Leccin 3 GENOMAS VRICOS

1.

Tipos y peculiaridades de los genomas vricos

Bases inusuales

Extremos cohesivos

Redundancia o repeticin terminal

Permutacin terminal

Repeticiones invertidas

Circularizacin mediada por protenas

ADN circular

Genomas segmentados

Peculiaridades del genomio de los Herpes virus

Organizacin del genomio de algunos Virus de ARN 1C (-)

Solapamiento de genes

Transcripcin inversa

2.

Taxonoma de los virus

3.

Clasificacin de Baltimore

EJEMPLOS DE VIRUS*
Desnudos

1c lineal (+) Microviridae

2c circular

Papillomaviridae

2c lineal

Adenoviridae

Con
envoltura

2c circular

Hepadnaviridae

2c lineal

Herpesviridae

Desnudos

1c lineal (+) Inoviridae

Con
envoltura

2c circular

Baculoviridae

Desnudos

2c lineal

Myoviridae

Con
envoltura

2c lineal

Poxviridae

Icosadricos

ADN

Helicoidales

Complejos

Los dibujos o fotografas de los ejemplos de virus no estn a escala

EJEMPLOS DE VIRUS*
Desnudos

2c segmentado Reoviridae
1c lineal (+)

Picornaviridae

Icosadricos
Con
envoltura

ARN

1c lineal (+) Flaviviridae

1c lineal (2 copias) Retroviridae
1c lineal (+) Tobamovirus

Desnudos

1c lineal (+) Crinivirus

segmentado
1c lineal (+) Coronaviridae

Helicoidales
Con
envoltura

1c lineal (-)

Rhabdoviridae

1c lineal (-) Orthomyxoviridae

segmentado

Los dibujos o fotografas de los ejemplos de virus no estn a escala

Tipos y peculiaridades de los cidos nucleicos

encontrados en los virus
1.

BASES INUSUALES

Ej. fago PBS1

OH-CH3 U

Ej. fago SP8

Virologa

OH-CH3 C

Ej. fago T4

2.

EXTREMOS COHESIVOS
ADN

Circularizacin del cormosoma de .

Los extremos cohesivos del cormosoma de est formado por
12 bases de cadena simple que sobresalen en cada uno de los
extremos de la molcula lineal de ADN. Estos extremos se
unen espontneamente y enzimas de la bacteria une las
cadenas produciendo una molcula de ADN circular de doble
cadena.

GGGC
CG
GGCG
ACCT
GCCC
CG
CGCC
GCTG
GC
GA

3.

Fago

REDUNDANCIA TERMINAL EN EL FAGO T4

A B C D E F G H I A B
A B C D E F G H I A B

Demostracin de la redundancia terminal

A B C D E F G H I A B

A B C D E F G H I

A B C D E F G H I A B

C D E F G H I A B

Exonucleasa III

C
BC D
A
E
I H
F
G

A
I
H

Ligacin

E
Virologa

4.

PERMUTACIN CIRCULAR EN EL FAGO T4

Mapa gentico del fago T4

Demostracin de la permutacin circular de los genes

en el fago T4
Desnaturalizacin
A B C D E F G H I A B
del ADN
A B C D E F G H I A B
C D E F G H I A B C D
C D E F G H I A B C D
E F G H I A B C D E F
E F G H I A B C D E F

Apareamiento
de las
cadenas
A B C D E F G H I A B
E F G H I A B C D E F
C D E F G H I A B C D
A B C D E F G H I A B
E F G H I A B C D E F
Virologa

C D E F G H I A B C D

5.

REPETICIONES INVERTIDAS

Deteccin de terminaciones repetidas e invertidas mediante la formacin de crculos de ADN1c

(Ejemplo: Adenovirus)

A B CD

D C B A

A B C D

D C B A

Desnaturalizacin del
ADN

D C B A

C D
B
A

A B
C D
D C
B A

Apareamiento de las
cadenas simples

DCBA
DCBA

6.

