Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
1 Transcripcion1SintesisdeRNA
1 Transcripcion1SintesisdeRNA
Todos
TRANSCRIPCIN
1)
2)
3)
4)
Aspectos generales
Transcripcin en Procariotes
Transcripcin en Eucariotes
Mecanismos reguladores
Transcripcin
Con la excepcin de los RNAs de ciertos virus, todas las
Iniciacin
Elongacin
Terminacin.
Transcripcin
RNA Polimerasa
b)
c)
d)
e)
b)
c)
RNA Polimerasa
Actividad Correctora
Un error en la replicacin del ADN puede transmitirse a todas
las clulas que deriven por divisin de la clula afectada.
Esto exige que durante la replicacin exista un mecanismo
eficaz que corrija cualquier error que se haya podido
introducir en la secuencia de bases del DNA.
A diferencia de lo que ocurre con las DNA polimerasas, las
RNA polimerasas o transcriptasas, habitualmente carecen de
funcin "correctora de pruebas".
Esta diferencia se debe:
1.
2.
A.
Estructura de la enzima
B. Unin al molde
C. Iniciacin de cadenas
D. Elongacin de cadenas
E. Terminacin de cadenas
F. RNA polimerasas eucariotas
2.
3.
4.
5.
6.
2
1
Factor
La fijacin del factor a la parte central activa de la enzima es transitoria y su presencia la hace capaz
de seleccionar y unirse tanto a la hebra correcta, como al molde correcto en la estructura del DNA para
iniciar la sntesis de RNA.
Despus de que la polimerasa transcribe ~10 pares de bases, la subunidad es liberada.
Genes Transcritos
Bacterias
RNA Polimerasa
Eucariotas (Ncleo)
RNA Polimerasa I
RNA Polimerasa II
RNA Polimerasa III
RNA Polimerasa IV (plantas)
Eucariotas (Organelos)
RNA Polimerasa Mitocondrial
RNA Polimerasas Cloroplasto
(mltiples)
Genes mitocondriales
Genes del Cloplasto
deriva
probablemente de sus varias y complejas funciones,
que incluyen
1.
2.
3.
4.
la unin al molde
la iniciacin de la cadena de RNA
la elongacin de la cadena
la terminacin de la cadena.
Etapas de la transcripcin:
Iniciacin en Eucariotas
1.
2.
2.
3.
Elongacin
Unin al Molde
La
Complejo Abierto
Los anlisis de huellas indican que la unin de la
Transcripcin
En Resumen, con extrema sencillez, el
Iniciacin
La RNA polimerasa se desliza a lo largo del DNA hasta que encuentra la secuencia del
promotor.
Una vez que la enzima encuentra al promotor se produce, cerca de la caja de Pribnow, el
desenrollamiento de una corta regin del DNA.
La transcripcin empieza con la fijacin del primer nucletido trifosfato (usualmente ATP o
GTP) al complejo de la RNA polimerasa.
Entonces se produce un ataque nucleoflico del grupo 3'-OH del primer nucletido trifosfato
sobre el segundo nucletido trifosfato (posicionado por enlaces de hidrgeno de acuerdo a la
complementariedad con el DNA que sirve de molde) y se produce el primer enlace
fosfodister.
Puesto que los grupos fosfato del primer nucletido no participan en estas reacciones, el
extremo 5 del transcrito primario termina en un grupo trifosfato.
Cuando la secuencia de transcripcin alcanza unos 10 nucletidos, la conformacin de la RNA
polimerasa cambia, el factor es liberado y la fase de iniciacin termina.
Tan pronto la RNA polimerasa ha iniciado la transcripcin y ha dejado libre el sitio del
promotor, este queda listo para ser ocupado por una nueva enzima e iniciar otro proceso
similar de transcripcin de dicha regin del DNA.
Elongacin
El alargamiento de la cadena de RNA se realiza mediante la
Elongacin
Elongacin
Segn la RNA polimerasa avanza, mantiene separadas las
Terminacin
Desplazamiento
Iniciacin
La RNA polimerasa como holoenzima, es decir con el factor ,
se une inicialmente al promotor para formar un complejo
reversible, llamado cerrado puesto que el DNA permanece
formando su doble hlice de bases apareadas.
