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Laboratorio de Biología Molecular, Facultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional de Cuyo, C.C. 7 (5505)
Chacras de Coria, Mendoza, Argentina
R esumen
En los últimos veinte años se produjeron grandes avances en la selección fenotípica en invernáculo o a campo. La
en Biología Molecular; se desarrollaron técnicas selección asistida por marcadores moleculares es una
moleculares que permiten analizar en forma rápida y herramienta muy interesante para los planes de
precisa el genoma de los seres vivos. A través de estas mejoramiento, ya que permite acelerar la selección y
técnicas se obtuvieron gran cantidad de marcadores disminuir los costos en el manejo de grandes poblaciones
moleculares dispersos a lo largo de todo el genoma, se de plantas. El objetivo de esta revisión es resumir los
construyeron mapas genéticos de diversas especies marcadores utilizados en el análisis genético y discutir
hortícolas, y se ubicaron genes de resistencia a el alcance de los mismos en el mejoramiento de
enfermedades, plagas, etc. Los marcadores ligados a hortalizas.
genes de interés agronómico se pueden utilizar para
realizar selección genotípica temprana, en plántulas, y Palabras clave: Marcadores moleculares -
de esta manera se evita manejar cientos o miles de plantas Mejoramiento vegetal - Cultivos Hortícolas
The development of the Molecular Biology in the last conventional breeding strategies were developed. The
two decade allowed to characterize and manipulate genes goals of this review is to resume the most important
of agronomic interest. Currently, several techniques to techniques to obtain molecular markers and their
obtain molecular markers (or DNA markers) are potential and limitations in breeding of vegetable crops.
available, high density genetic maps were obtained and
several genes were tagged with markers. The use of these Key words: Molecular markers - Plant breeding -
markers in the genetic analysis increases the efficiency Vegetable crops
of conventional plant breeding methods and a non-
genética, ahora pueden ser fácilmente orígen de la genética. Mendel utilizó entre
etiquetados con marcadores moleculares, y la otros, el carácter rugoso o liso de las semillas
selección de los mismos se puede realizar a para analizar la segregación de los
través de ellos. cruzamientos de arvejas. En 1952, Rick
Los marcadores moleculares han tenido un desarrolló uno de los mapas genéticos más
fuerte impacto en el mejoramiento genético completos en tomate utilizando caracteres
de hortalizas. A través de su uso es posible morfológicos (30). En el mejoramiento
analizar en profundidad la estructura del genético estos marcadores son de uso
genoma de las plantas y de esta manera hacer limitado, principalmente porque su expresión
más eficiente la utilización de los recursos puede estar influenciada por el ambiente, por
genéticos en el mejoramiento vegetal. En los factores genéticos (por ejemplo, epistasis o
últimos años se ha avanzado mucho en el genes modificadores), lo que altera el
desarrollo de mapas genéticos y en el marcado fenotipo de la planta e interfiere en el
de genes de interés agronómico. La utilización mejoramiento (32).
de estos marcadores en el mejoramiento
constituye lo que se ha dado en llamar 2. Marcadores bioquímicos.
Selección Asistida por Marcadores o “Marker
Assisted Selection” (MAS). La selección Las proteínas de reserva de la semilla y las
asistida permite incrementar la eficiencia de isoenzimas son los marcadores bioquímicos
selección, ya que se puede realizar una más utilizados.
selección temprana de los genotipos y de esta Las proteínas de reserva, por tener distinto
manera reducir el tamaño de la población de peso molecular y carga, se pueden separar por
selección. La ventaja de MAS sobre la electroforesis en geles de poliacrilamida y
selección fenotípica radica en que no se teñirlas con un colorante para proteínas. Las
selecciona el carácter en particular sino un bandas que se obtienen son producto de la
marcador molecular ligado a éste. Por expresión de genes y se las analiza como
supuesto, que es necesario disponer de marcadores genéticos.
