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PLEGAMIENTO DE PROTENAS

Algo que caracteriza un sistema vivo es la habilidad de ensamblar con una gran
precisin todos y cada uno de sus componentes moleculares. Descubrir el
mecanismo por el cual se lleva a cabo cada uno de estos procesos es el gran
desafo de la ciencia.
El plegamiento de las protenas hasta llegar a su conformacin en tercera
dimensin es un ejemplo fundamental y universal del auto ensamble biolgico,
variedad de estructuras altamente especficas que resultan del plegamiento de las
protenas y sus grupos funcionales son clave en el complejo sistema de la vida,
y desarrollan una variedad asombrosa de procesos qumicos conocidos que
permiten la adaptabilidad y la seleccin. La falla en el plegado puede dar origen a
una gran variedad de condiciones patolgicas. El plegado correcto de las
protenas requiere de asumir una conformacin especfica de una constelacin de
posibles estructuras, siendo todas las dems incorrectas. La falla de los
polipptidos para adoptar la estructura propia es la mayor amenaza para las
funciones celulares y su viabilidad. La primera lnea de defensa contra el plegado
incorrecto son las chaperonas moleculares, las cuales se asocian con la formacin
de los polipptidos, ya que ellas emergen de los ribosomas, promueven el plegado
correcto y previenen las interacciones perjudiciales.

Que es el plegamiento de las protenas


La protena nativa casi siempre corresponde a una estructura que es
termodinmicamente estable bajo condiciones fisiolgicas. Sin embargo el nmero
total de posibles combinaciones de una cadena polipeptdica es muy grande, una
bsqueda sistemtica para una estructura en partcula seria larga y difcil. Sin
embrago busca la manera de poder conformar la protena, si la energa superficial
es la adecuada, nicamente un pequeo nmero de todas las posibles
combinaciones darn origen a la estructura nativa de una protena. La forma final
es codificada por la secuencia de aminocidos y la seleccin natural que permite
evolucionar y ser capaces de plegarse rpida y eficientemente. El mecanismo
fundamental del plegamiento proteico involucra la interaccin del menor nmero
de residuos para formar un ncleo de plegado alrededor del cual se condensaran
todas las dems estructuras rpidamente, que implica el menor gasto de energa.
Mientras la topologa correcta central no se pliegue el resto de las interacciones no

se llevaran a cabo y la protena no alcanzara su estructura globular estable. Este


mecanismo por lo tanto acta tambin como un proceso de control de calidad por
el cual los plegados equvocos pueden eludirse. La estructura secundaria, las
hlices y las bandas se localizan en protenas nativas, se estabilizan por puentes
de hidrogeno entre los grupos carboxilo y amino de la cadena. En la cintica del
plegamiento intervienen una gran variedad de factores, entre los ms destacados
encontramos al ph, a la temperatura, fuerzas inicas. En el plegado de las
protenas unas molculas denominadas chaperoninas juegan un papel esencial en
la asistencia del plegamiento. En el caso de las protenas citosolicas el sistema de
chaperoninas consiste en dos anillos heptamericos los cuales forman una
estructura cilndrica con dos cavidades .Otro de los aspectos a considerar en el
plegamiento de las protenas es el hecho de que siempre adoptara la estructura
que consuma menos energa en su formacin.

Chaperonas moleculares
Algunas chaperonas interactan con las cadenas recin formadas que emergen
de los ribosomas. En tanto que otras guan en las etapas posteriores del plegado.
Las chaperonas moleculares frecuentemente trabajan en conjunto asegurando
que los diferentes estadios en el plegado de cada sistema sea completamente
eficiente. Muchos de los detalles del funcionamiento de las chaperonas
moleculares han sido determinados en estudios realizados in Vitro. Hoy en da se
sabe que tanto el correcto plegamiento de las protenas como su adecuado
ensamblaje en complejos requieren el concurso de unas protenas especializadas,
conocidas como chaperonas, debido a que su papel es vigilar y eventualmente
corregir el plegamiento. Estas protenas estn presentes en todos los seres vivos.
Las chaperonas tales como la trimetilamina N oxidasa tienen un papel activo en el
plegamiento de las protenas, esta enzima de manera especfica permite el
plegamiento correcto de la PrPc ( Protena prionica celular), la carencia de dicha
chaperona propicia la formacin de la PrPsc ( Protena prionica scrapie ) al
permitir la formacin de bandas beta. 0

