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1er Depa Bioka
1er Depa Bioka
Queupumil
Rodrguez
Bioqumica
Primer
departamental
I
Agua
-
Caractersticas:
En
el
ser
humano
entre
el
45
y
80%
del
peso
corporal
(50%
intra
y
20%
extracelular)
El
contenido
corporal
disminuye
con
el
incremento
de
grasa
Equilibrio
en
el
organismo
por:
ingestin
y
excrecin
Fuentes:
bebidas,
alimentos
slidos,
oxidacin
- Funciones:
Soporte
o
medio
d
solvatacin
(solubilizacin
y
dispersin)
donde
ocurren
las
reacc
met
Amortiguador
trmico
Transporte
de
sustancias
polares
y
aislamiento
de
entidades
apolares
Regulador
del
equilibrio
hidroelctrico
Lubricante,
amortiguadora
del
roce
entre
rganos
Medio
de
circulacin
que
favorece
la
turgencia
Da
flexibilidad
y
elasticidad
a
los
tejidos
Interviene
como
reactivo
en
reacciones
metablicas;
aportando
H+
o
OH-
al
medio
Alta
constante
dielctrica
78.6
Genera
eventos
de
smosis
(flujos
de
agua
a
favor
de
un
gradiente)
Densidad
(EGO):
1.020
normal
- Propiedades fisicoqumicas:
Puente
de
hidrogeno:
Asociacin
entre
2
molculas,
mediada
por
tomo
de
H.
Da
polaridad
al
agua;
su
fuerza
depende
de
las
electronegatividades,
arreglo
espacial
de
aceptores
y
donadores,
distancia
entre
ncleos
aceptores
y
donadores
y
el
medio
de
solvatacin
donde
ocurran
los
puentes.
II
Soluciones
Solucin:
mezcla
homognea
entre
2
o
ms
sustancias.
La
sustancia
que
se
encuentra
en
mayor
proporcin
se
llama
disolvente
y
las
otras
se
llaman
solutos
Solubilidad:
es
la
medida
de
la
cantidad
de
soluto
que
se
puede
disolver
en
un
solvente
dado,
a
cierta
temperatura.
Depende
la
naturaleza
del
solvente
y
del
soluto:
lo
polar
disuelve
a
lo
polar
y
no
polar
a
lo
no
polar.
Las
molculas
que
se
disuelven
pueden
ser
molculas
que
se
disocian
generando
iones
o
electrolitos
(conducen
la
electricidad)
y
sustancias
no
disociables
o
no
electrolitos.
Iones
polares:
Li+,
Na+,
K+,
NH4+,
NO3-,
ClO3-,
CH3COO-;
Cl-,
Br-,
I-
(menos
con
Ag,
Pb
y
Hg)
y
SO2-
(excepto
con
Pb,
Sr
y
Ba)
En
los
disolventes
polares,
los
iones
se
solvatan
Solvatacin:
proceso
por
el
cual
un
in
o
una
molcula
se
rodea
de
molculas
de
disolvente.
Cuando
el
disolvente
es
agua,
se
habla
de
hidratacin
-Tipos
de
soluciones:
existen
6
tipos
de
soluciones,
segn
el
estado
fsico
de
los
componentes.
Las
soluciones
ms
comunes
son
las
que
tienen
como
disolvente
el
agua
Disolvente
Soluto
Gas
Lquido
Slido
Lquido
Lquido
Slido
Gas
Gas
Gas
Lquido
Slido
Slido
Cristalizacin:
proceso
de
formacin
de
cristales,
los
cuales
pueden
ser
grandes
y
con
una
estructura
definida
Precipitacin:
proceso
por
el
que
se
forman
partculas
pequeas
y
con
una
estructura
indefinida
-
Concentracin:
Es
la
cantidad
de
soluto
presente
en
una
determinada
cantidad
de
solucin.
