Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
Reservado todos los derechos. Está prohibido, bajo las sanciones penales y el resarcimiento civil
previsto en las leyes, reproducir, registrar o transmitir esta publicación, íntegra o parcialmente por
cualquier sistema de recuperación y por cualquier medio, sea mecánico, electrónico, magnético, por
fotocopia o por cualquier otro, sin la autorización previa por escrito de la editora.
ÍNDICE DE MANUAL DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y TÉCNICAS INMUNOLÓGICAS
BIBLIOGRAFÍA 293
BIBLIOGRAFÍA 343
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Fuente: Figura apartado 2.2 (pag 11) del libro “Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética.,
Barcelona, 1ª ed., 2008”.
1
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Fuente: Figura apartado 2.32 (pag 13) del libro “Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética.,
Barcelona, 1ª ed., 2008”.
4
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
3.2. MODELO DE WATSON Y CRICK: FORMA B DEL ADN. p. 225 (2013); 153
(2012); 10 (2007); 145, 204 (2004).
17
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Fuente: Modelos ADN (pag 54) del libro “Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética.,
Barcelona, 1ª ed., 2008”.
22
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
29
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
4.1.2. Las topoisomerasas. p. 184 (2015); 156, 215 (2013); 226 (2012); 192 (2008)
Catalizan cambios en el número de enlace y con ello aumentan o disminuyen el
grado de enrollamiento. Hay dos tipos:
- Topoisomerasas de tipo I: Cortan transitoriamente una cadena del ADN, hacen pasar la
hebra intacta a través del corte y vuelven a unir los extremos cortados. Un extremo de la
hebra cortada se une covalentemente a una tirosina del centro activo de la enzima mientras
se manipula el extremo o los extremos libres. Utilizan Mg 2+ como cofactor. Cambian L en
una unidad.
Ejemplos: Topoisomerasas I y III de E. coli; topoisomerasa III de levadura y humana;
girasa inversa arqueobacteriana y topoisomerasa I eucariota.
- Topoisomerasas de tipo II: cortan las dos hebras de la molécula de ADN y modifican L en
dos unidades. Requieren Mg2+ y ATP. Ej. Topoisomerasas II procariótica (DNA girasa) y IV
(decatenasa, encargada de separar las dos moléculas hijas tras la replicación) de E. coli y la
topisomerasa II eucarionte. p. 184 (2015); 215 (2013); 226 (2012)
31
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
La cantidad de las proteínas no histónicas puede variar de unos tejidos a otros en el mismo individuo y dentro del mismo tejido
a lo largo del desarrollo.
41
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
heterogamético. El par XX está formado por cromosomas homólogos, sin embargo sólo
una pequeña parte del X e Y son homólogas y se llama región pseudoautosómica.
Las células con más de 2n cromosomas se denominan poliploides.
56
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
57
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
58
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
71
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
82
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Las caspasas cortan proteínas clave en la célula como la laminina que al romperse
desintegra la membrana nuclear y degradan a la enzima que inactiva a la DNAsa
ocasionando la degradación del material genético.
83
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
84
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
8. LA REPLICACIÓN DEL ADN. (2015) 178, 211; (2014) 144, 150, 165,
187, 190, 199; (2013) 137, 168, 207, (2012) 108; 110, 138, 160, 187; (2011) 186,
201, 213, 238; (2010) 150, 162, 173, 175, 214, 217, 231, 232; (2009) 136, 151, 176,
202, 250; (2008) 145, 146, 159, 162, 182; (2007) 12, 24, 103, 116, 256; (2006) 204;
(2005) 177, 181, 205, 209; (2004) 142, 150, 185, 196, 239; (2003) 158, 203.
