BIOQUIMICA I

Medicina

Transaminasas

Industria Qumica Transformacin de Alimentos

Penicilina Fermentaciones Quesos Vinos

Agricultura

Rhyzobium

Definicin de enzima

Son protenas que aceleran las reacciones sin sufrir modificaciones en el curso de la reaccin

Propiedades de las enzimas

Eficientes Fisiolgicas Especficas Regulables

Enzimas con especificidad de sustrato y reaccin

Enzima

Sustrato (ligando)

Complementariedad

Zonas de unin de enzimas

Puentes de hidrgeno

Unin inica

Interaccin hidrofbica

Ejemplo citocromo c que tiene numerosas cargas negativas, enlaces covalente momentneo

Estereoespecificidad
La estereoqumica de reactivos condiciona la estereoqumica de los productos La tripsina actan sobre los L-aminocidos mientras que los D- permanecen sin cambios frente a ella. Las enzimas que actan sobre la glucosa solo aceptan a la D-glucosa. Sirve para separar reacciones que se producen simultneamente en una clula (eleccin de pareja de unin exigentes)

La especificidad de reaccin es la especial transformacin que realizan sobre el sustrato. Las reacciones con catalizadores qumicos normales industriales tienen efectos no deseados productos no deseados a diferencia de la catlisis enzimtica se obtiene 100 % del producto deseado. Los catalizadores qumicos la regulacin es menos eficaz que en las enzimas biolgicas

El centro activo
Ejemplo el grupo hidroxilo de la serina. El grupo carboxilo del aspartato.

El centro activo

Es el lugar de unin de un sustrato a una enzima

Tiene a.a con grupos funcionales qumicamente activos

La cadena aliftica como valina e isoleucina Son relativamente inertes (portadores de la reacccin)

Ejemplo de centro activo

Las cadenas laterales de aspartato, histidina y serina forman el conjunto el centro activo de las proteasas es una triada cataltica.

Parte del equipo del centro activo

Coenzimas: se unen a la enzima por ejemplo a la catalasa que usa como coenzima al hemo. Se introducen a travs de la alimentacin como las vitaminas del complejo B. Las coenzimas sufren transformacin en el curso de la reaccin enzimtica. Receptan o donan protones. Transfieren grupos funcionales

Coenzimas
Si solo se unen temporalmente y se regeneran en otros lugares se constituyen en cosustratos. Si la coenzima se une y recorre una serie de reacciones de manera permanente constituye el grupo prosttico que es la parte no protenica.

Cuando a la enzima se le une el hierro por ejemplo hablamos de una metaloenzima. Los metales son importantes en la conformacin de los cofactores y se explica su necesidad en los elementos traza.

S: PM 250, 0.8 nm

Cofactor
E: PM 100000, 7 nm
Inorgnico: Fe2+, Mn2+, Zn2+,etc.

Orgnico: Coenzimas NAD, FAD, CoASH. Grupo Prosttico

Enzimas que requieren elementos inorgnicos

Citocromo oxidasa Catalasa, peroxidasa
Citocromo oxidasa DNA polimerasa Anhdrasa carbnica Alcohol deshidrogensa Hexoquinasa Glucosa 6-fosfatasa Arginasa Piruvato quinasa Ureasa Nitrato reductasa

Fe2+, Fe+,
Cu2+ Zn2+ Mg2+ Mn2+ K+, Mg2+ Ni2+ Mo2+

Coenzimas: Actan como transportadores eventuales de tomos especficos o de grupos funcionales Coenzimas Entidad transferida Pirofosfato de tiamina . Aldehdos
Dinucletido de flavina y adenina. tomos de hidrgeno
Dinucletido de nicotinamida y de adenina

Ion hidruro (H-) Coenzima A . Grupos acilo

Fosfato de Piridoxal . Grupos amino

5-Desoxicobalamina (Coenzima B12) tomos de H y grupos

alquilo

Biocitina . CO2
Tetrahidrofolato . Otros grupos monocarbonados

Coenzimas

Adenosine Triphosphate (ATP)

Coenzyme A (CoA)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD+)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate (NADP+)

Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)

VITAMINAS
C (cido ascrbico) B1 (tiamina) B2 (riboflavina) B3 (cido pantotnico)

FUNCIONES
Coenzima de algunas peptidasas. Interviene en la sntesis de colgeno Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que transfieren grupos aldehdos Constituyente de los coenzimas FAD y FMN Constituyente de la CoA Constituyente de las coenzimas NAD y NADP Interviene en las reacciones de transferencia de grupos aminos.