Las
formas
ms
comunes
en
las
que
se
expresa
son:
*Osmolaridad
de
la
membrana
celular:
(290)0.310
0.320
osmol/L
(0.308
osmol/L
o
308
mOsm/L)
(C1V1
=
C2V2)
-
Propiedades
coligativas
de
las
soluciones:
La
presencia
de
solutos
en
una
solucin
modifica
las
propiedades
del
disolvente,
generando
nuevas
propiedades
en
las
soluciones.
Las
propiedades
coligativas
slo
dependen
del
nmero
de
partculas
de
soluto
en
solucin,
pero
no
de
la
naturaleza
de
dichas
partculas:
Tonicidad:
medida
cualitativa
de
la
cantidad
de
solvente
por
soluto
en
una
solucin
(Relacin
de
la
osmolaridad
con
la
presin
sangunea)
Cuando
2
soluciones
tienen
dif
presin
osmtica,
se
dice
que
la
ms
concentrada
es
hipertnica
respecto
de
la
ms
diluida
y
que
esta
ltima
es
hipotnica
respecto
a
la
ms
concentrada.
Cuando
una
solucin
tiene
la
misma
osmolaridad
que
la
sangre
se
dice
que
es
isotnica.
Si
se
ponen
eritrocitos
en
una
solucin
hipertnica,
estos
se
deshidrataran
en
un
fenmeno
llamado
crenacin;
si
se
ponen
en
una
solucin
hipotnica,
los
eritrocitos
se
llenan
de
agua
y
eventualmente
se
rompen,
en
un
fenmeno
llamado
hemolisis.
En
algunas
enfermedades
como
la
desnut
o
mal
funcionamiento
renal,
la
presin
osm
es
menor
(albumina)
y
produce
edema
III
Equilibrio
hidroelctrico
70%
de
agua
en
el
organismo
=
50
%
intracelular,
20%
extracelular
(Plasma
5%,
Intersticio
15%,
lquido
transcelular)
(Plasma
=
nico
que
intercambia
fluidos
con
el
ambiente)
-
Electrolitos
en
los
compartimentos
(mEq/L):
In
Extracelular
Intersticio
140
143
4.5
4
5
3
2.5
2
152
152
101
(103)
113
24
27
2
2
1
1
6
7
18
2
152
152
Intracelular
Plasma
Na
K
Ca
Mg
Cationes
Cl
HCO3
H2PO4
SO4
Ac
Orgnicos
Protenas
Aniones
10
135
10
25
180
5
10
100
5
10
50
180
Se
puede
decir
que:
El
Na
(Sodio)
es
el
soluto
(catin)
ms
abundante
del
lquido
extracelular,
su
reabsorcin
en
el
tbulo
renal
va
acompaada
de
la
reabsorcin
de
agua
El
K
(Potasio)
es
el
principal
soluto
(catin)
del
lquido
intracelular,
+
importante
catin
del
paro
cardaco
en
sstole
(inyeccin
letal)
El
soluto
(anin)
principal/dominante
del
espacio
extracelular
es
el
Cl
(Cloro),
junto
con
el
HCO3-
es
el
principal
anin
perdido
en
el
vmito
de
alcalosis
metablico
El
soluto
(anin)
ms
abundante
del
lquido
intracelular
es
H2PO4
(Fosfatos)
amortiguador
intracelular
+
importante
(despus
de
las
prot),
acta
como
donador
de
protones
Las
protenas
son
ms
abundantes
en
la
clula,
despus
en
el
plasma
y
por
ltimo
en
el
intersticio
La
carencia
de
Mg
(Magnesio)
(catin)
causa
convulsiones
y
su
exceso
narcosis
La
concentracin
de
HCO3
(Bicarbonato)
(anin)
es
un
indicador
de
la
capacidad
del
cuerpo
para
afrontar
cargas
metablicas
de
cido
(componente
metablico)
se
pierde
en
las
diarreas
(acidosis
metablica)
*El
H
(Hidrogeno)
(catin)
(que
no
puede
estar
solo)
se
elimina
por
va
renal
en
forma
de
H2PO4
y
NH4
(amonio)
