvia M. Becerra B.
sbecerra521@unab.edu.co
1
Presaberes
2
Evaluación - Calificación
Clases magistrales
Tutorias Talleres
Trabajo previo:
Puntualidad Solución de
lecturas, ejercicios,
inquietudes
solución preguntas
Lecturas previas
Revisar los espacios
Quices, trabajos
Asistencia asignados
cortos
semanalmente
Quiz acumulativo
(tercera semana de
clases)
3
9
10
Libros para consultar
BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA
Libros básicos:
1. Genética en Medicina. Thompson & Thompson. 8ª edición (2016). R. L. Nussbaum, R.R. McInnes y
H.F. Willard. Elsevier-Masson, S.A., Barcelona.
2. Genetics, a conceptual approach. Benjamin A. Pierce. 7th edición (2019). W.H. Freeman. New York.
3. Genética Médica. 6ª edición (2020). L.B. Jorde, J.C. Carey, M.J. Bamshad y R.L. White. Elsevier
España, S.A.
Libros complementarios:
4. Human Genetics. R. Lewis (2018). 12th edition. McGraw-Hill International.
5. Human Molecular Genetics. T. Strachan y A.P. Read (2019). Garland publishing. 5th edition.
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BASES MOLECULARES DE
LAS VARIANTES GENÉTICAS
Silvia M. Becerra B.
sbecerra521@unab.edu.co
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Agenda
Organización del genoma
1
Variabilidad genómica y
2 naturaleza de las mutaciones
Today’s
Topics
3
Tipos de mutaciones
4
Significado clínico de las
mutaciones
19
Genetic variation
22
Genetic variation
23
Genetic variation
Polymorphism Mutation
25
Genomic variablity
• Versiones alternativas de la
secuencia de ADN en un locus:
alelos
• Alelo natural, normal,
salvaje o común (wild)
• Alelo variante (mutant)
27
Human genome organization
30
Genomic variablity
Las variaciones ocurren cuando la secuencia de referencia del
ADN cambia, y se pueden clasificar en dos categorías:
35
Genomic variablity
36
Genomic variablity
POLIMORFISMO:
Se refiere a la ocurrencia
de alelos múltiples en un
locus, donde al menos
dos alelos aparecen con
una frecuencia >1% en
la población general
37
Genomic variablity
POLIMORFISMO: Algunos ejemplos…
Polimorfismo tipo microsatélite
Polimorfismo tipo elemento de inserción Alelo 1
Alelo 2
Alelo 3
Alelo 1
Alelo 2
Alelo 1
Alelo 2
Alelo 2
38
Mutations and gene expression
39
Mutations and gene expression
Efecto en el fenotipo
Alelo 1
Alelo 2
Jorde, L.; Carey, J.; y Bamshad, M. (2016). Medical Genetics. Canada: Elsevier.
42
Mutations and gene expression
Efecto en el fenotipo
Alelo 1
Alelo 2
Jorde, L.; Carey, J.; y Bamshad, M. (2016). Medical Genetics. Canada: Elsevier.
43
Mutations and gene expression
Efecto en el fenotipo
Alelo 1
Alelo 2
Mutación dominante negativa (alelo 2): produce
una proteína anormal que interfiere con la función
de la proteína norma producida por el alelo 1
Jorde, L.; Carey, J.; y Bamshad, M. (2016). Medical Genetics. Canada: Elsevier.
44
Mutations and gene expression
45
Mutations and gene expression
46
Types of mutations
51
Mutations and gene expression
52
Types of mutations
Substitutions (point mutations)
Sustituciones de bases (base substitution)
Transición: A-T -> G-C; G-C-> A-T; C-G -> T-A; T-A -> C-G
Transversión: AT->CG, … (8 posibilidades)
53
Types of mutations
Structural effects: coding sequences
1. Silenciosas (silent):
55
Types of mutations
Structural effects: coding sequences
2. De cambio de sentido (missense mutation):
56
Types of mutations
Structural effects: coding sequences
3. Sin sentido (nonsense mutation):
57
Types of mutations
Structural effects: noncoding sequences
58
Types of mutations
Structural effects: noncoding sequences
Splicing
normal
60
Types of mutations
Insertions and deletions
2. Inserciones y deleciones.
• Inserciones: resultan del agregado de una base extra, entonces ATG CAT
CCA podría ser copiada como
ATG CAT CCCA
61
Types of mutations
Insertions and deletions
Cambio de encuadre (frameshift mutations)
62
Types of mutations
Insertions and deletions
De cambio de encuadre (frameshift mutations): Por delección o inserción.
In-frame insertion o In-frame deletion: no afectan la lectura del
encuadre (non-frameshift)
63
Types of mutations
Structural effects: coding sequences
64
Types of mutations
Repeat alteration
3. De expansión de repetición de tripletes:
Aumento del número de tripletes desde el número normal hasta número en
cual se desencadena la enfermedad.
65
Types of mutations
Repeat alteration
3. De expansión de repetición de tripletes:
66
70
Types of mutations
Repeat alteration
72
Types of mutations
Repeat alteration
3. De expansión de repetición de tripletes:
75
Types of mutations
Repeat alteration
3. De expansión de repetición de tripletes:
• Suelen presentar el fenómeno de anticipación
76
Types of mutations
79
Germline and somatic mutations
Mutación Gametos
germinal
Mutación
Embrión somática
Área
La afectada
mutación
se
encuentra Individuo
en todo el
cuerpo
La mitad de los
Ninguno de los
gametos
gametos tiene
tienen la
la mutación
mutación
80
Germline and somatic mutations
83
Germline and somatic mutations
84
Clinical significance
85
Summary
• A point mutation is a change in a single base pair. Such a mutation can be a
transition or a transversion.
• Silent, missense, nonsense, and frameshift mutations may occur within the
coding region of a gene.
• Mutations may also occur within non-coding regions of a gene and affect gene
expression.
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Important terms
Mutation Expanding nucleotide repeat
Somatic mutation Missense mutation
Germ-line mutation Nonsense mutation
Gene mutation Silent mutation
Base substitution Loss-of-function mutation
Transition Gain-of-function mutation
Transversion Mutation rate
Insertion Spontaneous mutation
Deletion Replication error
Frameshift mutation Depurination
In-frame insertion Deamination
In-frame mutation Mutagen
Intercalating agent Base analog
Pyrimidine dymer Anticipation (genetics)
Copy number variant Polymorphism
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