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ESTRUCTURA DE NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos son las unidades estructurales de los ácidos nucleicos. Si bien estos últimos son
moléculas de grandes dimensiones, están compuestos por repetición de un número reducido de
moléculas.
Un nucleótido está compuesto por una aldopentosa: Ribosa (R), 1, en el caso de los nucleótidos y
ácidos ribonucleicos (ARN o ARN) y desoxirribosa (dR), figura 15.2, en el caso de los
desoxinucleótidos y los ácidos desoxirribonucleicos (ADN o ADN).
En el caso que el nucleósido se ligue a una o más moléculas de ácido fosfórico (o fosfato) se
obtendrán nucleótidos mono, di o trifosfato, dependiendo de que las moléculas de fosfato sean 1, 2 o
3 respectivamente. El primer fosfato se une por unión éster en el oxhidrilo del carbono 5' de la
pentosa. Los otros fosfatos se unen al fosfato mencionado por enlace anhídrido, que es un enlace
macroérgico. En el caso que a la adenosina se le una un fosfato se obtendrá el adenosin monofosfato
o AMP (figura 15.9).
Si se unen 2 fosfato se forma un nucleótido llamado adenosin difosfato o ADP (figura 15.10). En
caso que sean tres los fosfato unidos se forma el adenosin trifosfato a ATP (figura 15.11).
Figura 15.10
En el caso que sea una ribosa unida a dos fosfatos y un uracilo el nucleótido se llamara
uridindifosfato y se simboliza UDP.
Si el glúcido es desoxirribosa, la base citosina y un fosfato el nucleótido se denomina
desoxicitosinamonofosfato o dCMP.
Enlace fosfodiéster
Este enlace es el característico de la unión de dos nucleótidos en estruras como los polinucleótidos y
los ácidos nucleicos. Para producirse esta unión sSe hidroliza la unión entre el primer y el segundo
fosfato del nucleótido, produciéndose la unión de este último al oxhidrilo del la posición 3' de otro
nucleótido. El enlace formado se conoce como 3'- 5' -fosfodiéster (figura 15.12).
A través de estos enlaces se unen gran cantidad de nucleótidos para dar origen a los ácidos
desoxirribonucleicos (ADN) y los ácidos ribonucleicos (ARN). Independientemente de la cantidad
de nucleótidos, en un extremo quedará libre el carbono 5' de la pentosa, este es el extremo 5'. En el
otro extremo de la cadena de nucleótidos permanecerá sin combinarse el carbono 3' del glúcido, este
extremo se llama 3'.
ESTRUCTURA DEL ADN
En la estructura del ADN intervienen desoxinucleótidos formados por desoxirribosa, fosfato,
adenina, guanina, citosina y timina, pero no tiene ribosa ni uracilo en su estructura. El ADN consiste
de dos cadenas de gran cantidad de nucleótidos. Estas cadenas se enfrentan y presentan lo que se
llama complementariedad de bases. Esto significa que mientras que en una cadena existe C, en la
otra existe G. Cuando existe A en la otra se complementa con T. Además las cadenas son
antiparalelas, esto significa que el extremos 3' de una cadena se enfrenta al extremo 5'de la otra. El
siguiente esquema representa una porción de una molécula de ADN
3' A A T T T C C G T G T A T C C C C G G T A 5'
5' T T A A A G G CA C A T A G G G G C C A T 3'
En esta estructura a un conjunto de tres bases se las denomina codón o triplete. Por ejemplo en la
cadena inferior, comenzado por el extremo 5' encontramos el triplete TTA.
En el ADN se encuentra codificada la información para construir la estructura de las proteínas. Cada
triplete codifica uno de los 20 aminoácidos. La porción del ADN que codifica una proteína se
denomina gen. Los genes tienen porciones que codifican proteínas llamadas exones y porciones no
codificantes llamadas intrones. También existen porciones con las cuales interactúan factores y
enzimas encargadas de copiar ARN utilizando como molde el ADN. Estas porciones se denominan
promotores.
La doble hebra del ADN adopta una forma helicoidal, de allí su nombre de doble hélice. Esta doble
hélice luego se liga a proteínas conocidas como histonas constituyendo así estructuras mas complejas
conocidas como nucleosomas. Estas estructuras constituyen la cromatina.
Genoma humano
A fin de tener una idea de la dimensión de la molécula de ADN se suministran algunos número
relacionados a la estructura del ADN surgida fundamentalmente de conocimiento del genoma
humano publicado en el año 2001. La secuencias completa del genoma conocido en el 2001 tiene
aproximadamente 3.000.000.000 de nucleótidos de A, C, G y T. Solamente del 1,1 al 1,5 % codifica
para proteínas. Un 40-46% del genoma son regiones repetidas y desiertas no codificantes. Existe un
99,9 % de homología de un individuo a otro, sin embargo geno y fenotípicamente somos diferentes.
ADN 5'
3' 3' 5'
5' 3'
5' 3'
HELICASA
Luego de la acción de la helicasa comienza a actuar la primasa o ARN polimerasa, enzima que
cataliza la formación de ARN. Como se mencionó anteriormente esta enzima lee la hebra utilizada
como molde en el sentido 3' a 5' y sintetiza una cadena en el sentido 5' a 3'. Utiliza como sustratos
nucleótidos trifosfato (ATP, CTP, UTP y GTP) incorporando nucleótidos monofosfato y liberando
pirofosfato. Por cada nucleótido que se incorpora se gastan por lo tanto 2 enlaces macroérgicos.
Esta enzima sintetiza una porción de ARN llamado "primer" o cebador.
Luego de la síntesis del "primer", la enzima primasa da lugar a la entrada de la ADN polimerasa,
enzima que a continuación del "primer" sintetizará ADN, en el mismo sentido que lo venía haciendo
la primasa. Esta enzima utiliza desoxinucleótidos trifosfato (dATP, dCTP, dTTP y dGTP),
incorporando desoxinucleótidos monofosfato a la cadena en formación, ligándolos por enlace 3'-5'
fosfodiéster. Esta enzima sintetiza ADN hasta completar la burbuja de duplicación. Se necesita luego
la acción nuevamente de la helicasa que amplia la burbuja de duplicación. De esta manera la ADN
polimerasa puede continuar la síntesis en el sentido que lo venía haciendo.
Para completar los extremos 3' de la burbuja se necesita la acción nuevamente de la primasa que
forma un primer, a continuación del cual una nueva molécula de ADN polimerasa completa con
ADN la porción restante. De esta manera sobre una hebra, utilizada como molde, a partir del sitio en
que se inició la duplicación se producen dos procesos: en el sentido 3' a 5'la ADN sintetiza ADN en
forma continua, esta es la hebra conductora o guía. En el sentido 5' a 3' se sintetiza de a porciones
compuestas por un "primer" y luego ADN, llamadas fragmentos de Okasaki. La porción de ARN de
estos fragmentos es luego eliminada por la acción de una nueva ADN polimerasa que posee dos
actividades enzimáticas: ribonucleasa que hidroliza ARN y ADN polimerasa que sintetiza en su lugar
ADN. Luego de la acción de esta enzima cada hebra de la molécula madre queda copiada , salvo que
quedan algunos enlaces 3'-5' fosfodiéster por formar entre los fragmentos. La acción de una enzima
llamada ADN ligasa cataliza la formación de estos enlaces completando la copia del sector.
Este proceso continua desde el punto de iniciación ampliando la burbuja de duplicación hasta
completar el proceso y tener así dos moléculas idénticas a la que le dio origen.