Virologia y Microbiologia PDF

B
Virologa y Microbiologa
B ndice General In icio X Salir
B 1 Modulacin de la respuesta inmune por virus

Virologa y
Microbiologa
Antonio Alcami Pertejo
B 2 Bases moleculares de la patogenia y del potencial anti-cncer viral
Jos M. Almendral del Ro
B 3 Ecologa Molecular de Ambientes Extremos

Ricardo Amils Pibernat
B
B 4 Divisin Celular Bacteriana y Resistencia a Antibiticos
Juan Alfonso Ayala Serrano
B 5 Biotecnologa y Gentica de Bacterias Termfilas Extremas
Jos Berenguer Carlos
B 6 VPPA: modelos virales de evasin y proteccin

ngel L. Lpez Carrascosa
B 7 Morfognesis bacteriana
B
Miguel ngel de Pedro Montalbn
B 8 Variabilidad gentica de Virus RNA
Esteban Domingo Solans
B 9 Expresin gnica en Streptomyces y levaduras
Antonio Jimnez / Mara Fernndez Lobato
B 10 Ingeniera de Virus
Mauricio Garca Mateu
B 11 Efectos de elementos extracromosmicos sobre el comportamiento
de su husped Bacillus
Wilfried J.J. Meijer
B 12 Retrotranscriptasa del virus de la inmunodeficiencia humana y terapia antirretroviral
Lus Menndez Arias
B 13 Virus de la peste porcina Africana
Maria Luisa Salas Falgueras
B 14 Desarrollo de nuevas estrategias para el control y prevencin de
enfermedades virales: el virus de la fiebre aftosa como modelo
Francisco Sobrino
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ndice General ndice Seccin Inicio X Salir
B1 Modulacin de la respuesta inmune por virus

Resumen de Investigacin
Estamos investigando mecanismos de evasin inmune utilizados por virus DNA de gran
Home tamao, poxvirus y herpesvirus. En concreto, estamos caracterizando una estrategia in-
munomoduladora nica que consiste en la secrecin de protenas virales que unen cito-
quinas y quimioquinas, mediadores importantes de las respuestas inflamatoria e inmune.
Trababamos en dos sistemas virales: (1) Herpesvirus como el virus herpes simplex y el
citomegalovirus humano, que son patgenos humanos con relevancia clnica; y (2) Pox-
Exit
virus como el virus vaccinia, la vacuna de la viruela, y el virus de la viruela, que caus la
nica enfermedad viral erradicada como resultado de una campaa global de vacuna-
cin. Los receptores de citoquinas secretados probablemente contribuyen a la patog-
nesis del virus de la viruela, que fue uno de los virus ms virulentos que ha conocido la
humanidad. La actividad inmunomoduladora de los receptores virales de citoquinas y su
Lnea Investigacin contribucin a la patologa se estn estudiando en el modelo de mousepox. Esta es una
enfermedad parecida a la viruela humana que est causada por el virus ectromelia, un
patgeno natural del ratn, y es un modelo clsico de patognesis viral.
Personal
Los virus han optimizado durante millones de aos de evolucin su capacidad de mani-
pular la respuesta inmune del hospedador. Los virus ofrecen una oportunidad nica para
Publicaciones desarrollar sus estrategias de evasin inmune como nuevas aproximaciones terapu-
ticas para bloquear el dao causado por una respuesta inflamatoria descontrolada. En
Otras Actividades colaboracin con compaas biotecnolgicas estamos trabajando en el desarrollo de pro-
tenas inmunomoduladoras virales como potenciales medicamentos para tratar alergias
y enfermedades autoinmunes causadas por reacciones inmunopatolgicas.
Los virus son las entidades biolgicas ms abundantes y diversas en la Tierra. Estamos
interesados en la caracterizacin molecular de comunidades virales complejas utilizan-
CBMSO 2009-2010
do nuevas metodologas de secuenciacin masiva (Roche-454 Life Sciences). Hemos
descrito por primera vez la comunidad de virus en un lago de la Antrtida y estamos ex-
tendiendo estos estudios a otros lagos en la Pennsula Antrtica y en el rtico. Estamos
tambin interesados en utilizar las nuevas tecnologas de secuenciacin para identificar
virus asociados con patologas humanas, como la esclerosis mltiple.
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Home
Figura 1. Mimetis-
Exit mo de citoquinas y
receptores de cito-
quinas por herpesvi-
rus y poxvirus.
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Otras Actividades Figura 2. Estudios meta-

genmicos de la comuni-
dad de virus en lagos de
la Antrtida.
CBMSO 2009-2010
Home
Becarios Predoctorales:
Jefe de Lnea: Marcos Palomo Otero
Antonio Alcami Pertejo Sergio Martn Pontejo
Exit Nadia Martnez Martn
Postdoctorales: Carla Mavin
Ali Alejo Herberg Haleh Heidarieh
Abel Viejo Borbolla
Alberto Lpez Bueno Tcnicos de Investigacin:
Daniel Rubio Muoz Roco Martn Hernndez
Lnea Investigacin Carolina Snchez Fernndez
Elena Merino Rodrguez
Soledad Blanco Chapinal
Personal Imma Montanuy Sellart Cientficos visitantes:
Juan Alonso Lobo Joanne Devlin (University of
Melbourne, Australia)
Publicaciones Julia Fahel (Trinity College,
Dublin, Ireland)
Otras Actividades
CBMSO 2009-2010

Publicaciones
Andrs G., Leali, D., Mitola, S., Coltrini, D., Camozzi, M., Corsini, M., Belleri, M., Hirsch, E., Schwendener, R. A., Christofori, Alcami,
Home A. and Presta, M. (2009) A pro-inflammatory signature mediates FGF2-induced angiogenesis. J. Cell. Mol. Med. 13, 2083-2108.
Waibler, Z., Anzaghe, M., Frenz, T., Schwantes, A., Phlmann, C., Ludwig, H., Palomo-Otero, M., Alcami, A., Sutter, G. and Kalinke,
U. (2009) Vaccinia virus-mediated inhibition of type I interferon responses is a multi-factorial process involving the soluble type I
interferon receptor B18 and intracellular components. J. Virol. 83, 1563-1570.
Carson, C., Antoniou, M., Ruiz-Argello, M. B., Alcami, A., Christodoulou, V., Messaritakis, I., Blackwell, J. M. and Courtenay, O.
(2009) A prime/boost DNA/Modified vaccinia virus Ankara vaccine expressing recombinant Leishmania DNA encoding TRYP is safe
Exit and immunogenic in outbred dogs, the reservoir of zoonotic visceral leishmaniasis. Vaccine 27, 1080-1086.
Alcami, A. and Saraiva, M. (2009) Chemokine binding proteins encoded by pathogens. Adv. Exp. Med. Biol. 666, 167-179.
Poole, E., Groves, I., Ho, Y., Benedict, C., Alcami, A. and Sinclair, J. (2009) Identification of TRIM23 as a co-factor involved in the
regulation of NFkB by the human cytomegalovirus gene product UL144. J. Virol. 83, 3581-3590.
Alejo, A., Ruiz-Argello, M. B., Viejo, A., Saraiva, M., Fernndez de Marco, M. M., Salguero, J. and Alcami, A. (2009) Adaptation of
a transient dominant selection method to the generation of ectromelia virus recombinants: in vivo analysis of ectromelia virus CD30
deletion mutants. PLoS ONE 4(4):e5175.
Lnea Investigacin Alcami, A. and Viejo-Borbolla, A (2009) Identification and characterization of virus-encoded chemokine binding proteins. Methods
Enzymol. 460, 173-191.
Shang, L., Thirunarayanan, N., Viejo-Borbolla, A., Martin, A. P., Bogunovic, M., Marchesi, F., Unkeless, J. C., Ho, Y., Furtado, G. C.,
Personal Alcami, A., Merad, M., Mayer, L. and Lira, S. A. (2009) Expression of the chemokine binding protein M3 promotes marked changes in
the accumulation of specific leukocytes subsets within the intestine. Gastroenterology 137, 1006-1018.
Lpez-Bueno, A., Tamames, J., Velzquez, D., Moya, A., Quesada, A. and Alcami, A. (2009) High diversity of the viral community from
an Antarctic lake. Science 326, 858-861.
Publicaciones Alejo, A. and Alcami, A. (2010) Chemokine binding proteins as therapeutics. In: Leurs, R., Smit, M. and Lira, S. (eds) Chemokine
Receptors as Drug Targets. Wiley-VCH, Weinheim, Germany, pp.359-374.
Rubio, N., Palomo, M. and Alcami, A. (2010) Interferon a/b genes are upregulated in murine brain astrocytes after Theilers murine
Otras Actividades encephalomyelitis virus infection. J. Interf. Cyt. Res. 30, 253-262.
Viejo-Borbolla, A., Muoz, A., Tabares, E. and Alcami, A. (2010) Glycoprotein G from pseudorabies virus binds to chemokines with
high affinity and inhibits their function. J. Gen. Virol. 91, 23-31.
Fernandez de Marco, M. M., Alejo, A., Hudson, P., Damon, I. K. and Alcami, A. (2010) The highly virulent variola and monkeypox
viruses express secreted inhibitors of type I interferon. FASEB J. 24, 1479-1488.
Devlin, J. M., Viejo-Borbolla, A., Browning, G. F., Noormohammadi, A. H., Gilkerson, J. R., Alcami, A. and Hartley, C. A. (2010)
CBMSO 2009-2010
Evaluation of immunological responses to a glycoprotein G deficient candidate vaccine strain of infectious laryngotracheitis virus.
Vaccine 28, 1325-1332.
Alcami, A. and Lira, S. A. (2010) Modulation of chemokine activity by viruses. Curr. Opin. Immunol. 22, 482-487.
Alcami A. (2010) The interaction of viruses with host immune defenses. Curr. Opin. Microbiol. 13, 501-502.
Viejo-Borbolla, A., Martin, A. P., Muniz, L. R., Shang, L., Marchesi, F., Thirunarayanan, N., Harpaz, N., Garcia, R. A., Apostolaki, M.,
Furtado, G. C., Mayer, L., Kollias, G., Alcami, A. and Lira, S. A. (2010) Attenuation of TNF-driven murine ileitis by intestinal expression
of the viral immunomodulator CrmD. Mucosal Immunol. 3, 633-644.
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Otras Actividades
Home
Miembro del Editorial Board de Virology

Miembro de Editorial Board de Journal of Virology
Exit
Consejero del World Health Organization Advisory Committee on Variola Virus Research
Editor de un nmero especial de Curr. Opin. Microbiol. sobre Interacciones microbio-
hospedador: Virus, vol. 13, agosto 2010
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Otras Actividades
CBMSO 2009-2010
B2 Bases moleculares de la patogenia y del potencial anti-cncer viral

La investigacin del laboratorio se centra principalmente en los mecanismos molecula-

