Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
SONDAS GENICAS
COMERCIALES
INTEGRANTE:
CLAUDIA INGRID WILLIS
SAMAME
2015 EMBRIOLOGA
pg. 1
FACULTAD DE MEDICINA
CONTENIDO
INTRODUCCIN................................................................................................... 3
OBJETIVOS:......................................................................................................... 4
MARCO TEORICO:................................................................................................ 5
SONDAS GNICAS............................................................................................ 5
1.1.-
Definicin.......................................................................................... 5
1.2.-
Tipos de sondas................................................................................ 5
1.3.-
1.4.-
Preparacin de la sonda....................................................................7
pg. 2
FACULTAD DE MEDICINA
INTRODUCCIN
Una sonda es un reactivo biolgico constituido por un fragmento de ADN que posee una
secuencia de bases complementaria a la del genoma de un microorganismo.
Las sondas gnicas son molculas de ADN sealadas con un marcador que tienen el
poder de reconocer genes en los cromosomas y establecer si dichos genes son normales
o portadores de alteraciones.
Entre las principales ventajas de las sondas genticas hay que destacar la sencillez de su
manipulacin, que permite su adaptacin a cualquier laboratorio. El principal
inconveniente es su coste. Es una tecnologa muy utilizada en la actualidad en
laboratorios nivel II
Una de sus aplicaciones ms extendida consiste en el establecimiento de diagnsticos
prenatales, que son realizados sobre muestras de clulas fetales. El anlisis gentico del
feto permite establecer si el nio que va a nacer es portador o no de un gen defectuoso o
deletreo.
Por lo tanto, desde el punto de vista tico, el diagnstico prenatal es aceptable y vlido si
respeta la vida e integridad del embrin y del feto humano, y siempre que de su estudio
vayan a derivarse beneficios para su curacin o conservacin. El diagnstico prenatal
debe tener como fin la curacin y no una sentencia de muerte que, irremediablemente,
conduzca al aborto del feto. El portador de una malformacin congnita no pierde por esto
las prerrogativas propias de un ser humano, a quien debe tributrsele el respeto a que
tiene derecho todo paciente.
El diagnstico mediante el empleo de sondas gnicas puede utilizarse tambin despus
del nacimiento, por ejemplo, para precisar la naturaleza y amplitud de una alteracin
gentica; o para el caso de parejas procedentes de familias "de riesgo" en particular para
las mujeres que deseen saber si son "portadoras " de un determinado precursor de
enfermedad (Gros 1993).
pg. 3
FACULTAD DE MEDICINA
OBJETIVOS:
Determinar que es una sonda y cuntos y cules son los tipos que existen.
pg. 4
FACULTAD DE MEDICINA
MARCO TEORICO:
1. SONDAS GNICAS
1.1. Definicin
Bioqumicamente una sonda es una molcula de ADN o ARN homologa a una
secuencia de ARN o ADN diana, con la que hbrida de forma estable y especifica (por
asociacin de bases complementarias).
La sonda es una copia fiel de un gen o de un fragmento de ARN o ADN y se unir
exclusivamente esa secuencia de la que es copia. Esto es lo que se llama especificidad
de la sonda.
Una vez que la sonda se une a la secuencia diana se detecta y cuantifica. La
deteccin solo es posible si la sonda se ha marcado con un grupo detectable.
Dependiendo del nmero de estos grupos incorporados y de la seal que emitan la sonda
puede tener diferente sensibilidad.
pg. 5
FACULTAD DE MEDICINA
pg. 6
FACULTAD DE MEDICINA
pg. 7
FACULTAD DE MEDICINA
que una sonda adems de homloga, debe ser lo suficientemente amplia para
llevar a cabo la hibridacin.
2. Para sondas pequeas (oligonucletidos de 20-30 pb) es muy probable que algn
gen distinto al de inters tenga una secuencia idntica.
Alternativamente se puede hacer un screening y ste puede ser realizado por
bsqueda de secuencias en bases de datos.
