CAPITULO 25 Biosntesis de los aminocidos no esenciales.

Los aminocidos no esenciales se definen como aquellos que pueden ser sintetizados por el hombre y por la ruta albina. Tienen rutas relativamente cortas Acido glutmico, glutamina y prolina. a) Glutamato consiste en la aminacin del -oxo glutarato por la accin de la L-glutamato-deshidrogenasa + NAD o NADP, en vegetales la enzima es especifica con NADP. NH3 + -oxoglutarato + NADPH +H+ glutamato deshidrogenosa. L- glutamato + NADP + H2O

b) La glutamina se a partir del cido glutmico por la accin de la glutaminasintetasa. NH3 + glutamato + ATP glutamina + ADP + Pi

Esta reaccin es compleja e implica dos o mas etapas inmediatas, el r- glutamil fosfato funciona como intermediario ligado a la enzima. A+ P+ Acido glutmico r- guamil fosfato + NH3 ADP + (r-glutamil-fosfato) glutamina + Pi

FORMULA

O O

OH P OH

O H2N HO O

glutamil- fosfato

La reaccin de la glutamina sintetasa participa tambin en la conversin del NH3 libre en los grupos - amino de los aminocidos , puesto que puede cooperar con la reaccin catalizada por la glutamato sintasa,convirtiendo al aminocido libre en el grupo -amino del glutamato. Glutamato + ATP+ NH3 Glutamina + ADP + Pi 2 Glutamato + NADPH+

Glutamina + - oxoglutarato + NADPH + H+ glutamato sintasa c)

La prolina se sintetiza a partir del acido glutamico semialdehido del acido glutamico+ ADP+

1 acidos glutamico + ATP + NADPH Pi+ NAD+ 2 Semialdehido del acido glutamico 3 Acido pirrolin 5 carboxilico + NADPH

Acido pirrolin 5 carboxilico + H2O PROLINA + NADPH +

FORMULA

H2N

O H2N OH

H3C

ATP + NADH

O HO O

ACIDO GLUTAMICO

O N OH

H2O

ACIDO 5'CRBOXILICO

PIRROLIN

O N OH

H N

O OH

NADP

NADP

PROLINA

Los restos de hidroxiprolina que esta en el colgeno se forman de restos de prolina ligados a la protena por la accin de la prolina L- mono oxigenasa que actua sobre los restos prolinicos. La oxigenasa utiliza - oxoglutarato como correductor.

Resto de Prolina + O2 + - oxoglutarato+ Co A FE++ Resto de 4 hidroxiprolina + succinil Co A + Co2 + H2O Biosintesis de ALANINA ACIDOASPARTICO ASPARAGINA

En la mayora de los organismos la alamina 5 el aspartato se forman del piruvato + el oxoloacetato por tranaminacion a partir del L- glutamato GLUTAMATO + PIRUVATO - oxoglutarato + alamina

GLUATAMATO + OXIALO CETATO

- oxoglutarato + aspartato

El acido asprtico es el percursor directo de la asparagina, mediante una reaccin catalizada por la asparagina sintetasa lo cual es anloga en su mecanismo a la glutamina - sintetasa

NH3 + Aspartato + ATP

Asparagina + ADP + Pi

Otra alternativa en algunos organismos, donde el grupo almitico de la glutamine se transfiere al grupo B carboxilo del acido aspartico gracias a la accion de la asparagine sintetasa (hidrolizante de la glutamine)

ATP + glutamina +aspartato

glutamato + asparagina + AMP + Pi

TIROSINA

Se forma a partir del aminoesencial fenilalanina en una reaccin de hirolizacion catalizada por la fenilalanina y mono oxgenosa, la cual, participa en la degradacin de la fenilalanina. la oxigenasa requiere NADPH como correductor y hidrobiopterina como cofactor.

Fenilalanina + NADPH + H+ + O2

tirosina + NADPH + H2O

SERINA Y GLICINA

La L-serina que funciona como precursor de la glicina y de la cistena se forma a partir del 3 fosfoglicerato, el 3 fosfo-D-glicerato es oxidado por la fosfogliceratodeshidrogenasa a expensas del NAD rindiendo 3 fosfohidroxipiruvato. La transaminacion con el glutamato produce 3 fosfoserina que rinde L-serina libre por la accin hidrolitica de la fosforesina-fosfatasa.

FORMULA

OH O
-

HO

NAD

HO

P HO

O O O OH

O OH

ACIDO GLICERATO

3-FOSFO-D

ACIDO FOSFOHIDROXI-PIRUVATO

+
NADH
HO P O HO O HO O O HO O O

HO

GLUTAMATO

HO

NH2

3-FOSFOSERINA
HO NH2 HO P O O O

+
a-OXOGLUTARATO

+
HO

H2O

HO

SERINA+Pi
H2N O HO

Por una ruta alternativa que condice la serina , el hidroxipiruvato procedente del oglicertao experimenta su transaminacion con la glucina a la alanina y rinde ferina y glioxilato o piruvato.

Hodrixipiruvato + glicina

serina + glioxilato

Hodrixipiruvato + glicina

serina + piruvato

La glicina se forma a partir del CO2 y del NH3 por la accin de la glicina-sintetasa

CO2+NH3+N5,N10 mentilentetrahidrofolato + NADH + H+ tetrahidrofolato + NAD

glicina +

La glicina tambin se puede formar a partir de la L- serina por accin de la serinahidroximetil-trinsferaa cataliza la tranferancia del atomo de Carbono de la serina al tetrahidrofolato y produce N5 N10 metilentetrahidrofolato

L-serina + tetrahidrofolato

glicina + N5 N10 metilentetrahidrofolato

CISTEINA

Es un aminocido no esencial, pero en los mamferos se forma a partir de la metionina que es esencial, y de la serina que no lo es. En esta ruta, el atomo de azufre de la metionina es transferido pasando a sustituir al atomo de oxigeno del hidroxilo de la serina. A este proceso se le llama TRANSULFURACION. L-METIONINA + ATP = S-ADENOSILMETIONINA + PPi + Pi

En la etapa 2 la homocisteina reacciona con la serina produciendo cistationina gracias a la accin cataltica de la cistationina - sintasa

FORMULA HOMOSISTEINA + SERINA CISTEINA

En la etapa final, la cistationina-r-liasa, dependiente del fosfato de piridoxol, cataliza la escisin de la cistationina liberando cistena con formacin secundaria de -oxobiturato y NH3

FORMULA

CISTATIONINA

A-OXOBUTIRATO + NH3 + CISTEINA

Reaccion global dela sntesis de la cistena

Metionina+ ATP+ aceptor grupo metlico+ H2O+serina cisteina + aceptor metalico+ adenosina+ el ATP pierde sus grupos fosfato para la adenosina libre PPi + Pi

En M.O la cistena se forma a partir de la serina catalizada por la cistena-sintasa

L-serina + SH2

L-cisteina+ H2O

Fuentes de azufre de la cistena ( SO4-2 ,S2O3-2, SH2) O- ACETILSERINA+ ACETIL CoA O-ACETILSERINA + CoA

Varias plantas y M.O. reducen enziamticamente el sulfato a teosrifito SH2, para convertir en el grupo tiol de la cistena.

FORMULA.
H2N O H3C S OH O

ATP + H2O

OH

+
METIONINA

Pi + PPi

ADENINA
O

CH3

HO

OH

5-ADENOCIL-METIONINA

O H2N

5-ADENOCIL-METIONINA

ACEPTOR METILO

DE

GRUPOS

OH

S O

HO

OH

S-ADENOSIL-HOMOCISTEINA NH2 SH

HO S-ADENOSIL-HOMOCISTEINA

H2O

HOMOCISTEINA
O

+
ADENOSINA

ADENOCINA

H2N

HOMOSISTEINA + O
NH2

OH

H2O

SERINA

OH S H2N

H2O

L-SISTATININA
HO O SH

L-SISTATIONINA + H2O

+ a-OXOBUTIRATO

H2N OH

CISTEINA

Biosintesis de los aminocidos esenciales TREONINA Y METIONINA Las dos tienen un denominador comn, sus esqueletos tetracarbonados proceden de la homoserina, anlogo de 4 carbonos de la serina que proviene del acido asprtico. La ruta P/reducir el gupo - carboxilo del acido asprtico a aldheido se parece a la reaccin 3 fosfogliceroil-fosfato a gliceraldehido 3 fosfato, catalizada por la gliceraildehido 3 fosfato deshidrogenasa.

RUTA DE LA SINTESIS DE LA TREONINA A PARTIR DEL ACIDO ASPARTICO

FORMULA
O H2N OH HO O O H2N O

ATP

OH

OH H2N

OH

+
ATP
OH O P O OH H2O H2N OH O

HO

ACIDO-HOMOSE RIN FOSFATO

ADP
O O

OH P O

+
ADP
OH

H2N

B-ASPARTIL-FOSFATO
O H2N OH

OH H3C

+
NADP + Pi TREONINA

METIONINA

Una ruta alterna que conduce a treonina la proporciona la serina-hidroximetaltransferasa ACETALDEHIDO + GLICINA L- treonina

La conversin de la homoserina en metionina se inicia con la formacin enzimtica de O-succinil-homoserina. FORMULA

OH

S NH2 CH4 O OH

HOMOSERINA
HO

H2N OH HN PH2

CISTATIONINA

+
SUCCINIL CoA
O

+
H2O H2N O OH HS O

HOMOCISTEINA

+ +
CoA PIRUVATO

+
O OH HO H2N CH3 HN

N5-METIL-FH4

METIONINA + FH4 O-SUCCINIL-HOMOSERINA

+
CISTEINA

O O OH H2N

OTRAS OPCIONES: Betaina + homocisteina dimetil glicina + metionina

Dimetiltetina + homocisteina LISINA (2 rutas) ( bacterias y hongos)

5-metiltioglicolato + L-metionina

1 la ruta del acido diaminopimelico. (bacterias) Aspartato+ ATP Aspartilfosfato+ ADP