8.1. CARACTERÍSTICAS
99
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
8.3.2. Elongación. p. 178 (2015); 150, 187, 199 (2014); 108 (2012); 146, 159, 162 (2008);
103, 256 (2007); 177, 205, 209 (2005); 142, 150, 185, 239 (2004); 15, 203 (2003)
107
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
intervienen las helicasas DnaB, PriA y Rep, estas últimas en dirección 3´→5´. p. 187
(2014); 185 (2004)
b) Proteínas de unión al ADN de hebra sencilla: son las siguientes en actuar. Evitan el
apareamiento de las dos cadenas y su degradación. Se denominan SSB (single strand
binding proteins) sobre todo en procariotas. En eucariotas desempeña esta función la
proteína de replicación A (RPA). Las proteínas mediadoras de la replicación
(RMP) determinan el desprendimiento de las SSB cuando llega al replisoma a copiar
las cadenas simples.
c) Topoisomerasas: la apertura de la doble hélice ocasiona la aparición de
superenrollamientos positivos delante de la horquilla. Para aliviar esa tensión de
torsión actúan las topoisomerasas que modifican el número de enlace del ADN. p. 159
(2008)
Las topoisomerasas de tipo I rompen una hebra del ADN, dejan pasar la otra hebra
por la brecha abierta y vuelven a ligar la primera. De esta forma, el número de enlace
aumenta o disminuye en una unidad
Las topoisomerasas de tipo II cortan las dos hebras, permiten el paso de otra doble
hebra, continua, por la brecha y sellan los cortes. Aumentan o disminuyen el número
de enlace en dos unidades. El ejemplo más conocido es la girasa procariótica. Las
topoisomerasas generalmente introducen superenrollamientos negativos e hidrolizan
una molécula de ATP por cada corte de la cadena.
d) Primasa: El inicio de las hebras nuevas requiere un cebador, que es sintetizado por
una primasa, una ARN polimerasa ADN dependiente, que fabrica cadenas cortas de
ARN complementarias de cada una de las hebras desemparejadas en el origen de
replicación. En procariotas la primasa es una proteína independiente, la DnaG, que
junto con la DnaB (helicasa), forma parte de un complejo proteico denominado
primosoma, asociado a la horquilla. En eucariotas, la actividad primasa reside en una
de las subunidades de la polimerasa α, distinta de la subunidad con el centro activo
polimerasa. Por eso se habla de ADNpol α/prim. p. 178 (2015); 150 (2014); 137
(2014); 108 (2012); 146, 162 (2008); 150 (2004)
Todas las ADN polimerasas catalizan la elongación de la cadena exclusivamente en
dirección 5´ → 3´. Al abrirse la horquilla, una de las hebras progenitoras se expone en el
sentido correcto para actuar como molde 3´→ 5´, de forma que su cadena complementaria
puede sintetizarse por avance de la ADNpol. A esta hebra nueva se le llama hebra
conductora, líder o guía (leading strand) y su molde recibe el mismo nombre o “molde de la
hebra conductora”. La otra hebra progenitora se expone en sentido 5´→ 3´, por lo que no
puede actuar como molde. Su cadena complementaria se sintetiza con un desfase respecto
108
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
En eucariotas
Las dos moléculas hijas se mantienen juntas por proteínas cohesinas hasta la
anafase, cuando proteínas de corte permiten la separación de los cromosomas hijos.
Además, en eucariotas se presenta un problema. Todos los cebadores intermedios
son eliminados y sustituidos, sin embargo, los cebadores de los extremos 5´ de las hebras
nuevas son eliminados pero no sustituidos, por lo que estas hebras quedan más cortas que
su molde. Este acortamiento, de unas 50-200 pb por cada división celular, supone la
disminución progresiva de la longitud del cromosoma con la consecuente pérdida de
información genética. La enzima encargada de solucionar este problema alargando los
telómeros es la telomerasa.
La telomerasa es una ADN polimerasa dirigida por ARN, por tanto una
transcriptasa inversa, con características especiales. Es una ribonucleoproteína que sólo
puede sintetizar una secuencia determinada de ADN y está formada por dos componentes:
a) Componente ribonucleotídico o “ARN de la telomerasa” (TR o TER), de tamaño
variable según las especies (de 146 a 1544 nt). Incluye una secuencia característica
para cada especie de 9 a 28 nt y complementaria a la secuencia telomérica respectiva.
Así, el ARN componente de la telomerasa humana (hTR) tiene 450 nt entre los que hay
una secuencia rica en C, 5´-CCCUAA-3´, complementaria y antiparalela a la hebra rica
en G de la repetición telomérica en tándem 5´- TTAGGG-3´-. Así el hTR sirve de molde
para la síntesis de nuevas secuencias teloméricas.
b) Componente proteico, que contiene la actividad enzimática o “transcriptasa inversa de
la telomerasa” (TRT o TERT). Sintetiza el ADN telomérico de novo, sin necesidad de
cebador.
