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Este documento describe un experimento para analizar los patrones de herencia de las mutaciones en los genes Dumpy, Black y White en la mosca de la fruta Drosophila melanogaster. Se realizó un cruce entre moscas macho triple mutantes (Dumpy, Black y White) y hembras silvestres, y se contó la progenie para determinar si seguían un patrón mendeliano de herencia. Los resultados mostraron proporciones consistentes con la herencia ligada al sexo del gen White en el cromosoma X, y la herencia autosómica de los genes Dumpy y
Este documento describe un experimento para analizar los patrones de herencia de las mutaciones en los genes Dumpy, Black y White en la mosca de la fruta Drosophila melanogaster. Se realizó un cruce entre moscas macho triple mutantes (Dumpy, Black y White) y hembras silvestres, y se contó la progenie para determinar si seguían un patrón mendeliano de herencia. Los resultados mostraron proporciones consistentes con la herencia ligada al sexo del gen White en el cromosoma X, y la herencia autosómica de los genes Dumpy y
Este documento describe un experimento para analizar los patrones de herencia de las mutaciones en los genes Dumpy, Black y White en la mosca de la fruta Drosophila melanogaster. Se realizó un cruce entre moscas macho triple mutantes (Dumpy, Black y White) y hembras silvestres, y se contó la progenie para determinar si seguían un patrón mendeliano de herencia. Los resultados mostraron proporciones consistentes con la herencia ligada al sexo del gen White en el cromosoma X, y la herencia autosómica de los genes Dumpy y
ANÁLISIS DE LIGAMIENTO EN GENES DUMPY, BLACK Y WHITE
EN LA MOSCA DE LA FRUTA DROSOPHILA MELANOGASTER
_____________________________________________________________________ Genética. Laboratorio de Genética Humana. Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de Los Andes, Bogotá D.C., Colombia.
Forero, L. M., Neira, L., Pedraza, J. J., Suárez, S.
Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de Los Andes, Bogotá D.C., Colombia.
Resumen – Drosophila melanogaster, conocida 1. INTRODUCCIÓN
como la mosca de la fruta, ha sido ampliamente Drosophila melanogaster resulta ser un excelente utilizada en estudios genéticos ya que posee organismo modelo para el estudio de la evolución distintas características que la hacen un modelo de cromosómica y las interacciones génicas. Después estudio óptimo, especialmente en estudios de de casi un siglo desde que Thomas Morgan (1866- 1945) descubre lo él denominó “herencia limitada patrones de herencia, como por ejemplo su ligada al sexo” y la mutagénesis causada por reducido número de cromosomas, reproducción radiación ionizante (Morgan, 1910) en D. temprana así como también su corto tiempo de melanogaster, este organismo sigue siendo ampliamente utilizado por la capacidad de realizar vida. En este experimento se realizó un cruce de múltiples cruces, con progenie numerosa, rápido cinco hembras virgenes de fenotipo silvestre (wt) crecimiento y con poco espacio requerido. de Drosophila melanogaster con cinco machos de fenotipo W D B de la misma especie. La obtención del primer mutante reportado de D. melanogaster fue realizado por Morgan, mutante Posteriormente, se llevo a cabo un conteo y que de diferencia de los individuos silvestres, tenía caracterización de la progenie y se establecieron, a ojos blancos. El conocimiento por parte de Morgan través de la prueba estadística de chi-cuadrado, los del trabajo previo de Mendel lo impulsó a realizar cruces para comprobar la base genética de esta patrones de herencia de la genes de estudio Dumpy mutación. Aunque Morgan encontró progenies y (Dp), Black (B) y White (W). Los resultados fueron proporciones similares a las esperadas bajo la congruentes con lo esperado, en donde se genética mendeliana un resultado no era predicho por la teoría de Mendel: todas las moscas de ojos corroboraron proporciones de aparición del gen blancos eran machos (Raven et al., 2002), a lo cual White de acuerdo a su ligamiento al X así como Morgan se refirió como un carácter “limitado al también se corroboró un ligamiento de los genes sexo”. Dumpy y Black situados ambos en el cromosoma En este informe se reportan los resultados de un II del modelo de estudio. experimento para analizar la aplicabilidad de la teoría genética mendeliana sobre la herencia de Palabras clave – Drosophila melanogaster, caracteres mutantes en D. melanogaster. herencia mendeliana, ligamiento, chi-cuadrado. Adicionalmente, al trabajar con la mutación White, ligada al sexo según la literatura, se pretende