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GUIA DE PRÁCTICAS
BIOQUÍMICA I
(Escuela Profesional de Química)
AUTORES:
Lima – Perú
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2017
Contenido
Temas
1 Introducción
3 Medidas de Seguridad
5 Extracción de ADN
8 Cálculos en bioenergética
12 Cinética enzimática
13 Efecto de pH y temperatura
16 Fotosíntesis
17 Bibliografía
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Correos de los autores:
Mg. Milagros Quintana Cáceda milagros quintana@gmail.com
Ana Gutiérrez Román: anaisabelflor@gmail.com
Carlos Santa Cruz Carpio: santacruzcm@yahoo.es
Oscar Nolasco Cárdenas: oscarnol@gmail.com
Introducción
Para la comprensión de la Bioquímica, actividad intelectual abierta con
limitaciones que establece el método científico, se requiere una actitud de
curiosidad despierta para observar hechos en condiciones experimentales.
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4. Desarrollar el sentido de responsabilidad social para manejar los recursos
humanos y materiales que inciden en su propia formación.
Por la naturaleza de las prácticas y para poder cumplir con sus objetivos es
imprescindible una participación activa y personal tanto de alumnos como de
docentes.
FCCNM – UNFV
Enero 2010
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Preparación de experimentos y registro de resultados
El registro de los resultados de los experimentos es una parte esencial de
cualquier trabajo científico. Los experimentos de laboratorio son el fundamento de las
hipótesis, teorías, conocimientos científico y tecnología, y son inútiles si no se
consigna por escrito la descripción de lo que se ha hecho y observado en tal forma
que permita a cualquiera, con cierto conocimiento del asunto, que repita, compruebe
o corrija el trabajo realizado sin necesidad de guía especial.
Las anotaciones deben ser breves y muy claras; se llevarán en las páginas en
blanco de esta guía, así como las gráficas y calibraciones de los experimentos que lo
requieran. Se harán inmediatamente después de cada experimento sin confiar a la
memoria un momento más de lo necesario.
Aunque los experimentos que se harán, producen resultados previsibles por las
teorías conocidas que de ellos se derivan originalmente, cualquier resultado
imprevisto, raro, o aún absurdo debe anotarse y de ningún modo llenar el protocolo
con lo “que debió pasar” pues sería una relación completamente inútil. Los asientos
falsos o las omisiones no enseñan nada. Sí en cambio, el análisis concienzudo de los
resultados inesperados o contrarios a lo previsto, que pueden ser fuente de mucha
información útil para el desempeño futuro en el laboratorio.
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Medidas de Seguridad
Todos los accidentes personales por triviales que sean deben comunicarse al profesor
encargado de la práctica.
Las sustancias que se utilizan, y las operaciones que se realizan en el laboratorio son
potencialmente tóxicas y peligrosas. Trabaje con cuidado, atento a los eventos que puedan
comprometer la seguridad personal o colectiva.
4. No utilizar la llama del mechero sin cerciorarse antes de que no haya cerca
líquidos inflamables.
5. Dirija la boca del tubo o matraz de reacción, lejos de sí mismo y del vecino, el
contenido puede proyectarse.
10. No cambie de lugar los reactivos para uso del grupo. Deben estar disponibles
para todos.
12. Tenga especial cuidado con los solventes volátiles que pueden llegar a provocar
explosiones. Si se vierte accidentalmente sobre la mesa, séquela inmediatamente con
un trapo húmedo y enjuáguese éste en el chorro de agua, exprimiéndolo.
13. Conserve limpio su lugar. Lave con mucho cuidado el material de vidrio y
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enjuagar con abundante agua
La extracción de ADN de una muestra celular se basa en el hecho de que los iones salinos
son atraídos hacia las cargas negativas del ADN, permitiendo su disolución y posterior
extracción de la célula. Se empieza por lisar (romper) las células mediante un detergente,
vaciándose su contenido molecular en una disolución tampón en la que se disuelve el ADN.
En ese momento, el tampón contiene ADN y todo un surtido de restos moleculares: ARN,
carbohidratos, proteínas y otras sustancias en menor proporción.
Objetivo
El objetivo fundamental de esta práctica es utilizar unas sencillas técnicas para poder
extraer el ADN
Materiales
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Colorante azul de metileno
3 vasos descartables plástico o de cristal limpios
Procedimiento
A partir de la longitud enorme de las fibras, también se confirma que en el núcleo el ADN
se encuentra compactado.