La actividad de la telomerasa es regulada por las proteínas TRF1 y TRF2 para que el
extremo cromosómico tenga la longitud adecuada. TRF1 induce la formación de una
estructura plegada que impide a la telomerasa acceder al extremo del cromosoma. En
113
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
9. LA TRANSCRIPCIÓN. (2015) 167, 185; (2014) 118, 121, 153, 159, 184, 207;
(2012) 157, 174; (2011) 189, 202; (2010) 165, 200, 255; (2009) 149, 152, 195, 199,
225, 247, 256; (2008) 201; (2007) 19, 109, 115; (2006) 201; (2005) 203, 225; (2004)
225; (2003) 220.
Un gen se definía como la región del genoma que tiene información para la síntesis
de una proteína (una molécula de polipéptido). Pero en un gen existen dos tipos de
secuencias con funciones diferentes:
- La región estructural: la unidad de transcripción (UT), la región realmente
codificadora. Comprende dos tipos de secuencias, los intrones o secuencias intercaladas,
regiones no codificantes presentes en el interior de la región codificadora [p. 225 (2004)], y
los exones que incluyen las secuencias codificantes. La UT además comprende una
secuencia corta que precede al primer intrón, el 5´-UTR denominado en humanos SANT
(secuencia anterior no traducida) y el 3´-UTR posterior al último exón que puede tener una
longitud considerable (SPTN en humanos). Los exones e intrones se transcriben y dan lugar
a un ARN llamado precursor o tránscrito primario (pre-ARNm o ARNhn), que requiere una
maduración cotranscripcional y postranscripcional para originar las moléculas funcionales de
ARN. Los ARNm son después traducidos para formar la proteína. p. 152, 156 (2009); 115
(2007)
117
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
9.3.4. Polimerasas. p. 167, 185 (2015); 121, 184 (2014); 157 (2012); 189, 202 (2011)
Cloroplastos
enzimática
α-amanitina Sí afectada
por la rifampicina
No se sabe si se sintetizan directamente en forma activa o como pre-ARNs que necesitan
maduración.
p. 185 (2015): 121, 184 (2014); 174 (2012); 189 (2011); 147 (2009); 201 (2006)
Las ARN polimerasas no requieren cebador y carecen de actividad correctora
exonucleasa 3´→5´.
Estructura de la ARN polimerasa de E. coli
La ARN polimerasa de procariotas, la mejor estudiada, está formada por 4 (puede
que 5) polipéptidos asociados en la llamada enzima “mínima” o “núcleo” . Para iniciar la
transcripción, la enzima necesita de la unión de otro polipéptido independiente, el factor σ
(sigma). p. 109 (2007)
122
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Enzima núcleo:
Subunidad α: ensambla la enzima núcleo y se une a proteínas reguladoras.
Subunidad β: sitio catalítico de la polimerasa.
Subunidad β´: se une al ADN molde.
Subunidad ω: (posible, no confirmado).
Factor σ: reconoce el promotor e inicia la síntesis. Hay diferentes tipos designados por su
masa molecular. El más común es σ70. p. 167 (2015); 157 (2012); 225 (2012)
La ARN polimerasa mitocondrial está formada por sólo una unidad.
Polimerasas de eucariotas
Son más complejas, están formadas por 10-14 subunidades. Las subunidades
mayores de cada una presentan homología de secuencia y a través de ellas la ADN
polimerasa se une al ADN. La subunidad mayor de la ARN polimerasa II contiene un
dominio C-terminal (CTD) con múltiples repeticiones (50 en mamíferos) de la secuencia Tyr-
Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Thr. Este dominio puede ser fosforilado en Ser y Thr y adquirir carga
negativa, lo cual está relacionado con su función en la transición entre las fases de iniciación
y elongación.
CTD no fosforilado → iniciación
CTD fosforilado → elongación
Las segundas subunidades en tamaño también muestran homología entre sí. Poseen
el centro activo de la catálisis.
