Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
BIOTECNOLOGIA
BIOTECNOLOGIA
Biotecnologa y Agricultura
15
16
IZQUIERDO, Juan
I.-Captulo1
Hacia una agricultura sustentable: las
alternativas de las ciencias de la vida y
de la biotecnologa
Izquierdo, Juan
1 El contexto del debate
En lnea con las conclusiones de la ltima
Cumbre de la Alimentacin de la FAO y diez
aos despus de la Cumbre de Ro y de la
adopcin de la Agenda 21, la Cumbre Mundial sobre Desarrollo Sustentable organizada
en Johannesburgo, Africa del Sur, por el Programa de las Naciones Unidas para el Medio
Ambiente (PNUMA), reforz que la sostenibilidad es cada vez ms un precepto crucial,
ampliamente aceptado y prioritario en el plano internacional dentro de un contexto integral que involucra la lucha contra la pobreza, el hambre y la malnutricin, la lucha contra las enfermedades infecciosas, la cooperacin tecnolgica, la educacin y la liberalizacin de los intercambios.
Las previsiones indican un importante
aumento de la demanda alimentaria, especialmente en los pases en vas de desarrollo,
lo que implica que para poder dar respuesta
a este reto una de las posibilidades es aumentar la superficie de terrenos cultivados.
Sin embargo, estos terrenos adicionales, limitados por la proteccin indispensable de
los entornos naturales, tan slo representaran una quinta parte del crecimiento de la
produccin mundial de cereales. Por consiguiente, resulta obligatoria la mejora del rendimiento y/o la adaptacin a condiciones
extremas de produccin (sequa, salinidad,
fro, altas temperaturas y otras) en zonas
poco aptas para la agricultura convencional
que permitan intensificar a los cultivos alimenticios y diversificar, sobre la base de especies
de cultivos introducidas o autctonas, alimenticias o volcadas al agroprocesamiento, la
base productiva de los pases de la regin.
En este desafo, en donde las ciencias de
la vida y la biotecnologa tienen un rol central, deben estar juntos todos los actores
del proceso del desarrollo (cientficos, legisladores, expertos en desarrollo, agricultores y
17
18
IZQUIERDO, Juan
cretos. Estas presentaciones servirn de valiosa introduccin general a los diversos temas e irn dirigidas a un pblico amplio, con
el fin de que ofrezcan una base para el inicio
del debate pblico.
6 Reforzar los conocimientos
Las ciencias de la vida y biotecnologa
(http://europa.eu.int/comm/
biotechnology/pdf/com2002-27_en.pdf) son
pilares en el contexto de la construccin de
una sociedad y una economa basada en el
conocimiento. Las inversiones en investigacin y desarrollo, en educacin y formacin y
en los nuevos enfoques de gestin tienen
una importancia clave para hacer frente a los
desafos de la biotecnologa y las ciencias de
la vida. Coherente con lo anterior, el
reforzamiento de los vnculos entre la investigacin y otras polticas socioeconmicas y
la necesidad de la participacin de los cientficos en el proceso de creacin de un consenso es parte de la creacin de nuevas asociaciones de investigacin entre los pases desarrollados y los pases en vas de desarrollo,
a fin de aprovechar al mximo las ventajas
de tecnologas prometedoras y el potencial
de la biodiversidad.
El libro Biotecnologa y Mejoramiento
Vegetal, para el cual he tenido el honor de
escribir este captulo, es producto del trabajo de un nmero importante de investigadores jvenes latinoamericanos. La obra representa una contribucin significativa a la
realidad de las instituciones acadmicas y de
investigacin en ciencias agronmicas y biolgicas al aportar conocimientos y el estado
del arte y llenar el vaco temporal en la disponibilidad de un libro en espaol de consulta actual, dando seguimiento a la obra pionera Cultivo de Tejidos en la Agricultura: Fundamentos y Aplicaciones realizada en 1991
y llevada a cabo por el Centro Internacional
de Agricultura Tropical bajo la edicin de los
Drs. William Roca y Luis Mroginski. La Oficina
Regional de la FAO para Amrica Latina y el
Caribe colabor con la edicin de dicho libro
y reafirma el inters por este tipo de material, que provee un conjunto de documentacin consolidada para el uso de estudiantes
y profesionales.
19
I.-Captulo 2
El papel de las nuevas biotecnologas
en la produccin agropecuaria
Pagliano, Daniel
1 Introduccin
La nueva economa determina que aquellas naciones que pretendan crecer y generar
riqueza debern necesariamente aceptar el
desafo que implica el aprender a utilizar los
idiomas digital y gentico. Es as entonces
que las empresas e instituciones basadas en
el uso intensivo del conocimiento son fundamentales en la creacin de prosperidad. Empresas de distinto porte han evolucionado y
crecido en el sector de la biotecnologa generando, directa e indirectamente, cientos
de miles de puestos de trabajo en todo el
mundo1 como resultado de inversiones que
se realizaron tanto en el sector pblico como
en el privado, y que hoy se consolidan a
travs de la generacin de un modelo productor de bienes y servicios. Entender este
continuum es vital.
Pero el punto principal es la creacin de
comunidades con visin competitiva. Es as
que desde un tiempo a esta parte muchos
pases desarrollados estn implementando
diferentes estrategias para impulsar el sector
de la biotecnologa como un rea prioritaria
de su economa, no slo por lo que significa
en trminos productivos sino tambin por lo
que significa culturalmente.
Para los pases latinoamericanos es entonces fundamental entender que hay que buscar un lugar dentro de esta nueva economa,
que es una economa de conceptos ms que
una economa de toneladas, y a la vez tratar
de establecer parmetros de desarrollo
sustentables que generen inversin, empleo
genuino y valor agregado.
El incremento de la demanda por factores de productividad y calidad en el producto terminado exige la utilizacin de tecnologas que introduzcan calidad en el material
inicial y que la continen y expandan hasta
The economic contributions of the biotec industry of the US
economy.
Informe realizado por Ernst & Young, Mayo 2000. www.bio.org
1
21
22
PAGLIANO, Daniel
dades de la regin puedan analizar y canalizar lo que est pasando en pases como Estados Unidos, Inglaterra, Blgica, Canad y Australia, donde existe una fuerte integracin de
las carreras cientfico-tecnolgicas con escuelas de negocios, integrando la visin comercial al desarrollo de la ciencia y la tecnologa.
En este sentido la regin posee una excelente capacidad cientfica-tecnolgica, pero
debe complementarla con la capacidad de
gestin de la tecnologa. Se requiere, por
ejemplo, del marketing (mercadeo) para
poder vender productos fuera de la regin,
para lo cual habr que estudiar y comprender los mercados que van a recibir nuestros
productos.
Para esto, es menester lograr sinergias
entre cientficos y empresarios, y potenciar
la formacin de nuevas empresas a partir del
reconocimiento de la capacidad de la
biotecnologa de la regin.
4 Conclusiones
Para la regin es muy importante, sin
duda, continuar trabajando en el camino
emprendido, buscando forjar las alianzas estratgicas entre los mbitos pblico y privado de las bioindustrias, coordinando esfuerzos en investigacin y desarrollo hacia obje-
23
PARTE II
Herramientas Bsicas
25
26
RADICE, Silvia
II.-Captulo 1
Morfognesis in vitro
Radice, Silvia
1 Introduccin
La embriognesis somtica y la
organognesis son dos procesos morfognicos muy frecuentes en el cultivo in vitro de
especies vegetales. La embriognesis somtica es el proceso por el cual se obtiene una
estructura similar al embrin zigtico sin que 2 Tipos de morfognesis. Definiciones
medie la fertilizacin de las gametas, mienEn condiciones de cultivo in vitro, las ctras que por organognesis pueden obtenerse tallos, races o flores. Estos rganos son lulas somticas pueden regenerar embriones
inducidos a partir de una clula o de un gru- (Fig. 1) o brotes, races y/o flores (Fig. 2) como
po de clulas que, segn las condiciones de respuesta a un determinado estmulo. La recultivo, tienen la propiedad
de mantenerse en activa divisin.
Esta totipotencialidad
celular haba sido anunciada
por Haberlandt en 1902,
quien propuso la teora de
que todas las clulas vegetales tienen la capacidad de
regenerar plantas completas. Este autor, sin embargo, no pudo demostrar su
hiptesis debido a que no
pudo lograr la divisin celular porque los medios de
cultivo que empleaba no incluan reguladores del crecimiento, an desconocidos
en ese entonces. Los avances en cultivo de tejidos fueron muy lentos en sus inicios. En 1934, White pudo
mantener en forma ilimitada el crecimiento de races
en medios lquidos a partir
de pices de tomate. Al mismo tiempo se identific el
cido indol actico (AIA),
Figura 1: A-F) Embriognesis somtica obtenida por cultivo in vitro. A, C y E)
que posibilit el manteni- Embriognesis somtica en diferentes fases de crecimiento observada en
miento indefinido in vitro Codiaeum variegatum (L) Blume cultivado en MS + 1 mg l-1 de BAP. B, D y F)
sp a partir
de callos de zanahoria y ta- Embriognesis somtica obtenida en diversos cultivares de Prunus
de embriones zigticos inmaduros cultivados en MS + 0,1 mg l-1 de ANA + 1
baco.
mg l-1 de Kin con una previa induccin en MS + 2 mg l-1 de 2,4-D. Las barras
Posteriormente se des- representan 5 mm.
27
28
RADICE, Silvia
3 Histologa de la morfognesis
Despus de 48 horas de realizada la siembra del explante en el medio de cultivo adecuado, a partir de una clula epidrmica o del
mesfilo foliar, como ocurre en las conferas,
se suceden una serie de divisiones mitticas.
As se pueden observar, a travs del estudio
histolgico, pequeas masas de clulas que
contienen un citoplasma denso y grandes
nuclolos. Este conjunto de clulas agrupadas a modo de esferas fueron denominadas
meristemoides por Torrey en 1966, y son los
responsables de la diferenciacin de los nuevos rganos. Este tipo de meristema puede
iniciarse en forma directa a partir de clulas
diferenciadas, pertenecientes a un explante
cultivado in vitro o, indirectamente, a partir
de una clula o grupo de clulas diferenciadas que promueven la proliferacin celular
(Fig. 4 A). Su evolucin determinar el crecimiento de un rgano como, por ejemplo,
una yema adventicia (Fig. 4 B).
Las clulas embriognicas son similares a
las clulas meristemticas debido a que no
son demasiado voluminosas, tienen gran cantidad de ribosomas, citoplasma denso, un
nuclolo agrandado y pequeos granos de
almidn. Estas clulas en general se agrupan
y pueden variar en tamao y nmero. Dentro de un grupo de clulas embriognicas, el
desarrollo de las mismas no est sincroniza-
29
den observarse diversos patrones. Los embriones somticos se forman a partir de grupos de clulas epidrmicas y subepidrmicas
(Fig. 4 C). Este tipo de ontogenia de origen
multicelular se llama comnmente budding
o embriognesis adventicia. Estas clulas
pequeas tienen una alta relacin ncleo/
citoplasma, un denso citoplasma y un
nuclolo voluminoso y teido. Se diferencian
de las clulas embriognicas por la falta de
sustancias de reserva, por su delgada pared
celular y su frecuente divisin celular. Estas
estructuras pueden ser denominadas como
proembriones globulares (Fig. 1 A y B). En una
etapa posterior, desarrollan una epidermis,
un tejido provascular, acumulan material de
reserva y tambin sufren la polarizacin. Estas estructuras globulares producen cotiledones y se transforman en embriones somticos
con la formacin de pices de tallo y raz.
Para una misma especie puede ocurrir uno
u otro tipo de inicio segn las condiciones de
cultivo. El desarrollo de un embrin somtico de origen unicelular es comparable a la de
un embrin zigtico. En dicotiledneas, la
etapa globular es seguida por una etapa corazn que se corresponde con la adquisicin
de la simetra bilateral: desarrollo de la epidermis, de los estratos procambiales y, de
manera sucesiva, el desarrollo del pice radical. El pice de tallo se desarrolla ms tarde
en la etapa de cotiledonar. En los embriones somticos de algunas especies hay una
etapa intermedia entre la globular y corazn
llamada oblonga, que corresponde a la individualizacin del pice de la raz y al
procambium en respuesta a la elongacin
axial del embrin somtico debido al transporte de auxinas (Fig. 1 C).
Los embriones de origen multicelular obtenidos por budding muestran la misma
ontogenia que los zigticos, as como tambin la produccin de sustancias de reserva.
Sin el seguimiento histolgico detallado,
la formacin del embrin somtico slo puede ser confirmado por la germinacin (Fig. 1
F). Sin embargo debido al bajo porcentaje
de embriones que llegan a esta etapa, esta
tarea es casi imprescindible para una correcta evaluacin de las respuestas encontradas
con los diversos medios de cultivo empleados.
Los embriones somticos, comparados
con los embriones zigticos de la misma es-
30
Los cuatro factores principales que condicionan la obtencin y el crecimiento de nuevos rganos en condiciones in vitro son:
el genotipo
las condiciones qumicas seleccionadas
para realizar el cultivo
las condiciones fsicas seleccionadas para
realizar el cultivo
el explante
El genotipo es un factor determinante
en todos los procesos morfognicos desde
la capacidad del explante para su establecimiento en condiciones in vitro as como tambin para la proliferacin de callo, o la diferenciacin y crecimiento de nuevos rganos.
Por esta causa, no es posible generalizar
metodologas o protocolos de trabajo debido a que los medios de cultivo como las condiciones de cultivo seleccionados, deben ser
especficos para cada situacin en particular.
Un ejemplo de ello es el protocolo empleado por Stamp y Meredith en diferentes
cultivares de Vitis vinifera. En cuatro de ellos
fue posible la obtencin de embriones
somticos a partir de embriones zigticos,
pero estos resultados no se repitieron con el
cultivar Pinot Noir.
RADICE, Silvia
31
ferente para cada tipo de tapa; en consecuencia, la atmsfera interna tambin sufrir variaciones.
En condiciones in vivo la atmsfera contiene 78 % de nitrgeno; 21 % de oxgeno y
0,035 % de dixido de carbono. En cultivos
in vitro se han registrado, adems, etileno y
otros compuestos hidrocarbonados.
El nivel de oxgeno disponible para el
explante condiciona el crecimiento y los procesos morfognicos. En general se necesita
una buena aireacin para obtener cualquier
tipo de proceso morfognico. En alfalfa se
puede obtener un buen incremento de material a partir de suspensiones celulares
embriognicas cuando la solucin se satura
con 70% de oxgeno en la solucin. Por el
contrario, una tensin de oxgeno del 5 %
estimula la produccin de plantas a partir de
anteras de tabaco.
La concentracin de dixido de carbono
(CO2) en la atmsfera gaseosa in vitro vara
segn la respiracin y la actividad
fotosinttica de las plantas. En condiciones
de oscuridad, el CO2 se incrementa mientras
que, en condiciones de luz disminuye. En trabajos realizados con Ficus lyrata se han encontrado concentraciones variables que van
del 0,5 al 8,5 %, segn el tipo de sello o tapa
empleados. Estas concentraciones superiores
a 1 %, generalmente txicas para las condiciones in vivo, probablemente no son
limitantes para la actividad fotosinttica.
La presencia de etileno en condiciones in
vitro promueve diversas respuestas. Para el
cultivo de clulas, callos y anteras, su acumulacin tiene efectos inhibitorios. La cantidad
de etileno producida in vitro vara con la especie, el tipo de explante, la concentracin
de citocininas en el medio de cultivo, el tipo
de agar seleccionado y con la luz. Una forma
de incorporar etileno al envase de cultivo es
a travs de la esterilizacin del material de
diseccin realizada con el material embebido en alcohol y flameado con mechero
Bunsen. En muchos casos, el etileno acta
como promotor de la morfognesis, pero luego es inhibitorio del crecimiento de los rganos diferenciados.
RADICE, Silvia
pus de seis semanas de cultivo in vitro previa inmersin del explante en una solucin
de IBA (1 mg l1) durante 20 minutos (Fig. 5).
5 Lecturas recomendadas
BUDDENDORF-JOOSTEN, J.M.C. and WOLTERING, E.J.
1994. Components of the gaseous environment and their
effects on plant growth and development in vitro. Plant
Growth Regulation 15: 1-16.
DE KLERK, G.J., Arnholdt-Schmitt B., Lieberei R. and
Neumann K.H. 1997. Regeneration of roots, shoots and
embryos: physiological, biochemical and molecular
aspects. Biologia Plantarum 39 (1): 53-66.
GEORGE, E. 1993. Plant propagation by tissue culture
Part 1 The technology. Butler and Tanner Ltd (ed). Gran
Bretaa. 1361pp.
33
II.-Captulo 2
Establecimiento de cultivos de tejidos
vegetales
Mroginski, Luis; Sansberro, Pedro;
Flaschland, Eduardo
1 Introduccin
El cultivo de tejidos en su acepcin amplia puede ser definido como un conjunto
muy heterogneo de tcnicas que presentan
en comn el hecho de que un explante (una
parte separada del vegetal que pueden ser
protoplastos clulas desprovistas de pared
celular clulas, tejidos u rganos) se cultiva
aspticamente en un medio artificial de composicin qumica definida y se incuba en condiciones ambientales controladas. La imprecisin de esta definicin puede generar muchas polmicas, pero es actualmente aceptada.
Generalmente es comn dividir las tcnicas del cultivo de tejidos en dos grandes grupos: a) cultivos en medios semislidos y b)
cultivos en medios lquidos, los que a su vez
pueden ser agitados (mediante el empleo
de agitadores de uso continuo) o estacionarios. Tambin es frecuente dividir al cultivo
de tejidos atendiendo a los niveles de complejidad en cultivo de rganos, cultivos celulares y cultivo de protoplastos. Para el establecimiento de los cultivos utilizando cualquiera de los sistemas es necesario tener en cuenta algunos aspectos generales comunes relacionados con el explante, la asepsia, el medio de cultivo y las condiciones de incubacin.
La discusin de estos aspectos constituye el
objetivo de este captulo. Adicionalmente se
incluye el tema de la aclimatacin de las plantas regeneradas in vitro, que es de gran importancia en la mayora de las aplicaciones
del cultivo de tejidos en la agricultura.
2 Explante
Varios factores deben ser tenidos en cuenta en la eleccin del explante apropiado para
el establecimiento de los cultivos in vitro,
entre ellos:
1. Objetivo del cultivo: si bien es difcil tratar de clasificar las aplicaciones que se persiguen con el cultivo de tejidos, se podra
esquematizarlas en aplicaciones para:
35
36
37
38
39
crecimiento de los cultivos. El carbn activado (0,1 a 5%) suele ser incorporado al medio, dado que es probable que absorba
metabolitos txicos para los cultivos.
En algunos medios se incorporan cidos
orgnicos como el mlico, el ctrico, el pirvico
y el succnico y es frecuente el empleo de Lglutamina y de casena hidrolizada. An hoy
se siguen utilizando ciertas sustancias de composicin qumica indefinida como el agua de
coco (5 a 15%), jugo de tomate y pur de
banana. Tambin en ocasiones es necesaria
la incorporacin de agentes antioxidantes (Lcistena, cido ascrbico, polivinilpirrolidona)
para prevenir el ennegrecimiento tisular causado por la oxidacin de polifenoles presentes en los explantes. Este ennegrecimiento
puede causar la muerte de los mismos.
La preparacin de los medios de cultivo
puede llevarse a cabo de diferentes maneras, en lecturas recomendadas se citan
manuales de laboratorio donde se describe
detalladamente este punto.
calidad e intensidad de luz, fotoperodo, humedad atmosfrica e higiene. Estas condiciones se logran con el empleo de cmaras
climatizadas o cuartos especialmente preparados con aire acondicionado (fro-calor), una
buena y uniforme circulacin de aire en el interior, dotados de un buen sistema de alarma para interrumpir la iluminacin en caso
de no funcionar el aire acondicionado.
En general, los cultivos son incubados a
temperatura constante de 25-28 C, con ciclo de luz/oscuridad de 16/8horas. La luz es
generalmente provista por lmparas
fluorescentes del tipo luz da con una
irradiancia de entre 50 y 200mol.m-2.s-1.La
humedad atmosfrica debe ser elevada (8090%).
6 Aclimatacin de las plantas
regeneradas in vitro.
Durante el perodo de incubacin, los cultivos son expuestos a condiciones ambientales dismiles al ambiente externo.
Tabla 1: Composicin de tres medios bsicos usados en el cultivo La atmsfera interna se caracteriza
in vitro de tejidos.
por presentar una considerable variacin diurna en la concentracin de
CO2, humedad relativa elevada, temperatura constante e intensidad
lumnica baja. A su vez, el medio de
cultivo compuesto por concentraciones elevadas de azcares (en aquellos sistemas heter-trofos y
semiauttrofos de micropropagacin), sales y reguladores del crecimiento, sumado a la ausencia de
microorganismos, generan anormalidades morfolgicas, anatmicas y fisiolgicas que las plantas debern corregir cuando son transferidas al ambiente externo. Este perodo de
adaptacin al nuevo hbitat es llamado fase o etapa de aclimatacin.
La estrategia a implementarse durante el mencionado ciclo deber contemplar el control minucioso de los
parmetros ambientales (humedad,
temperatura y luz) de tal manera que
permita disminuir la deshidratacin y,
al
mismo
tiempo, estimular la fotosntesis con
5 Condiciones ambientales para la
el
objeto
de generar un rpido crecimiento
incubacin.
de los plantines.
La incubacin de los cultivos se debe lleEl retraso en el desarrollo de la cutcula y
var a cabo en condiciones controladas. Por la escasa funcionalidad del aparato estomlo menos en lo que se refiere a temperatura, tico que presentan las hojas de la mayora
40
de las especies cultivadas in vitro, determinan una alta tasa de transpiracin que puede ocasionar la muerte por deshidratacin.
El control de este proceso fisiolgico es de
vital importancia durante la aclimatacin, teniendo en cuenta que la disminucin de la
transpiracin ser gradual y depender de la
rehabilitacin de los estomas, as como tambin del desarrollo de la cutcula. El equipamiento necesario estar sujeto a la especie, pudiendo utilizarse desde tneles de
polietileno para plantas que posean un elevado control de la transpiracin (por ej.
Malus pumila o Agave tequilana) o bien, a
travs del empleo de cmaras climatizadas
(Fig.1) equipadas con sensores que permiten
un descenso paulatino de la humedad relativa. En algunos casos puede resultar necesaria la aplicacin exgena de ABA (hormona
involucrada en el control del cierre de los
estomas) o bien, el empleo de sustancias
antitranspirantes que forman una capa
semipermeable en la superficie de la hoja. En
este ltimo caso debern tomarse algunas
precauciones debido a que pueden observarse reacciones de fitotoxicidad.
Resulta imprescindible evitar la exposicin
a temperaturas extremas tanto en la fase
area como en el substrato. Mediante el
empleo de extractores y/o acondicionadores
de aire combinados con un sistema de niebla, es posible establecer la temperatura de
la fase gaseosa entre los 25 y 30 C durante
la estacin estival, mientras que en la poca
invernal es necesario, a veces, el empleo de
mantas trmicas o serpentinas, sea de agua
o aire caliente a nivel del substrato, para
mantener la temperatura por encima de los
18-20 C.
Sin lugar a dudas, la opcin ms econmica es el empleo de la luz natural, disminuyendo su irradiancia (20-50%) mediante el
agregado de mallas de sombreado (saram).
No obstante, en aquellas latitudes donde el
nivel medio de luz natural es bajo y los das
son cortos durante una parte considerable
del ao, la luz artificial puede ser aplicada
como complemento de la luz natural. Las lmparas tubulares fluorescentes del tipo luz
da son empleadas en horticultura para prolongar el fotoperodo. Asimismo, las lmparas tubulares de sodio alta presin presen-
41
7 Agradecimientos
Los autores agradecen
al Ing. Pablo F. Luna por
la planificacin digital de
la cmara de aclimatacin. A la Secretara General de Ciencia y Tcnica
(UNNE) y al Establecimiento La Cachuera por el
aporte financiero recibido
para construir la misma.
8 Lecturas
Recomendadas
GEORGE, E.F.; D.J.M. PUTTOCK y
H.J. GEORGE. 1987. Plant Culture
Media . Vol. 1 (Formulations and
Uses). Exegetics Limited.
England. 567 pg.
GEORGE, E.F.; D.J.M. PUTTOCK y
H.J. GEORGE. 1988. Plant Culture
Media . Vol. 2 (Commentary and
analysis). Exegetics Limited.
England. 420 pg.
HURTADO, D.V. y MERINO, M.E.
1991. Cultivo de Tejidos
Vegetales. Ed.Trillas. Mxico. 232
pg.
42
II.-Captulo 3
Herramientas bsicas de ingeniera
gentica
Gmez, Marisa; Echenique, Viviana
1 Introduccin
Hasta aproximadamente 1970 el ADN era
la molcula de la clula que planteaba ms
dificultades para su anlisis bioqumico. Excesivamente larga y qumicamente montona,
la secuencia de nucletidos del ADN slo
poda ser estudiada por caminos indirectos,
tales como la determinacin de la secuencia
de protenas, del ARN o por el anlisis
gentico. Actualmente es posible separar regiones determinadas del ADN, obtener cantidades ilimitadas de esos fragmentos y determinar incluso la secuencia de esos
nucletidos. Estos adelantos tcnicos forman
parte de la tecnologa del ADN recombinante, constituida por una mezcla de tcnicas, algunas de las cuales son nuevas, pero
otras son adaptaciones de procesos naturales de la gentica microbiana que han sido
estudiados y se conocen en profundidad.
2 Gentica microbiana
En los procariotas existen mecanismos de
intercambio gentico que permiten tanto la
transferencia de genes como la recombinacin. La recombinacin gentica en procariotas ocurre porque se transfieren fragmentos
de ADN homlogos desde un cromosoma
donador a una clula receptora por uno de
estos tres procesos:
Transformacin: es un proceso por
cual el ADN libre del medio ambiente se incorpora en una clula receptora, trayendo
aparejado un cambio gentico. Esto ocurre
slo en algunas especies bacterianas. El movimiento de las molculas de ADN a travs
de la membrana y dentro del citoplasma de
la clula receptora es un proceso activo, que
requiere energa. Una clula que es capaz de
tomar una molcula de ADN y ser transformada se dice que es competente. Estas clulas secretan el factor de competencia, que es
43
44
ADN forneo
a insertar
Ligacin
Vector
plasmdico
Gen de resistencia
a antibitico
Molcula de ADN
recombinante
Introduccin en la
clula hospedadora
4 Herramientas y procedimientos
implicados.
Endonucleasas de restriccin
La habilidad para clonar cualquier gen o
secuencia de ADN de inters, depende, en
gran medida, de un tipo especial de enzimas
denominadas endonucleasas de restriccin,
que son enzimas que cortan la molcula de
ADN en sitios especficos denominados sitios
de restriccin. Estas enzimas reconocen secuencias especficas de 4 a 8 bases. Las diferentes endonucleasas de restriccin son
producidas por distintos microorganismos,
para los cuales constituyen un mecanismo de
defensa contra el ataque de fagos. Cuando
el ADN de un fago ingresa en la clula
bacteriana, sta lo degrada gracias a su batera de enzimas de restriccin. Para proteger su propio ADN, las bacterias contienen
enzimas (metilasas) que se encargan de
modificar (metilar) ciertas bases en los sitios
que reconocen sus propias enzimas de restriccin, de manera que ya no pueden reconocer dichos sitios de clivaje. La metilacin
ocurre rpidamente despus de la replicacin,
catalizada por metilasas producidas por el
microorganismo.
Las enzimas de restriccin se denominan
utilizando la primera letra del gnero y las
dos primeras letras de la especie que la produce, seguidas por un nmero que indica el
orden en que han sido identificadas las
enzimas correspondientes a la misma especie (Tabla 1). Una interesante caracterstica
de las enzimas de restriccin es que comn-
Organismo
Designacin
Secuencia
Nota
Bacillus subtilis
BsuRI
Escherichia coli
EcoRI
Escherichia coli
EcoRII
Escherichia coli
EcoRV
Haemophilus
influenzae
HindII
5..GGCC..3
3..CCGG..5
5..GAATTC..3
3..CTTAAG..5
5..CCAGG..3
3..GGTCC..5
5..GATATC..3
3..CTATAG..5
5..GTPyPuAC..3
3..CAPuPyTG..5
Genera extremos
cohesivos
No palindrmica
Genera extremos romos
Pu: cualquier purina
Py: cualquier pirimidina
45
Figura 2: Mecanismo de corte del ADN por las enzimas de restriccin.. a. Corte en secuencias palindrmicas
originando extremos cohesivos (ej. enzima EcoRI). b. Corte en el centro de la secuencia de reconocimiento de la
enzima, originando extremos romos (ej enzima Hind II). c. Incorporacin de extremos cohesivos a un fragmento de
extremos romos por la transferasa terminal. (Modificado de Watson y col., 1992).
Vectores de clonacin
Como se mencionara ms arriba, un
vector es una molcula de ADN que
vehiculizar al fragmento de inters y permitir su amplificacin. Los vectores de
clonacin ms utilizados derivan del genoma
viral o de plsmidos bacterianos. Un vector
de clonacin tiene tres componentes esenciales:
1. Un origen de replicacin
2. Un gen marcador fcilmente seleccionable
3. Al menos un sitio nico de restriccin
46
47
48
C
Figura 4: Vectores de clonacin.. a. Utilizacin del
fago. 1. Dos sitios de restriccin EcoRI en el ADN del
fago. 2. Regin central no esencial del fago 3. El ADN
forneo puede reemplazar al segmento no esencial del
ADN del fago 4. Unin con ADN ligasa, se eligen las
condiciones para que el ADN hbrido tenga la longitud
adecuada para ser empaquetada dentro de la partcula
del fago y 5. Empaquetamiento del ADN hbrido
aadiendo extractos celulares que contengan las
partculas de la cabeza y cola para permitir la formacin
de partculas viables del fago. b. Cromosoma artificial
de levadura (YAC). ARS: origen de replicacin, CEN:
centrmero, TEL: telmeros, URA. gen marcador
seleccionable par el desarrollo en medio con uracilo.
Modificado de Watson et al., 1992). c. Cromosomas
artificiales de bacterias (BAC) (Modificado de Griffith et
al., 2000).
C) Csmidos:
Son vectores hbridos, que combinan las
caractersticas ventajosas de los plsmidos
bacterianos y del fago . Cos proviene de
sitio cohesivo (cohesive site), en referencia a las secuencias terminales de simple cadena de 12 bases complementarias en el
cromosoma de maduro. El sitio cos es reconocido por el sistema de empaquetamiento de ADN de , que hace cortes escalonados que originan los extremos
cohesivos complementarios en el cromosoma
maduro del fago. Poseen la habilidad del
plsmido para replicarse autnomamente en
las clulas de E. coli y la capacidad de
empaquetamiento in vitro del cromosoma
de . Contienen el origen de replicacin y los
genes de resistencia a los antibiticos de su
plsmido parental. La principal ventaja de los
csmidos como vectores es su habilidad para
insertar fragmentos de ADN de 35 a 45 kb.
D) Fsmidos (fagmidos):
Son vectores que combinan las caractersticas de un fago filamentoso (M13) y un
plsmido (pBR323) y contienen tanto el origen de replicacin del fago como del
plsmido. Normalmente la replicacin depende del plsmido, pero cuando una clula que
contiene un fsmido se infecta con un fago
de tipo silvestre, el origen del fago es responsable de la replicacin y se generan copias
Figura 5: Mtodo de hibridacin de Southern. a. Inclusin del ADN en el gel de agarosa. b. las molculas de ADN
migran a travs del gel dependiendo de su tamao y forma, c. transferencia de las molculas de ADN del gel a una
membrana por capilaridad (S. Solucin tampn, M: mecha, A gel de agarosa, N: membrana de nitrocelulosa, P:
papel de filtro y peso), d. incorporacin de la sonda e hibridacin con las molculas de ADN, f: deteccin por
autorradiografa, contacto de la membrana con el filme autorradiogrfico, g: revelado de la autorradiografa,
observacin de las bandas hibridadas. (Modificado de Micklos et al., 1990).
49
50
Figura 6: Reaccin en cadena de la polimerasa. a) Los tres pasos de un ciclo de PCR. En primer lugar se eleva la
temperatura de la reaccin para separar las hebras de ADN (1) y a continuacin la temperatura baja nuevamente, lo
que permite que los cebadores o primers se peguen a las regiones adecuadas de la hebra de ADN (2), y entonces
se ensamblan, actuando como lmites de la regin de la molcula que va a ser duplicada. Para terminar, se eleva la
temperatura nuevamente y la Taq polimerasa comienza a copiar (3), y sobre la plantilla crece una hebra nueva
complementaria (4). Despus de varios ciclos se obtienen mltiples copias del fragmento en cuestin. b) La PCR es
una reaccin donde el nmero de copias del gen de inters crece exponencialmente. c) Verificacin de un producto
de PCR sobre un gel de agarosa. En primer calle se observa un producto de aproximadamente 1850 pares de bases
(bp) de longitud, en la calles 2 y 4 fragmentos de 800 bp, en la calle 3 fall la amplificacin y en la calle 5 se han
formado tres bandas debido a que el primer ha encontrado complementariedad en ms de un sitio en el genoma.
51
52
millones de copias de un segmento especfico de ADN. La reaccin se basa en la hibridacin y extensin de un par de oligonucletidos, sintetizados artificialmente, utilizados como iniciadores o cebadores (primers)
que delimitan una secuencia de ADN de doble cadena que se desea amplificar.
Un ciclo de PCR comprende tres etapas
(Fig. 6): desnaturalizacin de la doble cadena, unin de una secuencia de ADN (primer) a la hebra simple y replicacin del
ADN a partir del primer. La doble cadena
de ADN se desnaturaliza por elevacin de la
temperatura a 92-95C. Luego la temperatura se baja rpidamente a 35-60C, dependiendo del tamao y secuencia del oligonuclotido utilizado, permitiendo la hibridacin
ADN-ADN de cada primer con las secuencias
complementarias que flanquean la regin
objetivo. Luego, se eleva la temperatura a
72 C para que la Taq polimerasa (una ADN
polimerasa termoresistente aislada de
Thermus aquaticus, bacteria que vive en
fuentes termales) realice la replicacin a partir de cada extremo 3 de los primers. Este
ciclo es repetido por algunas decenas de veces y, como el producto de cada
polimerizacin sirve como molde para el siguiente, cada ciclo duplica la cantidad de
producto del anterior. El resultado de la reaccin es un fragmento de ADN de doble
cadena, cuyos extremos corresponden a los
extremos 5 de los primers y su tamao a la
distancia entre los mismos. A pesar de que
se forman molculas ms largas a partir del
molde original en cada ciclo, se acumulan solo
a una tasa lineal y no contribuyen significativamente a la masa final de secuencia blanco.
Despus de apenas 20 ciclos se logra ms
de un milln de veces la cantidad inicial de
la secuencia de inters. Esta escala de amplificacin permite, por lo tanto, iniciar el proceso con cantidades mnimas de ADN (del
orden de pico o nanogramos) y terminar la
reaccin con grandes cantidades de una secuencia de inters. La versatilidad de esta
reaccin es enorme y la combinacin de la
PCR y la secuenciacin constituye una poderosa herramienta para el anlisis de genes.
La tecnologa de PCR es de suma utilidad
para amplificar ADN a partir de fragmentos
clonados en distintos vectores. Solo se nece-
RT-PCR
La reaccin de PCR en unin con la transcripcin reversa (RT-PCR) puede ser utilizada para el estudio de ARNm casi a nivel de
una clula individual. Esta tcnica puede utilizarse para determinar la presencia o ausencia de un transcripto, para estimar el nivel
de su expresin y para el clonado de ADNc
sin la necesidad de construir una genoteca.
Consiste en la sntesis de una cadena de ADN
a partir de ARNm por medio de la
transcriptasa reversa (enzima extrada de
virus tumorales cuyo material gentico es
ARN), que utiliza ARN como molde para sintetizar una hebra de ADN. La cadena complementaria se sintetiza por PCR .
Subsecuentes ciclos de PCR nos permiten tener cantidades apropiadas del ADNc para
diversas manipulaciones genticas.
PCR cuantitativa
La clave en la PCR cuantitativa es la posibilidad de detectar el nivel de amplificacin
de una secuencia de inters, con el objeto
de estimar la cantidad de esa secuencia en la
muestra original. Para llevar a cabo esta deteccin existen varios mtodos pero casi todos basados en la utilizacin de otro fragmento de ADN (sonda) complementario a
una parte intermedia del ADN que se quiere
amplificar. Esta sonda lleva adherida una
molcula fluorescente y otra molcula que
inhibe esta fluorescencia (quencher), de
tal forma que slo cuando la sonda es desplazada de su sitio por accin de la ADN
polimerasa la molcula fluorescente se libera de la accin del quencher y emite fluorescencia al ser iluminada con un lser. La
fluorescencia detectada durante cada ciclo
de la PCR ser proporcional a la cantidad
de ADN que se est amplificando. En gene-
53
54
Estas colas de poliA tambin son utilizadas en el prximo paso de clonado. La reaccin consiste en poner en contacto el ARNm
aislado con oligo(dT) de 12 a 20
desoxitiminas que actan como cebadores o
primers para la transcriptasa reversa. El producto de la reaccin es un hbrido ARN-ADN.
El problema que tiene esta tcnica es que si
el ADNc es muy largo, al comenzar en el extremo 3, muchas veces no se llega al extremo 5. Para salvar esta dificultad existe otra
tcnica donde se utilizan primers al azar. Estos constan de 6 a 10 nucletidos de longitud y estn confeccionados de manera de
representar muchas secuencias diferentes,
por lo que la reaccin comienza a partir de
muchos sitios diferentes, no slo del extremo 3. Por cualquiera de los dos mtodos se
obtiene un hbrido ARN-ADN, a partir del cual
se obtienen molculas de ADN de doble cadena que puede clonarse en el vector apropiado.
El primer mtodo desarrollado para obtener la segunda cadena tomaba ventaja de
una vuelta o giro que da la hebra recin
sintetizada, como un efecto de cambio de
rumbo de la transcriptasa reversa al llegar al
final de la cadena de ARN. Este artefacto provee un cebador adecuado para la sntesis de
la segunda cadena de ADN y puede eliminarse una vez obtenida la segunda cadena, con
una nucleasa S1, perdindose parte de la
secuencia correspondiente al extremo 5 del
mensajero.
Existe una segunda tcnica, que presenta dos ventajas sobre la anterior. Una es que
genera molculas de ADNc ms largas y la
segunda es que contiene prcticamente toda
la secuencia correspondiente al extremo 5.
Se basa en la utilizacin de la enzima RNasaH,
que reconoce molculas hbridas ARN-ADN y
digiere la cadena de ARN dejando trozos
pequeos que permanecen unidos a la primera cadena del ADNc y sirven como primers
para la ADN polimerasa I, que usa el ADNc
original como molde para sintetizar la hebra
complementaria de ADN. Slo queda un pequeo segmento de ARN en el extremo 5.
La segunda cadena de ADN tiene algunos sectores no unidos que son sellados por una
ligasa de ADN.
Estas molculas de ADNc de doble cadena estn listas ahora para ser insertadas en
55
56
Cuando se trata de genomas muy grandes, como es el caso del humano o de varias
especies vegetales y animales la utilizacin de
csmidos resulta ineficiente. Por ello en estos casos se utilizan los YAC y BAC.
A) Genotecas genmicas en cromosomas artificiales
La capacidad de clonar fragmentos de
ms de 100 kb es crucial para la genmica
estructural, funcional y comparativa de organismos complejos. El primer sistema de
clonado de grandes fragmentos de ADN fue
informado en 1987 por Burke y colaboradores. Este sistema estaba basado en YAC, que
permitan clonar y mantener fragmentos de
ms de 1000 kb en levaduras. Debido a esta
ventaja el sistema fue rpidamente adoptado para los proyectos de genmica. Sin embargo, tienen algunos problemas que limitan
su utilizacin, como el alto nivel de
quimerismo o insertos hbridos (artefacto
que resulta de la unin de fragmentos no
contiguos en el genoma original en un mismo clon), la inestabilidad de los insertos y la
dificultad de purificar los
insertos clonados.
Para minimizar estos
problemas se desarrollaron
sistemas alternativos que
utilizan bacterias en lugar
de levaduras: los BAC y los
PAC, que son vectores de
clonacin de copia simple.
Cuando se los utiliza para
transformar plantas se los
llama BIBAC. BAC y PAC
pueden contener establemente fragmentos mayores de 300 kb en E. coli.
Para preparar una
genoteca genmica, el ADN
se corta con enzimas de
restriccin o, para evitar la
presencia de fragmentos
demasiado largos o cortos,
se fragmenta al azar. Un
paso crtico en el proceso es
el aislamiento de molculas
intactas de ADN de elevado peso molecular, esencialmente ADN cromosmico. Para ello las clulas se
embeben en bloques de
agarosa de baja temperatura de gelificacin y se
tratan con en-zimas y otros
Figura 8: Bsqueda de imgenes en una genoteca genmica. Utilizacin de la reaccin en cadena de la polimerasa
para buscar un gen especfico en una genoteca de BACs. Las 180 placas de cultivo, de 96 pocillos, contienen un
genoma vegetal completo. Estas placas se replican, de a 4, en filtros o membranas. Todos los clones de un mismo
filtro son juntados y varios de estos conjuntos de clones son agrupados para preparar agrupaciones de conjuntos.
El ADN de estos conjuntos se aisla y se amplifica por PCR utilizando primers especficos para el gen de inters. Como
control positivo se utiliza un ADN vegetal, tambin amplificado por PCR. La reaccin se analiza sobre un gel de
agarosa. Un resultado positivo indica la presencia del gen en el ADN genmico del vegetal y tambin en uno de los
clones. En este caso en el conjunto que contena los filtros 1-3. Cuando se chequean los conjuntos individuales se
encuentra que el clon positivo pertenece al filtro 1. El producto de PCR se hibrida luego con este filtro y esto nos dar
la posicin exacta en la placa de 96 pocillos donde se encuentra el gen de inters (Modificado de Watson et al.,
1992).
57
reactivos para separar el ADN de las protenas celulares y del RNA. La funcin del bloque de agarosa es proteger a las grandes
molculas, que, embebidas en esta matriz,
se someten a la digestin con enzimas de
restriccin que realicen cortes poco frecuentes (rare cutters). La preparacin de
ADN de alta calidad en plantas es ms complicada que la correspondiente para el caso
de animales debido a la presencia de la pared celular, que dificulta el embebido en
agarosa de bajo punto de gelificacin. Para
obviar esta dificultad se aslan los ncleos y
se trabaja con ellos directamente. Si se desea separar estos fragmentos por
electroforesis, los bloques de agarosa conteniendo el DNA digerido pueden ser directamente embebidos en la matriz del gel que
se correr.
B) Separacin de grandes trozos de
ADN: electroforesis de campo pulstil
Las tcnicas estndares de separacin de
ADN en geles de agarosa no son adecuadas
para molculas mayores de 10 kb. Esta limitacin ha sido subsanada con una tcnica llamada electroforesis de campo pulstil, por
la cual el campo elctrico que conduce a las
grandes molculas de ADN a travs del gel
cambia peridicamente de orientacin. De
esta manera pueden separarse molculas tan
grandes como los cromosomas de levaduras
(200 a 3000 kb) (ver VII.-1). La separacin de
las molculas de este tamao depende de
su relativa facilidad o dificultad para reorientarse en respuesta a direcciones cambiantes
de un campo elctrico. Esta tcnica puede
utilizarse para hacer mapas fsicos a gran escala.
C) Preparacin de una genoteca de BAC
El procedimiento consiste en 4 pasos,
preparacin del vector, aislamiento y digestin del ADN y seleccin de los fragmentos por tamao, transformacin de las bacterias y ensamblado de la genoteca
El vector debe estar bien purificado, digerido y defosforilado (cuando se corta con
una sola enzima, se eliminan los fosfatos terminales, para evitar la recircularizacin). La
digestin del ADN es crtica para obtener fragmentos adecuados para clonar. Los fragmentos son seleccionados por electroforesis de
campo pulstil y se separan de la matriz de
agarosa por digestin de la misma con
58
cual su crecimiento cesa. Con una proporcin correcta ddNTP:dNTP, se generan una
serie de fragmentos de distinta longitud,
dependiendo de la distancia de la ltima base
incorporada al extremo marcado del ADN.
Estos fragmentos son separados en un gel
de poliacrilamida, donde, previa autorradiografa, se determina el patrn de bandas, que
refleja la secuencia del ADN. Al principio, la
posicin de cada banda revelada en la pelcula radiogrfica se anotaba manualmente,
luego, los digitalizadores de imgenes posibilitaron la lectura directa de la pelcula. Existen actualmente secuenciadores automticos que realizan la electroforesis en gel y determinan autom-ticamente la secuencia utilizando un sistema de deteccin con lser.
Messing desarroll una serie de vectores
de clonado basados en el fago filamentoso
M13, muy tiles para el secuenciado
enzimtico. La ventaja es que slo una de
las cadenas del vector es empaquetada en
las cabezas del fago (ver Vectores de
clonacin). Este ADN de simple cadena es
ideal para utilizar con el mtodo de Sanger.
Clonando el inserto en M13, en las dos
orientaciones posibles, se obtiene una o la
otra hebra del ADN a secuenciar. Para ello se
utiliza un primer que se posiciona en un lugar adyacente a la regin de policlonado de
M13, que se llama primer universal, ya que
se puede utilizar para secuenciar cualquier
clon recombinante.
Actualmente se utilizan fsmidos (ver
Vectores de clonacin). La adicin de un
fago ayudante (helper phage) a las clulas que lo contienen, hace que el ADN del
mismo, de simple cadena, sea replicado,
empaquetado y extrado de la clula. Al ser
de menor tamao (aprox. 3000 bp) que M13
permite la insercin de fragmentos de ADN
ms largos.
Los proyectos de secuenciacin
genmica han requerido mtodos de
secuenciado ms veloces y econmicos. Para
ello se ha desarrollado una tcnica llamada
Multiplex, que permite manejar mayor cantidad de muestras en menor tiempo. Se utilizan 20 vectores plasmdicos que permiten
construir 20 genotecas diferentes a partir del
mismo ADN. Cada vector lleva dos secuencias nicas que flanquean al sitio de
clonado, que pueden ser usadas como eti-
59
quetas (tags) para el ADN clonado y estarn presentes sobre cada fragmento a ser
secuenciado. Se toma un clon de cada una
de las genotecas plaqueadas (20 colonias) y
se mezclan. Se hace crecer el cultivo, se asla
el ADN y se secuencian los plsmidos utilizando el mtodo Maxam y Gilbert. Los productos de 12 conjuntos de reacciones de
secuenciacin se corren en un gel y se transfieren a una membrana de nylon. El filtro se
hibrida secuencialmente (es decir, se despega una sonda para luego hibridar con las siguiente y as sucesivamente), utilizando como
sonda la etiqueta de cada uno de los 20
vectores. En cada caso se van leyendo las
secuencias correspondientes a cada uno de
los distintos vectores. De esta manera, una
sola reaccin produce datos de 20 clones a
la vez.
