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Tema 6.

Ligamiento y mapas
genéticos

Genética CC. Mar 2005-06

Objetivos

•Establecer las relaciones entre genes


situados en el mismo cromosoma.

•Explicar los principios básicos de


elaboración de mapas genéticos en
eucariotas.

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Segregación no independiente (I)
• 1910 Morgan, Drosophila melanogaster
P ojos rojos, alas normales ! ojos púrpura, alas vestigiales
pr+/pr+ vg+/vg+ pr/pr vg/vg
F1 rojo, normal
pr+/pr vg+/vg

Cruzamiento prueba rojo, normal ! púrpura, vestigial


pr+/pr vg+/vg pr/pr vg/vg
F2 pr+/pr vg+/vg rojo normal 1339 tipo paterno
pr+/pr vg/vg rojo vestigial 151 tipo no paterno
pr/pr vg+/vg púrpura normal 154 tipo no paterno
pr/pr vg/vg púrpura vestigial 1195 tipo paterno

• La proporción no es 1:1:1:1 => la segregación


no es independiente.
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Segregación no independiente (II)


• Los gametos de tipo paterno (genotipos parentales) son
mucho más frecuentes que los no paternos.
• Los genes están ligados, localizándose en el mismo
cromosoma.
• Los tipos no paternos son realmente genotipos
recombinantes, que se producen por recombinación
genética durante el entrecruzamiento meiótico.

Figura. Mecanismo de entrecruzamiento


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Fase gamética
• Los genes ligados se pueden ordenar de
dos maneras (“fase”):
– Acoplamiento (cis) = AB / ab
– Repulsión (trans) = Ab / aB

AB Ab AB Ab
---- ---- === ===
ab aB ab aB

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Demonstración del entrecruzamiento


• Harriet Creighton y
Barbara McClintock
(1931) en maíz.
• La recombinación
está asociada al
intercambio de
fragmentos físicos de
los cromosomas.
Figura. Experimento de Creighton y McClintock (1931)

C: color de la semilla, c: sin color


Wx: endospermo almidonoso, wx: endospermo ceroso

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Determinación de grupos de
ligamiento
• H0: los genes no están ligados (segregan
independientemente).
• H1: los genes están ligados.
• Cruzamiento prueba.
• Ji-cuadrado de independencia (o de ajuste)
g.l.= (nº de columnas – 1) ! (nº de filas – 1
nº de!clases
(Oi " Ei )2
! =
2
# Ei
i =1

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Ji-cuadrado

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Prueba del ligamiento (I)
• Drosophila (b+ cuerpo gris, b cuerpo negro; vg+ alas normales, vg
alas vestigiales)

b+/b vg+/vg (gris, normal) ! b/b vg/vg (negro, vestigial)

283 gris, normal


1294 gris, vestigial
1418 negro, normal
241 negro, vestigial
Figura. Mutantes vestigial

Observados vg+ vg
b+ 283 1294 1577
b 1418 241 1659
1701 1535 3236

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Prueba del ligamiento (II)


Observados vg+ vg
b+ 283 1294 1577
b 1418 241 1659
1701 1535 3236

• Si los genes no estuviesen ligados esperaríamos:


b+ vg+ = 1577/3236 ! 1701/3236 ! 3236 = 1577 ! 1701 / 3236 = 828.95
b+ vg = 1577 ! 1535 / 3236 = 748.05
b vg+ = 1659 ! 1701 / 3236 = 872.05
Esperados vg+ vg
b vg = 1659 ! 1535 / 3236 = 786.95 +
b 828.95 748.05 1577
b 872.05 786.95 1659
1701 1535 3236

"2 = (283 – 828.95)2 / 828.95 + (1294 – 748.05)2 / 748.05+ (1418– 872.05)2 /


872.05 + (241–786.95)2 / 786.95 = 1478.556
"21g.l, 0.05= 3.84

"2 >> "21g.l, 0.05 => Se rechaza H0 = los genes están ligados.