Aspartato quinasa

Aspartilfosfato+ NADP

aspartato semialdehido+ NAD+ Pi Acido 2,3 dehidrodipicolinico

Aspartato semialdehido+ piruvato Dehidrodipicolinato-sintasa

Acido 2,3 degidropicolinico+NADPH

piperidein 2,6 decarboxilico+ NADP

Piperidein 2,6 decarboxilato deshidrogenosa

Piperidein 2,6 decarboxilico+ succinil Co A L-pimelico

acido N succinil-2-amino-6-oxo-

Acido N succinil-2-amino-6-oxo-L-pimelico+Glutanato L, 2, 6 diaminopimelico+ -oxoglutaratp

Acido N-succinil L,

Acido N-succinil L, L, 2,6 diaminopimelico+ glutamato diaminopimelico+ succinato Succinil diaminopimelico desuccinotasa

Acido L, L , E-

Acido-meso--E-diaminopimelico

lisina + Co2

1 Aspartato + ATP 2 Aspartilfosfato+ NADH

Aspartilfostfato+ ADP aspartato semialdehido+NAD+Pi

3 Aspartato semialdehido+piruvato

FORMULA

HO N O OH

NADPH HO N O OH O

acido 2,3 dihidrodipicolinico

PIPERIDEIN2,6 DICARBOXILATO
CoA O

PIPERIN 2,6 DICARBOXILATO

Acido N-succinil2-amino 6-oxo-l- pimelico

O OH O H2N OH O OH

succinil-C0A

glutamato

NH

acido n-succinil diaminopimelico

H2N O H2N

l-l

2,6

O OH

acido n-succinil diaminopimelico

L-L

2,6

OH

acido L-L E-diaminopimelico

succinato

acido L-L E-diaminopimelico

acido meso diaminopimelico

a,B

NH2

O OH H2N

lisina

Ruta del aminoadipico (hongos)

FORMULA
O

acido oxaloglutarico
OH

acido oxaloadipico
O O OH O OH

co2

acido oxaloadipico +

glutamato

+
O OH

oxoglutarato

acido a-aminoadipico
O

+ ATP + NADPH + NADP + Pi + ADP

NH2

O HO

SEMIALDEHIDO a-AMINOADIPICO

semialdehido a-aminoadipico

glutamato + NADP
NH

O OH

O OH

HO O

NH2

NADP + H2O

sucaropina

NH2

SUCAROPINA sucaropina

NADP

a-OXOGLUTARATO NADPH

O OH

NH2

VALINA-ISOLEUCINA-LEUCINA Estos aminocidos pose en grupos ramificados alifticos R y R sintetizan por rutas similares. Las que conducen a la valina sin catalizador por el mismo conjunto de enzimas. RUTAS DE LA VALINA Y LA ISOLEUCINA FORMULA

CH3

ACIDO PIRUBICO

PIRUVATO

+
O H3C

CO 2

OH

ACIDO a-ACETOLACTICO
H3C

ACIDO a-ACETOLACTICO+ NADPH

CH3

+ NADP
O

HO

HO

OH

ACIDO a,B DIHIDROXI-ISOVALERIANO

ACIDO a,B-ISOVALERIANO
H3C

CH3

O OH

ACIDO a-OXOISOVALERIANO
O

+ GLUTAMATO
H3C

H3C

NH2 OH

VALINA

ISOLEUCINA A PARTIR DE LA TREONINA

FORMULA
TREONINA
H3C

+
O HO O

NH3

ACIDO a-OXOBUTIRICO
H3C H3C O

ACIDO a-OXOBUTIRICO + PITUVATO

OH

ACIDO a-CETO a-HIDROXIBUTIRICO OH

NADP
H3C HO OH CH3 OH

ACIDO a-B HIDROXI B-METIL VALERIANO

ACIDO a-OXO-B_METIL VALERIANO CH

3

O H3C O OH CH4 CH 3 O OH H2N

H3C

GLUTAMATO

ISOLEUCINA

+
a-OXOGLUTARATO
O OH CH3 H2N CH3

ACIDO a-OXOISOPROPIONICO

GLUTAMATO

LEUCINA

ORTININA Y ARGININA La ortinina es el precursor de la arginina por el ciclo de Krebs, la arginina es tan rpidamente escendida por la arginasa para producir urea y ornitina, que su disponibilidad resulta insuficiente para la sntesis de protenas. La ornitina se forma a partir del acido glutamico por 2 rutas generales.

FORMULA
ACIDO L- GLUTAMICO

ACETIL CoA

ACIDO N-ACETIL GLUTAMICO HO NH2 O OH O

ACIDO N-ACETIL GLUTAMICO

ATP
O

O OH NH CH3

P O 3H2 O

N-ACETIL-Y-GLUTAMIL FOSFATO N-ACETIL-Y-GLUTAMIL FOSFATO

NAPH
O O HN
Y-SEMIALDEHIDO NACETIL-GLUTAMICO

OH O CH3

+ NADP + PI

OH

Y-SEMIALDEHIDO N-ACETIL-GLUTAMICO

O NH2

a-N-ACETILORNITINA
O H2N O NH CH3 OH

GLUTAMATO

a-N-ACETILORNITINA+ H2O

O O NH2 NH2

+H3C
OH

L-ORNITINA

ACIDO ACETICO

NH2 O NH2 NH2 O NH2 NH NH

ORNITINA

ARGININA

Otras formas de obtener ornitina Semialdehido glutamato + aspartato Ornitina + axalacetato

La ornitina por esta ruta se convierte en arginina por el ciclo de la urea Ornitina + carbamil fosfato Argininasuccinato citrulina + Pi

arginina + fumarato

BIOSINTESIS DE LOS AMINOACIDOS AROMATICOS Fenilalanina y triptfano

FORMULA sntesis fenilalanina

O O O O HO P OH CH2 OH O OH P O OH O OH

acido eritrosa y fosfato acido fosfoenol piruvato

O O P OH acido desoxi A-arabino-heptulosa -7 fosforico OH O OH O OH O OH OH OH

acido desoxi a-arabino-heptulosa-7fosforico

acido 5' deshidroquinico

+
O OH OH

H2O

acido 3-deshidroquimico
O OH

acido 3-deshidroquimico

NADPH
OH HO O OH OH

NADP

ACIDO D-SIQUIMICO

ACIDO D-SIQUIMICO

ATP
O HO P O OH OH

OH

5 ENOLPIRUVIL-SIQUIMICO 3 FORFATO

HO

5 ENOLPIRUVIL -SIQUIMICO 3 FOSFATO

O OH O OH O

ACIDO CORISMICO
CH2 OH O CH3 OH O HO O

Pi

ACIDO CORISMICO

+ 2+

H O

CO 2

ACIDO PREFENICO ACIDO FENIL PIRUVATO

GLUTAMATO
O H2N OH

FENILALANINA

FENILALANINA+ GLUTAMINA
NH2 HO O

ACIDO ANTRANILICO

ACIDO ANTRANILICO + GLUTAMATO

+PIRUVATO

O NH2 N H

TRIPTOFANO

OH O O O OH O O

NAD

P-HIDROXIFENIL PIRUVATO

P-HIDROXIFENIL + GLUTAMATO PIRUVATO

H2N

OH

TIROSINA
OH

RUTA DEL ANTRANILICO TRIPTOFANO

ACIDO AL

O NH2 HO O

O O O NH

OH

HO FOSFORIBOSILPIROFOSFATO

P HO

ACIDO ANTRANILICO

HO

OH

ACIDO N(5{FOSFORRIBOSIL)ANTR ANILICO

HO HO P O O

OH O

ACIDO N(5'FOSFORRIBOSIL) ANTRANILICO

+
NH OH OH ENOL 1-O-CARBOXIFENIL-AMINO 1-DESOXIRIBOSO-FORFATO

H2O

CO 2

OH ENOL 1-OCARBOXIFENIL-AMINO 1-DESOXIRIBOSO-FOSFATO HO HN P O O

HO

OH

INDOL 3-GLICEROFOSFATO INDOL 3-GLICEROFOSFATO

SERINA

O NH2 N H

+
GLICERALDEHIDO FOSFATO

REGULACION DE LA BIOSINTESIS DE LOS AMINOACIDOS 1.- Inhibiccin alosterica o retroinhibiccion : (inhibiccion por el producto final) inhibiccion Feed-back El primer enzima de esta secuencia el cual es inhibido por el producto final, el enzima se le llama alosterico. ALOSTERICO: significa otro espacio Cuando un enzima alosterico posee solamente un modulador, se dice que es monovalente, cuando responde a 2 se le llama pilivalente. 2.- REPRESION DE LA BIOSINTESIS de uno o varios enzimas de la biosntesis de uno o varios de los enzimas de la ruta, disminuyendo asi su concentracin en la celula.

RETRO CONTROLES (Feed-back)

ERITROSA 4-FOSFATO FOSFOENOL PIRUVATO

II

III

ACIDO DESOXI-HEPTULOSONICO 7-FOSFATO

ACIDO DESHIDROQUINICO

ACIDO SIQUIMICO

ACIDO CORISMICO

ACIDO PREFENICO

ACIDO ANTRANILICO

ACIDO FENIL PIRUVICO FENILALANINA TRIPTOFANO

INHIBICIUN ALOSTERICA MULTIVALENTE

ACIDO GLUTAMICO

ATP + NH3

GLICIN A ALANINA

GLUTAMINA TRIPNOFANO

CARBAMIL FOSFATO

HISTODINA

CTP

AMP

GLUCOSAMINA 6 FOSFATO

Funciones precursoras de los aminocidos Como sillares de construccin de las protenas Como sillares de construccin de las hormonas Como sillares de construccin de las vitaminas Como sillares de construccin de la co- enzimas Como sillares de construccin de los alcaloides Como sillares de construccin de las porfirinas Como sillares de construccin de las antibiticos

Como sillares de construccin de los pigmentos Como sillares de construccin de las sustancias neutransmisoras

De los aminocidos aromticos son precursores de alcaloides: morfina,codena,papaverina. De las hormonas: toroxina,epireluina,acido indolacetico,epinefrina o adrenalina.