entre
otros
El
H2O
(agua)
tiene
una
concentracin
de
55.5
moles/L
en
estado
puro
(kw
constante
equilibrio)
permitiendo
mantener
la
temp
corporal
+
baja
que
el
medio
ambiente
El
CO2
(dixido
de
carbono)
(Concentracin)
se
modifica
en
los
desequilibrios
respiratorios
como
el
enfisema,
la
intoxicacin
por
barbitricos
y
el
asma
Composicin
de
los
compartimentos
lquidos
del
organismo:
Trastornos:
Hiper
e
hiponatremia:
Na+
elevado
y
disminuido
en
plasma
Hiper
e
hipocalcemia:
Ca+
elevado
y
disminuido
en
plasma
Hiper
e
hipokalemia:
K+
elevado
y
disminuido
en
plasma
Hipoalbuminemia
(por
dao
heptico)
-Soluciones
intravenosas:
Isotnica/Salina/Fisiolgica:
Al
0.9%NaCl,
5.5%Glucosa
(0.31M)
(1/1
relacin:
Na+/Cl-)
Osmolaridad
de
308mOsm/L
Ringer
(con
Lactato):
contiene
45
mEq/L
de
cloro
menos
que
el
suero
fisiolgico,
causando
slo
hipercloremia
transitoria
y
menos
posibilidad
de
causar
acidosis.
Por
litro
contiene:
Na+=
130
mEq,
Cl
=
109
mEq,
Lactato=
28
mEq,
Ca2+
=
3
mEq
y
K+
=
4
mEq.
Estas
proporciones
le
suponen
una
osmolaridad
de
273
mOsm/L
IV
Equilibrio
Acido-Base
cidos
Arrhenius
Lowry-Bronsted
Toda
sustancia
que
al
Cualquier
molcula
disociarse
en
agua
que
al
disociarse
o
genera
iones
Hidronio
entrar
en
una
reaccin
o
Hidrogeniones
qumica,
aporta
(H3O)+
protones
(H+)
Bases
Toda
agente
que
al
Cualquier
reactivo
que
disociarse
en
agua
recibe
protones
(+)
genera
iones
oxidrilo
o
hidroxilo
(OH-)
Anftero:
sustancia
que
acta
como
cido
y
como
base
Lewis
Cualquier
tomo
o
molcula
que
recibe
electrones
(e-)
al
entrar
en
combinacin
qumica
Cualquier
material
que
ceda
electrones
(e-)
cido
fuerte:
aqul
que
se
ioniza
por
completo
o
casi
por
completo,
para
donar
todos
sus
protones.
El
resultado
de
aadir
un
cido
fuerte
al
agua,
es
un
gran
aumento
de
la
concentracin
de
iones
hidronio
(Ejm:
HCl,
H2SO4,
HNO3)
cido
dbil:
Se
ioniza
parcialmente
en
agua
para
donar
sus
protones.
La
adicin
de
un
cido
dbil
al
agua,
da
por
resultado
slo
un
pequeo
aumento
en
la
concentracin
de
iones
hidronio
(Ejem:
H2CO3,
H2S,
HBrO)
Base
fuerte:
Tiene
una
gran
atraccin
por
los
protones.
In
hidroxilo
(Ejm:
NaOH,
KOH,
LiOH)
Base
dbil:
Tiene
una
gran
atraccin
por
slo
un
pequeo
porcentaje
de
sus
molculas
aceptar
protones.
Amoniaco
(Ejm:
NH4OH,
Ca(OH)2,
NH2OH)
Si
un
cido
es
fuerte,
su
base
conjugada
ser
dbil.
Mismo
caso
para
las
bases
El
nmero
de
tomos
de
hidrogeno
en
un
cido
no
indica
su
fuerza
como
cido
-
Escala
de
pH
Tiene
el
objetivo
de
expresar
en
forma
ms
conveniente
la
concentracin
de
iones
hidrgeno,
en
lugar
del
uso
de
exponentes
negativos
(10^-7)
o
decimales
0.0000001
El
pH
es
la
potencia
negativa
a
la
que
se
debe
ser
elevado
el
nmero
10
para
expresar
la
concentracin
de
los
iones
hidrgeno
en
moles
por
litro.
pH
=
-
log
[H+]
y
pOH
=
-log[OH-]
A
temperatura
ambiente,
la
[H+]
en
agua
pura
es
de
1x10^-7.