Home res que operan en las enfermedades causadas por virus, as como en el diseo de virus
como posibles herramientas biolgicas anti-cncer. Empleamos como modelos experi-
mentales el parvovirus diminuto del ratn (MVM) y el alfavirus Sindbis (SV). Entre los
temas que se han abordado recientemente, o son objeto de nuestro inters actual, desta-
can los dos siguientes: (i) La regulacin del ensamblaje de la cpsida del MVM en clulas
Exit
de cncer humano. Hemos encontrado que VP2, la protena principal de la cpsida del
MVM, se fosforila especficamente por Raf-1 (Figura 1), una quinasa que juega un papel
central en el desarrollo de varios tipos de tumores frecuentes humanos. La fosforilacin
por Raf-1 activada por mutacin facilita el transporte nuclear de trmeros de VP2 (Figura
1B), un proceso necesario para la maduracin viral. Esta regulacin del ensamblaje de
Lnea Investigacin MVM (Figura 1C) puede explicar gran parte del tropismo natural de los parvovirus por
clulas cancerosas humanas, e identifica una diana relevante para posibles viroterapias
Personal oncolticas; (ii) Traduccin de ARNm virales. Intentamos entender hasta qu punto la
traducibilidad de los ARNm virales determina el rango de husped y la evolucin viral,
el tropismo por tipos celulares y tejidos especficos y la patognesis. Nuestro objetivo
Publicaciones fundamental es comprender cmo la quinasa celular PKR, a travs de la fosforilacin del
factor de iniciacin 2 (eIF2), es capaz de modular la replicacin de los virus SV (Figura 2)
Tesis Doctorales y del parvovirus MVM. Empleando biologa integrativa estamos caracterizando los meca-
nismos que el SV emplea para contrarrestar el efecto antiviral de la PKR, lo que implica
el uso de estructuras especficas presentes en los ARNm virales y factores de iniciacin
alternativos de la clula.
El grupo de B. Aguado (*) se centra en el estudio del Splicing Alternativo como un factor
CBMSO 2009-2010
que contribuye a la complejidad y diversidad entre primates y otros mamferos, mediante
la produccin de diferentes transcritos, incluyendo quimricos y no-codificantes. Adems
buscamos alteraciones en el splicing alternativo que puedan ser causantes de enferme-
dades, como de la Artritis Reumatoide y de la Distrofia Miotnica. Usamos nuevas tecno-
logas como nano Q-PCRq, microarrays y Secuenciacin Masiva.
Figura 1. La quinasa
Raf-1 regula el ensambla-
Home je de MVM. (A) Mapa bi-
dimensional de fosfopp-
tidos de las subunidades
de la cpsida de MVM
fosforiladas in vitro por
Raf-1. (B) Trmeros de la
Exit protena de la cpsida de
MVM, aislados de clulas
humanas y de insecto,
difieren en su competen-
cia en transporte nuclear.
(C) El papel de Raf-1 en
la translocacin nuclear
Lnea Investigacin de los intermedios de en-
samblaje de MVM.
Personal
Publicaciones
Tesis Doctorales Figura 2. El fenmeno

de shut-off en tejido ce-
rebral de ratn infectado
por el virus Sindbis. La
traduccin del mRNA ce-
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lular, pero no la del viral,
se inhibi debido a la fos-
forilacin del factor eIF2.
Home
Jefe de Lnea:
Jos M. Almendral del Ro
Personal Cientfico:
Exit Begoa Aguado Orea (*)
Antonio Talavera Dez
Ivn Ventoso Bande
Investigador Posdoctoral:
Lnea Investigacin Elena Domingo Gil
Esther Grueso Hierro
Francisco Hernndez-Torres (*)
Personal
Estudiante de posgrado:
Publicaciones Noelia Blanco Menndez
Maria Elizalde Arbilla
Ren Toribio Lpez
Tesis Doctorales Olatz Villate Bejarano (*)
Alberto Rastrojo Lastras (*)
Raquel Lpez-Dez (*)
Estudiante:
CBMSO 2009-2010
Marian Fernandez Estevez
Julia Wienke (*)
Publicaciones
Home
Sanz MA, Castell A, Ventoso I, Berlanga JJ, Carrasco L. (2009). Dual mechanism for the translation of
subgenomic mRNA from Sindbis virus in infected and uninfected cells. PLoS One. 4(3):4772.
Exit Blanco, AM, L Rausell, B Aguado, M Perez-Alonso, R Artero. (2009). A FRET-based assay for characterization
of alternative splicing events using peptide nucleic acid fluorescence in situ hybridization. Nucleic Acids
Research 37 e116.
Riolobos, L., Valle, N., Hernando, E., Maroto, B., Kann, M., and J. M. Almendral. (2010). Viral oncolysis that
targets Raf-1 signaling control of nuclear transport. J. Virol., 84, 2090-2099.
Lnea Investigacin Ventoso, I., Berlanga, J.J., and J. M. Almendral. (2010). Translational control by the Protein Kinase R
restricts Minute Virus of Mice infection: role in parvovirus oncolysis. J. Virol., 84, 5043-5051.
Personal Toribio R, Ventoso I. Inhibition of host translation by virus infection in vivo. (2010). Proc Natl Acad Sci
USA. 107(21):9837-42.
Publicaciones
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
Tesis Doctorales
Home
Olatz Villate. Splicing en el MHC de clase III: caracterizacin y expresin de las iso-
formas del gen NFkBIL1. Estudio de su relacin con artritis reumatoide. Directora,
Begoa Aguado.
Exit Ren Toribio Lpez. Cambios traduccionales que regula la interaccin virus hospeda-
dor. Implicacin en el desarrollo de virus oncolticos. Director, Ivn Ventoso
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
B3 Ecologa Molecular de Ambientes Extremos
Home En el grupo de Biologa Molecular de Extremfilos se estn desarrollando en la actualidad dos

lneas de investigacin:
Ecologa Molecular de Ambientes Extremos: Esta rea de investigacin persigue los siguien-
tes objetivos:
Acidfilos: ecologa microbiana convencional (cultivos de enriquecimiento, aislamiento, fisiolo-
Exit ga), ecologa molecular (DGGE, FISH, CARD-FISH, clonaje), biologa molecular (genmica,
metagenmica, protemica, expresin diferencial de genes) y biotecnologa (control de la bio-
lixiviacin, secuestro especfico de metales y fitorremediacin) de ambientes cidos extremos
(la cuenca del Ro Tinto, distintas lagunas cidas de la Faja Pirtica Ibrica, ro Agrio (Argentina),
zonas volcnicas de Islandia y la Antrtida).
- Caracterizacin geomicrobiolgica de ambientes extremos como modelos de habitabilidad de
inters astrobiolgico: la cuenca del Tinto (anlogo geoqumica de Marte), depsitos de sulfuros
Lnea Investigacin metlicos de la Antrtica (anlogo de Marte), la laguna hipersalina de Tirez (anlogo de Europa,
en colaboracin con la profesora I. Marn del Dpto de Biologa Molecular de la UAM), el salar de
Uyuni (anlogo de Europa, en colaboracin con la profesora I. Marn), reas volcnicas de Islan-
Personal dia y zonas de permafrost de Alaska (anlogos de Marte).
- Geomicrobiologa del subsuelo de la Faja Pirtica Ibrica (IPB): distintas tcnicas se estn im-
plementando para la caracterizacin del bio-reactor subterrneo en la IPB responsable de las
Publicaciones condiciones extremas de la cuenca del Tinto. Este trabajo se est desarrollando en colaboracin
con el Centro de Astrobiologa (Proyecto Origin IPBSL).
- La lnea de ecologa microbiana de ambientes anaerobios, dirigida por el profesor J.L. Sanz
Patentes (UAM) se est desarrollando en los nuevos laboratorios que el Departamento de Biologa Mole-
cular tienen en el edificio de Biologa. Este trabajo de colaboracin est centrado en la caracteri-
zacin de las actividades anaerobias en los distintos modelos de estudio del grupo de investiga-
Tesis Doctorales cin (cuenca del Tinto, IPB, laguna de Tirez).
Micologa. Esta rea de investigacin est dirigida por el Dr. Aldo Gonzlez y tiene los siguientes
objetivos:
CBMSO 2009-2010
- Gentica molecular y microbiologa de Basidiomicetos (Pleurotas ostreatus como sistema mo-
delo de estudio).
- Uso de hongos filamentosos como fuente de metabolitos secundarios, encimas lignolticas y
para secuestro especfico de metales.
- Control y eliminacin de hongos de aire de interior.
Home
Exit
Lnea Investigacin Figura 1. Hongo acidfilo secuestrador especfico de Cr(III).
Personal
Publicaciones
Patentes
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
Figura 2. Biofilm fotosinttico acidfilo.
Jefe de lnea:
Ricardo Amils Pibernat
Home
Personal cientfico:
Aldo Gonzlez Becerra
Exit Posdoctorales:
Moustafa Malki
Monika Oggerin de Orube
Lourdes Rufo Nieto
Javier Ruiz Prez
Lnea Investigacin Becarios predoctorales:

Patxi San Martn Uriz
Personal Enrique Marn Palma
Carlotta Vizioli
Irene Snchez Andrea
Publicaciones
Tcnicos:
Patentes Nuria Rodrguez Gonzlez
Catalina del Moral Juarez
Tesis Doctorales Cientficos visitantes:

Linda Amaral (MBL, Woods Hole, USA)
CBMSO 2009-2010
Jim Field (Arizona State University, USA)
Alberto Gonzlez Fiaren (NASA-Ames, USA)
Eric Zettler (MBL, Woods Hole, USA)
Publicaciones
Home
Fairen, A.G., Dvila, A.F., Duport, L.G., Amils, R., McKay, C.P. (2009) Nature, 459: 398-400.
Fairen, A.G., Schulze-Makuch, D., Rodrguez, A.P., Fink, W., Dvila, A., Uceda, E.R., Furfaro, R., Amils, R.,
McKay, C.P. (2009) Planet. Space Sci., 57: 276-287.
Exit Daz-Garretas, B., Asensi, A., Rufo, L., Rodrguez, N., Snchez-Mata, D., Amils, R., de la Fuente, V. (2009)
Northeastearn Naturalist, 16 : 56-64.
Carnicero, D., Daz, E., Escolano, O., Rubinos, D., Ballesteros, O., Barral, M.T., Amils, R., Garca Frutos,
F.J. (2009) Adv. Materials Research, 71-73: 677-680.
Eugenio, M.E., Carbajo, J.M., Martn, J.A., Gonzlez, and A.E. Villar, J.C. (2009) J. Basic Microbiol.
49(5): 433-440.
Lnea Investigacin Gonzlez-Toril, E., Aguilera, A., Souza-Egipsy, V., Diez, M., Lpez-Pamo, E., Snchez-Espaa, J., Amils, R.
(2009) Adv. Materials Research, 71-73: 113-116.
Amils, R., Gonzlez-Toril, E., Aguilera, A., Rodrguez, N., Fernndez-Remolar, D., Daz, E., Garca-
Personal Moyano, A., Sanz, J.L. (2009) Adv. Materials Research, 71-73: 13-19.
Garca-Moyano, A., Gonzlez-Toril, E., Amils, R. (2009) Adv. Materials Research, 71-73: 109-112.
Publicaciones Gonzlez-Toril, E; Amils, R; Delmas, RJ, et al. 2009. Biogeosciences, 6(1): 33-44.
de la Fuente, V., Rufo, L., Rodrguez, N., Amils, R., Zuluaga, J. (2009) Biol Trace Elem Res, DOI
10.1007/s12011-009-8471-1.
Patentes
Aguilera, A., Souza-Egipsy, V., Gonzlez-Toril, E., Rendueles, O., Amils, R. (2010). Internat. Microbiol., 13:
29-40. DOI: 10.2436/20,1501.01.109.
Tesis Doctorales Gonzlez-Toril, E., Aguilera, A., Rodrguez, N., Fernndez-Remolar, D., Gmez, F., Daz, E., Garca-
Moyano, A., Sanz, J.L., Amils, R. (2010) Hydrometallurgy, 104: 329-333.
CBMSO 2009-2010
Cid, C., Garcia-Descalzo, L., Casado-Lafuente, V., Amils, R., Aguilera, A. (2010) Proteomics, 10: 2026-
2036 DOI 10.1002/pmic.200900592.
Souza-Egipsy, V., Aguilera, A., Mateo-Mart, E, Martn-Gago, J.A., Amils, R. (2010). Geomicrobiol. J., 27:
692-706.
Lalueza, J., Rius, A., Puig, R., Mart, E., Mart, J.F., Rodrguez, N., Amils, R. (2010). Journal of American
Home Leather Chemists Association, 105: 210-221.
Amaral-Zettler, L., Zettler, E.R., Theroux, S.M., Palacios, C., Aguilera, A., Amils, R. (20010) ISME J.
doi:10.1038/ismej.2010.101.
Arana-Cuenca, A., Tllez Jurado A., Yage, S., Fermian, E., Carbajo, J.M., Gonzlez, T., Domnguez, A.,
Villar, J.C., and Gonzlez, A.(2010) Forest Systems 19 (2): 234-240.
Exit
Eugenio, M.E., Santos, S.M., Carbajo, J.M., Martn, J.A., Martn-Sampedro, R., Gonzlez, A.E., and Villar,
J.C. (2010) Bioresources Technology 101(6): 1866-1870.
Fairn, A.G., Chevier, V., Abramov, O., Marzo, G.A., Gavin, P., Davila, A.F., Tornabene, L.L. , Bishop, J.L.,
Roush, T.L., Gross, C., Kneissl, T., Uceda, E.R., Dohm, J.M., Schulze-Makuch, D., Rodrguez, J.A.P., Amils,
R., McKay, C.P. (2010) PNAS (USA), doi/10.1073/pnas.1002889107.
Fairen, A. G., Dvila, A.F., Lim, D., Bramall, N., Bonaccorsi, R., Zavaleta, J., Uceda, E.R., Stoker, C.,,
Lnea Investigacin Wierzchos, J., Amils, R., Dohm, J.M., Andersen, D., McKay, C. (2010) Astrobiology, 821- 843. DOI:10.1089/
ast. 2009.0440.
Personal Fernndez-Remolar, D., Snchez-Romn, M., Amils, R. (2010) Sustainability, 2: 2541-2554,