3
Un operón está definido como un conjunto de genes, más el promotor y secuencias adicionales que funcionan
conjuntamente en la regulación.
123
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
El ADN mitocondrial es transcrito por una sola ARNpol formada por un único
polipéptido y necesita para la iniciación el factor mtTFA. Se transcribe a partir de 3 lugares
de iniciación, dos para la hebra pesada (H1 y H2) y uno para la ligera (L), originándose tres
tránscritos primarios diferentes. Los tres promotores se encuentran en el bucle D.
Son inhibidores indirectos que impiden la acción de la ADN girasa procariótica. Los
principales son: la cumermicina, la novobiocina y el ácido nalidíxico.
129
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Dogma central de la biología molecular Ampliación del dogma central para incluir
con indicación del sentido Replicación- la síntesis de RNA y DNA dependientes
Transcripción-Traducciónn enunciado por de RNA. Es decir, la información puede
primera vez por Crick fluir “hacia atrás”, del RNA al DNA.
. Fig.26-28, pág. 1021, Cap.26. LEHNINGER.et al. “Principios de Bioquímica”. Ediciones Omega, 4ª ed., 2005.
130
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Virus RNA de doble cadena: A partir del genoma (dos cadenas de sentido contrario) se
producen réplicas sentido-positivo que sirven primero como RNAm y para obtener más
copias sentido-positivas y luego como moldes para obtener cadenas complementarias
sentido-negativas que completen el genoma que se ensamblará en los nuevos viriones.
Existen ciertos virus RNA, cuyo genoma consta en realidad de dos cadenas simples en
sentido positivo de RNA y que son transcritas por una enzima DNA polimerasa dependiente
de RNA, denominada transcriptasa inversa. Durante el proceso de infección el genoma
vírico de RNA monohebra y el enzima penetran en la célula huésped. Cada una de estas
cadenas simples de DNA es utilizada como molde por la transcriptasa inversa y así obtener
cadena de DNA complementaria del RNA vírico y a continuación degrada la cadena del RNA
del híbrido RNA-DNA vírico y lo reemplaza por DNA, obteniéndose un DNA bicatenario que
es integrado en el genoma de la célula eucariótica. Estos genes víricos integrados (y en
estado latente) pueden ser activados y transcritos y los productos génicos –proteínas víricas
y el propio genoma vírico- son empaquetados como nuevos virus.
Replicación de los virus RNA
131
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
133
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
137
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
10.2.1. Control del inicio de la transcripción en procariotas. p. 156 (2008); 149 (2009);
203 (2005); 193 (2004); 161, 210, 255 (2003)
OPERONES:
140
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Es habitual que los operones incluyan de dos a seis genes transcritos como una
unidad; algunos operones contienen 20 o más genes.
En las bacterias se conocen dos formas de control:
a. Control constitutivo: depende de la estructura del promotor, secuencia diana para la unión
de la ARN polimerasa.Los elementos del promotor son los siguientes, los dos primeros son
los más importantes:
- el hexámero – 10, caja TATA o caja de Pribnow, con la secuencia consenso 5´-
TATAAT-3´. p. 156 (2008); 161 (2003).
- el hexámero -35 con la secuencia consenso 5´-TTGACA3-3´.
- La región -10 extendida, que es un dinucleótido 5´-TG-3´localizado enlas posiciones -
14 y -15.
- El elemento UP, una secuencia de unos 20 pb localizada de la posición -40 a la -60,
rica en bases A y T
Cuanto más se parezcan las secuencias de un promotor a las secuencias consenso,
más eficiente será su reconocimiento. La eficiencia es la cantidad de iniciaciones
productivas por segundo. Los promotores fuertes dirigen más de 1000 iniciaciones
productivas que los débiles.
b. Control regulador: depende de proteínas reguladoras:
- Factores σ alternativos.