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Alternativa extracción a partir del manto de choros
Osmosis y Difusión
Objetivos:
Teoría:
La membrana plasmática celular es una bicapa lipídica fluida y semipermeable, ya que
permite el paso de algunos solutos hacia el interior de la célula.
Muchas sustancias, además del agua, entran a la célula y salen de ella por efecto de los
gradientes de concentración, aunque sólo unas cuantas (CO2 y O2) puedan hacerlo tan
fácilmente como el agua.
El volumen celular cambia cuando el agua penetra o sale de la célula por un proceso
denominado osmosis. Por lo cual, las células de los organismos pluricelulares deben
permanecer en equilibrio osmótico con los líquidos tisulares que los bañan.
La ósmosis se define como una difusión pasiva,
caracterizada por el paso del agua, disolvente, a través
de una membrana semipermeable, desde la solución
más diluida a la más concentrada.
Si los líquidos extracelulares aumentan su
concentración de solutos, se haría hipertónica respecto
a las células, como consecuencia se originan pérdida
de agua y deshidratación (las células animales se
crenan y las vegetales la membrana puede desprende
bruscamente de la pared
celular ocurriendo la
plasmólisis)
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células.
Según el medio en el que se encuentre la célula, la membrana dejará pasar algunos solutos,
modificando así la turgencia de la célula.
Agua destilada
Tubos de ensayo
Algodón
Gradillas
Marcador de vidrio
Solución hipotónica NaCl 0.065 M (0.43%)
Solución hipertónica NaCl al 2% y 4%
Azul de metileno
Solución isotónica de NaCl al 0.9% (suero fisiológico)
Procedimiento
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Actividad N°4: Prueba en células animales
1. Colocar los tres huevos en un vaso de precipitación de 1 litro y verter el vinagre hasta cubrir
completamente los huevos. Debe realizarse este proceso 5 días antes de la práctica.
2. Al momento de la práctica lavar con mucho cuidado con agua de caño.
3. Frotar cuidadosamente con los dedos para sacar la cáscara. Realizar este proceso hasta tener
casi un tercio del huevo libre de cáscara.
4. Coloquen agua de caño en uno de los vasos de precipitación de 100ml y ubiquen allí uno de los
huevos. El agua debe cubrir al huevo.
5. En otro vaso de precipitación colocar un huevo en la mezcla muy concentrada de sal en agua y
colocar allí otro de los huevos.
6. Llenar el tercer vaso con agua destilada y poner allí el tercer huevo.
7. en cada frasco se adicionó unas gotas de azul de metileno
8. Dejar por una hora y observar membrana y el contenido interno del huevo.
NOTA: En todos los vasos de precipitación, los huevos deben quedar sumergidos en el
líquido.
Alternativa
1 En cinco tubos de ensayo numerados coloque:
-1 ml. de solución hipotónica NaCl 0.09 %
-1 ml. de solución hipotónica NaCl 0.45 %
-1 ml. de solución isotónica de NaCl al 0.9% (suero fisiológico)
-1 ml. de solución de hipertónica NaCl al 2%
-1 ml. de solución de hipertónica NaCl al 4%
2 Obtener unas gotas de sangre empleando la lanceta hematológica en un tubo limpio
con heparina
3 Dejar caer 3 a 4 gotas de sangre en cada uno de los tubos con un gotero (o directamente
de la punción).
4 Agite los tubos y dejar en reposo durante 2 ó 3 minutos.
5 Con un gotero coloque en una lámina portaobjeto una gota de cada uno de los tres
tubos.
6 Luego examine en el microscopio su aspecto. Observar qué efecto ha tenido las
distintas soluciones sobre la morfología del eritrocito y explicar por qué.
7 Estime la concentración de hemoglobina al espectrofotómetro
Cuestionario:
1. Dibujar todo lo observado en la práctica que pueda servirle para la discusión de sus
resultados.
2. Indique en que muestras se observó: a) Osmosis b) Difusión c) Turgencia d)
Plasmólisis
3. Mencione y dibuje las diferencias encontradas en cada uno de los huevos sometidos a
cada proceso.
4. ¿Qué factores podrían afectar la velocidad de difusión?