doi:10.3390/su2082541.
Gmez; F., Mateo-Mart, E., Prieto.Ballesteros, O., Martn-Gago, J., Amils, R. (2010) Icarus, doi:10.1016/j.
Publicaciones icarus.2010.05.027.
Carbajosa, S., Malki, M., Caillard, R., Lpez, M.F., Palomares, F.J., Martn-Gago, J.A., Rodrguez, N.,
Amils, R., Fernndez, V.M., De Lacey, A.L. (2010) Biosensors and Bioelectronics, 26: 877-880.
Patentes
Fernndez-Remolar, D., Prieto-Ballesteros, O., Gmez-Ortiz, D., Fernndez-Sampedro, M., Sarrazin, P.,
Gailhanou, M., Amils, R. (2010) Icarus, 211: 114-138.
Tesis Doctorales Menor-Salvn, C., Tornos, F., Fernndez-Remolar, D., Amils, R. (2010) Earth Planet. Sci. Lett., doi:
10.1016/j.epsl.2010.09.020.
CBMSO 2009-2010
Captulos de libros: Cinco captulos de libro.
Libros: Amils, R., Segura, J. (2010) Ro Tinto viaje a Marte, ediciones Alfar (Sevilla).
Patentes
Home
Amils, R. Malki, M., Fernndez, V., de Lacey, A.L.
Ttulo: Electrodo bacteriano aerbico para nodo de una pila de combustible sin me-
diadores redox ni membrana intercambiadora de protones. N de solicitud: 200701534.
Exit Fecha de concesin: 23/12/2009
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Patentes
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
Tesis Doctorales
Home
Eric Zettler, enero 2009, The relationship between environment and the microbial community
in a patchwork of geochemical islands, Ricardo Amils, Universidad Autnoma de Madrid.
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Patentes
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
B4 Divisin Celular Bacteriana y Resistencia a Antibiticos
Home
Los objetivos de nuestro grupo son el estudio desde un punto de vista molecular del pro-
ceso de crecimiento y divisin bacteriana y de los diversos mecanismos de resistencia
a los antibiticos b-lactmicos, que se han desarrollado por los microorganismos pat-
genos de origen clnico. Dentro de este esquema general, hemos desarrollado varios
Exit aspectos, por un lado la caracterizacin molecular de b-lactamasas de la familia CTX-M,
su mecanismo de movilizacin y el origen ltimo de la subfamilia CTX-M-1. As como la
identificacin de las PBPs y el estudio de su implicacin en los mecanismos de resisten-
cia en estirpes anaerobias y en bacterias entricas Gram-negativas. Una nueva familia
de PBPs, perteneciente al COG1680, que presenta homologa a b-lactamasas de clase
Lnea Investigacin C y puede estar implicada en la morfognesis bacteriana est siendo estudiada en un
nuevo proyecto.
Personal Basado en el anlisis de la estructura del peptidoglicano en mutantes de PBP4 en Aero-
monas hemos propuesto un modelo de induccin de la expresin de b-lactamasa media-
do por un sistema de dos componentes (ver figura adjunta).
Publicaciones
Durante la divisin celular, la concentracin de protenas en el anillo de divisin tiene el
efecto de constriccin de la membrana y la produccin de un tabique de la pared celular.
Otras Actividades La sntesis de este tabique peptidoglicano involucra un conjunto de enzimas dedicadas,
como las protenas de unin a penicilina. Hemos logrado la purificacin de varias de estas
enzimas (PBP1B, PBP3, y variantes inactivas), junto con un buen nmero de sustratos
(incluyendo sculos, como la estructura ms grande disponible, peptidoglicano fragmen-
tado y precursores de menor tamao como lpido II y UDP muramil-pentapptido) para
CBMSO 2009-2010
conseguir el establecimiento de un ensayo de screening de inhibidores in vitro.

Figura 1. Modelo de la induccin de beta-lactamasa en
Aeromonas spp. e implicacin del reguln blr.
La inhibicin de PBPS por los b-lactmicos causa un
aumento de la concentracin del ligando activador de
Home BlrB. Este ligando entonces interacta con BlrB (fle-
cha punteada), causando su auto-fosforilacin (P en
el diagrama). Este fosfato es transferido a BlrA, lo que
hace que se una a la secuencia de etiqueta cre/blr en-
contrada corriente arriba de todos los promotores de
genes del regulon blr. El efecto de esto es reclutar a la
RNA polimerasa y activar la transcripcin del regulon blr.
Exit Entre los genes conocidos del reguln blr se codifican
tres b-lactamasas, Amp, Cep e Imi, que directamente hi-
drolizan el -lactmico, ayudando a impedir mayor dao
del peptidoglicano. Tambin se sabe que el reguln blr
incluye genes no codificando--lactamasas, p.ej. blrD, y
se ha propuesto que sus productos tengan un papel en
la proteccin de la clula del efecto de los -lactmicos
por un mecanismo auxiliar.
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones Figura 2. Actividad DD-endopeptidasa de AmpH iden-

tificada por HPLC. Los picos corresponden a M4.-
NAcGlc-NAcMur-tetrapptido, M5.- NAcGlc-NAcMur-
Otras Actividades pentapptido, D45.- Disacrido-tetra-pentapptido, y
C.- cefmetazol.
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Home
Jefe de Lnea:
Juan Alfonso Ayala Serrano Cientficos visitantes:
Ayelen Patricia Porto (Universidad de Bue-
Postdoctoral: nos Aires, Buenos Aires, Argentina)
Exit Silvia Marina Gonzlez Leiza Ana Catarina Souza Lopes (Universidade
Federal de Pernambuco, Brasil)
Becarios Predoctorales: Bartolome Moya (Universidad Islas Balea-
Cristian Gustavo Aguilera Rossi res, Mallorca)
Alaa Ropy Mahmoud Sayed Judith J. Velasco (Universidad de los An-
Lnea Investigacin des, Mrida, Venezuela)
Estudiantes: -Jzsef Ski University of Szeged,
Godofrey Cherry -Elizabeth Nagy University of Szeged,
Personal Yasemin Ezgi Ertrk -Gabriella Terhes
Andrs Caballero (University of Szeged, Szeged, Hungary)
Publicaciones Laura Vuolo Sergei Borchsenius (Institute of Cytology,
Jose Roberto Angeles Vzquez RAS, Saint-Petersburg, Russia)
Nicolas Cordeiro
Otras Actividades Ana Fernndez Gonzlez
Sorelis Urdaneta Fernndez
Lucia Lozano
Paula Andrea Espinal
Mara Margarita Bernal
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Publicaciones
Home
D. Korsak, Z. Markiewicz, G. O. Gutkind, and J. A. Ayala. (2010) Identification of the full set of Listeria
monocytogenes penicillin-binding proteins and characterization of PBPD2 (Lmo2812). BMC Microbiology,
10:239-251
Ins Bado, Nicols F. Cordeiro, Luciana Robino, Virginia Garca-Fulgueiras, Vernica Seija, Cristina Bazet,
Exit Gabriel Gutkind, Juan A. Ayala, and Rafael Vignoli. (2010). Detection of class 1 and 2 integrons, extended-
spectrum -lactamases and qnr alleles in enterobacterial isolates from the digestive tract of Intensive Care
Unit inpatients. Intern. J. Antimicrob. Agents, 36(5):453-458
A.C.S. Lopes, D. Leal Veras, A.M.S. Lima, R.C. Andrade Melo, and J.A. Ayala. (2010). bla(CTX-M-2) and
bla(CTX-M-28) extended-spectrum beta-lactamase genes and class 1 integrons in clinical isolates of
Klebsiella pneumoniae from Brazil.. MIOC. 105(2):163-167.
Lnea Investigacin Amy E. Tayler, Juan A. Ayala, Pannika Niumsup, Katrin Westphal, Timothy R. Walsh, Bernd Wiedemann,
Peter M. Bennett, and Matthew B. Avison. (2010). Induction of beta-lactamase production in Aeromonas
hydrophila is responsive to beta-lactam-mediated changes in peptidoglycan composition. Microbiology.
Personal 156(Pt 8):2327-35.
Porto, Ayeln; Ayala, Juan; Gutkind, Gabriel; and Di Conza, Jos. (2010). A novel OXA-10-like -lactamase
is present in different Enterobacteriaceae. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 66:228-229.
Publicaciones M. Macedo-Vias, N. F. Cordeiro, I. Bado, S. Herrera-Leon, M. Vola, L. Robino, R. Gonzalez-Sanz, S.
Mateos, F. Schelotto, G. Algorta, J. A. Ayala, A. Echeita and R. Vignoli. (2009). Surveillance of antibiotic
resistance evolution and detection of class 1 and 2 integrons in human isolates of multiple resistant
Otras Actividades Salmonella Typhimurium obtained in Uruguay from 1976 to 2000. International Journal of Infectious
Diseases, 13:342-348.
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Otras Actividades
Home
Profesor Ad Honorem, Facultad de Medicina, Universidad de la Republica, Uruguay