Actualmente existen equipos robotizados que pueden llevar a cabo dos de las reacciones ms limitantes en el proceso de
secuenciado: la deteccin de las bandas de
ADN y la traduccin de un patrn de bandas en uno de secuencia. Estos equipos utilizan nucletidos marcados con fluorocromos.
Se utilizan 4 colorantes diferentes, que al ser
exitados por lser emiten luz de diferente
longitud de onda. Los colorantes pueden
utilizarse para marcar el primer universal de
secuenciacin de M13 o cada uno de los 4
terminadores de cadena didesoxi. En este
caso, cada mezcla de reaccin con un
terminador diferente se marca con un colorante diferente. Cuando la reaccin es completada, los productos de las 4 reacciones se
mezclan y se corren en una sola calle de un
gel, en un secuenciador automtico. A medida que los fragmentos pasan a travs del l-
60
II.- Captulo 4
Marcadores Moleculares
Picca, Aurora; Helguera, Marcelo;
Salomn, Nelly; Carrera, Alicia
1 Introduccin
61
3 Isoenzimas
Se definen como diferentes formas
moleculares de una enzima, que poseen una
actividad cataltica comn, es decir actan
sobre el mismo sustrato. Ciertos cambios en
el ADN que codifica estas enzimas (mutaciones) pueden resultar en cambios en la composicin de aminocidos, originando protenas con la misma actividad biolgica pero con
diferente carga neta y por tanto con diferentes velocidades de migracin en un campo elctrico. Estas diferencias determinan
patrones caractersticos de migracin
electrofortica de las formas iso-enzimticas.
Varios factores determinan el patrn de
bandas o zimograma:
1) Nmero de genes que las codifican.
La presencia de varios genes codificando para
una misma enzima ha sido atribuida a procesos de duplicacin gnica y subsecuente divergencia a travs de mutaciones diferentes
en cada caso.
2) Estados allicos. El proceso ms simple de generacin de nuevas formas
enzimticas es la mutacin de un gen estructural; las variantes allicas se denominan
aloenzimas. Estos marcadores muestran
codominancia
3) Estructura cuaternaria de los productos proteicos. La enzima funcional puede
estar compuesta por un nmero variable de
sub-unidades. En las formas ms simples o
monomricas los individuos homocigotas presentan una banda y los heterocigotas simplemente la suma de ambas. Cuando la estructura cuaternaria se vuelve ms compleja,
encontramos enzimas activas compuestas
por dmeros, tetrmeros, etc.. En este caso
el individuo heterocigota presenta bandas
adicionales no presentes en los homocigotas,
que se generan por la combinacin de subunidades codificadas por los distintos alelos
o loci. (Fig. 1).
4) Compartimentalizacin subcelular. Se
encuentran formas enzimticas localizadas
en citoplasma, cloroplasto o mitocondria,
codificadas todas por genes nucleares pero
con diferentes velocidades de migracin.
Las isoenzimas se obtienen por
homogenizacin del tejido (semilla, raz, hoja)
62
en soluciones buffer y se analizan mediante electroforesis en un soporte slido, generalmente almidn. El gel puede ser cortado
en capas horizontales y cada una se destina
a una solucin de revelado especfica que
consta de un sustrato, un colorante y
cofactores, disueltos en un buffer apropiado.
La preparacin del gel es relativamente simple y el equipamiento es de bajo costo.
Las enzimas se clasifican de acuerdo a su
funcin y se representan con una sigla de tres
letras. Por ejemplo: dehidrogenasas (alcohol
dehidrogenasa ADH, glutamato dehidrogenasa GDH), oxidasas (peroxidasas PRX),
hidrolasas (fosfatasas cidas ACP, esterasas
EST), isomerasas (fosfoglucoisomerasa PGI) y
transferasas (fosfoglucomutasas PGM). Los
loci en general se representan con las tres
letras sealadas en tipo cursiva y se agrega
un nmero para designar al locus y una letra
para el alelo, de acuerdo a distancias decrecientes de migracin. Por ejemplo: Adh-1a,
Adh-1b, Adh-2a, Adh-2b, Adh-2c.
Las isoenzimas han tenido un rol prominente en estudios de poblaciones vegetales
para determinar variabilidad y estructura
gentica, sistemtica y biologa evolutiva as
como en descripcin de germoplasma e identificacin de variedades. Su aplicacin en la
construccin de mapas se ha visto limitada
por el nmero de marcadores isoenzimticos
disponibles, en general menor a 50 y por su
reducido polimorfismo, 2-4 alelos. Por otro
lado, las formas enzimticas extradas de hoja
o raz (no as las de semilla) presentan variaciones en relacin a las condiciones ambientales de crecimiento y a la edad del tejido, lo
cual afecta la reproducibilidad de los
zimogramas. No obstante, estos loci representan importantes marcas de referencia
para relacionar mapas obtenidos a partir de
63
64
placa radiogrfica La ventaja de los RFLPs radica en que son altamente reproducibles,
codominantes y multiallicos. A su vez cuentan con la desventaja de ser muy laboriosos,
difciles de automatizar, requieren de infraestructura adecuada para mantener las sondas, trabajar con radiactivos, lo que los hace
relativamente caros.
Los minisatlites o VNTR variable
number of tandem repeats son repeticiones en tandem de secuencias del genoma que
contienen de 9 a 100 pares de bases. El nmero de repeticiones es variable pero en general es menor a 1000. Existen dos formas
de detectar los VNTR ya sea por hibridacin
o por tcnicas de PCR. El ADN genmico es
digerido con enzimas de restriccin que reconocen los sitios de restriccin que
flanquean las repeticiones en tandem, separado electroforticamente e inmovilizado en
una membrana. Cuando la enzima de restriccin corta las secuencias adyacentes a un locus
hipervariable, la longitud de los fragmentos
de restriccin producidos en diferentes individuos vara con el nmero de repeticiones
de minisatlites. Estos fragmentos con diferentes longitudes son detectados utilizando
sondas diseadas a partir de las secuencias
de ADN que flanquean las repeticiones o a
partir de las repeticiones mismas. Estos fragmentos pueden ser considerados como un
tipo especfico de RFLP. La diferencia bsica
entre RFLP y VNTR reside en el tipo de sonda utilizada. En la tcnica de VNRT las sondas estn constituidas por secuencias
homlogas a las secuencias repetidas de los
minisatlites, por lo tanto todos los locus
hipervariables son detectados simultneamente, mientras que en RFLP, las sondas son
homlogas a secuencias nicas del genoma,
detectando as uno o pocos loci cada vez. De
esta manera, en el autoradiograma al contrario del patrn simple de bandas obtenido por RFLP (una banda para genotipos
homocigotas o dos bandas para genotipos
heterocigotas), para minisatlites se obtiene
un perfil complejo de bandas mltiples. Una
ventaja de los VNRT, es que adems de explorar el polimorfismo en la longitud de los
fragmentos de restriccin en cada locus
hipervariable, utilizan tambin el polimorfismo en el nmero y distribucin de estos
loci a lo largo del genoma, posibilitando as
la visualizacin simultnea de diversas regiones del mismo. Las limitaciones para esta tcnica, son las mismas descriptas oportunamente para RFLP. Los minisatlites tambin pueden ser detectados mediante la amplificacin
por PCR de los segmentos conteniendo diferente nmero de repeticiones, utilizando
primers o cebadores, que flanqueen dichos
segmentos.
65
ciacin y PCR, junto a la creciente informacin sobre genomas animales y vegetales han
permitido el desarrollo de marcadores basados en PCR con diferentes caractersticas,
entre ellos los ms frecuentemente utilizados
en plantas son: SSR simple sequence
repeats o microsatlites y AFLPs
amplified fragment length polymorphisms.
Los microsatlites (SSR), son regiones
genmicas hipervariables constituidas por
repeticiones en tandem de unos pocos pares de bases (1 a 4) flanqueadas por secuencias de copia nica. La base gentica del
polimorfismo detectado en microsatlites se
basa en la variabilidad del nmero de repeticiones en tandem y consecuentemente del
tamao del microsatlite amplificado en individuos de una especie. El microsatlite amplificado por PCR es sometido a electroforesis
en geles de alta resolucin que permiten detectar diferencias de 2, 3 o 4 nucletidos que
corresponden al mnimo polimorfismo de longitud en un microsatlite. Por el alto
polimorfismo que presentan por locus
(multialelismo) se los considera los marcadores ideales para el mejoramiento en especies
autgamas como el trigo. Estos marcadores
son codominantes, genoma-especficos y altamente polimrficos en comparacin con los
RFLPs y RAPDs. Su implementacin en un laboratorio requiere de mayor infraestructura
y presupuesto que los RAPDs.
C) Marcadores mixtos: AFLP (polimorfismo en la longitud de fragmentos amplificados de ADN) puede considerarse como una
combinacin de RFLP y RAPDs. Esta tcnica
consiste en esencia de cuatro etapas: 1) el
ADN genmico es cortado con enzimas de
restriccin (generalmente una de corte raro
y otra de corte frecuente). 2) adaptadores
de ADN de doble cadena se adhieren en forma especfica a los extremos de los fragmentos obtenidos en el paso anterior, generando as el molde para la amplificacin del ADN.
3) una fraccin de los fragmentos obtenidos
es amplificada selectivamente por la accin
de primers especficos que fueron diseados
para reconocer la secuencia de los
adaptadores ligados en el segundo paso, el
sitio de la enzima de restriccin, ms una a
tres bases selectivas al azar agregadas en el
66
que los RAPDs, ya que en la amplificacin se (ARNm transcripto a ADN utilizando la enziutilizan oligonucletidos ms largos, que au- ma transcriptasa reversa). La ventaja de los
mentan significativamente la especificidad de ESTs, al ser derivados de ARNm maduro es
la reaccin sin perder las ventajas de la am- que generalmente se ven libres de intrones
plificacin de secuencias al azar (no requiere y de ADN repetitivo. Esto implica que los ESTs
informacin previa de secuencia de ADN). representan genes funcionales y son por lo
Otra ventaja de los AFLPs es el nmero de tanto ms tiles como marcadores
fragmentos (marcadores) resueltos por moleculares que las secuencias annimas.
electroforesis que oscila entre 30 - 50 contra
En una variante conocida como CAPs
los 4 10 de RAPDs.
cleavage amplified polymorphic
Para una utilizacin ms eficiente en pro- sequence, los productos de amplificacin de
gramas de mejoramiento de marcadores secuencias especficas se digieren con una
RFLPs, RAPDs y AFLPs existe la posibilidad de enzima de restriccin. Este mtodo permite
transformarlos en marcadores PCR alelo-es- identificar individuos heterocigotas, por lo
pecficos, que son econmicos, robustos y de que se comporta como marcador codomisencilla implementacin en cualquier labora- nante. La informacin para la secuencia de
torio.
los primers utilizados en CAPs puede proveExisten distintas estrategias para la con- nir de un banco de genes o de clones
versin de marcadores RFLP, RAPDs y AFLPs genmicos o de cDNA. Recientemente meen marcadores PCR alelo-especficos, en ge- diante CAPS ha sido posible seleccionar planneral ligados a un caracter de inters agro- tas de trigo hexaploide portadoras del alelo
nmico. Se conocen como STS sequence- 2NS, proviente de una translocacin de
tagged sites. En estos casos se aisla el frag- Triticum ventricosum que contiene genes de
mento de ADN polimrfico del gel, se clona, resistencia a roya Lr37, Sr38, Yr 17 (Fig. 5).
se secuencia y se disean
oligonucletidos especficos de
alrededor de 20 pb, para ser utilizados como cebadores. Cuando se parte de un fragmento
RAPD, el marcador derivado mediante este proceso es conocido
como SCAR regin amplificada de secuencia caracterizada. El paso siguiente es detectar el alelo de valor agronmico Figura 5: CAPS en trigo. Calle 1 planta control (sin amplificacin). Calles
superior, por ejemplo un alelo 2, 3, 6 y 7 plantas homocigotas para el alelo 2AS (275 pb = 166 + 109).
4 y 5 homocigotas 2NS (285 pb). Calles 8 y 9 plantas heterocigotas
asociado a la resistencia a un pa- Calles
2AS/2NS.
tgeno y el marcador entonces
se hace evidente con una simple
reaccin de PCR. El problema que enfrentan
Existen tcnicas de alta resolucin que
estas estrategias suele ser el bajo nivel de permiten detectar mutaciones a nivel de un
polimorfismo entre variedades de una espe- solo nucletido conocidas como SNPs sincie (trigo, soja, etc), lo que disminuye las po- gle nucleotide polymorphisms. Entre ellas,
sibilidades de encontrar mutaciones tiles los SSCPs single-strand conformational
para desarrollar estos marcadores. De todos polymorphism tienen la capacidad de demodos, existen antecedentes exitosos de tectar cambios de un solo nucletido en fragdesarrollo de marcadores de PCR alelo-espe- mentos de ms de 1000 pares de bases. La
cficos en trigo para locus altamente tcnica de SSCPs se basa en la movilidad de
polimrficos como pueden ser alelos de las cadenas simples del ADN en geles de
gluteninas.
poliacrilamida no desnaturalizantes, moviliLos ESTs expressed sequence tags son dad que depende tanto de su tamao como
similares a los STSs y sirven para los mismos de su secuencia. Las cadenas simples de ADN
propsitos pero derivan de clones de cDNA tienen tendencia a formar apareamientos
67
6 Lecturas recomendadas
BUSHUK W.; ZILLMAN, R.R. 1978. Wheat Cultivar
Identification by Gliadins Electrophoregram I: Apparatus,
methods and nomenclature. Canadian Journal of Plant
Science, 58: pp. 505-515.
68
II.-Captulo 5
Citogentica
Poggio, Lidia; Naranjo, Carlos A.
1 Introduccin
Los estudios citogenticos han permitido
realizar valiosos aportes al conocimiento de
los mecanismos de aislamiento reproductivo
y modos de especiacin en plantas. La
especiacin hbrida es muy comn en el reino vegetal, en especial la especiacin por
poliploida. En estos casos la citogentica, a
travs del anlisis genmico, ha contribuido
a la resolucin del origen y evolucin de distintos grupos taxonmicos. Mutaciones
cromosmicas que alteran la morfologa de
los cromosomas jugaran un papel importante en la determinacin de los mecanismos
de aislamiento reproductivo y distintos modos de especiacin. Aun sin alterar la morfologa de los cromosomas, existen ejemplos
en los que mutaciones gnicas que afectan
el apareamiento han sido determinantes en
la evolucin de distintos grupos. La
citogentica brinda valiosos aportes para la
resolucin de problemas taxonmicos, evolutivos y aplicados. Esta disciplina tiene grandes ventajas pero tambin limitaciones y sus
aportes deben ser complementados con estudios provenientes de otros campos. Sin
embargo es importante sealar que trabajar en biologa o gentica de eucariontes,
usando tcnicas clsicas o moleculares, pero
desconociendo las caractersticas y el comportamiento de sus cromosomas puede llevar a
errores en la interpretacin de causa y efecto de muchos fenmenos. En esta contribucin se explicar brevemente la informacin
que la citogentica puede brindar, con el
anlisis del cariotipo, anlisis meitico en
hbridos y poliploides, estudio de la variacin
intra e interespecifica en el tamao del
genoma y con la citogentica molecular (hibridacin in situ, FISH, GISH), exponiendo
como ejemplos, algunos aportes realizados
por nuestro grupo de trabajo.
69
posee un cariotipo
bimodal por adicin de
heterocromatina en 24
de los 26 cromosomas
del complemento.
El nmero cromosmico tambin puede
variar por poliploida.
Nuevos nmeros bsicos que no tengan relacin directa con los
ancestrales pueden surgir si ocurren nuevas reestructuraciones o hibridacin entre poliploides con distintos nmeros bsicos.
Variaciones en el
cariotipo pueden ocurrir sin cambios notorios
en el exofenotipo. Sin
embargo rearreglos en
condicin heterocigota
pueden ocasionar disturbios en el apareamiento meitico e iniciar aislamiento reproductivo. Si se dan las
condiciones adecuadas
para la fijacin de estos
rearreglos pueden iniciarse eventos especiognicos que involucren
rearreglos cromosmi- FIGURA 1. A-E = Bandeo C. A, C, E = metafases mitticas. B, D = interfases. A, B =
cos. Estos procesos Zea luxurians. C, D = Zea mays ssp. mays. E = Bulnesia retama, las flechas sealan
el nico par de cromosomas metacntricos eucromticos.- F = Metafase I. Eulophia
pueden conducir, en paiveana
ssp. borealis, n = 42; las flechas muestran ejemplos de asociacin
algunos casos, a la exis- secundaria de bivalentes.- G, H = Zea luxurians x Z. diploperennis , n = 10; G =
tencia de especies Metafase I, 8 bivalentes y 4 univalentes, la flecha seala un bivalente heteromorfo;
crpticas o hermanas, H = Anafase I, 2 puentes (flechas) y 2 fragmentos (cabeza de flecha).- I, J = Zea mays
ssp mays, diacinesis. n = 10; I = dos grupos de 5 bivalentes y un cromosoma B; J =
con pocas diferencias a Asincrona meitica, 5 bivalentes en Metafase I y 10 cromosomas en Anafase I.- K =
nivel bioqumico o Zea luxurians x Z. perennis, 2n=30; metafase I, 5 trivalentes, 5 bivalentes y 5
morfolgico pero con univalentes. A-D y F-K poseen el mismo aumento. Las barras representan 10 micrones.
diferencias cromos- Ver explicacin extensa de las figuras en: Poggio et al., 1986a y b, 1999; Tito et al.,
1991.
micas que las mantendran aisladas reproductivamente.
matina constitutiva compuesta por secuenUn anlisis ms preciso de la variacin cias cortas repetidas en tandem. La
cariotpica puede obtenerse empleando tc- heterocromatina constitutiva es un componicas de bandeo que revelan marcadores nente aditivo del genoma y presenta, en
cromosmicos (secuencias de ADN altamen- muchos grupos, variacin intra e
te repetidas ricas en AT o GC, regiones orga- interespecfica. Aunque no contiene genes
nizadoras del nucleolo, etc.). El bandeo C es activos podra tener importancia en eventos
el que se utiliza de rutina y revela heterocro- regulatorios, en el desarrollo y en la organi-
70
71
72
alotetraploide del maz y especies relacionadas con 2n=20 cromosomas. En hbridos con
2n=30 cromosomas (Z. diploperennis x Z.
perennis y Z. mays ssp mays x Z. perennis) la
configuracin meitica ms frecuente fue 5
III + 5 II + 5I. Zea perennis, con 2n=40
cromosomas present, con frecuencia elevada, 5 IV + 10 II. Estas configuraciones slo
pueden ser claramente explicadas proponiendo dos genomas (A y B) de 5 cromosomas
cada uno, siendo AmAm BmBm y ApAp
ApAp Bp1Bp1 Bp2Bp2 las frmulas genmicas
postuladas para maz y Zea perennis, respectivamente. Nuestro grupo de trabajo ha
encontrado, en especies e hbridos con 2n=20
cromosomas, formacin frecuente de dos
grupos de 5 II cada uno en MI. Este doble
huso observado sera una evidencia de la
existencia de genomas ancestrales con 10
cromosomas cada uno. Adems, en alrededor del 50 % de las clulas observadas en algunas lneas de maz e hbridos interespecficos se observ asociacin secundaria de
bivalentes, sugiriendo la existencia de
homeologa entre los genomas ancestrales
A y B postulados.
Tratamientos premeiticos con soluciones
diluidas de colchicina (0,5 x 10 -4) en el gnero Helianthus indujeron apareamiento
homelogo y formacin de multivalentes en
especies que, aunque tienen origen
poliploide, posean meiosis regular con formacin de bivalentes. Los resultados obtenidos sugirieron que estos tratamientos pueden inducir apareamiento intergenmico.
Este tratamiento produce el mismo efecto
que alelos mutantes de genes que controlan
el apareamiento, permitiendo recombinacin
entre genomas que normalmente no
recombinaran. Hemos realizado tratamientos con soluciones diluidas de colchicina en
maz y Z. perennis con la finalidad de detectar recombinacin entre los genomas A y B
postulados anteriormente. El maz tratado
mostr en Diplotene-MI de 1 a 5 IV mientras
que el maz testigo slo form bivalentes.
Estos resultados sugirieron que en maz existen genomas homelogos (Am y Bm) con 5
cromosomas cada uno. El tratamiento en Zea
perennis di como resultado un incremento
en la frecuencia de IV sealando tambin
manifestacin de homeologa dentro de los
genomas A y B. El tratamiento con colchicina
73
74
75
76
FIGURA 2. A-B, FISH: Zea luxurians (2n=20, A = las zonas amarillas brillantes muestran hibridacin con la sonda
Knobs de maz marcada don digoxigenina y revelada con FITC; B = contratincin con DAPI, las zonas intensamente
hibridadas en A coinciden con las zonas DAPI (+) de B.- C y D = Zea mays ssp. parviglumis , ncleo interfsico; la
mayora de las zonas DAPI (+) observadas en D muestran fuerte seal de hibridacin en C; se utiliz sonda Knob
de maz marcada con dioxigenina y revelada con FITC. E = Zea mays ssp. mays (2n=20 + 5 cromosomas B),
hibridacin con sonda rDNA pta71 de trigo, marcada con biotina y revelada con Cy3, se sealan (puntas de flechas)
los organizadores nucleolares en cromosomas y ncleo interfsico. F = Prometafase I meitica de la F1 Zea mays ssp.
mays x Zea perennis (2n=30); se observan III, II y I; la seal de hibridacin se encuentra en un trivalente (sealado
con flecha), se utiliz como sonda rDNA (pta71) como fue indicado en E. G-I = clula de Tricepiro; G = hibridada con
sonda de ADN genmico total de centeno marcado con dioxigenina y revelada con FITC (GISH), se observan 14
cromosomas con fuerte seal de hibridacin indicando que Tricepiro posee 14 cromosomas de centeno. H = igual
clula rehibridada con la sonda pSc119.2 marcada con biotina y que da fuerte seal con Cy3 (en rojo), permiti
reconocer los genomas de trigo presentes en Tricepiro. I = contratincin con DAPI. La barra representa 10 micrones,
todas con igual aumento. Ver explicacin extensa de las figuras en: Ferrari et al., 2001, 2004; Poggio, et al.,1999a,b
y 2000.
77
78
79
PARTE III
Mtodos
para generar variabilidad
81
82
III.-Captulo 1
Variacin somaclonal
Cardone, Susana; Olmos, Sofa;
Echenique, Viviana
1 Introduccin
El comportamiento celular normal es el
resultado de una compleja cascada de programas genticos que son sensibles a la
disrupcin por estreses biticos y abiticos.
El cultivo in vitro per se puede ser muy
estresante para las clulas vegetales e
involucra procesos mutagnicos durante el
establecimiento del explanto, la induccin de
callo, la formacin de embriones y la regeneracin de plantas. Por esta va es posible obtener variacin, de origen nuclear y/o
citoplasmtica, que podra ser utilizada para
el mejoramiento vegetal. Este proceso, denominado variacin somaclonal por Larkin
y Scowcroft (1981), involucra cambios en las
plantas regeneradas que son transmitidos a
la progenie. Asimismo cabe citar la ocurrencia in vitro de interacciones no especficas que
no generan variacin estable y transmisible,
pero que conducen a cambios en la expresin gnica. Dichos cambios, denominados
epigenticos, son tambin considerados
por algunos autores como variacin
somaclonal mientras que otros slo incluyen
en la misma los cambios estables.
Los mecanismos por los cuales ocurre la
variacin somaclonal no han sido completamente dilucidados, pero entre sus causas se
mencionan alteraciones en el cariotipo, mutaciones puntuales, recombinacin somtica
e intercambio de cromtidas hermanas,
rearreglos gnicos somticos, elementos
genticos transponibles, amplificacin y/o
metilacin del ADN y cambios en el ADN de
las organelas. Por ello, aunque los caracteres
morfolgicos (como por ejemplo el hbito de
crecimiento, la morfologa floral, etc.) son
fciles de evaluar, muchos aspectos de la variacin suceden sin manifestarse en cambios
morfolgicos evidentes. Una diferencia estructural en un producto gnico puede no
alterar su actividad biolgica lo suficiente
como para producir un fenotipo modificado.
83
84
85
86
87
88
89
fenotpicamente normales.
Otros marcadores moleculares utilizados
con xito para la evaluacin de variacin
somaclonal, como los AFLP, permitieron detectar en banana la existencia de diferencias
a nivel molecular entre plantas regeneradas
de fenotipo normal y aberrantes.
A veces, para detectar un cambio es necesario realizar pruebas especficas. Por ejemplo, se evaluaron somaclones de Cynodon
dactylon en laboratorio, invernculo y a campo para resistencia a la oruga militar. Un
somaclon, el Brazos-R3 (Croughan y col.,
1994), tena un rendimiento a campo equivalente al del cultivar madre, pero adems
era resistente a dicho insecto. Esto fue debido a que produca menores niveles de un
estimulante para la alimentacin del insecto. Es decir que mantena los caracteres
agronmicos positivos del cultivar parental,
pero tena un cambio en la produccin de un
metabolito secundario que confera resistencia a la oruga.
5 La variacin somaclonal y su aplicacin
en el mejoramiento gentico de las
plantas
La base del mejoramiento gentico es la
optimizacin de interacciones gnicas. Para
lograr combinaciones gnicas ptimas o superiores se requiere de diversidad gentica.
Esta diversidad, que se encuentra normalmente en las poblaciones de individuos, puede provenir de cruzamientos sexuales, mutaciones inducidas (fsicas o qumicas o producidas por ADN-T o por elementos transponibles
o retrotrasposones), hibridacin somtica y
transformacin gentica. La variacin
somaclonal proveera una fuente adicional de
variabilidad gentica, utilizable en programas
convencionales de mejoramiento.
Algunas de las ventajas que presenta la
variacin somaclonal pueden resumirse de la
siguiente manera:
90
etapa de multiplicacin de semillas, que permitir realizar pruebas agronmicas en diferentes ambientes, al menos en dos aos distintos, para evaluar los efectos del componente ambiental en la expresin del carcter. El programa finaliza con la etapa de multiplicacin de semillas para el lanzamiento de
la variedad nueva al mercado.
Una modificacin para la produccin de
nuevas variedades est basada en el empleo
de variantes gametoclonales (Fig. 1). Si se
utilizan clulas haploides como fuente de tejido, las variantes obtenidas se denominan
variantes gametoclonales. Los gametoclones
91
92
93
Figura 3: Obtencin de variantes somaclonales de pasto llorn, Eragrostis curvula (Schrad.) Nees a partir del cultivo
de inflorescencias A) Formacin de callos, B) Masa de callo a partir de la cual comienza a evidenciarse morfognesis.
C) Estudio histolgico de los mismos callos mostrando clulas embriognicas y D) embriones somticos. E) En el
mismo callo se observaron embriones bipolares y tambin F) organognesis. G) Plntula completa en el momento
de salir del tubo de ensayo. H) Las plantas llevadas al campo fueron frtiles (I). J) Cromosomas en el pice radical de
la planta donadora de explanto, 2n=4x=40 apomctica. K) Cromosomas de una regenerante primaria (R0) obtenida a
partir de la anterior 2n=2x=20, sexual L) Isoenzimas de peroxidasas de las descendientes de la planta R0, mostrando
variacin, lo cual indica la presencia de sexualidad. M) Idem anterior, pero malato deshidrogenasas.
94
7 Lecturas recomendadas
BREGITZER, P.; HALBERT, S.; LEMAUX, P. 1998. Somaclonal
variation in the progeny of transgenic barley. Theor.
Appl. Genet. 96: 421-425.
CASSELS, A.C.; CROKE, J.T.; DOYLE, B.M. 1997. Evaluation
of Image Analysis, Flow Cytometry, and RAPD Analysis
for the Assessment of Somaclonal Variation and Induced
Mutation in Tissue Culture-Derived Pelargonium Plants.
Angew. Bot. 71: 125-130.
CROUGHAN, S.; S. QUISENBERRY; M. EICHHORN; JR., P.
COLYER AND T. BROWN. 1994. Registration of BrazosR3 bermudagrass germplasm. Crop Science. 34: 542.
DAMATO, F. 1991. Nuclear changes in cultured plant
cells. Caryologia. 44 (3-4) : 217-224.
DUNCAN, R.1997. Tissue Culture-Induced variation and
crop improvement. Advances in Agronomy 58: 201-240.
EASTMAN, P.; WEBSTER, F.; PITEL, J.; ROBERTS, D. 1991.
Evaluation of somaclonal variation during somatic
embryogenesis of interior spruce (Picea glauca
engelmannii complex) using culture morphology and
isozyme analysis. Plant Cell Reports 10: 425-430.
EVANS, D.; SHARP, W. 1983. Single gene mutations in
tomato plants regenerated from tissue culture. Science.
221: 949-951.
FRANZONE P, SUAREZ Y, SOLARI R, FAVRET A, ROS R,
DAZ PALEO A. 1996. Somaclonal variation in three
Argentinean varieties of Triticum aestivum with different
karyotypic instability. Plant Breed. 115: 89-93.
GALLEGO, F.; MARTNEZ, I.; CELESTINO, C., TORIBIO, M.
1997. Testing somaclonal variation using RAPDs in
Quercus suber L. somatic embryos. Int. J. Plant Sci. 158
(5): 563-567.
GEIER, T. 1991. Chromosome, variability in callus
produced plants. In Genetics and Breeding of Ornamental
Species. 79-106. Harding & Mol. eds.
KAEPPLER, S. M. & PHILLIPS, R. L. 1993 In Vitro Cell Dev.
Biol. 29: 125-130.
KAEPPLER S, KAEPPLER H, and Y. RHEE. 2000. Epigenetic
aspects of somaclonal variation in plants. Plant Molecular
Biology. 43: 179188.
KRIKORIAN, A. 1991. Estabilidad genotpica en clulas,
tejidos y plantas derivados del cultivo in vitro. En Cultivos
de tejidos en la Agricultura. CIAT. Roca W. y Mroginsky
L. Eds.
LARKIN, P.; SCOWCROFT. W. 1981. Somaclonal variation
- a novel source of variability from cells cultures from
plant improvement. Theor. Appl. Genet. 60, 197-214.
LINACERO R.; FREITAS ALVES E.; VASQUEZ A. 2000. Hot
spots of DNA instability revealed through the study of
95
96
III.-Captulo 2
Hibridacin somtica
Polci, Pablo; Friedrich, Pablo
1 Introduccin
La mejora gentica de las plantas cultivadas en procura de incrementar la produccin
viene siendo practicada por el ser humano
desde hace miles de aos, seguramente desde el inicio mismo de la agricultura. Para ello,
el hombre ha empleado los cruzamientos con
el fin de incrementar la variabilidad gentica,
paso inicial en el proceso de mejoramiento.
De esta manera la hibridacin entre especies
diferentes permiti aumentar de modo significativo la productividad de diversos cultivos, como por ejemplo los cereales. Sin embargo, en otros cultivos esta estrategia no
result exitosa a causa de esterilidad sexual
o incompatibilidad gentica.
La hibridacin somtica, es decir, la obtencin de plantas hbridas a partir de la fusin de clulas o de protoplastos derivados
de clulas somticas, surgi hace unos 30 aos
como una herramienta muy promisoria para
sortear problemas de incompatibilidad
precigtica.
Esta tcnica, si bien presenta algunas limitaciones, como una elevada esterilidad o
imposibilidad de regenerar plantas en algunos casos, demostr ser til en la mejora
gentica de plantas, principalmente por permitir la introgresin limitada de genes de especies silvestres en los cultivos. Se utiliza, por
ejemplo, cuando se quiere transferir resistencia a enfermedades o tolerancia a estreses.
Tambin permite la obtencin de citoplasmas
hbridos (cbridos). La hibridacin asimtrica
y cibridizacin sirve como puente para la
transferencia de genes individuales
La tcnica de fusin de protoplastos se
desarroll en la dcada de 1950-60, a partir
de la observacin de que ciertos virus pueden inducir la fusin de clulas animales. Sin
embargo, recin en la dcada de 1980-90 tuvo
un mayor auge debido a la aparicin de mtodos qumicos y elctricos ms apropiados
para la fusin de clulas vegetales. La pared
presente en estas clulas representa una
97
98
3. Cbrido, que contiene el genoma nuclear completo de uno de los parentales, reteniendo slo material gentico extranuclear
del otro parental.
Es usual que en el proceso de regeneracin de plantas hbridas ocurra una eliminacin gradual de cromosomas de uno de los
tipos parentales, producindose de este
modo hbridos asimtricos o cbridos. La prctica de la hibridacin somtica en plantas
demostr que, en general, los hbridos
asimtricos y cbridos son ms valiosos que
los simtricos producidos entre plantas alejadas filogenticamente. Por esta razn se
han desarrollado mtodos para inducir la hibridacin asimtrica o cibridacin, alterando
el genoma de uno de los protoplastos
parentales. En este caso se dice que se transfiere parte del genoma de un protoplasto
donante a uno receptor. Por lo tanto, teniendo en cuenta el material de partida empleado para la fusin, pueden producirse tres tipos de clulas hbridas:
1. Clulas hbridas simtricas, por fusin
de dos protoplastos con sus genomas completos.
2. Clula hbrida asimtrica, por fusin
de un protoplasto conteniendo su genoma
completo con otro conteniendo su ncleo
inviable o slo una parte de su genoma nuclear. Los protoplastos donantes son irradiados con rayos X o Gamma, lo que provoca la
fragmentacin de los cromosomas. Una vez
producida la fusin, dichos fragmentos tienden a eliminarse en las sucesivas mitosis, pero
algunos de ellos pueden integrarse con el
genoma del receptor produciendo un hbrido asimtrico. El tratamiento de irradiacin
parece no tener efectos deletreos o
mutagnicos sobre los genomas de
organelas, probablemente debido a que
cada clula posee varias copias de ellas. Tambin puede producirse una clula hbrida
asimtrica fusionando protoplastos receptores con microprotoplastos, conteniendo uno
o pocos cromosomas. Los microprotoplastos
se obtienen induciendo la formacin de
microncleos por tratamientos con agentes
antimicrotbulos.
3. Cbridos, por fusin de un protoplasto
conteniendo su genoma nuclear completo
99
100
6 Mtodos de fusin
6.1 Mtodos qumicos
101
102
cias de fusin diferentes, aun cuando provengan del mismo genotipo. En general, los
protoplastos obtenidos a partir de hojas se
fusionan ms fcilmente que los provenientes de raz o de cultivos celulares.
El tamao de los protoplastos. Los
ms grandes se fusionan ms fcilmente.
La densidad de los protoplastos.
El nmero, la duracin y la fuerza de
los pulsos de corriente directa. La duracin
del pulso elctrico es de 15 a 50 seg. El tiempo requerido para la fusin que sigue a la
aplicacin de un pulso vara desde pocos segundos a varios minutos. Esto probablemente est relacionado a la diferencia de fluidez
de la membrana en los distintos tipos celulares y a las propiedades del citoesqueleto dentro de la clula.
El medio de fusin. Un factor de limitacin en la agregacin dielectrofortica de
las clulas es la conductividad elctrica del medio; si sta es muy alta, hay mucho flujo de
corriente en la solucin y se producen
calentamientos y turbulencias que impiden
la formacin de cadenas.
El potencial osmtico del medio de fu-
103
rn ligados entre ellos mismos. Seleccionando las condiciones duracin y voltaje de los
pulsos que promuevan slo la fusin de los
protoplastos ms fusionables, los productos
sern mayormente heterocariones.
Sin embargo, aun cuando las condiciones
de fusin puedan fijarse de modo de incrementar la frecuencia de fusin y la proporcin de heterocariones formados, la fusin
de protoplastos a gran escala (macrofusin),
tanto por mtodos qumicos como elctricos,
resultar en una mezcla de protoplastos
parentales, homocariones y heterocariones.
Esto conlleva la necesidad de emplear mtodos de seleccin de los hbridos somticos
obtenidos. Una tcnica alternativa que ofrece la ventaja de no requerir una posterior
seleccin de heterocariones, aunque demanda mayor manipulacin, es la microfusin o
electrofusin de pares de protoplastos. Esta
tcnica se basa en los mismos principios que
la electrofusin a gran escala pero est diseada para inducir la fusin en pares seleccionados de protoplastos. Este sistema emplea
microelectrodos de platino fijados a un soporte montado debajo del condensador de
un microscopio invertido. Los pares de
protoplastos seleccionados se colocan en
microgotas de medio de fusin sobre un soporte, recubiertas por aceite mineral. En cada
evento de fusin, los microelectrodos se
posicionan a cada lado de una microgota
conteniendo un par de protoplastos, y se
aplican los pulsos elctricos. Despus de la
fusin, los heterocariones resultantes son
transferidos a gotas con medio de cultivo
para la posterior regeneracin de plantas
hbridas. La tasa de fusin es de aproximadamente 30 pares de protoplastos fusionados y transferidos a medio de cultivo por
hora, pudiendo alcanzarse frecuencias de fusin cercanas al 50 %.
Ventajas de la electrofusin:
1. El proceso entero puede ser seguido
bajo microscopio por lo que los hbridos pueden ser fcilmente identificados y transferidos a un medio nutritivo o selectivo.
2. Puede preseleccionarse el nmero de
clulas a ser fusionadas. Las formaciones de
dos clulas son favorecidas por bajas densidades en la acanaladura entre los electrodos.
104
AAaaBBbb (verde)
Asimismo, a partir de dos lneas mutantes
no allicas de tabaco deficientes en nitrato
reductasa, se obtuvieron colonias capaces de
crecer en un medio conteniendo nitrato
como nica fuente de nitrgeno.
b) Fusionando parentales que expresan
caracteres dominantes tales como resistencia a antibiticos o herbicidas. Para ello se
emplea una lnea resistente a cierta droga, y
otra resistente a una segunda droga, efectundose la seleccin de las clulas hbridas
en un medio conteniendo ambas drogas a
concentraciones que resultan letales para las
lneas parentales.
c) Una lnea que presente una mutacin
autotrfica (por ejemplo: albinismo, deficiencia a nitrato reductasa) y un carcter dominante (por ejemplo, resistencia a antibiticos
o herbicidas) es de gran utilidad para la seleccin. Los hbridos producidos por el cruzamiento de estos parentales con cualquier
genotipo silvestre pueden ser seleccionados
en medio mnimo suplementado con el antibitico o herbicida, que no permite el crecimiento de los parentales.
Seleccin por aislamiento de los
heterocariones o clulas hbridas. Es el sistema ms confiable y de ms amplio espectro de aplicacin. El aislamiento puede realizarse de dos maneras:
a) Seleccin mecnica directa utilizando
tcnicas de micromanipulacin con micropipeta. Puede realizarse cuando los protoplastos parentales presentan rasgos que los
distinguen al microscopio, permitiendo reconocer las clulas hbridas. Por ejemplo, al fusionar protoplastos del mesfilo (verdes) con
protoplastos de suspensiones celulares (incoloros). Tambin pueden colorearse las clulas de ambos progenitores con diferentes
colorantes vitales, como el rojo neutro y azul
brillante de cresilo.
b) Citometra de flujo. Los protoplastos
parentales se marcan con diferentes colorantes fluorescentes; por ejemplo, rodamina
(rojo) y fluorescena (verde amarillento). El
aislamiento de los heterocariones marcados
con ambos colorantes se realiza utilizando un
citmetro de flujo (FACS, fluorescenceactivated cell sorter), que es preciso y muy
rpido. El equipo posee fotoclulas que detectan fluorescencia, pudiendo separar los
protoplastos marcados con un solo fluorocromo (parentales) de aqullos doblemente
marcados (hbridos).
8 Cultivo de protoplastos
La habilidad para regenerar plantas a
partir de clulas y tejidos en cultivo es un componente esencial en la biotecnologa para la
manipulacin gentica y el mejoramiento
vegetal. Esto resulta relativamente fcil para
las dicotiledneas herbceas, pero ha sido
bastante difcil para las monocotiledneas,
particularmente las gramneas.
Los protoplastos se cultivan en cajas de
Petri en medio lquido o semislido, rico en
compuestos orgnicos e inorgnicos, suplementado con reguladores del crecimiento, y
en presencia de un estabilizador osmtico.
Suelen ser cultivados en cajas de Petri con medio agarificado, donde se mezcla la solucin
de protoplastos con un medio de cultivo lquido a 40C conteniendo 1,2% de agar,
perferen-temente agarosa (Fig. 5AyB). Los
protoplastos quedan, as, atrapados en el
medio semislido y, luego de varios das, se
ven las colonias formadas (Fig. 5C). Sin em-
105
bargo, el medio lquido da mejores resultados por varias razones: (a) los protoplastos
de varias especies slo pueden dividirse en
medio lquido, (b) la presin osmtica del
medio puede ser fcilmente reducida a los
pocos das en cultivo, (c) la densidad celular
puede ser modificada agregando medio de
cultivo o las clulas con especial inters pueden ser aisladas y cultivadas a alta densidad,
(d) la degradacin de algunos componentes
del medio por la poblacin de protoplastos
puede producir algunas sustancias citotxicas,
cuya concentracin alrededor de las clulas
ser menor en el medio lquido. Una tcnica
muy eficiente que combina medio slido y
lquido es la de cultivo en perlas de agarosa,
donde los bloquecitos con los protoplastos
inmovi-lizados en agarosa son cortados en
cuatro mitades y colocados en medio lquido, donde se cultivan en continua agitacin.
Los protoplastos regeneran la pared celular luego de uno a cuatro das en cultivo. La
presencia de pared es esencial para lograr una
divisin regular. Luego de dos a tres semanas, producto de mitosis sucesivas, se forman
microcolonias derivadas cada una de una clula, que dos semanas despus se pueden ver
a simple vista. Estos callos son transferidos a
un medio de cultivo y a condiciones apropiadas para regenerar plantas (Fig. 5).
Los principales factores a tener en cuenta para el cultivo de protoplastos son:
Los requerimientos nutricionales: se han
utilizado en muchos casos los mismos medios
de cultivo que se utilizan en el cultivo de clulas y tejidos, pero en general son enriqueci-
106
estado fisiolgico del tejido del cual provienen y la calidad de los protoplastos son muy
importantes para obtener una elevada eficiencia en la respuesta al cultivo.
La hibridacin somtica ha permitido producir hbridos que no se haban podido obtener por cruzamientos sexuales, incrementando as el flujo de genes en los cultivos. La
tabla 1 muestra algunos ejemplos de hbridos
somticos que presentan algunas ventajas
agronmicas.
En sus inicios, algunos esperaban que la
hibridacin somtica permitiera producir nuevas especies que expresaran las caractersticas deseadas de ambos progenitores. Por
ejemplo, por hibridacin entre tomate y
papa, se busc producir plantas que desarrollaran tomates en la parte area y tubrculos
en la raz (pomato). La experiencia mostr
que difcilmente puedan lograrse estos
hbridos espectaculares, debindose ms bien
dirigir la tcnica hacia la introgresin de pocos genes silvestres en las especies cultivadas
mediante hibridacin asimtrica o cibridacin,
manteniendo las caractersticas generales del
cultivo.
Uno de los factores que dificulta la obtencin de hbridos simtricos es la progresiva prdida de cromosomas de uno de los
parentales, que normalmente ocurre durante la regeneracin. Si bien la fusin de
protoplastos permite sortear las barreras
precigticas, siguen existiendo barreras
genmicas que resultan en la eliminacin espontnea de cromosomas durante las divisiones celulares. El mecanismo que determina la eliminacin de cromosomas no est
bien comprendido, pero generalmente se
retienen los cromosomas del parental que
tiene el ciclo celular ms corto. Uno de los
factores que puede producir incompatibilidad
genmica es el estado de diferenciacin de
los tipos celulares involucrados en la fusin.
Por ejemplo, cuando se fusionan clulas en
fase de crecimiento activo con clulas del
mesfilo, que no se dividen, generalmente
se pierden los cromosomas de estas ltimas.
Los hbridos somticos o sexuales entre
especies silvestres y cultivadas contienen
107
oryzicola, Triticum
monococcum (+)
Pennisetum americanum, Festuca
arundinacea (+)
Lolium multiflorum. El primer caso
de regeneracin de
plantas maduras de
hbridos intergenricos (simtricos y
asimtricos) en gramneas fue el Festulolium.
A pesar de los
esfuerzos realizados,
la aplicacin de esta
estrategia no ha
conducido a la obtencin de nuevos
hbridos de especies
importantes, fundamentalmente debido a problemas de
baja o nula fertilidad. Los mtodos
actuales de transferencia de genes aislados han desplazado el inters en la hibridacin somtica. Sin embargo son una excelente herramienta para estudiar las interacciones ncleo-citoplasmticas entre genomas.
12 Lecturas recomendadas
BHOJWANI, S.S.; RAZDAN, M.K. 1996. Protoplast isolation
and culture. Somatic hybridization and cybridization. En:
Plant Tissue Culture: Theory and Practice, Capitulos 12 y
13. S.S. Bhojwani y M.K. Razdan (eds.) Elsevier,
Amsterdam. pp. 337-406.
LINDSEY Y JONES, 1992. Biologa celular de la ingeniera
gentica. En: Biotecnologa vegetal agrcola, Captulo 6.
Editorial ACRIBIA, S.A., Zaragoza. pp.105-142.
MATSUMOTO, K. 2001. Hbridos somticos. Biotecnologa Ciencia & Desenvolvimiento, 20,mayo / junio: pp.
26-28.
ZIMMERMANN, U. 1983. Electrofusion of cells: principles
and industrial potential. Trends in Biotechnology, 1,5:
pp. 149-156.
108
III.-Captulo 3
Transformacin gentica
Daz, Marina L.; Zappacosta, Diego C.;
Franzone, Pascual M.; Ros, Ral D.