5. Defina el movimiento Browniano y como se relaciona con la difusión?
6. Diferencie la pared celular de la células vegetales.
Bibliografía:
1. ..
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2. ..
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Teoría
2(ADP+Pi) 2ATP
GLUCOSA
ETANOL
Figura Nº1. Destino de la glucosa en condiciones aerobias (respiración) o anaerobias (fermentación).
Materiales y Reactivos:
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5. Galactosa 2% 7. Almidón 2%
6. Glucosa 2%
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Experimento I:
1. Debe disponer de una gradilla, una piseta con agua destilada, seis tubos de ensayo, seis
pipetas graduadas de 2 ml, seis pipetas Pasteur con bulbo y trozos de parafilm. Marque
los tubos 1, 2, 3, 4 y 5. Llénelos del siguiente modo:
Tubo 1 = 1.25 ml de glucosa (2% p/v)+ 1.25 ml de suspensión de levadura.
Tubo 2 = 1.25 ml de sacarosa (2% p/v)+ 1.25 ml de suspensión de levadura.
Tubo 3 = 1.25 ml de galactosa (2% p/v)+ 1.25 ml de suspensión de levadura.
Tubo 4 = 1.25 ml de almidón (2% p/v)+ 1.25 ml de suspensión de levadura.
Tubo 5 = 1.25 ml de agua + 1.25 ml de suspensión de levadura.
2. Mezcle las soluciones. Selle el extremo inferior de una pipeta graduada con parafilm.
3. Usando la pipeta Pasteur llene completamente la pipeta graduada con la solución del tubo
1 por el extremo superior.
4. Coloque sobre el extremo sin sellar de la pipeta graduada el tubo 1 invertido. Invierta
luego todo el sistema cuidadosamente manteniendo juntos el tubo de ensayo y la pipeta.
Repita el procedimiento con los demás tubos.
5. El gas producido se acumulará en el extremo cerrado de la pipeta graduada.
6. Registre el nivel del gas en las pipetas cada 2 minutos por alrededor de 20 min.
7. Anote los datos en una la tabla.
Experimento II:
Absorbancia [Glucosa]
Tubo 1
Matraz 1
Matraz 2
Matraz 3
Cuestionario
2. ¿Qué tipo de carbohidrato sustentó la tasa más rápida de fermentación? ¿Por qué?
5. Cuando el carbohidrato es fermentado por la levadura, sólo un tercio de los carbonos son
liberados en forma de CO2. El resto del carbono es liberado como moléculas
de.....................
TEORÍA:
La presencia de una enzima se demuestra siguiendo la desaparición del substrato o aparición
del producto de la reacción. Para ello la enzima es incubada con el substrato bajo condiciones
cuidadosamente controladas y se sacan alícuotas a intervalos de tiempo para ser analizadas. Debe
considerarse además controles para corregir los errores que se presentan debido a reacciones químicas
espontáneas no específicas ni catalizadas por la enzima.
La amilasa es la enzima responsable de la hidrólisis del almidón, tanto su actividad como la
presencia de sus transcriptos está asociada a este polisacarido. Kuhn, en 1925 demostró la presencia
de dos amilasas: la alfa amilasa Ec 3.2.1.1 y la beta amilasa 3.2.1.2. La alfa amilasa hidroliza los
enlaces alfa 1-4 pero no puede hidrolizar los enlaces alfa 1-6 de las cadenas ramificadas de la
amilopectina, por lo que se requiere de la enzima desramificadora para la hidrólisis completa del
almidón.
El estudio "in vitro" implica, sin embargo, aislar y purificar aunque sea parcialmente la
enzima y posteriormente analizar individualmente las variables que influyen en su actividad. Para
todo este proceso es indispensable fijar inicialmente en forma tentativa las condiciones
experimentales en que se realizará el ensayo enzimático, tomando en consideración todos los
conocimientos generales que se tienen sobre la naturaleza de las enzimas y aquellos hechos
particulares que nos permiten suponer algunas cualidades o requerimientos especiales de la enzima en
estudio. De este modo se debe elegir un pH, una temperatura y un tiempo de incubación compatible
con la naturaleza proteica de la enzima, condiciones que deben ser en lo posible lo más semejantes a
las del medio en el cual la enzima actúa "in vivo". Además se debe procurar que las concentraciones
de la solución amortiguadora del pH que se use en el medio de incubación, garanticen la estabilidad
del pH elegido durante el lapso de observación y que la concentración del substrato sea lo
suficientemente alta para mantener la saturación de la enzima, mientras dure el experimento.