PLEGAMIENTO PROTEICO
A medida que la cadena polipeptdica va siendo sintetizada se produce el
plegamiento de la cadena naciente. Si se calculan la cantidad de formas que
podra adquirir una protena en el espacio, esta estar determinada por la cantidad
de aminocidos que presentes. Cada protena adopta una conformacin nica
que denominaremos estado nativo, siendo sta la forma de plegamiento ms
estable de la molcula. Para evitar un anormal plegamiento, la clula consta de
dos procesos fundamentales. Uno de ellos se realiza a nivel molecular, mediante
el cual la protena se pliega a travs de una va que solo favorece unos pocos
pasos intermedios. El otro consiste en un sistema celular que detecta e impide
esta condicin anmala.
De qu depende para que una protena pueda adquirir su forma nativa, la clave se
encuentra en la secuencia de aminocidos que componen la cadena polipeptdica.
Este descubrimiento fue realizado gracias al estudio del plegamiento y
desplegamiento in vitro de las protenas. sabemos que ciertos factores rompen los
enlaces no covalentes que estabilizan la conformacin nativa de la
protena.algunos de ellos son el calor, los extremos de pH y ciertos agentes
qumicos figuran dentro de estos factores a este proceso donde se altera la
conformacin compacta y la actividad de la protena se le llama desnaturalizacin
proteica. La mayora de las protenas desnaturalizadas precipitan cuando se
encuentran en solucin, debido a que sus grupos hidrfobos interactan con
regiones similares de otras molculas no plegadas, formando as un agregado
insoluble. La desnaturalizacin no es un proceso irreversible sino que
generalmente es posible renaturalizar la protena mediante la eliminacin de los
elementos desnaturalizantes. Para este propsito se realiza la dilisis, en donde
vuelven a formarse todos los enlaces disulfuro, los puentes de Hidrgeno y todos
aquellos enlaces no polares que estabilizan la conformacin nativa.

El plegamiento proteico es acompaado por


verdaderas chaperonas
Un plegamiento errtico de las protenas correspondera a un gasto innecesario de
energa y, como sabemos, muchos de los procesos celulares tienen su base en el
ahorro energtico. Las chaperonas se caracterizan por tener representantes en
todos los compartimentos celulares, en los cuales se unen a una amplia gama de

protenas, formando parte del mecanismo general que determina su plegamiento.


Podemos establecer dos tipos distintos de chaperonas: Las chaperonas
moleculares y las chaperoninas . Las primeras se encargan de estabilizar a
aquellas protenas que no estn plegadas, impidiendo as su degradacin. Las
segundas facilitan el plegamiento de las cadenas polipeptdicas. El accionar de las
chaperonas demanda un gasto energtico, gasto que es cubierto mediante la
degradacin del ATP.

Muerte programada de las Protenas


Las clulas son capaces de degradar selectivamente cualquier complejo proteico
mal ensamblado mediante un elaborado conjunto de protenas que permite
dirigirlas especficamente hacia la maquinaria que realizar la protelisis. Una de
las funciones que posee dicha protelisis es, el reconocer y eliminar aquellas
protenas que se encuentren daadas o mal plegadas. La mayora de las
protenas que son degradadas a nivel citoplasmtico son liberadas a grandes
complejos proteicos denominados proteosomas. Cada proteosoma consiste en un
cilindro central formado por mltiples proteasas, cuyos centros activos formaran
una cmara central. Se cree que los tapones proteicos seran los encargados de
seleccionar a las protenas que debern ser destruidas, unindose a ellas e
introducindolas en la cmara del cilindro. Las protenas que sean blanco de esta
verdadera mquina, sern degradadas hasta pequeos pptidos que se
eliminarn hacia el exterior. los proteosomas actan sobre aquellas protenas que
han sido marcadas mediante la adicin covalente de una pequea protena, la
ubiquitina . Este pequeo polipptido est presente en todos los tipos celulares,
libre o unida covalentemente a otras protenas. La unin de la ubiquitina a las
protenas se realiza mediante enzimas especficas, quienes la aaden a un
residuo del aminocido lisina, y posteriormente aaden series de ubiquitinas
adicionales, formando una cadena multiubiquitina , la cual es reconocida por un
receptor proteico especfico del proteosoma. Las protenas mal plegadas,
desnaturalizadas, con residuos oxidados o anormales, son reconocidas y
degradadas por el complejo dependiente de la ubiquitina. Las enzimas que
aaden este pptido reconoceran ciertas seales proteicas que denotan su
anormalidad.

Ciertas enfermedades podran ser causadas por


protenas mal plegadas
Las protenas podran adoptar concurrentemente formas distantes a la
conformacin nativa, por lo cual se producira la prdida de la funcin biolgica y
su posterior marcado para ser degradada. La acumulacin de los fragmentos
resultantes de la protelisis contribuye a ciertas enfermedades degenerativas
caracterizadas por la presencia de placas proteicas insolubles en rganos tales
como el hgado y el cerebro. La enfermedad de Alzheimer es un ejemplo de lo
antedicho, pues se caracteriza por la presencia de placas y ovillos a nivel
cerebral.

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