1 Introduccin
El mejoramiento gentico vegetal se origin hace aproximadamente 10.000 aos,
cuando el hombre se hizo agricultor y comenz la domesticacin de las plantas. En el siglo XX, con la incorporacin de los cruzamientos sexuales, el conocimiento de la biologa
floral de las especies, los avances de la
gentica y de la estadstica experimental,
entre otros, se desarrollaron los mtodos de
mejoramiento actualmente utilizados. El
mejoramiento gentico se basa en la existencia de variabilidad gentica para los caracteres que se desea mejorar y la reproduccin sexual para la incorporacin de los
mismos. Este hecho hace que el aprovechamiento de la variabilidad est restringido por
barreras de cruzabilidad. El reciente desarrollo de mtodos no sexuales para transferir
genes, como la transformacin gentica,
permite superar esta limitacin, abriendo
nuevas perspectivas en el mejoramiento de
las plantas.
La ingeniera gentica o transformacin
gentica, tcnica conocida como del ADN
recombinante, permite introducir en plantas
genes provenientes no slo de otras especies vegetales muy alejadas desde el punto
de vista evolutivo sino incluso de hongos, virus, bacterias y animales. Conviene destacar
que la transformacin de plantas es una tecnologa que aporta variabilidad gentica conocida sin alterar el fondo gentico. Este ltimo aspecto es de gran importancia ya que
la creacin de cultivares es un proceso
acumulativo; es decir que se desea incorporar caractersticas favorables sin perder las
mejoras logradas anteriormente. El
germoplasma transgnico es posteriormente incorporado al proceso de mejoramiento,
el cual depender de la especie y del tipo de
cultivar a obtener.
En 1983 se informaron los primeros experimentos de expresin de un transgen (gen
109
110
Un transgen est compuesto por una secuencia codificante (regin comprendida entre los codones de iniciacin y terminacin
de la traduccin) y por secuencias regulatorias
que determinan el tejido, el momento del
desarrollo y el nivel de expresin del transgen
en la planta. La adecuada expresin de los
transgenes es un aspecto importante en la
obtencin del fenotipo deseado en la planta transgnica. Muchas veces los genes utilizados provienen de bacterias y usualmente
no pueden expresarse eficientemente en
clulas eucariotas. Por ello, para optimizar la
expresin del transgen es necesario reemplazar las secuencias regulatorias bacterianas por
otras aptas para su expresin en clulas vegetales. En este contexto, la secuencia ms
importante es el promotor, sitio del ADN al
cual se une la enzima ARN-polimerasa para
iniciar el proceso de transcripcin (Fig. 1).
Cabe destacar que la expresin gnica es controlada por las secuencias regulatorias y no
depende de la secuencia codificante. Por lo
tanto, una secuencia codificante aislada de
un gen A, puesta bajo el control de un promotor aislado de un gen B, se expresar de
acuerdo con el patrn de expresin de dicho
promotor. Asimismo, en la eleccin del pro-
Constitutivos
Promotores
111
tumor-inducing
o inductor de tumores) o Ri (por
root-inducing o
inductor de races),
presentes en algunas de las agrobacterias. Se demostr
que durante la patognesis un fragmento de estos
plsmidos llamado Figura 2: Estructura del T-DNA
T-DNA
(por
transfer-DNA), es transferido a la clula estn involucrados genes cromosmicos (chv
vegetal, donde se integra al ADN A, chv B, chv E, cel, psc A y att), se produce
cromosmico de la planta y cuya expresin el procesado y la transferencia del T-DNA,
causa proliferacin de clulas de la planta a mediados por los genes vir (por virulencia)
travs de la sntesis y alteracin de la respues- que son inducidos por azcares y compuesta a hormonas vegetales. El T-DNA contiene tos fenlicos, como la acetosiringona, produgenes que se expresan eficientemente en la cidos por clulas vegetales heridas. Se conoclula vegetal infectada y producen sntesis ce con mucho detalle la etapa de la
de hormonas vegetales (llamados oncogenes patognesis que ocurre en la bacteria (ver
porque son los responsables de la prolifera- revisin de Gelvin, 2000). La regin de virucin anormal del tejido) y genes que provo- lencia (de alrededor de 30 Kb) est organizacan la sntesis de opinas (fuente de carbono da en operones esenciales para la transferencia del T-DNA (vir A, vir B, vir D, vir G) o
y nitrgeno para la bacteria).
A. tumefaciens es el caso ms estudiado que permiten incrementar la eficiencia de la
y utilizado en la transformacin de plantas. transformacin (vir C, vir E). El ingreso de
El T-DNA est delimitado por dos repeticio- Agrobacterium en la era genmica permitines directas imperfectas de 25 pares de ba- r avanzar en el conocimiento de la
ses (bp) que lo flanquean, llamadas bordes interaccin de esta bacteria con las plantas.
El desarrollo de la patognesis de planderecho e izquierdo (Fig. 2). Estos bordes son
los nicos elementos en cis necesarios para tas por Agrobacterium representa una situadirigir el procesamiento del T-DNA. Cualquier cin nica en la naturaleza: la transferencia
fragmento de ADN ubicado entre estos bor- de un elemento gentico (T-DNA) de un ordes puede ser transferido a la clula vegetal. ganismo procariota a un organismo eucariota
Contrariamente a lo que sucede con otros superior, con su subsiguiente integracin y
tipos de secuencias mviles de ADN, el T-DNA expresin en el genoma hospedador. Este
no codifica los productos que median su mecanismo de ingeniera gentica natural es
transferencia. El T-DNA es una regin relati- aprovechado para la transferencia de genes
vamente grande (ca. 20 Kb) que contiene de inters a las plantas, para lo cual, los
genes con secuencias regulatorias (promoto- oncogenes y genes de sntesis de opinas, son
res y seales de poliadenilacin) tpicamente reemplazados por un marcador seleccionable
y el gen a transferir (Fig. 2). El mtodo llamaeucariticas.
Desde la dcada de 1950-60 se sabe que do del explante (Horsch y col., 1984) conlos tumores de la agalla de la corona se desa- siste en inocular un explante con A.
rrollan si hay A. tumefaciens patognicas en tumefaciens, dejar la bacteria en contacto
presencia de heridas. Un aspecto destacable con el explante durante un cierto tiempo, en
de esta bacteria es que usa la respuesta de la l se produce la transferencia del T-DNA que
planta a las heridas (cicatrizacin y defensa) contiene un gen marcador seleccionable y el
como quimioatractivo y activador del proce- o los transgenes de inters. Posteriormente
so de patognesis. Luego de la adhesin de se transfieren los explantes a un medio de
la bacteria a la clula vegetal, etapa en la que cultivo que contiene un antibitico que ac-
112
113
114
de carburo de silicio para facilitar la entrada corporar de manera permanente la informadel ADN en las clulas en cultivo y el bombar- cin gentica transferida. A pesar de la desdeo con microproyectiles o micropartculas.
ventaja que representa el bajo nmero de
- Bombardeo de micropartculas
transformantes producido por un solo epiEs un proceso por el cual micropartculas sodio de bombardeo, la versatilidad de la
cubiertas con ADN son aceleradas por un gas aceleracin de partculas para introducir
comprimido e introducidas en clulas vege- transgenes ha superado muchas de las batales. Esta tcnica se ha ido perfeccionando rreras asociadas a otros mtodos de transy actualmente es la ms difundida entre los formacin, como son el rango de huspedes
mtodos de transformacin directa. Inicial- de Agrobacterium y las dificultades inherenmente, la fuerza impulsora de las partculas tes al cultivo y regeneracin de protoplastos.
estaba dada por plvora, pero
luego fue reemplazada por el Tabla 2: Comparacin entre mtodos de transformacin del genoma
sistema de helio comprimido nuclear
Mtodo biolstico
Agrobacterium
que brinda una mejor regulacin de la fuerza, distribucin
Especies a transformar
- dicotiledneas y algunas
- sin limitaciones
monocotiledneas
de microproyectiles y mayor
Eficiencia de transformacin
- alta
- baja
reproducibilidad entre bombar- Tipo de integracin en el - aleatoria en regiones con
- aleatoria
transcripcin
genoma vegetal
deos. Se utilizan micropro- bajo nmero de copias
- multicopia en tandem
yectiles de oro o tungsteno
independientes
- precisa
- imprecisa
(qumicamente inertes) cuyos
Construccin de vectores
- compleja
- simple
tamaos van desde 0,5 a 3 Dependencia del genotipo
- mayor
- menor
vegetal
mm, que al ser disparados a
grandes velocidades pueden
La biolstica ha demostrado ser la mejor opatravesar pared y membranas de la clula cin para la produccin de plantas
vegetal bombardeada sin causarle daos le- transgnicas de soja, sorgo, papaya, esprratales (Klein y col., 1987). Para el bombardeo go, caa de azcar y trigo.
se puede emplear cualquier tipo de explante
vegetal, desde clulas o protoplastos hasta 2.3.3 Transformacin directa vs. indirecta
plntulas completas, pasando por tejidos organizados en embriones y meristemas. El
Con el transcurso de las investigaciones
explante es generalmente sometido a un tra- se ha logrado optimizar los protocolos de
tamiento osmtico pre y posbom-bardeo, transformacin para muchas especies vegeque produce plasm-lisis celular, evitando tales; igualmente, en la actualidad, ambas
que el impacto y la penetracin de las part- vas de transformacin presentan ventajas y
culas daen las clulas (Fig. 3). Los vectores desventajas que las hacen ms o menos conplasmdicos que se usan en este tipo de pro- venientes para los distintos fines. En la Tacedimiento slo requieren un origen de bla 2 se presenta una comparacin entre la
replicacin que permita un alto nmero de transformacin del genoma nuclear mediacopias de los mismos en E. coli, aspecto que da por A. tumefaciens y el mtodo biolstico
facilita en la prctica la preparacin del ADN como representante de los mtodos de
necesario en grandes cantidades para la transformacin directa.
transformacin gentica por este mtodo.
Uno de los procesos necesarios para obEsta tcnica, sin embargo, tiene manifies- tener plantas transgnicas es la integracin
tas limitaciones. Algunas especies oponen del transgen al ADN cromosmico. Con reuna resistencia natural a la penetracin de lacin a este proceso existen diferencias enlas partculas, dada por cutculas endurecidas, tre ambos mtodos. A. tumefaciens posee
paredes celulares lignificadas o superficies un mecanismo natural muy eficiente para
vellosas. Sin embargo, la principal limitacin transferir, al ncleo celular, el T-DNA que condel mtodo contina siendo la baja relacin tiene el transgen y producir una integracin
entre el total de clulas sometidas al bom- aleatoria en regiones cromosmicas con acbardeo y el nmero de clulas que logran in- tividad transcripcional. Generalmente, los
115
116
sin fenotpica de un transgen ser diferente en distintas plantas que contienen el mismo transgen, por lo cual, para clarificar la situacin se considera a cada una de ellas
como eventos de transformacin distintos.
La aplicacin de cualquiera de estos mtodos de transformacin al mejoramiento
vegetal depende, en gran medida, de la disponibilidad de genotipos con muy buena
respuesta al cultivo in vitro. Finalmente,
cabe mencionar que en el caso de A.
tumefaciens, debido a que se trata de una
interaccin biolgica entre una planta y una
bacteria, la dependencia del genotipo es
mucho ms acentuada, ya que influyen tambin en la eficiencia de transformacin, tanto el genotipo de la planta como el de la
bacteria.
2.3.4 Genes de seleccin e informadores
En el proceso de obtencin de plantas
transgnicas, los genes marcadores
seleccionables (Tabla 3), generalmente de
origen bacteriano, cumplen un rol de relevancia, sea para poner a punto un protocolo de
transformacin o como acompaantes de
genes de inters que se desean introducir. El
gen marcador seleccionable otorga a las clulas transgnicas que lo expresan una importante ventaja, con respecto a las clulas no
transgnicas, al permitirles crecer en un medio de cultivo que contiene el agente selectivo correspondiente. Entonces, si el gen marcador codifica para una protena que confiere resistencia a agentes fitotxicos como
antibiticos o herbicidas, las clulas que lo
expresen podrn crecer y desarrollarse en
medio de cultivo que contenga dichos agentes selectivos mientras que las clulas no
transgnicas no lo harn (seleccin negativa). En otros casos, la ventaja estar dada
por la posibilidad de utilizar diferencialmente
un sustrato. As, el gen man A de E. coli permite a las clulas vegetales que lo expresan
utilizar la manosa como fuente de carbono,
lo cual no es posible para las clulas no
transgnicas (seleccin positiva). Es necesario tener en cuenta que algunas especies pueden poseer una resistencia natural a los agentes selectivos antes mencionados, por lo que
es importante evaluar este aspecto cuando
se elige el gen de seleccin a utilizar, as como
Luego de la seleccin in
vitro, las plantas regeneradas deben ser analizadas
por mtodos moleculares
para identificar aquellas
que porten y expresen los transgenes en los
niveles deseados. Para ello se emplean tcnicas como:
- Reaccin en cadena de la polimerasa
(PCR): con el uso de primers homlogos a
la secuencia del transgen se puede determinar la presencia del mismo. Esta tcnica permite hacer un screening rpido de las plantas regeneradas, aunque tiene algunas limitaciones, un resultado positivo indica solamente que en la muestra existe una secuencia que amplifica con los primers utilizados
pero no indica si el transgen se encuentra incorporado al genoma de la planta. Para
maximizar la robustez de esta prueba es necesario utilizar temperaturas de annealing
o apareamiento de primers altas (ms de 60
C) y primers relativamente largos (ms de
20 nucletidos). Una variacin de esta tcnica, PCR en tiempo real, resulta de utilidad
para evaluar el nmero de copias del
transgen incorporadas al genoma de la clula vegetal.
117
Hind III
BI
Eco RI
Sal I
Gen Marcador
1 2 3
4 5
c) 1 2 3 4 5
Sonda:
2 3
Transgen
Frag: tamao
cantidad
d) 1 2 3
4 5
> 5 kb
e) 1
BD
3 kb
Sitio de corte:
Frag: tamao
Hind III
Gen de Inters
2 kb
b)
Sal I
> 3 kb
Igual que en d)
Gen marcador
> 2 kb
f)
2 3
118
cada sitio de insercin independiente del TDNA (4-c). La aparicin de un nmero impar
de bandas indica que en un mismo sitio se
insertaron mltiples copias, ocurrieron
rearreglos o se produjo el truncado del TDNA. Si se digiere la muestra con una enzima
de restriccin que posee un sitio nico de
corte entre el gen marcador y el gen de inters y utilizando como sonda el gen marca-
La actividad de la protena debe ser medida, sea por ensayos bioqumicos o por
bioensayos, a fin de interpretar correctamente el fenotipo de la planta obtenida. Adems, es conveniente confirmar la estabilidad
meitica de los transgenes estudiando su
transmisin sexual a la generacin siguiente.
Estas tcnicas se encuentran descriptas
detalladamente en la seccin II.3 y su aplicacin para el anlisis de plantas transgnicas
en Register (1997) y en Bhat y Srinivasan
(2002).
Finalmente, el comportamiento de los
individuos transgnicos se estudia en laboratorio, invernculo y campo. Cabe aclarar que
para realizar experimentos de invernculo y
de campo es necesario contar con autorizacin de la Comisin Nacional Asesora de
Biotecnologa Agropecuaria (CONABIA) (ver
IX.-3).
3 Aporte de la transformacin gentica a
la variabilidad gentica
Como ya se mencion, la transformacin
gentica permite introducir variabilidad
gentica novedosa en las diferentes especies
vegetales. Analizando con ms detalle este
concepto podemos considerar que este aporte puede ser realizado de diferentes maneras. As, este puede consistir en:
a) La expresin de secuencias codificantes
no existentes en la especie (ejemplo: protenas insecticidas de origen bacteriano).
b)La expresin de nuevas formas allicas
de genes que ya estn presentes en el
genoma (ejemplo: tolerancia al glifosato en
soja).
c) La expresin de secuencias codificantes
presentes en el genoma pero bajo el control
de nuevas secuencias regulatorias que modifican su nivel o patrn de expresin (ejemplo: protenas relacionadas a la patognesis).
d)La inhibicin de la expresin de genes
residentes en el genoma .
Para lograr la inhibicin de la expresin
gnica se pueden usar diferentes tcnicas:
cosupresin, antisentido y la denominada
interferencia del ARN. Todas ellas se basan
en un proceso denominado silenciamiento
gnico post-transcripcional. Este involucra la
degradacin del ARN mensajero producido
119
120
chaperonas
endgenos.
sistemas
enzimticos
distribuy en 12 pases. Esta superficie estuvo ocupada prcticamente por 4 cultivos: soja
(62%), maz (21%), algodn (12%) y canola
(5%). Los caracteres modificados que presentaron estos cultivos fueron resistencia a herbicidas (75%), resistencia a insectos (17%) o
una combinacin de ambos (8%). En la Argentina los eventos con autorizacin de
comercializacin son los siguientes: soja (tolerancia a glifosato), maz (resistencia a
lepidpteros, tolerancia a glufosinato de
amonio) y algodn (resistencia a
lepidpteros, tolerancia a glifosato). La
CONABIA (ver en la pgina de la Secretara
de Agricultura, Ganadera, Pesca y Alimentos,
Repblica
Argentina;
http://
www.sagpya.mecon.gov.ar/), ha autorizado
desde el ao 1991, 520 solicitudes para liberaciones a campo, en distintas especies y con
diferentes eventos de transformacin.
Los cultivos transgnicos actuales corresponden a lo que se denomina la primera
generacin que tiene por objetivo el aumento de la productividad de los cultivos, la reduccin en el uso de agroqumicos, la conservacin de la tierra arable, el agua y la energa, la reduccin de la contaminacin del
ambiente y los beneficios para la salud humana derivados de estos aspectos. Se considera que la segunda generacin de cultivos
transgnicos tendr ms beneficios directos
para los consumidores. Estos comprenden el
mejoramiento de la calidad nutricional (protenas, aceite, vitaminas y minerales), la eliminacin de alergenos, la fitoremediacin (es
decir la recuperacin de ambientes contaminados mediante el uso de plantas) y la utilizacin de plantas como bioreactores para la
expresin de protenas recombinantes con
fines tales como la produccin de vacunas
comestibles, anticuerpos y otras protenas de
uso teraputico o industrial. Esta aplicacin
se conoce como molecular farming (produccin de molculas en la granja) y presenta numerosas ventajas para la produccin en
gran escala de estas protenas en particular
en lo que respecta a costos, practicidad y seguridad. Sin embargo an quedan algunos
aspectos que limitan su potencial como
biorreactores como son la calidad y homogeneidad del producto final. En los ltimos
10 aos, se han desarrollado varios sistemas
de expresin basados en plantas y en la ac-
121
122
quieren de genotipos con una excelente respuesta al cultivo in vitro, lo cual resulta en
una clara limitacin cuando se desea aplicar
esta tecnologa a los materiales usados por
los mejoradores, los que generalmente no
poseen esta caracterstica. Por ello, se est
tratando de reducir y si es posible evitar la
fase de cultivo in vitro durante el proceso de
transformacin, lo que permitir ampliar el
rango de genotipos a los cuales se podr
aplicar esta moderna tecnologa. As, se desarroll un mtodo eficiente y reproducible
de transformacin in planta para
Arabidopsis thaliana. Este consiste en infiltrar con vaco plantas adultas de esta especie, con una suspensin de A. tumefaciens
de modo que los tejidos y rganos
reproductivos sean invadidos por la bacteria.
Posteriormente se propuso una simplificacin
de este mtodo que consiste en reemplazar
el tratamiento de vaco y sumergir la
inflorescencia en una suspensin bacteriana
que incluye un surfactante. Las plantas
transgnicas que se obtienen por
autofecundacin de las plantas as transformadas, son hemicigotas y se demostr que
esta metodologa produce la transformacin
de la gameta femenina.
El logro de determinados objetivos como
puede ser el redireccionamiento de una ruta
metablica o la modificacin de un carcter
complejo de inters agronmico como por
ejemplo la resistencia durable a enfermedades fngicas, requiere de la integracin de
mltiples transgenes y de la expresin coordinada de los mismos en la planta
transgnica. Este tema est recibiendo notable atencin (ver revisin de Franois y col.,
2002).
Los mtodos de transformacin que hemos descripto se basan en la utilizacin de
genes marcadores seleccionables. Sin embargo, hay razones por las cuales la presencia
del marcador no es deseable en plantas
transgnicas que se liberan al ambiente. Hay
un manifiesto rechazo por parte del pblico
con respecto a la utilizacin de genes de resistencia antibiticos y en determinadas situaciones, el uso de genes de resistencia a
herbicidas puede ser inconveniente. Por otra
parte, desde un punto de vista experimental puede ser necesario transformar una misma planta varias veces con distintos trans-
7 Lecturas recomendadas
AGRAWAL, N.; DASARADHI, V.; MOHAMMED, A.;
MALHOTRA, P.; BHATNAGAR, R. y MUKHERJEE, S. 2003
RNA Interference: Biology, Mechanism , and
Applications. Microbiology and Molecular Biology
Reviews Dec. 2003, p. 657-685.
BIRCH R. 1997. Plant transformation: Problems and
strategies for practical applications. Annu. Rev.Plant
Physiol. Plant Mol.Biol. 48: 297-326.
FRANOIS, I.; BROEKAERT, W.; CAMMUE, B. 2002.
Different approaches for multi-transgene-stacking in
plants. Plant Science 63: 281-295.
GELVIN S. 2000. Agrobacterium and plant genes
involved in T-DNA transfer and integration. Annu. Rev.
Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 51: 223-256.
HANIN, M.; PASZKOWSKI, J. 2003. Plant genome
modification by homologous recombination. Current
Opinion in Plant Biology 6: 157-162.
HORSCH, R.; FRALEY, R.; ROGERS, S.; SANDERS, P.;
LLOYD, A.; HOFFMAN, N. 1984. Inheritance of functional
foreign genes in plants. Science 223: 496-498.
KLEIN, T.; WOLF, E.; WU, R.; SANFORD, J. 1987.High
velocity microprojectiles for delivering nucleic acids into
living cells. Nature 327: 70-73.
KUSABA, M. 2004. RNA interference in crop plants
Current Opinion in Biotechnology 15: 1-5.
MALIGA, P. 2002. Engineering the plastid genome of
higher plants. Current Opinion in Plant Biology 5: 164172.
PUCHTA, H. 2003. Marker-free transgenic plants. Plant
Cell, Tissue and Organ Culture 74: 123-134.
REGISTER J. 1997. Approaches to evaluating the transgenic
status of transformed plants. TiBTech, 15:141-6.
123
III.-Captulo 4
Polinizacin y fertilizacin in vitro.
Picca, Aurora; Cardone, Susana
1 Introduccin
Muchas plantas con flores producen menos frutos maduros que flores, y los frutos, a
su vez, generan menos semillas que el nmero de vulos disponibles para la fecundacin.
Considerando que la produccin de polen no
es el factor limitante, existen diferentes razones que explican esta situacin. En ocasiones, a pesar de la ocurrencia de la polinizacin, la fecundacin no puede llevarse a cabo.
Otras veces, la fecundacin ocurre normalmente pero el embrin aborta en forma precoz. En cualquiera de estas circunstancias, las
tcnicas de cultivo in vitro y manipulacin de
clulas aisladas son apropiadas para lograr el
proceso completo de desarrollo del embrin
y del endosperma y la obtencin de semillas
normales.
En este captulo se utilizarn indistintamente los trminos fecundacin y fertilizacin como sinnimos, refirindose a la
unin de las gametas masculina y femenina
para originar un nuevo individuo.
La tcnica de fertilizacin o polinizacin
ovular in vitro fue desarrollada por Kanta
et al. en 1962, quienes demostraron que en
algunas especies de papaverceas los granos
de polen tenan la capacidad de germinar in
vitro directamente sobre los vulos en cultivo. En estas condiciones el tubo polnico alcanzaba el saco embrionario para concretar
la fertilizacin, con la consiguiente formacin
de semilla normal en el mismo medio de cultivo. Esta tcnica desarrollada en Papaver
somniferum, ha sido luego empleada en varias especies de plantas como Dianthus
caryophyllus, Nicotiana tabacum, N. rustica,
Argemone mexicana, Eschechlozia
californica, Petunia violacea, Antirrhinum
majus y Dicranostigma franchetianum.
Bajo el nombre de polinizacin in vitro
se suele englobar a varias tcnicas que si bien
poseen puntos en comn, difieren en otros.
Entre ellas se pueden citar la polinizacin in
vitro de vulos, la polinizacin placental
125
126
127
128
129
130
131
132
Preglobular
Globular
Embrin maduro
Corazn
Torpedo
133
134
PARTE IV
Mtodos para acelerar programas
de mejoramiento
e identificacin varietal
135
136
Identificacin de Haploides
IV.-Captulo 1
Obtencin de plantas doblehaploides
Polci, Pablo; Conti, Vernica; Miranda, Rubn
1 Introduccin
Antecedentes
El valor de los haploides es conocido desde 1922, cuando se descubri la produccin
espontnea de los mismos. Actualmente son
ms de cien las especies vegetales capaces
de producirlos in vivo. Sin embargo, la frecuencia con la cual se producen es muy baja,
con valores que van de 0,001 a 0,01 %.
Entre los casos de haploida espontnea
es comn la poliembriona, que, con una
gran variacin entre los distintos genotipos,
ocurre en una amplia gama de especies, gneros y familias. En estos casos es frecuente
137
138
aaBB
Generacin parental
1/4
1/4
1/4
1/4
1/4
1/4
1/4
1/4
139
Mutagenesis
Si se aplica mutagnesis a un sistema de
haploides, se obtienen mutantes slidos,
logrndose la homocigosis del mutado rpidamente luego de la duplicacin con
colchicina. Entre los agentes mutagnicos
ms frecuentemente utilizados se encuentra
la N-metil-N-nitrosurea (20 mM), los rayos
(0,5 krad) y el etil metil sulfonato.
Transformacin gentica
Rige el mismo principio que para
mutagnesis. La transformacin de haploides
permite la obtencin del transgen en
homocigosis luego de la duplicacin con
colchicina. Puede realizarse con PEG,
microinyeccin o utilizando Agrobacterium
tumefaciens.
Produccin de plantas homogamticas
Asparagus officinalis es una especie cultivada, dioca, en la cual las plantas femeninas son XX y las masculinas son XY. De esta
manera, para obtener una poblacin de
plantas deben cruzarse ambos tipos, lo que
dar una progenie constituida por 50 % de
plantas XX y 50 % de plantas XY. Sin embargo, desde el punto de vista del productor, es
deseable la obtencin de una poblacin cons-
tituida solamente por plantas XY, que tienen un menor contenido de fibra y son, por
lo tanto, preferidas por los consumidores.
141
VI. Semigamia: el ncleo del gameto masculino penetra en la ovoclula pero sin fusionarse con el ncleo femenino. Ambos ncleos
comienzan a dividirse independientemente,
produciendo un individuo haploide con tejidos de origen materno y paterno.
142
143
145
to de amonio, el agregado de
glutamina, y el empleo de APA (cido fenil actico) como auxina para favorecer la induccin (Kasha y col.,
2001).
(h) Medio de regeneracin: la
composicin del medio de regeneracin puede afectar el vigor y supervivencia de las plntulas.
Kasha et al. (2001), trabajando
con cebada, encontraron en este
mtodo una manera eficiente de produccin de DH, con una mejor respuesta y una menor dependencia del
genotipo que en el caso del cultivo
de anteras. A esto se le suma la ventaja de contar con una elevada cantidad de micrsporas haploides en un
estado fisiolgico uniforme, que constituyen excelentes blancos para la
mutagnesis, la seleccin y la transformacin.
- Hibridacin interespecfica e
intergenrica: en este caso los
haploides se originan a travs de la
eliminacin del genoma del
polinizador. El sistema de hibridacin
de trigo x Hordeum bulbosum, inicialmente descubierto y empleado
con xito en cebada, ha sido considerado superior al cultivo de anteras
por tres razones:
(a) La produccin de haploides es
ms fcil.
(b) El tiempo requerido para la regeneracin de plantas es menor.
(c) La eficiencia en la regeneracin
de plantas parece ser mayor.
146
los cruzamientos, en el caso de trigo, utilizando maz como polinizador (Fig. 6). Luego de
la fertilizacin del vulo de trigo por el polen
de maz, durante las primeras mitosis del
cigoto, los cromosomas del maz son eliminados. Esto se debe a una incompatibilidad
entre los cinetocoros de estos cromosomas
y las fibras de los husos acromticos que hace
que en las primeras anafases los cromosomas
de maz vayan quedando rezagados en el
citoplasma, donde finalmente son degradados. El resultado de este proceso es un em-
segregacin anafsica de las cromtides. Afecta por lo tanto slo a las clulas que se encuentran en divisin. Puede aplicarse a
plntulas, plantas adultas, semillas,
micrsporas y anteras.
El tratamiento puede realizarse utilizando una solucin acuosa donde se sumergen
las races, dejando fuera la parte area. Tambin se puede hacer llegar la solucin al interior de la planta utilizando una jeringa con la
dosis deseada (microinyeccin), o por absorcin de la solucin a travs de los tallitos decapitados, sobre los que se vierte.
Otra forma de hacerlo es tratar los callos
con colchicina antes de trasladarlos al medio
de regeneracin. Este ltimo mtodo permite la obtencin de gran nmero de
doblehaploides, pero presenta la desventaja de que la mayora de las plantas as obtenidas son mosaicos cromosmicos.
Otra alternativa, para micrsporas y
anteras, es la adicin del agente duplicador
directamente en el medio de induccin, antes de la primer mitosis. La diploidizacin en
este momento requiere menos tiempo y esfuerzo y ha sido utilizada en programas de
mejoramiento de trigo, maz, Tritordeum y
arroz. El problema de la suplementacin del
medio de induccin con colchicina es que reduce la embriognesis en trigo, si bien en
Oryza sativa y Brassica la puede incrementar. La duracin del tratamiento y la concentracin de la solucin varan para cada especie.
Cualquiera que sea el mtodo con que se
duplique la planta, un macollo o slo una
yema floral, lo importante es lograr que las
semillas que stas produzcan sean viables.
5 Consideraciones finales
La eleccin de los progenitores y la seleccin son etapas decisivas en un programa de
mejoramiento que avanzar luego generacin tras generacin, hacia una homocigosis
que permita entrar en las etapas de evaluacin. Ganar tiempo en estos casos puede significar una reduccin de costos muy importante y una ms temprana entrada en el
mercado de la nueva variedad. En el caso de
una especie autgama como el trigo es posible ganar generaciones haciendo dos cosechas en un ao, especialmente en aquellos
cultivares de corto ciclo vegetativo. Esto, sin
147
148
6 Lecturas Recomendadas
ATANASSOV, A.; ZAGORSKA, P.; BOYADJIEV, P.;
DJILIANOV, D. 1995. In vitro production of haploid plants.
World Journal of Microbiology & Biotechnology 11, 400408.
BERNARD, S. 1980. In vitro androgenesis in hexaploid
triticale: determination of physical conditions increasing
embryoid and green plant production. Z. Pflazenzucht
85: 308-321.
BHOJWANI, S.S.; RAZDAN, M.K. 1996. Haploid
Production. En: Plant Tissue Culture: Theory and Practice,
Capitulo 7. S.S. Bhojwani y M.K. Razdan (eds.) Elsevier,
Amsterdam. pp.167-213.
KASHA, K.J.; SIMION, E.; ORO, R.; YAO, W.A.; HU, T.C.;
CARLSON, A.R. 2001. An improved in vitro technique for
isolated microspore culture of barley. Euphytica 120:379385.
KASPERBAUER, M.; COLLINS, G. 1972. Reconstitution of
diploids from leaf tissue of anther derived haploid in
tobacco. Crop Sci. 12: 98-101.
LACADENA, J.R. 1988. Variaciones cromosmicas
numericas. En: Gentica, Captulo 15. Lacadena, J.R.(ed.)
A.G.E.S.A., Madrid. pp. 683-719.
WANG, C.; CHU, Z.; SUN, C.; CHI, C.; WU, W. 1978. Studies
on the albino pollen plantlets of rice. En: Proc. Symp.
Plant Tissue Culture, Pekin Press, pp149-160.
IV.-Captulo 2
Aplicaciones de los marcadores
moleculares
Carrera, Alicia; Tranquilli, Gabriela;
Helguera, Marcelo
Las herramientas descriptas en II.-4 se
utilizan en numerosas reas relacionadas con
el mejoramiento vegetal y el anlisis de la
biodiversidad. A continuacin se describen
algunas de esas aplicaciones. Cada uno de
estos campos posee una base terica en ocasiones compleja y muchos de ellos requieren
del uso de programas de estadstica avanzada. De este modo, el presente captulo debe
ser considerado como una introduccin a los
temas considerados.
1 Identificacin de genotipos Pureza
varietal
El control de la pureza varietal y la discriminacin de variedades protegidas (es decir,
registradas) requieren de una adecuada identificacin de los materiales. Esta identificacin
se basa tradicionalmente en el uso de
descriptores morfolgicos y fisiolgicos. En la
mayora de los cultivos, la utilizacin de recursos genticos similares en diferentes programas de mejoramiento ha reducido la eficiencia de discriminacin por marcadores
fenotpicos. Por otro lado, varios de los caracteres usados como descriptores presentan
limitaciones en cuanto al nmero restringido
de variantes, influencia ambiental y dependencia del estadio de desarrollo de planta.
Como alternativa para resolver estos problemas, los polimorfismos moleculares de protenas y ADN resultan de utilidad en la determinacin de los criterios DUS (distincin,
uniformidad y estabilidad). Se utilizan localmente como datos complementarios de los
descriptores morfolgicos y fisiolgicos para
el registro de los cultivares, en aquellos casos
en que las diferencias entre materiales no son
conspicuas. ISTA (International Seed Testing
Association) y UPOV (Union Pour La
Protection Des Obtenions Vegtales) son
entidades internacionales que han desarrollado protocolos para estandarizar los anlisis de laboratorio para identificacin de
cultivares y reglamentar la utilizacin de diferencias moleculares en el control de la pureza varietal, la discriminacin de variedades
protegidas y en el otorgamiento de nuevas
patentes. Con el objeto de evitar el registro
de variedades esencialmente equivalentes,
UPOV ha establecido umbrales mnimos de
diferencias moleculares sobre la base de distancias genticas obtenidas a partir de caracteres tradicionales. En la actualidad se dispone de patrones moleculares varietales para
una extensa lista de especies. Como ejemplo podemos mencionar al trigo pan
(Triticum aestivum L.), para el que se desarroll una matriz de identificacin varietal
sobre la base de marcadores microsatlites
de ADN, que permite la individualizacin de
variedades argentinas. (Manifesto y col.,
1998). A partir de datos moleculares es posible obtener distintos ndices de distancia
gentica y generar esquemas ramificados o
dendrogramas, que ponen en evidencia la
similitud gentica de los materiales (Ver VI.1).
La pureza varietal es uno de los principales requisitos de la semilla comercial. En la
produccin de semilla hbrida la heterogeneidad intralote puede originarse por falta de
uniformidad en las lneas parentales, polinizacin cruzada espontnea o mezcla de semillas durante la cosecha o embolsado. Los
individuos fuera de tipo pueden identificarse mediante el patrn molecular. Del mismo
modo pueden establecerse las relaciones de
descendencia entre una serie de lneas
parentales y sus hbridos.
Se ha observado que an despus de 5-6
generaciones de autofecundacin, una lnea
puede no haber alcanzado completa uniformidad para ciertos marcadores moleculares.
Esto puede interpretarse como una porcin
residual del genoma que permanece segregando. Cuando la evaluacin de estos lotes
muestra uniformidad morfolgica, fisiolgica
y de caracteres agronmicos, pueden aceptarse ciertos niveles de variacin molecular sin
expresin fenotpica evidente. El mejorador
considerar en cada caso los niveles mximos
de variacin admisibles. Sin embargo, la ocurrencia de polimorfismos moleculares
149
150
151
152
Figura 1. Esquema de un programa de retrocruzas, asistido por un marcador especfico para el gen de resistencia
a roya de la hoja del trigo Lr47. Pavon: variedad donora de la fuente de resistencia. PI Gaucho: variedad
susceptible recurrente. BC: generacin de retrocruza.
153
154
6 Clonado posicional
El clonado posicional de un gen es un
claro ejemplo de la utilizacin de informacin
gentica (disposicin espacial de genes),
molecular (secuencia nucleotdica de genes)
y del funcionamiento (expresin de los
genes) de un genoma (conjunto de genes)
para identificar al gen responsable de un carcter particular.
El primer paso para lograr esto es seleccionar parentales que sean contrastantes
para el gen en cuestin; por ejemplo, una
variedad de trigo susceptible y otra resistente a la roya de la hoja, para desarrollar una
poblacin de mapeo segregante para el gen
de resistencia (Stein y col., 2000). Una vez
seleccionados los parentales se desarrolla una
poblacin segregante para el carcter, la ms
sencilla es una F2.
Posteriormente, se caracteriza esta poblacin utilizando marcadores moleculares
(microsatlites, RFLP, AFLP, RAPD) que cubran
todo el genoma del organismo en estudio
(en este caso trigo).
El siguiente paso es determinar el
fenotipo de los individuos que constituyen
la poblacin de mapeo (en este caso plantas
resistentes o susceptibles a roya de la hoja).
Una vez obtenida la informacin fenotpica
y molecular de la poblacin de mapeo, con
la ayuda de programas especficos de computacin (por ejemplo, Mapmaker QTL), se
identificarn marcadores ligados genticamente al carcter en una regin especfica del genoma.
Una vez identificada la regin cromosmica portadora del gen responsable del carcter, se satura dicha regin con nuevos
marcadores moleculares. El objetivo es delimitar el intervalo del genoma al fragmento
mnimo posible que contenga al gen de inters. Muchos de estos marcadores pueden
obtenerse del mapeo comparativo, identificando las regiones cromosmicas colineares
de las especies ms estudiadas, por ejemplo
en plantas, arroz, Arabidopsis, maz, sorgo,
tabaco, etctera.
Una vez reducido al mnimo el intervalo
de genoma portador del gen de inters, el
paso siguiente es obtener la secuencia
nucleotdica del mismo. Una forma de hacerlo es mediante una caminata cromosmica.
155
156
tud (I) o distancia gentica (D) que cuantifican la semejanza o diferencia gentica entre
poblaciones a partir de las frecuencias allicas
(Ver VI.-1 ).
La diversidad gentica cuantificada por
marcadores moleculares puede mostrar por
ejemplo, que en una especie nativa de inters forestal todas las poblaciones presentan
altos niveles de variabilidad gentica y son
bastante similares entre s. En este caso la
decisin de cules poblaciones formarn parte del programa de conservacin podra basarse en consideraciones exclusivamente prcticas ya que las poblaciones son genticamente equivalentes. Por el contrario, una
especie compuesta de poblaciones con niveles bajos de variabilidad en cada unidad pero
con alto grado de diferenciacin entre poblaciones, requerir que los esfuerzos de proteccin sean dirigidos hacia tantas poblaciones como sea posible, ya que cada una de
ellas posee una identidad gentica diferente. Poblaciones de especies endmicas, con
niveles de diversidad gentica extremadamente bajos y un reducido nmero de individuos, son normalmente ingresadas a la categora de especies en peligro de extincin.
En este punto, es importante recordar
que los marcadores moleculares representan
variacin gentica esencialmente neutra, es
decir se encuentran sometidos a la accin de
fuerzas evolutivas no selectivas tales como
deriva o flujo gnico. Las decisiones finales
de un programa de conservacin deberan
por lo tanto combinar los datos obtenidos a
partir de marcadores moleculares junto con
la evaluacin de ciertos rasgos morfolgicos,
fisiolgicos o reproductivos, que son crticos
en el proceso de adaptacin y supervivencia
de las poblaciones en su hbitat.
El conocimiento de los componentes de
variacin entre y dentro de las poblaciones
naturales puede utilizarse adems en situaciones de repoblamiento, es decir, la introduccin de individuos en reas en proceso
de declinacin. De acuerdo a la informacin
obtenida por la caracterizacin molecular, es
posible seleccionar la las poblaciones
donadoras sobre la base de la similitud
gentica con la receptora, de modo de evitar los efectos indeseables de la depresin
por exogamia.
Las malezas de mayor impacto en la agri-
157
permiten cuantificar cada uno de estos procesos. Si el flujo gnico se produce bsicamente a travs de polen, los marcadores de ADN
de organelas, como por ejemplo cloroplastos,
no sern transferidos de una poblacin a otra
porque este tipo de informacin es slo heredada por va materna. En contraste, si el
flujo gnico se realiza principalmente a travs de semillas, tanto los marcadores de herencia materna como los de herencia
biparental o nuclear, sern transmitidos entre poblaciones. Mediante el uso de marcadores altamente polimrficos como los
microsatlites es posible determinar cul ha
sido la planta donadora del polen de cada
semilla por ejemplo, en especies arbreas. En
este caso, por un lado se obtiene informacin acerca de la distancia de transporte de
polen y adems constituye un test de paternidad.
La estimacin del flujo gnico ha cobrado especial relevancia en los estudios tendientes a evaluar el efecto sobre el ambiente de los materiales genticamente modificados. Dicho efecto comprende diferentes
facetas. Por un lado la posibilidad de que
poblaciones silvestres cercanas a las formas
cultivadas, adquieran el transgen mediante
fecundacin cruzada, generando cambios en
la dinmica poblacional, competitividad o
relacin con otro miembros de la comunidad
bitica tales como polinizadores, patgenos,
etc.. Esta potencial transferencia de genes se
torna preocupante cuando se trata de flujo
gnico hacia poblaciones silvestres catalogadas como malezas. En este escenario los
marcadores moleculares de ADN o
isoenzimas constituyen herramientas muy
tiles. Los individuos de una determinada
poblacin pueden ser analizados y comparados con su progenie, producto de una polinizacin libre. Los alelos que no estaban presentes en la poblacin materna son atribuidos al ingreso externo de polen del cultivo.
Evaluando poblaciones a distancias crecientes desde una determinada fuente de polen, el flujo gnico puede ser cuantificado, y
cuando esta informacin se complementa
con datos de compatibilidad sexual,
polinizadores y clima se arriba a una serie de
conclusiones que pueden aplicarse al cultivo
en gran escala de variedades transgnicas. A
modo de ejemplo, con el objeto de estable-
158
En la evolucin del gnero Citrus ha operado la hibridacin natural a travs de reproduccin sexual pero tambin estn presentes mecanismos apomcticos que constituyen
barreras al intercambio de genes. La taxonoma de este grupo resulta particularmente
compleja ya que no puede ser aplicado el
concepto biolgico de especie. Marcadores
de ADN han permitido esclarecer las relaciones de este polimrfico grupo que incluye
naranjas, limones, limas y mandarinas.
Los estudios moleculares ms recientes
han colocado al tomate, previamente denominado Lycopersicon esculentum, dentro
del gnero Solanum, pasndose a denominar Solanum lycopersicon. Los estudios sobre ADN de cloroplasto y la similitud de los
mapas de ligamiento constituyen evidencias
de que el tomate y la papa comparten un
antecesor comn muy reciente. Esta informacin resulta de gran aplicacin en el mejoramiento de estos cultivos as como en la comprensin de la evolucin de los genomas.
10 Lecturas recomendadas
ANDERSEN, J. R.; LBBERSTEDT, T. 2003 Functional
markers in plants. Trends in Plant Science 8: 554-560.
ANGIOLILLO, A.; MENCUCCINI, M.; BALDONI, L. 1999.
Olive genetic diversity assessed using amplified fragment
polymorphisms. Theor. Appl. Genet. 98: 411-421.
CARRERA, A.; PIZARRO, G.; POVERENE, M.; FEINGOLD,
S.; BERRY, S.; LEN, A. 2002. Variability among inbred
lines and RFLP mapping of sunflower isozymes. Genetics
and Molecular Biology 25: 65-72.
FALCONER, DS. 1988. Introduction to quantitative
genetics. New York, Longman.
GRIFFITH, S.; ANTHONY, J.F.; GELBART, WILLIAM, M.;
MILLER, JEFFREY H.; LEWONTIN, RICHARD C.1999.
Modern Genetic Analysis. New York: W.H: Freeman &
Co.
(eds.)
ISBN
0-7167-3118-5
http://
w w w . n c b i . n l m . n i h . g o v / b o o k s /
bv.fcgi?call=bv.View..ShowSection&rid=mga
GODT M, HAMRICK J. 1998. Allozyme diversity in the
grasses. En: Population biology of grasses. G. P. Cheplick
(ed). Cambridge University Press. 399 pp.
MANIFESTO M.M., SCHLATTER A.R., HOPP H.E., SUREZ
E.Y., AND DUBCOVSKY J. Quantitative evaluation of
genetic diversity in wheat germplasm using molecular
markers. 2001, Crop Science 41: 682- 690.
MOORE G. 2001. Oranges and lemons: clues to the
taxonomy of Citrus from molecular markers. Trends in
Genetics 17: 536-540.
159
160
PARTE V
Mtodos de propagacin y
conservacin de germoplasma
161
162
V.-Captulo 1
Micropropagacin
Olmos, Sofa; Luciani, Gabriela;
Galdeano, Ernestina
1 Introduccin
La micropropagacin consiste en la propagacin de un genotipo a gran escala a travs del empleo de tcnicas de cultivo de tejidos. El cultivo es as una herramienta muy til
en los programas de mejoramiento, ya que
tiene el potencial de producir plantas de calidad uniforme a escala comercial, a partir de
un genotipo selecto y con una tasa de multiplicacin ilimitada.
Esto es posible gracias a la propiedad de
totipotencia que tienen las clulas vegetales; esto es la capacidad de regenerar una
planta completa cuando estn sujetas a los
estmulos adecuados. As, las clulas
somticas de cualquier tejido podran formar
tallos, races o embriones somticos de acuerdo con la competencia que posean y al estmulo que reciban.
Esta regeneracin ocurre en fases consecutivas: la fase de desdiferenciacin, donde
las clulas se vuelven competentes para responder ante cualquier estmulo organognico
o embriognico; la fase de induccin, donde las clulas se determinan para formar un
rgano o embrin, y la fase de realizacin,
donde se forma el rgano o embrin propiamente dicho. Estas fases estn directamente afectadas por el balance hormonal del
medio de cultivo, por lo cual la optimizacin
de los protocolos de regeneracin debe realizarse teniendo en cuenta los requerimientos intrnsecos de cada genotipo en cada fase
del cultivo. As, en general, puede decirse que
el proceso de desdiferenciacin generalmente es promovido por una auxina, la fase de
induccin por un balance hormonal especfico del rgano o embrin a formarse y la fase
de realizacin, por una disminucin de la concentracin hormonal en el medio de cultivo.