BIOSNTESIS DE COMPUESTOS METILADOS El grupo metilo de la metionina es utilizado como precursor para la formacin de un gran nmero de biomoleculas metiladas metionina + ATP S adenosil metionina + PPi + Pi Meteltraufenasa Aceptores metulados: creatina fosfatodil colina, adrenalina, noradrenalina, acidos grasos cclicos ergasterol vitamina B12, N-metilhistamina, nometilnicoxinamida, colina sarcosina, anserina SERINA +TH4 N5, N10 METILEN TETRAHIDROFOLATO + NADH METIONINA

N5 METIL TETRAHIDROFOLATO + HOMOCISTEINA METIONINA + ATP 5 Adenosil- metionina

5 Adenosil metionina + aceptor metilo Fosfatidil colina, adrenalina) PEPTIDOS

aceptores metilados (Creatinina,

Pptidos los aminocidos son precursores biolgicos de varios pptidos, como las hormonas: oxitocina, vasopresina bradequinina El glutatin: tripeptido simple de los tejidos animales.

Formula

GLUTATION

HO

NH2

HN O HS

OH

Glutamina + cistena + ATP + Glutamina + cistena + glicina + ATP

glutamicil eutenia + ADP + Pi glutatin + ADP + Pi

Glutatin (r-l.siutetixa un pptido cclico que contiene lo restos aminocidos llamada antibiotoco Gramicidina

Formula

LEU
O

CH3 CH3 O

PHE

ORN
O NH2 NH2

NH2

NH2

VAL
O

CH3 CH3 NH2 H N O H N

PRO

CH3 O NH2 CH3

PRO

VAL
O NH2 O O NH2 CH3 CH3 NH2 NH2

PHE

ORN

LEU

Serotonina y cido indol actico Seratonina: sustancia neuro humoral y vaso constryctus de los vertebrados y el lado indolacetco hermano del crecimiento de las plantas se forma apartir del triotifeno

Basillus brevis sintetiza un pptido cclico que contiene 10 restos aminocidos llamados antibitico GRAMICIDINA.

Formula
NH2

N H

5 HIDROXITRIPTAMINA

HO

O OH NH2 N H H2N

5 HIDROXI TRIPTOFANO

NH

OH O

TRIPTOFANO

O OH O N H

ACIDO INDOL PIRUVICO

O OH

NH

ACIDO INDOL ACETICO

Epinefrina y norepinefrina

Segregadas por la medula adrenal funcionen fucologicamenteen la regulacin del ritmo cardiaco y de la presin sangunea

La epinefrina es un activador de la degradacin del glucgeno en el hgado y musculo Estas hormonas se forman a partir de la TIROSINA La histamina es un vaso dilatador y es segregado por mastocitos de los pulmones, del hgado y la mucosa gstrica, que se forma por descarboxilacion de la histadina

HISTADINA + H2O

HISTAMINA + CO2

histadina descarboxilasa

TIROSINA

NORADRENALINA

O NH2 OH

TIROSINA

HO NH2 HO HO O

DIHIDROXIFENILALANINA

HO

NH2

HO

DOPAMINA

HO NH2 HO OH

NORADRENALINA

OH HO

ADRENALINA
NH OH CH3

POLIAMINAS (ESPERMINA Y ESPERMIDINA) Son factores de crecimiento P(ciertos M,O. y sirven para estabilizar las estructuras de las membranas bacterianas asi como las estructuras de los ribosomas de virus y del ADN de muchos organismos Se forma a partir de la putnecina y 5_ adenosil metconina En mamferos la putnecina se obtiene descarboxilando la ornitina Ornitina H2N- CH2- CH2- CH2-NH2 + CO2 putrecina

ornitina descarboxilasa Arginina En E. Coli Arginina

NH2

H2N- CH2- CH2- CH2-NH + CO2

NH2 H2N

NH2

agmantina

agmantina + H2O

H2N NH2

UREA

PUTRESINA

Mecanismo en limatico de la fijacin del nitrgeno N2 + 6 H+ + 6e- + 12 ATP + 12 H2O 2NH3 + 12 ADP + 12 Pi

La enzima nitrigenasa est regulada por presin gentica si las clulas disponen ampliamente de NH3 detienen su produccin de enzima as la fijacin de nitrgeno tiene lugar solamente cuando el producto de su actuacin sea necesario.

CAPITULO 19 METABOLISMO DE NUCLEOTIDOS Son bases de purina y pirimidina (Nucleotidos de purina y de pirimidina) Ejemplos ATP, como sustrato AMP cclico como reguladores Nucleotidos: son sustratos para la biosntesis de ADN y RNA para la conversin de algunas vitaminas B a sus formas de coenzima. LAS PRIMERAS INVESTIGACIONES DE LA BIOSINTESIS DE LAS PURINAS INCLUYERON MARLADO ISOTOPO. El acido {urico fue la primera purina en ser descubierta en 1776, presente en la orina humana y en las piedras de la vejiga. Aos mas tarde se observo que la mayor parte de Nitrogeno ingerido por las gallinas era excfretado como acido {urico. Se ha observado que en pajaros, reptiles, el producto final del metabolismo del nitrgeno es acido urico, anlogo a la urea en el metabolismo de los mamferos. En 1936 Krebs comprob que la via que produce los nucletidos de purina, la incorporacin de aminocido en acido urico se hace en dos etapas. 1.- El amoniacxo es incorporado en hipoxantina en el hgado, la hipoxantina es oxidada en el rion a acido urico en una reaccin catalizada por la xantina oxidaza . Formula Para seguir una ruta metabolica utilizaron trazadores u isotopos estables como 13 C, 15N, tambin se utilizo 14C radioactivo. Compuestos sencillos como 13CO2, H13COO(formato) y H3N-CH2-13COO, (glicina), ser
administraron a palomas y ratas. Despues aislaron y degradaron qumicamente el acido urico excretado detectando el 15N Y 13C, marcados.

Observaron que el C del 13CO2 era incorporado en C-6 y el carbono del formato en C-2 y C-8 de las purinas . Por ultimo se demostr qu las fuentes de los atomos del anillo son N1 del aspartato.; C-2 y C-8 formato por medio del 10-formil tetra hidrofolato, N-3 y N-9 de los grupos amino de la glutamina se C-4, C-5 y N-7 de la glicina y C-6 del CO2. Formula Las fuentes de los atomos de los anillos en las purinas sintetizadas de Nous. Notece qwue el atomo del C de la molecula de la glicina son incorporados en las posiciones 4, 5 y 7 de las purinas. Los atomos de nitrgeno amidicos de dos molculas de glutamina proporcionan los N-3 y N-9, C-6 probiene del CO2. El aspartato contribuye con su nitrgeno N-amino a la posicin 1, C-2 y C-8 se originan del formato mpor la via del 10-formiltetrahidrofolato. SE REQUIERE FOSFORIBOSIL PIROFOSFATO(PRPP) PARA LA BIOSINTESIS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS. G. Roberto Greemberg demostr que la estructura del anillo de purina de la hipoxantina no es sintetizado como una base libre sino como una sustituyente de la ribosa fosfato. El producto final de la via Biosintetica no es hipoxantina sino su 5-ribonucleotido, inosina 5-monofosfato( IMP o Inocinato) Formula La hipoxantina detectada en el hgado de aves por Krebs, se formo por la accin de las enzimas de degradacin que catalizan la remosion de los grupos azucares y fosfato de los ribonucleotidos. La via del Novo de la sisntetis de la purina comprende una serie de intermedios azcar con esqueletos imcompletos de purina formados. La fuente de las ribosas fosfato para la biosntesis de la purina se identifico como 5fosforribosil-1 pirofosfato (PRPP). PRPP se sintetiza a partir de la ribosa 5-Fosfato + ATP catalizada por PRPP sintetasa. PRPP dona su ribosa 5-fosfato para que sirva como fundamento sobre el cual se construir la estructura de la purina. Tambien PRPP reacciona como una pirimidina para formar nucletidos PRPP se utiliza en las vas de economa y en la biosisntesisde Histidina y triptfano. Formula PRPP sintetasa cataliza la transferencia de un grupo pirofosforilo del ATP al grupo 1hidroxilo de la ribosa 5-fosfato. EL SISTEMA ANULAR DE LA PURINA IMP ES ENSAMBLADO EN 10 PASOS

IMP= Inosina 5 Fosfato o Inocinato. Formulas.

ANALOGOS DE LA GLUTAMINA (Azaserina, y 6-diazo-5-oxo-norleucina) Formulas ANTIBIOTICOS Los antibiticos que contienen diazo actan como reactivos marcadores por afinidad fijndose inicialmente al sitio de fijacin de la glutamina de la amidotransferaza que catyaliza la etapa 4 de la biosntesis de la purina. La inactivacin cmprende la alquilacin de un reciduo nucleofilico de cistena al sitio activo Formula La sntesis del novo de IMP consume energa. El ATP es convertido en AMP durante la sntesis del PRPP. 19.4 AMP Y GMP SE SINTETIZAN A PARTIR DE IMP ( INOSINA 5-MONOFOSFATO) IMP se puede convertir en cualquiera de las dos purinas nucletidos importantes. AMP o GMP se requieren dos reacciones enzimticas para cada conversin . Formulas 19.5 LAS MOLECULAS DE PURINAS QUE PROBIENEN DE LA RUPTURA DE LOS NUCLEOTIDOS PUEDEN SER RECUPERADAS. Durante el metabolismo celular y durante el proceso digestivo de los animales los acidos nucleicos son degradados a mononucleotidos, nucleosidos y eventualmente a bases heterocclicas. En esrtas reacciones catalticas intervienen ribonucleasas, desoxirribonucleasas y nucletidos y nucleosidos. Las purinas se degradan en acido urico y purina ribonucleotidos. Formulas 19.6 LA VIA DEL NOVO PARA LA SISNTESIS DE PIRIMIDINA PRODUCE UMP La via biosintetica del Novo para los pirimidina nucletidos es mas sencilla que la via para las purinas y requiere de un consumo menor de ATP.