marcadores fuertemente ligados al carácter de Las isoenzimas consisten en moléculas de
interés (menos de 10 cM, centimorgan) y que proteína diferencialmente cargadas, que
sean repetibles (39). también se pueden separar usando métodos
El objetivo de esta revisión es resumir losde electroforesis (19). Estas enzimas catalizan
marcadores utilizados en el análisis genético reacciones bioquímicas específicas; por lo
y discutir el alcance de los mismos en el tanto, al separarlas en geles de almidón y
mejoramiento de hortalizas. Al final del poliacrilamida, agregarles el sustrato y los
artículo hay un glosario de los términos cofactores apropiados, se produce una
técnicos utilizados. reacción bioquímica que reduce una sustancia
coloreable, la que se deposita como una banda
Tipos de marcadores genéticos en el gel. Estas bandas se pueden analizar
como marcadores genéticos y se heredan en
A los marcadores utilizados en el análisis forma codominante.
genético se los puede dividir en tres tipos. Los marcadores bioquímicos han sido
reemplazados en gran medida por otro tipo de
1. Marcadores morfológicos marcadores genéticos; sus principales
desventajas son: 1) que detectan niveles
Los marcadores morfológicos fueron los menores de variación y 2) que al ser productos
primeros utilizados y tienen que ver con el de la expresión génica se ven afectados por
polimorfismo está dado por el número de que tienen estas bases suplementadas a los
repeticiones y son marcadores del tipo primers (Figura 4). La separación de estos
codominante. Por su alto grado de fragmentos por electroforesis en geles de
polimorfismo pueden ser utilizados para poliacrilamida genera entre 50 y 100
diferenciar genotipos con alto grado de fragmentos. La ventaja de este método radica
parentesco (clones). La dificultad de esta en que se puede analizar un gran número de
técnica radica en que es necesario invertir en locus en un solo gel; el principal inconveniente
el desarrollo de las secuencia de los cebadores de estos marcadores que se comportan como
específicos para el microsatélite, y esto no lo dominantes, es el uso de radioactividad o la
pueden realizar laboratorios de baja dificultad en la manipulación de los geles tan
complejidad. Sin embargo, una vez conocida delgados, al teñirlos con plata.
las secuencias su utilización en el análisis La elección correcta de la técnica a utilizar en
genético no es compleja. el análisis genético es un aspecto muy
importante, ya que en el mejoramiento vegetal
3.2.3. CAPs (Cleaved Amplified se trabaja con muestras muy grandes, lo que
Polymorphic Sequence) supone altos costos y una cantidad
considerable de trabajo. En la Tabla 1 se
La técnica consiste en sintetizar primers resumen las ventajas y desventajas del uso de
específicos para un locus de interés del cada uno de los marcadores moleculares
genoma de plantas. Estos cebadores se previamente descriptos, en el análisis genético.
utilizan en reacciones de PCR para amplificar
segmentos de ADN de muestras de diversos Aplicaciones de los marcadores moleculares
individuos. Los productos de amplificación en el mejoramiento genético de cultivos
se cortan con enzimas de restricción y se hortícolas
analiza el perfil de bandas que se obtiene,
luego de separarlas por electroforesis y 1. Análisis de la diversidad genética
teñirlas con bromuro de etilio. Esta técnica
tiene algunas de las ventajas de los RFLP Uno de los aspectos más importantes en
pero no las complicaciones del análisis a los planes de mejoramiento es el manejo
través de Southern blots (ensayos de eficiente de los recursos genéticos y del
Southern). Sin embargo, es necesario conocer germoplasma disponible. Tradicionalmente,
las secuencias de ADN del fragmento que se los recursos genéticos se caracterizaban por
quiere amplificar y esto dificulta su amplia una combinación de caracteres morfológicos
utilización. y agronómicos. Los marcadores moleculares,
al analizar varios loci por reacción, permiten
3.2.4. AFLP (Amplified Fragment Length estimar en forma rápida y eficiente la
Polymorphism) diversidad genética existente en el plan de
mejoramiento y el grado de similitud genética
AFLP consiste en amplificar en forma entre los cultivares. Los mejoradores pueden
selectiva fragmentos de ADN cortados con usar los datos sobre similitud genética para
enzimas de restricción (42). El ADN de las seleccionar genotipos parentales, con el fin de
plantas a analizar se corta con dos enzimas de desarrollar poblaciones de mejoramiento, o
restricción, usualmente Mse I y EcoR I, luego para identificar padres genéticamente
se le ligan adaptadores con una, dos o tres divergentes y utilizarlos en cruzamientos (26).