Este estudio es particularmente importante por la estudiar los patrones correspondientes a dicho tipo utilización de una cepa triple-mutante, tratando así de herencia en el marco de las teorías propuestas de comprender mejor los fenómenos de interacción por Thomas Morgan. génica que pueden ocurrir en genes del mismo o diferente locus y cromosoma. Además, este Drosophila melanogaster tiene un genoma estudio posee implicaciones en el entendimiento compuesto por cuatro pares de cromosomas (tres de procesos evolutivos, métodos de mejora pares autosómicos y un par sexual), en los cuales genética y herencia de enfermedades. el material genético es altamente conservado entre las especies del género (Müller, 1940). Esto da 2. METODOLOGÍA lugar la posibilidad de identificar interacciones génicas a nivel alélico y de alelos de diferente loci, Para observar la segregación genética de los más aún cuando se posee una característica fenotipos de las mutaciones asociadas a los genes genética clara que de un cambio fenotípico claro, White, Dumpy y Black se realizó un cruce entre como es el caso de las mutaciones, que son muy hembra de cepa pura silvestre y macho triple dicientes cuando se estudian patrones hereditarios. mutante White, Dumpy y Black. Inicialmente, se seleccionaron 5 machos con las tres mutaciones Para el desarrollo experimental del presente mencionadas, además 5 hembras silvestres proyecto se seleccionaron moscas triple-mutantes vírgenes y se introdujeron en un recipiente con el macho y moscas silvestres hembra para la medio de cultivo apropiado compuesto por banano realización de los cruces, las tres mutaciones de y fécula de maíz. los genes asociadas a los individuos macho se encuentran en los genes White (XWY), ubicado en Se realizaron adicionalmente 3 réplicas para el cromosoma sexual (X), la cual otorga al obtener una mayor progenie, evitar interferencias y individuo el fenotipo de ojos y ocelos blancos, esta tener resultados estadísticamente significativos. mutación se encuentra ligada al cromosoma sexual Los tres recipientes con las moscas se incubaron a X, es de origen tanto mutagénico como espontáneo una temperatura de 25ºC durante 15 días para y presenta dominancia incompleta. Los optimizar su ciclo de vida, obteniendo la primera heterocigotos (w/w+) tendrán menor cantidad de filial (F1) dos semanas después. Posteriormente, se pteridinas de pigmento rojo, mientras que en los realizó el conteo de la progenie y se prosiguió a individuos homocigotos (w+/w+) no presentan realizar el cruce de la F1 tomando 5 machos que pigmentos a causa de un bloqueo en al ruta presentaron las tres mutaciones y 5 hembras metabólica de las pteridinas y omocromos vírgenes por recipiente. Se tomaron, además, 3 (Thiemann, 2001). réplicas y se incubaron a 25ºC durante dos semanas. Los individuos, a su vez, eran portadores de una Finalmente, se llevo a cabo el conteo de la segunda mutación en el gen Dumpy, el cual se encuentra en filial (F2) para comprobar la existencia de un la región 13 del cromosoma 2 implicado en la patrón de herencia mendeliano de las tres codificación de proteínas encargadas de mantener mutaciones consideradas y en caso de no la tensiones en las uniones epidermis-cutícula, de cumplirse las leyes mendelianas se verificó bajo esta manera mutaciones en este gen ocasiona un qué mecanismo genético se segregaron los alelos fenotipo recesivo caracterizado por poseer alas que causan las mutaciones. truncadas y reducidas a ⅔ de su longitud normal. La tercera mutación presente en las moscas macho se encuentra en el gen Black y ocasiona cuerpo de coloración negra. El primer mutante del gen Black fue reportado por Thomas Morgan quien lo describió como una mutación autosómica recesiva. 3. ANÁLISIS DE RESULTADOS Y Tabla 2. Resultados prueba Chi cuadrado (X2) para DISCUSIÓN patrón mendeliano. Se muestran los individuos observados (O) de cada fenotipo, las proporciones esperadas (P) y el número de individuos esperados (E), Conteo de fenotipos obtenido de la F2 así como el valor de chi cuadrado y el P-value obtenido Los datos obtenidos del conteo de progenie de la de la prueba. F2 entre (i) machos wild type (wt) y hembras triple mutantes (W, D y B), así como (ii) hembras wt y machos triple mutantes se resumen en la Tabla 1, donde se obtuvieron 1012 y 1440 individuos para cada cruce respectivamente. Los genes mutantes se encuentran agrupados según la característica fenotípica del grupo de individuos. D, B y W hacen referencia a la presencia de un único alelo sin mutación, por lo cual al ser dominante, este no expresa el fenotipo del alelo mutado.