Este complejo experimenta una transicin estructural a la forma
llamada abierta, en la cual aproximadamente 18 pb del DNA,
alrededor del punto inicial de la transcripcin, se funden (las
dos hebras de la doble hlice se separan) para exponer la
hebra que servir de molde para la sntesis del RNA.
La transcripcin parece ser favorecida por la existencia de un
superenrollamiento negativo de la regin del promotor, la cual
requiere el empleo de una cantidad menor de energa libre para
la separacin de las dos hebras del DNA. Asimismo las
regiones ricas en AT tambien requieren menos energa para
iniciar su fusin.
La formacin del complejo abierto es generalmente irreversible
Iniciacin
Una vez que la holoenzima ha iniciado la transcripcin
del RNA, el factor se disocia del complejo enzimaDNA-RNA, y as puede unirse a otro ncleo para formar
un nuevo complejo de iniciacin.
La base 5'-terminal de los RNAs procariticos es casi
siempre una purina, siendo la A ms frecuente que la G.
La reaccin de iniciacin de la transcripcin es la unin de
dos nuclesidos trifosfato en la reaccin:
pppA + pppN pppApN + PPi
Los RNAs bacterianos, por tanto, poseen grupos 5'trifosfato terminales.
Elongacin
La transcripcin probablemente sobre enrolla al DNA.
La elongacin de la cadena de RNA requiere que el
molde de DNA bicatenario sea abierto en el punto de
sntesis de RNA, de manera que la cadena con sentido
pueda ser transcrita a su hebra de RNA complementaria.
Durante este proceso, la cadena de RNA forma cortos
segmentos bicatenarios hbridos RNA-DNA, aunque slo
de manera transitoria.
Esto se deduce de la observacin de que la transcripcin
deja intacto al DNA bicatenario original, con la liberacin
de RNA de cadena sencilla.
La "burbuja" de DNA no apareado de los complejos de
iniciacin abiertos se desplaza aparentemente a lo largo
del DNA junto con la RNA polimerasa. Esto podra ocurrir
de dos maneras:
(a) La RNA polimerasa sigue la ruta marcada por la hebra con sentido a lo largo
de la doble hlice de DNA, con lo que el transcrito acabara envolviendo al
DNA una vez por cada vuelta del dplex. El RNA no se desenrollara
espontneamente en un tiempo razonable del largo DNA.
(b) El RNA se desplaza en lnea recta al mismo tiempo que el DNA gira por debajo.
En este caso, el RNA no se enrollara alrededor del DNA, sino que el DNA
situado por delante de la burbuja de transcripcin se sobreenrollara a medida
que sta va avanzando, y se ira desenrollando por detrs
Superhelicoicidad
Segundo Mecanismo
Si la RNA polimerasa se desplaza en linea recta mientras que
es el DNA el que rota, entonces el RNA y el DNA no se
enredarn, en lugar de ello, las vueltas de hlice del DNA sern
empujadas hacia adelante de la burbuja de transcripcin en
movimiento, de forma que el DNA situado por delante de la
burbuja quedar enrollado ms fuertemente (cosa que
promueve el sobre enrollamiento positivo), mientras que el DNA
situado por detrs de la burbuja ser desenrollado de forma
equivalente (y esto promueve el sobre enrollamiento negativo;
obsrvese que el nmero de ligamiento del DNA completo
permanece inalterado).
Este modelo est apoyado por las observaciones de que la
transcripcin de plsmidos en E. coli mutantes para la girasa
(incapaces de relajar sobre enrollados positivos) genera
plsmidos sobre enrollados positivamente, mientras que un
experimento similar en mutantes para la topoisomerasa 1
(incapaces de relajar sobre enrollados negativos) genera
plsmidos sobre enrollados negativamente,
Terminacin
Terminacin
Transcripcin en Eucariotas
c.
Factores de Transcripcin
b.
c.
Complejo de Iniciacin
2.
3.
Fosforilacin de la Polimerasa
La seal efectiva para iniciar la
transcripcin consiste de la fosforilacin
mltiple de un dominio en el extremo
carboxi-terminal de la Polimerasa.
En su forma fosforilada, la Polimerasa
puede liberarse del complejo basal,
junto con algunos de los factores de
transcripcin, e iniciar la sntesis de lo
que ser el RNAhn (RNA heterogneo
nuclear).
Pre-iniciacin
Iniciacin
Elongacin
Terminacin