Un método para la determinación cuantitativa de la actividad de la amilasa es el amiloclasico
iodometrico. En este método el sustrato, almidón tamponado, se incuba con la muestra produciéndose
la hidrólisis enzimática. Este se detiene al agregar el reactivo de yodo. La disminución de color
respecto a un sustrato sin muestra permitirá medir la actividad enzimática.
La técnica mide el almidón que queda sin hidrolizar = Ash
La diferencia Blanco-Almidón sin hidrólisis (Ash) = Almidón hidrolisado (Ah) = Producto
MATERIALES y REACTIVOS:
1. Solución de Sustrato almidón 500 3. Enzima amilasa
mg/L, en buffer fosfato 0.1 M y NaCl 4. Tubos de prueba y pipetas
0.15 M (pH 7) 5. Centrífuga clínica
2. Reactivo de yodo 0.01 eq/L de Yodo 6. Espectrofotómetro o fotocolorímetro
en HCl 0.02M 7. Baño de maría a 37°C.
PROCEDIMIENTO:
Reactivos 1 2
CUESTIONARIO:
1. ¿Cuál es la actividad de la muestra analizada?
2. La actividad de la amilasa es directamente proporcional al volumen empleado? Si no es
así que cantidad describe mejor la cantidad de enzima presente?
3. En relación al almidón defina los términos gelatinización, licuefacción, sacarificación
4. En que se diferencian las enzimas amilasas y que orígenes tienen?
5. Qué reacción catalizan las amiloglucosidasas y cuál es su origen?
OBJETIVO:
a) Conocer como la concentración de substrato puede modificar la velocidad de reacción
y calcular la constante de Michaelis de una enzima.
TEORÍA.-
Si se analiza la influencia de la concentración del substrato, manteniendo la
concentración de la enzima constante, y se dibuja una gráfica con los resultados, se obtiene
una hipérbola rectangular. Esta curva está expresada matemáticamente por la ecuación de
Michaelis:
Vmax Vmax S
v = -------------- ó v = -------------
1 + Km. / S S + Km.
donde v es la velocidad de la reacción, Vmax es la velocidad máxima, S es la concentración
molar de substrato y Km. es una constante equivalente a la concentración de substrato con la
que se obtiene la mitad de velocidad máxima. Suele usarse la expresión de Lineweaver-Burk,
que es la reciproca de la ecuación de Michaelis y da una línea recta.
1 Km. 1 1
--- = ------- . ---- + ----
v Vmax S V
MATERIALES y REACTIVOS:
1. Solución de Sustrato almidón 500 3. Enzima amilasa
mg/L, en buffer fosfato 0.1 M y NaCl 4. Tubos de prueba y pipetas
0.15 M (pH 7) 5. Centrífuga clínica
2. Reactivo de yodo 0.01 eq/L de Yodo 6. Espectrofotómetro o fotocolorímetro
en HCl 0.02M 7. Baño de maría a 37 °C
PROCEDIMIENTO
Se montará el siguiente set de trabajo:
Para cada tubo de reacción deberá hacerse un tubo blanco enzimático (sin enzima)
El blanco para el espectrofotómetro se realizará mezclando 0.5mL de agua con 4.5mL
de solución de lugol.
Inmediatamente mezcle e incube a 37 C por 7.5 min
Agregar 4,5 mL de solución reveladora
Leer al espectro a 640nm
PROCEDIMIENTO
Se montará el siguiente set de trabajo
CUESTIONARIO
1. …
2.
TEORÍA.-
El efecto de pH en la cinética enzimática es debido a cambios en el estado de
ionización de los componentes del sistema enzimático (enzima libre, complejo enzima -
substrato, substrato). Es posible que la enzima reaccione con una sólo especie iónica de un
substrato ionizable o tenga diferente afinidad con las diferentes especies iónicas del substrato.
Por su carácter de proteína posee numerosos grupos ionizables. Si se varia la
ionización de estos grupos en el nivel del sitio activo o en algún punto lejano, para que de
alguna manera altere el sitio activo, se afecta el tipo de unión y la estabilidad del complejo
enzima - substrato o la actividad catalítica misma.