Crculo de ADN1c

GENOMAS SEGMENTADOS (VIRUS DE ARN)

Familia vrica

Constitucin
y polaridad
del genoma

Transcriptasa
en los
viriones

Infecciosidad
del ARN

ARN2C
Reoviridae
10-12 segmentos

ARN1C ( - )
Ortomyxoviridae
8 segmentos
Bunyaviridae
3 segmentos
Arenaviridae
2 segmentos

ARN1C ( + )
Bromoviridae
3 segmentos en
3 partculas vricas

Virologa
Virologa

7.

PECULIARIDADES DEL GENOMIO DE LOS HERPESVIRUS

(ejemplo: virus herpes simplex, HSV)

(a)

UL

US
IRL

TRL
kpb 0

50

100

UL

(b)

TRS

IRS

152
US

(a) El genoma de los herpesvirus

consiste en dos secciones unidas
covalentemente:
secciones UL y US, cada una de
ellas unidas a repeticiones
invertidas.

(b) Esta organizacin permite la

formacin de 4 formas ismeras
distintas del genomio.

Demostracin de la organizacin de las secuencias repetidas

ADN2C
Desnaturalizacin
del ADN
ADN1C
Apareamiento de la cadena
simple: Estructura tipo A

Apareamiento de la cadena
simple: Estructura tipo B

ABCDE

EDCBA BAFGH

HGFAB

ABCDE

EDCBA BAFGH

HGFAB

Deteccin de las secuencias invertidas y repetidas en el ADN del virus herpes simplex (HSV)
tipo 1. La secuencia AB aparece en los extremos de ambas secuencias

Virologa

8.

ORGANIZACIN DEL GENOMA DE ALGUNOS

VIRUS DE ARN1C ( - )

Gn Phlebovirus y Tospovirus (Bunyaviridae):

3 segmentos
5

Fam. Arenaviridae:

M 5,7 kb

S 0,9 kb

2 segmentos

L 5,7kb

9.

L 8,5 kb

S 2,8kb

Solapamiento de genes

Genomio del fago MS2 (ARN1C), 3,5 kb

Protena A Cpsida

Replicasa

Lisis

Genomio del fago X174 (ADN1C), 5,386 kb

Virologa

10. TRADUCCIN INVERSA

Dogma central de la Biologa Molecular
Replicacin

Traduccin
(Sntesis de protenas)

ARNm
ADN

Ribosoma
Transcripcin
(Sntesis de ARN)
Protena
ADN
ADN

ARN
ARN

Protena
Protena

 RETROVIRUS

Howard Temin

David Baltimore

Transcriptasa inversa
ARN
ADN

CICLO DE MULTIPLICACIN DEL VIH

Virus de
Inmunodeficiencia
humana (VIH)

Virologa

 HEPADNAVIRUS (vertebrados)
 CAULIMOVIRUS (plantas)

Virus de la Hepatitis B

Taxonoma de los virus

The International Committee on Taxonomy of Viruses
(http://www.ncbi.nlm.nib.gov/ICTVdb/)
1.
2.
3.
4.

Este comit agrupa a los virus teniendo en cuenta los siguientes criterios:
La naturaleza del genoma viral
N de cadenas del genoma viral
Algunos virus realizan transcripcin inversa
Polaridad del genoma vrico
De esta forma se crean 7 grupos de virus y un total de 56 familias y 233 gneros
Orden (-virales)
Familia (-viridae)
Subfamilia (-virinae)
Gnero (-virus)
Especie
Ej. Caudovirales
Herpesviridae
Alphaherpesvirinae
Simplexvirus
Human herpesvirus 1

Virologa

http://www.virustaxonomyonline.com
Como ejemplo de esta taxonoma de virus, a continuacin se muestran slo los nombres de algunos virus que se
mencionan en este curso

rden

Familia/Subfamilia

Gnero

Especie-tipo

Hospedador

Virus de ADN
1. Virus de ADN 2c
CAUDOVIRALES
Myoviridae
Siphoviridae
Podoviridae
Poxviridae
Chordopoxvirinae
Herpesviridae
Alphaherpesvirinae
Betaherpesvirinae
Gammaherpesvirinae
Adenoviridae
Polyomaviridae