2 Etapas de la micropropagacin
La regeneracin de plantas in vitro presenta cuatro etapas principales: 1) estableci-
miento del cultivo, 2) desarrollo y multiplicacin de vstagos, 3) enraizamiento y 4) aclimatacin de las plntulas. Generalmente, las
etapas de enraizamiento y aclimatacin pueden combinarse en condiciones ex vitro. En
algunos casos tiene importancia considerar
una etapa previa (Etapa 0), que es la etapa
de preparacin de los explantos para el establecimiento.
163
anlisis directamente sobre las plantas donantes, previo establecimiento, presenta dos
ventajas. En primer lugar, el empleo de tejidos maduros permite visualizar los sntomas
ms marcados de la enfermedad; en segundo lugar, la carga de patgenos es mayor y
por lo tanto la precisin del sistema de deteccin aumenta. Por otro lado, las plantas
enfermas pueden tratarse con tcnicas adecuadas para la eliminacin de patgenos
como la termoterapia, la quimioterapia a travs de la aplicacin de antibiticos, desinfectantes, antivirales y el cultivo de meristemas.
La desinfeccin superficial incluye varios
pasos: el lavado de los explantos con agua
corriente, el empleo de etanol al 70% por 1
minuto, seguido de concentraciones variables
de hipoclorito de sodio (0,5 a 1,5% de cloro
activo) con unas gotas de tensoactivos para
favorecer su penetracin y actividad. Posteriormente, los explantos deben ser enjuagados al menos tres veces con agua destilada
estril.
Algunos patgenos permanecen latentes
y se expresan cuando son transferidos a un
medio de cultivo nuevo. En general, estos
patgenos incluyen los patgenos superficiales del material vegetal, los patgenos
endgenos y los patgenos propios del manejo en laboratorio. En la Etapa 1 tambin
pueden observarse infecciones por bacterias
y hongos asociados a trips que sobreviven a
los tratamientos de esterilizacin y por
patgenos endgenos latentes dentro del
sistema vascular, resultado de una esterilizacin inefectiva de los explantos. Estos
patgenos latentes podran manejarse mediante el empleo de bacteriostticos o
antibiticos en el medio de cultivo.
Etapa 2: Multiplicacin
165
emplea como medio basal el medio MS completo sugerido por Murashige & Skoog (1962)
suplementado con 3% de sacarosa como
fuente de carbono. A este medio se le adicionan adems reguladores de crecimiento,
tanto del tipo de auxinas como de citocininas.
La etapa de multiplicacin generalmente
comprende dos perodos, la fase de induccin y la fase de multiplicacin propiamente
dicha. La primera implica, generalmente, el
empleo de concentraciones elevadas de reguladores de crecimiento (generalmente de
auxinas ms que citocininas) para favorecer
la desdiferenciacin. La segunda etapa requiere del empleo de un balance hormonal
adecuado para favorecer los procesos de diferenciacin y multiplicacin celular. En este
caso, el sistema es ms dependiente de reguladores del tipo de las citocininas. En algunos casos, como ocurre en la formacin de
embriones somticos, se requiere de una tercera y cuarta etapa, denominadas de maduracin y de germinacin respectivamente,
cuya duracin vara entre 1 a 2 semanas. Para
la etapa de maduracin se adiciona ABA (cido absccico) al medio basal en rangos de 5 a
20 micromolar, seguido del subcultivo a un
medio basal conteniendo AG (cido
giberlico) en concentraciones de 0,1-1
micromolar, cuyo fin es lograr la germinacin
de los embriones obtenidos.
Los tipos de auxinas (a) y citocininas (b) y
los rangos de concentracin ms empleados
se mencionan a continuacin: a) IBA (cido
3-indolbutrico): 0,1-2 M; 2,4-D (cido 2,4diclorofenoxiactico): 4-35 M; AIA (cido 3indolactico): 0,1-2 M ; ANA (cido
naftalenactico): 1-5 M; y, picloram: 1-10
M; b) BA (N6-benciladenina): 1-20 M; CIN
(cinetina): 0,1-1 M; ZEA (zeatina): 1-10 M;
2ip (isopentiladenina): 1-5 M ; y, TDZ
(tidizuron): 0,01-1 M.
Los tipos de reguladores, sus combinaciones y rangos de concentraciones deben ser
optimizados para cada especie, genotipo y
etapa de multiplicacin determinada. Los
cultivos se incuban en luz a 272 C con 14
horas de fotoperodo e intensidad lumnica
moderada (100 mol m-2 s-1).
La presencia de compuestos fenlicos
oxidados se encuentra asociada con tejidos
vegetales sometidos a situaciones de estrs,
tales como aquel provocado por el dao
mecnico producido durante el aislamiento
del explanto de la planta madre.
Estos compuestos se encuentran en ge-
166
rante la aclimatacin ex vitro. Por ello, es fundamental conocer el rol de los distintos factores que inciden negativamente sobre el
desarrollo morfognico normal (auttrofo) in
vitro. Estos factores son el ambiente de cultivo, los componentes orgnicos e
inorgnicos del medio, los reguladores de crecimiento, la luz y la temperatura. Una baja
humedad relativa, elevada irradiacin, la remocin de la fuente de carbohidratos del
medio de cultivo y la defoliacin de las plantas para estimular la formacin de hojas nuevas estimulan la fotosntesis y otras actividades metablicas de las hojas en forma normal. Otras estrategias para lograr un ptimo
crecimiento implican el empleo de retardantes del crecimiento para estimular la formacin de hojas nuevas despus del
transplante. O bien, el empleo de altos niveles de CO2 (antagonista del etileno) para estabilizar la va de lignificacin y prevenir la
vitrificacin a travs de la inhibicin de la
hiperhidratacin, la hipolignificacin y la formacin de aernquima.
167
168
169
blanco y negro
Figura 3: Etapas de la micropropagacin en plantas de paraso gigante, Melia azedarach var. gigantea L. (Olmos
et al., 2002): A) Huerto semillero de paraso gigante con ejemplares de seis aos de edad, provincia de Misiones,
Danzer Forestacin S.A. Las semillas de los genotipos seleccionados fueron empleadas para generar una poblacin
de plantas donantes de explantos. B) Etapa 0, Preparacin del material vegetal: plantas de origen sexual de 6 meses
de edad crecidas en condiciones de invernadero y utilizadas como donantes de meristemas. C) Etapa 1: Establecimiento
del cultivo: vstagos desarrollados a partir de meristemas luego de 30 das sobre medio de establecimiento (Medio
basal de Murashige y Skoog, 1962 (MS) suplementado con 2,22 M 6-bencil amino-purina (BAP) + 0,29 M cido
giberlico (GA3) + 0,25 M cido 3-indolbutrico (IBA). D) Etapa de Multiplicacin: vstagos luego de 30 das sobre
medio de multiplicacin (medio MS suplementado con 2,22 M BAP, estos vstagos fueron empleados como
explantos para los subcultivos siguientes o para pasar a la etapa de enraizamiento. E) Explantos provenientes de la
etapa de multiplicacin con problemas de vitrificacin y presencia de callo. En estos casos, el medio de multiplicacin
para los cultivos subsiguientes fue modificado reduciendo la concentracin de BAP a 0,44 M. F) Vstago enraizado
en medio de MS con la concentracin salina reducida a la mitad, suplementado con 9,89 M IBA durante 2 das,
seguido por el subcultivo en medio basal durante 30 das hasta estar listo para pasar a la etapa de aclimatacin.
170
mayor crecimiento lateral que permiten comparativamente un mejor anclaje y una mayor resistencia a los vientos.
4 Propagacin de especies herbceas
La micropropagacin de especies herbceas est orientada a proveer material libre
de patgenos, propagar material seleccionado por su mayor rendimiento o por su mayor resistencia a enfermedades y estreses
ambientales, conservar la diversidad especfica en bancos de germoplasma, obtener
material para estudios fisiolgicos y genticos
y sentar las bases para la aplicacin de tcnicas de ingeniera gentica.
Existe una gran variedad de protocolos,
desarrollados en funcin de la especie y de
los objetivos de la propagacin. Existen protocolos generales para monocotiledneas
como en el caso ciertos cereales (trigo, maz,
cebada, avena, arroz), pasturas (pasto
bermuda, festuca alta, raigrs, pasto llorn)
y hortcolas (cebolla, ajo, puerro); protocolos generales para dicotiledneas que incluyen especies hortcolas (tomate, papa, pimiento y zanahoria) y leguminosas forrajeras
(alfalfa, man, trbol blanco) y protocolos
para especies modelo como Arabidopsis y
tabaco.
En todos los casos, las formas de propagacin son las mismas. Se emplean vas de
regeneracin por formacin de yemas
axilares, yemas adventicias y embriognesis
somtica. En los dos primeros casos, el sistema de propagacin a travs de la organognesis directa asegura la estabilidad gentica
de las plantas regeneradas y se emplean
cuando el objetivo es la propagacin clonal
a gran escala. La embriognesis u organognesis indirecta, con formacin de callo, se
emplea en cambio para generar variabilidad
en programas de mejoramiento.
En el caso de ajo y cebolla, por ejemplo,
las etapas de la micropropagacin incluyen
tanto la multiplicacin de yemas axilares por
el cultivo de meristemas, la formacin directa de yemas adventicias en explantos obtenidos a partir de placas basales o umbelas
inmaduras y la formacin indirecta de yemas
adventicias y/o embriones somticos obtenidos a partir de callos que provienen de distintos tipos de explantos (meristemas, bro-
171
172
V.-Captulo 2
Semilla sinttica
Rey, Hebe Y.; Mroginski, Luis A.
1 Concepto
Resulta difcil determinar como se origin
la idea de producir semillas sintticas o artificiales. Estas son el resultado de la aplicacin
en agricultura del fenmeno de embriognesis somtica, descripto por primera vez en
1958 por Jakob Reinert y F.C.Steward y colaboradores. Sin embargo, un gran propulsor
de su utilizacin para la propagacin a gran
escala de plantas fue Toshio Murashige, quien
en un simposio realizado en 1977 en Ghent
(Blgica) present formalmente la idea de la
produccin de las semillas sintticas, entendiendo como tal a un simple embrin somtico encapsulado. Esta semilla se diferencia
de la semilla verdadera en que el embrin es
somtico (producido por el fenmeno conocido como embriognesis somtica) y no
cigtico, y que si tiene endosperma y cubierta, stos son artificiales (Fig.1 a y b). Esta semilla, puesta en condiciones adecuadas, germina (Fig.1 c) y se convierte en una planta
(Fig.1 d). Muchos grupos de investigacin han
contribuido al desarrollo de tales semillas.
Entre ellos se deben destacar el grupo
liderado por Keith Walker de la Compaa
Monsanto, quien a partir de mediados de la
dcada que va de 1970 a 1980 trabaj especialmente con alfalfa. Tambin hay que mencionar la labor de Robert Lawrence de la
Union Carbide, quienes comenzaron los trabajos con especies forestales, lechuga y apio.
Otros investigadores como Drew, Kitto y
Janick realizaron sus trabajos con zanahoria.
El aporte del grupo liderado por Keith
Redenbaugh de la Plant Genetic Inc. fue muy
importante, especialmente por su descubrimiento de que hidrogeles como el alginato
de sodio podan utilizarse para producir semillas artificiales que podan germinar en condiciones de invernadero.
Existe otro tipo de semilla sinttica, diferente del definido ms arriba, donde, en lu-
173
de los embriones somticos tal como resultan del proceso de embriognesis somtica,
sin ningn tipo de cubierta protectora. Este
sistema ha sido desechado en la prctica por
la escasa conversin de embriones en plantas.
4) Semillas sintticas con embriones
somticos hidratados suspendidos en un gel
viscoso (fluid drilling)(Tipo 4,
Tabla 1: Ejemplos de semillas sintticas basadas en la desecacin de Fig. 2). Inicialmente fue desarrollaembriones sin cubierta protectora.
do en zanahoria y ms recientemente en batata; consiste en la
Especie
% humedad en la semilla % conversin en plantas
inclusin de varios embriones en
Apium graveolens
10-13
35-85
una especie de tubo que contieDactylis glomerata
13
5-30
Medicago sativa
8-20
33-95
ne un gel viscoso.
5) Semillas sintticas con
dad de este tipo de embriones por un ao, embriones somticos hidratados y provisaproximadamente, en condiciones de labo- tos de una cubierta protectora (Tipo 5, Fig.
2). Es el sistema ms usado. Por esta razn,
ratorio.
2) Semillas sintticas con embriones de aqu en adelante, cuando se mencione
somticos desecados y provistos de cubier- semilla sinttica se referir a este tipo. Tieta protectora (Tipo 2, Fig. 2). Esta tcnica ha ne la ventaja de que los embriones no estn
sido utilizada en zanahoria y apio, donde los sujetos a la desecacin, que constituye la prinembriones fueron recubiertos con cipal causa de los bajos valores de conversin
polyoxietileno y luego desecados. Los resul- en plantas. Si bien se han ensayado numetados han mostrado que es factible lograr rosas sustancias para encapsular a los embriouna buena supervivencia de stos; sin embar- nes somticos (agar, gelrite, gomas), una de
go, la conversin en plantas es realmente la tcnicas ms utilizadas consiste en lograr
la formacin de una cubierta protectora de
baja.
3) Semillas sintticas con embriones alginato de calcio, compuesto que no es txihidratados sin cubierta (Tipo 3, Fig. 2). Es el co para el embrin y permite una rpida
sistema ms simple; consiste en la utilizacin encapsulacin. El proceso es muy simple y
consiste bsicamente en sumergir a los
embriones somticos en una solucin de
Explante
alginato de sodio al 2%, pasndolos luego a una solucin acomplejante de, por
Cultivo e induccin de la
ejemplo, 100 mM de Ca (NO3)2 (Fig. 3).
embriognesis somtica
Con esta tcnica se genera una semilla
sinttica consistente en un embrin somtico recubierto con una cubierta
Embriones somticos
seminal y provisto de un endosperma
artificial (Fig.1 a y b). Eventualmente esDesecados
tas cpsulas pueden ser recubiertas por
Hidratados
sustancias tales como polioxieti-lenglicol,
que sirve para mantener una adecuada
Gel Viscoso Encapsula do hidratacin de las cpsulas y embriones.
Encapsulado
Este procedimiento ha posibilitado la
obtencin de semillas sintticas de nu1
2
3
4
5
merosas especies de inters econmico,
entre las que pueden mencionarse alfalSiembra en el suelo
fa, zanahoria, apio y especies forestales
como Picea abies, Pinus radiata,
Figura 2: Tipos de semillas sintticas.
Santalum album y Pseudotsuga
trata de un sistema muy simple donde los
embriones son desecados hasta alcanzar
porcentajes de humedad del 8 al 20% y no
estn provistos de ningn tipo de cubierta
protectora. En el caso de alfalfa, embriones
sometidos a la desecacin mostraron porcentajes de conversin en plantas de hasta el
95% (Tabla 1). Es posible mantener la viabili-
174
Encapsulamiento mecanizado
175
Otro aspecto de gran importancia tecnolgica es el contar con semillas sintticas que,
adems de no generar variantes somaclonales, tengan un alto porcentaje de conversin en plantas cuando stas son sembradas
en el suelo. Este aspecto se ve afectado por
varios factores, entre los que figuran el tipo
de embrin, la calidad del endosperma sinttico, la dureza de la cpsula y la proteccin
176
semillas verdaderas. Adicionalmente las semillas sintticas podrn actuar como transportadoras de reguladores de crecimiento,
microorganismos y pesticidas que se quieran
incorporar durante la siembra. De esta manera, los costos de los transplantes se vern
reducidos, las poblaciones sern genticamente uniformes y podrn ser comercializados ciertos hbridos resultantes de costosas manipulaciones manuales.
En la Tabla 2 se sealan algunas especies
para las cuales sera necesario contar con un
sistema de semilla sinttica.
La falta de una difusin masiva de esta
tecnologa en la actualidad obedece a razones tcnicas, ya que en muchas especies an
no se ha logrado inducir eficientes sistemas
que permitan la generacin de grandes cantidades de embriones somticos de calidad,
y econmicas. Los clculos realizados en rela-
Especie
Agua
(Chrysophyllum
gonocarpum )
Araucarias
(Araucaria spp.)
Algarrobo
(Prosopis spp)
Ctricos *
(Citrus spp.)
Eucaliptos*
(Eucalyptus spp.)
Mango
(Mangifera indica)
Paraso
(Melia azedarach)
Pinos* (Pinus spp.)
Quebracho
(Schinopsis
balansae)
T
(Camellia sinensis)
Toona (Toona
ciliata)
Yerba mate (Ilex
paraguariensis)
Estado de desarrollo
Estado de
Inters en contar con de la induccin de la desarrollo de la
semillas sintticas
Embriognesis
produccin de la
Somtica
semilla sinttic
a
XXX
---
XXX
XX
---
XXX
---
---
XX
XXX
XXX
---
XX
---
XXX
XX
XXX
XX
XX
---
X
---
XXX
XXX
---
XXX
---
---
XXX
---
Ref.:
* depende de la especie --- Nulo, X
escaso,
XX
177
cin a alfalfa indican que su costo de produccin supera en casi cien veces el costo de produccin de la semilla verdadera. Sin embargo, este costo es casi similar o incluso inferior
al de la produccin de semillas verdaderas
para algunos hbridos de alcaucil, geranio y
gerbera.
6 Conclusiones
Si bien el uso de semilla sinttica en la
agricultura es an incipiente y slo es utilizada en ciertos grupos de rboles forestales,
las perspectivas para esta tecnologa son altamente promisorias, pudiendo llegar a convertirse, en un futuro cercano, en el principal
mtodo de propagacin de plantas. Si bien
los progresos logrados en los ltimos 20 aos
han sido notables, existe an la necesidad
de realizar estudios bsicos sobre embriognesis somtica para luego abordar los aspectos industriales de la produccin a gran escala de semillas sintticas, tanto de
angiospermas como de gimnospermas. En la
Argentina, la mayor demanda proviene del
sector de productores de plantas leosas,
donde el desarrollo de esta tecnologa es an
incipiente (Tabla 2). Existe, sin embargo, la
capacidad tcnica y humana para encarar
este desafo.
7 Lecturas recomendadas
CANTLIFFE, D. J. 2001. Bioreactor technology in plant
cloning, Proceedings of the Fourth International
Symposium on In Vitro Culture and Horticultural
Breeding. Acta Horticulturae. 560: 345-351.
CARLSON, W. C.; HARTLE J. E. 1995. Manufactured seeds
of woody plants. In S.M. Jain , P K.Gupta,R.J. Newton
(eds.) Somatic embryogenesis in woody plants. London,
Kluwer Acad. Press. 1 : 253-263.
GRAY, D. J. P., A. 1991. Somatic embryogenesis and
development of synthetic seed technology. Critical
Reviews in Plant Sciences 10: 33-61.
GUERRA, M. P. T., A.C.; TEIXEIRA, J.B. 1999. Embriogenese
somtica e sementes sintticas. In: A.C.Torres, L.S.Caldas,
J.A.Buso (eds.) Cultura de Tecidos e Transformacao
Gentica de Plantas. CBAB. Embrapa. Brasilia . 2: 533-568.
IBARAKI, Y. K., K. 2001. Automation of somatic embryo
production. Plant Cell, Tissue and Organ Culture. 65: 179199.
JIMNEZ GONZLEZ,E.A.; MENDOZA ,E.Q. 1998. In :Prez
Ponce,J.N. (ed.) Propagacin y Mejora Gentica de Plantas
por Biotecnologa. Instituto de Biologa de Plantas.Santa
Clara. Cuba. pp.225-240.
McKERSIE,B.D.; BROWN D.C.W. 1996. Somatic
embryogenesis and artificial seeds in forage legumes.
Seed Science Research 6: 109-126.
MROGINSKI, L. A.; REY, H.; OLMOS, S.; GONZALEZ, V.
1995. Semillas artificiales para la propagacion de plantas.
Paradigmas 1: 5-9.
TIMMIS,R. 1998. Bioprocessing for tree production in the
forest industry: Conifer somatic embryogenesis.
Biotechnol. Progress 14: 156-166.
178
V.-Captulo 3
Conservacin de germoplasma in vitro
Scocchi, Adriana; Rey, Hebe
1 Introduccin
Desde sus inicios, el hombre ha dependido bsicamente de los vegetales como fuente de energa. Al aumentar rpidamente el
tamao de la poblacin, se han ido
implementando tcnicas de explotacin, en
particular agropecuarias, que han contribuido a la destruccin de las poblaciones vegetales pioneras, que fueron el producto de siglos de evolucin. Por otro lado, las tcnicas
modernas de produccin de variedades
mejoradas, altamente homogneas, han
provocado la reduccin de la variabilidad
gentica de las especies cultivadas, ocasionando una verdadera erosin gentica.
Es en este contexto en que se recurre a
las fuentes genticas originales de variabilidad, las que se deben preservar adecuadamente. Cuando se habla de preservacin de
germoplasma hay que subrayar que el objetivo es conservar, con la mayor integridad
posible, la variabilidad gentica de las poblaciones seleccionadas.
2 Mtodos empleados para la
conservacin de germoplasma
La estrategia a seguir para la conservacin
de germoplasma depende de la naturaleza
del material vegetal, y est definida por la
duracin de su ciclo de vida, el modo de reproduccin y el tamao de sus individuos. De
acuerdo con estas caractersticas se han intentado diversas alternativas de conservacin, que van desde el tradicional banco de
semillas hasta el mantenimiento de reas de
reserva. Sin embargo, en muchos casos el
mantenimiento no es posible y en otros resulta sumamente costoso, siendo muy elevados los riesgos de prdidas por manipulacin o desastres naturales. Por ello se ha buscado implantar nuevas estrategias para conservar los recursos genticos en una forma
ms eficiente.
179
180
Deshidratacin
La deshidratacin del explante
es un paso crucial
para el xito de la
crio-conservacin,
ya que es necesario eliminar toda el
agua libre presenFigura 1: Estrategias para la conservacin de germoplasma de paraso (Melia azedarach
te en el tejido veL.), desarrolladas en el Laboratorio de Cultivo in vitro de Tejidos Vegetales. IBONE.
getal, minimizanFacultad de Ciencias Agrarias. UNNE.
do as posibles daos debidos a conLa crioconservacin consta de seis pasos: gelacin. La deshidratacin del tejido puede
realizarse en una cmara a 0C o en cmaras
Seleccin del material a crioconservar hermticamente cerradas utilizando sustanCuando se realiza la seleccin del mate- cias higroscpicas como silica gel o glicerol (5
rial a crioconservar se debe tener la absoluta - 20%), o sometiendo al explante a una coseguridad de que a partir del mismo se ob- rriente de aire en un flujo laminar de aire estendrn plantas completas. El explante se- tril.
leccionado depender del objetivo de conservacin y est estrechamente relacionado
Aclimatacin
Biotecnologa y Mejoramiento Vegetal
181
Almacenamiento
De acuerdo al material vegetal que se utilice, se presentan dos grandes sistemas:
- Sistemas secos: comprenden todos
aquellos tejidos vegetales endgenamente
resistentes y tolerantes a las bajas temperaturas y a la deshidratacin.
- Sistemas hidratados: son todos aquellos tejidos vegetales no tolerantes a las bajas temperaturas y a la deshidratacin, por
lo cual se requiere de una proteccin
exgena. Esta proteccin puede lograrse a
travs del uso de crioprotectores o bien por
la utilizacin de soluciones de vitrificacin.
Los sistemas secos, por tratarse de tejidos ms resistentes, necesitan de una me-
182
Descongelamiento y rehidratacin
Cuando se desea recuperar el explante
mantenido en nitrgeno lquido se puede
realizar un descongelamiento rpido en bao
de agua (generalmente 1-2 min. a 30-40 C)
o en forma lenta, sometiendo al explante a
la temperatura del laboratorio o a una corriente de aire en el flujo laminar de aire estril.
Tests de viabilidad
Los tests de viabilidad nos permiten comprobar la/s zona/s del tejido que ha/n muerto y cul/es ha/n sobrevivido al fro. La evaluacin de la viabilidad puede llevarse a cabo
en forma visual, realizando el re-cultivo y determinando la capacidad de regeneracin,
utilizando TTC (cloruro de 2,3,5TrifenilTetrazolio) que colorea el tejido que ha sobrevivido a la crioconservacin o midiendo la
conductividad elctrica, que permite estimar
el dao producido en las membranas celulares.
Tcnicas de almacenamiento del material a preservar
En la ltima dcada han surgido numerosas tcnicas que combinan el uso de
crioprotectores y de soluciones de vitrificacin
con tcnicas de deshidratacin y
encapsulacin, las cuales bsicamente pueden resumirse en tcnicas de:
- Encapsulacin-deshidratacin
- Vitrificacin
- Encapsulacin-vitrificacin
- Desecacin
- Precultivo
- Precultivo-desecacin
- Gotita congelada.
En la Tabla 1 se detallan las especies y
Tabla 1: Utilizacin de tcnicas de crioconservacin en diferentes explantes de algunas especies de inters agronmico.
Tcnica
Empleada
Explante y Especie
183
184
3 Conclusiones
Los recursos fitogenticos constituyen un
reservorio de informacin gentica imprescindible para la solucin de muchos de los problemas a los que se enfrenta la agricultura.
Los mtodos para asegurar su conservacin
son diversos y cada uno de ellos posee sus
ventajas e inconvenientes. Por ello, se considera que el conjunto de tcnicas de conservacin in situ y ex situ son mtodos complementarios, no excluyentes, para lograr el
objetivo comn de preservar los recursos
fitogenticos, como parte esencial de una
estrategia global para la conservacin de la
biodiversidad.
En la ltima dcada se han producido
avances significativos en el desarrollo de tcnicas in vitro de conservacin. La disponibilidad de bancos de germoplasma in vitro, tanto en condiciones de crecimiento lento como
la conservacin a temperaturas ultrabajas
(crioconservacin), han contribuido a dicho
avance. Las tnicas de crecimiento lento son
utilizadas como rutina en centros internacionales tales como el CIAT (Cali, Colombia),
donde se aplican a la conservacin de
germoplasma de mandioca y para la conservacin de germoplasma de papa en el CIP
(Centro Internacional de la Papa, Per). Las
185
PARTE VI
Mtodos de anlisis de la
variabilidad
187
188
VI.-Captulo 1
Consideraciones estadsticas y
biolgicas para estimar variabilidad
gentica
Olmos, Sofa; Di Renzo, Miguel
1 La variacin biolgica
La variabilidad gentica es un hecho universal en las poblaciones reproductivas y una
condicin preliminar necesaria para el cambio evolutivo y para la respuesta al mejoramiento gentico mediante seleccin o hibridacin. Por otra parte son conocidos los peligros que implica la uniformidad y la falta de
diversidad en las especies cultivadas y en los
animales domsticos, como consecuencia de
la erosin gentica.
La variacin que presentan los individuos
de una poblacin puede ser discontinua o
continua. Los caracteres cualitativos de variacin discontinua, como los marcadores
moleculares, permiten clasificar a los individuos sin ambigedades, ya que estos caracteres estn regidos por uno o por pocos
genes y el ambiente no tiene efecto en su
manifestacin fenotpica. En cambio, los caracteres cuantitativos, representados por la
mayora de los caracteres de inters agronmico, presentan variacin continua y los
fenotipos, que estn determinados por
poligenes y por efectos ambientales, son difciles de clasificar en categoras discretas. Para
su anlisis deben emplearse mtodos
biomtricos, que no miden el efecto de genes
individuales o de segmentos cromosmicos
especficos, sino de todo el genoma.
Durante los ltimos aos ha surgido un
consenso entre los mejoradores y genetistas
moleculares sobre la conveniencia del uso de
marcadores moleculares para asistir a la seleccin de caracteres cuantitativos (MAS,
Marker Assisted Selection). La biotecnologa
ha colaborado mediante la construccin de
mapas genticos saturados, esto es, con innumerables marcadores moleculares a lo largo de los cromosomas, que permiten ubicar
regiones de actividad cuantitativa (QTL,
Quantitative Trait Loci). De esta manera, un
189
experimental es necesario formular claramente una hiptesis, utilizar un diseo experimental apropiado y analizar e interpretar los
resultados obtenidos.
Por ejemplo, la aplicacin de distintos tratamientos (ej.: distintas dosis de fertilizante
= causa), producen variaciones sobre una caracterstica de inters (ej. rendimiento = efecto):
Terminologa
- Factor: es la causa cuyo efecto se quiere
medir (ej. fertilizante, competencia, medio de
cultivo)
- Nivel: es cada una de las categoras o
alternativas del factor en estudio (ej. dosis
de un fertilizante, densidades de siembra, pH
de los medios de cultivo).
- Tratamiento: Es cada nivel del factor en
estudio. Si se estudia el factor fertilizante,
cada dosis (o nivel) es un tratamiento distinto. Si se prueba el efecto de concentraciones
crecientes de un fertilizante los tratamientos
tendran un orden natural (discreto ordinal);
pero si se prueban distintas combinaciones
de fertilizantes (NPK), no habra un orden
entre los tratamientos (discreto categrica).
Cuando se estudian dos (o ms) factores simultneamente, los distintos tratamientos
resultan de la combinacin de cada nivel de
un factor con cada nivel del otro factor. Por
ejemplo, si se estudia el efecto de fertilizante y competencia, cada tratamiento resulta
de la combinacin de una dosis de fertilizante y una densidad de siembra determinada.
190
El anlisis de la varianza es un procedimiento aritmtico que permite la descomposicin de la varianza total en varianzas parciales. El cociente entre las varianzas permite
obtener un valor de F calculado (Fc), el cual
se compara con un F de tabla (Ft) para un
determinado nivel de significacin (por ejemplo = 0,05) y los grados de libertad de los
tratamientos y del error. Los programas de
computacin calculan directamente el P (la
probabilidad) del test.
Varianza total
Se puede considerar a la variacin total
como la resultante de dos fuentes de variacin: una fuente de variacin debida a las
diferencias entre grupos o tratamientos, sealadas por los promedios de stos y otra
debida a la diferencia dentro de los tratamientos, que se calcula sobre la base de las
diferencias entre las observaciones de cada
tratamiento.
Varianza entre tratamientos
Para aislar la variacin entre los grupos
necesitamos suprimir la variacin dentro de
los tratamientos. Podemos obtener este resultado haciendo a todos los individuos de
un mismo grupo iguales entre s e iguales a la
media del grupo. Mediante esta operacin,
la variacin entre los grupos no se modifica
mientras que toda la variacin dentro del
grupo queda anulada.
Varianza dentro de tratamientos
Para obtener la varianza dentro de los
grupos debemos tener en cuenta solamente la variacin entre las observaciones de un
mismo tratamiento. La variacin dentro de
un tratamiento se debe a las desviaciones
que presentan los valores individuales en ese
grupo en relacin con la media de ese grupo.
5 Anlisis multivariado
El anlisis multivariado brinda los mtodos estadsticos para el anlisis conjunto de
dos o ms variables que pueden estar
interrelacionadas. Esta rama de la estadstica comprende procedimientos y tcnicas
para la sntesis, la presentacin y el anlisis
multidimensional de caracteres, tanto cualitativos como cuantitativos, obtenidos a par-
191
192
193
194
tadsticas y de las conclusiones a que se arriba luego del anlisis. Las conclusiones confirmatorias solamente se justifican si los
estudios estuvieron basados en un muestro apropiado. Esto significa que la
inferencia est justificada
en relacin a la forma en
que los datos fueron tomados y en que el experimento fue realizado, ms
que en la tcnica de anlisis en s misma.
Las inferencias slo estn justificadas cuando los
datos son tomados de
una muestra grande y bien
definida. Cuando esto no
ocurre, los valores de probabilidad directamente
no se deberan informar y
las conclusiones a las que
se arriba slo deberan limitarse a los datos utilizados y a las condiciones en
las que se desarroll el experimento. De la misma
manera resulta poco aconsejable elaborar generalizaciones demasiado amplias cuando los estudios
se realizan sobre casos
particulares o especficos
que no son representativos.
A menudo sucede que
el investigador prefiere o
necesita interpretar las variables en forma separada
cuando maneja un grupo
de variables correlacionadas. En estos casos sera
ms apropiado utilizar mtodos univariados, con el complemento de
pruebas de Bonferroni ajustadas. Sin embargo, cuando sea posible, la consideracin conjunta de las variables, mediante la aplicacin
del anlisis multivariado, puede brindar conclusiones ms fuertes que las logradas a travs de un grupo de comparaciones simples.
Si se tiene cuidado durante el proceso de in-
195
196
Lecturas recomendadas
EVERITT, B.S.; DUNN, G. 1991. Applied
Multivariate Data Analysis. E. Arnold,
London.
HAIR, J.F.; ANDERSON, R.E.; TATHAM, R.L.;
BLACK, W.C. 1995. Multivariate Data Analysis.
4ta. Ed. Prentice Hall - Upper Saddle River,
New Jersery.
MANLY, B.F. 1986. Multivariate Statistical
Methods. A Primer. Chapman and Hall,
London.
RENCHER, A.C. 1995. Methods Of Multivariate Analysis. J. Wiley & Sons, Inc. New York.
197
VI.-Captulo 2
Mtodos para estimar variabilidad
gentica
Winzer, Nlida; Di Renzo, Miguel; Olmos, Sofa
1 Introduccin
La informacin procesada a partir de las
tcnicas que se desarrollan en este libro pueden ser de diversos tipos y puede tratarse,
por otro lado, del anlisis de una sola variable o de varias variables evaluadas en cada
individuo o muestra.
Los anlisis estadsticos a utilizar dependen de estos dos aspectos, tipo de datos y
nmero de variables, y, adems, de qu objetivo se haya planteado el investigador.
Si se trata de una sola variable se podrn
aplicar las tcnicas aprendidas en un curso
bsico de estadstica (comparacin de dos
medias, anlisis de la varianza, anlisis de regresin, pruebas chi-cuadrado, etc.), o bien
alguna de sus generalizaciones.
En este captulo se desarrollarn en ms
detalle algunas metodologas multivariadas.
Se han seleccionado aquellas que se utilizan
con mucha frecuencia y que no requieren
demasiados conocimientos previos.
Los datos multivariados se ordenan en
una matriz. A efectos de unificar el lenguaje
se considerar que cada fila de la matriz representar un individuo, una muestra, una
especie; en definitiva, una OTU (Operational
Taxonomic Unit). Las columnas representarn los caracteres o variables que se observan en cada OTU.
2 Tipo de datos
DATOS DOBLE ESTAD: Son los tambin llamados datos binarios o dicotmicos. Estos datos se presentan cuando el carcter puede
tomar slo dos estados posibles. Habitualmente se codifican como 0 1.
Hay que reconocer dos tipos de situaciones donde pueden aparecer datos binarios.
a) Datos de presencia o ausencia. Slo se
registra la presencia ausencia del carcter.
199
J12 =
a
a+b+c
DICE
1
0
200
OTU 1
1
0
a
b
c
d
2a
a
=
+
+ (a + c)
(a
b)
2a + b + c
2
Es la proporcin de caracteres copresentes respecto al promedio de los caracteres presentes en cada OTU.
OTU 2
D12 =
1
2
3
4
5
6
7
8
A
1
1
0
1
1
0
1
0
1
2
3
4
5
6
7
8
Codificacin
B
0
1
1
1
1
0
0
0
C
0
0
1
0
0
1
0
1
D
1
1
1
0
0
0
0
0
E
1
1
0
1
1
0
1
0
F
0
1
1
1
1
1
1
1
Matriz de Datos
1
1
0
0
1
1
0
A
B
C
D
E
F
2
1
1
0
1
1
1
3
0
1
1
1
0
1
Bandas
4
1
1
0
0
1
1
5
1
1
0
0
1
1
6
0
0
1
0
0
1
Asociacin de Jaccard
A
B
C
D
E
F
7
1
0
0
0
1
1
8
0
0
1
0
0
1
Asociacin de Dice
1
0.5
0
0.333
1
0.5
0.5
1
0.167
0.4
0.5
0.571
0
0.167
1
0.2
0
0.429
0.333
0.4
0.2
1
0.333
0.25
1
0.5
0
0.333
1
0.5
0.5
0.571
0.429
0.25
0.5
1
A
B
C
D
E
F
1
0.667
0
0.5
1
0.667
0.667
1
0.286
0.571
0.667
0.727
0
0.286
1
0.333
0
0.6
0.5
0.571
0.333
1
0.5
0.4
1
0.667
0
0.5
1
0.667
0.667
0.727
0.6
0.4
0.667
1
SM12 =
SIMPLE MATCHING
a+d
a+b+c+d
0.625
1
0
0.375
1
0.5
0.625
0.5
1
1
0.625
0
0.5
1
0.5
0.625
0.5
0.250
0.5
1
d12 = 2 1 - pi q i )
i =1
201
P*
0.8
P
0.6
Q*
0.4
I=
i i
i =1
i =1
i =1
pi2 qi2
0.2
p q
0
0
0.2
0.4
0.6
0.8
d12 = 2 1 -
i =1
pijq ij )
mi
j=1
j=1
ij
- q ij ) 2
202
mi
p q
ij ij
i =1 j=1
mi
mi
p q
i =1 j=1
mi
(p
D12 = - ln
1 r
R 12 =
r i =1
Si se usan varios loci se trabaja con el promedio aritmtico de las probabilidades definidas anteriormente resultando:
2
ij
i =1 j=1
2
ij
datos provenientes de muchos alelos. La distancia de Nei est formulada para un modelo donde se asume que las mutaciones ocurren en forma infinita, con la misma probabilidad para todos los alelos a una tasa de
mutacin neutral, y que la variabilidad
gentica inicial en la poblacin est en equilibrio entre la variabilidad producida por mutaciones y por deriva gentica, siendo el tamao efectivo de la poblacin, en cada una,
constante. Basndose en estos supuestos, y
de que todos los loci sean equivalentes entre s, se espera que la Distancia de Nei
incremente linealmente con el tiempo. Si las
frecuencias allicas en cada poblacin han
sido estimadas con pocas muestras se pueden utilizar en cambio algunas modificaciones a la Distancia Estndar de Nei como las
propuestas por Nei, (1978) y Hillis, (1984). La
distancia de Cavalli-Sforza y Edwards, por el
contrario, asume que las diferencias entre las
poblaciones no provienen de mutaciones
sino solamente como consecuencia de la deriva gentica. Adems, no asume que el tamao poblacional ha permanecido constante en todas las poblaciones. Considera que
el tamao de la poblacin cambia en forma
lineal pero no con el tiempo sino con 1/N,
donde N es el tamao efectivo de la poblacin. As en estos casos, los conocimientos
bsicos de gentica poblacional brindarn las
herramientas necesarias en el momento de
la eleccin del mtodo ms apropiado para
el anlisis de nuestros datos.
5 Anlisis de coordenadas principales
Si se tiene una matriz de distancias entre
N muestras ser posible representar cada
muestra mediante un punto de manera tal
que las distancias resultantes reproduzcan las
de la matriz?
Veamos dos ejemplos:
(i) Si se tiene la siguiente matriz D de distancias entre las muestras A, B y C:
1
.447
0
D= 1
0
.707
.447 .707
0
1.4
1.2
1.0
B
0.8
0.6
0.4
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
0.5
II
0.3
C
0.1
-0.1
-0.3
-0.5
-1.0
-0.5
0.0
0.5
1.0
0.5
III
0.3
0.1
A
B
-0.1
C
-0.3
-0.5
-1.0
-0.5
0.0
0.5
1.0
Coordenadas de A, B y C:
I:(1.444, 0.881); (0.445, 0.94); (1.111, 1.179)
II:(0.444, -0.119); (-0.555, -0.06); (0.111,0.179)
III: (0.444, 0.119); (-0.555, 0.06); (0.111,-0.179)
Si se calcula la distancia eucldea entre los
puntos en uno cualquiera de estos grficos
se ve que se han reproducido exactamente
los valores de la matriz D. Por ejemplo:
d E (A, B) = (1.444 - 0.445) 2 + (0.881 - 0.94) 2 = 1
en el grfico I.
(ii) Si se tuviera la matriz de distancias
entre las muestras P1, P2 y P3:
Es fcil ver que es
imposible representar
en un plano puntos
separados por estas
distancias porque si
P1 y P2 se ubican como extremos de un segmento de longitud 0.9, no hay manera de
ubicar un punto P3 que est a 0.5 de P1 y a
0.3 de P2.
0 0.9 0.5
#
D = 0.9 0 0.3
0.5 0.3 0
203
P1
P1
P2
P 3? P 3?
P2
204
(2)
Sij0
S = 0.5
1
0.75
0.9 0.75
1
Autovalores de S0 :
a1=
l1 + l2
x 100%
l1 +l2 +...+ln
0.0280.0720.0444
0.1543
Primeras 2 Coordenadas:
Muestra 1
Muestra 2
Muestra 3
sij0
- 0.2674
0.8019
l11 v
l 22 v
0.4437
-0.5546
0.1109
-0.1195
-0.0598
0.1793
d12 = 1
2
d13
= 2(1 - S13 ) = 2(1 - 0.9) = 0.2
d13 = 0.447
0.57735
0.57735
Porcentaje de Distorsin:
2
l1+l2
a1= 2
x 100%
l 1 +l22 +...+l2n
Este valor mide cunto se acercan los valores de la matriz de asociacin reconstruda
respecto de la matriz de asociacin original
S0. Ms exactamente:
0
0* 2
a2= 1- S - 0S2
S
x 100%= 1-
(S - S
(S )
0
ij
0* 2
ij
0 2
ij
x 100%
205
sij = -
d ij
2
v 2 = -0.2674
0.8019
0.5344
- v 2 = 0.2674
-0.8019
A.cruen.
A.hypoch
A.caudat.
A.manteg.
A.dubius
A.tricolor
A.hybrid.
0.6
206
38-39
40-43
0.4
6-9-10-11
41
0.2
14
5
42
27
4
28
13
17
36
0.0
35
12
15
7
8
-0.2
18-22
29-30
-0.4
37
34
20
16
25
26
19
21
23
32-33
31
24
-0.6
-0.6
-0.4
-0.2
0.2
0.4
0.6
Matriz de datos
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
1
1
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
1
1
1
1
0
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
3
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
0
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
0
0
0
0
1
0
0
4
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
0
0
1
1
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
5
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
0
0
0
0
1
1
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
6
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
1
1
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
7
1
1
1
1
0
1
0
0
1
1
1
0
0
0
0
1
0
0
1
1
1
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
1
1
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
8
1
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
0
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
9
1
1
1
0
1
0
1
1
0
0
0
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
10
1
1
1
0
1
1
0
0
1
1
1
1
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
11
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
12
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
13
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
14
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
15
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
16
1
1
1
0
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
1
0
0
1
1
0
0
0
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
17
1
1
1
0
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
1
0
0
0
0
1
0
0
1
0
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
18
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
1
0
1
1
0
0
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
1
0
0
19
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
20
1
1
1
1
0
0
0
1
0
0
0
1
0
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
0
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
21
0
0
0
0
0
0
1
0
0
0
0
1
0
0
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
22
1
0
0
0
0
0
1
0
0
0
0
1
0
0
1
0
0
0
0
0
1
0
1
1
0
0
0
1
1
1
1
1
1
0
1
1
0
0
0
0
0
1
0
23
0
1
0
0
1
1
1
0
1
1
1
1
1
1
0
1
1
1
1
1
0
1
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
207
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
V1
-0.12709
-0.10710
-0.12311
-0.00462
-0.22005
-0.23182
-0.12459
-0.12472
-0.23182
-0.23182
...
V2
0.03060
0.13683
0.09085
0.07441
0.07043
0.16179
-0.11226
-0.09717
0.16179
0.16179
...
CP1
-0.27881
-0.23496
-0.27007
-0.01014
-0.48274
-0.50856
-0.27331
-0.27360
-0.50856
-0.50856
...
Al slo efecto de que el lector pueda repasar algunos clculos se dan los primeros 10
elementos de los 2 primeros autovectores y
las 2 primeras coordenadas Principales.
6 Anlisis de agrupamientos (cluster)
Esta tcnica tiene como objetivo formar
grupos de muestras, poblaciones, individuos
u OTUs que sean similares entre s y diferentes a los elementos de los otros grupos.
El primer problema es fijar el criterio para
decidir cundo dos elementos son similares.
Si se tuviera un mazo de cartas, cmo formar grupos? por el valor de la carta?, porque comparten el palo?. Segn el criterio que
se aplique los grupos que se formen sern
distintos.
En la seccin anterior hemos visto distintas maneras de definir la similitud o disimilitud entre OTUs. Cada una de ellas, u otras
que no se han presentado aqu, plantean
distintas formas de medir la similitud entre
los elementos a agrupar.
Existen, adems, muchos mtodos para
formar los grupos. Uno de los ms usados
son los agrupamientos jerrquicos que pueden, a su vez, ser divisivos o aglomerativos.
Los primeros comienzan con todos los elementos en un solo grupo y en sucesivas divisiones se van formando grupos cada vez ms
pequeos. Los aglomerativos, por el contrario, empiezan considerando tantos grupos
como elementos se tienen y se van agrupando segn su grado de parecido. Los sucesivos pasos de uno y otro mtodo se pueden
representar en un grfico denominado
dendrograma.
208
CP2
0.05495
0.24570
0.16313
0.13362
0.12647
0.29052
-0.20157
-0.17448
0.29052
0.29052
...
Autovalores:
4.81258
3.22431
1 = 46.85 2 = 78.2
COMPLETO:
LIGAMIENTO PROMEDIO:
d({A,B},C) =
d(A, C) + d(B, C)
2
En el caso del ligamiento simple, la incorporacin del nuevo elemento est basada en
la extraccin de los menores valores de distancias entre el nuevo elemento y el grupo
preformado, y entre el nuevo elemento y las
restantes OTUs que se consideren. En cambio, el ligamiento completo lo que hace es
extraer los mayores valores de distancia, respectivamente. Si A, B y C son grupos formados en pasos anteriores, se usan los mismos
algoritmos en el caso del ligamiento simple o
completo. Para el ligamiento promedio hay
que promediar todas las distancias entre ele-
mentos de AB y de C:
d(AB, C) =
ij
A
B
C
D
E
F
A
0
1
1.41
1.15
0
1.1
B
1
0
1.29
1.10
1
0.93
C
1.41
1.29
0
1.26
1.41
1.07
D
1.15
1.10
1.26
0
1.15
1.22
E
0
1
1.41
1.15
0
1
AE
B
C
D
F
AE
0
1
1.41
1.15
1.1
B
1
0
1.29
1.10
0.93
C
1.41
1.29
0
1.26
1.07
D
1.15
1.10
1.26
0
1.22
F
1.1
0.93
1.07
1.22
0
i, j
n AB n C
F
1.1
0.93
1.07
1.22
1
0
AEBF
C
D
AE
0
1
1.41
1.15
AEBF
0
1.07
1.10
BF
1
0
1.07
1.10
C
1.07
0
1.26
C
1.41
1.07
0
1.26
D
1.15
1.10
1.26
0
AEBFC
D
AEBFC
0
1.10
D
1.10
0
D
1.10
1.26
0
209
7 Lecturas recomendadas
210
PARTE VII
Genmica
211
212
VII.-Captulo 1
Genmica
Echenique,Viviana; Schrauf, Gustavo;
Selva, Juan P.