Existen tres precursores metablicos del anillo de la Pirimidina. Bicarbonato, el cual contribuye con el C-2 , el grupo amida de la glutamina (N-3) y el aspartato el cual contribuye con los atomos restantes. Formulas 19.-7 DOS PROTEINAS MULTIFUNCIONALES PARTICIPAN EN BIOSINTESIS DE PIRIMIDINA EN LOS MAMIFEROS. Dihidroorotato : Proteina multifuncional del citosol Uridin Monofosfato (UMP) sintasa 19.8 EL CTP SE SINTETIZA A PARTIR DE UMP El UMP es convertido a CTP en tres etapas UMP + ATP -------UDP + ADP UMP-cinasa ADP + ATP --------UTP + ADP Nucleosido difosfato cinasa UTP + GLUTAMINA + ATP + H2O -------CTP + GLUTAMATO + ADP +Pi FORMULAS 19.9 LOS DESOXIRIBONUCLEOTIDOS SE SINTETIZAN POR REDUCCION DE LOS RIBONUCLEOTIDOS Los dos desoxiribonucleotidos cuya funcin principal es servir como trifosfato sustrato para la DNA polimerasa. Se sintetizan por medio de una reduccin enzimtica de los ribonucleotidos, en los Microorganismos esta reduccin de efectua a nivel de los nucleosidodifosfatos. Se demostr que los cuatro ribonucleosidos difosfato( ADP,GDP,CDP y UDP) son sustratos de una sola ribonucleosido difosfato reductasa. En microorganismos (Lactobasillus, clostridium, Rhizobium) los ribonucleosidos trifosfato son los sustratos para la reduccin de una reductasa que depende de una cobalamina, ambas enzimas se conocen como ribonucleotido- reductasa. (Ribonucleotido difosfato reductasa y ribonucleotido trifosfato reductasa) El NADPH proporciona la energa de reduccin para la sisntesis de los desoxiribonucleosidos de fosfato. Un grupo disulfuro en el sitio activo de la ribonucleotido reductasa es reducido a dos grupos tiol (-SH), Los cuales a su ves reducen el C-2 de la parte de la ribosa del sustrato nucleotidico.

Formulas Una ves formados los dADP , dGDP y dCDP ( d= desoxirribonucleotidos) son fosforilados a nivel de trifosfato por la accin de nucleosido difosfato cinasa. El dUDP es convertido a dTMP por via de dUMP . La regulacin es de acuerdo al sitio activo o al de especificidad, entonces la fijacin de ATP activa la reductasa La unin de dATP inhibe toda actividad enzimtica. Cuando el ATP esta fijo al sitio de actividad y ATP o dATP se fija en el sitio de especifisidad la reductasa se convierte en pirimidina especifica y cataliza la reduccin de CDP y UDP. La fijacin de dTTP al sitio de especificidad activa la reduccin de GDP y la fijacin de dGTP activa la reduccin de ADP. 19.10 UNA REACCION UNICA DE METILACION PRODUCE dTMP A PARTIR DE dUMP. El timidilato (dTMP) que se requiere para la sistesis de DNA se forma a partir de UMP en cuatro etapas. 1.- UMP se fosforila a UDP, el cual se reduce a dUDP, y el dUDP es desfosforilado a dUMP el cual entonces puede ser metilado. UMP -----UDP-------dUDP--------dUMP------dTMP La conversin de dUDP a dUMP se puede efectuar por dos rutas. a) dUDP puede reaccionar con ADP en presencia de una nucleosida monofosfato cinasa para formar dUMP + ATP dUDP + ADP------dUMP + ATP dUDP tambin se puede fosforilar a dUTP a espenzas del ATP por accin de la Enzima nucleosido difosfato cinasa. dUTP es hidrolizado a dUMP + PPi por la desoxiuridina trifosfato difososfohidrolasa (dUTPasa) dUDP+ATP----dUTP + ADP dUTP + H2O----dUMP + PPi La hidrolisis rpida de dUTP evita que accidentalmente sea incorporado en DNA en lugar de dTTP. dCMP es fuente de dUMP via hidrolisis catalizada por dCMP desaminada. dCMP + H2O -----dUMP + NH4 SINTESIS DE TIMIDILATO (dTMP) A PARTIR DE (dUMP)

Formulas El dTMP tambin se puede sintetizar por via de una economa de timidina (desoxitimidina), la cual es catalizada por la timidina cinasa dependiente de ATP TIMIDINA + ATP -------- dTMP + ADP Timidina cinasa 19.11.- LOS NUCLEOTIDOS Y SUS CONSTITUYENTES SON INTERCONVERTIDOS Existen diversas reacciones de intyerconversion de nucletidos de nucletidos y de suis consntituyentes. Los nucleosdidos tambin son degradados a sus constituyentes utilizxzando bases purinicas de su degradacin . 19.12LA DEGRADACION DE PURINAS EN ACIDO URICO (EN PRIMATES, AVES Y REPTILES) Las purinas y pirimidinas libres algunas son catabolizadas. Estas molculas son originadas por un exceso de nucletidos ingeridos o por el recambio intracelular (sntesis y degradacin continua) de los acidos nucleoicos. En primates, aves y reptiles y humano los purina nucletidos son convertidos en acido urico, el cual es excretado. Alguinos organismos degradan el acido urico en tre subproductos La gota es una enfermedad de los humanos causada por lsa sobreproduccin o la excrecin inadecuada de acido urico, cuando su nconcentracion es eleveda en sangre, puede cristalizar en rion, cartlago y los tejidos blandos (Rion,) en los dedos de los pies y articulaciones. Causas: Deficiencia parcial en la actividad de la hipoxantina-guanina-fosforibosiltransferasa, queda como resultado un ahorro menor de las purinas y mayor produccin catablica de acido urico. Se trata con aloprinol un ismero posicional (-7, N-8 de la hipoxantina) Formula VIAS PARA LA DEGRADACION DE AMP Y GMP A ACIDO URICO FORMULAS 19.13 LA MAYORIA DE LOS ORGSANISMOS DEGRADAN EL ACIDO URICO

El acido urico se oxida por la urato-oxidasa, catalizando la conversin que dependen del oxigeno O2 degradando o convirtindolo en alantoina, H2O, CO2. La alantoina es el producto principal de la degradacin de los mamferos. La alantoina tambin la excretan las tortugas, insectos y gastropodos. Formulas 19. 14 LAS PIRIMIDINAS SON CATABOLIZADAS A ACETIL CoA Y SUCCINIL-CoA 1.- Primera etapa las pirimidinas (CMP, UMP,dTMP,) son degradadas a uracilo y timina. Formulas Catabolismo del uracilo y timina a B-aminoisobiturato el cual es degradado a acetil-CoA y succinil-CoA Formiulas.

CAPITULO 20 Replicacin y reparacin del DNA cap-20

Watson y Crick revelaron ADN en 1953 y el mtodo de replicacin. Dado que 2 cadenas del DNA de hlice doble son complementarias, la secuencia de los nucletidos de una cadena especifica automticamente la secuencia de la otra. Las 2 cadenas de una hlice se desarrollan durante la replicacin del DNA y que cada cadena de DNA acta como una plantilla para la sntesis de una cadena complementaria. En esta forma la replicacin del DNA produce dos replicas hijas de DNA, cada una de ellas contiene una cadena parental y una nueva sntesis. Este mtodo de replicacin se denomina Replicacin semiconserva dora del DNA debido a que una cadena del DNA parentales conserva en cada molcula sintetizada nuevamente del DNA de doble cadena. Imagen

A y B son cadenas de DNA parentales y

A y B son cadenas complementarias sintetizadas A y B sirven de plantilla para sintetizar (A y B) como las cadenas A y B se conservan la replicacin se llama replicacin semi conservadoras DNA. El concepto de una maquina protenica que realiza una serie de reacciones bioqumicas se aplica no solo a la replicacin del DNA, sino tambin a la transcripcin, al procesamiento de RNA y a la traduccin. Adems hay evidencia de que otros procesos del metabolismo celular se llevan a cabo por complejos de enzimas y otras macno molculas asocladas dbilmente. El mantenimiento de la informacin gentica de generacin en generacin requiere que la replicacin del DNA sea rpida. (Debido que el complejo entero de DNA se debe replicar antes de cada divisin celular). Y exacta. Adems de tener enzimas de polimerizacin que son sumamente exactas todas las clulas tienen encimas de reparacin que aseguran en su posicin el DNA daado y corrige errores de replicacin. 20.1 la replicacin cromosmica de DNA. Es bidireccional. El cromosoma de E-coli es una molcula grande, circular de DNA de doble cadena 4.2x103 pares de kilo bases (kb). La replicacin de este cromosoma se inicia en un sitio nico, que se llama el origen de la replicacin y se replica bidireccionalmente hasta que los dos complejos de replicacin se encuentran en un sitio determinacin, en donde se define la replicacin. Imagen

La mquina protenica que lleva a cabo la direccin de polimerizacin se llama RELIPSOMA. EL RELIPSOMA contiene varias protenas diferentes que llevan a cabo varias reacciones que se requieren para que la replicacin del DNA sea rpida y exacta. Un relipsoma est localizado en cada una de las dos horquillas de la replicacin. En E-coli la replicacin es de aproximadamente 1000 pares por segundos. (Cada una de las cadenas se extiende 1000 nucletidos cada segundo). Como has 2 horquillas de replicacin que se mueven a esta velocidad, el cromosoma de E-coli entero se puede replicar en 35 minutos.