3. Los mRNA poseen las secuencias poli(T) y poli(U), al transcribirse a cDNA se evita
que la sonda no incluya esta cola, porque secuencias largas, ricas en GC dan una
gran estabilidad a la sonda por los triples enlaces que se forman entre estas
bases.
Se necesitan dos elecciones ms para la preparacin de la sonda: el tipo de
cidos nucleicos y la marca que se incorpora en la sonda. Algunos mtodos alternativos
estn disponibles para la sntesis de la sonda.
1.4.2. Eleccin de la sonda:
Las sondas largas de cadena simple (RNA o DNA) proporcionan una alta
sensibilidad en la deteccin de cadena sencilla. Los oligonucletidos son muy sensibles y
la seal puede ser incrementada por el uso de un cocktail de sondas que flanquearn en
regiones distintas.
Para estudios de mRNAs estrechamente relacionados, las sondas especficas,
pueden ser obtenidas por sntesis de oligonucletidos. Se disean primers que sern
usados para la amplificacin del fragmento deseado de DNA en el PCR. Estos fragmentos
pueden ser clonados y usados para sintetizar cadenas dobles o sencillas de DNA o RNA.
Alternativamente, para el caso de sondas de RNA, pueden ser marcadas
directamente sin clonacin incluyendo el primer marcado en el sitio de iniciacin de la
RNA polimerasa. Finalmente las sondas de DNA de doble cadena son recomendadas
para blancos de doble cadena y esto puede ser suficientemente sensible para detectar
abundancia de cadena sencilla.
1.4.3. Tamao de la sonda:
Las sondas largas pueden emitir una seal ms fuerte debido a que incorporan
mayor nmero de nucletidos marcados dentro de ella. Sin embargo, las sondas que son
tan largas dan seales dbiles, debido a que la sonda penetra menos eficientemente en el
tejido. La mejor estrategia es usar una secuencia larga como templado para la sntesis de
pg. 8
FACULTAD DE MEDICINA
la sonda pero asegurar que la sonda generada es lo suficientemente pequea para poder
penetrar. Muchos procedimientos estn basados en que la sonda de 50-150 bases porque
emiten seales ptimas para la hibridacin en secciones de ciertos tejidos. Se ha
encontrado que las sondas de RNA que miden por arriba de 1 kb proveen seales
ptimas para la hibridacin in situ, en embriones fijados en para formaldhedo. La
penetracin est influenciada por el tamao de la sonda aunque tambin depende de la
naturaleza del tejido, de la forma de fijacin y si el pre tratamiento ha sido realizado para
remover las protenas celulares.
El tamao de la sonda puede ser controlado durante la reaccin de sntesis:
a. Sondas de DNA, sintetizadas por nick translation, el largo est determinado por
la cantidad de DNasa en la reaccin.
b. Sondas marcadas por random priming el tamao est determinado por la
concentracin del primer.
c. Primers que puedan ser elegidos para deteminar el tamao de la sonda sintetizada
por PCR.
d. Sondas largas de DNA pueden ser cortadas parcialmente por incubacin a altas
temperaturas.
e. Sondas largas de RNA son parcialmente cortadas por hidrlisis alcalina limitada. Si
el tamao de la sonda es cortada por hidrlisis hay que revisar el tamao de la
sonda, porque si sta es muy pequea, sta no hibridar bajo condiciones
selectivas standard, dando una baja seal.
1.4.4. Estabilidad de la sonda y la interaccin con su blanco:
En experimentos de hibridacin los puentes entra la sonda y la secuencia blanco
juega un rol importante. El largo decrementa la estabilidad en el siguiente orden RNARNA, DNA-RNA, DNA-DNA. La estabilidad de los hbridos est influenciada por las
condiciones de hibridacin, por la concentracin de formamida, sales y la temperatura.