1 Introduccin
La genmica se desarroll en los ltimos 10 aos como consecuencia de los avances realizados en biologa molecular e Informtica, dos reas de la ciencia que han tenido un desarrollo tecnlogico enorme, generando una revolucin en el conocimiento y
en la comprensin de los procesos biolgicos. El trmino fue acuado en 1986 por
Thomas Roderick para referirse a la
subdisciplina de la gentica que se ocupa
del mapeo, secuenciacin y anlisis de las
funciones de genomas completos y sirvi de
nombre para una revista especializada en la
publicacin de los mencionados temas,
Genomics. Consiste en la caracterizacin
molecular de genomas enteros y aporta informacin acerca de la secuencia y de la funcin de cada sector del genoma en diferentes situaciones de desarrollo y bajo diferentes condiciones ambientales, as como
de los mecanismos implicados en la regulacin de la expresin e interaccin gnica.
Para ello, las herramientas que se utilizan para
el anlisis individual de genes o pequeas
regiones cromosmicas, se aplican al anlisis
global de genomas completos, estudiando
en conjunto los miles de genes, protenas y
metabolitos que constituyen un organismo,
as como las complicadas redes de
interacciones que operan entre ellos. La informacin generada es enorme y es clave para
la identificacin y el aislamiento de genes de
inters y permitir interpretar, en trminos
moleculares, los procesos biolgicos. Para
ayudar en este proceso han surgido poderosas herramientas bioinformticas que permiten almacenar e interpretar esta informacin.
Las aplicaciones de la genmica alcanzan
a todos los mbitos de la actividad humana
relacionados con la biologa, como la salud,
la alimentacin y el medio ambiente. En pocos aos estarn disponibles las secuencias
213
214
215
216
generar miles de secuencias parciales conocidas como ESTs (ver VII.- 2). Estas secuencias
de entre 300-500 pb suelen ser suficientes
para la identificacin de los genes mediante
comparacin con las secuencias existentes en
las bases de datos pblicas (ej. Genbank,
EMBL), utilizando para ello programas de
anlisis informtico. Si la informacin contenida en la secuencia parcial no es suficiente,
habra que determinar la estructura del ADNc
completo para estudiar su funcin por otros
mtodos.
- Secuenciacin genmica
La aproximacin anterior no permite
identificar genes que se expresan a bajo nivel o en situaciones fisiolgicas no consideradas o regiones no representadas en el ARNm.
Para obtener esta informacin debe
secuenciarse el genoma completo. Para ello,
el ADN genmico total se digiere con enzimas
de restriccin apropiadas o se fragmenta
mecnicamente para generar fragmentos de
gran tamao (100-300 kb), que se clonan en
vectores apropiados, para construir
genotecas que contienen, al menos, una representacin completa del genoma, que
puede estudiarse en detalle y secuenciarse
(ver II.-3). A fin de distinguir las regiones
codificantes para genes, que en muchos organismos representan un porcentaje bastante pequeo del genoma, de las no
codificantes, las secuencias se comparan con
las secuencias de ESTs y ADNc previamente
estudiadas.
a) Secuenciacin de los clones y ensamblado de los fragmentos
El clonado comienza obteniendo un nmero elevado de fragmentos al azar que
se clonan en un vector apropiado. En la preparacin de mapas fsicos de genomas se
utilizan vectores como los csmidos, los YAC,
los BAC y los PAC, que aceptan insertos de
gran tamao (ver II.-3). El contenido de estos clones se caracteriza y se ordenan, buscando los puntos de solapamiento o superposicin. Un conjunto de clones solapantes
se llama contiguo (contig). Para establecer
el solapamiento de clones al azar se
secuencian regiones cortas del inserto
proximales al sitio de clonado utilizando
primers posicionados en el vector. Los vacos
(gaps) se completan utilizando el final de un
217
218
candidatas. Esta estrategia de saltos se utiliz para clonar el gen de la fibrosis qustica,
que es una enfermedad humana que resulta
fatal y es causada por mutaciones en gen de
gran tamao localizado en el cromosoma 7.
- Estrategia del gen candidato: la caracterizacin de una regin cromosmica hace
que aparezcan varios genes de funcin desconocida. Si un gen de inters es mapeado
en esa regin, estas secuencias pasan a ser
candidatas. Para cada una de ellas, o para
la ms probable de acuerdo al anlisis de secuencia, se disean experimentos tendientes
a determinar en cuales tejidos se expresa, en
qu condiciones, etc., utilizando Northern
blot o RT-PCR. Si el patrn de expresin encontrado coincide con el patrn esperado es
altamente probable que hayamos encontrado el gen de inters. El experimento ideal
para confirmar esto, sera la transformacin
de un individuo mutante para esta funcin
con el gen normal. Si se produce la reversin
del fenotipo mutante (complementacin),
tendremos la prueba irrefutable de que estamos frente al gen buscado.
- Genes con patrones complejos de
herencia: no todos los genes muestran patrones simples de herencia. Puede suceder
que:
- La variacin fenotpica sea cuantitativa, como peso o altura. Este tipo de variacin se debe a la interaccin acumulativa
entre alelos + y de varios genes y el ambiente. La disponibilidad de miles de marcadores moleculares como los SSLP, dispuestos
a lo largo del cromosoma, ha posibilitado el
mapeo de algunos de estos genes que contribuyen a la variacin cuantitativa cuyos loci
son llamados QTL (quantitative trait loci).
Para abordar este problema, se buscan
dos tipos de lneas que muestren fenotipos
contrastantes para un carcter cuantitativo
y se cruzan para generar descendencia
homocigota que contenga solo un segmento o un pequeo nmero de segmentos de
una de las lneas. Se realizan cruzas y
retrocuzas y se obtienen lneas endocriadas
recombinantes (RIL). Estos individuos pueden caracterizarse por su fenotipo y puede
estimarse la contribucin de los segmentos
especficos a la variacin observada. (ver IV.2)
En el futuro, el anlisis de SNP (polimorfismos de un nucletido simple) promete ace-
219
220
bidimensional en geles de poliacrilamida (2DPAGE), que permite separar con gran resolucin, la mayora de los polipptidos celulares
combinando de forma secuencial diferencias
en carga y en masa molecular. Utilizando sistemas computarizados de anlisis de imagen
se seleccionan las protenas cuya abundancia relativa cambia durante el desarrollo o en
respuesta a diferentes estmulos ambientales. Los polipptidos se purifican y digieren
con proteasas para generar una coleccin
de pptidos que se analizan por
espectrometra de masas o se secuencian a
partir del extremo amino. Para identificar la
protena, los perfiles de masa molecular o
secuencias de aminocidos obtenidos se comparan con las bases de datos de protenas
existentes.
- El metaboloma: comprende el conjunto total de metabolitos de una clula. En
plantas, el metabolismo secundario (conjunto de reacciones que no son vitales para
el individuo y que conducen a la producin
de compuestos que no tienen una funcin
reconocida en el manteniento de los procesos fisiolgicos fundamentales de los organismos que los sintetizan pero que a veces
ayudan a la supervivencia, como por ejemplo antraquinonas, alcaloides, digoxina,
taumatina, vainillina, menta, etc.) produce
una enorme variedad de compuestos diferentes de los que se han identificado 40.000
y se estima que an quedan por descubrir
alrededor de 100.000. Los investigadores que
trabajan en este nuevo campo de la qumica
aplicada a la biologa (metabolmica) consideran que slo de esta forma se podra definir, en trminos moleculares, un fenotipo
concreto. En metabolmica se emplean herramientas analticas muy sensibles (tales
como espectrometra de masa, cromatrografa lquida o gaseosa y resonancia magntica
nuclear) para analizar los cambios
metablicos provocados por mutaciones
gnicas o por la expresin de transgenes.
La metabolmica puede ser aplicada al
monitoreo de estreses inducidos, para identificar pasos metablicos limitantes, para el
anlisis de mutantes y hasta para realizar la
evaluacin de manejos agronmicos, tales
como el efecto de fertilizantes sobre el metabolismo, etc.
- La bioinformtica intenta dar sentido
221
222
223
224
225
226
cionales. Las bases de datos de EST han crecido exponencialmente en la ltima dcada,
de manera que en el National Center for
Biotechnology Information dbEST database
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST) en
Marzo de 2004 haba 20 millones de ESTs.
Esto incluye cerca de 1 millon de ESTs de trigo hexaploide y sus parientes ms cercanos
de la tribu Triticeae, que son Hordeum
vulgare L., especies diploides y tetraploides
de Triticum, Secale cereale L. y Aegilops
speltoides Tausch.
Toda esta informacin permite inferir que
la biotecnologa puede cambiar el escenario
del trigo en dos reas principales: (1) protegiendo al cultivo de estreses biticos y
abiticos y (2) modificando el concepto de
produccin de commodities por el de
produccin de specialities derivadas de
trigo, de mayor valor agregado, como
noodles (tipo de fideo muy utilizado por los
asiticos), galletitas dulces, crackers (un tipo
de galletita que se rompe fcilmente), masa
congelada, pan de molde, pasta, almidones,
plsticos biodegradables, etc.
9 Genomas trabajadores
La genmica aplicada a dilucidar los mecanismos por los cuales funcionan los
microorganismos puede conducir al aislamiento de sus componentes para desarrollar
nanoestructuras que lleven a cabo complejas funciones. Como ejemplos pueden citarse:
Methanococcus jannaschii: es una bacteria que produce metano, una importante
fuente de energa. Contiene enzimas que
soportan temperaturas y presiones elevadas
por lo que son potencialmente tiles para fines industriales
.Deinococcus radiodurans: soporta niveles de radiacin extremadamente elevados
por lo cual tiene un alto potencial para limpiar desechos radiactivos.
Thalassiosira pseudonana: se trata de
una diatomea marina que es la principal participante en el bombeado biolgico de carbono hacia las profundidades de los ocanos, por lo que posee un elevado potencial
para mitigar los cambios climticos del planeta
227
propios del germoplasma regional, de manera de disminuir la dependencia de variedades y genes desarrollados y aislados por pases del primer mundo y buscar soluciones
para problemas propios de la regin, que difcilmente pueden ser enfrentados por programas de mejoramiento gentico ajenos a
la misma.
11 Lecturas recomendadas
CENCI A., CHANTRET N., XY K., GU Y., ANDERSON
O.D., FAHIMA T., DISTELFELD A., y DUBCOVSKY J..
2003. Construction and characterization of a half million
clones Bacterial Artificial Chromosome (BAC) library of
durum wheat. Theor Appl Genet 107:931-939.
ECHENIQUE V., STAMOVA B., WOLTERS P., LAZO G.,
CAROLLO V y DUBCOVSKY J. 2002. Frequencies of Ty1copia and Ty3-gypsy retroelements within the Triticeae
EST databases. Theor. Appl. Genet. 104: 840-844.
GALE M. y DEVOS K. 1998. Plant comparative genetics
after 10 years. Science, 282: 656-658.
DEVOS, K.M,; GALE, M.D. 2000. Genome relationship:
the grass model in current research. Plant Cell 12:637-646
GOFF, S.A.; RICKE, D.; LAN, T.H.; PRESTING, G.; WANG,
R.; DUNN, M.; GLAZEBROOK, J.; SESSIONS, A.;
OELLER, P.; VARMA, H. et al. 2002. A draft sequence of
the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica). Science,
296:92-100.
GRIFFITHS, A.; MILLER, J.; SUZUKI, D.; LEWONTIN, R.;
GELBART, W. 2000. An introduction to the genetic
analysis. Sptima Edicin. W:H:Freeman, N:York. 860 pp.
KNIGHT, JONATHAN. 2003. News Feature. A Dying
Breed Nature 579, vol. 421
KONCZ, C. 2003. Plant Biotechnology. From genome
projects to molecular breeding. Current Opinion in
Biotechnology 14:133-135.
KUMAR, A. y BENNETZEN, J.L. 1999. Annu Rev Genet
33:479532
LAGUDAH, E.; DUBCOVSKY, J. y POWELL, W. 2001.
Wheat Genomics. Plant Physiology and Biochemistry.
39:335-344.
MORGANTE, M. y SALAMINI, F. 2003. From plant
genomics to breeding parctice.Current Opinion in
Biotechnology14:214-219.
RAFALSKI, A. 2002. Applications of single nucleotide
polymorphisms in crop genetics. Curr Opin Plant Biol,
228
5:94-100.
SANMIGUEL, P.; RAMAKRISHNA, W.; BENNETZEN, J.
L.; BUSSO, C. y DUBCOVSKY, J. 2002. Transposable
elements, genes and recombination in a 215-kb contig
from wheat chromosome 5A. Functional and Integrative
Genomics. 2: 70-80.
SCHNEIDER, K.; WEISSHAAR, B.; BORCHARDT, D.C.;
SALAMINI, F. 2001.SNP frequency and allelic haplotype
structure of Beta vulgaris expressed genes. Mol Breed,
8:63-74
SNUSTAD, D.; SIMMONS, M. 2003. Principles of
Genetics. 3th. edition. John Wiley and Sonds, Inc. 840
pp.
WADE, C.M.; KULBOKAS, E.J. III; KIRBY, A.W.; ZODY,
M.C.; MULLIKIN, J.C.; LANDER, E.S.; LINDBLAD-TOH,
K. y DALY, M.J. 2002. The mosaic structure of variation
in the laboratory mouse genome. Nature, 420:574-578.
YAN, L.; ECHENIQUE, V.; BUSSO, C. S.; SANMIGUEL,
P.; RAMAKRISHNA, W.; BENNETZEN, J.L.;
HARRINGTON, S. y DUBCOVSKY, J. 2002. Cereal genes
similar to Snf2 define a new subfamily that includes
human and mouse genes. Molecular and General
Genomics 268:488-499.
YAN, L.; LOUKOIANOV, A.; BLECHL, A.; TRANQUILLI,
G.; RAMAKRISHNA, W.; SANMIGUEL, P.; BENNETZEN,
J.; ECHENIQUE, V. y J. DUBCOVSKY. 2004. Positional
cloning of wheat VRN2 gene reveals a new vernalization
pathway. Science. En prensa.
YANO, M.; KATAYOSE, Y.; ASHIKARI, M.;
YAMANOUCHI, U.; MONNA, L.; FUSE, T.; BABA, T.;
YAMAMOTO, K.; UMEHARA, Y.; NAGAMURA, Y. Y
SASAKI, T. 2000. Hd1, a major photoperiod sensitivity
quantitative trait locus in rice, is closely related to the
Arabidopsis flowering time gene CONSTANS. Plant Cell,
12:2473-2484.
YU, J.; HU, S.; WANG, J.; WONG, G.K.; LI, S.; LIU, B.;
DENG, Y.; DAI, L.; ZHOU, Y.; ZHANG, X. et al. 2002. A
draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp.
indica). Science, 296:79-92.
The Arabidopsis Genome Initiative: Analysis of the
genome sequence of the flowering plant Arabidopsis
thaliana. Nature 2000, 408:796-815.
The Caenorhabitis elegans Sequencing Consortium.
Science, 282, 2012-2018.
The Genome International Sequencing Consortium.
Nature, 409, 860-921 2001.
The Yeast Genome Directory, Nature, 387,
supplement 1-105 1997.
VII.-Captulo 2
Mtodos para el estudio de la
expresin de genes
Pessino, Silvina C.; Martelotto, Luciano G.
1 Introduccin
La capacidad de secuenciar genomas completos desarrollada en la ltima dcada ha
impulsado a la investigacin cientfica en la
direccin de definir la funcin de cada uno
de los genes identificados. Para contribuir
con ese objetivo se han diseado tcnicas
que permiten estudiar la expresin gnica
global en un determinado tejido y en un
momento particular del desarrollo, posibilitando la identificacin inicial y el agrupamiento en clases funcionales de secuencias nuevas con una actividad asociada.
Los procedimientos para esta evaluacin
han progresado desde los mtodos desarrollados para el anlisis de genes nicos especficos (como el Northern slot y dot blotting,
la RT-PCR semicuantitativa y cuantitativa y los
ensayos de proteccin de nucleasas) hacia
otros enfocados en la identificacin de mltiples transcriptos que difieren en su representacin entre las diversas muestras experimentales (como la hibridacin substractiva,
el display diferencial, el ADNc-AFLP , la
secuenciacin de etiquetas expresadas o EST,
el anlisis serial de la expresin de genes o
SAGE y la hibridacin de microarreglos). La
organizacin de las secuencias dentro de grupos funcionales basada en los datos de expresin y de homologa proporciona un marco bsico para conducir nuevos estudios dirigidos a definir la actividad precisa de cada
producto gnico.
2 Hibridacin substractiva
Los mtodos de hibridacin substractiva
fueron creados a principios de la dcada que
comenz en 1980 con el propsito de construir bibliotecas de ADNc para obtener sondas de genes expresados diferencialmente.
Fueron los primeros que se utilizaron de manera amplia con el propsito de identificar
genes regulados positiva o negativamente en
229
Figura 1: Esquema general que describe el procedimiento de hibridizacin substractiva de supresin (SSH). El
ADNc prueba (tester) se divide en dos porciones iguales que se ligan a dos adaptadores diferentes y son hibridizadas
por separado con un exceso de ADNc de la muestra control (driver), lo que conduce a la formacin de los productos
de tipo a, b, c y d que se indican en la figura. Luego ambas muestras se mezclan y se rehibridizan en presencia de
un exceso adicional del driver desnaturalizado, lo que origina los productos a, b, c, d y e. Los extremos de las
hebras dobles se rellenan y los fragmentos se amplifican por PCR utilizando cebadores complementarios a los
adaptadores. El enriquecimiento en las molculas e se logra durante la amplificacin por PCR ya que: i) a y c pueden
unir un solo cebador por lo que se amplifican linealmente; ii) la amplificacin de b est suprimida debido a la
complementariedad de unas terminaciones largas repetidas invertidas presentes en la secuencia del adaptador
que promueven la formacin de estructuras secundarias internas en las hebras simples; iii) d no contiene sitios de
unin a los adaptadores. Los productos de PCR resultantes provendrn de transcriptos presentes esencialmente en
el tester y ausentes en el driver y adems su representacin estar normalizada ya que los fragmentos diferenciales
abundantes tendrn mayores posibilidades de formar molculas de tipo b. Este esquema fue adaptado de Diatchenko
et al. 1996.
230
plementarias permitiendo formar una hebra en los distintos tratamientos experimentade ADNc desde este sitio. En este caso el les representan potenciales transcriptos de
subgrupo de ARNms que sufre transcripcin ARNm de expresin diferencial. Tpicamenreversa estar integrado por aquellas mol- te, las bandas son evaluadas slo si amplificulas que presenten la secuencia complemen- can en forma consistente en reacciones de
taria a la del cebador orientada en el senti- PCR duplicadas para cada muestra (Fig. 2).
do adecuado.
La fase final del display diferencial consisLuego de haberse realizado la sntesis de te en la identificacin de la secuencia del
la primer hebra del ADNc, se amplifican seg- transcripto representado por el producto de
mentos de los transcriptos usando pares ml- PCR y la confirmacin de que este realmente
tiples de cebadores de PCR. Tanto para el se expresa en forma contrastante. Estas etadisplay diferencial como para la RAP-PCR, el pas se logran localizando fsicamente y
cebador superior es un oligonucletido arbi- escindiendo la seccin del gel de
trario de 10 pares de bases. El cebador infe- poliacrilamida que contiene al producto de
rior es el mismo oligonucletido poliT
anclado (para el caso del display diferencial) o el decmero arbitrario (para
el caso de RAP-PCR) que se usaron alternativamente para hacer la transcripcin reversa.
Se ha estimado que los productos
de PCR de 240 combinaciones particulares de pares de cebadores de display diferencial (por ejemplo todas las
combinaciones de 20 oligonucletidos arbitrarios y 12 oligonucletidos anclados) representan
estadsticamente a todos los ARNm
originalmente presentes en la muestra.
Los productos de PCR pueden ser
marcados por incorporacin de un
nucletido radiactivo o de una molcula que pueda ser detectada a travs de su interaccin con un anticuerpo conjugado a un sistema de deteccin (por ejemplo digoxigenina). Tambin puede usarse un cebador unido
a un fluorforo u optarse por no marcar los fragmentos amplificados y usar
luego una tincin con nitrato de plata para revelar los geles. La visualizacin de los productos de PCR se logra Figura 2: Representacin grfica del mtodo de display diferencial.
luego de la electroforesis en geles de Las muestras de ARN son transcriptas en forma reversa usando
poliacrilamida seguida de la apropia- como cebador un oligonucletido poliT de secuencia 5T(T)nTXY
da generacin y deteccin de imge- 3 (donde 10 n 12) que se fija en forma estable al extremo 3de
transcriptos a travs de la unin de las bases adicionales de
nes, que son evaluadas comparando los
secuencia arbitraria X e Y. Una vez sintetizada la primer hebra del
la intensidad relativa de las bandas ADNc, sta se usa como molde para una reaccin de PCR que
producidas a partir de diferentes utiliza como cebadores el mismo poliT anclado y un decmero de
secuencia arbitraria. Distintas combinaciones de poliTs y decmeros
muestras experimentales.
Los fragmentos que estn presen- generan numerosos perfiles de amplificacin a partir de diversas
subpoblaciones de ARN mensajeros. El patrn de bandas de las
tes en una muestra y ausentes en la muestras experimentales se compara en busca de diferencias de
otra o aquellos que estn presentes tipo presencia-ausencia o alteraciones en la intensidad de las
con diferentes intensidades relativas bandas.
231
232
233
234
Figura 4: Procedimiento general para la obtencin de etiquetas de secuencia SAGE. El ARN mensajero es
transcripto en forma reversa utilizando un poliT biotinilado como cebador. Luego es digerido con una enzima de
restriccin ancla que reconoce sitios de 4 bases frecuentes en la secuencia de los mensajeros. Es probable que la
mayora de los mensajeros sean digeridos por esta enzima en algn sector de su secuencia. Los extremos 3de las
molculas son recuperados por unin a esferas de estreptavidina. La muestra se divide en dos partes iguales que
se ligan alternativamente a dos adaptadores diferentes (A y B). A continuacin son digeridas con una segunda
enzima de restriccin (enzima de etiquetado) que reconoce un sitio dentro de la secuencia del adaptador pero
corta al transcripto unos 20 pares de base ms abajo generando un extremo romo. Ambas muestras se mezclan,
se ligan y amplifican con dos oligonucletidos A y B complementarios a los respectivos adaptadores. Los
amplicones se digieren nuevamente con la enzima ancla y los fragmentos se ligan como concatmeros y se
clonan. Este diagrama fue adaptado a partir del presentado por Velculescu et al. 1995.
235
Figura 5: Expresin de genes controlada a travs del uso de microarreglos de ADNc. Los clones amplificados por
PCR se imprimen sobre un soporte slido. Las muestras a analizar se marcan con diferentes fluorforos y se
hibridizan con la matriz. Un detector permite medir por separado la emisin de cada fluorforo. La intensidad de
la seal de hibridizacin ser proporcional al contenido de cada molcula particular de ARN en la muestra. Los
patrones de emisin de ambas muestras son comparados para detectar expresin diferencial.
236
237
238
VII.- Captulo 3
Anlisis informtico de secuencias
moleculares
Paniego, Norma; Heinz, Ruth;
Fernndez, Paula; Lew, Sergio;
Hopp, Esteban
1 Introduccin
La Bioinformtica es el rea de las ciencias de la computacin que aborda la bsqueda de soluciones a los problemas biolgicos con herramientas computacionales. Tanto el anlisis genmico como sus disciplinas
relacionadas pueden ser abordados desde
una perspectiva diferente a partir de la enorme disponibilidad de secuencias moleculares
acumuladas en las bases de datos internacionales como GenBank [1], EMBL [2], DDBJ
[3] y SwissProt [4]. El impacto de los proyectos genmicos durante los ltimos 10 aos,
ha sido por un lado la creciente disponibilidad de secuencias, y por el otro la gran diversidad de datos biolgicos acumulados. Esto,
junto con el desarrollo de las tecnologas
informticas y el arribo de Internet transformando la estructura de almacenamiento y
acceso de los datos, ha permitido el desarrollo de aspectos fundamentales para el avance de los conocimientos sobre los sistemas
biolgicos, como lo son la bsqueda de similitud en secuencias moleculares, el anlisis comparativo (filogentico, taxonmico
y sintnico) de las especies, el anlisis de
macromolculas, la ingeniera y diseo de
estructuras proteicas, entre otros [5].
El propsito de este captulo es introducir los conceptos y las herramientas bsicas
de la Bioinformtica a los estudiantes de un
curso de biotecnologa vegetal o de biologa
molecular de plantas. De ninguna manera
este material pretende cubrir la totalidad de
los recursos existentes para la materia, por el
contrario el objetivo es guiar el inters de los
estudiantes en la exploracin y el uso de
mtodos computacionales decisivos para el
desarrollo de su actividad cientfica o profesional futura. Por lo cual, en primer lugar describiremos las bases de datos generales para
secuencias de ADN y protenas y las bases
239
je por amplificacin por PCR por secuenciacin nica (es decir, con posibles artefactos tcnicos y sin rechequeos) hasta secuencias obtenidas de clones independientes y
que han sido secuenciadas en ambas hebras. Lo mismo pasa con la funcin hipottica de los genes representados.
Tpicamente los proyectos de biologa
molecular bsica generan datos muy bien
caracterizados en cuando a la funcin de los
genes estudiados, mientras que los proyectos genmicos generan secuencias annimas
cuya funcionalidad es primero hipottica, es
decir, deducida a partir de su similitud con
otros genes de funcin conocida (ver prediccin de genes, ms abajo) y debe ser corroborada funcionalmente, por ejemplo, mediante experimentos de complementacin
gentica.
Incluso los perfiles de usuarios que atienden estas bases de datos pueden ser bastante heterogneos: desde el tpico bilogo
molecular que clon y secuenci un gen
involucrado en su tema de estudio (por ejemplo, genes que se activan a partir de una aplicacin hormonal) hasta evolucionistas interesados en redefinir la taxonoma tradicionalmente basada en caractersticas fenotpicas.
A pesar de esta heterogeneidad de intereses y de recursos disponibles, lo ms comn
es que los usuarios frecuenten las tres bases
de datos generales de acceso pblico. Estos
sitios colaboran desde 1982 manteniendo las
bases de datos de nucletidos de Genbank
(NCBI), EMBL Nucleotide Sequence Database
(EMBL-Bank, EBI), y DDBJ [8]. Estos grupos
coleccionan una porcin del total de las secuencias producidas y reportadas en el mundo, e intercambian diariamente todas las secuencias nuevas o actualizadas. Las bases de
datos de protenas incluyen aquellas que
derivan de las bases de datos de nucletidos
como Swissprot, TrEMBL [4] y PIR [9], y las
bases de datos estructurales como PDB
(Protein Data Bank [10]) que contiene mas
de 21.000 estructuras resueltas por
cristalografa o resonancia magntica nuclear
y Macromolecular Structure Database (MSD)
[11] que es una base de datos de EBI derivada en parte de PDB.
El NCBI, el EBI y el DDBJ disponen de
otros recursos como bases de datos de
transcriptos (dbEST), polimorfismos de un
240
Figura 1: La Figura muestra los cdigos asignados por las bases de datos a cada secuencia ingresada. A) Nmero de
acceso y gi de una secuencia nucleotdica. B) Nmero de acceso y gi de la secuencia de aminocidos correspondiente.
cionar o consultar estas bases de datos. Desde el punto de vista informtico, Entrez es
241
242
Figura 4: Representacin grfica de las relaciones del sistema DBGET para la bsqueda y la recuperacin de datos
El mapeo automtico de trminos puede evitarse en primer lugar encerrando el trmino o frase entre comillas. Esto evitar el
filtrado a travs de listas, realizando una bsqueda sobre todos los campos de la base de
datos en forma directa. Adems, en caso de
una bsqueda con una frase (ms de una palabra), esto fuerza la bsqueda usando la frase tal como fue ingresada (con las palabras
en ese orden), lo cual puede resultar til en
algunos casos.
Los trminos de una bsqueda pueden
proporcionarse truncados (truncation), utilizando un asterisco (*). Por ejemplo, una
bsqueda con el trmino enzym* retornar
citas conteniendo la palabra enzyme, pero
tambin enzymes, enzymology, enzymatic,
etc. La bsqueda con trminos truncados
desactiva el mapeo automtico, por lo cual
243
244
de las bases de datos generales, son las llamadas de motivos estructurales y funcionales. Estas bases de datos introducen el
concepto de patrones y perfiles de secuencias. Los patrones definen secuencias cortas
de aminocidos conservados que corresponden a sitios activos, sitios de unin, etc. Al
ser regiones acotadas, no dan cuenta del resto de la secuencia adyacente y son muy poco
sensibles al momento de encontrar secuencias relacionadas que presenten una divergencia mnima en la regin definida por el
patrn [23, 24, 25]. Los perfiles compensan
esta debilidad dado que cubren reas ms
largas de la secuencia a travs de la representacin numrica de las posiciones conservadas en un alineamiento mltiple. En
otras palabras, los perfiles representan las
posiciones comunes y caractersticas de
aminocidos de una coleccin particular de
secuencias, frecuentemente de una familia
de protenas. Usando perfiles es posible encontrar miembros muy divergentes de familias de protenas que presenten muy baja
identidad de secuencia [23, 24, 25].
Descripcin
Database of protein alignment blocks
Conserved domain database
Clusters of SWISS-PROT and TrEMBL proteins
Protein-domain database based on sequence alignments
Integrated documentation resource for protein families,
domains and functional sites
Integrated protein classification database
Database of protein family information
Collection of multiple sequence alignments and hidden Markov
models
Protein Information Resource
Curated database of protein sequence alignments
Compendium of protein fingerprints
Non-redundant protein database organized by family relationships
Automatic compilation of homologous domains
Database of patterns and profiles describing protein families and
domains
Automatic hierarchical classification of SWISS-PROT proteins
Curated protein domain library based on sequence clustering
Simple Modular Architecture Research Tool
- a collection of protein families and domains
SWISSPROT
Protein sequence databases
and TrEMBL
Systematic re-searching method for sequence searching and
SYSTERS
clustering
TIGRFAMs Protein families based on hidden Markov models
URL
http://blocks.fhcrc.org/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml
http://www.ebi.ac.uk/clustr/
http://www.infobiogen.fr/services/domo/
http://www.ebi.ac.uk/interpro/
http://pir.georgetown.edu/iproclass/
http://metafam.ahc.umn.edu/
http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/
http://pir.georgetown.edu/
http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/piraln.html
http://www.bioinf.man.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/
http://pir.georgetown.edu/gfserver/proclass.html
http://prodes.toulouse.inra.fr/prodom/doc/prodom.html
http://www.expasy.ch/prosite/
http://www.protomap.cs.huji.ac.il/
http://www3.icgeb.trieste.it/~sbasesrv/
http://smart.embl-heidelberg.de/
http://www.ebi.ac.uk/swissprot/ or
http://www.expasy.org/sprot/
http://systers.molgen.mpg.de/
http://www.tigr.org/TIGRFAMs/
Tabla 1: Bases de datos y recursos para el anlisis de datos de familias de protenas, dominios y motivos [25].
245
246
puntuales aceptables PAM [33, 34]. La construccin de estas matrices se basa en el modelo de Dayhoff [33], que establece que relaciones lejanas entre secuencias pueden
modelarse con suficiente precisin usando la
informacin de secuencias estrechamente
relacionadas. Ambas matrices se basan en
grupos de alineamientos altamente
confiables de protenas homlogas, a partir
del cual miden la frecuencia de todas las sustituciones a travs de mtodos diferentes
[26].
Las matrices PAM fueron calculadas sobre
la base de un modelo de distancia evolutiva
sobre alineamientos de secuencias muy relacionadas, as PAM1 define una unidad de
cambio evolutivo y representa la probabilidad de que 1 aminocido en 100 haya experimentado una sustitucin. Multiplicando
PAM1 por s mismo se obtiene una familia
de matrices de sustitucin arbitrarias que representan distintos grados de parentesco. La
matriz PAM120 es considerada una buena
matriz de sustitucin para analizar secuencias
evolutivamente ms cercanas, mientras que
PAM250 es ms apropiada para comparar secuencias ms distantes [26, 27].
Las matrices BLOSUM son calculadas de
manera similar pero usando una estrategia
diferente para estimar las frecuencias de sustitucin [27, 32]. Los bloques representan
alineamientos mltiples de secuencias relacionadas (a diferencia de PAM, que usa secuencias estrechamente relacionadas). Los nmeros asociados a estas matrices indican el valor de corte del porcentaje de identidad que
define el grupo. Por lo tanto, las matrices
con valores de corte ms bajo (ej.
BLOSUM62) admiten una mayor diversidad
de secuencias en los grupos y son ptimas
para comparar secuencias ms distantes.
No obstante, los eventos de mutacin
no slo incluyen sustituciones sino tambin inserciones y deleciones, por lo cual
tambin se asigna un score a los intervalos
vacos o gaps observables en los alineamientos.
Una vez definido el score para un alineamiento arbitrario, surge la necesidad de encontrar el alineamiento ptimo entre los
muchos alineamientos posibles. Dado que lo
ms comn entre secuencias de ADN o protenas es que sean similares en algunos seg-
dose de mtodos de programacin dinmica, para los cuales el tiempo de clculo es proporcional al cuadrado del tamao de las secuencias que se comparan [23], son extremadamente lentos para realizar bsquedas exhaustivas en las bases de datos de mayor
Figura 5: Resultado de una bsqueda en BLAST. A) el encabezado muestra el nombre de la secuencia incgnita y el
nombre de la base de datos analizada. Como el programa usado fue BLASYx, la secuencia fue traducida en las seis
marcos de lectura correspondientes y comparada con la base de datos nr (non redundant}de protenas mantenida
por NCBI. B) muestra una representacin grfica de los alineamientos. C) muestra un resumen de los alineamientos
mas significativos junto con el score normalizado y el valor E. D) muestra los lineamientos detallando las propiedades
247
referencia (GenBank, Swissprot, etc.). En cambio, tanto FASTA como BLAST emplean otro
tipo de desarrollo llamado heurstico, que
favorecen la velocidad a cambio de la sensibilidad y la selectividad [26]. Ambos programas operan de manera similar pero usando distintas estrategias para localizar las posiciones donde es ms probable que ocurra
el mejor alineamiento. FASTA busca cadenas
de letras exactamente iguales de un tamao
fijo establecido (words). BLAST, en cambio,
usa matrices de sustitucin (tomando de
base BLOSUM62 para secuencias de
aminocidos) para encontrar words que sin
ser exactamente iguales muestren el score
ms alto, en este nivel de bsqueda ambos
algoritmos no admiten gaps. BLAST realiza
algunas otras operaciones como filtrar las
regiones de baja complejidad (regiones
repetitivas), y elimina words con baja probabilidad de producir un score alto. Una vez que
se identifican estas regiones de alto score,
se aplican algoritmos ms sofisticados de programacin dinmica, ahora s permitiendo la
existencia de gaps. En esta segunda etapa
BLAST busca segmentos similares a la lista de
words establecidos en toda la base de datos y cuando encuentra un alineamiento
posible trata de extenderlo hacia ambas direcciones, hasta tanto el score contine
incrementndose. Luego BLAST evala si el
valor E de los alineamientos obtenidos satisface el umbral seleccionado por el usuario
(normalmente entre 0,1-0,001) para finalmente informar la lista de los seleccionados.
La Figura 5 muestra un resultado obtenido a partir de BLAST. El encabezado cita la
versin del algoritmo empleado y su referencia, el nombre y la longitud de la secuencia
analizada y la base de datos que se us como
blanco. La segunda parte del informe presenta un resumen de todas las secuencias que
produjeron alineamientos significativos
junto con un valor de score normalizado y el
valor E. La tercera parte muestra los
alineamientos detallando los valores de los
scores, identidad y valor E obtenidos y la ltima parte del informe muestra los
parmetros utilizados en la bsqueda.
Para interpretar los resultados obtenidos
de la bsqueda de similitud en bases de datos moleculares usando cualquiera de los
algoritmos (FASTA, BLAST o SSEARCH), el
valor ms representativo es el valor E [26, 35].
248
249
250
sitio Computational Gene Recognition mantenido por W Li [68] ofrece una lista completa y actualizada de publicaciones y software
dedicado a este tema. Sin embargo, aunque
los recursos son vastos y los algoritmos de
prediccin han ido avanzando junto con los
desarrollos en informtica y el avance de los
conocimientos, cimentados en una mayor
disponibilidad de informacin biolgica caracterizada, actualmente no existen mtodos
precisos para identificar estas seales en las
secuencias moleculares. Este problema se
acenta cuando se trata de predecir genes
eucariticos que tienen una organizacin y
una estructura ms compleja que la de los
genes de organismos procariticos. En
genomas complejos los genes no estn dispuestos en forma continua, estn separados
por distancias intergnicas enormes y a su
vez estn estructurados en fragmentos
codificantes (exones) separados por regiones no codificantes (intrones), los cuales
adems varan en tamao y nmero dentro
y, ms an, entre especies.
Algunos programas, adems de reconocer y modelar las seales de patrones especficos, tratan de incorporar un modelo estadstico de las propiedades que definen de
manera ms global exones, intrones y regiones intergnicas, aprovechando los sesgos
de composicin de bases (en regiones
codificantes es ms alto el porcentaje de
G+C) [69], el uso de codones, la frecuencia
de hexmeros o dicodones [70, 71, 72, 73],
la periodicidad de aparicin de bases [74],
etc. Sin embargo, todas estas consideraciones no son suficientes para reconocer con
exactitud exones e intrones cuando stos son
cortos.
En la mayora de los casos, los programas
ms promisorios para reconocer genes en la
especie bajo estudio deben ser analizados
particularmente, a partir de lo cual muchos
son redefinidos o diseados especficamente
[67]. Dado que los algoritmos usan distintas
medidas y scores para predecir regiones
codificantes, lo recomendable es combinar el
resultado de algunos o varios de ellos para
construir el mejor modelo, en este sentido
existen distintas herramientas de acceso libre como RiceGAAS [75, 76], y GenMachine
[77, 78], GenMark [79], entre muchos otros.
7 Conclusiones
La biologa moderna ha generado una
explosin de informacin en el rea de
secuenciacin de genomas completos, la
protemica, la transcriptmica, la
genmica funcional, la interactmica, la
metabolmica, etc. Todo esto genera la necesidad constante de actualizar esta informacin y aplicarla en beneficio de los proyectos
particulares. Para ello, es necesario entender
cmo se genera esa informacin, cun
confiable es, cmo se maneja y cmo se analiza. En este proceso juega un papel clave el
desarrollo de la bioinformtica, que se define como un rea de fusin entre la biologa, la matemtica avanzada y la computacin cuyo objetivo discurre en observar la biologa en trminos de macromolculas, con el
fin de ordenar y entender la informacin contenida en las mismas a partir de recursos de
la informtica. En este sentido, la
bioinformtica enfoca tres reas bsicas, la
primera tiene que ver con el desarrollo de un
sistema simple de organizacin de los datos biolgicos de manera de favorecer el
acceso y el ingreso de nuevas entradas a las
bases de datos compartidas. La segunda rea
tiene que ver con el desarrollo de recursos y
herramientas para analizar la informacin
coleccionada en las bases de datos, lo cual
implica conocimientos slidos en las teoras
computacionales y biolgicas.El tercer rea,
implica el uso de estas herramientas para
analizar los datos e interpretar los resultados de manera biolgicamente significativa.
En este captulo hemos intentado dar
una visin amplia de la bioinformtica
focalizando dos elementos fundamentales
como son las secuencias y los alineamientos, familiarizando a los lectores con los
recursos bsicos disponibles para el acceso a
la informacin y su anlisis, e instalando el
concepto de que existen diferentes caminos
para resolver un problema. Sin dejar de tener en cuenta que la mayora de los mtodos computacionales se basan en conocimientos limitados sobre genes, protenas y
caminos biosintticos por lo cual todos los
resultados obtenidos a travs de estos medios exigen una verificacin experimental.
En su defecto, es recomendable explorar dis-
251
252
253
254
PARTE VIII
Aplicaciones
255
256
ESCANDN, Alejandro S.
VIII.-Captulo 1
1 Introduccin
257
258
ESCANDN, Alejandro S.
estas tcnicas de produccin superaron largamente los rendimientos del mtodo convencional, por lo que fueron adoptadas como
mtodo de rutina para la multiplicacin comercial de este gnero.
El cultivo in vitro tambin puede ser fuente de variabilidad gentica. La produccin de
plntulas por regeneracin a partir de callos,
suspensiones celulares o protoplastos, puede dar origen a individuos que presentan algn rasgo diferente respecto de la planta
madre. Esto tambin puede lograrse utilizando mutgenos durante el cultivo in vitro asociados con una presin de seleccin conferida por factores tales como pH, salinidad, toxinas y baja temperatura. Las plantas regeneradas luego de estos tratamientos pueden
mostrar caractersticas que difcilmente se
puedan obtener por otra va. La induccin
de variantes somaclonales tiene especial significado en la floricultura debido a la constante bsqueda de nuevas variedades,
seleccionndose las variantes prometedoras
y estables e incorporndolas a los programas
de mejoramiento. En la actualidad se conoce un importante nmero de variantes en
ornamentales. Se han obtenido individuos
con diferencias en la forma, el color y el tamao de la flor (en Chrysantemum, Zinnia,
Geranium y Saintpaulia).
En Chrysantemum, se han obtenido individuos con resistencia al estrs salino y con
cambios interesantes en la forma de las hojas. Otro ejemplo de variacin somaclonal es
el caso de Zinnia. Los somaclones en este
gnero se obtuvieron a travs del desarrollo
de yemas adventicias a partir de cotiledones
cultivados con diferentes concentraciones de
tidiazuron (TDZ). Este fue un avance importante para la especie Z. marylindica, que es
un hbrido estril. A partir de este tratamiento se recuper una gran cantidad de variantes, plantas con diferentes tamaos, hbitos de floracin, color de ptalos y, lo que es
ms interesante, en algunos casos se restaur la fertilidad. Aquellas variantes cuyos nuevos caracteres mostraron ser heredables se
seleccionaron para incorporar en el programa de mejoramiento.
Asimismo, la variacin somaclonal tambin se ha utilizado a fin de seleccionar
genotipos resistentes a enfermedades
fngicas en el gnero Rosa, lo mismo que la
259
260
dores moleculares.
Como el resto de las tcnicas biotecnolgicas, la de marcadores moleculares est
siendo intensamente aplicada en especies
ornamentales, sobre todo por la relevancia
Tabla 1: Aplicacin de marcadores moleculares para
determinar la distancia gentica (DG), identificacin
varietal (I.V) y anlisis gentico (A.G), en algunos gneros
ornamentales.
Gnero
I. V.
D. G.
A. G.
Alstroemeria
Calladium
Cephalotaxus
Cymbidium
Dahlia
Dedrathema
Dianthus
Euphorbia
Geranium
X
X
X
X
Gerbera
Heliconia
Jacaranda
Junipers
Lilium
Osteospermum
Ozothamnus
Pelargonium
Petunia
Rhododendron
Rosa
Scaevola
Syringa
Viola
que estos estn adquiriendo en la verificacin de los criterios de distinguibilidad, estabilidad y uniformidad de las nuevas variedades que ao a ao ingresan al mercado.
En la Tabla 1 se mencionan los cultivos
ornamentales en los cuales se han aplicado
marcadores moleculares.
4 Mejorando la ecologa de los cultivos y
modificando las formas y los colores de
las flores
La tecnologa gnica es otra de las estra-
ESCANDN, Alejandro S.
261
Tabla 2: Algunos
avances logrados en el
mejoramiento de
ornamentales por
ingeniera gentica
262
ESCANDN, Alejandro S.
263
264
ESCANDN, Alejandro S.
265
http://aggie-horticulturae.tamu.edu/rose/rmaping.htm
-My love is like a blue, rose blue. The scientist. Nasto, B.
http://www.biomedcentral.com/news/20030213/06
- Ornamental Plant Biotechnology
http://sbc.ucdavis.edu/Outreach/lecture/
ornamental_files
- Plant Biotechnology Applied To Horticultural Crops.
Boxus, P. World Conference on Horticultural Research.
Junio, 1998, Roma ,Italia.
http://www.agrsci.unibo.it
- Proceeding of the XIX International Symposium
Improvement Ornamental Plants. Acta Hort.508, 2000.
- Proceeding of the XX International Eucarpia
266
ESCANDN, Alejandro S.
VIII.-Captulo 10
Estrategias para el control de insectos
plaga
Ferrero, Adriana A.; Descamps, Lilian;
Reviriego, Mara
1. Introduccin
toneladas por ao. Esto representa un recurso potencialmente disponible para ser
explotado por los insectos fitfagos.
El impacto de los insectos sobre las cosechas es conocido desde los tiempos bblicos,
cuando las plagas de langostas se extendieron por el territorio egipcio. Sin embargo, el
estudio global de la interaccin y del impacto de los insectos sobre la vegetacin natural se ha desarrollado en los ltimos cien
aos. En la actualidad, los insectos plaga y
los organismos patgenos (hongos, bacterias y virus) son responsables del 14 % de las
prdidas en cosechas en el mundo (Fig. 1).
Las actividades agrcolas incrementan las
oportunidades para el surgimiento de las plagas a travs del desarrollo de monocultivos,
del cultivo en reas donde no existen enemigos naturales de la plaga, del uso de fertilizantes y herbicidas, del desarrollo del cultivo
en un rea nueva permitiendo as que las
especies nativas de insectos se alimenten de
ste y se conviertan en plagas, de la eliminacin de los enemigos naturales de la plaga
por cambios en el manejo del cultivo y del
uso continuo del mismo producto qumico,
generando adaptacin a ste y posibilitando la aparicin de resistencia.
En los agroecosistemas modernos la evidencia experimental sugiere que la
biodiversidad puede ser utilizada para mejo-
335
336
mos. Estos genes pueden tener diversos orgenes y constituyen una herramienta importante en el desarrollo de variedades resistentes. Su importancia radica en su efectividad,
selectividad contra la plaga, baja estabilidad
relativa y compatibilidad con otras tcticas.