Enfermedades carenciales
Escorbuto

Beriberi Dermatitis y lesiones en las mucosas Fatiga y trastornos del sueo

B5 (niacina)
B6 (piridoxina)

Pelagra
Depresin, anemia Anemia perniciosa Fatiga, dermatitis

Coenzima B12 Coenzima en en la la transferencia transferencia de de grupos grupos (cobalamina) metilo. metilo. Coenzima de las enzimas que Biotina transfieren grupos carboxilo, en metabolismo de aminocidos.

Clases de Enzimas:
1. Oxidorreductasas

2. Transferasas
3. Hidrolasas

4. Liasas
5. Isomerasas

6. Ligasas

Enzimas:
No.

Clase

Tipo de reaccin que catalizan

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas De xido reduccin (transferencia de e-)

Reduccin: ganancia de electrones (hidrgeno o prdida de oxgeno) Oxidacin: prdida de electrones (hidrgeno o ganancia de oxgeno). La Oxidacin y la Reduccin son reacciones acopladas (REDOX)

1. Oxido-reductasas ( Reacciones de oxido-reduccin).

Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Kinasas Transaminasas

2. Transferasas

(Transferencia de grupos funcionales)

grupos aldehdos gupos acilos grupos glucosilos grupos fosfatos (kinasas)

Succinato Deshidrogenasa Citocromo c oxidasa.

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Hidrolasas

Hidrlisis, con transferencia Pirofosfatasa de grupos funcionales del Tripsina agua Aldolasa

3. Hidrolasas (Reacciones de hidrlisis)

Transforman polmeros en monmeros. Actan sobre: enlace ster

enlace glucosdico enlace peptdico enlace C-N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa

Oxidorreductasas

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua

Liasas

Lisis de un substrato, (Sintasas) generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un Descarboxilasa doble enlace de un 2o. pirvica substrato

4. Liasas (Adicin a los dobles enlaces)

Entre C y C Entre C y O Entre C y N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica

Oxidorreductasas

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa)

Liasas

Isomerasas

Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras

Mutasas Epimerasas Racemasas

5. Isomerasas (Reacciones de isomerizacin)

Enzimas:
No.
1

Clase
Oxidorreductasas

Tipo de reaccin que catalizan

De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa)

Liasas

Isomerasas

Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras

Mutasas Epimerasas Racemasas Sintetasas

Ligasas

Formacin de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N. Mediante reacciones de condensacin, acopladas a la ruptura del ATP

6. Ligasas (Formacin de enlaces, con aporte de ATP)

Entre C y O Entre C y S Entre C y N Entre C y C

Reacciones endergnicas y exergnicas

Una reaccin endergnica es una reaccin qumica que necesita o utiliza energa.
Fotosntesis.

Una reaccin que libera energa se conoce como una reaccin exergnica.
Respiracin celular.

Energa de activacin

Muchas reacciones exergnicas necesitan calor (energa) para comenzar.

Ej.: Combustin de madera.

Esta energa se conoce como energa de activacin.

La cantidad de energa de activacin

es, generalmente, mucho menor que la energa que libera la reaccin.

Las clulas realizan reacciones exergnicas?

Cmo lo hacen sin sufrir daos?

Catalizadores
Las clulas poseen compuestos qumicos que controlan las reacciones que ocurren en su interior. La sustancia que controla la velocidad a la que ocurre una reaccin qumica sin que la clula sufra dao alguno ni se destruya se conoce como un catalizador. Las enzimas son protenas que actan como catalizadores.

Enzimas

Hacen posibles las reacciones, disminuyendo la cantidad de energa de activacin que se necesita. Controlan la velocidad a la que ocurre la reaccin. Permiten que las reacciones ocurran a unas temperaturas que no hagan dao al organismo.

Estado de transicin

Este se encuentra entre el sustrato y el producto de la reaccin.

El estado de transicin o estado activado

Cuando la reaccin iniciada de A (sustrato) debe superar un mximo de energa libre para transformarse en la molcula B (producto)

La barrera energtica que se debe vencer la diferencia entre la energa libre del sustrato y la energa libre del estado de transicin se denomina Energa libre de activacin AG.