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Aminoacidos. Propiedades Acido Base
Aminoacidos. Propiedades Acido Base
Aminoacidos. Propiedades Acido Base
ph y equilibrios acido-base
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hidrofbicos o apolares de cadena aliftica Glycina (Gly, G), Alanina (Ala, A), Valina
(Val, V), Leucina (Leu, L), Isoleucina (Ile, I) & Metionina (Met, M)
Caractersticas
- hidrofobicidad de la cadena lateral: se localizan en el interior de las protenas globulares y
contribuyen a la formacin de la estructura global de la protena (efecto ncleo hidrofbico).
- reactividad qumica muy baja.
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Glicina (Gly, G): Sin actividad ptica ni estereoisomera y con mucha flexibilidad y capacidad de
rotacin. Suele estar excluido de las estructuras en -hlice, excepto en la hlice del colgeno, y
aparece con frecuencia en los giros codos de las protenas. La posicin de Gly en una protena
dada suele estar altamente conservada en series filogenticas, debido a su pequeo tamao (el
nico posible en esa posicin).
Alanina (Ala, A): aminocido ms pequeo con isomera y activdad ptica.
Valina (Val, V), Leucina (Leu, L) e Isoleucina (Ile, I): mayor ndice de hidrofobicidad. La Ile
presenta dos carbonos asimtricos, uno el C y otro en la cadena lateral.
Metionina (Met M): iniciador en la biosntesis de protenas. Tioaminocido.
polares sin carga Serina (ser, S), Treonina (Thr, T), Cistena (Cys, C), Prolina (Pro, P),
Asparragina (Asn, N) & Glutamina (Gln, Q)
Caractersticas
- mayor carcter hidroflico
- se localizan en la parte externa de la protena.
Serina (Ser, S) & Treonina (Thr, T): hidroxiaminocidos que forman enlaces glicosdicos en
ciertas protenas. El grupo OH se puede fosforilar, regulando la funcin proteica.
- La Ser se localiza en el centro activo de enzimas como las serin proteasas.
- La Thr presenta dos carbonos asimtricos, uno el C y otro en la cadena lateral.
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Cistena (Cys, C): tioaminocido que forma enlaces disulfuro intra- y/o intercatenarios. El grupo
sulfhidrilo (SH -S-) puede disociarse a pH muy alto. La Cys forma parte del centro activo de
muchas enzimas.
Prolina (Pro, P): aminocido con un papel estructural muy importante, ya que est excluido de
las estructuras en -hlice = helix breaker (si bien aparece en la hlice de colgeno), pero es
clave en la formacin de giros codos en las protenas. Alto grado de conservacin en las en
series filogenticas.
Asparragina (Asn, N) & Glutamina (Gln, Q): aminocidos amidados, ya que son las amidas de
los cidos dicarboxlicos. Desempean un papel importante como intermediarios en el
metabolismo nitrogenado, estando implicados en el transporte de iones amonio ( NH 4+ ).
Asimismo, estn implicados en la gluconeognesis a partir de los esqueletos carbonados de los
aminocidos.
- La Gln es clave para el reciclaje del Glu en el tejido nervioso (recaptacin de
neurotransmisores).
polares cargados Acido asprtico (asp, D), cido glutmico (Glu, E), Histidina (His,
H), Lisina (Lys, K) & Arginina (Arg, R)
Acido asprtico (Asp, D) y glutmico (Glu, E): aminocidos dicarboxlicos con carga
negativa. Presenta carga negativa a pH fisiolgico, por lo que son muy polares. Forman parte del
centro activo de glicosidasas y Ser proteasas, y presentan enlaces de coordinacin con cationes
metlicos (cofactores de protenas). Adems, estn implicados en el metabolismo nitrogenado y
en la gluconeognesis.
Histidina (His, H), Lisina (Lys, K) & Arginina (Arg, R): aminocidos dibsicos con carga
postiva. Presentan Q positiva a pH fisiolgico, por lo que son muy polares.
- La Lys forma bases de Schiff, que actan como intermediarios covalentes en la catlisis
enzimtica e interviene en la unin de coenzimas a las protenas.
- La Arg es un metabolito intermediario en el ciclo de la urea.
- La His se localiza en el centro activo de muchas enzimas, ya que puede actuar donando
captando protones del sustrato. Esta propiedad se debe a la presencia de un grupo imidazol en
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la cadena lateral. Adems, debido a que el pKR pH fisiolgico, las protenas ricas en His actan
como tampones en los medios biolgicos (ejemplo, la Hemoglobina).
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Aminocidos no proteingenos
No estn presentes en las protenas, aunque s tienen otras funciones importantes
L-: aparecen como intermediarios metablicos.
- homo-Ser, homo-Cys: intermediarios en el metabolismo de
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Derivados de aminocidos
De Phe/Tyr: laL-Dopa es el precursor de las catecolaminas: adrenalina, noradrenalina
hormonas tiroideas: T3, T4
melanina
De Trp: serotonina, melatonina
Cys: taurina - se conjuga con cidos biliares (c. Tauroclico y c. Tauroquenodesoxiclico) y
est presente en bebidas energticas (Red Bull), pues parece que presenta actividad como
neurotransmisor inhibidor, acta como detoxificante y aumenta la contractilidad cardiaca.