Por
lo
tanto,
el
pH
del
agua
es
de
7.
En
el
agua
pura,
la
[H+]
=
[OH-]
Equilibrio
de
autoionizacin
del
agua:
H2O
+
H2O
H3O+
+
OH-
pH
+
pOH
=
14
Ecuacin
de
Henderson
Halsselbalch:
establece
relacin
entre
el
pH
de
la
solucin
acuosa
de
un
cido
dbil
y
s
pka,
y
las
cantidades
de
las
formas
disociada
y
no
disociada
pH
=
pk
+
log
(base/acido)
pk:
valor
de
pH
al
cual
se
tiene
la
mxima
capacidad
amortiguadora
para
Acido-Base
porque
tienen
la
misma
cantidad
(6.1
en
el
amortiguador
en
intracelular
ms
importante:
H2PO4)
kw:
Constante
de
disociacin
del
agua
(1x10^-14
mol/L)
expresa
el
producto
de
las
concentraciones
de
H+
y
OH-
Componente
metablico
[A]
(cido):
HCO3
Componente
respiratorio:
[HA]
(Base):
pCO2
(constante:
0.03)
(Relacin
20:1)
-Amortiguadores
fisiolgicos/Tampn/Bufer:
Amortiguador
H2CO3
HCO3-
H2PO4
HPO4-2
HbH-Hb
y
Hb
OH
HbO-
Aminocidos
(COOH
COO-
y
NH3
NH2
pks
6.1
7.21
7.9
y
6.7
1.98-2.28
Localizacin
Plasma
Interior
celular
Eritrocito.
Rico
en
Histidina
Plasma
(Grficas)
Concentraciones
de
pCO2
(mmHg)
24
(componente
metablico)
40mmHg
Concentracin de HCO3
Acidosis
Alcalosis
7 7.4 8
Escala de pH
-
Aminocidos:
No
polares
/
Apolares
(9)
Glicina
(L)
Prolina
(C)
(L)
*
Alanina
(L)
Fenilalanina
(A)
Valina
(L)
Triptofano
(A)
Leucina
(L)
Radical:
Cadena
lateral
del
aminocido
(lo
que
hace
diferentes
a
todos)
L
Aminocidos:
los
que
usa
el
cuerpo
En
la
forma
polar
de
un
aminocido:
el
grupo
amino
(NH3)
esta
protonizado
+;
e
grupo
carboxilo
(COO)
esta
disociado
(forma
zwiterrionica)
Punto
isoelctrico:
sitio
de
la
curva
de
titulacin
donde
los
a
muestran
carga
neta
(son
neutros)
(pH)
pI=
pk1
+
pk2
2
*Slo
los
polares
con
carga
(5)
tienen
pk3)
Neg=
pk1
y
pk2
Pos=
pk2
y
pk3
La
carga
del
aminocido
a
un
pH
dado,
esta
determinada
por
el
pka
de
cada
grupo
(pk1
de
COO,
pk2
de
NH3)
El
resultado
indica
a
donde
migra
el
aminocido:
+
de
7
es
positivo
(migra
al
nodo
[polo
neg]),
-
de
7
es
negativo
(migra
al
Ctodo
[polo
pos]).
Esenciales:
Los
que
el
organismo
NO
puede
producir
en
cantidades
suficientes
para
la
dieta
y
sus
necesidades
se
obtienen
de
la
dieta
No
esenciales:
los
que
puede
cubrir
(se
sintetizan)
Enlace
peptdico
(u
omega):
Entre
el
acido
carboxlico
de
1
aa
y
e
grupo
amino
de
otro
(entre
OH
y
H),
saliendo
agua
H2O
(es
covalente).