Julio, 2009.
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Otras Actividades
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B5 Biotecnologa y Gentica de Bacterias Termfilas Extremas
Home Empleamos la bacteria termfila extrema Thermus thermophilus (Tth) como modelo de
trabajo principal. Tth crece muy rpido a 70 C, forma colonias sobre placas, y presenta
competencia natural. Como otros termfilos sus enzimas cristalizan mejor que sus ho-
mlogas de mesfilos, convirtindolo en un excelente modelo en Biologa Estructural. Su
filogenia ancestral tambin aade inters biolgico y evolutivo al modelo.
Exit
Empleando Tth perseguimos objetivos tanto biotecnolgicos como bsicos. Biotecnolo-
ga: i) Sobreproducimos y empleamos enzimas termostables para biotransformaciones
en colaboracin con grupos externos especializados en biocatlisis; ii) Evolucionamos
enzimas y protenas de forma dirigida para incrementar su estabilidad mediante selec-
cin in vivo o para aumentar la actividad especfica a baja temperatura; y iii) Desarrolla-
Lnea Investigacin mos nuevas herramientas genticas para su uso en termfilos. A lo largo de los ltimos
dos aos hemos sobreproducido ms de 50 termozimas (deshidrogenasa, esterasas, y
glicosidadas) y llevado a cabo procesos de seleccin de variantes termoestables de tres
Personal
protenas.
A nivel ms bsico, estudiamos el metabolismo energtico de Tth, especficamente la
Publicaciones respiracin de xidos de nitrgeno desnitrificacin-, su control gentico, y los meca-
nismos implicados en su transferencia lateral (LGT). Mediante secuenciacin genmica
hemos descubierto que el proceso es catalizado por un grupo de reductasas codifica-
Patentes
das por un megaplsmido en una isla gentica de desnitrificacin (DI) transferible ho-
rizontalmente. La DI concentra la informacin para permitir el reemplazamiento de los
complejos respiratorios I y III por enzimas ms sencillas o por otras con doble funcin
como reductasa-transportador de electrones. En la DI tambin se encuentran codificados
CBMSO 2009-2010
nuevos sistemas de deteccin-transmisin de seales que le permiten seleccionar los
componentes de su cadena respiratoria de acuerdo con seales medioambientales. En
los prximos aos continuaremos con estos estudios e iniciaremos el anlisis de meca-
nismos no convencionales que previenen la LGT entre especies bacterianas.
Home
Figura 1. El aparato de desni-
trificacin de Thermus thermo-
philus. Se muestra un esquema
de la localizacin y papel de la
NADH deshidrogenasa (Nrc)
Exit y de las reductasas de nitrato
(Nar), nitrito (Nir) y xido ntrico
(Nos). Observe el papel de Nar
como transportador de electro-
nes reemplazando al complejo III.
El paso de electrones se indica
Lnea Investigacin como flechas rojas.
Personal
Publicaciones
Figura 2. Evolucionando
Patentes una esterasa. (R)-1-fenil-2-
propil acetate encajado en
el sitio activo de un mutante
cuadruple (mutante Q) de
la esterasa I de Pseudomo-
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nas fluorescens.
Home
Jefe de Lnea: Estudiantes:
Jos Berenguer Carlos Alba M Sanchez Nio,
Akbar Espaillat Fernndez
Exit Personal Cientfico: ngel Cantero Camacho
Aurelio Hidalgo Huertas Daan Swarts
Postdoctorales: Tcnico de Investigacin:

Daniel Vega Esther Snchez Freire
Leticia Torres Maria Jos de Soto Lpez
Lnea Investigacin
Becarios Predoctorales: Cientficos visitantes:
Personal Federico Acosta Estariette van Heerden
Eloy Ferreras Puente Koos Albertin
Zahra Chahlafi Derek Litthauer
Publicaciones Marcos Almendros Gimenez Godfrey Tlou
Laura lvarez Muoz Philip Armand Bester
Patentes Carlos Bricio Garber Mariana Erasmus
No Rigoberto Rivera Novalanda Betty Mabizela
Yamal Al-Ramahi Gonzlez Susana Alarico
Martin Hesseler Hernn Costa
CBMSO 2009-2010
Publicaciones
Home
Larsen,M., Zielinska, D.F., Martinelle, M., Hidalgo, A., Jensen, L., Bornscheuer, U.T. and Hult, K. (2010)
Suppression of water as a nucleophile in Candida antarctica lipase B catalysis. ChemBioChem 11,796-801.
Cava, F, Hidalgo, A., and Berenguer, J. (2009) Thermus thermophilus as biological model. Extremophiles,
13, 213-231.
Exit Schliemann, A., Hidalgo, A., Berenguer, J. and Bornscheuer, U.T (2009). Increased Enantioselectivity by
Engineering Bottleneck Mutants in an Esterase from Pseudomonas fluorescens. ChemBioChem 10,2920-
2923 (cover feature).
Rocha-Martin, J., Vega D., Cabrera Z, Bolivar JM. Fernandez-Lafuente R., Berenguer J. and Guisan, J.M.
(2009) Purification, immobilization and stabilization of a highly enantioselective alcohol dehydrogenase
from Thermus thermophilus HB27 cloned in E. coli. Proccess in Biochemistry, 44,1004-1012.
Lnea Investigacin
Bolivar J.M., Rocha-Martin J., Mateo C., Cava F., Berenguer, J, Vega D. , Fernandez-Lafuente R., Guisan
J.M. (2009) Purification and stabilization of a glutamate dehygrogenase from Thermus thermophilus via
Personal oriented multisubunit plus multipoint covalent immobilization. Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic
58, 158-163.
Almendros M., Sinisterra JV, and Berenguer J. (2009) Thermus thermophilus Strains Active in Purine
Publicaciones Nucleoside Synthesis. Molecules 2009, 14, 1279-1287.
Bolivar J.M, Rocha-Martin J. Mateo C., Cava F., Berenguer J., Fernandez-Lafuente R., Guisan J. M.
Patentes (2009) Coating of soluble and immobilized enzymes with ionic polymers: full stabilization of the quaternary
structure of multimeric enzymes. Biomacromolecules 10, 742-747
Bolivar J., Mateo, C., Rocha-Martin, Cava F., Berenguer J., Fernandez-Lafuente R., Guisan J. M. 2009.
The adsortion of multimeric enzymes on very lowly activated supports involves more enzyme subunits:
stabilization of glutamate dehydrogenase from Thermus thermophilus by immobilization on heterofunctional
CBMSO 2009-2010
supports. Enzyme Microb. Technol. 44, 139-144.
Cava, F., Chahlafi, Z., Alavare, L., and Berenguer, J. (2009) Respiracin y desnitrificacin en Thermus
thermophilus. In: Bonete, M. J., and Martnez-Espinosa R. M. (ed) Avances en el metabolismo del nitrgeno.
Editorial Club Universitario, Alicante. pp. 173-186.
Patentes
Home
Procedimiento de inmovilizacin de una glutamato deshidrogenasa.
PCT/ES2008/070166.
Nuevo marcador termoestable para la seleccin gentica de Thermus spp P200603279.

Exit (Concesin 28-05-2010).
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Patentes
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B6 VPPA: modelos virales de evasin y proteccin
Home
Durante los ltimos aos hemos investigado sobre lneas celulares susceptibles al Virus
de la Peste Porcina Africana (VPPA) para la produccin y titulacin de aislados virales
tanto de campo como de laboratorio, as como para la generacin de virus recombinan-
tes con genes especficos delecionados. Estos mutantes de delecin se utilizan para
Exit profundizar el estudio del papel de una serie de genes relacionados con la evasin de la
respuesta antiviral celular en el proceso infectivo, y pueden servir como modelos virales
atenuados en la generacin de posibles vacunas que induzcan inmunidad protectiva
contra la PPA. En este sentido hemos confirmado el papel de la lectina del VPPA (gen
EP153R) en la modulacin de la expresin de los antgenos MHC-I en la membrana de
Lnea Investigacin la clula infectada y estamos inactivando diversos genes virales en un aislado (NHV)
parcialmente atenuado, que ha sido capaz de generar proteccin cruzada contra otro
aislado virulento (L60), pero que mantiene una virulencia residual demasiado elevada
Personal para ser aceptado como vacuna.
Las lneas celulares de origen porcino susceptibles al VPPA se estn utilizando tambin
Publicaciones para determinar los niveles de diversas citoquinas inducidos por aislados virales con dis-
tintos grados de virulencia, en la bsqueda de un perfil de virulencia/atenuacin, cuya
consecucin supondra en la prctica la reduccin sustancial de las infecciones in vivo
para la determinacin del grado de virulencia de los aislados virales.
Otro objetivo de nuestro Grupo es la optimizacin del uso de antivirales no convenciona-
les tipo lauril galato en la prevencin y/o tratamiento de enfermedades virales de inters
clnico y veterinario. Hemos determinado su baja citotoxicidad y su eficacia en la inhibi-
CBMSO 2009-2010
cin de la produccin de diversos virus (VPPA, influenza, herpes,) en clulas infecta-
das en el laboratorio, y pretendemos ampliar el estudio sobre el grado de proteccin que
pueden conferir estos antivirales en infecciones in vivo.
Home
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
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Figura 1. Interaccin entre EP153R y SLA-I. Residuos implicados
Home
Jefe de Lnea:
ngel L. Lpez Carrascosa
Exit
Postdoctoral:
Patricia de Len Valds
Estudiantes:
Alba Martnez Flrez
Lnea Investigacin
Tcnico de Investigacin:
Personal Maria Jos Bustos Snchez
Publicaciones
CBMSO 2009-2010
Publicaciones
Home
Hurtado, C., Bustos, M. J. and Carrascosa, A. L. (2010). The use of COS-1 cells for studies of field and la-
boratory African swine fever virus samples. J. Virol. Methods 164, 131-134.
Hurtado, C., Bustos, M. J., Granja, A. G., de Len, P., Sabina, P., Lopez-Vias, E., Gomez-Puertas, P., Re-
Exit villa, Y., and Carrascosa, A. L. (2010). The African swine fever virus lectin EP153R modulates the surface
membrane expression of MHC class I antigens. Arch. Virol. DOI: 10.1007/s00705-010-0846-2.
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
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B7 Morfognesis bacteriana
Home
Nuestro tema central es la investigacin, a nivel estructural y molecular, de la pared
bacteriana (sculo o capa de peptidoglicano) como elemento morfogentico primario
de la clula procaritica. En la actualidad nos centramos en el estudio de los procesos
de diferenciacin celular, adaptacin y generacin de distintos apndices (prostecas,
Exit flagelos, pili tipo IV y hold-fast) en alfa-proteobacterias, principalmente Asticcacaulis
biprosthecium, y otras bacterias de morfologa compleja.
Pretendemos extender el conocimiento adquirido en organismos de ciclo celular simple
como Escherichia coli a otros ms complejos como A. biprosthecium. Esta bacteria pre-
senta un ciclo celular dimrfico, con una fase mvil flagelada que da lugar por un proceso
Lnea Investigacin de diferenciacin a una forma sesil con dos prostecas (prolongaciones de forma tubular)
en posiciones laterales (ver figura). Slo la forma ssil es capaz de dividirse dando lu-
Personal gar a clulas flageladas mviles que entran en un nuevo ciclo de diferenciacin. Inves-
tigamos como se modifica y regula el metabolismo y estructura de la pared celular en
consonancia con las distintas etapas del proceso de diferenciacin morfolgica y como
Publicaciones se produce el crecimiento y diferenciacin de las prostecas y otros elementos celulares
con topologa definida en el espacio y el tiempo (flagelo, pili, hold-fast). Recientemente
hemos emprendido una nueva lnea centrada en el descubrimiento de un sistema de
regulacin del metabolismo de la pared celular mediado por la produccin de D-amino
cidos en Vibrio cholerae y otras bacterias. Este sistema es parte de la respuesta general
a estrs, y tiene el potencial de poder actuar como sistema de sealizacin inter e intra
especfico. Adems mantenemos colaboraciones para el anlisis de aspectos estructura-
CBMSO 2009-2010
les y biosintticos de la pared celular en otros organismos como Listeria monocitogenes,
o Leptospira biflexa asociados a morfologas peculiares o al establecimiento de relacio-
nes simbiticas o patolgicas.
Home Resumen de Investigacin
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Figura 1. Clulas de Asticcacaulis biprosthe- Figura 2. Clulas de Vibrio cholera creciendo