bases de más, que permite que se amplifiquen Diversos son los trabajos donde se han
en forma selectiva sólo aquellos fragmentos utilizado marcadores moleculares para la
1 Los adaptadores son secuencias de ADN que se ligan a los extremos cortados con Eco RI y Mse l y que sirven
para que los primers se hibriden.
2 Los primers tiene una base de más para seleccionar fragmentos y disminuirlos 16 veces con respecto a los
fragmentos originales.
3 Al agregarle dos bases más a los primers se reduce 256 veces el número de fragmentos que se pre-amplificaron.
en los cultivares; 3) aportar datos para entender moleculares. Debido a que se evalúan un
las bases biológicas de caracteres complejos, gran número de plantas y marcadores, los
como los de herencia cuantitativa; y 4) aportar datos se pueden analizar a través de
información para la clonación posicional de programas de computación como
genes. MAPMAKER (17). Estos programas
Con el desarrollo de los marcadores analizan los datos obtenidos de las
moleculares se aceleró el proceso de obtención poblaciones segregantes y estiman la
de mapas genéticos y en este momento se dis- frecuencias de recombinación, que luego se
pone de mapas con alta densidad de utilizan para ubicar los marcadores genéticos
marcadores, por ejemplo en cultivos como: en un mapa de ligamiento linear.
poroto (Phaseolus vulgaris L.) con 244 Michelmore et al. (21), desarrollaron un
marcadores y 1200 cM de longitud (38); papa método que permite la identificación rápida
(Solanum tuberosum L.) con 977 marcadores de marcadores ligados a genes de interés. El
que cubren 684 cM de longitud y en tomate método denominado bulk segregant analysis
(Lycopersicon esculentum Miller) con 1.030 (BSA) consiste en agrupar el ADN de las
marcadores con una longitud de 1.276 cM (35). plantas individuales de una población
Uno de los aspectos críticos en la segregante. Los grupos contienen ADN de
construcción de mapas genéticos y en la individuos que son idénticos para un carácter,
obtención de marcadores ligados a por ejemplo resistencia o susceptibilidad para
caracteres de interés agronómico es la una enfermedad en particular. Los
selección de una población de mapeo agrupamientos se analizan por alguna de las
apropiada (32). Con el fin de buscar técnicas de marcadores moleculares antes
marcadores ligados a genes de resistencia a descriptas. Así, las diferencias detectadas en-
enfermedades, se utilizan progenies (F 2 , tre los agrupamientos indicarían que existe
retrocruzas, líneas isogénicas) de ligamiento entre los marcadores y el carácter
cruzamientos de progenitores resistentes y por el que se hicieron los grupos. A través de
susceptibles a la enfermedad. Los datos de este método, Maisonneuve et al. (20)
segregación para la resistencia, obtenidos en encontraron marcadores fuertemente ligados
pruebas de progenie, son combinados con a genes de resistencia a Bremia lactucae en
los datos de segregación de los marcadores lechuga.
Tabla 2. Algunas citas sobre el uso de marcadores moleculares para la caracterización de germoplasma en
especies hortícolas
Tabla 3. Lista de algunos de los marcadores moleculares ligados a resistencia a enfermedades en cultivos hortícolas.
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