- Represores (se unen al operador, región de unión del represor en los operones, e
impiden la unión de la ARN polimerasa al promotor), inductores y correpresores (se
unen a represores), activadores y pequeños ligandos como el ppGpp. p. 162 (2015);
68 (2007)
Regulación negativa (Represor) y positiva (activador) (proteínas reguladoras):
El gen regulador codifica una proteína reguladora represora (el represor) que se une
al centro operador. La unión del represor al operador impide la transcripción de los genes
estructurales (regulación negativa) porque se bloquea la unión de la RNA polimerasa. La
unión del represor al DNA se regula a través de una señal molecular (efector o inductor),
normalmente una molécula pequeña o una proteína, que se une al represor y provoca un
141
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
cambio conformacional, que facilita, en unos casos, la disociación del represor unido al DNA
del operador y por tanto el inicio de la transcripción puede proceder libremente. En otros
casos, la interacción entre un represor inactivo y la molécula señal hace que el represor se
una al operador bloqueando en este caso el proceso de transcripción (figura b). p. 193
(2004).
Los activadores (proteínas reguladoras activadoras) constituyen el contrapunto
molecular de los represores; se unen al DNA y potencian la actividad de la RNA polimerasa
en el promotor; se trata de la regulación positiva. Los sitios de unión de los activadores se
encuentran a menudo adyacentes a promotores a los que la RNA polimerasa o bien no se
une por sí sola o la unión es muy débil, por tanto en ausencia de activador la tasa de
transcripción es escasa. De manera análoga a los represores, se puede provocar la
disociación de la proteína activadora a través de la unión a ella de una molécula señal,
inhibiéndose por la transcriupción (figura c). En otros casos, el activador se une al DNA solo
después que de la interacción con la molécula señal (figura d).
142
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
143
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Figura. Control de lacP por cAMP. Un complejo CAP-cAMP se une al sitio de CAP y activa
la transcripción en lacP. La represión por catabolito se produce cuando la glucosa hace
descender la concentración intracelular de cAMP lo que reduce la cantidad de complejo
CAP-cAMP y disminuye la tasa de transcripción a partir de lacP y de los promotores de
algunos otros operones.
Fuente: Fig.8-6, pág. 337, Cap.8. DEVLÍN.et al. “Bioquímica”. Editorial Reverté, 4ª ed., 2004.
presente para facilitar la transcripción; cuando la CRP-cAMP no está unida, el promotor lac
salvaje es un promotor relativamente débil.
145
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
146
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
147
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Figura. El operón lac en estado reprimido. El gen I codifica el represor Lac. Los genes Z, Y, y A
codifican la β-galactosidasa, la galactósido permeasa y la tiogalactósido transacetilasa,
respectivamente. P es el promotor para los genes lac y PI es el promotor para el gen I. O1 es el
148
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
operador principal para el operón lac; O2 y O3 son sitios secundarios del operador con menor afinidad
para el represor Lac.
Fuente: Fig.28-7 pág. 1086, Cap.28. LEHNINGER.et al. “Principios de Bioquímica”. Editorial Omega, 4ª ed., 2005.
149
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Figura. El operón trp. Este operón es regulado por dos mecanismos: cuando los niveles de
triptófano son altos, (1) el represor (arriba a la izquierda) se une a su operador y (2) la transcripción
del mRNA trp se atenúa. La biosíntesis del triptófano por los enzimas codificados en el operón trp
está representada en la parte inferior.
. Fig.28-19, pág. 1095, Cap.28. LEHNINGER.et al. “Principios de Bioquímica”. Editorial Omega, 4ª ed., 2005.
150
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Operón pur:
Los genes que participan en la biosíntesis de las purinas y, en menor medida los que
participan en la biosíntesis de las pirimidinas, están rerimidor por el represor pur. El 31% de
la secuencia de esta proteína dimérica es idéntico al represor lac y poseen una estructura
tridimensional parecida. Sin embargo, el comportamiento del represor pur es opuesto al
represor lac; mientras que el represor lac se disocia del DNA cuando se une a una molécula
pequeña (inductor), el represor pur se une al DNA de forma específica únicamente cuando
se encuentra unido a una molécula pequeña
(correpresor). Esta molécula correpresora puede ser tanto
guanina como hipoxantina. El estudio de la secuencia del
genoma de E. coli revela la existencia de más de 20
lugares (regiones) que coinciden con la secuencia del
operador pur, que regulan 19 operones que barcan más
de 25 genes. A diferencia del operadador lac que posee
una única región.