Adems, las variedades resistentes pueden
ser introducidas fcilmente y en forma econmica resultando en ganancias en corto
tiempo. Sin embargo, el tiempo requerido
para su desarrollo, los problemas de biotipos
y que, a veces, las caractersticas agronmicas
de un cultivar puedan ser beneficiosas para
otra plaga son algunas de sus desventajas.
Las barreras qumicas de las plantas pueden ser interpretadas como un mecanismo
de defensa contra los insectos que se alimentan de ellas y que la planta ha adquirido por
seleccin natural. Sin embargo, es difcil demostrar esta afirmacin. Los metabolitos
secundarios tienen funciones alternativas,
muchos son considerados como agentes
antimicrobianos que protegen las plantas de
posibles enfermedades. De todas maneras
existen ejemplos que demuestran que durante la alimentacin de los insectos con una
planta puede inducirse en la misma un incremento en la concentracin de algunos
metabolitos secundarios, que sern efectivos
contra sucesivos ataques.
La relacin entre el estmulo qumico de
la planta y la respuesta del insecto es una
forma de comunicacin qumica entre estos
organismos. Esta comunicacin se realiza
mediante compuestos conocidos como
semioqumicos, que suelen llamarse agentes
antiinsectos y que pertenecen al grupo de
los biorracionales. Los semioqumicos incluyen a las feromonas, sustancias producidas
por insectos que permiten la comunicacin
entre individuos de la misma especie y a los
aleloqumicos, que permiten la comunicacin
entre individuos de diferentes especies. Es
necesario destacar que en la ltima dcada
se han investigado intensamente las posibilidades de aplicar comercialmente las
feromonas con fines de control. En la prctica slo el 5% de las mismas se ha logrado
sintetizar. Hasta el momento no se encuentran en la bibliografa casos instalados de resistencia a feromonas, pero poco uso se ha
hecho de ellas.
Los aleloqumicos pueden subdividirse en
337
338
endotoxinas vara segn el gen que las codifica. Se identificaron y clasificaron numerosos
genes que las codifican, que son de dos tipos, denominados cry (por cristal), y cyt (toxinas citolticas). Ya hay ms de 100 genes identificados pertenecientes a estas familias. El
modelo actualmente vigente para el mecanismo de accin sugiere que por unin de la
toxina a su receptor especfico se induce la
formacin de poros en la membrana celular
que generan un desbalance inico que conduce finalmente a la muerte del insecto. Una
nueva clase de insecticidas que surgieron a
partir de las bacterias mencionadas es la que
corresponde a la llamada clase VIP (vegetative
insecticidal protein). Estas molculas se sintetizan durante el ciclo vegetativo de las bacterias y actan como exotoxina que al ser
ingerida por la plaga, cesa la alimentacin y
muere rpidamente.
Gracias a los avances de la tecnologa del
ADN recombinante se pudieron aislar los
genes de las deltas endotoxinas de Bacillus
thuringiensis y expresarlos en plantas y bacterias del suelo. Esta biotecnologa condujo
a nuevas formas de liberacin de las toxinas
para controlar insectos plaga. Los genes Bt
que ms comnmente se utilizan, en la actualidad en algodn tienen dos orgenes, uno
es el CryAc utilizado por Monsanto en sus
variedades Bollgard y el otro es un gen hbrido que fue desarrollado por el sector pblico
(Academia de Ciencias Agrarias de China,
CAAS). Se trata de un gen Cry1Ab/Cry1Ac.
Existe otro gen CpTi (cowpea trypsyn
gene) que se emplea unido a Bt en alguna
variedades chinas. Otro gen dual es el CryAc/
Cry1F. La utilizacin de dos genes simultneamente es una importante herramienta
para demorar el comienzo de la resistencia.
Las dos toxinas juntas resultan en un control
redundante que conferira una resistencia
ms duradera e incrementa el espectro de
insectos que permite controlar. En la actualidad se han informado 1.326 especies de insectos que atacan al algodn, de los cules
10 producen prdidas importantes desde el
punto de vista econmico, la mayora de los
cuales son lepidpteros.
Cabe mencionar que las toxinas expresadas en la plantas Bt son idnticas o similares
a las encontradas en la naturaleza y a las que
se encuentran en el microorganismo que se
Como un efecto indirecto de la proteccin contra insectos del maiz Bt, se ha podido determinar una reduccin en la presencia
de fumonisinas (micotoxinas producidas por
diferentes especies de Fusarium sp). Estas
micotoxinas son toxicas y cancerigenas para
un nmero de especies animales y se han
relacionado con los altos indices de cancer
esofgico observados en agricultores de Africa y China. Los niveles de reduccin de
fumonisinas en maices protegidos del dao
de los insectos (que constituyen vas de entrada del hongo), varan entre 3 y 8 veces en
diferentes pases y aos.
Otra ventaja es el ahorro en consumo de
agua que implica la menor utilizacin de insecticidas, que, como se sabe es uno de los
recursos ms limitantes del planeta (ver
VIII.12). El volumen de agua utilizada en una
339
340
perimentos muestran que pueden ocurrir algunas violaciones a algunas de las asunciones clave (baja frecuencia de alelos de resistencia y herencia recesiva de la resistencia a
Bt) en algunos sistemas. De esta manera,
dado el difundido uso de los cultivos Bt contra varios insectos plaga, la resistencia podra
evolucionar rpidamente en algunas situaciones a pesar de la presencia de refugios. Contrariamente a esto, no se han documentado hasta la fecha incrementos en la frecuencia de resistencia a las toxinas Bt en poblaciones de insectos a campo a causa de la exposicin a cultivos comerciales que expresan
Bt.
Los factores clave para la demora en la
aparicin de resistencia son probablemente:
los refugios, las bajas frecuencias iniciales de
los genes de resistencia, la herencia recesiva
de la misma, los costos asociados con el desarrollo de la resistencia, que reducen la aptitud de los individuos resistentes en relacin
a los individuos susceptibles sobre los cultivos Bt y las desventajas sufridas por las cepas resistentes sobre los huspedes Bt en
relacin a su desempeo sobre cultivos no
Bt. La importancia relativa de estos factores
vara entre los sistemas de las plagas y los
cultivos Bt.
Una leccin que nos brindan estos pocos
aos de cultivos Bt es que debemos ser cautelosos y reconocer que la habilidad para predecir tasas de evolucin de la resistencia en
el campo es limitada. El xito de los cultivos
Bt hasta la fecha excede las expectativas de
muchos, pero no previene los problemas de
resistencia en el futuro. El monitoreo constante y las estrategias biotecnolgicas en
continuo desarrollo sern fundamentales
para conservar este recurso de control biolgico.
2.1. Insecticidas naturales vs insecticidas
sintticos
La pregunta que nos deberamos hacer
es: son los insecticidas naturales ms seguros que los sintticos? Los cientficos responden que puede ser que sean, dependiendo
del insecticida natural o sinttico que se est
comparando. Cuando se evala el riesgo o la
seguridad de cualquier plaguicida se debe recordar que 1) la toxicidad es una funcin de
la necesidad de utilizar estrategias de manejo de la plaga para minimizar el resurgimiento de la misma. A pesar de todo, los insecticidas han sido y probablemente continuarn
siendo los mtodos ms efectivos para controlar el desarrollo de las plagas. Deca el Dr.
Edgardo Wood, en una conferencia relacionada con la resistencia a insecticidas: El hombre contemporneo debera comprender
que las tcticas qumicas eficaces para controlar las plagas como asimismo los blancos
sensibles y viables deben protegerse como
patrimonio de la humanidad, porque de la
irracionalidad en el uso de la qumica contra
la naturaleza podr sobrevenir una crisis debida a resistencia generalizada en la que no
contaremos con molculas naturales o sintticas efectivas ni con blancos viables. Entretanto la esperanza radica en el conocimiento cada vez mayor del problema y su potencialidad para ser cuidadosos en el aporte y
utilizacin de las soluciones. El primer gran
paso ya est dado: el no desconocer el fenmeno.
4. Lecturas Recomendadas
ALTIERI. M.A. 1994. Biodiversity and Pest Management
in Agroecosystems. Ed:TheHaworth Press, Inc. New York,
London, Norwood (Australia). 185 pp.
ANNIMO. 1957. World Health Expert Committee on
Insecticide, 7 th Report, Who Technical Report Series N
125.
BENEDICT, J.H. 2003. Strategies for Controlling Insect,
Mite and Nematode Pests. In: Plants, Genes and Crop
Biotechnology. Chrispeels, M.J. y Sadava, D.E. Ed. Jones
y Bartlett Publishers, Sudbury, Massachusets. 562pp.
CASIDA, J.E. Y QUISTAD, G.G. 1998. Golden age of
insecticide research: past, present or future?. Ann. Rev.
Entomol. 43: 1-16.
COATS, J. R. 1994. Risks from Natural versus Synthetic
Insecticides. Ann. Rev. Entomol: 39: 489-515.
DE BACH, PAUL. 1992. Control Biolgico de las Plagas de
Insectos y Malas Hierbas. Ed: Lycsa Impresores. Mxico.
949 pp.
FRANCO, O.L.; RODRIGUES MELO, F.; MATTAR DA SILVA,
M.C. y GROSSI DE S, M. F. 1999. Resistncia de Plantas
a Insetos. Biotecnologia, Ciencia y Desenvolvimiento: 3640.
ELLIS, T. R.; STOCKHOFF, L.S.; SCHNEPF, H.E.; SCHWAB,
G.E.; KNUTH, N.; RUSSELL, J.; CARDINEAU, G.A. y NARVA,
K. E. 2002. Novel Bacillus thuringiensis binary insecticidal
341
342
VIII.-Captulo 11
Estrategias para el manejo integrado
de malezas: problemtica, resistencia a
herbicidas y aportes de la
biotecnologa.
Sabbatini, M.R.; Irigoyen, J.H.; Vernav, M.N.
1 Definiciones, caractersticas y daos
ocasionados por las malezas
Se define a las malezas como plantas que
crecen en sitios no deseados por el hombre,
por lo que puede ser considerada maleza
toda planta que disminuye el rendimiento de
un cultivo, resulta txica para el ganado, invade el csped de un jardn o la que crece en
el techo de una casa dificultando el desage
de sus tuberas. Este concepto de maleza o
de planta indeseable causa por lo general un
rechazo especialmente por parte de botnicos que no admiten que se catalogue de esta
manera a una especie vegetal. Contrariamente, para un productor agropecuario, las malezas constituyen plantas nocivas que deben
ser eliminadas de los campos en produccin,
debido a que en la mayora de los cultivos y
pasturas su presencia ocasiona perjuicios econmicos de mayor o menor grado de severidad. La referencia negativa a estas plantas
se traslada a otros pases; as, por ejemplo,
en Espaa se las denomina malas hierbas
y en Brasil plantas dainas. El concepto de
maleza tiene por ello un origen
antropocntrico, ya que en realidad no existe ninguna caracterstica morfolgica o fisiolgica que permita caracterizar a una especie
vegetal como maleza. As, existen algunas
especies que de acuerdo con el lugar donde
crecen pueden ser consideradas cultivos o
malezas. Un buen ejemplo de ello lo constituye el raigrs (Lolium multiflorum), en la
provincia de Buenos Aires, que es una maleza importante del cultivo de trigo pero paralelamente es una forrajera ganadera muy
deseable.
Las malezas conforman una pequea proporcin del mundo vegetal: de las 200.000
especies de angiospermas, slo cerca de
30.000 se comportan como malezas y no ms
343
344
345
te a un determinado herbicida, logrando sobrevivir a su efecto txico. El maz, por ejemplo, es tolerante a los herbicidas de la familia
de las triazinas debido a que puede conjugar
o enlazar dichas sustancias txicas con compuestos qumicos naturales dentro de la planta de maz.
Existe un gran nmero de herbicidas en
el mercado. En la Argentina, actualmente se
comercializan aproximadamente 100 ingredientes activos, agrupados en familias de
herbicidas, que a su vez pueden asociarse de
acuerdo con su mecanismo de accin (Tabla
1).
Una de las vas de desarrollo del control
qumico es el continuo mejoramiento de
tcnicas de aplicacin de los herbicidas. As,
para que una sustancia alcance su mxima
potencialidad biolgica debe garantizarse su
traslado desde el equipo aplicador hasta el
sitio de accin en el vegetal, donde ejercer
su efecto letal. Para ello se han diseado
equipos de aplicacin muy precisos y la industria qumica ha perfeccionado la formulacin
de los principios activos con el agregado de
distintos vehculos, coadyuvantes, diluyentes,
etc., que los acondicionan para su mejor desempeo biolgico.
En los ltimos aos, debe destacarse el
importante avance en el uso de protectores
de herbicidas, mal denominados antdotos.
Un protector de herbicidas es un compuesto que protege a las plantas de un cultivo de
los daos de una sustancia herbicida dirigida
al control de malezas. Estos compuestos protectores actan nicamente sobre el cultivo,
reduciendo la habilidad de las sustancias herbicidas para alcanzar o interferir el sitio de
accin donde actan. En la actualidad existe
ms de una decena de protectores disponibles para uso comercial en cultivos de maz,
trigo, arroz, sorgo y otros cereales. El alcance
de estos protectores ha permitido que herbicidas de accin especfica sobre malezas de
la familia de las gramneas puedan ser utilizados selectivamente en cultivos de gramneas,
como por ejemplo el trigo o el maz. El desarrollo de esta tecnologa se inici con la aparicin del NA (1,8-naftalen-anhdrico),
patentado en 1971, para uso en tratamientos de semillas de maz con el objeto de protegerlo de los daos ocasionados por los
herbicidas tiocarbamatos y actualmente se
346
Tabla 1. Mecanismo y sitio de accin de las principales familias de herbicidas, frecuentemente utilizadas en el
control de malezas en la Repblica Argentina y su riesgo potencial de ocasionar resistencia en las especies de
malezas controladas.
bicida B, hacia el cual es inicialmente susceptible; luego de un tiempo de intenso uso del
herbicida B la poblacin se torna resistente
a ste, por lo cual ahora es resistente a ambos herbicidas.
Los mecanismos ms comunes de resistencia son:
(i) Modificaciones en los sitios de accin,
347
348
349
350
gnicos. Un ejemplo lo constituye la obtencin de resistencia al glifosato por la transferencia de un gen, que codifica para un producto que inhibe la actividad de la enzima
EPSP sintetasa (Tabla 1), desde una especie
de Agrobacterium al genoma de la soja.
Este proceso de transferencia gnica dio
como resultado la obtencin de la denominada soja RR (soja Roundup Ready) resistente a la accin herbicida del glifosato (Fig.
1). Posteriormente, dicho gen tambin fue
introducido en el maz, generando el hbrido
de maz RR (maz Roundup Ready), tambin resistente a glifosato. En este cultivo se
ha obtenido tambin la variedad Liberty
Link, resistente a glufosinato de amonio,
herbicida no selectivo conocido comercialmente como Liberty. En este ltimo ejemplo, el gen incorporado codifica una enzima
(fosfinotricin-N-acetil transferasa) que es la
responsable de convertir al glufosinato en un
metabolito inocuo para maz.
El desarrollo de CRH ha generado un impacto econmico y biolgico de magnitud
sobre la produccin agrcola, pudindose
351
352
7 Bibliografa
353
VIII.-Captulo 12
Outlook to 2005: an impending crisis predice que si la crisis del agua contina, cabra
esperar para el 2025 una reduccin de 350
Tolerancia a factores abiticos
millones de toneladas mtricas en la produccin de granos, lo cual representa un poco
Puebla, Andrea F.; Del Viso, Florencia
ms de la produccin actual de Estados Unidos. Como resultado, el precio del arroz
incrementara en un 40%, el del trigo en un
1 Introduccin
80% y el del maz en un 120 % si se considera
la demanda actual. Dado que la agricultura
La radiacin, la temperatura, el agua y los consume el 70 % de toda el agua utilizada
nutrientes son factores del medio ambiente por el hombre, resulta obvio que la mejor
que afectan el crecimiento y el desarrollo de forma de ahorrar agua es a travs de la
las especies vegetales. La distribucin de las implementacin de prcticas agrcolas que
plantas sobre la tierra depende, por lo tan- tiendan a reducir el consumo. Una forma es
to, de la existencia e intensidad de estos fac- la reduccin del riego mediante la creacin
tores. Para alimentar a una poblacin futura de plantas resistentes a sequa, otra es la disde 8 billones de habitantes con las prcticas minucin en el uso de insecticidas mediante
agrcolas actuales se requerira de un incre- la utilizacin de estrategias de control biolmento del 12 % en la cantidad de tierras cul- gico contra insectos (ver VIII.10) y plantas
tivables (Fig. 1), lo cual ser imposible dada tolerantes a herbicidas (ver VIII.11). Estas dos
ltimas estrategias tambin reducen el riesla densidad demogrfica esperada.
go de contaminacin de las fuentes
de agua potable disponibles
Levitt (1980) define a los estreses
ambientales como cambios en las
condiciones del medio que reducen
o cambian desfavorablemente el crecimiento o desarrollo de las plantas.
Los estreses ambientales provocan en las plantas respuestas complejas y constituyen un problema fundamental para la agricultura, ya que influyen sobre la supervivencia y la productividad de los cultivos. Estas respuestas se manifiestan a nivel celular, fisiolgico y del desarrollo (Levitt,
1980) y son caracteres de variacin
continua (cuantitativos), controlados por un importante nmero de
Fig. 1: La cantidad de tierra destinada a la agricultura, calculada en genes aditivos y probablemente
acres/persona ha ido disminuyendo paulativamente. Se estima que sinrgicos (Bohnert y col., 1995). Se
para alimentar a una poblacin futura de 8 billones de habitantes, ha visto, por ejemplo, en estudios
con las tecnologas actualmente en uso, se requerira de un citogenticos, que al menos diez de
incremento de un 12 % en la cantidad de tierra cultivables. Gentileza
los veintin pares cromosmicos en
Prof. Germn Spangenberg.
el trigo estn comprometidos en la
respuesta
a las bajas temperaturas (Sutka y
Por otro lado la agricultura es la principal
Vesz,
1988).
consumidora de agua en el mundo, uno de
Los genes inducidos bajo condiciones de
los recursos ms limitantes para el futuro. Las
estreses
abiticos, tales como las bajas temreservas de agua del planeta han ido dismiperaturas, la salinidad y la sequa, codifican
nuyendo a medida que los consumos han ido
protenas que tienen funciones de sealizaaumentado con el crecimiento de la humanicin, transduccin de seales y proteccin
dad y las prcticas agrcolas (Fig. 2). Un inforcelular, como por ejemplo, protenas constime reciente de IIPRI (2002) Global Water
tuyentes de canales de agua que alteran el
355
356
Figura 3: Vas principales de sealizacin en plantas en respuesta a estreses abiticos (Fro, Sequa y Salinidad).
La va I de sealizacin involucra la produccin de antioxidantes y osmolitos involucrando la transduccin de
seales a travs de MAP kinasas. La va II involucra la produccin de diferentes tipos de protenas (tipo LEA y otras)
y est mediada por CDPK. La va III involucra a la va SOS, especfica del estrs inico. No se detallan las molculas de
sealizacin o segundos mensajeros.
357
358
ron tambin varios QTLs con efectos significativos en la tolerancia a la sequa (Tunistra y
col., 1997).
Las nuevas tecnologas para el anlisis
genmico (microarreglos de ADN, gentica
directa y reversa) produjeron una revolucin
en el anlisis gentico de las especies y permitieron cambiar el enfoque en el anlisis,
yendo desde estudios de un solo gen a estudios que abarcan todo el genoma. Utilizando tanto macro como microarreglos de ADN
(Lin y col., 2003; Seki y col., 2001, 2002a,
2002b; Kawasaki y col., 2001; Oono y col.,
2003) se estudiaron genes inducidos o suprimidos en condiciones de estrs abitico (fro,
sequa, salinidad). La mayor parte de estos
estudios se realizaron en Arabidopsis debido al hecho, entre otros factores, de que su
genoma ha sido completamente secuenciado, facilitando as la construccin de los
microarreglos y el anlisis de las secuencias
obtenidas.
Los resultados de estos trabajos indicaran la existencia de una mayor interseccin
entre las vas de sealizacin de ABA, sequa
y salinidad, comparada con las vas en comn
entre ABA y fro (Seki y col., 2002b). A partir
de estos estudios tambin se identificaron
numerosos genes que son inducidos por uno
solo de los tratamientos, los cuales se clasificaron como especficos de cada respuesta.
Los resultados obtenidos hasta el momento permiten sugerir que la tecnologa de
microarreglos ser de mucha utilidad para el
aislamiento de nuevos genes, para el estudio de perfiles generales de expresin tejido-especfico ante distintas condiciones de
estrs abitico y tambin para la identificacin de genes y potenciales elementos en cis
de factores de transcripcin.
4.1 Tolerancia a las bajas temperaturas
Las especies vegetales adaptadas a regiones templadas del planeta varan durante
transcurso del ao en su habilidad para sobrevivir a las bajas temperaturas. Las plantas
capaces de aclimatarse al fro perciben las
bajas temperaturas sobre cero durante el
avance del invierno y disparan procesos
bioqumicos especficos que resultan en la
tolerancia, an, de temperaturas de
congelamiento (Thomashow, 1999).
359
360
estrs hdrico incluira posiblemente un cambio de turgencia que provoca el cierre de los
estomas, la expresin y/o activacin de
enzimas de sntesis de osmolitos y la de sistemas transportadores de stos y de agua.
Los genes involucrados en la homeostasis
hdrica incluyen los genes de acuaporinas, los
genes de enzimas de biosntesis de osmolitos,
de cotransportadores de sentido contrario
(antiporters) de Na+/H+ asociados a membrana plasmtica para la extrusin de Na+,
de antiporters de Na+/H+ para la compartimentalizacin de Na+ en la vacuola y de transportadores de K+ con alta afinidad para la
adquisicin de K+.
La seal de detoxificacin se disparara
ante la desnaturalizacin proteica y la presencia de especies reactivas de oxgeno. La
respuesta incluye la hidrlisis de fosfolpidos,
cambios en la expresin de protenas tipo
LEA/dehidrinas, de chaperonas moleculares
y proteasas que remueven las protenas desnaturalizadas, as como la activacin de
enzimas responsables de la remocin de especies reactivas de oxgeno, de protenas relacionadas con la ubiquitinacin y de otras
protenas detoxificantes.
6 La va SOS (Salt Overly Sensitive o
sensible al exceso de salinidad) de
tolerancia a la salinidad
El estrs salino quiebra la homeostasis
inica de las plantas provocando un exceso
txico de Na+ en el citoplasma y una deficiencia de iones esenciales como el K+.
El clonado y la caracterizacin bioqumica
de varios genes y productos de genes SOS
(Salt Overly Sensitive) ha permitido establecer recientemente una va de sealizacin
para la regulacin de la homeostasis inica y
la tolerancia a la salinidad en Arabidopsis.
Esta va se dispara por un aumento intra o
extracelular de Na + y provoca una seal
citoplasmtica de calcio que induce la expresin y cambios de actividad de transportadores de iones como el Na+, K+ y H+. La va
contiene tres genes principales llamados
SOS1, 2 y 3 (Zhu, 2000) (Fig. 3).
El estrs salino provoca una seal
citoslica de Ca 2+. Una protena que se une
a Ca 2+ , codificada por SOS3 percibe
presumiblemente esta seal y desencadena
361
raturas revelaron la presencia de un elemento ABRE. Estos genes se expresan en respuesta a ABA, demostrando que las vas
regulatorias de fro y las dependientes de
ABA se cruzan en algn punto de la seal de
transduccin (Shinozaki y YamaguchiShinozaki, 1997).
8 Plantas transgnicas tolerantes a
estreses abiticos
Pases
Bajas temperaturas
Bolivia
China
India
Bangladesh, Brasil, China,
India, Pakistn, Tailandia
China
China
Argentina
Egipto
China, Indonesia, Sudfrica,
Tailandia
Indonesia
Croacia
Salinidad
Papa
Tomate
Trigo
Arroz
Sequa
Maz
Sorgo
Tabaco
Trigo
Arroz
Caa de azcar
Trigo
362
Las investigaciones en el campo de la tolerancia a factores ambientales adversos tuvieron un desarrollo importante en la ltima
dcada. Se identificaron genes y protenas
con roles en la tolerancia a fro, sequa y
salinidad, se determinaron muchos de sus
mecanismos de accin y se avanz en el conocimiento de cmo se desencadenan y activan las respuestas de las clulas vegetales
ante estos estreses y sus interrelaciones.
Las nuevas tecnologas (micro y
macroarreglos de ADN, transformacin
gentica de plantas) prometen brindar nuevos descubrimientos, fundamentales para
entender cmo las especies vegetales son
capaces de adaptarse a un ambiente siempre cambiante.
Lecturas Recomendadas
ANCHORDOGUY T.J.; RUDOLPH A.S.; CARPENTER J.F. y
CROWE J.H. 1987. Modes of interaction of cryoprotectans
with membrane phospholipids during freezing.
Cryobilogy 24: 324-331.
BACHMAN M.; MATILE P. y KELLER F. 1994. Metabolism
of the raffinose family oligosaccharides in leaves of
Ajuga reptans L. Plant Physiol. 105: 1335-1345 .
363
SEKI M.; NARUSAKA M.; ISHIDA J.; NANJO T.; FUJITA M.;
OONO Y.; KAMIYA A.; NAKAJIMA M.; ENJU A.; SAKURAI
T.; SATOU M.; AKIYAMA K.; TAJI T.; YAMAGUCHISHINOSAKI K.; CARNICI P.; KAWAI J.; HAYASHIZAKI Y. y
SHINOSAKI K. 2002. Monitoring the expression profiles
of 7000 Arabidopsis genes under drought, cold and highsalinity stress using a full-length cDNA microarray. The
plant Journal 31(3): 279-292.
SEKI M.; ISHIDA J.; NARISAKA M.; FIJITA M.; NANJO T.;
UMEZAWA T.; KAMIYA A.; NAKAJIMA M.; ENJU A.;
SAKURAI T.; SATOU M.; AKIYAMA K.; YAMAGUCHISHINOSAKI K.; CARNICI P.; KAWAI J.; HAYASHIZAKI Y. y
SHINOSAKI K. 2002b. Monitoring the expression pattern
of around 7000 Arabidopsis genes under ABA treatments
using a full-length cDNA microarray. Funct. Integr.
Genomics 2: 282-291.
STOCKINGER E.J.; GILMOUR S.J. y THOMASHOW M.F.
Arabidopsis thaliana CBF1 encodes an AP2 domaincontaining transcriptional activator that binds to the Crepeat/DRE, a cis-acting DNA regulatory element that
stimulates transcription in response to low temperature
and water deficit. P.N.A.S. 94: 1035-1040.
SHINOZAKI K. y YAMAGUCHI-SHINOZAKI 1997. Gene
expression and signal transduction in water-stress
response. Plant Physiol. 115: 327-334.
SHINOZAKI K. y YAMAGUCHI-SHINOZAKI K. 1998.
Molecular responses to drought and cold stress. Plant
Biotechnology.
364
365
VIII.- Captulo 13
Aproximacin biotecnolgica
integrada para un manejo sustentable
del estrs bitico en frutilla
Castagnaro, Atilio Pedro;
Salazar, Sergio Miguel; Zembo, Juan Carlos
Daz Ricci, Juan Carlos
Introduccin
La frutilla cultivada (Fragaria x ananassa:
2n=8x=56) es un poliploide con 56
cromosomas resultante de la hibridacin
interespecfica entre dos especies de frutillas
silvestres, tambin octoploides. Una de estas frutillas es originaria del sur (F. chiloensis:
2n=8x=56) y la otra del norte de Amrica (F.
virginiana: 2n=8x=56). La x en el nombre
cientfico hace referencia a su condicin de
hbrido. Se trata de un importante fruto que
se consume en fresco o industrializado y que
es muy apreciado en prcticamente todo el
mundo. Su cultivo involucra dos actividades
agronmicas bien diferenciadas: la produccin de frutas y la viverstica, las cuales generan una gran demanda de mano de obra
(alrededor de 500 jornales /Ha /ao), por lo
cual en muchos pases es considerado tambin como un cultivo social.
Si bien se realiza mejoramiento gentico
en distintos lugares de Asia, Europa y Norte
Amrica, el mercado de variedades est dominado por empresas estadounidenses. En
Argentina, a partir de 1996 comenz a funcionar, en forma organizada, el Programa
Nacional de Mejoramiento Gentico de la
Frutilla (Pro\Frutilla) a travs de una iniciativa
interinstitucional (sectores pblico y privado)
e interdisciplinaria (combina el mejoramiento gentico convencional con los mtodos
surgidos de la biotecnologa molecular), que
en 1999 represent a nuestro pas en la exposicin Flanders Technology InternationalTechnoland, en Gante, Blgica.
El objetivo general del Pro\Frutilla es obtener cultivares argentinos adaptados a por
lo menos dos agroecosistemas o ambientes
de seleccin (el subtropical de Lules en
Tucumn y el templado del cinturn hortcola
del Gran La Plata, en Buenos Aires), con resistencia incrementada a estrs de origen
367
Figura1. Esquema de seleccin recurrente seguido en las poblaciones comerciales (mayor nivel de domesticacin)
nica, en el marco de las mencionadas Poblaciones Intermedias (2) y siguiendo un esquema diallico incompleto, se realizaron 500 cruzamientos interespecficos entre accesiones
silvestres de Fragaria vesca, Duchesnea indica, Potentilla tucumanensis y 9 genotipos
de la cultivada F. x ananassa. Este estudio
permiti detectar barreras pre y poscigticas
de aislamiento reproductivo entre estas especies. A fin de conocer la naturaleza de las
barreras, se investig el crecimiento del tubo
polnico en el pistilo utilizando microscopia
de fluorescencia (Fig. 2) y se realizaron estudios histolgicos de aquenios. Este conocimiento permitir disear estrategias que
posibiliten la transferencia de genes de inters agronmico desde los genotipos silvestres a los domesticados.
368
ESPECIE
EC50 (uM)
Bacterias
Gram positivas
Clavibacter michiganensis
Staphylus aureus
Enterococcum faescium CRL 35
Bacillus subtilis
Listeria monocytogenes
Gram negativas
Xanthomonas fragariae
Xanthomonas axonopodis pv citri
Pseudomona auruginosa
Pseudomona siringae pv. gladiolii
Erwinia carotovora
Salmonella newport
E.coli D21
Hongos
Colletotrichum fragariae
Colletotricum acutatum
Colletotrichum gloeosporioides
0.07
0.14
0.20
0.25
0.28
0.06
0.07
0.12
0.27
0.95
3.25
4.00
8.92
7.91
9.37
369
370
371
7 Conclusiones
En general, se podra decir que el caso del
Pro\Frutilla es un claro ejemplo de
complementacin, interaccin, integracin y
coordinacin, entre el mejoramiento
gentico convencional y la biotecnologa
molecular, para buscar soluciones a problemas de estrs bitico asociados a un cultivo
de inters comercial, en un marco de
sustentabilidad y competitividad agronmica.
8 Lecturas Recomendadas
ARIAS M, CAMADRO E, DAZ RICCI JC AND CASTAGNARO
A. (2003). Breeding barriers between the cultivated
strawberry, Fragaria x ananassa, and related wild
germplasm. Euphytica 136:139-150.
CASTAGNARO A, DIAZ RICCI J, ARIAS M AND ALBORNOZ
P. (1998). A new Southern Hemisphere species of
Potentilla (Rosaceae). Novon 8: 333-336.
DATTA SK and MUTHUKRISHNAN S. Eds. Pathogenesisrelated proteins in plants. CRC Press. 291pp.
DIATCHENKO L, LAU YC, CAMPBELL AP, CHENCHIK A,
MOQADAM F, HUANG B, LUKYANOV S, LUKYANOV K,
GURSKAYA N, SVERDLOV ED and SIEBERT PD. (1996).
Suppression Subtractive Hybridization: A Method for
Generating Differentially Regulated or Tissue-Specific
cDNA Probes and Libraries. Proc Natl Acad Sci U S A. 93:
60256030.
DIXON DP, LAPTHORN A and EDWARDS R. (2002). Plant
glutathione transferases. Genome Biology 3:
reviews3004.1-10.
FILIPPONE MP, DIAZ RICCI JC, CASTAGNARO A and
FARIAS RN. (2001). Effect of Fragarin on the Cytoplasmic
Membrane of the Phythopathogen Clavibacter
michiganensis. Molecular Plant-Microbe Interactions 14:
925-928.
FILIPPONE MP; DIAZ RICCI J; MAMAN DE MARCHESE A;
FARAS RN and CASTAGNARO A. (1999). Isolation and
purification of a 316 Da preformed compound from
strawberry (Fragaria ananassa) leaves active against
plant pathogens. FEBS Letters 459: 115-118.
GARCA MG, ONTIVERO M, DAZ RICCI JC and
CASTAGNARO A. (2002). Morphological traits and high
resolution RAPD markers for the identification of the
main strawberry varieties cultivated in Argentina. Plant
Breeding 121: 76-80.
LEISTER D, BALLVORA A, SALAMINI F, and GEBHARDT C
(1996) A PCR-based approach for isolating pathogen
resistance genes from potato with potential for wide
application in plants. Nat. Genet. 14:421-429.
372
VIII.-Captulo 2
Mejoramiento de Plantas Forrajeras en
la Era Genmica
Spangenberg, Germn
1 Introduccin
La agricultura de pastizales depende en
gran medida de la disponibilidad de fuentes
adecuadas de forraje como base primaria
para la alimentacin del ganado. En la mayora de las regiones agrcolas del planeta la
produccin de forraje es un sistema de baja
inversin donde el mejoramiento gentico
de plantas es la forma ms econmica de
aportar tecnologa de avanzada a los productores. El mejoramiento convencional se basa
en el uso de la variacin gentica natural existente entre ecotipos o aquella creada a travs de recombinacin sexual. La biotecnologa
permite generar nueva variabilidad y utilizar
de manera ms eficiente la variabilidad
gentica existente. Esto incrementa la fuente de genes tiles para el desarrollo de nuevos cultivares, acelerando los programas de
mejoramiento gentico.
En los ltimos aos se han desarrollado
numerosas tcnicas biotecnolgicas y
moleculares para el mejoramiento de
gramneas y leguminosas forrajeras
(Spangenberg 1999; Forster et al. 2000). Entre estas tcnicas cabe mencionar el establecimiento de sistemas eficientes de regeneracin de plantas a partir de clulas competentes para la transformacin gentica, la combinacin total o parcial de genomas por hibridacin somtica y cibridacin a travs de
la fusin de protoplastos, la produccin de
plantas forrajeras transgnicas utilizando
Agrobacterium y biolstica, y el establecimiento de sistemas altamente informativos de
marcadores moleculares codominantes
para ser utilizados en el proceso de seleccin
y en el desarrollo de mapas genticos.
En este captulo se describen las aplicaciones actuales y futuras y el impacto de la
biotecnologa en el mejoramiento de especies forrajeras.
2 Transgnesis
La tecnologa gnica y la obtencin de
plantas transgnicas brindan la posibilidad de
267
268
SPANGENBERG, Germn
sinpico
el verano, debido a
cido ferlico
PAL
4CL
4CL
4CL
4CL
4CL
que estos carbohiCCoA-3H
CCoA-OMT
CCoA-OMT
dratos parecen con?
p-cumaroilcafeoilferuloil5-hydroxysinapoiltrarrestar las disminuCoA
CoA
CoA
feruloyl-CoA
CoA
ciones en digestiCCR
CCR
CCR
CCR
bilidad debidas a
lignificacin, favorep-cumaraldehdo
coniferaldehyde 5-hidroxisinapaldehdo
coniferaldehdo
ciendo adems la asiCAD
CAD
CAD
milacin del forraje y
de protenas en el
alcohol p-cumarlico
alcohol coniferlico
Alcohol sinaplicol
rumen y, concomi(H)
(G)
(S)
tantemen-te, conduPER
LAC
ciendo a incrementos
LIGNINA
A en el peso vivo.
La sntesis de
fructosa en gramLG2
LG7
neas involucra la accin concertada de al
menos tres enzimas:
sacarosa:sacarosa 1Xc30.1,
fructosil-transferasa
Xbcd147
e41t50240,
Xcdo1417
LpCAD2.2
e41t50144
Xbcd1823
(1-SST), fructano:
e33t50120
LpCAD2.1
e33t62340
Xpsr154, Xpsr690
Xbcd135, Xc600.1
fructano 1-fructosilLpOMT1
e33t62760
e38t50244
transferasa (1-FFT) y
LpCCR1
e33t62620
e41t47520
sacarosa: fructano 6Xpsr540.1
fructosiltransferasa
(6-SFT) que sintetizan
e40t50334
10 cM
la mezcla ms comLpCAD1
e40t49173, Xcdo36
pleja de fructa-nos liXpsr546
Xpsr1316
gados que se encuenXc472
Xr738
tra en pastos y cereaXc556, Xc498, Xpsr10 (Gli-2)
Xc847
les. Varios de los
B genes involucrados
en
esta
va
metablica han sido
Figura 2: A) Diseccin de la va metablica de la biosntesis de monolignoles. Las
aislados y caracterizaenzimas son: PAL = fenilalanina amonio liasa, C4H = 4-cumarato-3-hidroxilasa, COMT =
O-metil transferasa del cido cafeico, F5H = ferulato-5-hidroxilasa, 4CL = dos, como el 6-SFT de
hidroxicinamato:CoA ligasa, CC3H = cumaroil CoA hidroxilasa, CCOMT = Cafeoil CoA 3- cebada, el 6G-FFT de
O-metil transferasa, CCR = cinamoil CoA reductasa, CAD = cinamil alcohol deshidrogenasa. cebolla y el 1-SST de
Las flechas punteadas indican reacciones que no han sido experimentalmente alcaucil. Su introducverificadas. B) Mapeo de los genes correspondientes a la va en los grupos de ligamento cin en plantas desLG2 y LG7 de raigrs perenne.
provistas de frucvigor, la tolerancia a estreses y por ltimo llevar a cabo la hibridacin y seleccin para obtener germoplasma elite.
269
270
SPANGENBERG, Germn
judiciales de acuerdo a los niveles encontrados en la planta. Niveles de taninos condensados superiores al 4-5% del peso seco son
perjudiciales, actuando como factores
antinutritivos y generando rechazo por parte del animal. En cantidades moderadas (13%) mejoran la calidad del forraje, ya que
reducen el meteorismo (empaste) por
disrupcin de la espuma causada por las protenas en el rumen, disminuyen la prdida de
protenas debidas a desaminacin microbiana y reduciendo la carga de parsitos en
el animal.
Las estrategias moleculares utilizadas para
la manipulacin de la biosntesis de taninos
se han orientado hacia la introduccin de
taninos condensados en alfalfa y trbol blanco y a su reduccin en leguminosas que tienen altos contenidos (ver Morris y Robbins
1997 y Gruber et al., 2000). Estas se basan
en la disponibilidad de genes involucrados en
la biosntesis de antocianas, que afectan las
etapas comunes en la biosntesis de
flavonoides y la suposicin de que estos funcionarn en la biosntesis de taninos.
El estudio de mutantes de la va
metablica de los flavonoides en Arabidopsis
ha proporcionado abundante informacin
acerca de la identidad de las enzimas
involucradas en la sntesis de taninos en esta
especie. Esto permiti el clonado, entre otros,
de los genes CHS, CHI, F3H y DFR. Se identific y clon tambin el gen BAN (BANYULS),
que parece ser especfico de la va de
biosntesis de los taninos.
Se ha intentado la regulacin negativa o
positiva de enzimas clave en la biosntesis,
como es el caso de chalcona sintetasa (CHS)
y leucoantocianina-4 reductasa (LAR) respectivamente, o la activacin de la ruta
biosinttica mediante la expresin de genes
reguladores apropiados que gobiernen la va
a travs de un accionar pleiotrpico (con
efectos a varios niveles fenotpicos). El anlisis de los promotores de algunos genes estructurales de esta va demostr la presencia
de motivos de secuencia especficos para
la interaccin con factores de transcripcin
de tipo MYB, bZIP y bHLH. Un ejemplo de
esto lo constituye la transformacin de plantas de Lotus corniculatus con el gen
regulatorio Sn de maz, que result en una
disminucin del contenido de taninos en
hojas, conjuntamente con un aumento del
271
Virus tales como el del mosaico de la alfalfa (alfamovirus,AMV), el del mosaico del
trbol blanco (potexvirus,WCMV) y el del
amarillamiento de las nervaduras
(potyvirus,CYVV) afectan negativamente el
crecimiento y desarrollo de las leguminosas.
Cada uno de ellos infecta individualmente a
un gran nmero de especies distribuidas por
todo el mundo, causando prdidas significativas en leguminosas utilizadas para distintos
fines. El control de estos tres virus podra incrementar la rentabilidad de las industrias
rurales australianas en ms de 860 millones
de dlares. La mayora de los mtodos clsicos utilizados para prevenir las infecciones
virales son laboriosos y econmicamente
inviables. Se han identificado fuentes potenciales de tolerancia o resistencia en alfalfa y
en unas pocas especies de Trifolium, pero
no existe una resistencia natural a estos virus
que sea transferible, efectiva y durable que
pueda ser incorporada a cultivares de leguminosas forrajeras. La tecnologa gnica es
una opcin atractiva para lograr este objetivo, ya que permite sortear barreras
interespecficas, desarrollar resistencias
multignicas y manipular niveles y sitios de
expresin. La transgnesis se ha usado
exitosamente para desarrollar resistencia
efectiva y durable en un amplio rango de es-
272
SPANGENBERG, Germn
to de la larva y una mayor mortalidad de estas cuando se la compara en la misma situacin utilizando plantas control .
Otro ejemplo lo constituye la utilizacin
de inhibidores de proteasas, tales como el
inhibidor de tripsina pancretica bovina o
aprotinina en trbol blanco, donde la expresin en hoja de aprotinina a niveles de 0,07%
de protena soluble reduce el ataque por las
larvas de Wiseana.
Otra estrategia para proteger contra insectos plaga sera la transformacin indirecta en gramneas, utilizando un endfito (microorganismo que vive y se desarrolla dentro
de los tejidos de la planta) transformado,
como Neotyphodium. Esto permitira obtener cepas del endfito seguras para los rumiantes que las consuman, que expresen y
secreten protenas insecticidas tales como
toxinas Bt e inhibidores de proteasas que
protejan a las gramneas forrajeras de las plagas.
2.3 Crecimiento y desarrollo
2.3.1 Manipulacin de alrgenos del
polen
La fiebre del heno y el asma alrgico
estacional debido al polen de las gramneas
son enfermedades ambientales que afectan
hasta el 25% de la poblacin en climas templado-fros. El polen de raigrs es uno de los
ms abundantes en estas regiones, siendo
el principal alrgeno para el 49-67% de los
pacientes alrgicos. Este polen contiene por
lo menos 4 clases principales de protenas
alergnicas, cada una de las cuales est
constituda por mltiples isoformas
inmunolgicamente indistinguibles que
involucran 17 alrgenos que tienen un tamao que va de 12 a 89 kDa. Al menos una protena de cada una de estas clases ha sido aislada y caracterizada en detalle. Se han aislado clones de ADNc para el principal alrgeno
del raigras Lolp1, Lolp2 y Lolp5. En 1997 se
obtuvieron las primeras plantas transgnicas
de raigrs perenne (Lolium perenne) y de
raigrs Italiano (Lolium multiflorum) que llevan genes para Lolp1 y Lolp2 en antisentido,
bajo el control de un promotor especfico del
polen a fin de regular negativamente los
alrgenos del mismo. Estas plantas permitirn estudiar el rol funcional in planta de es-
273
274
SPANGENBERG, Germn
275
Figura 3: A) Esquema de la liberacin a campo, a pequea escala, de plantas transgnicas de trbol blanco inmunes
a AMV. B) Estrategia para el desarrollo de germoplasma elite transgnico de trbol blanco inmune a AMV, basada
en la utilizacin de PCR cuantitativa para detectar las plantas homocigotas para los transgenes (npt2 y AMV4).
276
llas cosechadas de las plantas de trbol blanco no transgnico de estas dos hileras se
analizaron utilizando una combinacin de
resistencia a antibitico (resistencia a G418
mediada por un gen npt2 ubicado en el ADNT integrado en el genoma de las plantas
transgnicas) y PCR para detectar la presencia del gen marcador de seleccin. Los resultados de este anlisis confirmaron que este
diseo de campo es adecuado para la evaluacin de plantas transgnicas (Fig. 3 A).
SPANGENBERG, Germn
bal de los genomas. Todo esto aportar informacin acerca de todos los aspectos del
crecimiento vegetal, desarrollo, diferenciacin
y respuestas a estreses biticos y abiticos,
revolucionando el mejoramiento vegetal y la
produccin. Cientos de miles de etiquetas de
secuencias expresadas (ESTs) han sido el
punto de partida para dilucidar la funcin de
miles de genes vegetales y se han creado
bases de datos de las mismas provenientes
de los principales cultivos. Esto posibilitar la
identificacin, caracterizacin funcional y uso
de genes valiosos para los sistemas de produccin de forraje.
3.1 Descubrimiento de genes y
micromatrices (microarrays) para el
anlisis de la expresin de genes en
plantas forrajeras
Las especies modelo para las cuales se han
encarado proyectos de genmica basados
fundamentalmente en el descubrimiento de
ESTs son Lotus japonicus y Medicago
truncatula. Aproximadamente 80.000 ESTs
de la ltima han sido generados por consorcios internacionales financiados por el French
Centre National de Sequencage, la
International Human Frontier Science
Program Organization, la Samuel Roberts
Noble Foundation, Stanford University, el US
National Science Foundation Plant Genome
Program y el US Deparment of Energy
Biosciences Program.
Un programa asociado entre Agriculture
Victoria-DNRE (Australia) y AgResearch
Limited (Nueva Zelanda) gener aproximadamente 100.000 ESTs de cultivos forrajeros
clave para la agricultura de clima templado,
como son el raigrs perenne (L. perenne) y
el trbol blanco (T. repens). Para ello se
secuenciaron a gran escala clones seleccionados al azar de genotecas de ADNc que representaban un amplio rango de rganos,
estados de desarrollo y tratamientos experimentales. Fueron generadas, 49503 secuencias de ADN de raigrs perenne, analizadas
por bsqueda de BLAST (Ver VII-3) y
categorizadas funcionalmente .
Dentro de este programa se realizaron
micromatrices de ADNc de alta densidad (con
4000-5000 gotas/arreglo) para su utilizacin
en la identificacin de secuencias de trboles
y raigrases (Fig. 4, ver pg. 13).