Imagen

En E-coli su cromosoma es 4.2x103 kb en mosca Drosophila melanogoster 1.65x105 kb mami mero: 3x106 kb. GENOMA: se refiere a la cantidad de DNA en un conjunto completo de cromosoma. La replicacin es bidireccional mientras el cromosoma tiene un origen nico. (En eucariontes). Los eucariontes tienen sitios mltiples en donde se inicia la sntesis del DNA. La velocidad en procariontes y eucariontes casi es la misma aunque en eucariontes la velocidad es menor. 20.2 LA DNA POLIMERASA CATALIZA LA REACCION DE POLIMERACION EN UNA ORQUILLA DE REPLICASION. - la sntesis de una cadena nueva de DNA se logra por la adicin de nucletidos al extremo 3 de una cadena en crecimiento. Esta actividad de polimeracion es catalizada por encimas conocidas como DNA polimerasas o DNA dirigidas. En clulas de E-coli existen 3 DNA polimerasas designadas cada una por un nmero romano de acuerdo al orden de su descubrimiento. DNA-polimerasa I.- repara el DNA y participa en la sntesis de una de las cadenas de DNA durante la replicacin. DNA-polimerasa II.- participa en la replicacin de DNA. DNA- polimerasa III.- es un componente clave del relipsoma y la principal encima de la replicacin del DNA, el responsable del alargamiento de la cadena durante la replicacin del DNA. La DNA polimerasa III contiene 3 sub unidades La Holo encima que es una forma ms grande y ms activa de la encima est aislada como un dimero que consiste en dos complejos, cada uno compuesto de 10 sub unidades. Cada complejo de 10 subunidades del dimero de la Holo encima es responsable de la sntesis de una de las 2 cadenas hijas de DNA en la horquilla de replicacin. a) El alargamiento de la cadena es una reaccin de transferencia de un grupo nucletido.

La DNA polimerasa III sintetiza el DNA adicionado un nucletido cada vez al extremo 3 de la cadena crecimiento del DNA recin sintetizado. El nucletido sustrato es un desoxinucleotido 5 trifosfato (dntp). El tipo de nucletido adicionado a la cadena en crecimiento se determina por el aparecimiento de bases de Watson y Crick a la cadena que acta como matriz. As ademina (a) se aparece con timina (t) Guanina (g) se aparea con citosina (c) La encima sintetiza DNA catalizando la formacin de un fosforiester entre el dntp entrante y la cadena naciente. Formula
NH N H H O H H NH N H H NH2 O H H3C H N O P O P O
+ +

N OH O

5' DNA
OH O OH HO

O H N N H

O P
+

O N

NH H N N H

NH

O O HO P
+

O O

H3C

HO NH

5' DNA
HO N N

H O H N H N H O NH P
+

HN O

O OH O P
+

O O HN H N N H N N H
+

H HN O N

NH

FOSFODIESTER
OH

b) LA HOLOENCIMA DE LA DNA POLIMERASA III PERMANECE FIJA AL HORQUILLA DE LA REPLICASION DURANTE EL ALARGAMIENTO DE LA CADENA. Una vez que sea iniciado la sntesis de DNA, la encima permanece fija en la horquilla de replicacin en el sitio activo de la encima mientras se adiciona de manera secuencial muchos nucletidos. Las enzimas que permanecen fijas a sus cadenas en crecimiento a travs de muchas etapas de polimerizacin se dice que son posesivas (posesivo es lo opuesto a distributivo) (una encima distributiva se disocia de la cadena de crecimiento despus de la adicin de cada monmero). Debido a que la DNA- polimerasa II como parte del replisoma es altamente posesiva durante la replicacin del DNA, solo se necesita un pequeo nmero de molculas de DNA poli meras III para duplicar el cromosoma de E-coli cada generacin. La procesidad tambin explica la rpida velocidad de la replicacin de DNA. La posesividad de la Holo encima de la DNA poli mera III se debe a varias cosas. a) la actividad de la sub unidad B de la misma encima. b) el hecho de que la DNA polimerasa III sea parte de una maquina protenica mayor en la hornilla de replicacin asegura adems, que la enzima permanezca asociada con las cadenas que van haciendo durante la polimerizacin. c) los errores de polimerizacin se pueden corregir por la lectura de pruebas. La Holo encima de kla DNA polimerasa III es una exonucleasa 3 -5 as como una polimerasa. Esta exonucleasa, cuyo centro de actividad queda dentro de la sub unidad E, puede catalizar la hidrolisis del fosfodiester que enlaza el residuo final con el resto de la cadena de poli nucletidos. La capacidad simultanea de la Holo encima de la DNA polimerasa III para catalizar el alargamiento de la cadena y para actuar como una fosfo esterasa permite a la encima corregir la lectura, o editar, DNA nuevamente sintetizado y enmendar los errores. Cuando la DNA polimerasa III reconoce una distorsin producida por el apareamiento errneamente antes de que contine la polimerizacin -solo los nucletidos apareados incorrectamente son removidos. La exonucleasa no se activa sobre bases apareadas correctamente. -una base equivocada se incorpora cada 105 etapas, de elorgacion. -la velocidad del error es 10-5 - la velocidad de correccin de lectura de la exonucleasa 3-5 tiene una velocidad error de 10-3

- la combinacin de estas dos reacciones secuenciales produce una velocidad general de error para la polimerizacin de 10-8, la cual es una de las velocidades de error ms pequeas de cualquier encima. - a pesar de ello los errores de replicacin son comunes, pero la mayor parte de estos errores pueden repararse por la encima reparadora de DNA. 20.3 LAS DOS CADENAS DE LA HORQUILLA DE REPLICASION SE SINTETIZAN POR SEPARADO POR COMPLEJO DE 10 SUB UNIDADES DEL DIMERO DE LA HOLO ENCIMA DE LA DNA POLIMERASA III. La DNA polimerasa III cataliza el alargamiento de la cadena, exclusivamente en la direccin 5-3. Debido a que las dos cadenas de DNA son anti paralelas, la sntesis 5-3 utilizada una cadena como plantilla, se efecta en la misma direccin que el movimiento de la horquilla, mientras que en la sntesis 5-3 en la otra cadena plantilla se efecta en la direccin opuesta al movimiento de la horquilla. La nueva cadena sintetizada formada por la polimerizacin 5-3 en la direccin opuesta al movimiento de la horquilla de replicacin se llama cadena retardadora. Un complejo del dmero de la Holo encima de la DNA polimerasa III es responsable de la sntesis de la cadena conductora. El otro complejo del dmero de la Holo encima de la DNA polimerasa III es responsable de la sntesis de la cadena retardada. A) LA SINTESIS DE DNA EN LA CADENA RETARDADA ES DISCONTINUA. La cadena conductora se sintetiza en forma continua desde el origen de la replicacin a medida que la horquilla va avanzando. Sin embargo a causa de la matriz para la cadena retardada tiene una orientacin 5-3 en la direccin opuesta al movimiento de la horquilla, esta cadena se sintetiza discontinuamente en cortos pedazos 5-3. Estos trazos individuales de cadena retardada naciente son despus reunidos en un proceso diferente. En una marcacin aparecen molculas grandes de DNA que surgen de la sntesis continua de la cadena conductora y fragmentos o molculas ms pequeas que surgen de la sntesis discontinua de la cadena retardada. Los pedazos de DNA se denominan fragmentos de okazaki B) CADA FRAGMENTO DE OKAZAKI SE INICIA CON UN CEBADOR DE RNA La sntesis discontinua explica cmo se sintetiza la cadena retardada, pero como se inicia la sntesis de cada fragmento de okazaki. Ninguna DNA polimerasa puede iniciar la polimerizacin de nuevo, solo puede adicionar nucletidos o polmeros ya existentes.

La iniciacin de la sntesis de los fragmentos de okazaki se explica por la presencia de abadores de RNA. Fragmentos cortos de RNA sintetizados en la horquilla de replicacin. Cada cebador, el cual es complementario de la plantilla de la cadena retardada, se exticude a partir de su extremo 3 por la DNA polimerasa para formar fragmentos de okazaki Imagen La cadena de cebadores de RNA se caracteriza por una enzima llamada primasa. La primasa es un componente de un complejo ms grande llamado primo soma que contiene al menos 16 poli pptidos. C) LOS FRAGMENTOS DE OKAZAKI SON UNIDOS POR LA ACCION COMBINADADE ADN POLIMERAZA I Y DNA LIGASA. La DNA polimerasa I es capaz de sintetizar DNA utilizando una cadena como plantilla es menos activa que la DNA polimerasa III. La DNA polimerasa I tiene actividad de exonucleasa 5-3. La exonucleasa 5-3 de la DNA polimerasa I cataliza la remocin del cebador de RNA en el sitio de cada fragmento de okazaki a medida que el cebador de RNA se degrada. Este proceso se llama DESPLAZAMIENTO DE LA MELLA. En el desplazamiento de la mella, la DNA polimerasa I reconoce y se fija a la mella. (VACIO) entre el extremo 3 del DNA naciente y el extremo 5 del caballar siguiente. La hexonucleasa 5-3 remueve hidroliticamente al cebador de nucletidos RNA. La polimerasa 5-3 adicionada un desoxinucleotido al extremo 3 de la cadena de DNA. En esta forma, la encima desplaza la mella a lo largo de la cadena retardada. Despus de haber completado 10 o 12 ciclos de hidrolisis y polimerizacin la DNA polimerasa I se disocia del DNA dejando detrs dos cadenas de DNA recin sintetizadas separadas por una mella en el esqueleto de fosfodiciter. La remocin de cebadores RNA por ADN polimerasa I es una parte indispensable de la replicacin del DNA, por que el producto final consiste completamente en DNA de doble cadena. -DNA-LIGASA. Cataliza la ltima etapa en la sntesis de la cadena retardada de DNA formando un fosforo de Ester por el enlace entre el grupo hidroxilo en 3 en el extremo de un fragmento de okazaki y el grupo fosfato en 5 de un fragmento de okazaki adyacente. Imagen

O OH P O O OH P O CH 3 O N
+

OH NH NH 23 P O NAD
+

+
OH OH HO OH

+
OH

HO

5 DNA
H3C O OH P O O OH P O O OH O P
+

H3C O

CADENA DNA
O

HO

HO OH

HO

3 DNA

20.4 LAS SINTESIS DE AMBAS CADENAS SE EFECTUAN SIMULTANEAMENTE A MEDIDA QUE EL DNA MATRIZ SE DESARROLLA FORMANDO LA HORQUILLA DE REPLICACION. En la clula las polimerizaciones de la cadena retardada estn acopladas estrechamente. Las protenas que participan en la sntesis de ambas cadenas estn ensambladas dentro del replisoma, asociado fsicamente en esta forma, los dos procesos de replicacin. El replisoma contiene un prisoma, DNA polimerasa III y protenas adicionales que se requieren para la replicacin del DNA. Las protenas son belicosas (belicosas da). Protena de unin de cadena sencilla (SSB). El replisoma contiene muchas molculas de SSB las cuales existen como tetrmeros. Cada tetrmero se fija que se fija al DNA cubre alrededor de 12 nucletidos. La fijacin de los tetrmeros de SSB a DNA de cadena sencilla, la hacen inflexible. Esta cadena est libre de estructuras secundarias. A medida que la helicasa desarrolla al DNA, la primasa sintetiza cebadores de RNA sobre la matriz de la cadena retardada (1 ves cada segundo).