A continuación, se procedió a comprobar la
existencia de un patrón de herencia mendeliano para las mutaciones estudiadas. Para lo anterior, se realizó una prueba Chi-cuadrado (X2) utilizando Análisis de Ligamiento Cromosómico como resultado esperado las proporciones de herencia mendeliana, lo cual incluye la suposición En consideración de la significancia estándar de que los genes mutantes se encontraban en utilizada de 0,05 y el valor de P de cromosomas autosómicos diferentes (Tabla 2), aproximadamente 0.00 se puede concluir que la obteniendo un valor crítico de X2 de 24,99 y herencia de los cruces realizados no siguen un correspondiente a un P-value menor a 0,001 patrón mendeliano. (α=0,05) para ambos cruces realizados. De esta manera, se encontró que los valores obtenidos de Por otro lado, se procedió a considerar la los conteos fenotípicos no presentan proporciones disposición de genes en el genoma de Drosophila propias de un patrón de herencia mendeliano. melanogaster (Ilustración 1). Se sabe que los tres Tabla 1. Conteo de progenie discriminado por sexo. D, genes: Dumpy (dp), Black(b) y White(w) son B y W hacen referencia a la presencia de un único alelo recesivos para cada fenotipo. Conociendo que los sin mutación, de esta manera no se expresa la alelos mutantes Dumpy (dp) y Black (b) se mutación. encuentran en el mismo cromosoma (Ilustración 1), es decir, están ligados a nivel cromosómico, permitiendo que por recombinación se presenten individuos genotípicamente, y por lo tanto también fenotípicamente distintos a los parentales.
Por consiguiente, estos genes no se comportan de
forma mendeliana en tanto la distancia entre genes que están en un mismo cromosoma aumenta las probabilidades de obtener genotipos recombinantes debido a la generación de diferentes gametos. Adicionalmente, el alelo mutante White (w) está ubicado en el cromosoma X, es decir, está ligado al sexo. Por lo que el fenotipo expresado por el distancia de 35.5cM entre los genes Dumpy y gen white se observa principalmente en machos Black, lo cual también indica un 35% de debido a que el cromosoma Y no contiene la probabilidad de recombinación durante la meiosis. mayoría de genes contenidos en el cromosoma X y Bajo la anterior premisa se puede conocer que la un solo gen recesivo expresaría ojos blancos en un probabilidad de que suceda alguno de los alelos macho XY. recombinados es de ½ r y la probabilidad de que sucedan los alelos sin recombinar corresponde a ½ (1-r), donde r es la fracción o probabilidad de recombinación. De esta manera, se obtuvieron las probabilidades de ocurrencia de los combinaciones alélicas para la F2 (Tabla 3).
Tabla 3. Probabilidad de aparición de gametos. El
símbolo “o” en los alelos hace referencia al alelo silvestre para Dumpy o para Black por cuestiones de facilidad visual, mientras que D o B indican la presencia del alelo mutado. X1 hace referencia a la presencia de la mutación White ligada al cromosoma X.
Con dichas probabilidades se desarrolló el cuadro
de Punnett para el cruce trihíbrido y se calcularon las probabilidades fenotípicas tanto para machos como para hembras.
Tabla 4. Cruce trihíbrido. En negrita se denota la
proporción de machos correspondientes a cada cruce. La Tabla 5 contiene el código de colores de cada fenotipo con sus respectivas probabilidades.
Ilustración 1. Disposición de loci y genes en el genoma
de Drosophila melanogaster. Nótese que el gen black body (b) y el gen dumpy (dp) se encuentran ambos en el cromosoma II. Imagen tomada de: http://flybase.org/maps/chromosomes/maps.html.
Se puede observar de la Ilustración 1 que el gen
Dumpy se encuentra en la posición 13.0 y el gen Black en la posición 48.5, es decir, existe una Conociendo las probabilidades de obtener los Tabla 6.Resultados prueba Chi cuadrado (X2) diferentes gametos, mostradas en la Tabla 3, se para patrón no mendeliano. Se muestran los realiza un cruce trihíbrido que es mostrado en la individuos observados (O) de cada fenotipo, las Tabla 4. proporciones esperadas (P) y el número de Las probabilidades de tener machos o hembras con individuos esperados (E), así como el valor de chi los cuatro diferentes fenotipos se obtienen cuadrado y el P-value obtenido de la prueba. sumando las probabilidades de los genotipos que dan origen al fenotipo específico. Por ejemplo, en la Tabla 4 se muestra en amarillo las probabilidades de tener un individuo con fenotipo salvaje, posteriormente se suman dichas probabilidades, discriminando si es hembra o macho, y de ese modo se obtiene una probabilidad igual a 0.151 para un macho con fenotipo salvaje y otra de 0.302 también para una hembra con fenotipo salvaje. Las sumas de las probabilidades de acuerdo a los fenotipo se muestran en la Tabla 5.