cium visualizadas por microscopa confocal . activamente (A) y en fase estacionaria (B) visua-
lizadas por ESM.
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Home
Jefe de Lnea:
Miguel ngel de Pedro Montalbn
Exit Said Taimani
Estudiantes:
Marisela Domnguez Domnguez
Mara Hidalgo Garca
Irene Cartas
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
CBMSO 2009-2010
Publicaciones
Home
Lam, H, Oh, D.C., Cava, F., Takacs, C.N., Clardy, J., de Pedro, M.A. and Waldor, (2009) D-amino acids
govern stationary phase cell wall remodeling in bacteria. Science 325:1552-1555.
Exit de Pedro, M.A. (2009). Peptidoglycan (Murein), In Encyclopedia of Microbiology. (Moselio Schaechter,
Ed.), pp. 453-469, Oxford: Elsevier.
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
CBMSO 2009-2010
B8 Variabilidad gentica de virus RNA
Home
El inters principal del grupo es entender las bases moleculares de la extincin de virus
RNA por mutagnesis letal y explorar protocolos antivricos empleando agentes mutag-
nicos e inhibidores. Hemos documentado una doble accin mutagnica e inhibidora del
5-fluorouracilo durante la replicacin del virus de la fiebre aftosa (VFA) y caracterizado
Exit mutantes del VFA resistentes al anlogo mutagnico de purinas ribavirina. En particular,
hemos descrito un cambio de aminocido en la polimerasa del VFA capaz de evitar la
accin detrimental de la ribavirina mediante la modulacin del tipo de mutaciones pro-
ducidas por la droga. La supervivencia del virus por modulacin de tipos de mutaciones,
sin alterar la fidelidad de la polimerasa, constituye un nuevo mecanismo de resistencia
Lnea Investigacin a un agente mutagnico. A pesar de la presencia de mutaciones de resistencia a agen-
tes mutagnicos, la extincin de virus puede lograrse con tratamientos mutagnicos al-
ternativos. Contrariamente a lo establecido para tratamientos antivirales clsicos, una
Personal administracin secuencial primero de un inhibidor y despus de un agente mutagnico
puede ser ms ventajosa que la administracin simultnea de ambos para la extincin
Publicaciones de virus.
Como paso importante para entender implicaciones del comportamiento de virus como
Patentes cuasiespecies, se ha caracterizado una dinmica de competicin y colonizacin entre
subpoblaciones de VFA surgidas en clulas en cultivo por diversificacin de un clon bio-
lgico del virus. Nuestro laboratorio ha participado en colaboraciones con otros grupos
Tesis Doctorales de virologa terica y experimental acerca de aspectos estructurales de la polimerasa
de VFA y sobre implicaciones biolgicas de cuasiespecies, incluyendo nuevos diseos
CBMSO 2009-2010
vacunales. Las colaboraciones se pueden identificar por los autores de las publicaciones
incluidas en este resumen.
Home
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Patentes
Tesis Doctorales
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Figura 1. Estrategia antiviral basada en la extincin de virus mediante el aumento de la
tasa de error durante su replicacin.
Home
Jefe de Lnea:
Esteban Domingo Solans
Postdoctorales:
Exit Celia Perales Viejo
Vernica Martn Garca
Armando Arias Esteban
Julie Sheldon
Lnea Investigacin Becarios Predoctorales:

Rubn Agudo Torres
Marta Sanz-Ramos Rojo
Personal Samuel Ojosnegros Martos
Hctor Moreno Borrego
Publicaciones Hctor Tejero Franco
Ignacio de la Higuera
Ana M Ortega Prieto
Patentes
Tcnicos de Investigacin:
Tesis Doctorales Ana Isabel de vila Lucas
Eva Garca Cueto
Isabel Gallego Jimnez
CBMSO 2009-2010
M Eugenia Soria Benito

Publicaciones
Agudo, R. Arias, A. and Domingo, E. (2009). 5-Fluorouracil in lethal mutagenesis of foot-and-mouth disease virus. Future Medicinal
Chemistry, 1(3), 529-539.
Home Domingo, E. and Wain-Hobson, S. (2009). The 30th anniversary of quasispecies. Meeting on quasispecies: past, present and future.
EMBO Reports, 10, 444-448.
Emonet, S.F., de la Torre, J.C., Domingo, E. and Sevilla, N. (2009). Phylogeny/molecular taxonomy and evolution or Arenaviruses. Infection Genetics
and Evolution, 9, 417-429.
Perales, C., Agudo, R. and Domingo, E. (2009). Counteracting quasispecies adaptability: extinction of a ribavirin resistant virus mutant by an
alternative mutagenic treatment. PLoS One, 4(5): e5554.doi: 10.1371/journal.pone.0005554.
Escarms, C., Perales, C. and Domingo, E. (2009). Biological effect of Mullers ratchet. Distant capsid site can affect picornavirus
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Ferrer-Orta, C., Agudo, R., Domingo, E. and Verdaguer, N. (2009). Structural insights into replication and elongation processes by the FMDV
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Bordera, A.V., Lorenzo-Redondo, R., Pernas, M., Casado, C., lvaro, T., Domingo, E. and Lpez-Galndez, C. (2010). Initial fitness recovery of HIV-1
Tesis Doctorales is associated with quasispecies heterogeneity and can occur without modifications in the consensus sequence. PLoS One, 5(4), e10319.
Martn-Acebes, M.A., Herrera, M., Armas-Portela, R., Domingo, E. and Sobrino, F. (2010). Cell density-dependent expression of viral antigens during
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CBMSO 2009-2010
Rodrguez-Calvo, T., Ojosnegros, S, Sanz-Ramos, M., Garca-Arriaza, J., Escarms, C., Domingo, E. and Sevilla, N. (2010). New vaccine design
based on defective genomes that combines features of attenuated and inactivated vaccines. PLoS One, 5(4), e10414.
Arias, A., Perales, C., Escarms, C. and Domingo, E. (2010). Deletion mutants of VPg reveal new cytopathology determinants in a picornavirus.
PLoS One, 5(5), e10735.
Agudo, R., Ferrer-Orta, C., Arias, A., de la Higuera, I., Perales, C., Prez-Luque, R., Verdaguer, N. and Domingo, E. (2010). A multi-step process of
viral adaptation to a mutagenic nucleoside analogue by modulation of transition types leads to extinction-escape. PLoS Pathog. 6(8) pii: e1001072.
Perales, C., Lorenzo-Redondo, R., Lpez-Galndez, C., Martnez, M. A., and Domingo, E. 2010. Mutant spectra in virus behavior. Future
Virology 5(6), 679-698.
Patentes
Home
N. Sevilla, E. Domingo, C. Escarms, S. Ojosnegros, J. Garca-Arriaza, M. Sanz-Rojo, T.
Rodrguez (2009) Vacuna atenuada para la fiebre aftosa. PCT1641.49. Entidades titula-
res: CSIC (70%), Instituto Nacional de Investigaciones Agrarias (30%).

Exit E. Domingo, R. Agudo, H. Tejero, S.C. Manrubia, C. Perales (2009) Tratamiento antiviral.
P200930482. Entidades titulares: CSIC (41%), Instituto Nacional de Tcnica Aeroespa-
cial (18%), Universidad Complutense de Madrid (18%), Centro de Investigaciones Bio-
mdicas en Red de Enfermedades Hepticas y Digestivas (CIBERehd) (23%).
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Patentes
Tesis Doctorales
CBMSO 2009-2010
Tesis Doctorales
Home
Samuel Ojosnegros Martos (2009) Dinmica evolutiva de virus RNA. Universidad Aut-
noma de Madrid. Director: Esteban Domingo Solans.
Rubn Agudo Torres (2009) Caracterizacin de las protenas del virus de la fiebre afto-
Exit
sa implicadas en respuesta a mutagnesis letal por anlogos de nucletido. Universidad
Autnoma de Madrid. Director: Esteban Domingo Solans.
Marta Sanz-Ramos Rojo (2009) Dinmica de cuasiespecies del virus de la fiebre aftosa
in vivo. Universidad Autnoma de Madrid. Director: Esteban Domingo Solans.
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Personal
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Tesis Doctorales
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B9 Expresin gnica en Streptomyces y levaduras
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Streptomyces y levaduras son microorganismos productores de un gran nmero de mo-
lculas de inters biotecnolgico. El grupo est interesado en conocer el mecanismo de
regulacin de la expresin de protenas implicadas en algunos de estos procesos biosin-
tticos y en la obtencin de nuevas molculas de posible utilidad industrial. Durante los
Exit ltimos dos aos hemos continuado el estudio del cluster ata de Streptomyces capreolus
responsable de la sntesis del antibitico nucleosdico A201A, y de distintas protenas
con actividad glicosiltransferasa de levaduras que puedan ser empleadas en la obtencin
de distintas molculas con propiedades prebiticas.
Un 44% de la masa de A201A lo constituyen residuos glucdicos que estn implicados en
Lnea Investigacin el control de las propiedades biolgicas-farmacolgicas del antibitico. Se han caracte-
rizando y estudiando, en organismos heterlogos, los genes implicados en la incorpora-
cin y posterior modificacin de estos residuos. Nos planteamos obtener nuevas mol-
Personal culas con actividad antibitica basndonos en la flexibilidad de sustrato que muestran las
glicosiltransferasas implicadas en procesos similares previamente descritas.
Publicaciones Las protenas que pueden sintetizar molculas prebiticas, caracterizadas en nuestro
grupo, se han aislado de distintas levaduras incluidas en los gneros Xanthophyllomy-
Patentes ces, Schwanniomyces y Rhodotorula; todas son hidrolasas con actividad transferasa y
pueden incluirse en la familia 32, 31, 1 y 2 de las glicosilhidrolasas. Conocer la relacin
que existe entre su estructura, funcin y especificidad es uno de nuestros objetivos prin-
Tesis Doctorales cipales. Para ello, estamos realizando estudios estructurales (hemos resuelto ya la es-
tructura 3-D de algunas de ellas), realizando mutaciones puntuales y aplicando tcnicas
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de evolucin molecular dirigida. Pretendemos aumentar/modificar la actividad transfera-
sa de estas enzimas para favorecer su utilizacin industrial. Hemos patentado ya en dis-
tintos pases la aplicabilidad industrial de la mayora de ellas, diseado un mtodo eficaz
para su fijacin a soportes slidos y pretendemos escalar hasta un nivel industrial tanto
su produccin como la de los productos generados.
Home Figura 1. (A) Vista del centro ac-

tivo de la Ffasa de Schwanniomy-
ces occidentalis acomplejado
con fructosa, 1-kestosa (verde;
izquierda) y 6-kestosa (amarillo;
derecha). El centro activo de la
Exit Ffasa (azul) est delimitado por
la subunidad adyacente (naran-
ja). (B) Fructan 1-exohidrolasa
IIa de Cichorium intybus (CiFEH)
acomplejada con 1-kestosa y (C)
invertase de Thermotoga maritima
acomplejada con rafinosa.
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Figura 2. Patrn de
oligomerizacin de
Patentes la Ftasa de Schwan-
niomyces occidenta-
lis sobre un cultivo de
Tesis Doctorales esta misma levadura.
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Jefe de Lnea:
Antonio Jimnez / Mara Fernndez Lobato
Exit Becarios Predoctorales:

Miguel de Abreu Felipe
Miguel lvaro Benito
Dolores Linde Lpez
Patricia Gutirrez Alonso
Brian Molloy Galiana
Lnea Investigacin
Estudiantes:
Personal David Gonzlez Prez
Marta Estvez Canales
Hugo Muoz
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Tcnico de Investigacin:
Patentes Asuncin Martn Redondo
Cientficos Visitantes:
Tesis Doctorales Vctor Cifuentes (Chile)
Marcelo Baeza (Chile)
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Publicaciones
Home
Linde, D., Macias, I., Fernndez-Arrojo, L., Plou, F.J., Jimnez, A. and Fernndez-Lobato, M. (2009)
Molecular and biochemical characterization of an fructofuranosidase from Xanthophyllomyces dendrorhous.
App Env Microbiol. 75(4), 1065-1073.
Gutirrez-Alonso, P., Fernndez-Arrojo, L., Plou, F.J. and Fernndez-Lobato, M. (2009) Biochemical
Exit characterization of a b-fructofuranosidase from Rhodotorula gracilis with transfructosylating activity. FEMS
Yeast Research. 9, 768-773.
Polo, A., lvaro-Benito, M., Fernndez-Lobato, M. and Sanz-Aparicio, J. (2009) Crystallization and
preliminary X-ray diffraction analysis of thefructofuranosidase from Schwanniomyces occidentalis. Acta
Cryst. 65, 1162-1165.
Baeza, M., Retamales, P., Sepulveda D., Lobato P., Jimenez A. and Cifuentes V. (2009) Isolation,
Lnea Investigacin characterization and long term preservation of mutant strains of Xanthophyllomyces dendrorhous. J. Basic
Microbiol. 49, 135-141.
Personal Alvaro-Benito, M., Polo, A., Gonzlez, B., Fernndez-Lobato, M. and Sanz-Aparicio, J. (2010) Structural
and kinetic analysis of Schwanniomyces occidentalis invertase reveals a new oligomerization pattern and
the role of its supplementary domain in substrate binding. J. Biol. Chem. 285 (18), 13930-14941.
Publicaciones Polo, A., Linde, D., Estvez, M., Fernndez-Lobato, M. Julia Sanz-Aparicio, J.. (2010). Crystallization and
preliminary X-ray diffraction analysis of the fructofuranosidase from Xanthophyllomyces dendrorhous. Acta
Cryst. 66, 1441-1444.
Patentes
lvaro-Benito, M., de Abreu, M., Portillo, F., Snz-Aparicio, J. and Fernndez-Lobato, M. (2010). New
insights into the fructosyltransferase activity of Schwanniomyces occidentalis -fructofuranosidase emerges
Tesis Doctorales from a non-conventional codon usage and directed mutation. App. Env. Microbiol. 76 (22), 7491-7499.
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Home
L. Fernndez Arrojo, F. Plou, A. Ballesteros, M. Alcalde, P. Gutierrez Alonso, M. Fernn-
dez-Lobato (2009). Biocatalizador inmovilizado basado en alginato para la biotransfor-
macin de carbohidratos. N P200930001. PCT-ES2010/070104 (24 -2- 2010). Titular:
CSIC-UAM.
Exit
M. Fernndez-Lobato, M. Alvaro Benito (2009). Fructofuranosidasa mejorada genticamen-
te para la obtencin del prebitico 6-kestosa. N P0200930929 (29-12-2009). Titular: UAM.
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Brian Molloy Galiana (2010). Expresin heterloga del cluster biosinttico del antibi-
tico A201A y estudio de las posibles glicosiltransferasas implicadas en su biosntesis.
Universidad Autnoma de Madrid. Director: Mara Fernndez-Lobato.
Exit
Mara Dolores Linde Lpez (2010). Caracterizacin bioqumica, molecular y estructural
de una b-fructofuranosidasa con capacidad trasferasa de la levadura Phaffia rhodozyma
aplicable a la produccin de oligosacridos prebiticos. Universidad Autnoma de Ma-
drid. Director: Mara Fernndez-Lobato.
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B10 Ingeniera de Virus
Home Utilizamos tcnicas de ingeniera de protenas para el estudio de relaciones entre estruc-
tura y funcin en virus y sus cpsidas, y para el diseo y anlisis de partculas vricas
modificadas con posibles aplicaciones en nanobiotecnologa (Mateu (2011). Prot.Eng.
Des.Sel. 24, 53-63).
Relevancia cientfica e implicaciones tecnolgicas: Conocimiento en profundidad de cier-
Exit
tas etapas del ciclo vrico, incluyendo ensamblaje, dinmica conformacional y desensam-
blaje de virus; diseo de vacunas, antivirales y nanopartculas para la liberacin dirigida
de frmacos.
Algunos resultados recientes: i) Mediante ingeniera de protenas hemos aumentado la
estabilidad trmica del virus de la fiebre aftosa (FMDV) frente a su disociacin en subu-
Lnea Investigacin nidades. Estamos investigando las bases moleculares de esta termoestabilizacin y las
posibilidades vacunales de estos virus modificados. ii) Hemos realizado un estudio ex-
Personal tensivo de mutaciones compensatorias en la cpsida de FMDV, y estamos investigando
los mecanismos moleculares por los que ocurre la compensacin. iii) En colaboracin
con P.J. de Pablo y J. Gmez (Depto. Fsica Materia Condensada, UAM), hemos investi-
Publicaciones gado en el virus diminuto del ratn (MVM) el papel de la estructura de poros y cavidades
en las propiedades mecnicas de la partcula vrica, mediante microscopa de fuerzas
Otras Actividades atmicas (tcnica que utilizamos en nuestro laboratorio). Hemos encontrado evidencia
de que las propiedades mecnicas encontradas pueden haber sido evolutivamente se-
leccionadas para optimizar la resistencia del virus a agentes fsicos, pero permitiendo
Patentes los cambios conformacionales necesarios para su infectividad. iv) En colaboracin con
J.L.Neira (CBMC) y M.A.Martnez (IRSI-Caixa) estamos investigando la capacidad de
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Tesis Doctorales diferentes pptidos sintticos y otras molculas para inhibir el ensamblaje de la cpsida
del virus de la inmunodeficiencia humana (HIV) y la infectividad del virin, con vistas al
diseo de agentes anti-HIV. v) En colaboracin con G.Rivas (CIB) hemos demostrado en
dos sistemas vricos modelo que, en condiciones fisiolgicas de aglomeracin molecular,
antivirales de pequeo tamao reducen su actividad.
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Exit
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Otras Actividades Figura 1. Imagen topogrfica de una partcula individual

del virus MVM en medio lquido, obtenida en nuestro la-
boratorio mediante microscopa de fuerzas atmicas. In-
Patentes mediatamente tras la obtencin de la imagen, se utiliza el
microscopio para la aplicacin de fuerza sobre la partcula Figura 2. Localizacin en la estructura de
visualizada, lo que permite medir su elasticidad mecnica. la cpsida de FMDV (A) de un conjunto de
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mutaciones letales en las interfases en-
Tesis Doctorales tre subunidades pentamricas (B, en color
blanco), y del conjunto de las diferentes mu-
taciones compensatorias que restauraron la
infectividad (C, en verde o naranja).
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Jefe de Lnea:
Mauricio Garca Mateu
Exit Postdoctoral:
Rebeca Prez Fernndez
Rebeca Bocanegra Rojo
Lnea Investigacin Milagros Castellanos Molina
Inmaculada Lpez Prez
Pablo Jos Prez Carrillo
Personal Vernica Rincn Forero
Publicaciones Tcnicos de Investigacin:

Miguel ngel Fuertes Villadangos
Alicia Rodriguez Huete
Otras Actividades
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Home
Carrasco, C., Douas, M., Miranda, R., Castellanos, M., Carrascosa, J.L., Mateu, M.G., Marqus, M. and
de Pablo, P.J. (2009). Action of capillary forces of water confined at the nanoscale during dessication of
viruses. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 5475-5480. (A)
Exit
Serena, P.A., Douas, M., Marqus, M.I., Carrasco, C., de Pablo, P.J., Miranda, R., Carrascosa, J.L.,
Castellanos, M. and Mateu, M.G. (2009). MC simulations of water meniscus in nanocontainers: explaining
the collapse of viral particles due to capillary forces. Phys. Status Solidi C 6, 2128-2132.
Mateu, M.G. (2009). Capsid protein interactions in human immunodeficiency virus type 1 assembly. FEBS
J. 276, 6098-6109.
Lnea Investigacin
Luna, E., Rodriguez-Huete, A., Rincn, V., Mateo, R. and Mateu, M.G. (2009). A systematic study of the
genetic response of a variable virus to the introduction of deleterious mutations in a functional capsid
Personal region. J.Virol. 83, 10140-10151.
Martn-Acebes, M., Rincn, V, Mateu, M.G. and Sobrino, F. (2010). A single amino acid substitution in the
Publicaciones structural protein VP3 of foot-and-mouth disease virus can increase acid-lability and confer resistance to
acid-dependent uncoating inhibition. J.Virol. 84, 2902-2912.
Otras Actividades Domenech, R., Abin, O., Bocanegra, R., Correa, J., Sousa-Herves, A., Riguera, R., Mateu, M.G.,
Fernndez-Mega, E., Velzquez-Campoy, A. and Neira, J.L. (2010) Dendrimers bind the homodimerization
interface of the capsid protein of HIV-1. Biomacromolecules 11, 2069-2078.
Patentes
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Otras Actividades
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Mauricio G. Mateu, miembro del Editorial Board de Virus Research
Exit
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Otras Actividades
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Patente OEPM n 2 323 929 (Vacuna frente a la fiebre aftosa). Concedida junio 2010.
Exit
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Otras Actividades
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Home
Eva Luna Garca (2010). Aproximaciones a la obtencin de cpsidas ms estables del

virus de la fiebre aftosa y estudio de la generacin de mutaciones compensatorias.
Universidad Autnoma de Madrid. Director: Mauricio G. Mateu.
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Otras Actividades
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Efectos de elementos extracromosmicos sobre el comportamiento

B11
Home Los llamados elementos genticos mviles (MGE), por ejemplo, fagos, plsmidos, trans-
posones e ICEs, se pueden transferir horizontalmente entre las clulas afectando la com-
posicin gentica y por lo tanto el comportamiento de las bacterias. En consecuencia, la
transferencia horizontal de genes (HGT) tiene un papel crucial en la evolucin microbia-
na, as como implicaciones importantes en una mirada de problemas de salud ambiental
Exit y pblica. Por ejemplo, HGT es el principal responsable de la aparicin y rpida disper-
sin de la resistencia a los antibiticos.
Especialmente en las bacterias Gram positivas se sabe poco sobre los mecanismos por
los cuales MGE ejercen sus efectos sobre el comportamiento de su hospedador en la
regulacin de su movilidad. Una mejor comprensin de estas cuestiones es crucial para
hacer frente a amenazas importantes como por ejemplo la diseminacin de las resis-
Lnea Investigacin tencias a antibiticos. En nuestro laboratorio estudiamos estos temas utilizando como
hospedador Bacillus subtilis y limitando los MGEs a plsmidos y fagos.
Personal Utilizamos B. subtilis porque, (i) es probablemente la bacteria Gram-positiva mejor es-
tudiada, (ii) no es patgena, (iii) es susceptible a la manipulacin gentica debido a su
capacidad para desarrollar competencia natural, y (iv) B. subtilis est relacionado con
Publicaciones bacterias patgenas/fastidiosas como Bacillus anthracis, B. cereus y, aunque ms dis-
tante, Listeria monocytogenes.
Se ha descrito para algunos fagos que su infeccin altera el comportamiento de B. subti-
lis. Sin embargo, no se dispone ni de informacin de la secuencia, ni del mecanismo por
el que estos fagos afectan el comportamiento de su hospedador infectado. Para analizar
estos temas centramos nuestros estudios en dos fagos. Alrededor del 20% de los ais-
lamientos naturales de B. subtilis contienen un plsmido endgeno. La mayora de los
plsmidos grandes (> 10 kb) se pueden transferir a otras clulas a travs del proceso de
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conjugacin. Somos los primeros que han secuenciado dos plsmidos Bacillus grandes e
identificado los genes involucrados en su conjugacin, as como otras que probablemen-
te afectan a los procesos de comportamiento del hospedador. En la actualidad estamos
analizando stos para desentraar la regulacin del proceso de conjugacin y profundizar
en la forma en que los genes plasmdicos alteran el comportamiento de su hospedador.