*sntesis simultanea de las cadenas conductoras y retardada en una horquilla de replicacin. a) La matriz de la cadena retardada es doblada hacia atrs por medio del replisoma, de modo que la sntesis de ambas cadenas se mueven en la misma direccin. b) A medida que la helicasa desarrolla la alise, la primasa sintetiza el siguiente cebador de RNA de la cadena retardada y la polimerasa de la cadena completa un fragmento de okazaki. c) Cuando el cebador de RNA encuentra un fragmento de okazaki ya sintetizado, la polimerasa de la cadena retardada se desprende de la matriz De la cadena retardada mientras permanece fija al replisoma. d) Rapolimeraza de la cadena retardada se fija a un cebador de RNA recin sintetizado y sintetiza otros fragmentos de okazaki. 20.5 LA INICIACION Y LA TERMINACION DE LA REPLICACION DE DNA REQUIEREN PROTEINAS ADICIONALES. La iniciacin la realiza una protena (gen DNA A) causando una desnaturalizacin del ADN. 2 replisomas se ensamblan y procesan bidireccionalmente la rplica del cromosoma. Los cebadores iniciales de RNA para la sntesis de la cadena conductora son fabricados por los primos somas en el origen. La terminacin de la replicacin se efecta en el sitio de terminacin, esta regin contiene secuencias de DNA que son los sitios de fijacin de una protena que se conoce como SUSTANCIA DE UTILIZACION EN LA TERMINACION. (TUS La (tus) evita que las horquillas de replicacin pasen atreves de la regin inhibiendo la actividad de la he lipasa del replisoma. El sitio de terminacin contiene secuencias de DNA que desempean una funcin cada separacin de los cromosomas hijos cuando se a completado la duplicacin del DNA. 20.6 20.7 LAS MOLECULAS DAADAS DE DNA SE PUEDEN REPARAR. El DNA es la nica molcula que puede ser reparada ya que sale ms barato reparar que sintetizar otra. En organismos unicelulares, si se daa el DNA que se localiza en un gen que codifica una protena indispensable, el dao puede matar al organismo. En multicelulares, con el tiempo se acumulan defectos pueden originar una prdida progresiva de las funciones celulares o el desarrollo desregulado.

El dao que no se corrige, pasa a las clulas hijas la reparacin protege de los efectos de la mutacin. En el caso de los organismos multicelulares, las mutaciones solo pueden pasar a la generacin siguiente si ocurre en la lnea germinal. Las mutaciones de la lnea germinal pueden no tener efectos apreciables sobre el organismo que las contiene, pero pueden tener efectos profundos sobre la progenie, especialmente si los genes mutados son importantes para el desarrollo. DAOS AL ADN *luz ultra violeta ocasiona la diverizasion de las terminas aplicadas en el ADN de doble hlice. (Foto derverizacion) la replicacin no se puede llevar a cabo en presencia del dmero de Timina. *radiaciones conizantes y sustancias qumicas que ocurren naturalmente, qumicamente por reactivos cidos y oxidantes. Las modificaciones que ocasionan los qumicos. Metilaciones y reexaminaciones, depurificasion y despiriminacion, perdida de bases heterocclicas. Para reparar el DNA por la va general de escicion-reparacion cuyas caractersticas generales son similares en todos los organismos. En la primera etapa de la va de reparacin una endonucleasa reconoce al DNA distorsionado, daado y lo rompe de ambos lados de la lesin, liberando un oligonucletido que contiene de 12 a 13 residuos. La ruptura la realiza la enzima U ur ABC. La remocin del oligonucletido de DNA requiere una actividad de helicasa, la cual es con frecuencia parte de la encima de escisin-reparacin. El resultado es un hueco en una sola cadena que es anlogo al hueco entre fragmentos de okazaki despus de la remocin del cebador de RNA. En la segunda etapa de la va de reparacin, el hueco es llenado por las acciones de la DNA polimerasa I en procariontes y DNA polimerasas de reparacin en los eucariontes la mella es entonces sellada por la dnaligasa. IMAGEN Sitio del dao La presencia del DNA daado se detecta por los encimas de esaaonreparacion.una endonucleasa forma una mella en el esqueleto del DNA en ambos lados del dao. La elicasa y la exonucleasa remueven el DNA daado dejando un hueco. La DNA polimerasa I llena el hueco. La mella que queda es sellada por DNA y ligasa.

TRANSCRIPCION Y PROCESAMIENTO DEL RNA

CAP.21

Gen: Unidad simple de herencia Una unidad de herencia o gen dirige la produccin de una sola enzima. RELACION GEN-PROTEINA Los cambios genticos pueden manifestarse como cambios en la estructura primaria de una protena. Por lo tanto la informacin en el genoma especifica la estructura primaria de cada protena en un organismo. Gen: una secuencia de DNA que se transcribe. Genoma: Grupo de genes (En procariontes un genoma cerca de 2000 genes) Gen constitutivo: Codifica protenas o molculas de RNA que son indispensables para las actividades normales de todas las clulas vivas. Ejemplo: Las enzimas que participan en la glucolisis o el ciclo de Krebs son codificadas por esos genes constitutivos. Lo mismo con el RNA de transferencia y el RNA ribosomal. Hay genes que se expresan en circunstancias especiales, por ejemplo durante la divisin celular. Los organismos multicelulares contienen tambin genes que se expresan solo en ciertos tipos de clulas. Por ejem. Todas las clulas de un rbol de Arce contienen genes para las enzimas que fabrican clorofila y solo se expresan en clulas que se exponen a la luz, (Celulas de la superficie de una hoja). De modo similar las clulas de mamferos contienen genes de insulina, pero solo las clulas pancreticas la producen. El numero de genes en eucariotes multicelulares se desconoce. En insectos hay 7000 genes En mamferos entre 20000 y 50000 genes. La informacin almacenada en el DNA dirige la sisntesis de las protenas y se llama el Dogma Central de la biologa molecular. Transcripcion: Proceso en el cual la informacin en el DNA es transferida al RNA y en esta forma queda disponible para la sisnyesis de protenas.

Procesamiento del RNA: Es la forma en la cual las molculas son modificadas despus de la trascripcion. Traduccion: Proceso en el que la informacin en las molculas de RNA es interpretada y se sintetizan las protenas apropiadas. La expresin de los genes se puede regular por ejemplo la transcripcin ( Regulacion transcripcional). 21.1 VARIAS CLASES DE MOLECULAS DE RNA PARTICIPAN EN LA TRANSFERENCIA DE INFORMACION GENETICA DESDE EL DNA ASTA PROTEINAS La transferencia de informacin del DNA a las protenas (Enzimas) requiere la participacin de varias clases de molculas de RNA. RNA de transferencvia (RNAt) acarrea los aminocidos a la maquinaria de traduccin. RNA ribosmico (RNAr) : constituye gran parte del ribosoma RNA mensajero (RNAm): Participan en la sntesis de protenas al traducir molculas inestables de RNA La secuencia de una molecula de RNAm es complementaria de un segmento de unas de las cadenas de DNA. Una cuarta clase de RNA contiene una diversidad de pequeas molculas de RNA que participan en varios eventos metablicos, incluyendo el procesamiento de ella misma (RNA), muchas de estas contienen actividad cefalitica. Contenido de RNA de Una celula de E. Coli Tipo RNAr RNAt RNAm Cebadores RNAt Otras molculas de RNA2 Nivel de estado uniforme 83% 14% 3% <1% <1% Capacidad sintetica3 58% 10% 32% <1% <1%

1.-Los cebadores de RNA son aquellos que se utilizan en la replicacin del DNA, estos no son sintetizados pr la RNApolimerasa.

2.-Otras molculas de RNA incluyen varias enzimas de RNA de la RNAasa P 3.-Cantidad relativa de cada tipo de RNA sintetizado en cualquier instante.