277
278
tos conducentes a la nodulacin en las leguminosas utilizando L. japonicus como modelo. Este proceso de nodulacin involucra la
interaccin compleja entre genes bacterianos
y sus productos con procesos de desarrollo
en la planta que involucran percepcin y
transmisin de seales y morfognesis. El
objetivo es comprender mecanismos
genticos de la planta involucrados en esta
simbiosis a fin de mejorar las asociaciones naturales beneficiosas para la agricultura y el ambiente. Este y otros recursos genticos de M.
truncatula y L. japonicus contribuirn
significativamente a conocer y comprender
las respuestas a patgenos y estrs y las
interacciones de la rizsfera con las leguminosas forrajeras.
Agriculture Victioria-DNRE tambin ha
encarado un programa de genmica de
endfitos de gramneas focalizado en el descubrimiento de genes gramnea-endfito en
la asociacin Festuca arundinacea/
Neotyphodium coenophialum. A travs de
este programa se han generado aproximadamente 8.000 secuencias del hongo que se
analizaron por bsqueda de BLAST y se caracterizaron funcionalmente. El principal inters est dirigido al descubrimiento de
genes involucrados en la colonizacin del
husped, en el aporte de nutrientes para el
hongo endoftico y en la biosntesis de
metabolitos secundarios activos de
pirrolopirazina y pirrolizidina (los repelentes
de insectos peramina y N-formilolina respectivamente) y su regulacin. Este proyecto
tambin aportar informacin acerca de la
interaccin endfito-husped as como de los
mecanismos fisiolgicos conducentes a un
incremento en el vigor de la planta y a una
mayor tolerancia a estreses. Estas herramientas genmicas y el conocimiento generado
posibilitarn el desarrollo de tecnologas para
manipular las asociaciones gramnea-endfito
a fin de incrementar el rendimiento de la planta, mejorar la tolerancia a estreses biticos y
abiticos y alterar la especificidad endfitohusped a fin de beneficiar a las industrias
semilleras de pasto para csped y forrajes.
En otro proyecto similar se ha tratado de
aislar y caracterizar genes involucrados en la
biosntesis de indol-diterpenos y ergopeptinas responsables de la toxicosis animal en
la asociacin Lolium perenne-N. Lolii. La pro-
SPANGENBERG, Germn
Figura 4: A) Perfiles de expresin a travs de micromatrices de ADN utilizando dos colorantes fluorescentes (Cy5 y
Cy3) para marcar dos muestras de RNA total provenientes de distintas situaciones de crecimiento o desarrollo, por
ejemplo plantas creciendo en luz (Cy3) y plantas creciendo en oscuridad (Cy5). Luego de la hibridacin, los puntos
marcados en verde indican los genes que se encuentran regulados positivamente cuando las plantas se encuentran
en condiciones de luz, aquellos marcados en rojo corresponden a los regulados positivamente cuando se hallan en
oscuridad y los que estn en amarillo corresponderan a aquellos genes que estn regulados positivamente en
ambas situaciones. C) Micromatrices de ADNc de trbol blanco utilizando RNA de hojas y raz. Confirmacin por
Northern de la expresin de los genes para la dihidroflavonol reductasa y una protena embrinica.
279
280
SPANGENBERG, Germn
4 Resumen y conclusiones
En los ltimos aos se ha realizado un
considerable progreso en el establecimiento
de las metodologas requeridas para el mejoramiento molecular de plantas forrajeras.
Numerosas estrategias biotecnolgicas estn
siendo consideradas en relacin al mejoramiento de la calidad nutritiva a travs de la
alteracin de la biosntesis de lignina,
carbohidratos solubles y protoantocianas y
de la expresin regulada de protenas ricas
en aminocidos esenciales, resistentes al
rumen. Tambin se pretende incrementar la
resistencia a patgenos y plagas, manipular
el crecimiento y desarrollo a fin de incrementar la persistencia y demorar la senescencia,
impedir la floracin y regular negativamente
los alrgenos del polen. Las primeras plantas
forrajeras transgnicas han sido evaluadas a
campo y eventos de transformacin seleccionados se han utilizado para el desarrollo de
cultivares.
Las herramientas genmicas permitirn
comprender mejor la gentica, fisiologa y
bioqumica de varios procesos vegetales complejos y acelerar la aplicacin de estrategias
de tecnologa gnica para el mejoramiento
de plantas forrajeras.
La aplicacin de herramientas y
metodologas moleculares para el mejoramiento de estas especies reemplazar en
gran medida la seleccin emprica basada en
el fenotipo por otra ms directa y predecible,
basada en el genotipo. Sin embargo, estas
estrategias son promisorias solamente cuando se las considera dentro de un programa
de mejoramiento. Los programas ms
exitosos sern aquellos que incluyan un equipo multidisciplinario conformado por
mejoradores, bilogos moleculares y celulares, bioqumicos, patlogos, agrnomos, expertos en nutricin animal y que adopten las
nuevas tecnologas gnicas, de genmica funcional, bioinformtica y de fenotipificacin y
que las apliquen de manera apropiada para
resolver problemas especficos. El esfuerzo de
tales equipos integrados ser crtico para el
desarrollo de cultivares destinados al mercado y para el desarrollo de plantas forrajeras
destinadas a otros usos.
La genmica vegetal tendr un rol vital al
acelerar la aplicacin de la biotecnologa para
la agricultura de forrajes y pastizales. La in-
281
VIII.-Captulo 3
Manipulacin de la Apomixis y su
Aplicacin en la Agricultura
Ortiz, Juan Pablo A.; Pessino, Silvina C.;
Quarin, Camilo L.
1 Qu es la apomixis?
Algunas plantas con flores presentan un
modo asexual de reproduccin llamado
apomixis. ste consiste en la formacin de
semillas que contienen embriones
genticamente idnticos a la planta madre,
generados sin que intervengan los procesos
de meiosis y fecundacin. La apomixis fue
descripta por primera vez en 1841 en la planta
australiana Alchornea ilicifolia por J. Smith.
Cuando un ejemplar femenino de esta especie dioica fue llevado a los Kew Gardens de
Londres desde Asia, la planta aislada floreci
y produjo semillas en abundancia, poniendo
al carcter en evidencia. Paradjicamente, los
primeros experimentos con plantas
apomcticas fueron realizados en forma
involuntaria por Gregor Mendel, quien utiliz cruzas entre especies del gnero
Hieracium para intentar confirmar los resultados obtenidos en sus famosos estudios
sobre la herencia de las arvejas de jardn.
Mendel atribuy errneamente a una supuesta frecuente autopolinizacin la falta
de segregacin observada. Hoy sabemos que
muchas especies de este gnero son
apomcticas.
Se considera que la apomixis ha evolucionado como un sistema de reproduccin alternativo a la sexualidad a travs de la
reformulacin de sus programas de desarrollo. Por lo tanto, para comprender su funcionamiento es necesario compararlo con el de
la reproduccin sexual. La sexualidad en las
angiospermas comprende la alternancia cclica entre los estados de esporfto (la planta
misma, 2n) y gametfito (el grano de polen
y el saco embrionario, n). La meiosis que ocurre en las flores posibilita la recombinacin y
reduccin del contenido gentico y da lugar
a la formacin de las esporas femeninas
(megsporas) en el ovario y masculinas
(micrsporas) en las anteras. La megaspo-
283
o meiosis
Mitosis
modi
Mitosis
Mitosis
Clulas somticas
ficad
Megasporas
haploides (n)
Megagametofito
no reducido (2n)
ac
i
somtica
d
un
fec
o
a
om
ci
t n
n au
da
Esporofito (2n)
Divisi
Endosperma
in
ss
osi
Mit
Embrin
tosi
s
Grano
de polen
is
tos
Mi
Mi
n
cu
fe
Doble fecundacin
Figura 1: La rutas biolgicas de la reproduccin sexual y apomctica. Durante la sexualidad una clula de la
nucela del vulo se diferencia como clula madre de la megspora y luego de sufrir un proceso de meiosis da origen
a cuatro megsporas haploides. Tres de estas megsporas degeneran y la cuarta da origen a la formacin de un saco
embrionario luego de una serie de mitosis, donde todos los ncleos celulares estn reducidos (n). La ovoclula y los
ncleos polares del saco son fecundados por los ncleos generativos del polen para generar el cigoto y el ncleo
primario del endosperma, respectivamente. El cigoto da origen al embrin a travs de sucesivas mitosis. La apomixis
consiste en la formacin de un embrin a partir de una clula no reducida (que no ha sufrido mitosis). En algunos
casos hay formacin de un megagametofito con clulas no reducidas, cuya ovoclula (2n) genera un embrin por
partenognesis (apomixis gametoftica). En otros casos el embrin es generado directamente a partir de una clula
de la nucela en un proceso similar a la embriognesis somtica (embriona adventicia).
284
Gametognesis
n
Mitosis
Meiosis
2n
Me
io
Clula madre
de la megspora
sis
Mitosis
mo
d
ific
ad
a
(tipo A
ntenna
ria)
2n
Mitosis (tipo Taraxacum)
2n
2n
Mitosis (tipo Paspalum)
2n
Clulas
nucelares
Sexualidad
Esporfito
Diplospora
Apospora
Gametfito
Figura 2: Distintos tipos de sacos embrionarios formados durante los procesos de sexualidad y de apomixis
gametoftica. En la sexualidad, la clula madre de la megspora realiza un proceso de meiosis y genera cuatro
megsporas haploides, tres de las cuales degeneran. La cuarta megspora lleva a cabo una serie de tres divisiones
mitticas para formar un saco embrionario reducido y octanucleado. En el proceso de apomixis diplosprica la
clula madre de la megspora realiza una serie de mitosis para generar un saco embrionario no reducido y octanucleado
(tipo Antennaria) o inicia un proceso de meiosis que falla para generar un saco embrionario no reducido y
octanucleado (tipo Taraxacum). En la apomixis aposprica clulas de la nucela cercanas a la clula madre de la
megspora realizan varias mitosis consecutivas para generar un saco embrionario no reducido que puede ser
pentanucleado (tipo Paspalum) y cuya caracterstica ms notable es la ausencia de antpodas.
285
Figura 3:
Microfotografas de
secciones de vulos
de razas
tetraploides de
Paspalum notatum.
A: vulo
conteniendo un
saco embrionario
meitico (las dos
sinrgidas y
algunas de las
antpodas no se
observan porque
estn en una
seccin adyacente
del corte del
vulo). B: vulo
conteniendo dos
sacos embrionarios
apospricos.
Referencias: a,
antpodas; e, clula
huevo, p, ncleos
polares; barra = 30
micras
286
287
288
289
290
crear el carcter pero permitieron la identificacin de varios genes involucrados en el control de etapas particulares de su desarrollo,
como la proliferacin del endospermo en
ausencia de fertilizacin. La transformacin
gentica de cultivares sexuales con genes que
controlan el inicio del carcter es an hipottica, ya que la identificacin de esos genes
no se ha logrado.
7 Caracterizacin molecular de la
apomixis
En los ltimos aos la tecnologa de marcadores moleculares y los procedimientos de
biologa molecular han generado una cantidad considerable de conocimientos nuevos
sobre las bases moleculares de la apomixis
que pueden ser tiles para el futuro aislamiento del/los genes que controlan el carcter.
Han sido identificados varios marcadores que
cosegregan con la apomixis en distintos gneros de gramneas como Tripsacum,
Pennisetum, Brachiaria y Paspalum. Estos
marcadores ligados al carcter pueden emplearse en el estudio de la transmisin del
mismo en los programas de mejoramiento
de especies apomcticas y eventualmente intentar cualquiera de las estrategias de
clonado basadas en el mapeo gentico para
aislar el/los disparadores del fenmeno. El
anlisis molecular posibilit la identificacin
de una regin genmica especfica de la
apospora (ASGR) en Pennisetum
squamulantum que est ausente en individuos sexuales y donde la recombinacin est
severamente restringida. En Tripsacum
dactyloides, Paspalum simplex y Paspalum
notatum se detectaron regiones similares en
donde numerosos marcadores aparecen
completamente ligados al carcter (ver figura 4). La ausencia de recombinacin bien podra estar asociada a una estrategia para evitar la dispersin de los factores que necesitan cosegregar estrictamente para determinar la apomixis. La existencia de una regin
ASGR de baja recombinacin puede enmascarar la presencia de varios genes que gobiernan al carcter, hacindolos aparecer y funcionar como una sola unidad gentica. Una
caracterizacin molecular detallada de este
segmento cromosmico revelar en el futuro la variedad y el nmero de genes
291
292
VIII.-Captulo 4
Tcnicas de ingeniera gentica para
conferir resistencia a virus en plantas
del Vas, M.; Distfano, A.J.; Vazquez Rovere,
C.; Hopp, H.E.
1 Introduccin
Las enfermedades de las plantas causan
la prdida de aproximadamente el 15% de
la produccin agrcola mundial. En particular,
las infecciones virales producen perjuicios
econmicos significativos de manera directa,
a travs de una disminucin del rendimiento
por efecto de la enfermedad e indirecta, a
travs de un incremento en los costos debido a la utilizacin de semilla libre de virus
(por ejemplo, en plantas de propagacin
clonal como papa, ajo y batata). Por otro
lado, la exportacin de ciertos productos se
ve restringida debido a las limitaciones internacionales impuestas a la exportacin de
materiales fuera de la calidad y tolerancia
fitosanitaria permitidas.
Clsicamente, las enfermedades virales en
plantas se controlan mediante distintas estrategias como el mejoramiento gentico,
el uso de semillas libres de virus, la rotacin de cultivos y la tcnica de proteccin
cruzada (que se describe brevemente ms
adelante).
A partir de 1983, cuando Fraley y col. obtuvieron plantas de tabaco y petunia
transgnicas, se public un gran nmero de
trabajos detallando la transferencia de genes
forneos a una cantidad creciente de especies de plantas. La ingeniera gentica permite incorporar en las plantas nuevos caracteres de inters agrcola en forma horizontal,
evitando as el traspaso de caracteres indeseables. De esta forma, la variedad
transgnica adquiere un carcter nuevo al
tiempo que mantiene intactos el fondo
gentico y el potencial productivo original, lo
que permite encarar el mejoramiento rpido de cultivares ya utilizados por el agricultor. Los transgenes introducidos pueden provenir de otras variedades de la misma especie vegetal, de plantas de otras especies
sexualmente incompatibles e incluso de organismos pertenecientes a otros reinos incluyendo animales y microorganismos.
En sentido amplio existen dos formas de
modificar plantas por ingeniera gentica de
manera de conferirles resistencia al virus: desencadenar resistencia mediante la expresin
de secuencias genmicas derivadas del propio virus al que se desea combatir (llamada
resistencia derivada del patgeno o PDR)
o desencadenar resistencia mediante la expresin de genes no-virales que poseen
actividad antiviral.
2 Resistencia a virus conferida por genes
virales
La prevencin del desarrollo de enfermedades virales utilizando genes derivados del
patgeno fue propuesta por primera vez a
comienzos del siglo XX, cuando se demostr
que las plantas de tabaco podan ser protegidas frente a la infeccin con una cepa severa del virus del mosaico del tabaco (Tobacco
mosaic virus o TMV) si, previamente, se las
haba inoculado con una cepa menos virulenta del mismo virus (McKinney, 1929). Este
tipo de estrategia, comnmente denominada proteccin cruzada, ha sido empleada para varios cultivos de importancia econmica, incluyendo tomate, papaya, ctricos,
etc. (Gadani y col., 1990). En 1985, Sanford y
Johnston propusieron que la expresin de
ciertos genes del patgeno en un hospedante alterara el balance normal de los componentes virales y predijeron que esto conducira al impedimento de la replicacin o del
movimiento del virus dentro de la planta ms
all de la primera clula infectada (Sanford &
Johnston, 1985).
Las primeras plantas transgnicas con
resistencia a virus se obtuvieron en 1986
mediante la expresin del gen que codifica
para la cpside del TMV (Abel y col., 1986).
Utilizando esta estrategia se logr obtener
plantas resistentes a virus pertenecientes a
casi todos los gneros de virus de plantas,
principalmente en tobamo-, potex- y
alfamovirus (Tabla 1).
En general, las plantas protegidas muestran un retardo temporal del desarrollo de
sntomas, una atenuacin en la sintomatologa caracterstica de cada virus en parti-
293
tas estrategias no se
detallarn debido a
que actualmente hay
Gneros de
transgn
Virus
Especies vegetales
virus
evidencias de que en
varios casos su efectiTobamovirus
CP
TMV; ToMV; AIMV
tabaco; tomate
vidad se debe a la induccin del mecanisPotexvirus
CP
PVX; CyMV; WCIMV
tabaco
mo de resistencia
Potyvirus
CP
PVY; TEV; PRV; PPV PPV; tabaco; papa; papaya; mediada por ARN
maz
MDMV; SMV; WMV II;
que se describe a conZYMV
tinuacin.
Carlavirus
CP
tabaco; papa
PVS
En 1992 se demostr,
por primera
Luteovirus
CP
PLRV
papa
vez, que se poda
Comovirus
CP
SLRSV
tabaco
obtener resistencia a
virus mediante la exNepovirus
CP
ArMV
tabaco
presin de un ARNm
Tobravirus
CP
TRV
tabaco
de cpside viral no
Ilavirus
CP
TSV
tabaco
traducible, es decir,
no era necesaria la
Geminivirus
CP
TYLCV
tomate
expresin de la proTospovirus
Gen N
TSWV; INSV; TCSV; GRSV
tabaco
tena codificada por
el transgn (Lindbo
Los acrnimos utilizados (en orden alfabtico) son: AIMV: Alfalfa mosaic virus; ArMV: & Dougherty, 1992).
Arabis mosaic virus; CMV: Cucumber mosaic virus; CyMV: Cymbidium mosaic virus; A partir de entonces
GRSV: Groundnut ringspot virus; INSV: Impatiens necrotic spot virus; MDMV: Maize se publicaron numedwarf mosaic virus; PLRV: Potato leaf roll virus; PPV: Plum pox virus; PRV: Papaya rosos trabajos proringspot virus; PVS: Potato virus; PVX: Potato virus X; PVY: Potato virus Y; SMV:
Soybean mosaic virus; SSLRSV: Strawberry latent ringspot virus; TCSV: Tomato fundizando la caracchlorotic spot virus; TEV: Tobacco etch virus; TMV: Tobacco mosaic virus; ToMV: terizacin de este
Tomato mosaic virus; TRV: Tobacco rattle virus; TSV: Tobacco streak virus; TSWV: tipo de resistencia a
Tomato spotted wilt virus; TYLCV: Tomato yellow leaf curl virus; WClMV: White virus, llamada en senclover mosaic virus; WMV II: Watermelon mosaic virus II; ZYMV: Zucchini yellow tido amplio resismosaic virus.
tencia mediada por
ARN.
Las
plantas
que
muestran este tipo
cular, una menor cantidad de sitios de infecde
resistencia
presentan
un fenotipo de incin y un menor ttulo viral. Se demostr que
munidad que se caracteriza porque no hay
hay una correlacin entre la resistencia y el
replicacin viral detectable, no hay diseminanivel de expresin de la protena de la cin viral dentro de la planta y no hay sntocpside, que la proteccin acta en el pla- mas debido a la enfermedad, o un fenotipo
no celular y es superada por altas dosis de de recuperacin que se caracteriza por una
inculo (viriones). En algunos casos es su- infeccin inicial (con produccin de sntomas)
perada por inoculacin con ARN viral.
que es seguida por un crecimiento posterior
La proteccin es ms efectiva para el vi- resistente a la infeccin y asin-tomtico. En
rus homlogo al que dio origen al transgn. cualquiera de los dos casos, las plantas son
Sin embargo, abarca tambin a virus y cepas solamente resistentes a la infeccin producirelacionadas aunque la eficiencia se va redu- da por virus mucho ms estrechamente relaciendo a medida que la relacin filogentica cionados con el virus que dio origen al
transgn que en el caso de proteccin mese hace ms lejana.
Adems, se logr obtener resistencia a diada por cpside. El anlisis de estas planvirus mediante la expresin de otras prote- tas en el plano molecular demostr que en
nas virales tales como las protenas respon- general contienen copias mltiples del
sables de la multiplicacin viral (por ejem- transgn y que si bien presentan un alto niplo ARN polimerasas dependientes de ARN) vel de transcripcin en el ncleo, los niveles
y las protenas responsables del movimien- estables del ARNm del transgn en el citoto viral de clula a clula disfuncionales. Es- plasma son muy bajos. Usualmente se ob-
294
295
gos (donde se denomina quelling) y animales como nematodos, moscas o mamferos (donde se lo denomina interferencia
mediada por ARN). El PTGS puede ser desencadenado eficientemente por transgenes
nucleares que dan lugar a transcriptos con
estructura de ARN de doble cadena (ARNdc)
o que expresan altos niveles o niveles
aberrantes de transcriptos. En plantas tambin puede ser desencadenado por la
replicacin de virus que generalmente produce intermediarios replicativos de ARNdc.
Una vez desencadenado el proceso, los intermediarios que contienen ARNdc son reconocidos por una nucleasa especfica de
ARNdc que los procesa en fragmentos de
ARNs pequeos (llamados pequeos
interferentes -small interfering- ARNs o
ARNsi) de ambas polaridades y de 21 a 25
nucletidos de longitud (Hamilton &
Baulcombe, 1999). A su vez, se postula que
Figura 1: Mecanismo propuesto para la iniciacin, diseminacin de la seal mvil y degradacin del ARNm blanco
durante el proceso de silenciamiento gnico postranscipcional (PTGS) dentro de una planta. RdRP: ARN polimerasa
dependiente de ARN.
296
gacin sistmica (Voinnet y col., 2000), y finalmente otros, como el codificado por el
virus del achaparramiento del tomate
(Tomato bushy stunt virus o TBSV), suprimen el silenciamiento slo en las nervaduras
(Voinnet y col., 1999). Incluso se han encontrado en virus animales supresores de
silenciamiento que son funcionales en plantas (Li y col., 2002). Es interesante destacar
que varios de los supresores de silenciamiento
virales descriptos haban sido previamente
caracterizados como protenas responsables
de la sintomatologa, del movimiento viral y/
o del fenmeno de sinergismo en la virulencia combinada de dos o ms virus.
La posibilidad de la supresin del
silenciamiento por parte de un virus que coexista con las plantas transgnicas protegidas por el mecanismo de silenciamiento
gnico debe ser tomada en cuenta ya que la
infeccin de una planta silenciada con un virus heterlogo que lleva un supresor de
silenciamiento puede dar lugar a la reversin
del silenciamiento tornndola susceptible a
la infeccin viral (Beclin y col., 1998). Resulta
importante entonces estudiar qu virus
coinfectan un mismo hospedador en condiciones naturales y en lo posible utilizar plantas transgnicas con resistencia a ambos virus.
Un aspecto interesante a recalcar es que,
debido a que el mecanismo de PTGS implica
una muy baja acumulacin del ARN derivado
del transgn y una nula acumulacin de protenas, la estrategia de obtener resistencia a
virus mediante el desencadenamiento de
este fenmeno en plantas transgnicas es
ms atractiva desde el punto de vista de la
evaluacin de riesgos en cuanto a la
bioseguridad de estos organismos genticamente modificados u OGMs, que la sobreexpresin de genes que interfieran con el
ciclo de multiplicacin viral, como es el caso
de la cpside u otras protenas virales. Esto
se debe a que la baja acumulacin de ARN
transgnico minimiza las posibilidades de una
potencial recombinacin homloga con ARN
de origen viral infectante. Por otro lado, la
ausencia de la protena codificada por el
transgn minimiza drsticamente el anlisis
de riesgo alimentario del OGM y evita el riesgo de transcapsidacin (la encapsidacin del
material gentico de otros virus) en el caso
297
heterlogas de infecciones virales. Se demostr que la expresin de esta protena en plantas de papa y tabaco transgnicas las protega frente a una variedad de viruses, sea que
stos fueran inoculados mecnicamente o
por fidos vectores (Lodge y col., 1993). El
estudio de esta resistencia demostr que la
protena PAP inhiba un paso temprano de
la infeccin. Estas protenas son potencialmente txicas para la planta husped (Wang
& Tumer, 2000).
En los ltimos aos se encontraron o
redisearon variantes menos txicas o no
txicas de estas protenas las que, expresadas en plantas transgnicas, confieren resistencia a virus sin producir el efecto de la
inactivacin de los ribosomas (Wang y col.,
1998, Zoubenko y col., 2000).
Por otro lado, se estudi la actividad
antiviral de la protena IRIP (protena RIP obtenida de bulbos de iris) en plantas
transgnicas de tabaco. Esta protena es una
ARN-N-glicosidasa y su expresin en plantas
transgnicas no produjo cambios fenotpicos
observndose una reduccin significativa de
las lesiones producidas por el virus TMV con
respecto a las plantas control (Desmyter y
col., 2003).
298
Tabla 3: Plantas transgnicas con resistencia a virus en etapas avanzadas de experimentacin en laboratorio (e) o de
pruebas piloto a campo (c) en pases en vas de desarrollo (fuente: FAO.Bio.Dec www.fao.org/biotech/
inventory_admin/dep/default.asp).
Cultivo
Virus
Pas
moscada
Los acrnimos utilizados fueron: BGMV: Bean golden yellow mosaic virus; BYDV: Barley yellow dwarf virus;
CLCV: Cotton leaf curl virus; CMV: Cucumber mosaic cucumovirus; CPsV: Citrus psorosis virus; CVBMV: Chilli
vein-banding mottle virus; MSV: Maize streak virus; PAMV: Potato aucuba mosaic virus; PLRV: Potato leafroll
luteovirus; PMV: Papaya mosaic virus; PRSV: Papaya ringspot virus; PStV: Peanut stripe virus; PVX: Potato virus
X; PVY: Potato virus Y; RDV: Rice dwarf virus; RRSV: Rice ragged stunt virus; SCMV: Sugarcane mosaic virus;
SMV2: Soybean mosaic virus; SPMFV: Sweet potato feathery mottle virus; TMV: Tabaco mosaic virus; TSWV:
Tomato spotted wilt virus; TuMV: Turnip mosaic virus; TYLCV: Tomato yellow leaf curl virus; ZAMV: Zantedeschia
mosaic potyvirus. ZYMV: Zuchini yellow mosaic potyvirus.
299
300
301
VIII-Captulo 5
Obtencin de plantas libres de virus
Conci, Vilma C.
1 Eliminacin de virus
Los virus de plantas son responsables de
importantes prdidas en los rendimientos,
llegando en algunos casos a ser limitantes
para el cultivo.
La mayora de los virus no se transmiten
por semilla, por lo tanto, las especies que se
multiplican por esta va tienen la posibilidad
de liberarse de ellos en forma natural.
Por otra parte, cuando las especies que
se propagan exclusivamente en forma
agmica son infectadas sistmicamente por
virus ellos son transmitidos, con alta eficiencia, desde la planta madre a la descendencia. Esta situacin. que es normal en especies
que se multiplican por bulbos, tubrculos,
esquejes o estacas permite que la infeccin
contine de generacin en generacin y se
disemine a diferentes regiones a travs del
comercio de estos propgulos. Ejemplo de
ello son ajo, frutilla, frutales de carozo o pepita, yuca, papa, batata y numerosas especies ornamentales. En estos casos, la obtencin y multiplicacin de plantas libres de virus por medios artificiales juega un papel importante para mejorar la produccin y calidad de estas especies. Existen numerosos
ejemplos respecto a los beneficios obtenidos
como consecuencia del empleo de plantas libres de virus, no slo por los incrementos en
la produccin sino que adems ha permitido
la recuperacin de reas de cultivo que haban sido prcticamente abandonadas.
Una larga lista de especies han sido liberadas de virus a travs de la regeneracin de
plantas in vitro. El sistema ms frecuentemente utilizado y con mayores xitos es el
cultivo de meristema, suplementado en muchos casos por tratamientos de termoterapia
o quimioterapia.
1.2 Cultivo de meristemas
Esta tcnica consiste en aislar el
meristema y sembrarlo en un medio de cultivo adecuado que posibilite el desarrollo de
303
Primordios
foliares
Nudos
3 Meristema apical
El meristema apical incluye las clulas
meristemticas iniciales y sus derivadas inmediatas del pice de la raz o del brote. El nmero de clulas iniciales es variable y pueden
presentarse en una o ms filas.
304
CONCI, Vilma C.
305
306
CONCI, Vilma C.
ladas de focos de contaminacin. Esta etapa se extiende todo el tiempo necesario hasta la obtencin del nmero requerido de individuos para realizar la produccin a nivel
comercial. Si el rea protegida est lo suficientemente alejada de plantas infectadas y se
evita el acceso de los vectores, es posible
mantener las plantas libres de virus por muchos ciclos de cultivo. Son fundamentales los
anlisis peridicos que permitan llevar un registro del estado sanitario del material.
Las plantas libres de virus deben ser multiplicadas bajo condiciones controladas para
evitar su recontaminacin. Una vez rusticadas
y adaptadas nuevamente a las condiciones
ex vitro ellas pueden ser multiplicadas bajo
jaulas antivectores todo el tiempo que se
considere necesario. En esta etapa es importante evitar que las plantas se reinfecten. Es
recomendable la esterilizacin del suelo para
evitar la contaminacin con nematodes y
hongos, que en algunos casos son transmisores de virus. Las jaulas deben estar revestidas de una malla muy fina para evitar la entrada de los vectores. Es recomendable, para
evitar la entrada de los vectores, utilizar una
doble puerta que permita abrir una de las
hojas y recin cuando est cerrada, abrir la
otra. Peridicamente la malla debe ser controlada para detectar inmediatamente la
presencia de roturas que dejen expuestas a
las plantas. A pesar de estos cuidados, es recomendable aplicar insecticidas y mantener
libre de malezas dentro y fuera de la jaula,
ya que las mismas pueden actuar como
reservorios de vectores. Si bien la sanidad del
material introducido a las jaulas debe ser previamente controlada, es conveniente, en esta
etapa, repetir los anlisis para detectar rpidamente la presencia de una infeccin a fin
de eliminarla antes de que se propague. En
estas condiciones es posible mantener como
plantas madres, por mucho tiempo, un
stock de material libre de virus a partir del
cual se pueden hacer las sucesivas multiplicaciones.
La etapa de multiplicacin masiva, o a
gran escala, se realiza a campo en reas ais-
307
308
CONCI, Vilma C.
309
tados negativos mediante DAS-ELISA resultan positivas cuando se prueban por otra
tcnica. Algunas variantes, como ELISA en
membrana de nitrocelulosa o Dot Blot, han
sido empleadas con resultados ms satisfactorios; sin embargo, estas tcnicas por s solas permiten el escape de muchas plantas
infectadas.
310
CONCI, Vilma C.
Figura 4: Fragmentos
amplificados por IC-RTPCR. Lneas 1-4,
segmentos de 489pb
correspondientes a
Onion yellow dwarf
virus; lneas 4-5,
segmentos de 566pb
correspondientes a
Leek yellow stripe
virus; lnea 6, marcador
de peso molecular.
311
11 Lecturas Recomendadas
10 Agradecimientos
312
CONCI, Vilma C.
VIII.-Captulo 6
Produccin de plantas de ajo libres de
virus
Conci, Vilma C.; Cafrune, Eva E.;
Lunello, Pablo; Nome; Sergio; Perotto, Cecilia
1 Introduccin
De los cultivos de Alliaceae, el ajo (Allium
sativum L.) es considerado como una especie valiosa por muchas culturas diferentes.
Adems de su conocida utilizacin en el arte
culinario, hoy es un producto apreciado por
sus beneficios medicinales, especialmente en
Europa y Asia. Algunos de sus productos derivados, poseen actividades biolgicas tales
como antibiticas, antiparasitario, reductores
de riesgo de enfermedades cardiovasculares
y como potenciales agentes anticancergenos.
El ajo es la principal hortaliza exportable
de Argentina desde el punto de vista de la
entrada de divisas, siendo este pas el segundo exportador mundial despus de China.
Las exigencias cada vez mayores del mercado y la aparicin permanente de nuevos competidores obligan a replantear las estrategias
de produccin nacional.
Entre las enfermedades que afectan a
este cultivo, los virus son los responsables de
las mayores prdidas (entre un 20 y 80% de
disminucin en el peso de los bulbos). Las
infecciones son causadas por un complejo
viral que incluye Potyvirus (Onion yellow
dwarf virus, OYDV, y Leek yellow stripe virus, LYSV); Carlavirus (Garlic common latent
virus, GCLV y Shallot lantent virus, SLV), y
Allexivirus (Garlic virus-A, -B, -C, -D, -E, -X,
GarV-A B C- D- E -X; Garlic mite-borne
filamentous virus, GarMbFV). Este conjunto causa un mosaico que si bien no mata la
planta produce una infeccin crnica. Debido a la exclusiva propagacin agmica de
esta especie, la totalidad de las plantas estn infectadas por virus, por lo tanto es evidente la importancia que tiene la obtencin
de propgulo libre de virus como salida de
control. En Argentina se ha detectado la presencia de OYDV y LYSV, GCLV, GarMbFV,
GarV-C y otros Allexivirus todava no caracterizados completamente.
313
jo laminar y con la
ayuda de instrumental estril se procede
a la extraccin del
explanto constituido por el domo ms
1 primordio foliar
(0,3 mm aproximadamente). Luego de
la escisin es rpidamente sembrado
en medio de iniciacin donde se desarrollar una planta
completa (Fig. 1, A).
Las plantas obtenidas son analizadas mediante ISEMD con un antisuero
producido a partir
de plantas de ajo
enfermas con la
mezcla de virus que
naturalmente infectan al cultivo. Aquellas plantas que resultan negativas a
esta prueba son
evaluadas
con
antisueros especficos para OYDV,
LYSV, GCLV, SLV,
GarMbFV y con un
antisuero que detecta fundamentalmente una mezcla
de
diferentes
Allexivirus.
Las
plantas negativas a
todos ellos son
transferidas a un
medio de micropropagacin. En este Figura 1: Produccin de ajo libres de virus. A: planta en medio de iniciacin. B:
medio es posible micropropagacin. C: bulbillos obtenidos in vitro (microbulbillos). D: planta transferida
a tierra y mantenida en cmara hmeda. E: planta adaptada a las condiciones ex vitro.
una tasa de multipli- F: plantas en suelo bajo jaula antifidos. G: multiplicacin a gran escala bajo jaula
cacin de 1:2-1:8 de- antifidos. H: bulbos de ajo libre de virus (arriba) e infectados (abajo).
pendiendo del cultivar (Fig. 1, B).. Esta
tasa vara con el nmero de repiques en el
C) Rusticacin y transplante a tierra bajo
medio de cultivo, siendo baja en los prime- condiciones controladas: despus de varios
ros y aumenta a partir del segundo o tercer ciclos in vitro, muchas plantas bulbifican esrepique, adems se detectaron diferencias pontneamente y otras deben ser inducidas
entre los distintos meristemas.
(Fig. 1, C). Repicando los plantines a un me-
314
CONCI, Vilma C.; CAFRUNE, Eva E.; LUNELLO, Pablo; NOME, Sergio; PEROTTO, Cecilia
Lneas selectas
Termoterapia
Plantas in vitro
Bulbificacin in vitro
(medio de bulbificacin)
Planta in vitro
1 generacin en suelo
(bajo jaula)
(bajo jaula)
(productores, semilleros)
Transferencia a productores
(produccin comercial)
La implementacin de programas
tendientes a la produccin de plantas de ajo libre de virus y el
control de la enfermedad adquiere fundamental importancia ya que han comenzado
a regir en Argentina normativas para la fiscalizacin de semilla de ajo. Estas normas establecen las categoras de Bsica (subcategora
Preinicial, Inicial y Fundacin) Registrada
(subcategora A y B) y Certificada. Cada una
de estas categoras contempla diferentes porcentajes de OYDV. Por ahora slo se controla este virus; sin embargo, con el avance de
los conocimientos respecto del dao que producen el resto de los integrantes del complejo, seguramente algunos otros sern considerados en el futuro.
dio sin hormonas, con alto contenido de sacarosa y luz continua se consigue mejorar el
porcentaje de bulbificacin en algunos clones,
o bien, se obtienen plantas ms robustas que
soportan mejor el transplante a suelo.
Los minibulbillos obtenidos in vitro son
cosechados y sembrados en suelo estril compuesto por una mezcla de tierra/mantillo/
arena (1/1/1). Las plantas que no forman
bulbos son transferidas a suelo y mantenidas en cmara hmeda por un tiempo variable entre 15 y 20 das luego son paulatinamente adaptadas a las condiciones naturales de humedad y temperatura (Fig. 1, D y E).
Las plantas ex vitro son probadas mediante DAS-ELISA para constatar su estado
sanitario y mantenidas bajo jaulas
antivectores. Los bulbos cosechados son conservados en lugar fresco y seco hasta la poca de siembra. Las sucesivas multiplicaciones
se realizan en jaulas donde se contina anali-
4 Lecturas recomendadas
CANAVELLI, A; NOME, S. F. y CONCI, V. C. 1998. Incidencia
de las virosis en ajo Rosado Paraguayo. Fitopatologa
Brasilera 23 (3): 354-358.
315
316
CONCI, Vilma C.; CAFRUNE, Eva E.; LUNELLO, Pablo; NOME, Sergio; PEROTTO, Cecilia
VIII.-Captulo 7
Plantas ctricas libres de enfermedades
Costa, Norma; Plata, Mara Ins;
Anderson, Catalina
1 Introduccin
Para competir en un mercado citrcola
globalizado se necesita de la mxima eficiencia en todas las fases de la produccin. Para
lograrlo es primordial partir con material de
excelencia desde el vivero. La planta es el primer escaln para iniciar una citricultura
exitosa.
Las exigencias de calidad en los ctricos
producidos en los viveros comerciales de todo
el pas aumentan da a da. El material de
multiplicacin para la produccin de plantas
de vivero debe provenir de un origen cierto y
certificado. El citricultor espera que la planta
que pondr en sus explotaciones tenga un
porte adecuado, un sistema radicular desarrollado y la garanta sanitaria y varietal correspondiente para obtener una produccin
rentable y duradera.
Las enfermedades producidas por virus,
viroides y otros organismos similares producen importantes prdidas econmicas en los
ctricos de todo el mundo. Algunas enfermedades provocan la muerte de las plantas y
otras disminuyen la produccin y la calidad
de la fruta, causando prdida de vigor y de
longevidad de la planta.
Algunas de las principales enfermedades
causadas por este tipo de microorganismos
son la psorosis, tristeza, exocortis y
cachexia. Estas enfermedades se han extendido debido a la propagacin vegetativa de
material infectado. Es normal encontrar varias virosis en una misma planta y en muchos
pases como la Argentina casi la totalidad de
las plantas adultas estn afectadas por alguna virosis.
La psorosis y otras enfermedades se
transmiten mediante el injerto de yemas.
Una vez hecho el injerto, la planta puede
permanecer con la enfermedad latente durante muchos aos. Las yemas que se extraigan de una planta con enfermedad latente
originarn plantas enfermas.
317
gramas de Mejoramiento. Una vez obtenida esta planta candidata a planta madre,
es sometida a termoterapia y cultivo de tejidos empleando la tcnica de microinjerto
de pices caulinares in vitro.
Esta tcnica comprende las siguientes etapas: preparacin del portainjerto, preparacin del pice, injerto, cultivo de plantas injertadas e injerto sobre un plantn vigoroso.
Las plantas obtenidas por microinjerto no
presentan caracteres juveniles y en las mismas no se han observado anormalidades con
respecto a la planta madre.
El xito de la tcnica depende del tamao del tejido extrado (0.1-0.2 mm) y del patgeno que se quiera eliminar. En el caso de
exocortis, tristeza y cachexia, el porcentaje
de plantas libres es superior al 90%. El ms
Tabla 2: Pruebas de Diagnstico para Plantas Madres
Enfermedad
Metodologa
Duracin
Tristeza
Inmunoimpresin ELISA
Plantas indicadoras
ELISA DAS
4h
12 meses
48 h
Psorosis
Plantas indicadoras
ELISA TAS
12 meses
48 h
Exocortis
Plantas indicadoras
Hibridacin Molecular
Electroforesis
12-24
meses
3 meses
3 meses
6 aos
Cachexia-xiloporosis
Plantas indicadoras
Hibridacin Molecular
Electroforesis
12 meses
3 meses
3 meses
6 aos
CVC
ELISA DAS
48 hs
6 aos
Cancrosis
10 das
7 das
7 das
48 hs
1 ao
318
1 ao
3 aos
VIII.-Captulo 8
Certificacin sanitaria de especies
frutales de Prunus
Docampo, Delia M.
1 Introduccin
Monitoreos realizados en especies frutales del gnero Prunus (durazneros, ciruelos,
cerezos, guindos) del rea frutcola templada (provincias de Mendoza, Crdoba y Buenos Aires) evidenciaron el deterioro de la condicin sanitaria de las plantaciones en produccin y de propagacin. Los anlisis pusieron de manifiesto que una de cada cuatro
plantas analizadas se encontraba infectada
por uno o ms virus.
Varios factores han sido decisivos para la
distribucin de estos patgenos. La carencia
de controles sanitarios, la ineficacia de los
mtodos usados en los anlisis, su dispersin
por vectores y la diseminacin de materiales
infectados a larga distancia, por el hombre a
travs de la comercializacin.
Un Sistema de Certificacin Sanitaria de
Plantas Perennes se fundamenta en producir el nmero de plantas requeridas por el
mercado a partir de una Planta Inicial. El Sistema contempla cuatro etapas bsicas: 1)
Eleccin de la Planta Inicial (selecta de variedades y de portainjertos) seleccionada sobre
la base de sus caracteres agronmicos deseables, por su pureza varietal (deben coincidir
con los Descriptores del Registro Nacional de
Cultivares) y su estado sanitario, (analizado
por las tcnicas ms rigurosas establecidas en
el Sistema de Certificacin). Constituye el
material fundacional de un Sistema de Certificacin del cual derivar todo el material certificado; 2) Establecimiento de un Monte Fundacin. Constituido generalmente por tres
plantas de cada cultivar (de variedad y de
cada portainjerto) obtenidas por propagacin agmica de la Planta Inicial. Constituye
un monte de reserva y es donante de materiales de propagacin; 3) Organizacin de un
monte de Plantas de Base que deber mantener al menos diez plantas por cultivar y/o
portainjerto como plantas madres de la
propagacin, sometidas a rigurosos contro-
319
MICROPROPAGACIN
Seccionado de yemas
CONTROL SANITARIO
Estaca de planta
seleccionada enraizada
a a1a2a3a4a5a6
a: explanto inicial
a1, a2, ... a6: clon
CONTROL SANITARIO
Toma de muestras
abcdefghij
Termoterapia
MICROPROPAGACIN
Clones libres
Yema tratada
Seccionado de brotes
Desinfeccin superficial
pice caulinar
Remocin de hojas
sembrado. 4.- Los meristemas generarn yemas (un yemario), en general, entre las 6 y
12 semanas de implantado. 5.- Repicar las
yemas del yemario. La propagacin de cada
meristema se deber identificar con una sigla, de manera que cada pice caulinar d
origen a un clon (una lnea de descendencia). 6.- Control sanitario. Antes de la tercera multiplicacin debern tomarse al menos
3 plantas de cada clon para realizar el anlisis de los patgenos que se estableci eliminar. Las plntulas seleccionadas debern permanecer destapadas por al menos una semana, fuera de la cmara de cultivo, bajo luz,
temperatura y humedad relativa controladas
a fin de dar oportunidad a el o los patgenos,
si los hubiera, de incrementar su poblacin
lo cual facilitar su deteccin. El control sanitario deber realizarse en plantas leosas y
320
DOCAMPO, Delia M.
321
5 Lecturas recomendadas
CHANG, T.T. 1988. The case for large collections. En: The
use of plantgenetic resources (A.H.D. Brown, O.H.
Frankel, D.R. Marshall y J.T. Williams, eds.). Cambridge
University Press, Reino Unido. p. 123-35.
322
DOCAMPO, Delia M.
VIII.-Captulo 9
Biotecnologa aplicada al control de
enfermedades fngicas y bacterianas
Zappacosta, Diego
1 Introduccin
Desde la domesticacin de las plantas por
el hombre las enfermedades han causado
enormes prdidas en la produccin. El uso
intensivo de monocultivos con baja diversidad gentica en la agricultura moderna ha
redundado en una elevada susceptibilidad a
algunas enfermedades y en un incremento
de la agresividad de algunos patgenos. Con
excepcin de las enfermedades epidmicas,
que llegan a destruir cultivos completos, se
estima que las prdidas ocasionadas por
patgenos en el plano mundial representan
un 12% del potencial de produccin, teniendo mayor incidencia en hortalizas, frutales y
arroz. Adems de causar prdidas en la produccin, algunos patgenos tambin reducen la calidad de los alimentos, como es el
caso de algunas especies de Fusarium y
Aspergillus, que dejan en los tejidos infectados toxinas que afectan la salud humana
y animal.
Existen varias formas de controlar las
enfermedades, entre los que podemos mencionar: a) las prcticas culturales, como la rotacin, la sanidad del material inicial, el control de restos vegetales, etc., b) la aplicacin
de agroqumicos y c) la resistencia gentica.
Aunque las tres alternativas son utilizadas,
la ltima, por su mejor implementacin y
menor impacto ambiental, es una de las
mejores opciones. Es frecuente, sin embargo, encontrar inconvenientes para su aplicacin, tales como la falta de genes de resistencia, la rpida evolucin de nuevas razas
virulentas del patgeno, etctera.
La incorporacin de genes de resistencia es uno de los mayores desafos para los
mejoradores durante el desarrollo de nuevos cultivares. Tradicionalmente se ha llevado a cabo a travs de mtodos convencionales de mejoramiento, que involucran seleccin y evaluacin de grandes poblaciones
derivadas de cruzamientos entre materiales
323
324
ZAPPACOSTA, Diego
325
326
ZAPPACOSTA, Diego
ducto del metabolismo secundario) o fortalecen las defensas estructurales (por ejemplo
fortificacin de la pared celular). Algunas respuestas normales de resistencia son relativamente lentas, detectndose, en algunos casos la expresin 48 hs luego de la infeccin
(Fig. 2).
En el caso de plantas transgnicas la idea
sera lograr expresin temprana o
sobreexpresin del producto, generalmente a travs de promotores constitutivos. Otros genes interesantes
son aquellos que participan en las vas
de induccin de los mecanismos naturales de resistencia. Recientemente, la clonacin de numerosos genes
R (de resistencia) ha precipitado el
inters en el uso de estos genes para
obtener resistencias de amplio espectro.
