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A finales del año 1939 viajó por barco a Norteamérica, llegando a Nueva York en enero
de 1940. Penzias estudió en el City College de New York, y se graduó en 1954 como
físico. Estudió en la Universidad Columbia. Antes de entrar a la Universidad, Penzias
había estado en la marina en donde adquirió experiencia en el laboratorio de radiación.
Esto le sirvió para concentrarse en el laboratorio de física de microondas. Su tesis fue la
construcción de un amplificador de masa para experimentos en radioastronomía.
En 1961 comenzó a trabajar en los laboratorios Bell, en New Jersey. Uno de sus
primeros proyectos fue buscar las líneas de emisión de las moléculas de OH. Con el
éxito de este primer trabajo emprendió la construcción de una antena más grande.
Durante este tiempo, otro radioastrónomo llamado Robert Wilson, llegó de Caltech y
comenzó a trabajar en 1963. Ambos iniciaron observaciones radioastronómicas. Debido
a la gran precisión de sus sistemas, comenzaron nuevos proyectos uno de los cuales fue
la medición de la intensidad de la radicación de nuestra galaxia en altas latitudes, que
dio como resultado el descubrimiento de la radiación cósmica de fondo.
El trabajo astronómico de Penzias siempre estuvo relacionado con los laboratorios Bell.
En 1972 fue el director del departamento de Investigaciones radiotécnicas y en 1976
director del laboratorio de investigación de comunicaciones. Durante este tiempo
también colaboró en la Universidad de Princeton, Observatorio de Harvard College,
Universidad del estado de New York y el Trenton State College. En 1978 fue
galardonado con el premio Nobel de física compartido con Robert Wilson.