En bacterias la mitad de las molculas nuevas de RNAm recin sintetizadas son degradas por una nucleasa en un periodo de tres minutos. En eucariontes la vida media promedio del RNAm es 10 veces mas larga como resultado de los eventos de procesamiento y modificacin que evita que los RNAm eucarioticos sean degradados durante su transporte desde el nucleo, donde se realiza la trascripcion hasta el citoplasma, en donde se efectua la traduccin eucariotica. 21.2 LA RNA POLIMERASA CATALIZA LA SINTESIS DE RNA La enzima RNa polimerasa: Cataliza la sntesis de RNA si se le provee de ATP, UTP, GTP, CTP y una molecula de DNA. Esta enzima cataliza la sntesis de RNA dirigida por DNA (la transcripcin) . La RNA polimerasa cataliza la polimerizacin de ribonucleosido tri fosfatos tambin. La RNA polimerasa es el centro de un complejo de transcripcin que transcribe el DNA (exactamente como la DNA polimerasa en el centro de un complejo de replicacin) Durante la trasncripcion, La RNA polimerasa desarrolla de modo parcial la matriz de DNA y sintetiza el cebador de RNA que despus se alargara. Tambien cataliza el procesamiento de alargamiento de la cadena de RNA mientras continua desenrollando y re enrollando el DNA. Al final despus de sintetizar una molecula de RNA, la RNA polimerasa termina la trasncripcion. A.- LA RNA POLIMERASA ES UNA PROTEINA MULTIMERICA Se compone de 6 subunidades de 5 tipos diferentes Sub unidades en la holoenzima de la RNA polimerasa en E. Coli Subb Sububidad p. p.

B1 B Roo A w

155613 150618 70263 36512 10105

B1 y B no estan relacionadas a pesar de la similitud de sus nombres. El valor para Roo es 70263 molecula mas comn de la holoenzima. 5 de estas sub unidades conbinan la estequimetria de a2BBRoo, para formar la holoenzima La sub unidad w puede formar parte de la holoenzima es pequea y su concentracin es pequea, las sub unidades funcionan juntas para realizar las funciones de transcripcin. Sub unidad B: La contribuye a la unin de DNA Sub unidad B : Tiene parte del sitio activo de la enzima Sub unidad Roo: Desempea una funcin importante en el sitio de la trasncripcion Sub unidad a: Se desconoce su fguncion Roo tien varios tipos, la principal es Roo70 (P:M: 70263) De forma irregular con endidura en un extremo olo suficiente para alojar 16 pares de bases de DNA B de doble cadena. Roo se puede disociar de la holoenzima dejando solo tres sub unidades a, B,B La asociacin mas dbil de Roo con la polimerasa central refleja el papel de Roo en la celula. Roo se disocia de las polimerasa central despues de que la trasncripcion se ha iniciado. Las clulas procarioticas contienen solo una forma de RNA polimerasa. Las clulas eucarioticas contienen tres diferentes RNA polimeraxsas nucleares a) La RNA polimerasa I: Transcribe los genes para molculas grandes de RNAr b) RNA polimerasa II: Trasncribe los genes que codofocvan las protenas c) La RNa polimerasa III: Trasncribe los genes que codifican muchas molculas pequeas estables de RNA incluyendo RNAt y RNAr pequeos.

B) LAS ELONGACION DE LA CADENA ES UNA REACCION DE TRANSFERENCIA DE UN GRUPO NUCLEOTIDO. La RNa polimerasa cataliza el alargamiento de la cadena por un mecanismo casi idntico al de la DNA polimerasa. Parte de la cadena en crecimiento de RNA es apareada en sus bases con la cadena de la matriz del DNA y los ribonuclewotidos trifosfato entrantes son probados en el sitio activo de la cadena de la matriz. Cuando los nucletidos entran forman enlaces de hidroheno correctos , la RNA polimeraza cataliza el ataque nucleofilico popr el grupo hidroxilo en 3 de la cvadena creciente de RNA sobre el fosforo alfa del ribonucleotido trifosfato entrante. La trasnferencia de un cnucleotidilo es la formacin de un jhuevo enlace fosfodiester y la liberacin de pirofosfato La RNA polimerasa cataliza la polimerizacin en la direccin S-3 y es en estyremo procesiba cuando forma parte de un complejo que esta enlazado al DNA. La RNA polimerasa utiliza solo trifosfatos nucleosidos (UTP,GTP,ATP y CTP) La DNA polimerasa utiliza desoxirribonucleosidoas trifosfato( dTTP, dGTP, dATP y dCTP)

Reaccion general de la sntesis de RNA RNAn-OH +NTP--------RNAn+1 OH + PPi G = -2.2Kcal mol-1 aun cuando el flujo de nucletidos es mayor a 104 moleculas por segundo la velocidad de transcripcin varia entre 30 y 85 nucleotidos por segundo. Para una fijacin precisa dentro del sitio activo, se require el apilamiento de bases y la formacin de enlaces de hidrogeno en el ribonucleotido difosfato y el nucletido de la matriz. La RNA polimerasa se equivoca cada 10-6 esto es cada milln de Nucleotidos incorporados sin embargo este valor es mas elevado que en DNA ya que no cuentan con la exonucleasa de correccin lectora, se requiere correccin estrema para que el error no pase a sus descendientes. 21.3.- LA TRASNCRIPCION SE INICIA EN LAS SECUENCIAS PROMOTORAS El inicio de las reacciones de alargamiento de RNA son prescindidas por una etapa de iniciacin separada y distinta, en la cual sae ensambla un complejo de trasncripcion en el sitio de iniciacin y se sintetiza un ribonucleotido cebador.

Los sitios de iniciacin de la trasncripcion se denominan PROMOTORES. En bacterias a partir de un solo promotor hay una unidad de transcripcin llamada OPERON En Eucariontes cada gen tiene su propio promorior. La frecuencia de iniciacin de transcripcin se relaciona con la necesidad del producto de un gen a) El complejo de transcripcin es ensamblado en las secuencias promotoras. b) Un complejo de transcripcin competente se forma cuando la secuencia promotora en el DNA atrae en esta forma a la RNA-polimerasa, reconocida por una o mas protenas que se unen al promotor. Estas protenas de unin al DNA atraen al RNA polimerasa hacia el sitio del promotos. En bacterias la Sub unidad Roo de RNa polimerasa reconoce al promotor y para el ensamblaje del complejo de transcripcin. Estas proteinas eucarioticas se llaman factores de trasncripcion. La secuencia de nucletidos en un promotor es uno de los factores mas importantes que afectan la velocidad de trascripcion de un gen. Se da un patrn comn llamado SECIENCIA CONCENSO compuesta de los nucletidos que se encuentran con mayor frecuencia en cada posicin. La secuencia concenso de un promotor bi partita presenta dos secuencias TTGACA en la regin 35 y TATAAT en la regin 10. Formulas
CADENA DE RNA EN ALARGAMINTO
OH P
+

CH3 O O H O OH O O OH O

OH

O P
+

O P
+

P O

OH

O O H O

OH

RIBONUCLEOTIDO TRIFOSFATO

Secuencia consenso de cuatro microorganismos GTGCGRG TTGACT ATTTTA GGCGGTG TTGACA TAAATA TGAGCTG TTGACA ATTAATA CCCAGGC TTTACA CTTTAT CCTCTGGCGGT GATAAT GG CCACTGGCGGT GATACT GA CATCGAACTAG TATGTT AG GCTTCCGGCTCG TATGTT GT

SECUENCIA CONCENSO REGION 35 TTGACA

REGION 10 TATAAT

Las secuencias del promotor de romaron de la cadena superior del gen del microorganismo La secuencia 10 se conoce como una caja tata, la regin 35 simplemente se conoce como regin 35 Juntas las dos regiones definen al promotor para la holoenzima de las clulas de E. Coli y esta secuencia se conoce como Roo70. c) La formacin de la burbuja de transcripcin y la sntesis de un cebador son las etapas limitantes de la velocidad en la iniciacin. La iniciacin de la transcripcin de hecho inicia como iniciacin de la replicacin del DNA, al abrirse la hlice de DNA se genera un cebador de RNA para el alargamiento de la cadena ( La replicacin se lleva a cabo por una helicasa y una primasa ) El desarrollo del DNA en el sitio de la iniciacin es una reaccin de isomerizacin en la cual la RNA polimerasa y el promotor (P) cambian de un complejo cerrado (RPc) a un complejo abierto (RPo). En el complejo cerrado RPc el DNA es de cadena doble. En el complejo abierto (RPc) el DNA es de cadena doble. En el complejo abierto 18 pares de bases del DNAse desnaturalizan formando una burbuja de transcripcin. La forma del complejo abierto es la etapa mas lenta de los eventos de iniciacin, una vez formado, la cadena matricialse situa en el centro de polimerizacin de la enzima. En la etapa siguiente , se forma un fosfodiester entre dos ribonucleotidos

trifosfatos que se han difundido al sitio activo y formado enlaces de hidrogeno con los nucletidos +1 y +2 del DNA de la cadena matricial. 21.4 LA TERMINACION DE LA TRANSCRIPCION REQUIERE SECUENCIAS DE TERMINACION ESPECIALES. La terminacin es un evento preciso en la transcripcin, asi como el complejo de transcripcin fue ensamblado activamente, tambin desensamblarlos debe ser activamente. La forma mas sencilla de terminacin se efectua en ciertas secuencias de DNA donde el complejo de alargamiento es inestable. La velocidad de sntesis del RNA durante el alargamiento es dependiente de la secuencia. Cuando pasa la secuencia GC es mas difcil desnaturalizar la matriz de DNA para formar la burbuja de transcripcin, esta secuencia se llama SITIO DE PAUSA haciendo mas lenta la transcripcin 10 a 100. La pausa es exagerada en siticos de DNA cuya secuencia presenta simetra binaria, esta secuencia se llama POLINDROMOS. LA TRANSCRIPCION TERMINA EN SECUENCIAS DE DNA QUE RECIBEN EL NOMBRE DE SECUENCIAS DE TERMINACION. En otros casos la terminacin requiere una protena reguladora especifica de nombre Rho. Rho se encuentra en el sitosol como un hexmero de sub unidades idnticas. Es un ATPasa potente con afinidad a RNA de cadena sencilla y tambin puede actuar como helicasa RNA:DNA. Rho se fija al RNA de cadena sencilla, expuesta detrs de un complejo de transcripcin en pausa en una reaccin que se acopla con hidrolisis de ATP. La terminacin de las secuencias de terminacin Rho-dependientes se debe a la desestabilizacin del hibrido RNA:DNA y el contacto directo entre el complejo de transcripcin y Rho a medida que Rho se fija a RNA. 21.5 LA TRANSCRIPCION DEL GEN SE PUED REGULAR Los genes constitutivos codifican las protenas que se requieren para los eventos metablicos bsicos, por ejemplo: La glucolisis y biosntesis de aminocidos y DNA.