His: histamina - regulador de la respuesta inmune local.
COOH
NH 3+ C H
R
Estructura de un aminocido
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Ka =
Ka
AH
A + H 3O +
H 2O
Log10 [ H 3O ] = ( Log10 K a
[ AH ]
[ A ]
[ A ][ H 3 O + ]
[ AH ]
]
[ H 3O + ] = K a [[AH
A ]
Por lo tanto:
[ A ]
pH = pK a + Log10
[ AH ]
En el caso de los aminocidos neutros, se establecen dos equilibrios en solucin acuosa entre
tres formas inicas distintas. Dichos equilibrios vienen determinados por las constantes de
equilibrio del grupo carboxilo (KC) y del grupo amino (KN):
H3O
+
Kc
H3O
+
KN
pKN = 9-10
pKC = 2-3
Catin
Zwitterion
ion dipolar
Anion
(Q +), pH < 6
especie (I)
(Q = 0), pH = 6-8
especie (II)
(Q -), pH > 8
especie (III)
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][ H 3O
K C = [ R [COO
R COOH ]
Si
la
Henderson-Hasselbalch,
se
utiliza
la
pH = pK C + Log10
formula
de
[ R COO ]
[ R COOH ]
ecuacin
de
pH = pK C + Log10
entonces
[ II ]
[I ]
Constante de equilibrio del grupo amino (KN): relaciona las formas inicas II & III y viene definida
por la siguiente ecuacin. K N =
Si
se
utiliza
la
pH = pK N + Log10
formula
[ R NH 2 ][ H 3O + ]
de
[ R NH 2 ]
+
[ R NH 3 ]
[ R NH 3 + ]
la
ecuacin
de
Henderson-Hasselbalch,
pH = pK N + Log10
entonces
[ III ]
[ II ]
Zwitterion o ion dipolar: se corresponde con la forma II, en la que el grupo -carboxilo y el grupo
amino estn disociados, por lo que la carga neta del aminocido es nula. A este pH, el
aminocido no presentara movilidad electrofortica.
Punto isoelctrico (pI): pH en que la carga neta del aminocido es nula; en este punto el
aminocido se encuentra en forma de ion dipolar, as como en pequeas cantidades equimolares
de aniones y cationes y una pequea fraccin de aminocido no ionizado. El pI de los
aminocidos neutros se localiza a pH 6-8.
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pI =
pKC + pK N
2
Aminocidos con un grupo disociable en la cadena lateral: son los aminocidos cidos Asp &
Glu, y los bsicos His, Lys & Arg. Existe un tercer equilibrio, que viene definido por su valor
pK, pKR (R = cadena lateral), y cuatro formas inicas. El orden de desprotonacin viene
determinado por la fuerza de disociacin de cada uno de los grupos, es decir, por el valor de los
pK. A modo de resumen, se puede decir que el orden de desprotonacin es el siguiente:
1. COOH (C): el equilibrio viene determinado por el pKC.
2. cadena lateral para Glu, Asp (COOH) e His (imidazol): el equilibrio viene determinado
por el pKR.
3. NH3+ (C): el equilibrio viene determinado por el pKN.
4. cadena lateral para Lys ( NH2) & Arg (grupo guanidino): el equilibrio viene determinado
por el pKR.
pI aa acidos =
pK C + pK R
2
pI aa basi cos =
pK N + pK R
2
Para realizar las demostraciones correspondientes, tambin se pueden utilizar las ecuaciones de
Henderson-Hasselbalch de los equilibrios inicos.
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AMINOCIDOS
Q A PH = 7.4
pI
CAPACIDAD TAMPON
neutros
> +
cidos
-1
bsicos
+1
10
His
7.59
pH 2 - 3
pH 9 - 10
pH 2 - 3
pH 9 - 10
pH 2 - 3
pH 3 - 4
pH 9 - 10
pH 2 - 3
pH 9
pH 10.5 - 12.5
pH 2 - 3
pH 6
pH 9 - 10
Asimismo, se puede observar que la solubilidad mxima de los aminocidos se localiza en las
zonas extremas del pH, y es mnima cuando pH = pI.
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sobre la tira de papel, que hace de puente entre los dos polos (que se encuentran en dos
cubetas con tampn a un pH determinado). La fuente de alimentacin se enciende, generando
un campo elctrico y transcurrido un cierto tiempo, se apaga, se retira el papel, se revela con un
reactivo apropiado y se identifican los componentes de la mezcla. La carga neta de cada
aminocido al pH en el que tiene lugar la electroforesis determinar la direccin y la velocidad de
la migracin electrofortica. De esta forma, se pueden separar los aminocidos presentes en una
mezcla en disolucin.
- Aquellos aminocidos cuyo pI = pH del tampn de electroforesis no presentarn carga neta, ya
que la forma predominante es el Zwitterion o ion dipolar; dichos aminocidos no presentarn
movilidad electrofortica.
- Aquellos aminocidos cuyo pI > pH estarn cargados positivamente y, por lo tanto se
comportarn como cationes se desplazarn hacia el polo negativo o ctodo.
- Aquellos aminocidos cuyo pI < pH estarn cargados negativamente y, por lo tanto se
comportarn como aniones se desplazarn hacia el polo positivo o nodo.
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