B11
Home
Figura 1. Microscopa
de contraste de fase
de la esporulacin de
clulas de B. subtilis
Exit portadoras del plsmi-
do pLS20.
Lnea Investigacin
Personal
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Figura 2. Mapa gen-
tico del plsmido p576
inhibidor de la esporu-
lacin de B. pumilus.
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B11
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Jefe de Lnea:
Wilfried J.J. Meijer
Exit Becarios Predoctorales:
Praveen K. Singh
Gayetri Ramachandran
Estudiantes:
Lnea Investigacin Esther Serrano
Sandra Ballestero Beltrn
Personal Tcnico de Investigacin:
Adriana Marulanda Aguirre
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B11
Publicaciones
Home
Singh, P. K., Ballestero-Beltrn, S., Ramachandran, G. and Meijer, W.J.J. (2010) Complete nucleotide
sequence and determination of the replication region of the sporulation inhibiting plasmid p576 of Bacillus
pumilus NRS576. Res. Microbiol. 161, 772-782.
Muoz-Espn, D., Daniel, R., Kawai, Y., Carballido-Lpez, R., Castilla-Llorente, V., Errington, J.*, Meijer,
Exit W.J.J.*, and Salas, M.* *: contributed equally. (2009) The actin-like MreB cytoskeleton organizes viral DNA
replication in bacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. July 27 Epub ahead of print.
Castilla-Llorente, V., Meijer, W.J.J., and Salas, M. Differential Spo0A-mediated effects on transcription and
replication of the related Bacillus subtilis phages Nf and f29 explain their different behaviours in vivo.
(2009) Nucleic Acids Res. 37: 4955-4964.
Lnea Investigacin
Castilla-Llorente, V., Salas, M., and Meijer, W.J.J. (2009) Different responses to Spo0A-mediated suppression
of the related Bacillus subtilis phages Nf and f29. Environ. Microbiol. 11: 1137-49.
Personal
Publicaciones
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B12 Retrotranscriptasa del virus de la inmunodeficiencia humana y terapia antirretroviral
Home
El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) es un retrovirus que infecta preferente-
mente a clulas del sistema inmune y provoca el sndrome de inmunodeficiencia adquiri-
da (SIDA). Actualmente, el tratamiento de la infeccin por el VIH se basa en la utilizacin
de inhibidores de enzimas del virus como la retrotranscriptasa (RT), la proteasa y la
Exit integrasa, adems de frmacos que actan bloqueando la entrada del VIH en la clula
hospedadora. Las terapias combinadas que incluyen dos o tres inhibidores de la RT han
demostrado una gran eficacia clnica. Sin embargo, la aparicin de virus resistentes, la
existencia de reacciones cruzadas entre distintos frmacos, adems de sus efectos se-
cundarios son factores que hipotecan su utilidad a largo plazo.
Lnea Investigacin Nosotros estamos interesados en el estudio de dianas teraputicas en el VIH, con un
enfsis particular en la RT. Esta enzima es la responsable de la replicacin del ARN que
Personal constituye el material gentico del virus. Recientemente nuestros esfuerzos se han diri-
gido hacia la consecucin de dos objetivos importantes: (1) entender el papel que juegan
distintos aminocidos en la especificidad de nucletido y en la fidelidad de copia de la en-
Publicaciones zima; y (2) determinar cules son los mecanismos moleculares implicados en resistencia
a inhibidores de la RT y cul es la contribucin de los distintos cambios de aminocido
Otras Actividades en la adquisicin de resistencia.
Adems, los estudios de la especificidad de nucletido de la RT pueden servirnos para
Patentes desarrollar nuevas herramientas de utilidad en biologa molecular. Por ejemplo, RTs ms
fieles y estables a temperaturas elevadas, con aplicaciones importantes en estudios de
expresin gnica. Finalmente, la extensin de estos anlisis a otras actividades catal-
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Tesis Doctorales ticas de la RT (por ejemplo, ribonucleasa H), o al proceso de iniciacin de la retrotrans-
cripcin puede abrir nuevas posibilidades en el diseo de estrategias teraputicas para
el tratamiento de la infeccin por el VIH.
Home
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Figura 1. Estructura cristalogrfica de la retro-
transcriptasa del VIH-1 unida a un complejo molde-
Otras Actividades iniciador de ARN/ADN, en la que se muestran (en
morado) residuos del subdominio thumb que mo-
dulan resistencia a anlogos a nuclesido Figura 2. Cinticas de reacciones de
Patentes escisin de iniciadores bloqueados con
AZT-monofosfato, llevadas a cabo con
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complejos ADN/ADN y variantes de la re-
Tesis Doctorales trotranscriptasa del VIH-1.
Home
Jefe de Lnea:
Luis Menndez Arias
Postdoctoral:
Exit Mar lvarez Garca
Tania Matamoros Grande
Vernica Barrioluengo Fernndez
Lnea Investigacin Gilberto J. Betancor Quintana
Mnica Kisic Aguirre
Personal Estudiantes:
Raquel N. Afonso Lehmann
Publicaciones Daniela Barbieri
Yasemin Ezgi Ertrk
Luis Goslbez Cisneros-Miret
Otras Actividades Cristina Jimnez Snchez
Patentes
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Publicaciones
Home lvarez, M., Matamoros, T. and Menndez-Arias, L. (2009) Increased thermostability and fidelity of DNA
synthesis of wild-type and mutant HIV-1 group O reverse transcriptases. J. Mol. Biol. 392, 872-884.
De Mendoza, C., Anta, L., Garca, F., Prez-Elas, M.J., Gutirrez, F., Llibre, J.M., Menndez-Arias, L.,
Dalmau, D., Soriano, V., on behalf of Platform for Drug Resistance of the Spanish AIDS Research Network
(2009) HIV-1 genotypic drug resistance interpretation rules 2009 Spanish guidelines. AIDS Rev., 11, 39-51.
Exit Garriga, C., Prez-Elas, M.J., Delgado, R., Ruiz, L., Prez-lvarez, L., Pumarola, T., Lpez-Lirola, A.,
Gonzlez-Garca, J. and Menndez-Arias, L., on behalf of the Spanish Group for the Study of Antiretroviral
Drug Resistance (2009) HIV-1 reverse transcriptase thumb subdomain polymorphisms associated with
virological failure to nucleoside drug combinations. J. Antimicrob. Chemother. 64, 251-258.
Matamoros, T., Nevot, M., Martnez, M.A. and Menndez-Arias, L. (2009) Thymidine analogue resistance
suppression by V75I of HIV-1 reverse transcriptase: Effects of substituting Valine 75 on stavudine excision
Lnea Investigacin and discrimination. J. Biol. Chem. 284, 32792-32802.
Menndez-Arias, L. (2009) Mutation rates and intrinsic fidelity of retroviral reverse transcriptases. Viruses
Personal 1, 1137-1165; doi:10.3390/v1031137
Puertas, M.C., Buzn, M.J., Artese, A., Alcaro, S., Menndez-Arias, L., Perno, C.F., Clotet, B., Ceccherini-
Silberstein, F. and Martinez-Picado, J. (2009) Effect of the human immunodeficiency virus type 1 reverse
Publicaciones transcriptase polymorphism Leu-214 on replication capacity and drug susceptibility. J. Virol. 83, 7434-7439.
Betancor, G., Puertas, M.C., Nevot, M., Garriga, C., Martnez, M.A., Martinez-Picado, J. and Menndez-
Otras Actividades Arias, L. (2010) Mechanisms involved in the selection of HIV-1 reverse transcriptase thumb subdomain
polymorphisms associated with nucleoside analogue therapy failure. Antimicrob. Agents Chemother.
54, 4799-4811.
Patentes Clotet, B., Menndez-Arias, L., Schapiro, J. M., Kuritzkes, D., Burger, D., Telenti, A., Brun-Vezinet, F., Geretti,
A. M., Boucher, C. A. and Richman, D. D. (eds.) (2010) Guide to management of HIV drug resistance,
CBMSO 2009-2010
antiretrovirals pharmacokinetics and viral hepatitis in HIV infected subjects, 10th Edition, Fundaci de Lluita
Tesis Doctorales contra la SIDA, Barcelona, Spain, 422 pp.
Menndez-Arias, L. (2010) Special issue: Retroviral enzymes. Viruses 2, 1181-1184 (editorial).
Menndez-Arias, L. (2010) Molecular basis of human immunodeficiency virus drug resistance: An update.
Antiviral Res. 85, 210-231.
Otras Actividades
Home
Luis Menndez Arias es miembro de los Comits Editoriales de Antiviral Therapy, Viru-
ses y Timely Topics in Medicine: AIDS Cyber Journal
Exit
Editor de un nmero especial de la revista Viruses dedicado a Retroviral enzymes
(2009/2010)
Miembro del comit de formacin de la Red de Investigacin en SIDA (RIS) y co-orga-

nizador de la Tercera Reunin Docente de la Red (San Lorenzo de El Escorial, 7-9 de
Lnea Investigacin octubre de 2009)
Personal
Publicaciones
Otras Actividades
Patentes
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Tesis Doctorales
Home Patentes
L. Menndez Arias, T. Matamoros, M. lvarez (2010). Retrotranscriptasa del VIH-1 de

grupo O modificada. Ref.: PCT/ES2010/070320.
Exit
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Home
Mnica Kisic Aguirre (2010). Mecanismos moleculares de resistencia e hipersensibili-