Los genes constitutivos tienen promotores energticos. La regulacin de la expresin del gen puede tener lugar en cualquier punto en el flujo de informacin biolgica, pero se efectua con frecuencia a nivel de la transcripcin. Dado que la iniciacin de la transcripcin requiere de secuencias especificas de DNA y protenas solubles, estos elementos se pueden manipular para modular la actividad de transcripcin. a) Los activadores incrementan la velocidad de trasncripcion de promotores dbiles activadores, son protenas reguladoras que pueden incrementar la velocidad de iniciacin de transcripcin en promotores poco activos. El contacto protena-proteina sirve para convertir el sitio de unin dbil a uno de unin fuerte. Los activadores son protenas alostricas, son reguladas alostericamente. Los activadores mas estudiados son AMPc y CRP b) Los represores pueden inhibir la transcripcin LAS LETRAS MARCADAS INDICAN LA SIMETRIA BINARIA Y SU SECUENCIA 5 A C C T G G C T C T C A G G A C C T T C C T G A G C A C A C T 3 3 T G G A C C G A G A G T C C T G G A A G G A C T G T G T G A 5

SIMETRIA RNA UNA SOLA CADENA 5 A C C U G G C U C A G G A C C U U C C U G A G C A C A C U 3

ORQUILLA DE RNA 5 A C C U G G C U ACACU C G A

C A G G A C

G U C C U U C

ANTIDOCON DE ACOPLAMIENTO

Para crear RNAt se requiere que las horquillas de RNA maduren teniendo rompimiento 5 RNAt es tridimensional. Las molculas de RNA ribosmico se producen por procesamiento de transcripciones iniciales grandes. Estas requieren procesamientos sub siguientes incluyendo metilacin y ruptura por endonucleasas y exonucleasas. El procesamiento de RNAr es acoplado al ensamblaje de los ribosomas.

SINTESIS DE PROTEINAS

CAP 22

22.1 EL CODIGO GENETICO ES INEQUIVOCO, DEGENERADO Y CASI UNIVERSAL El cdigo gentico utilizado por los organismos vivos es sin superposiciones. En un cdigo de 3 palabras, en el que no hay superposicin, el mensaje traducido a partir de una secuencia particular de letras depende del punto en el cual principia la traduccin; al correrse el punto de partida para la lectura del cdigo, en una letra, a la izquierda o a la derecha cambia todo el mensaje. Cada punto de

partida potencial define una secuencia nica de palabras de 3 letras o MARCO DE LECTURA. As la traduccin correcta del cdigo gentico depende del establecimiento del marco de lectura correcto para la traduccin. RNAm AUGCAUGCAUGC

Mensaje ledo en cdigo triplete que se superpone

AUG UGC GCA ACAU

Mensaje ledo en cdigo triplete que no se superpone

AUG AC A U GCA UGC

Marco de lectura RNAm

AUGCAUGCAUGC

Mensaje ledo en el marco de lectura 1 . . /AUG/CAU/GCA/UGC/ Mensaje ledo en el marco de lectura II ..A/UGC/AUG/CAU/GC..

Mensaje ledo en el marco de lectura III AU/GCA/UGC/AUG/C..

El alfabeto del DNA consiste en 4 letras (A, T, C, G) los cuales codifican 20 aminocidos. El cdigo gentico deba contener por lo menos tres letras. Las palabras de 2 letras producen un vocabulario de 16 palabras (4)2 insuficiente para los 20 aminocidos. En contraste las palabras de 4 letras producen un vocabulario de 256 palabras (4)4 mucho ms de lo necesario. Las palabras de 3 letras permiten un vocabulario posible de 64 palabras (4) 3 ms que suficientes para especificar cada uno de los 20 aminocidos. Crick demostr que son palabras de 3 letras. Un cdigo hecho hasta de 3 letras puede superponerse o no. Superposicin: En un cdigo con superposicin, una letra es parte de ms de una palabra, al cambiar una sola letra.

En un cdigo de 3 palabras en el que no hay superposicin, el mensaje traducido a partir de una secuencia particular de letras depende del punto en el cual principia la traduccin. Al correrse el punto de partida para la lectura del cdigo, en una letra, a la izquierda o a la derecha, cambia todo el mensaje. Cada MARCO DE LECTURA . Asi la traduccin correcta del cdigo gentico depende del establecimiento del marco de lectura correcto para la traduccin.

CODIGO GENETICO ESTANDAR El cdigo gentico esta formado por 3 letras que no se superponen llamados CODONES. Por conversin todas las secuencias de nucletidos se escriben de 5-3, por ejemplo UAC especifica tirosina y CAU especifica Histidina. El termino CODON se refiere por lo regular a tripletes de nucletidos en el RNAm, pero tambin se puede aplicar a tripletes de nucletidos en la secuencia del DNA de un gen. Ejemplo: Un codn de DNA para tirosina podra ser TAC.

Los codones se traducen siempre en secuencias en la direccin 5----3, principiando seria del extremo 5 del mensaje. (El extremo sintetizado primero) y procediendo hacia el extremo de la regin de codificacin, la que por lo general esta mas cerca del extremo 3 del RNAm. Primera posicin extremo 5 Segunda posicion Tercera posicin extremo 3 A Tyr Tyr PARO PARO His His Gln Gln Asn Asn Lys Lys Asp Asp Glu glu G Cys Cys PARO Trp Arg Arg Arg Arg Ser Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly

U C A G

U Phe Phe Phe Phe Leu Leu Leu leu Ile Ile Ile ile Val Val Val val

C Ser Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala ala

U C A G U C A G U C A G U C A G

El codn gentico estndar tiene varias caractersticas. 1.- Es inequvoco. En un organismo o en un organelo en particular, cada codn corresponde solo a un aminocido. 2.- Hay varios codones para la mayor parte de los aminocidos, ejemplo. Hay 6 codones para la Serina, 4 codones para la glicina y 2 codones para la lisina. Debido a la existencia de varios codones para la mayor parte de los aminocidos, se dice que el cdigo gentico es degenerado. Codones diferentes que especifican los mismos aminocidos, se conocen como CODONES SINONIMOS. La degeneracin del cdigo gentico minimiza los efectos de las mutaciones dado que el cambio de un solo nucletido da como resultado un codn que como especifica al mismo aminocido. Nota: El triptfano y la metionina son los nicos aminocidos de un solo codn.

3.- Los dos primeros nucletidos de un codn con frecuencia son suficientes para especificar un aminocido dado, por ejemplo los cuatro codones para la glicina empiezan todos ellos con GG. GGU,GGC,GGA,y GGG. 4.- Los codones con secuencias similares, especifican aminocidos similares qumicamente. Por ejemplo los codones para los aminocidos treonina difieren de 4 de los codones para la serina, en solo un nucletido sencillo en la posicin 5; los codones para los aminocidos Aspartato y glutamato empiezan con GA y difieren solo en la posicin 3. Los codones que tienen pirimidinas en su segunda posicin por lo regular codifican los aminocidos hidrofbicos, por consiguiente, las mutaciones que alteran la posicin 5 o 3 de estos codones, usualmente darn un aminocido qumicamente similar que se incorpore a la protena. 5.- Solo 61 de los 64 codones especifican aminocidos. Los tres codones restantes (UAA, UGA, UAG) son codones de terminacin o codones de PARO. Los codones de terminacin por lo general no se reconocen por ninguna molcula de RNAt. En vez de ello se reconocen por protenas especficas que hacen que los nuevos pptidos se liberen de la maquinaria de traduccin. Codn de terminacin AUG (metionina)

LOS ANTICODONES DE RNAt APAREAN SUS BASES CON LOS CODONES DEL RNAm

RNAt CGI GCU RNAm

RNAt CGI GCC RNAm

RNAt CGI GCA RNAm

ANTICODONES

CODONES

SE APAREAN C-G, Y I-U, TAMBIEN I-C Y I-A. Segn Watson y Crick los apareamientos naturales son: Adenina Uracilo (A-U) y GuaninaCitocina (G-C)

Existen algunas variaciones, el apareamiento de Watson y Crick solo requieren el apareamiento de 2 bases (A-U y G-C), la tercera base del codn al interactuar con la tercera base del anticodon (A-A, B-B y X-Y) El apareamiento debe ser 5-3, pero se permiten otros apareamientos de bases en la posicin 5 del anticodon.(Es la conformacin flexible) llamada Bamboleo. Base en la posicin 5 de bamboleo del codon C A U G I* *INOSINA Base reconocida en la posicin 3 del anticodon G U AoG UoC U, A o C

Los ribosomas son una parte indispensable del complejo de sntesis de protenas.

LA TRADUCCION PRINCIPIA CON LA FORMACION DE UN COMPLEJO DE INICIACION

La iniciacin de la sntesis de protenas comprende el ensamblaje de un complejo de traduccin sobre el RNAm al principio del marco de lectura. El complejo de iniciacin consiste en las sub unidades ribosmicas, la matriz de RNAm para ser traducida, un RNAt iniciador especial y varias protenas accesorias que se llaman FACTORES DE INICIACION . Parte del papel de la reaccin de iniciacin es asegurar que antes de que la traduccin se inicie, se hallan seleccionado el codn apropiado de iniciacin y el marco correcto de lectura para la protena. La iniciacin requiere molculas especiales de RNAt, metionil RNAt, por ejemplo reconoce el codn AUG .( Hay dos molculas, una se ocupa en los codones de iniciacin y se denomina RNAy iniciador) La otra molcula de metionil RNAt reconoce los codones internos de metionina. En eubacterias el RNAt iniciador se llama RNAtf (fenil-transferasa)

RNAtf
O NH HO OH O

S CH3
F metil RNA-tf

En eucariontes la molcula es la metionina y no esta formilada.