T4-like viruses
-like viruses
T7-like viruses

Enterobacteria phage T4
Enterobacteria phage
Enterobacteria phage T7

Bacteria
Bacteria
Bacteria

Orthopoxvirus

Vaccinia virus

Vertebrados

Simplexvirus
Varicellovirus
Cytomegalovirus
Lymphocryptovirus
Mastadenovirus
Polyomavirus

Human herpesvirus 1
Human herpesvirus 3
Human herpesvirus 5
Human herpesvirus 4
Human adenovirus C
Simian virus 40

Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados

Inovirus
Microvirus

Enterobacteria phage M13

Enterobacteria phage X174

2. Virus de ADN 1C
Inoviridae
Microviridae
Parvoviridae
Parvovirinae

Parvovirus

Mice minute virus

Bacteria
Bacteria
Vertebrados

3. Virus de ARN y ADN con transcriptasa inversa

Hepadnaviridae
Retroviridae

Orthohepadnavirus
Alpharetrovirus
Lentivirus

Hepatitis B virus
Avian leukosis virus
Human immunodeficiency virus 1

Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados

Virus de ARN

4. Virus de ARN 2c
Reoviridae

Orthoreovirus

Mammalian orthoreovirus

Vertebrados
Virologa

rden

Familia/Subfamilia

Gnero

Especie-tipo

Hospedador

5. Virus de ARN 1C(-)

MONONEGAVIRALES
Filoviridae
Paramyxoviridae
Paramyxovirinae

Orthomyxoviridae
Arenaviridae

Marburg-like viruses Marburg virus

Ebola-like-viruses
Zaire Ebola virus
Respirovirus
Morbillivirus
Rubulavirus
Influenzavirus A
Influenzavirus B
Arenavirus

Vertebrados
Vertebrados

Sendai Virus
Vertebrados
Measles Virus (Sarampin) Vertebrados
Mumps virus (Paperas)
Vertebrados
Influenza A virus
Vertebrados
Influenza B virus
Vertebrados
Lymphocytic choriomeningitis virus Vertb.

6. Virus de ARN 1C(+)

Leviviridae
Picornaviridae

Comoviridae
NIDOVIRALES
Coronaviridae
Flaviviridae
Togaviridae

Levivirus
Enterovirus
Rhinovirus
Aphtovirus
Comovirus

Coronavirus
Flavivirus
Hepacivirus
Rubivirus
Tobamovirus

Enterobacteria phage MS2

Bacteria
Poliovirus
Vertebrados
Human rhinovirus A
Vertebrados
Foot-and-mouth disease virus Vertebr.
Cowpea mosaic virus
Plantas

Infectious bronchitis virus

Yellow fever virus
Hepatitis C virus
Rubella virus
Tobacco mosaic virus

Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados
Vertebrados
Plantas

7. Viroides

Virologa

CLASIFICACIN DE BALTIMORE
Clasificacin de los virus basada en el modo de replicacin de los genes y su expresin. En
ella el ARNm juega un papel central, de modo que cada grupo de virus sigue el mismo
camino para la sntesis del ARNm

Clase I: ADN 2c

Genoma
ADN

ADN

ARNm +
Clase II: ADN 1c

Protenas

Ej. Adenoviridae
Herpesviridae
Poxviridae
ADN -

ADN

Genoma
ADN +

ADN +

ARNm +

Protenas

Ej. Microviridae

Clase III: ARN 2c

Genoma
ARN

ARNm +

Protenas

ARN

Ej. Reoviridae

Clase IVa: ARN 1c(+)

Poliprotena
Genoma
(ARN +)
ARN -

Virologa
Ej. Picornaviridae

Clase IVb: ARN 1c(+)

Protenas

Genoma
(ARN +)

Ej. Togaviridae
ARN -

Clase V: ARN 1c(-)

EnzV
ARN +

Protenas

Genoma
(ARN -)
ARN +

Ej. Orthomyxoviridae
Paramyxoviridae

ARN -

Clase VI: ARN 1c(+)/ADN

EnzV
Protenas
Genoma
(ARN +)

ADN -

ADN

ARN +

Ej. Retroviridae
Clase VII: ADN 2c / ADN

Protenas

Genoma
(ADN )

ADN
ARN +
Virologa

ADN -

ADN

Ej Hepadnaviridae