La
cadena
empieza
con
un
NH3+
y
termina
con
un
COO-
Hidrlisis:
separar,
metiendo
agua
H2O
-
Protenas:
Estructura
Primaria
Secundaria
Terciaria
Cuaternaria
Composicin
Secuencia
de
aminocidos
unidos
cov
(amida/pept),
codificados
por
1
gen
Dicta
la
localizacin
de
los
puentes
disulfuro,
si
los
hubiese
Permanece
despus
de
la
desnaturalizacin
Conformacin
local
del
esqueleto
de
aa
(orden
espacial
y
estructura
peridica)
Incluye
las
hlices
y
las
lminas
paralelas
o
anti
(estabilizadas
x
puentes
d
H)
Los
motivos
o
estructuras
supersec
so
agrupamientos
peridicos
de
estruct
sec(s)
Los
dominios:
repeticiones
de
motivos
(para
algunos
ya
es
terciario)
Ordenamiento
espacial
de
aa
alejados
de
la
secuencia
lineal
Forma
tridimensional
(3D)
Constituida
por
dominios
Mantiene
residuos
en
la
superficie
Acoplamiento
de
2
o
+
subunidades
(complejo)
para
la
unin
cooperativa
Unin
de
subunidades
(contactos
mutuos)
dictado
por
terciaria
Forma
homo
y
heteropolmeros
(cadenas
polimricas)
(polmero)
Configuracin
nativa:
o
fisiolgica;
forma
en
la
naturaleza
con
funciones
optimas;
es
la
forma
que
tienen
en
el
medio
de
trabajo
Enlaces:
Enlaces
Peptdico
Inico
Caractersticas
De
tipo
amida
Se
establece
entre
un
amino
y
un
carboxilo
de
aa
con
salida
de
H2O
Covalente,
plano
y
rgido
Entre
2
tomos
electronegativos
que
comparten
1
protn
Establecido
por
interaccin
electrosttica
entre
aa
de
carga
opuesta
Disulfuro
Covalente
(entre
2
cistenas)
Producido
por
la
oxidacin
de
2
grupos
tiol
Estabiliza
las
estructuras
terciarias
y
cuaternarias
Hidrofbico
Entre
radicales
no
polares/apolares
de
aa
Protenas
de
inters
clnico:
(Fibringeno
=
presente
en
plasma,
no
en
suero;
Prolina
grupo
Imino
cicla;
-Termodinmica:
Ley
Principio
1
Entalpa
(H)
2
Entropa (S)
Valores
>0
(+)
<0
()
>0
(+)
<0
()
>0
(+)
/
Keq
<1
Relacin
1
Endotrmico
Exotrmico
Desorden
aumenta
Desorden
disminuye
Endergnico
[A][B]
>
[C][D]
<0
()
/
Keq
>1
Exergnico
[A][B]
<
[C][D]
Relacin
2
Recibe
calor
Libera
calor
Orden
disminuye
Orden
aumenta
No
espontneo
(termodinamicamente
imposible)
Espontneo
(termodinamicamente
posible)
-
Enzimas:
Son
catalizadores
biolgicos
que
tienen
las
siguientes
caractersticas:
Conceptos:
Enz
simple
Enz
conjugada
Apoenzima
Holoenzima
Coenzima
Grupo
prosttico
Vitamina
Cofactor
Metaloenzima
Enz
act
x
metales
Precursores
de
coenzimas
(hidrosolubles)
Vitamina
hidrosoluble
B1
Tiamina
Importancia
Precursor
del
TPP
(transcetilac
y
descarbox)
B2
Riboflavina
Precursor
del
FAD+
B3
Niacina
Precursora
del
NAD+
(transp
de
e-)
B5
Pantotenato
Precursor
de
Acetil
CoA
(aceptor
y
donador)
B6
Pirodoxina
Precursora
del
PP
(pirodal
fosfato)
(descarbox
y
transamin)
B8
Biotina
B9
Folacina
Forma