Fuente: Fig.31-9, pág. 872, Cap.31. STRYER.et al. “Bioquímica”. Editorial Reverté, 5ª ed., 2003.
151
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
161
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
12. EL CÓDIGO GENÉTICO. (2015) 121, 218; (2014) 226; (2013) 198; (2012)
148, 178; (2011) 162, 244; (2010) 177,186, 246; (2009) 146, 251; (2008) 171; (2007)
22, 47; (2006) 188; (2003) 163, 208.
Para poder codificar los 20 aminoácidos se necesita que cada uno venga
especificado por una secuencia de 3 nucleótidos denominada triplete o codón. Las 64
posibles combinaciones sobran para los 20 aminoácidos.
Cada nucleótido forma parte sólo de un codón. No existen interrupciones entre los
nucleótidos que muestren cómo se realice la lectura, por lo que existen potencialmente tres
pautas o marcos de lectura cuya traducción formaría tres polipéptidos diferentes. Sin
embargo, en la traducción no se manifiesta esta ambigüedad; una vez iniciada la síntesis
según una pauta de lectura, los otros dos carecen de información. Los otros dos marcos de
lectura servirían en el caso de los genes solapantes.
Si se desplaza el marco de lectura en una o dos bases se produce una mutación.
12.1.3. El código genético es degenerado. p. 198 (2013); 148, 178 (2012); 162 (2011);
171 (2008); 47 (2007); 188 (2006)
171
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
1. La 1ª y la 2ª base del codón forman puentes de hidrógeno de tipo Watson y Crick bien
definidos con las bases 3ª y 2ª del anticodón.
2. La 1ª base del anticodón, en posición 5´ del ARNt, puede orientarse de formas
ligeramente distintas para interaccionar con distintas bases en la 3ª posición del codón.
p. 121 (2015). Este apareamiento tiene lugar mediante enlaces de Hoogsteen, más
débiles.
A esta flexibilidad de interacción también contribuye la presencia en el anticodón de
algunos ARNt, del nucleósido inosina (I, con la base nitrogenada hipoxantina) capaz de
aparearse con A, U o C. La inosina se genera por la acción de una adenosina desaminasa
sobre la adenina presente en el tránscrito primario del ARNt. p. 178 (2012).
172
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
175
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
La unión del aminoácido correcto a cada ARNt es el paso más crítico de la expresión
génica y debe realizarse de forma correcta. La unión del aminoácido con el ARNt se realiza
en dos reacciones catalizadas por la misma enzima, una aminoacil-ARNt sintetasa (aaRS):
R-CH(NH2)-COOH + AMP-P-P + enzima → Enzima-AMP-CO-CH(NH2)-R + PPi
(aminoácido) (ATP) (aminoacil-AMP-enzima)
Reacción global
Aminoácido + ATP + ARNt → Aminoacil-ARNt + AMP +2Pi
El producto final de la doble reacción es un aminoacil-ARNt, con un enlace éster
entre el grupo 3´-OH terminal del ARNt y el grupo carboxilo del aminoácido.
176
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
La elevada especificidad de las aminoacil-ARNt sintetasas hace que los errores sean
infrecuentes. Aún así, existen mecanismos de corrección que actúan sucesivamente en el
centro activo de la enzima antes y después de cada etapa de la reacción de síntesis.
A pesar de todos estos mecanismos de corrección, la tasa de error de la traducción
es mucho mayor que la de la replicación, de uno por cada 10.000 aminoácidos (frente a uno
por cada 106-108 nucleótidos en la replicación).
13.2. INICIACIÓN.
13.2.1. El punto de inicio. p. 163 (2003); 182 (2005); 201 (2009); 138 (2015)
179
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
proporcionado por la subunidad menor del ribosoma y requiere que el codón AUG forme
parte de la secuencia de Kozak, que contiene una purina en -3 y una guanina en +4 que
son los principales determinantes.
Los codones AUG en los que se inicia la traducción son reconocidos por un ARNt
iniciador (ARNtfMet en procariotas y ARNtiMet en eucariotas) mientras los codones AUG
internos interaccionan con un ARNt distinto que se denomina ARNtMet.