Tabla 5. Proporciones fenotípicas. Se observan
las proporciones fenotípicas totales, así como las Considerando únicamente aquellas categorías proporciones respectivas por sexo, y el código de donde el valor de Chi cuadrado es diferente a 0 se colores utilizada en la Tabla 4. puede calcular el p-value asociado a nuestros resultados, el cual es 0,0752. De esta manera y considerando un valor crítico de X² de 19,68 y un alfa de 0.05, no se rechaza la hipótesis nula bajo los supuestos y se concluye con un 95% de confianza que, los datos obtenidos de los conteos de los fenotipos tienen un comportamiento tal que los alelos mutantes de los genes Dumpy y Black se encuentran en el mismo cromosoma, mientras que el alelo mutante del gen White está ligado al sexo (X).
Respecto a la tabla 2, se analizaron los altos
valores para la prueba de chi-cuadrado y un p- value menor al valor alfa (0.05) para el rechazo de la hipótesis nula. Además, y según los datos obtenidos para las mutaciones White, Dumpy y Black se rechaza una herencia mendeliana. Por esto se procedió a incluir en el análisis las Luego de éstos cálculos se procedió a computar el posiciones relativas de los genes en los valor de X² para el cruce 1. cromosomas de D. melanogaster.
Por otro lado, en la tabla 6 se analizaron los
valores de chi-cuadrado para un patrón de herencia no mendeliano y teniendo en cuenta las posiciones a lo anterior, en la progenie no se esperarían relativas de los genes en cuestión se resaltaron tres hembras con el fenotipo White ya que todas las categorías en las que no se esperaba encontrar hembras XX con al menos un X sin la mutación individuos pero que no cumplieron con dicha presentarían el fenotipo salvaje de ojos rojos. Por suposición. Debido a que son individuos el contrario, los machos al ser heterogaméticos teóricamente imposibles bajo el tipo de herencia (XY) cuando heredan un cromosoma con la conocido y apoyado científicamente, se puede mutación obligatoriamente presentan el fenotipo concluir a priori de la prueba de chi-cuadrado de mutante de ojos blancos. En otras palabras, se los datos recolectados no cumplen las predicciones esperaría un porcentaje de 25% de machos con el iniciales. Estos grupos que no se ajusten cuentan fenotipo White, con la tabla 5 se puede sumar las con máximo dos individuos que a comparación de probabilidades de tener un macho con fenotipo un total de 1440 individuos no son significativos. White dando 0.249 que concuerda con lo esperado. Asimismo, los resultados no esperados pueden ser debido a una mala caracterización del sexo de los BIBLIOGRAFÍA individuos ya que al no tener individuos esperados para las cuatro categorías estipuladas inicialmente Morgan, T. (1910). Sex Limited Inheritance in no se tuvieron en cuenta para el análisis chi- Drosophila. Science, 120-122. cuadrado. Finalmente y respecto a el análisis de herencia no mendeliano del valor de chi-cuadrado Mülller, H. J. (1940), 'Bearings of the Drosophila no superó el valor crítico y el p-value supera el Work on Systematics', in J. Huxley(ed.), The New valor alfa. Lo anteriormente mencionado permite Systematics, The Clarendon Press, Oxford, pp. aceptar la hipótesis nula. 185–268
4. CONCLUSIONES Raven, P., & Johnson, G. (2002). Biology 6th
Edition. McGraw Hill. Recuperado de Se concluye que el tipo de herencia de las http://www.mhhe.com/biosci/genbio/raven6b/grap mutaciones White, Dumpy y Black no tienen un hics/raven06b/howscientiststhink/02-lab.pdf carácter mendeliano ya que el gen que posee el alelo mutado para Dumpy y el gen que posee el Stephenson, R., & Metcalfe, N. (2013). Drosophila alelo para Black se encuentran en el cromosoma II melanogaster: a fly through its history and current a una distancia de 35cM que afecta la forma en la use. J R Coll Physicians Edinb, 70-75. Recuperado que se segregan dichos alelos durante la mitosis. de En síntesis, lo genes Dumpy y Black se encuentran http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23516695. ligados parcialmente en tanto puede ocurrir una recombinación dándose una segregación Thiemann, T. C.(2001). Genotype to Phenotype: diferencial o una segregación en el que ambos Investigating Eye Color Mutations Using genes se hereden en bloque. Con respecto a la Chromatography. Recuperado de mutación White, este fenotipo se encuentra ligado http://www.public.asu.edu/~thoffman/commonfile al sexo ya que el gen que posee este alelo se s/lsc348/lsc348drosophilaeyepigment.pdf. encuentra en el cromosoma X. El ligamiento parcial y el ligamiento al sexo de los fenotipos cambian las proporciones mendelianas de los fenotipos expresados. La ausencia de hembras con fenotipo White se explican a partir del ligamiento al sexo de este fenotipo y su carácter recesivo. Finalmente, la filial dos (F2) se obtuvo a partir del cruce entre una hembra portadora del fenotipo White y un macho sin el fenotipo. En consecuencia