dad a frmacos antirretrovirales mediados por deleciones en la horquilla 3-4 de la re-
Exit trotranscriptasa del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1. Universidad Autnoma
de Madrid. Director: Luis Menndez Arias.
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
Otras Actividades
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B13 Virus de la peste porcina Africana
Home
Reparacin del DNA del virus de la peste porcina africana (VPPA).
Actualmente, nuestro objetivo es estudiar la funcin biolgica de la DNA polimerasa re-
parativa, pol X, del VPPA, que participa, junto con la endonucleasa AP y la DNA ligasa
viral, en un sistema de reparacin por escisin de bases (BER). Nuestros estudios mues-
Exit
tran que la pol X se requiere para la replicacin del virus en su clula blanco, el macrfa-
go porcino, y protege a la clula infectada frente a agentes genotxicos oxidantes. Ms
an, la pol X del VPPA es necesaria para mantener la estabilidad del genoma, reparando
mutaciones introducidas en el DNA del virus durante la infeccin, lo que subraya la im-
portancia de su funcin in vivo.
Lnea Investigacin Morfognesis del VPPA.
La biognesis de las membranas del VPPA es uno de los temas de mayor inters y
Personal ms controvertidos en el estudio de la morfognesis del virus. Con el fin de abordar es-
tos estudios estamos utilizando recombinantes del VPPA que expresan induciblemente
Publicaciones protenas estructurales de membrana que se localizan en la envuelta interna del virus.
Recientemente, hemos identificado un nuevo intermedio morfogentico, constituido por
estructuras helicoidales de membrana que son precursoras de las partculas virales ico-
Patentes sadricas. Para conocer mejor la estructura de estos intermedios helicoidales, estamos
utilizando actualmente tcnicas de tomografa electrnica y otras tcnicas avanzadas de
Tesis Doctorales microscopa electrnica para la resolucin de estructuras tridimensionales.
Otro objetivo de nuestros estudios sobre morfognesis es conocer mejor la regulacin
CBMSO 2009-2010
del procesamiento de las poliprotenas pp220 y pp62 del VPPA, que son componentes
mayoritarios del core viral y cuyo procesamiento proteoltico es esencial para la ma-
duracin del virus. Nuestros resultados indican la existencia de mecanismos redox que
podran operar durante el ciclo infectivo regulando la actividad de la proteasa viral que
lleva a cabo dicho procesamiento.
Home
Exit
Lnea Investigacin
Personal
Publicaciones
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Figura 1. Anlisis de cortes seriados de una factora viral mostrando una estructura heli-
coidal de membrana con una partcula icosadrica asociada. Panel a la derecha, recons-
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truccin de la estructura helicoidal. Los componentes de cada banda en las diferentes
secciones estn coloreadas idnticamente.
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Jefe de Lnea:
Maria Luisa Salas Falgueras
Exit Postdoctorales:
Modesto Redrejo Rodrguez
Cristina Surez Garca
Cristina Surez Garca
Lnea Investigacin Marina del Rosal Macas
Personal Tcnico de Investigacin:

Mara Luisa Nogal Pars
Mara Jos Bustos Snchez
Publicaciones Esther Martn Forero
Patentes CientficosVisitantes:
Mara Ballester Devis
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CBMSO 2009-2010
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Redrejo-Rodrguez, M., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Salas, M. L. and Salas, J. (2009) African swine
fever virus AP endonuclease is a redox-sensitive enzyme that repairs alkylating and oxidative damage to
DNA. Virology 390, 102-109.
Exit Rodrguez, I., Nogal, M. L.,Redrejo-Rodrguez, M., Bustos, M. J.and Salas, M. L. (2009) The African swine
fever virus virion membrane protein pE248R is required for virus infectivity and an early postentry event. J.
Virol. 83, 12290-12300.
Surez, C., Salas, M. L. and Rodrguez, J. M. (2010) African swine fever virus polyprotein pp62 is essential
for viral core development. J. Virol. 84, 176-187.
Lnea Investigacin
Surez, C., Gutirrez-Berzal, J., Andrs, G., Salas, M. L. and Rodrguez, J. M. (2010) The African swine
fever virus protein p17 is essential for the progression of the viral membrane precursors towards icosahedral
Personal intermediates. J. Virol. 84, 7484-7499.
Ballester, M., Galindo-Cardiel, I., Gallardo, C., Argilaguet, J. M., Segals, J., Rodrguez, J. M. and Rodrguez,
Publicaciones F. (2010) Intranuclear detection of African swine fever virus DNA in several cell types from formalin-fixed and
paraffin-embedded tissues using a new in situ hybridization protocol. J. Virol. Methods 168, 38-43.
Patentes
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M. L. Salas y J. M. Rodrguez (CSIC), L. K. Dixon (IAH). (2010). Vacuna contra el virus

de la peste porcina Africana basada en virus recombinantes deficientes en replicacin.
N Solicitud: ES1641.748.
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Modesto Redrejo Rodrguez (2009). La endonucleasa AP del virus de la peste porcina

Africana y el papel biolgico del sistema viral de reparacin del ADN. Universidad Aut-
noma de Madrid. Directores: Jos Salas Falgueras y Mara Luisa Salas Falgueras.
Exit
Cristina Surez Garca (2009). Papel de la poliprotena pp62 y de la protena p17 en la
morfognesis del virus de la peste porcina Africana. Universidad Autnoma de Madrid.
Director: Javier M. Rodrguez.
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Desarrollo de nuevas estrategias para el control y prevencin de enfermedades virales:

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el virus de la fiebre aftosa como modelo
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El virus de la fiebre aftosa (VFA) constituye un interesante modelo, de gran importancia

econmica, para entender como las interacciones entre un virus con gran capacidad de
variacin y sus diferentes hospedadores naturales condicionan el control de la enferme-
Exit dad que produce. Se est trabajando en el desarrollo de nuevas vacunas marcadoras
frente al VFA (pptidos y vacunas DNA) que induzcan respuestas humorales y celula-
res protectoras - empleando como principal modelo animal un importante hospedador
natural de ste virus: el cerdo - y en el anlisis de su inmunogenicidad. Algunas de las
estrategias desarrolladas estn siendo empleadas para el desarrollo de nuevas vacu-
nas frente a otra importante enfermedad viral animal, la peste porcina clsica (PPC). Se
Lnea Investigacin trabaja, tambin, en el anlisis funcional de distintas protenas virales en la internaliza-
cin, el ciclo de multiplicacin y los mecanismos que median la patogenicidad del VFA
Personal y de otros virus que causan enfermedades vesiculares similares, como el virus de la
enfermedad vesicular del cerdo (VEVC) y el virus de la estomatitis vesicular (VSV), en
cultivos celulares y modelos animales. Se presta especial atencin a las implicaciones
Publicaciones funcionales de las protenas no estructurales en la virulencia y el rango de hospedador
virales, mediante el estudio de sus interacciones con diferentes componentes celulares.
Patentes A su vez, se est llevando a cabo un estudio paralelo de las implicaciones funcionales
de regiones no codificantes del ARN viral. Adems de informacin bsica sobre el ciclo
de multiplicacin de estos virus, los resultados obtenidos estn siendo empleados para
Tesis Doctorales la identificacin de dianas antivirales y determinantes de atenuacin viral, as como para
el desarrollo de nuevas estrategias vacunales. Como parte de estos estudios se est ca-
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racterizando la capacidad del cido valproico para inhibir la multiplicacin de diferentes
virus con envoltura, recientemente identificada.
Parte de este trabajo ha sido desarrollado en las instalaciones BSL3 del CISA-INIA.

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Figura 1. Partculas del VFA (rojo) entrando en Figura 2. Colocalizacin en clulas IBRS-2 de
Patentes clulas IBRS-2 (porcinas). En azul se resaltan VEVC (azul), transferrina (verde) y tubulina (rojo).
los ncleos.
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Francisco Sobrino
Exit Personal Cientfico:

Margarita Siz Estudiantes:
Susan Realgen
Postdoctoral: Abraham Arrizon
Maria Flora Rosas Maria Rodolis
Lnea Investigacin Jackob Zimmermann
Ral Postigo Tcnicos de Investigacin:
Personal Miguel ngel Martn Mnica Gonzlez
Mara Teresa Snchez
Publicaciones Miguel Rodrguez Cientfico Visitante:
Yuri A. Vieira Beln Borrego (CISA-INIA)
ngela Vzquez
Patentes Flavia Caridi
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Rodrguez-Pulido, M., Sobrino, F., Borrego, B., Siz, M. (2009) RNA. Attenuated foot-and-mouth disease virus
RNA carrying a deletion in the 3 non-coding region can elicit immunity in swine J. Virol.. 83, 3475-3485.
Exit Martn-Acebes, M.A., Gonzlez-Magaldi, M., Vzquez-Calvo, A., Armas-Portela, R. and Sobrino, F. (2009)
Internalization of swine vesicular disease virus into cultured cells: a comparative study with foot-and-mouth
disease virus. J. Virol. 83, 4216-4266
Sanchez-Aparicio, M.T., Rosas,M-F., Ferraz, R.M., Delgui, L., Veloso, J.J., Blanco, E, Villaverde, A. and
Sobrino, F. (2009) Discriminating foot-and-mouth disease virus-infected and vaccinated animals by use of
-galactosidase allosteric biosensors. Clin. Vaccine Immunol.16, 1228-1235
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Martn-Acebes, MA., Rincn, V., Armas-Portela, R., Mateu, M.G. and Sobrino, F. (2010). A single amino acid
substitution in the capsid of foot-and-mouth disease virus can increase acid-lability and confer resistance
Personal to acid-dependent uncoating inhibition. J. Virol. 84, 2902-2912
Rodrguez-Pulido, M., Sobrino, F., Borrego, B. and Siz, M. (2010). RNA immunization can protect mice
Publicaciones against foot-and-mouth disease virus. Antiviral Res. 85, 556558.
Martn-Acebes, M.A., Herrera, M., Domingo, E. and Sobrino, F. (2010). Cell density-dependent expression
Patentes of viral antigens during persistence of foot-and-mouth disease virus in cell culture. Virology 403, 4755.
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Construccin peptdica dendrimrica para la prevencin de la fiebre aftosa en anima-
les Inventores: C. Cubillo, E. Blanco, J. Brcena, F. Sobrino y D. Andreu. N de solici-
tud: P 200602142. Fecha de prioridad: 2-08-2006. Solicitud PCT (08/2007) N PCT ES
Exit 2007/070146.
Uso del cido valproico como antiviral contra virus con envoltura. A. Vazquez, F. Sobrino,
M.A. Martn y J.C. Siz. No Solicitud: P 200602142 (29 marzo 2010).
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Home Tesis Doctorales
Miguel ngel Martn Acebes (2009). Mecanismos de entrada y de organizacin del

complejo de replicacin del virus de la fiebre aftosa: estudio comparativo con el virus de
Exit la enfermedad vesicular del cerdo y el virus de la estomatitis vesicular. Universidad Aut-
noma de Madrid. Co-dirigida por F. Sobrino y R. Armas.
Miguel Ramn Rodrguez Pulido. Julio 2009. Estructura y funcin de la regin 3 no co-
dificante del virus de la fiebre aftosa. Aplicacin a nuevas estrategias vacunales basadas
Lnea Investigacin en RNA. Universidad Autnoma de Madrid. Director: M. Siz.
Ral Postigo Fernndez. Octubre 2009. Anlisis funcional de la protena 3A del virus de
Personal la fiebre aftosa. Universidad Autnoma de Madrid. Co-dirigida por F. Sobrino y M.F. Rosas.
Publicaciones Mara Teresa Snchez Aparicio. Abril 2010. Estudio de protenas no estructurales del
virus de la fiebre aftosa: anlisis funcionales y aplicacin al diagnstico viral. Co-dirigida
por F. Sobrino y M.F. Rosas. Universidad Autnoma de Madrid.
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