En procariotas y en mitocondrias y cloroplastos eucarióticos se forma Met-
Met
ARNti , que luego es modificado con un grupo formilo en el α-amino de la metionina. Hay
aminoacilación y formilación para incorporar N-formil-metionina como primer aminoácido de
la proteina.
En eucariotas sólo se requiere la aminoacilación para incorporar metionina en el
N-terminal.
13.2.3. Pasos en la iniciación. p. 171 (2012); 148, 189 (2008); 60, 120 (2007
180
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
Células procariota:
181
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
183
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
El polipéptido recién sintetizado necesita sufrir una serie de procesos para adquirir la
estructura nativa de la proteína que determina su función. Estos procesos denominados
maduración o modificación postraduccional son los enumerados a continuación. Los tres
primeros pasos ocurren simultáneamente.
1. Transporte de la proteína a su localización definitiva subcelular o extracelular.
2. Maduración del polipéptido, que comprende modificaciones químicas de los
aminoácidos y eliminación de fragmentos.
3. Plegamiento hasta alcanzar la conformación activa.
4. Degradación.
191
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
193
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
194
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
Mediante esta ruta pueden degradarse la mayoría de las proteínas libres del citosol.
El proceso es muy selectivo, está bajo un estricto control y es la degradación que necesita
mayor gasto de ATP. Intervienen como mediadores aminoácidos N-terminales y la proteína
ubiquitina.
a) Ubiquitina
Es una proteína pequeña, presente en todas las células eucariotas, de las más
conservadas, globular, rígida y muy estable que interviene como marcador selectivo de la
degradación de otras proteínas cuando se une covalentemente a ellas. La ubiquitinación se
realiza en un proceso de 3 reacciones.
Fuente: Figura apartado 24.5.2.1 (pag 341) del libro “Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería
Genética., Barcelona, 1ª ed., 2008”.
202
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
15. MUTACIÓN. (2015) 213, 216; (2014) 211; (2011) 135, 171, 204; (2009) 196;
(2008) 226, 240; (2007) 73; (2005) 234; (2003) 176.
- Mutaciones morfológicas.
- Mutaciones bioquímicas o nutritivas: las que impiden el crecimiento del organismo si no se
les suministra el compuesto final de la ruta metabólica. Las cepas salvajes son prototróficas
y sólo necesitan un medio mínimo para crecer. Los mutantes auxotróficos necesitan un
medio suplementado con el producto final de la ruta que muestran alterada.
- Mutaciones letales: producen la muerte del individuo antes de alcanzar la madurez sexual.
Si sólo produce una disminución de su capacidad para sobrevivir o reproducirse se
denomina mutación deletérea. Las mutaciones letales son en su mayoría recesivas,
manifestándose en homocigosis o en hemicigosis en haploides y en las ligadas al sexo.
- Mutaciones condicionales: si el fenotipo mutante sólo se manifiesta en un determinado
ambiente.
- Mutaciones de resistencia.
- Mutaciones de desarrollo.
- Mutaciones de comportamiento.
205
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
16. REPARACIÓN DEL ADN. (2015) 180; (2011) 237; (2009) 187, 249; (2007)
49; (2005) 259; (2004) 178.
Los dímeros de timina causan una distorsión estructural que impide físicamente la
replicación y la transcripción. El mecanismo de reparación se basa en el reconocimiento del
fotodímero por la enzima fotoliasa, que lo escinde mediante una reacción de transferencia
electrónica iniciada por la absorción de luz visible (por eso también se le llama enzima
fotorreactivante), regenerando sus dos bases originales. La fotoliasa tiene como coenzimas
FADH2 y un cromóforo que absorbe luz. En oscuridad se requieren otros sistemas para
reparar estas lesiones. Este sistema se ha encontrado en bacterias, hongos, peces, anfibios,
reptiles y mamíferos marsupiales, pero no aparece en humanos.
En algunos organismos, como Drosophila, se detectó una fotoliasa que repara los
fotoproductos 6-4.
213
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
acoplado con la transcripción. Se origina por mutaciones en cualquiera de los tres genes
siguientes: CSA, CSB o XPG ; que impiden la asociación normal del TFIIH con los
componentes del NER. Algunas mutaciones de XPB, XPD y XPG originan síndromes
solapantes XP/CS.