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Mapas genéticos
• Alfred Sturtevant (1913): mayor
distancia entre genes => mayor nº de
entrecruzamientos => mayor
frecuencia de recombinación (FR o r).
• Entrecruzamiento (físico) !
recombinación (genética).
• Con las distancias podemos construir
mapas genéticos.
• 1 unidad de mapa (mu) =
1 centimorgan (cM) =
1% recombinación.

Figura. Entrecruzamiento y distancia genética.

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Primer mapa
• Drosophila. Genes ligados al sexo white (w),
miniatura (m) y yellow (y).

– FR (w ! m) = 32.6%
– FR (w ! y) = 1.3%
– FR (m ! x) = 33.9%

1.3 mu 32.6 mu
y w x

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Cruzamientos de dos puntos
• Se estudian dos caracteres en la
descendencia de un cruzamiento
prueba de un doble heterocigoto.
– Freq (parental) > Freq (recombinante).
– Freq (parental 1) = Freq (parental 2).
– Freq (recombinante 1) = Freq
(recombinante 2).

N º recombinantes
Frecuencia!de!recombinación!(r) = ! 100
N º progenie

• Más exacto en distancias cortas.


• La frecuencia de recombinación
subestima las distancias de mapa.
• Conviene medir una progenie
numerosa.
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Frecuencia de recombinación
• La frecuencia
máxima de
recombinación (r)
es del 50%.
• Genes no ligados:
r = 50%
– En diferentes
cromosomas.
– Distantes en el
mismo
cromosoma.

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Cruzamiento de tres puntos
• Se estudian tres caracteres en la descendencia un triple
heterocigoto con un triple homocigoto recesivo.
• Se empieza por establecer el orden de los genes.
• 8 clases fenotípicas posibles:
– 2 parentales (los más frecuentes)
– 4 recombinantes simples (menos frecuentes)
– 2 recombinantes dobles (muy raros)
• En el doble recombinante cambia la orientación del
par alélico situado en el medio de los tres genes:

Figura. En el doble recombinante el gen del medio es el que invierte sus alelos
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Ejemplo cruzamiento 3 puntos (I)


• Las clases 6 y 7 son
recombinantes dobles.
• => El orden es p j r.

Figura. Resultado del doble entrecruzamiento

Figura. Cruzamiento de tres puntos Genética CC Mar 2005/6 • D. Posada, Universidad de Vigo 16
Ejemplo cruzamiento 3 puntos (II)
• FR (p ! j) = (52 + 46 + 4 + 2) /
500 ! 100 = 20.8%
• FR (j ! i) = (22 + 22 + 4 + 2) /
500 ! 100 = 10.0%
• FR (p ! r) = FR (p x j) + FR (j x r)
! 100 = 30.8%

Figura. Mapa genético

Figura. Resultados del cruce

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Interferencia y coincidencia
• En el ejemplo anterior la frecuencia de los dobles
recombinantes debería ser 0.208 ! 0.100 = 2.08%,
pero es 6/500 = 1.2%
• Interferencia: la presencia de un entrecruzamiento
interfiere con la formación de otro entrecruzamiento
cercano.

N º dobles!recombinantes!observados
Coeficiente!de!coincidencia!(CC) =
N º dobles!recombinantes!esperados

Interferencia!(I ) = 1 ! Coeficiente!de!coincidencia

• En el ejemplo anterior CC = 0.012/0.0208 = 0.577;


I = 0.423.
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Funciones de mapa (I)
• Entrecruzamientos dobles entre dos genes:
– 100% gametos parentales.
– Subestima de la distancia de mapa.
– Relación no linear entre la frecuencia de recombinación
y la distancia de mapa.

Figura. Progenie de entrecruzamientos simples y dobles Genética CC Mar 2005/6 • D. Posada, Universidad de Vigo 19

Funciones de mapa (II)


• Podemos ignorar la interferencia y asumir que el número de
entrecruzamientos sigue una distribución de Poisson con
media d: x
!d d
P(X = x) = e
x!

• Podemos estimar la probabilidad de observar


entrecruzamientos mútiples impares (1,3,5,7, … ), ya que
son los únicos que resultan en genotipos recombinantes.
"
e! d d (2 k +1) 1
r=# = (1 ! e!2d )
k = 0 (2k + 1)! 2

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