al
cido
flico
B12
CianoCobalamina
Cofactor
de
las
carboxilasas
C
cido
ascrbico
Hidrox
en
la
form
de
colgeno
Deficiencia
(Avitaminosis)
Beri
veri
y
Sx
Wernicke-Korsakoff
Fotobia,
Queilosis
Pelagra
Anemia
(convulsiones)
Mala
absorcin
Anemia
megaloblast
macroctica
Anemia
perniciosa
Escorbuto
Liposolubles:
Vitamina
A
Caroteno/Retinol
Calciferol
D
E
Tocoferol
K
Fitomenadiona/
Filoquinona
Importancia
Pigmentos
visuales
en
retina
Deficiencia
(Avitamonosis)
Ceguera
nocturna
Incrementa
la
absorcin
intestinal
de
Ca+
Antioxidante
en
membranas
celulares
Precursor
de
-Carboxi-
glutamato
de
coagulacin
Hipocalcemia,
Raquitismo
(desmineralizacin
del
hueso)
Sntomas
neurolgicos,
debilidad
muscular
Problemas
en
la
coagulacin
de
la
sangre,
enf
hemorragica
Clasificacin:
Clase
Oxidoreductasas/
Oxigenasas/
Deshidrogenasas
Transferasas
Reaccin
Intercambio/Transferencia
de
protones
y
electrones
(iones
hidruro
o
tomos
de
H)
Transferencia
de
grupo
fosfato
Hidrolasas
Liasas
Isomerasas
Ligasas
Enzimas
(ejemplos)
Deshidrogenasa,
Reductasa,
peroxidasa,
hidrolasa
Cinasa
(fosforilasa),
transaminasa,
transcarboxilasa,
transmetilasa
Fosfatasa
(desfosforilasa),
peptidasa,
esterasa,
glucosidasa,
ribonucleasa
Sintasa,
aldolasa,
descarboxilasa
Epimerasa,
mutasa,
racemasa
Sintetasa,
carboxilasa
Enzimas
de
escape
(clnica)
Enz
srica
Aspartato
tranaminasa
(AST
o
TGO)
Alanina
aminotransferasa
(ALT)
Amilasa
pancretica
Creatina
cinasa
Fosfatasa
cida
Fosfatasa
alcalina
Lactato
deshidrogenasa
Lipasa
pancretica
-Glutamil
Transpeptidasa
Deshidrogensa
de
Glucosa
6-P
Parmetros
cinticos:
Uso
diagnostico
Infarto
al
miocardio
(pico
de
48
hrs
y
permanencia
de
5
das),
afeccin
heptica
y
anomalas
de
musc
esq
Hepatitis
viral
Pancreatitis
aguda
Distrofia
al
miocardio
(1era)
Cncer
de
prstata
Tumores
(enfermedades)
seos
Infarto
dl
miocardio,
destrucc
d
musc
int
y
algunos
carcinomas
Pancreatitis
aguda
Dao
heptico
y
cirrosis
alcohlica
Anema
hemoltica
inducida
por
frmacos
Km
=
aumenta
Km
=
sin
cambio
(igual)
Vmax
=
sin
cambio
(igual)
Vmax
=
disminuye
Afinidad
=
disminuye
Afinidad
=
sin
cambio
(igual)
*
A
>
Km
-
Afinidad
y
viceversa
A
<
km
+
Afinidad
Km
=
disminuye
Vmax
=
disminuye
Afinidad
=
aumenta
Inhibicin
competitiva:
el
inhibidor
(y
el
sustrato)
compiten
por
alcanzar
el
sitio
cataltico
No
competitiva:
altera
la
velocidad
inicial
(Sale
en
el
vrtice)
(Depende
slo
de
la
concentracin
del
inhibidor)
Acompetitiva
(irreversiblemente
no
competitiva):
paralela
Isoenzimas:
Enzimas
que
catalizan
1
reaccin
especfica,
pero
con
caractersticas
fsicas,
bioqumicas
e
inmunolgicas
distintas
Zimogeno/Proenzima:
enzima
inactiva
(A
>
Energa
de
activacin
<
Velocidad
de
reaccin)