Las principales estrategias de control de enfermedades fngicas mediante el uso de plantas transgnicas
pueden ser agrupadas en cinco categoras (Punja, 2001):
Expresin de productos
gnicos que son directamente txicos para los patgenos o que reducen su crecimiento. Incluyen protenas relacionadas a la patognesis (proFigura 2: Tiempo relativo de induccin de las principales defensas
contra patgenos fngicos (modificado de Kombrink y Somssich, tenas PR), como enzimas hidrolticas
(quitinasas, 1,3--glucanasas), prote1995).
nas antifngicas (osmotinas y tauel ataque de microorganismos y son reco- matinas), pptidos antimicrobianos (tioninas,
mendados como una lectura accesoria al defensinas, lectinas), protenas de transfematerial que sigue a continuacin (Kombrink rencia de lpidos (LPT), protenas inactivay Somssich, 1995; Durand-Tardif y Pelletier, doras de riboso-mas 28S rRNA fngicos (RIP)
2003).
y fitoalexinas.
Expresin de productos gnicos que
3.1 Resistencia a hongos fitopatgenos
destruyen o neutralizan componentes de
La seleccin de genes de resistencia para ataque del patgeno. Por ejemplo:
ser introducidos en plantas por tecnologa inhibidores de poligalacturonasas (enzimas
gnica se basa, en parte, en la evaluacin de que degradan algunos componentes de la
la toxicidad de productos gnicos sobre el pared celular vegetal), cido oxlico o lipasas.
crecimiento y desarrollo de los patgenos in
Expresin de productos gnicos que
vitro y del rol del gen en las respuestas de mejoran las defensas estructurales de la
resistencia. Muchos productos gnicos per- planta. Consiste en la elevacin de los nivetenecen al grupo de las protenas relaciona- les de ligninas y peroxidasas asociadas a la
das a la patognesis (van Loon, 1999), mien- pared celular.
tras que otras pertenecen a las vas
Expresin de productos gnicos que
biosintticas de las fitoalexinas (compuestos participan en las vas de seales que reguantimicrobianos de bajo peso molecular pro- lan las defensas. Incluyen la produccin de
Biotecnologa y Mejoramiento Vegetal
327
328
ZAPPACOSTA, Diego
hospedador-patgeno. En plantas transgnicas se ha demostrado que la sobreexpresin de genes que participan en la sntesis
de ciertas fitoalexinas como el resveratrol y
la medicarpina resulta en una demora en el
desarrollo de la enfermedad y en la aparicin
de los sntomas producidos por varios
patgenos en distintas especies vegetales.
Sin embargo, hay que tener en cuenta que
las fitoalexinas son potencialmente txicas
para los animales y tienden a no ser especficas en su accin, por lo tanto es necesario
realizar ms evaluaciones de los riesgos potenciales de su utilizacin, adems de las relacionadas con sus caractersticas de conferir
resistencia a enfermedades (Essenberg,
2001).
3.5 Compuestos que mejoran las
defensas estructurales de la planta
La pared celular vegetal es una barrera
que los patgenos tienen que superar en su
ataque y lo logran a travs de enzimas que
la degradan (como las poligalacturonasas) o
mediante la accin de toxinas. Se han diseado plantas transgnicas que expresan
inhibidores de poligalacturonasas, pero los
resultados por el momento no son concluyentes. Otra estrategia considerada ha sido
la sobreexpresin de peroxidasas, enzimas
que participan en la lignificacin de la pared
celular. La lignificacin alrededor de los sitios
de infeccin es un mecanismo natural que
presentan las plantas para restringir el ataque de patgenos. Mediante esta estrategia se logr un aumento en los niveles de
lignina de la planta, que no brind, sin embargo, una mejora en la resistencia a enfermedades en varios sistemas hospedadorpatgeno estudiados.
Una opcin ms reciente es la expresin
de enzimas que degradan toxinas fngicas,
como la expresin en tabaco de una enzima
degradadora de tricotecenos de Fusarium
sporotrichloide, que reduce el dao a los tejidos y mejora la emergencia de plntulas en
presencia de la toxina. La inactivacin de factores de virulencia especficos por productos
gnicos expresados en plantas transgnicas
es una estrategia promisoria para reducir el
desarrollo de patgenos especficos.
3.6 Elicitores
Las vas de seales que coordinan las respuestas de defensa en las plantas, que incluyen la reaccin de hipersensibilidad (RH), la
produccin de protenas PR y de fitoalexinas,
pueden ser activadas por molculas llamadas
elicitores. La induccin de RH y necrosis, que
resulta en la activacin de respuestas de defensa, podra resultar en una induccin de
resistencia a un amplio espectro de enfermedades. El uso de estas estrategias requerira,
sin embargo, de la cuidadosa manipulacin
de vas metablicas complejas, cuya alteracin podra tener efectos secundarios no
deseables sobre otros caracteres del cultivo,
ya que intervienen en varios procesos vegetales. Mediante el uso de plantas
transgnicas se han disectado genticamente muchas de estas vas, identificndose muchos de los compuestos intervinientes en las
respuestas de defensa a patgenos.
El perxido de hidrgeno (H2O2) inhibe el
crecimiento de patgenos y activa ciertas vas
de trasmisin de seales que inducen respuestas de defensa. La expresin de niveles
elevados de H2O2 en plantas transgnicas a
travs de la expresin de la glucosa oxidasa
reduce los efectos causados por patgenos
como
Rhizoctonia,
Verticillium,
Phytophthora y Alternaria en varias especies cultivadas. Hay que tener en cuenta, sin
embargo, que niveles elevados de H2O2 son
fitotxicos.
Otros activadores de defensas son el cido saliclico, el etileno y el cido jasmnico.
La manipulacin de los niveles de cido
saliclico en plantas transgnicas tiene un gran
potencial para mejorar la resistencia a enfermedades, ya que no slo inducen la expresin de protenas PR, sino tambin la de
otros productos de defensa, los cuales, en
conjunto, han demostrado tener una
interaccin sinrgica y conferir elevados niveles de resistencia (Lawton, 1997).
3.7 Genes R
Estos genes son los ms utilizados en
mejoramiento convencional ya que son determinantes simples de una resistencia efectiva y especfica. En su mayora, los productos de estos genes actan reconociendo in-
329
330
ZAPPACOSTA, Diego
331
332
ZAPPACOSTA, Diego
333
334
ZAPPACOSTA, Diego
PARTE IX
Bioseguridad y regulacin de
organismos vegetales
genticamente modificados
(OVGM)
373
374
RUBINSTEIN, Clara
IX.-Captulo I
Criterios cientficos para la evaluacin
de la bioseguridad de organismos
genticamente modificados.
Rubinstein, Clara
375
376
RUBINSTEIN, Clara
377
378
evala la seguridad de la/s protena/s resultantes. Si bien esta evaluacin la deben realizar los obtentores previamente a la transformacin , ya que no ser aprobado un cultivo que pueda presentar algn problema
toxicolgico o de alergenicidad, las agencias
regulatorias encargadas del control de estos
productos efectan un exhaustivo anlisis de
seguridad de los genes insertados y sus productos de expresin.
b) en el cultivo o alimento como un
todo: sobre el cultivo GM, se analizan los rasgos fenotpicos / agronmicos y la composicin y se los compara con los de sus contrapartes no-GM o convencionales. Las diferencias encontradas, sean intencionales o no, se
convierten en el centro de ulteriores evaluaciones de seguridad. El objetivo de estas
evaluaciones es demostrar que el cultivo o
alimento GM es tan seguro como el alimento tradicional conocido, independientemente de su grado de equivalencia (Figura 2).
a. El rasgo introducido:
Para caracterizar el gen introducido se
requiere conocer la secuencia completa del
inserto o insertos, el nmero de copias y su
estabilidad a lo largo de varias generaciones.
La seguridad (o inocuidad) de la/s protena/s producidas por el inserto se evala
basndose en informacin relativa a su fuente de origen (el organismo donante, historial de uso seguro, etc.), su estructura (secuencia de aminocidos, cambios postraduccionales, incluso su estructura
tridimensional), su funcin / especificidad /
modo de accin, su expresin en diferentes
tejidos de la planta, su toxicidad aguda, su
potencial de alergenicidad, su digestibilidad
in vitro y su estabilidad al procesamiento,
que son indicadores de esta potencialidad.
Se utiliza la toxicidad aguda determinada en ensayos estndares en ratones por va
oral, ya que la gran mayora de las protenas ejercen sus efectos txicos por esta va,
fundamentalmente debido a su naturaleza
(que hace que se degraden rpidamente en
el tracto intestinal). Para detectar otros efectos que podran dejar fuera a algunos casos
especiales, se realizan estudios de alimentacin en animales y toxicolgicos
subcrnicos (en general, estudios de 90 das
en rata, cuando se considera justificado por
RUBINSTEIN, Clara
b) El cultivo o alimento
GM:
Sobre la base de los 50 aos de experiencia ganada en mejoramiento tradicional
(breeding), y evaluacin de seguridad de
otros productos como medicamentos, alimentos, y qumicos, las agencias internacionales recomiendan comparar los siguientes
parmetros de los OGM respecto de contrapartes convencionales, para poder contar
con suficiente informacin que permita arribar a una certeza razonable de inocuidad:
- Parmetros fenotpicos: La caracterizacin fenotpica/agronmica del cultivo GM se
hace tempranamente durante el proceso de
seleccin. Los puntos evaluados ( por ej. morfologa, rendimiento) son muy sensibles a los
cambios genticos y a las perturbaciones desfavorables en el metabolismo, por lo tanto
son buenos indicadores de equivalencias entre el cultivo modificado y su contraparte tradicional.
Se observan y miden cuidadosamente las
caractersticas morfolgicas, fisiolgicas, y
reproductivas, la resistencia o susceptibilidad
a plagas y enfermedades, e incluso caractersticas como perfume o sabor de los frutos.
Este proceso, que dirige la seleccin de aque-
379
380
RUBINSTEIN, Clara
381
382
RUBINSTEIN, Clara
383
GM), debido a la variabilidad natural. Esta variabilidad, hace muy difcil en estos momentos poder interpretar de manera clara muchos de los resultados que se obtienen, y su
significacin biolgica real, para poder sacar
conclusiones en cuanto a su relevancia en la
bioseguridad.
Sin embargo, en un futuro cercano, y a
medida que se avanza en el conocimiento
de los sistemas biolgicos, ser posible aplicar nuevas tecnologas a la evaluacin de la
seguridad alimentaria, no slo de OGMs sino
de cualquier alimento.
Conclusin
El objetivo del anlisis de riesgos para organismos y/o alimentos derivados del uso de
la ingeniera gentica (GM) es estimar el impacto que los efectos intencionales y los no
intencionales de la modificacin, pudieran
tener sobre la inocuidad del alimento o del
organismo GM, o sobre su impacto ambiental.
El enfoque utilizado para aplicar este proceso (el enfoque comparativo) ha sido
consensuado a partir de consultas y discusiones en el plano internacional, y se basa en la
comparacin de parmetros como composicin, txicos naturales o aptitud nutricional,
con la contraparte convencional que tiene
historia de uso seguro y es aceptado como
alimento inocuo (OECD, 2000).
Lecturas sugeridas :
Agbios.com: http://www.agbios.com
Agricultural Biotechnology: Informing the Dialogue.
College of Agriculture and Life Sciences, Cornell
University, 2002 . www.nysaes.cornell.edu/agibiotech
ANZFA (2000) GM Foods and the Consumer. Australia
New Zealand Food Authoritys Safety Assessment Process
For
Genetically
Modified
Foods.
http://
www.anzfa.gov.au/documents/pub02_00.pdf
ASTWOOD JD, LEACH JN, FUCHS RL (1996) Stability of
food allergens to digestion in vitro. Nature Biotechnol
14:1269-1273
BENEFITS ASSESSMENT, 2001. Revised BT Crops
Assessment. EPA.
www.epa.gov/pesticides/biopesticides/otherdocs/
bt_reassess/6-Benefits.pdf
BENEFITS AND CONCERNS ASSOCIATED WITH
RECOMBINANT DNA BIOTECHNOLOGY-DERIVED FOODS.
(2000). Food Technology 54 (10): 61-80 (published by
the Institute of Food Technologists- IFT).
384
RUBINSTEIN, Clara
385
IX.- Capitulo 2
Bioseguridad de Organismos
Genticamente Modificados - Marcos
Regulatorios
Dr Burachik, Moiss
1. Panorama Internacional
Desde 1986, algunos pases como Japn,
por ejemplo, se han ocupado de elaborar y
desarrollar regulaciones para controlar la
entrada en el mercado de productos derivados del uso de tcnicas de ADN recombinante. En ese momento el foco estaba
puesto en los ingredientes o aditivos
alimentarios producidos por microorganismos recombinantes, pero a medida
que la tecnologa avanzaba y se aplicaba a
otros organismos, estas reglamentaciones se
vieron extendidas a plantas y animales modificados.
Numerosos pases en los cinco continentes, tienen en este momento un marco
regulatorio disponible para la evaluacin y
aprobacin de OGMs antes de su entrada
en el mercado.
Entre los primeros pases que han desarrollado estos procesos, se encuentran los
pases europeos, siendo la Comisin Europea,
el rgano de evaluacin y control de la Unin
Europea. En los Estados Unidos, diferentes
agencias estn involucradas en estas evaluaciones: la Agencia de Alimentos y Drogas
(FDA), la Agencia para la Proteccin del Medio Ambiente (EPA) y el Departamento de
Agricultura (USDA). Canad y Australia-Nueva Zelanda, han establecido sus sistemas
regulatorios ms recientemente (a partir de
1993).
En cuanto a Amrica Latina, Argentina
fue el pas pionero en esta materia, con la
creacin de CONABIA en 1991, en el mbito
de la Secretara de Agricultura, Ganadera,
Pesca y Alimentacin (ver ms adelante). Es
importante notar que despus de los EEUU,
Argentina es el pas con mayor grado de
adopcin de cultivos agrobiotecnolgicos,
seguido por Canad.
387
388
BURACHIK, Moiss
389
Esta definicin hace referencia al mtodo de obtencin del OGM, con el propsito
de establecer el campo de aplicacin de la
norma, excluyendo, por ejemplo, los cruzamientos tradicionales. Sin embargo, en el
anlisis del riesgo de la liberacin de un
OGM, la caracterstica dominante, esto es,
aquella que constituye el foco del anlisis de
la Comisin, es el inserto, esto es, la porcin
de DNA efectivamente presente en el
genoma transformado, cuya naturaleza y
consecuencias (geno- y fenotpicas) caracterizan al OGM como tal.
Al OGM o conjunto de OGMs con un
dado inserto se los denomina colectivamente evento. Varios OGMs pueden contener el mismo evento, y por lo tanto sus anlisis de riesgo sern equivalentes. Ocasionalmente, en etapas tempranas del desarrollo
de un OGM, se admite que el evento puede
no estar inequvocamente caracterizado, en
el sentido de que no se ha definido el inserto con la debida precisin (por ejemplo, el
inserto puede estar en diferentes posiciones
en el genoma del vegetal). En estos casos, el
anlisis se enfoca en la construccin gentica
utilizada en la transformacin.
Definimos como transformacin, el mtodo utilizado para introducir la nueva informacin gentica, vehiculizada por el
vector.
Si bien la normativa argentina atiende
aspectos del proceso de obtencin de un
OGM en el anlisis de riesgo, esa atencin
slo se enfoca en aquellas caractersticas
que interesan en la evaluacin del producto (y no del proceso de su obtencin), en el
sentido de que esas caractersticas se encontrarn finalmente en el OGM obtenido.
Otra caracterstica del marco regulatorio
administrado por la CONABIA es que considera cada producto o liberacin caso por
caso. Si bien los antecedentes (si los hubiera) se tienen en cuenta, y los casos similares
son identificados y considerados como objetos de informacin vlida para la evaluacin,
los datos no son transferibles, y cada caso
y/o solicitante deben ser coherentes y
autosuficientes en cuanto a la informacin
que provee a la Comisin. La definicin de
caso es entonces relevante. Un caso est
definido por:
390
BURACHIK, Moiss
La CONABIA es una Comisin multisectorial, formada por miembros de los sectores pblico y privado. Su Coordinacin Tcnica est a cargo de tres profesionales que
pertenecen al sector pblico (vase la Tabla).
Dada las caractersticas de esta composicin,
la operatoria de la Comisin hace especial
La CONABIA no interviene en las etapas
nfasis en mantener una elevada tica de
ulteriores (aprobacin alimentaria, dictamen transparencia, evitando rigurosamente la
sobre el impacto en las exportaciones y re- posible interferencia de conflictos de interegistro, para la comercializacin) del camino ses. Para ello, los miembros deben declarar
de una planta GM hacia el mercado (Ver Fi- la existencia y naturaleza de sus intereses,
gura 1). Sin embargo, emite un dictamen sean ellos comerciales o cientficos, y excluirparticular fundado sobre la bioseguridad de se totalmente de la discusin de solicitudes
la produccin masiva a escala comercial del de liberacin de OGMs que provengan de las
cultivo en cuestin. De este modo, la empresas o institutos a los que estn vinculados.
Fase I
La Comisin es profesioliberacin
nalmente
multidisciplinaria,
experimental
los
criterios
para la toma de
CONABIA
Informacin
Solicitantes
decisiones
son
exclusivamenrequerida
te tcnicos y el principio bFase II
sico que rige esas decisiones,
SENASA
liberacin
(seguridad
alimentaria)
Aprobacin
que se toman por consenso,
extensiva
o Rechazo
/comercial
es la bioseguridad.
En los documentos que
presentan
a la CONABIA, los
Secretario de
Direccin de Mercados
Dictmenes
solicitantes de autorizaciones
Agricultura
Internacionales
fundamentados
de ensayos tienen la opcin
de hacer reserva de informacin que consideren confidenEvaluacin del OGM a tres niveles
cial. La informacin as considerada, ser examinada por
FIGURA 1: el sistema de regulacin y aprobacin de OGMs en Argentina
solamente uno de los miem-
391
392
BURACHIK, Moiss
En ensayos a campo: distancias, tiempos de floracin, jaulas, cobertura para evitar la diseminacin del polen, por viento o
insectos, control de vectores potenciales de
polen u otro material con capacidad de propagacin, etc.
En ensayos en laboratorio o invernadero: mtodos o estructuras de contencin
contra el ingreso de vectores potenciales de
material gentico.
b) En los movimientos de materiales:
semillas, material vegetal acompaante, as
como los lugares, normas e identificacin del
material que sea almacenado.
c) En lo relacionado con el destino del
material cosechado: el solicitante deber
informar sobre su utilizacin, aclarando si ser
local o si ser exportado o destrudo, e identificando los lugares de su almacenaje final o
transitorio.
d) En lo relacionado con la disposicin
final (OGM y materiales remanentes): se requiere informacin sobre el tratamiento del
suelo post-cosecha, el uso futuro del terreno, los controles posteriores (deteccin de
plantas voluntarias) y su duracin.
e) En el caso de un eventual escape del
OGM y/o de cualquier material asociado:
El solicitante debe exponer con claridad los
procedimientos que seguir en el caso de un
eventual escape del OGM y/o de cualquier
material asociado. Normalmente, esto incluye mtodos de identificacin del OGM, procedimientos para limitar y controlar el escape, as como la obligacin de notificar
perentoriamente a la autoridad regulatoria.
f) Tcnicas que se usarn para detectar
la transferencia de genes desde el OGM al
ambiente bitico.
g) Usos previstos del terreno con posterioridad a la liberacin solicitada. Control
posterior de la parcela, duracin de los controles post-cosecha.
Una vez completados los ensayos, es requisito indispensable para poder acceder a
nuevas autorizaciones, la entrega de un Informe de Cierre de la Liberacin, que incluye observaciones relativas al comportamiento agronmico del OVGM en cuanto a
germinacin, crecimiento vegetativo, floracin, susceptibilidad a enfermedades y plagas, as como efectos sobre organismos no
393
Cmara de Productos de
Sanidad Agropecuaria y Fertilizantes
394
Caracterizacin
del
OVGM, incluyendo protenas y/o RNAs que
expresa el OGM originados en el inserto y el
fenotipo que resulta de esa expresin; las
ventajas aportadas por la modificacin
gentica; resultados de los ensayos de campo realizados, en el pas y en el extranjero,
en lo que respecta a la bioseguridad .
Una declaracin de equivalencia, diferencia o no equivalencia del OVGM. El
solicitante declarar aqu si el OVGM es equivalente al organismo no GM de la misma especie, excepto por el fenotipo aportado por
la modificacin gentica introducida. La declaracin se referir a todas aquellas caractersticas del OVGM que no fue intencin modificar en el evento. Se deben citar los trabajos que sostienen esta declaracin. La equi-
BURACHIK, Moiss
395
396
BURACHIK, Moiss
Pas
Maz
Argentina
-Maz resistente a
-Soja tolerante al
lepidpteros (evento Bt herbicida glifosato
176)
-Maz tolerante al
herbicida glufosinato de
amonio
-Maz resistente a
lepidpteros (evento
MON 810)
-Maz resistente a
lepidpteros (evento Bt
11)
-Maz tolerante a glifosato (evento Nk603)
Soja
Algodn
Otros
-Algodn resistente
a lepidpteros
-Algodn tolerante
al herbicida glifosato
-Soja tolerante al
herbicida glifosato
Brasil*
-Algodn resistente
a lepidpteros
Colombia
Clavel azul
-Algodn tolerante al
herbicida glifosato
Honduras
-Maz resistente a
lepidpteros
Mxico**
-Maz resistente a
lepidpteros
-Soja tolerante al
herbicida glifosato
-Maz resistente a
coleptero
-Maz tolerante a
herbicidas
Uruguay
Papa resistente a
escarabajo de la
papa y virus Y
-Algodn tolerante (New leaf Y)
al herbicida glifosato Tomate de maduracin retrasada.
(TH)
Canola tolerante
-Algodn RLxTH
(evento combinado) a herbicidas
-Algodn resistente
a lepidpteros (RL)
-Maz resistente a
-Soja tolerante al
lepidpteros (MON 810) herbicida glifosato
397
398
BURACHIK, Moiss
IX.-Captulo 3
Flujo gnico mediado por polen y su
posible impacto ambiental
Poverene, Mnica; Ureta, Soledad
El flujo de genes es un proceso biolgico
natural. Puede ocurrir flujo mediado por polen entre plantas de la misma especie o de
especies relacionadas y depende del modo
de polinizacin y la compatibilidad gentica
entre la planta receptora y la dadora de polen. Tambin puede ocurrir flujo gnico por
movimiento de semillas o de otras partes
vegetales hacia poblaciones sexualmente
compatibles. Los agricultores pueden adoptar prcticas de manejo para minimizar y controlar este flujo.
1. Flujo gnico y riesgo de escape de
transgenes al ambiente
El flujo gnico es el proceso de incorporacin de genes de una poblacin dentro de
otra. En plantas, donde el concepto de especie es frecuentemente puesto a prueba, el
intercambio de material gentico ocurre entre individuos formalmente considerados
una especie o entre especies relacionadas.
El flujo gnico tiene lugar a travs de la migracin de polen o semillas, dispersados por
viento, agua o la accin de animales y el hombre. En el contexto de la agricultura, el intercambio de genes entre plantas y poblaciones es un proceso bien conocido en todos
los cultivos mejorados por tcnicas tradicionales o mediante ADN recombinante y en
las plantas silvestres relacionadas con ellos.
El flujo gnico es un poderoso mecanismo
para prevenir la diversificacin de las poblaciones, pero tambin para permitir la difusin de mutaciones favorables (Rieseberg y
Burke, 2001).
La utilizacin de cultivos transgnicos
plantea la posibilidad de que el flujo de
transgenes hacia otras poblaciones (escape
al ambiente) represente un riesgo para los
ecosistemas, dependiendo de las caractersticas que aporten y sus efectos sobre la poblacin receptora. Se denomina escape a la
399
de un transgen que confiere resistencia a virus y su descendencia puede heredar una, dos
o las tres copias del gen (Spencer y Snow,
2001). Normalmente, el carcter conferido se
expresa como dominante y aun cuando no
se conozca exactamente el nmero de copias de un transgen en un genoma, la probabilidad de transmisin a travs del polen
mediante el proceso normal de meiosis, es
de al menos 50%. En especies algamas o
parcialmente algamas, la difusin del
transgen hacia variedades no transgnicas
de la misma especie depender exclusivamente de los mecanismos de polinizacin,
generalmente por el viento (anemfila) o
los insectos (entomfila).
En la mayor parte de los cultivos se conocen las distancias mnimas de aislamiento necesarias para prevenir la polinizacin
cruzada entre variedades. Estas constituyen
la base para determinar las medidas de
bioseguridad que se exigirn en cada caso
durante la fase de liberacin experimental.
Una vez aprobado el cultivo para su siembra
a escala comercial, esas distancias no son
necesariamente aplicadas en la prctica
agronmica. La cuestin queda en manos de
los agricultores y depende de los intereses
econmicos que para ellos represente la
comercializacin de un cultivo transgnico,
tradicional u orgnico. Un ejemplo de conflicto se dio en 1998 en Canad, donde se
registraron denuncias de contaminacin de
lotes de colza tradicional con polen de colza
GM, posiblemente provenientes de lotes cercanos o de plantas subespontneas, escapadas de los cultivos (http://news.bbc.co.uk/
go/pr/fr/-/2/hi/science/nature/
3116713.stm).
En lugares donde se ha autorizado la
siembra de cultivos transgnicos, stos
pueden coexistir con cultivos tradicionales
u orgnicos, lo que requiere medidas adecuadas durante el cultivo, cosecha, transporte y almacenamiento, a fin de evitar la
mezcla accidental de materiales GM y no
GM, que puede tener consecuencias econmicas para productores que comercialicen productos no transgnicos. Las recomendaciones tendientes a evitarla consisten
en: 1. Medidas a tomar dentro del establecimiento, como respetar las distancias de aislamiento, colocar barreras a la dispersin del
polen, o intercalar lotes con cultivo de una
400
especie distinta. 2. Cooperacin entre establecimientos vecinos sobre planes de siembra, o uso de variedades con tiempo de floracin diferente. 3. Utilizar los servicios de
extensin para informar a los productores,
monitoreo, intercambio de informacin tcnica y servicios de alarma.
La modificacin gentica en plantas ha
sido exitosa en ms de 20 familias botnicas
diferentes, comprendiendo cereales,
oleaginosas, forrajeras, especies hortcolas,
frutales, forestales y ornamentales
(www.agbios.com). La mayor parte de las
especies domesticadas como cultivos posee parientes silvestres, los que frecuentemente se utilizan como donantes de caracteres tiles para el mejoramiento
gentico, tales como resistencia a estreses
biticos y abiticos. Esto implica que entre la
especie domesticada y la silvestre existe suficiente relacin gentica como para transferir
esos caracteres mediante cruzamientos y seleccin. Los cruzamientos ocurren naturalmente en regiones donde las especies conviven y muchas malezas han evolucionado a
travs de la adquisicin de genes de los cultivos (Keeler, 1989; Ellstrand y col., 1999). Es
posible que un transgen sea transferido de
un cultivo GM hacia poblaciones silvestres
o malezas relacionadas. Los transgenes que
confieren tolerancia a herbicidas, resistencia
a insectos o a patgenos podran conferir las
mismas caractersticas a plantas silvestres relacionadas en la vecindad, determinando una
mayor supervivencia bajo la presin de seleccin natural (insectos herbvoros o
patgenos) o de prcticas agronmicas usuales para el control de malezas, plagas o enfermedades (uso de pesticidas, agentes de
control biolgico). En consecuencia, aumentara el nmero o tamao de las poblaciones
silvestres. El concepto de supermaleza ha
surgido como consecuencia de reconocer la
dificultad que implicara el control de esas
poblaciones. El potencial impacto ambiental depende tanto de la probabilidad de
transferencia del transgen a la poblacin
silvestre como de la consecuencia de esa
transferencia (Ahl Goy y Duesing, 1996).
Segn la probabilidad de transferencia, los
cultivos pueden clasificarse en tres grupos:
I. Mnima probabilidad de transferencia a
especies silvestres, sea porque stas no exis-
401
402
403
404
el cultivo. Por el contrario, puede representar un costo para la planta que lo adquiera
debido a efectos pleiotrpicos sobre otros
caracteres fenotpicos que a su vez afecten
la aptitud. El beneficio de un transgen asociado a la resistencia a determinada plaga
debe ser evaluado comparando la aptitud
biolgica de plantas con el transgen y sin l
que hayan sido expuestas a esa plaga. Por el
contrario, el costo de adquirir el transgen
debe ser medido comparando la aptitud biolgica de plantas que lo llevan o no, en ausencia de la plaga. Adems, los caracteres
que determinan supervivencia y fecundidad
pueden ser afectados por las condiciones
ambientales, por lo que es necesario
estimarlos en distintos ambientes y a lo largo de varias estaciones de crecimiento. Las
diferencias significativas entre plantas silvestres GM y no GM en cada sitio, entre sitios y
entre aos pueden ser probadas para cada
carcter relacionado con la aptitud mediante un anlisis de la varianza.
5. Consecuencias ecolgicas de la
difusin del transgen en la poblacin
silvestre
La teora de la seleccin natural predice
que un fenotipo cuya aptitud biolgica sea
superior a la de otros fenotipos de la poblacin, dejar mayor cantidad de descendientes y que si estos a su vez heredan el genotipo
favorecido, su frecuencia aumentar en detrimento de los dems genotipos. Sin embargo, el impacto ambiental depender no slo
de la frecuencia sino del cambio en las
interacciones biticas y abiticas de ese
genotipo silvestre en su ambiente. La prediccin de las consecuencias de un escape de
transgenes requiere del estudio de la alteracin de las interacciones ecolgicas existentes entre las especies. Un gen de resistencia
a insectos o a enfermedades modificar la
herbivora o la relacin husped-patgeno
entre la especie silvestre y otras especies de
su hbitat, as como un transgen que favorezca el crecimiento modificar las relaciones
de competencia intra e interespecficas.
Cuanto ms se conozca acerca de la dinmica poblacional de una especie, ms fcilmente se podr evaluar el impacto ambiental. En Cucurbita pepo, hbridos entre
presin selectiva que podra favorecer la seleccin de insectos resistentes a las toxinas,
que llevan una mutacin recesiva de resistencia en condicin homocigota. La descendencia podra heredar los genes de resistencia y
en unos pocos aos, la biotecnologa desarrollada para el control de insectos se volvera inefectiva. Para evitar esta situacin se ha
ideado la estrategia del cultivo refugio, que
consiste en sembrar una franja de variedad
no transgnica junto a la variedad Bt. Los
insectos se reproducen libremente en esa
franja, de modo que los raros portadores de
resistencia se mantendrn en una frecuencia
relativamente baja en la poblacin total de
insectos. La prdida de la eficacia Bt es actualmente una de las mayores preocupaciones ambientales en relacin con el uso de
biotecnologa agrcola aplicada al control de
insectos. Hasta el momento no se han detectado insectos resistentes en condiciones
de produccin a campo de cultivos Bt
(Shelton y col., 2002; Tabashnik y col., 2003).
Conclusiones
El estudio del impacto ambiental precede la liberacin de cualquier nuevo evento
de transformacin en plantas para tener resultados confiables en el ambiente de la liberacin. La mayor parte de los efectos no deseados del escape de un transgen pueden
evitarse mediante acciones adecuadas que
pueden planificarse anticipadamente (manejo del cultivo, bancos de germoplasma, cultivos refugio, etc.). Sin embargo, la difusin de
un transgen hacia poblaciones silvestres
emparentadas es difcil de evitar debido a que
el polen de los cultivos puede alcanzar grandes distancias. En las prximas dcadas, los
cultivos GM se utilizarn en gran escala, por
lo que ser necesario evaluar cuidadosamente el riesgo de escape de transgenes para
cada uno de ellos. Esa evaluacin, realizada
por equipos multidisciplinarios, debe considerar los siguientes aspectos: a) Presencia de
especies silvestres sexualmente compatibles
con el cultivo y la probabilidad de que el
transgen difunda en ellas. b) Cambios en las
caractersticas de poblaciones de patgenos,
insectos y malezas relacionadas con el cultivo GM y medidas para evitar o retardar la
aparicin de biotipos resistentes. c) Cambios
405
Tabla I. Clasificacin de las especies GM en Argentina segn la probabilidad de transferencia del transgen (Grupo
1,2,3) y las consecuencias biolgicas de la modificacin gentica( Clase 1,2,3).
406
Argentina. ISNAR Country Report 63, 69 p. ISSN 10239394. ISBN 92-9118-060-2 (www.isnar.cgiar.org)
407
408
IX-Captulo 4
Deteccin de OGM en la cadena
alimentaria
Tozzini, Alejandro C.
Una gran cantidad de plantas
genticamente modificadas (GM) han sido
aprobadas para su cultivo en el mbito mundial luego de haber pasado por rigurosos controles de seguridad alimentaria y ambiental.
Sin embargo, algunos mercados, en particular la Unin Europea, tienen estrictos requerimientos para su etiquetado. En este caso,
la normativa de etiquetado que rige a partir
de abril de 2004, establece el etiquetado
obligatorio de los alimentos y piensos derivados de un OGM, independientemente de
la detectabilidad de ADN o protenas, y slo
admite la presencia adventicia (accidental) de
hasta un 0.9% de OGM aprobados o de 0,5%
en el caso de eventos, an no aprobados
pero con un dictamen de bioseguridad favorable.
La Argentina es uno de los pases con
mayor adopcin de OGM, segundo despus
de los EE.UU. y antes que Canad. El aprovechamiento a campo de los beneficios de la
biotecnologa vegetal implic inmediatamente la necesidad de implementar procedimientos de campo y laboratorio para poder discriminar mercaderas conteniendo un nivel de
OGM superior a un determinado umbral, de
aquellas que estaban por debajo. A partir del
ao 1997 los exportadores comienzan a demandar el anlisis de partidas de granos destinados a la Comunidad Europea. En ese
momento el contenido aceptable era inferior al 1%, los protocolos de deteccin requeran de la germinacin de los granos (para
extraer ADN de las hojas) y en algunos casos
hasta el uso de sondas radioactivas. Desde
entonces, se ha avanzado sensiblemente en
una serie de aspectos que han hecho evolucionar el panorama, tanto en el pas como
en el mundo:
- Se han desarrollado protocolos de
purificacin de ADN y de PCR para aplicar
a gran escala.
- Los mtodos de PCR han evoluciona-
409
Deteccin fenotpica
En referencia a los mtodos de deteccin
fenotpica, nos concentraremos en el
fenotipo como resultado de algn proceso metablico de la planta (y no restringirnos
a una definicin de fenotipo que implique la
medicin de alguna protena). Las plantas
genticamente modificadas (PGM) que se
encuentran actualmente a campo presentan
la caracterstica de resistencia a herbicida y/o
a insectos. La evaluacin de la resistencia a
insectos de una planta se realiza mediante
ensayos biolgicos complejos y de larga
duracin, por eso sta no es una alternativa
prctica parael anlisis de granos. Sin embargo, la resistencia a herbicidas s puede ser
evaluada mediante ensayos sencillos en laboratorio y a campo. Las semillas o granos
pueden ser puestos a germinar en presencia
del herbicida (para soja, 0.5 ml glifosato 48%
en 1 litro de agua; Monsanto America Latina. 2001), y slo germinarn aquellos individuos portadores del gen de resistencia (Fig.
1).
La cantidad de semillas GM puede ser
estimada en la muestra mediante un clculo sencillo: semillas RR = semillas germinadas con glifosato/semillas germinadas
con agua.
Una vez que un lote ha sido sembrado y
mientras el cultivo se encuentre en una etapa en la que es susceptible al herbicida, se
pueden hacer aplicaciones de herbicida en
pequeas parcelas representativas (Fig. 2)
para luego hacer el recuento de plantas so-
410
TOZZINI, Alejandro C.
Procedimientos inmunolgicos
Bsicamente dos son los formatos que
toman los ensayos inmunolgicos para la
deteccin de OGM: las tiras reactivas (o
strips de flujo lateral) o ELISA (ensayo de
inmunodeteccin ligado a enzimas).
Flujo lateral o lateral flow
Figura 2: representacin esquemtica de la aplicacin
de herbicida en parcelas representativas en un lote de
soja para determinar y cuantificar la presencia de
individuos GM con resistencia al herbicida.
cia alimentos terminados, los distintos tratamientos a que son sometidos los componentes, hacen que se vayan degradando el ADN
y las protenas. Especialmente estas ltimas
pierden su estructura disminuyendo rpidamente sus propiedades inmunolgicas, por
lo tanto no es apropiado aplicar mtodos
inmunolgicos a alimentos con alto grado
de procesamiento.
El ADN, por su parte, se corta en fragmentos pequeos, hasta que la mayora
tiene un largo menor al segmento a amplificar y por lo tanto ya no resulta amplificable. A esto hay que sumarle las modificaciones qumicas de las bases del ADN que
hacen que pierdan su capacidad de servir
como templado en el proceso de copia in
vitro que ocurre durante la PCR (Fig. 3), por
eso en determinadas ocasiones la presencia
de OGM en las materias primas usadas deja
de ser detectable en el producto final. Algo
similar ocurre con aquellas materias primas
usadas como sustrato de procesos
fermentativos, como la fabricacin de cerveza, al final del cual la mayora de las molculas han sido digeridas y resintetizadas.
Junto con esto cabe acotar que los costos de extraccin/purificacin del ADN son
mayores a partir de matrices elaboradas y/o
complejas.
Otro de los factores que atenta contra
las posibilidades de deteccin es el grado de
purificacin del producto: en productos
como los aceites, la lecitina o la glucosa no
queda una cantidad suficiente de ADN como
para ser purificado y amplificado.
411
412
TOZZINI, Alejandro C.
413
Figura 14: Desarrollo de la amplificacin en una PCR en Tiempo Real para distintas muestras (incluyendo la curva de
calibracin, el control sin DNA (lnea horizontal marrn) y el control negativo (inicia fase exponencial en ciclo 39.
414
TOZZINI, Alejandro C.
415
P 35S
Tnos
T35S
GA21
GTS 40-3-2
MON 810
NK 603
3 T25
TC1507
176
Bt11
MON 809
T14
MON 832
DBt418
CBH 351
416
TOZZINI, Alejandro C.
bre la cual se ubiquen los primers, los mismos tendrn propiedades de deteccin distintas. Los primers generales o universales estn diseados sobre secuencias presentes en la mayora de las construcciones
vegetales (promotores, terminadores, genes
marcadores, etc.), por lo tanto, permiten detectar varios eventos (Fig. 7). Los primers
especficos permiten detectar uno o pocos
eventos. Si estos estn ubicados sobre la secuencia codificante pueden detectar un mismo tipo de construccin, por ejemplo, los
eventos Bt11 y MON810. Normalmente, con
una construccin se obtienen muchos eventos en una misma especie, pero slo uno alcanza la fase comercial; sin embargo, a veces
una misma construccin se usa para transformar varias especies y por ello, una misma
construccin se repite en el mercado en varios cultivos. En estos casos, los primers que
amplifican esta construccin detectan varios
eventos. Por ejemplo, con los mismos
primers se puede amplificar el evento GTS 403-2 de soja y el NK603 en maz (as como tambin los mismos reactivos inmunolgicos).
417
418
TOZZINI, Alejandro C.
Figura 13: Esquema de la estructura optica del ABI prism 7700 (PE
Biosystem). Este sencillo esquema muestra como a partir de uan
fuente de luz (laser en este caso) se direcciona la luz hasta cada
muestra y la emisin de retorno es dirigido hacia una cmara. Un
detalle de equipos como este es que la tapa caliente que apoya sobre
las muestras debe ser transparente. Fuente PE Biosystems
(Fig. 12.).
Esta estrategia, adems de laboriosa
(para obtener una reaccin donde se igualen los productos de amplificacin), requiere
del desarrollo del control interno, pero se
puede realizar en un laboratorio de PCR tradicional.
PCR en Tiempo Real (Real Time PCR)
En un sistema de PCR en Tiempo Real, el
proceso de amplificacin se va siguiendo
ciclo a ciclo, observando el incremento de la
masa de ADN presente en cada reaccin. Esto
se logra gracias a un termociclador que tiene
adosado un sistema ptico que emite un haz
de luz sobre cada muestra y registra la emisin de fluorescencia a partir de las misma y
de uno o ms reactivos fluorescentes agregados a la reaccin y que emiten luz de manera proporcional a la cantidad de ADN presente (Fig. 13). La ventaja de este sistema es
que permite detectar en qu momento cada
reaccin alcanza su fase exponencial de amplificacin (Fig. 14, ver pg.6), y sta
correlaciona con la cantidad de copias del
ADN blanco que haba inicialmente en la
muestra.
Para poder cuantificar se necesita incluir
en el experimento una curva de calibracin
con la cual comparar las muestras incgnitas.
A partir de esta curva, se determinar en qu
ciclo alcanza la fase exponencial cada concentracin de OGM. Una muestra con un 10%
de OGM alcanzar la fase exponencial antes
que una muestra con un 1%; y sta antes que
una con 0.1%. La cuantificacin del contenido de OGM se obtiene comparativamen-
419
420
referencia, es preparado por el IRMM de Europa (Institute for Reference Material and
Measurements, www.irmm.-jrc.be ) y por su
costo se lo usa generalmente para calibrar
los materiales preparados en el laboratorio;
sin embargo, es muy difcil lograr la estabilidad y reproducibilidad de los valores entre
lotes e incluso algunos productos se han
discontinuado.
En materia de plsmidos, una firma japonesa comercializa uno que contiene 8 secuencias que estn presentes en un gran nmero
de eventos comerciales (www.fasmac.co.jp).
Al tema de los materiales de referencia
se le agrega el de las unidades de medicin.
En la mayora de los contratos comerciales
de granos en los cuales se estipula un determinado contenido de OGM, este contenido
se expresa de manera porcentual pero sin
especificar las unidades. Lo mismo ocurre
dentro de la legislacin europea de etiquetado (EC 49/2000) y su reciente modificacin
hacia un lmite de 0.9% para cada especie ingrediente (EC 1829/2003), donde tampoco
se especifica las unidades de esta medicin
relativa. En general se asume que se trata
de una medicin relativa de peso en peso.
Sin embargo, ninguno de los mtodos analticos cuantitativos, ELISA cuantitativo o
PCR cuantitativa, puede medir estas unidades e incluso cuantifican elementos distintos entre ellos. Si en una muestra de granos
se conoce el nmero de granos GM, se puede calcular con precisin el contenido porcentual en peso. Sin embargo, conocer el nmero de granos GM a partir de un contenido
de genomas modificados medidos por la presencia del promotor 35S, implica conocer informacin precisa de la muestra o suponerla. Por ejemplo, en una especie diploide, si
TOZZINI, Alejandro C.
el evento est en estado homocigota, tendremos el doble de copias del p35S que si
est en estado de heterocigosis (lo ms probable es que en una muestra tengamos proporciones distintas de ambos estados). Adems, en los granos heterocigotas, el tejido
triploide del endos-perma genera diferencias en la densidad del transgen por unidad de masa; si el transgen lleg al grano
por la gameta masculina (polen), el
endosperma tendr una relacin modificado:
no modificado de 1:2, mientras que si ingres por la gameta femenina, la relacin ser
2:1, debido a la contribucin gentica desigual de ambos padres en el endosperma 3n.
Tambin hay que conocer los eventos
involucrados, ya que algunos tienen una copia del p35S por genoma, mientras que otros
tienen dos, tres y hasta 5 copias (Tabla 1).
Cuando se est cuantificando la contaminacin accidental con GM de un lote de granos, es poco probable que se tenga la informacin precisa de la misma y su origen.
Cmo detectar OGM en el futuro?
En un futuro cercano sern muchos los
eventos aprobados y liberados en el mundo, y las secuencias hoy presentes en la mayora de los eventos, como son el promotor
35S y el terminador NOS, ya no sern comunes. El desarrollo de nuevos promotores especficos de la especie y la funcin har que
los distintos eventos prcticamente no tengan ninguna secuencia en comn. Con la tecnologa actual, esto implica que deberamos
realizar una reaccin de PCR por cada evento posible para poder finalmente decir que
la muestra no contiene (con un lmite de deteccin dado) una determinada lista de eventos correspondiente a todos los que hayan
sido ensayados. Hoy, un ensayo de PCR dirigido al P35S y cuyo resultado sea negativo permite descartar la presencia de ms
del 90% de los eventos del mercado mundial.
El consumidor, especialmente el europeo,
ha solicitado la eliminacin en las plantas
transgnicas de los genes de resistencia a
antibiticos. Estos son usados como marcadores de seleccin en los procesos de transformacin y regeneracin vegetal. Estas secuencias tambin son comunes a muchos
421
de investigacin est encargada de desarrollar el GMO chip, un chip de baja densidad (1000 puntos /cm2) que permita detectar la presencia de distintos OGM simultneamente (ver: www.gmochips.org).
Segregacin, trazabilidad e identidad
preservada para GMO
El objetivo de un programa de trazabilidad es generar un producto de identidad
preservada, esto es un producto del cual se
puede conocer su origen y los procesos a que
fue sometido hasta alcanzar el producto final en destino. La identidad preservada se
aplica para obtener un producto identificado por su origen geogrfico, y/o por su contenido y/o por su mtodo de produccin.
Esto implica el trabajo de auditores, ensayos
de laboratorio y documentacin a lo largo
de todo el proceso. La trazabilidad est asociada a la reastreabilidad (identificar el origen de los productos) y a la segregacin,
para evitar las mezclas y para descartar todo
aquello que no cumpla con lo requerido.
Muchas veces se confunden los trminos
trazabilidad y segregacin y no se refieren a
los mismos conceptos. Segregacin implica
mantener separado un producto de otros,
mientras que trazabilidad significa conocer su
origen y no forzosamente separacin. La
trazabilidad de un producto puede mostrar
que en sus composicin hay ingredientes diferentes, por ejemplo derivados de OGMs.
Lo que suele ocurrir es que se utiliza a la
trazabilidad como una herramienta para
asegurar la segregacin e identidad de un
producto.
Para que un programa de trazabilidad se
justifique se necesita de la demanda de un
sector dispuesto a pagar un precio mayor al
normal por una determinada caracterstica de
calidad.
En el caso de los granos, existen programas para asegurar calidad y origen y recientemente se le ha acoplado un nuevo atributo que es el contenido de OGM. Los niveles
requeridos varan de acuerdo al destino del
producto. Actualmente stos, van de menos
del 0.1% al 5% en algunos casos. En funcin
de este requerimiento, se arma un programa de trazabilidad y/o segregacin que requerir de mayores controles cuanto menor
422
TOZZINI, Alejandro C.
423
424
TOZZINI, Alejandro C.