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Dr. Margarita Margarita Concha G.

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Concha G., o=UACh,
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Concha G. Date: 2004.04.29
10:10:37 -04'00'

BIOQ 108 -2004

Dra. Margarita Concha G.
FLUJO DE LA INFORMACIÓN GÉNICA
Dilucidación del código genético
Dilucidando el código genético
Código genético
DEGENERACIÓN DEL CÓDIGO GENÉTICO
Código genético universal
Apareamientos del tRNA fenilalanina

Apareamiento de bases no-estándar

Apareamiento del tRNA alanina (no estándar)
HIPOTESIS DEL BALANCEO
MARCOS DE LECTURA PRESENTES EN UNA SECUENCIA
CARACTERÍSTICAS DE LA SÍNTESIS PROTEICA

™ Proceso biosintético más complejo de la célula

™ Requiere participación de aprox. 300 macromoléculas distintas

™ Puede requerir aprox. el 90% de la energía destinada a la

biosíntesis en una célula

™ A pesar de ello es un proceso muy rápido y preciso

Ej. Una proteína de 100 residuos en 5 seg.
ESQUEMA GLOBAL DE LA SÍNTESIS PROTEICA

Iniciación Elongación Terminación

Dirección de movimiento de ribosomas

¿CUALES SON LOS COMPONENTES BÁSICOS

REQUERIDOS PARA LA SÍNTESIS PROTEICA?

RIBOSOMAS SUBUNIDADES MAYOR Y MENOR

RNAS rRNAS, tRNAs y mRNAs

PROTEÍNAS aaRSs, S y L; IFs, EFs, RFs, otras

NUCLEÓTIDOS Mg+2-ATP y Mg+2-GTP

AMINOACIDOS 20 diferentes
 ESTRUCTURA SECUNDARIA

Apareamiento de bases a lo largo de regiones extensas de

secuencias complementarias entre 2 hebras de ácidos
nucleicos estabiliza la estructura secundaria tal como ocurre
en la doble hélice del ADN.

Las interacciones de apilamiento entre bases hidrofóbicas

adyacentes contribuye a estabilizar tales estructuras secundarias.
Cada base interactua con su vecinas ubicadas inmediatamente
arriba y abajo en el arreglo tipo escalera que existe en la doble
hélice del ADN
 Estructura de ARN:

La mayoría de los ARNs poseen C UG

A U A C C
: : : : : U
estructura secundaria, consistente U A U G G U
C U
en dominios de asa y tallo .
stem loop

El tallo doble hélice se origina del apareamiento de bases entre

bases complementarias dentro de la misma hebra.

Las asas o bucles ocurren donde hay falta de complementariedad,

o donde la presencia de bases modificadas, previene el
apareamiento.
Estructura secundaria del tRNA (hoja de trébol)

Brazo de unión del aa

Los tRNAs típicamente

incluyen muchas bases
modificadas, particularmente
en los dominios de asas.
 Estructura tridimensional del tRNA

Sitio de
unión del aa #46
(m7G)

#22
G #13
C

Tertiary base
Phe
pairs in tRNA

anticodón

La estructura terciaria depende de interacciones de bases en sitios más distantes.

Muchas de estas interacciones involucran apareamientos no-estándares y/o
interacciones que involucran 3 o más bases. tRNAs generalmente se pliegan en
forma de L.
 anticodon

Phe
tRNA

acceptor
stem

I. Extendiéndose del brazo aceptor, el extremo 3’ de cada tRNA

posee la secuencia CCA

II. El aminoácido se une a la ribosa de la A terminal del extremo 3’

El asa del anticodon se encuentra en el lado opuesto en la forma L
 O O O O
H γ β α
R C C O − −
O P O P O P O CH2 Adenine
O
NH3+ O− O− O− H H
Amino acid ATP H H
1 OH OH

O O
H α Adenine
Rα C C O P O CH2
O
NH2 O− H H + PPi
Aminoacyl-AMP H H
OH OH

Aminoacil-tRNA Sintetasas catalizan la unión del aminoácido

apropiado a cada tRNA. La reacción ocurre en 2 etapas

En la etapa 1, un átomo de O del carboxilo α ataca al átomo

P del fosfato α del ATP
 O O
H
R C C O P O CH2 Adenine
O
NH2 O− H H

Aminoacyl-AMP H H
OH OH
Etapa 2, el 2' o 3' OH de
tRNA
2
la adenosina terminal tRNA AMP

del tRNA ataca al átomo O

O P O CH2 Adenine
de C del carbonilo. O
(terminal 3’nucleotide
O− H H
of appropriate tRNA)
H 3’ 2’ H
O OH

C O
Aminoacyl-tRNA
HC R

NH3+
Resumen de la reacción:

1. amino ácido + ATP Æ aminoacil-AMP + PPi

2. aminoacil-AMP + tRNA Æ aminoacil-tRNA + AMP

La reacción global es espontánea, debido a que la concentración de

PPi es mantenida baja gracias a su hidrólisis catalizada por la enzima

pirofosfatasa.
Aminoacil-tRNA- sintetasas

-Clase I y II (10 c/u)

- monoméricas
- diméricas
-o tetraméricas

-Escasa homología
entre ellas

-Tampoco unen el tRNA

por el mismo lado
Interacción entre un tRNA
y su aminoacil tRNA
sintetasa
Existe una Aminoacil-tRNA Sintetasa (aaRS) diferente por cada
aminoácido

Cada aaRS reconoce su aminoácido particular y a los tRNAs que

codifican para ese aminoácido

La traducción precisa del código genético depende de la unión de

cada aa a un tRNA apropiado

Los dominios del tRNA reconocidos por una aaRS se denominan

Elementos de identidad

La mayoría de los elementos de identidad se encuentran en el brazo

aceptor y en el asa del anticodon.

Las aaRS se originaron tempranamente en la evolución. Las aaRSs

primitivas probablemente reconocían a sus tRNAs solo por su brazo
aceptor
Dos proteínas ancestrales distintas evolucionaron en 2 clases
de aaRS, las cuales difieren en la arquitectura de sus dominios
de sitio activo

Estas se unen a lados opuestos del brazo aceptor del tRNA,

resultando en aminoacilación de un diferente OH del tRNA
(2' o 3').

tRNA
(terminal 3’nucleotide
O of appropriate tRNA)

O P O CH2 Adenine
O
− H H
O
H 3’ 2’ H
O OH

C O

HC R

NH3+ Aminoacyl-tRNA
Clase I aaRSs:

¾ Clase I aaRSs aminoacilan el 2'-OH de adenosina del extremo 3'

¾ Los elementos de identidad generalmente incluyen residuos del

asa del anticodon y del brazo aceptor

Clase II aaRSs:

¾ Los elementos de identidad para algunas enzimas clase II no

incluyen el dominio del anticodon

¾ Clase II aaRSs tienden a aminoacilar el 3'-OH de adenosina del 3’