C. Tricotiodistrofia (TTD)
Debida a mutaciones en los genes TTD-A, XPB o XPD. Se trata de un defecto de la
transcripción, que se puede corregir in vitro por microinyección de TFIIH a las células. Sus
síntomas, en los dos últimos casos solapantes con XP, incluyen caries, ictiosis y retraso
mental por desmielinización.
D. Hemocromatosis primaria
Es una enfermedad hereditaria que afecta al metabolismo del hierro, provocando un
acúmulo excesivo e incorrecto de este metal en los órganos y sistemas del organismo. Las
causas de la enfermedad hereditaria son mutaciones en el gen HFE, localizado en el brazo
corto del cromosoma 6. El HFE codifica para una proteína (perteneciente a la familia de
moléculas del sistema mayor de histocompatibilidad HLA-A) que participa en la regulación
de la absorción del hierro y se expresa, en niveles altos, en órganos como el hígado y el
intestino delgado.
216
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
19.1. NUCLEASAS
Se denomina nucleasa a una enzima que escinde los enlaces fosfodiéster de los
ácidos nucleicos. Son fosfodiesterasas específicas respecto a 3 criterios:
a. Posición: las exonucleasas hidrolizan exclusivamente enlaces fosfato en los que
participa el nucleótido terminal 5´ o 3´. Generan una cadena de nucleótidos acortada y
un nucleósido (N), nucleósido monofosfato (pN o Np) o un nucleósido bisfosfato (pNp).
Las endonucleasas hidrolizan enlaces internos de la cadena y generan dos fragmentos
polinucleotídicos.
b. Tipo de enlace fosfodiéster: las nucleasas de tipo a hidrolizan los enlaces fosfato
formados con el 3´-OH y origina extremos 3´-OH y 5´-P. Las nucleasas de tipo b
hidrolizan los formados con 5´-OH y da lugar a extremos 3´-P y 5´-OH.
T A T A T A
2´ 2´ 2´ Tipo a 2´ 2´ 2´
3´ 3´ Tipo a 3´ 3´ Tipo b 3´ 3´
O
OH O O O O
-
O P P P O-
-
O O -
O O O- HO
5´ 5´ 5´ Tipo b 5´ 5´ 5´
3´- OH y 5´-P 3´- P y 5´- OH
Enlace FOSFODIÉSTER
3´- 5´
241
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
seguidas por una letra que identifica el serotipo y un número romano que indica enzimas de
una misma cepa con diferentes especificidades. p. 212 (2015)
EcoRI (Escherichia coli, cepa RY13, primera endonucleasa aislada de esta cepa)
242
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
271
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
277
InspiracleQIR/2016 Biología Molecular
2. Ejecución
El proceso consta de varias alteraciones que conducen a la muerte de la célula: cambios
morfológicos y de la membrana con disminución de la adhesión a otras células y a la
matriz extracelular, contracción del citoplasma, condensación de la cromatina,
fragmentación del DNA, disminución del volumen nuclear seguida de su desintegración,
rotura de mitocondrias con vertido de su contenido al citoplasma, aparición de
protuberancias en la membrana celular (zeiosis), etc. Estas alteraciones se deben a la
activación de varias proteasas y nucleasas, que se convierten así en las principales
moléculas responsables de la apoptosis.
a) Proteasas:
Las caspasas son una familia de proteasas citosólicas, (cisteína endopeptidasas).
En humanos se han identificado 10, clasificadas en tres grupos de acuerdo con su
especificidad de sustrato. Producen la proteolisis de proteínas diana o sustrato, entre las
278
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
(2014) 143.
Conocer la estructura fina del genoma de una especie es un proceso largo que se
ha abordado a tres niveles crecientes de resolución: mapa genético o de ligamiento, mapa
físico y secuenciación.
281
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
AD
289
Biología Molecular InspiracleQIR/2016
BIBLIOGRAFÍA
Páginas web
- http://www.ucm.es/info/genetica/grupod
- http://www.drscope.com/pac/mg/b1/index.htm
- http://www.es.embnet.org/-Imc/
- http://genmolecular.wordpress.com/ligamiento
293