1.4.5. Sondas de doble cadena contra cadena sencilla:
Un nmero de reacciones competentes ocurren durante la hibridacin in situ con
sondas de doble cadena. Las sondas de cadena sencilla proveen las siguientes ventajas:
a. La sonda no se agota porque no se autoliga.
b. No son cadenas largas porque deben penetrar en la seccin de tejido o en los
cromosomas.
pg. 9
FACULTAD DE MEDICINA
Las ventajas de estas tcnicas son que nos permiten investigar directamente al
microorganismo, sin necesidad de que se encuentre viable, ni de que est en cultivo puro.
Hoy en da se utiliza para identificar microorganismos no cultivables, de lento crecimiento
o difcil y de identificacin compleja. Es posible utilizarlo en cualquier tiempo de muestra
biolgica y permite la identificacin de genes no expresados fenotpicamente. Son
tcnicas muy vlidas, pues el ADN es muy estable.
pg. 10
FACULTAD DE MEDICINA
2. TECNOLOGAS GENTICAS
Los cientficos han desarrollado una serie de tcnicas bioqumicas y genticas mediante
las cuales el ADN puede ser separado y transferido de una clula a otra. Algunos de esos
mtodos de laboratorio ayudan a los investigadores a estudiar las propiedades de los
genes en la naturaleza (permiten, por ejemplo, comparar los ADN de diferentes animales
para establecer distancias evolutivas).
Otras tcnicas de ADN constituyen herramientas bsicas en el campo de la ingeniera
gentica (alteracin de genes de un organismo).
pg. 11
FACULTAD DE MEDICINA
32
fragmento de ADN homlogo del Southern blot, el cual a su vez puede ser detectado
mediante autorradiografa.
pg. 12
FACULTAD DE MEDICINA
mayor de los virus que causan infecciones importantes en la comunidad, han hecho
posible que en el momento se disponga de fragmentos de ADN del material genmico
especfico y altamente conservado de un determinado virus que se utiliza como sonda.
Las sondas preparadas a partir del ADN o ARN especfico se pueden purificar por
clonacin o copia en un plsmido del ADN o del ADNc (complementario) obtenido
de transcripciones de ARN. Utilizando el plsmido como vector y bacterias como
huspedes, es posible producir sondas genticas en grandes cantidades.
pg. 13
FACULTAD DE MEDICINA
Altamente sensitivos.
Eptopos: son cada uno de los sitios discretos de una macromolcula que son
reconocidos individualmente por un anticuerpo especfico o por un TCR especfico.
Anticuerpos: La R.C. son ms comunes para los anticuerpos policlonales que para los
anticuerpos monoclonales.
Todos los organismos vivientes poseen ADN excepto los virus q poseen ARN.
pg. 14
FACULTAD DE MEDICINA
La Hibridacin del ADN por una sonda de ADN se llama tcnica de Southern Blot.
Las sondas gnicas permiten encontrar un determinado trozo de ADN de unas
pocas bases pares en una cadena de 6 x 109 bases pares. y ello lo consigue
gracias al marcaje con P32
pg. 15
FACULTAD DE MEDICINA
pg. 16
FACULTAD DE MEDICINA
pg. 17
FACULTAD DE MEDICINA
El PGH nos acerca a un nuevo tipo de prctica clnica, la que se ha dado en llamar
Medicina Genmica y Predictiva.
Sondeo prenatal
Amniocentsis
Objetivo: informacin a las parejas sobre la situacin del feto, actual o futura.
Obviamente, el horizonte es el del recurso al aborto en el caso de "malformacin"
o posibilidad de enfermedad grave futura.
pg. 18
FACULTAD DE MEDICINA
CONCLUSIONES
Las sondas son molculas de ADN o ARN homologas a una secuencia de ARN
pg. 19
FACULTAD DE MEDICINA
BIBLIOGRAFA
[Acceso
12
de
Abril
del
2014].
Disponible
en:
http://www.ibt.unam.mx/computo/pdfs/met/hibridacion_in_situ.pdf
pg. 20
FACULTAD DE MEDICINA
pg. 21
FACULTAD DE MEDICINA