Los efectos del pH sobre la actividad enzimática implican modificación del Km o de
la velocidad máxima de la reacción o de ambos.
PROCEDIMIENTO
Se montará el siguiente set de trabajo:
CUESTIONARIO
3. …
4.
CUESTIONARIO
1. Realice sus anotaciones y haga sus respectivos cálculos.
2. Para cada experimento ejecute su respectiva gráfica.
3. Comente sus resultados.
4. Grafique las absorbancias vs. las concentraciones de almidon digerido.
5. Grafique la velocidad (concentración de producto) vs. tiempo.
BIBLIOGRAFÍA
1. Gutierrez R., Ana y Santa Cruz C., C. (1998) Guía de Prácticas Bioquímica.
Universidad Nacional Federico Villarreal.
2. WIENER LAB. 1995. Vademécum. Edición Revisada y Actualizada. Rosario-Argentina.
Objetivos:
a) Usar el azul de metileno como indicador del proceso de oxidación, es decir como
aceptor final de hidrógenos.
b) Determinar la actividad Enzimática de la Succínico Deshidrogenasa, en un extracto de
hígado, riñón o corazón.
c) Estudiar algunos factores que afectan el transporte de electrones, siguiendo esta vía.
Teoría.-
Materiales y Reactivos:
Procedimiento:
1. Preparación de la enzima
La actividad enzimática se reconocer por la decoloración del azul de metileno. Cada grupo
de trabajo diseñará sus propios experimentos, que permitan responderlas preguntas que se
han formulado con respecto a los blancos necesarios y a los factores que puedan influir en
la reacción.
Cuestionario
MATERIAL y REACTIVOS
1. Elodea sp. u otra planta acuática. 5. 2 frascos de boca ancha
2. Agua destilada 6. 2 embudos de vidrio
3. Fuente de luz. 7. 2 tubos de ensayo
4. Cronómetro 8. 2 soportes con focos de 20 y 75 Watts
PROCEDIMIENTO
1. Preparar frascos con agua destilada.
2. Colocar en estos frascos la elodea o planta acuática bajo el embudo y sumergir
dentro del frasco.
3. Llena el tubo de ensayo con agua e inviértelo sobre el vástago del embudo,
procurando que no se derrame.
4. Repite los pasos descritos en el otro frasco obteniendo 2 montajes similares
5. Ilumina cada frasco con un foco distinto
6. Espera unos 15 minutos y mide con una regla el espacio vacío que queda en el
tubo de ensayo. Hasta aquí obtenemos la cantidad de O2 en volumen.
7. Para obtener en número de burbujas hacer otra preparación con agua destilada.
8. Colocar en estos la planta acuática sumergida cortando previamente una rama.
9. Medir la tasa de fotosíntesis cronometrando el número de burbujas de oxígeno
producidas por cada 10 segundos durante 100 y 120 segundos.
10. Observa durante una hora lo que pasa en ambos frascos
11. Anota la cantidad de burbujas que se desprenden cada minuto y mide nuevamente
el espacio vacío en el tubo de ensayo
12. Diseña una tabla de datos que resuma los resultados y colocar en una hoja de
cálculos.
CUESTIONARIO
1. Anote sus resultados y explique.
Teoría
Prácticas
1. ARIAS M. F., ARROYO B. A., GARCÍA DE GÓMEZ M. E. y VILLALOBOS M.
R. (1985): Curso de Bioquímica. Univ. Nacional Autónoma, México.
2. FALEN B. J. M. (1982): Manual de Práctica de Bioquímica. UNFV. Lima - Perú.
3. FRAIS F. (1972): Practical Biochemistry an Introductory course. Butterworths
London, University Park Press Baltimore.
4. GORNALL A.G., BARDAWILL C. y DAVID M.M. (1949): Determination of serum
proteins by means of the Biuret reaction. J. Biol. Chem. 177: 751 - 766.
5. NELSON N. (1944): A photometric adaptation of de Somogy Method for the
determination of glucosa. J.Biol.Chem. 153: 375 - 380.
6. PLUMMER T. D. (1981): Introducción a la Bioquímica Práctica. Ed. Mc Graw-Hill
Latinoamerica S.A.
7. BRYAN L.W. y WILSON K. (1981): Principios y Técnicas de Bioquímica
Experimental. Ed. Omega, S.A. Barcelona 36, España.