Facultad de Medicina Humana

Acidos nucleicos.
Tipos de bases nitrogenadas.
Nucleósidos y nucleótidos.
Conformaciones sin y anti .
Complementaridad de bases.
DNA. Enlace fosfodiéster.
Estructuras, doble hebra.
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 1
 Gen

mRNA

tRNA
rRNA

Información para
1. ejecutores
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio su secuencia 2
Definición:

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 3

Nucleotidos:

•Energía
•Señales de transducción
•Cofactores enzimáticos
•Intermediarios metabólicos
•Monómeros de DNA RNA

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 4

Nucleotido

Enlace ester

Enlace N-glucosidico

En DNA
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 5
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 6
 A = 6-aminopurina

G =6-oxi-2-aminopurina

C = 2-oxi-4-aminipirimidina

T = 5-metil-2,4-dioxipirimidina

U = 2,4-dioxipirimidina

T= 5-metiluracilo

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 7

Orga. superiores
Bacterias
Bases Menores

tRNAs

Bacterias infectadas
con fagos

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 8

Nucleosido

La unión de la base nitrogenada a la pentosa

recibe el nombre de nucleósido y se realiza a
través de un enlace N-glucosídico entre el
carbono 1’ de la pentosa y los nitrógenos de las
posiciones 3 (pirimidinas) o 9 (purinas) de las
bases nitrogenadas.

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 Nomenclatura de nucleósidos y nucleótidos

Bases Base-Azucar Base-Azucar-Fosfato Ac nucleico

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 10

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 11
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 12
Los nucleótidos y los nucleósidos contienen una pentosa: la D-ribosa
(ribonucleótidos y ribonucleósidos) o la 2-desoxi-D-ribosa
(desoxirribonucleótidos y desoxirribonucleósidos). Conformación de la ribosa

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 13

Los nucleótidos pueden tener 1, 2 ó 3 grupos fosfato
unidos al C 5’.

Asi tenemos: nucleótidos 5’ monofosfato,

nucleótidos 5’ difosfato y nucleótidos 5’ trifosfato.

En algunos casos el fosfato se une al C 3’, existiendo

nucleótidos 3’ monofosfato, difosfato o trifosfato
según el número de grupos fosfato que posea.

En otros el fosfato se une al C2’ o puede cerrar un

ciclo con C3’.

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Monofosfatos de adenosina
Derivados de hidrólisis alcalina

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 15

Los nucleótidos se unen entre si para formar
largas cadenas de polinuclóetidos, esta
unión se realiza mediante enlaces
fosfodiéster entre los carbonos de las
posiciones 3’ de un nucleótido con la 5’ del
siguiente.

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 El esqueleto covalente:
Fosfatos y pentosas alternantes

Las bases se ubican como

grupos laterales unidos al
esqueleto a intervalos regulares

El esqueleto es hidrofílico,
S-OH ---H2O,
pH 7, P- , prot+, M+, poliaminas

Polaridad;

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La Hidrólisis no enzimática de DNA y RNA es muy lenta. En
cambio el RNA en medio alcalino, es hidrolizado rápidamente

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Representación de una secuencia de nucleótidos

P ACGTAOH
pApCpGpTpA Estructura
pACGTA primaria
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Las propiedades de las bases nucleotidicas, afectan la
estructura de AN
Las BN son bases débiles ?
Son altamente conjugadas ? Estructura, distribución
electrónica, uv
“Resonancia” doble enlace parcial, estructura planar,
Libres pueden tener dos formas tautoméricas
dependientes de pH

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Como consecuencia de la resonancia…

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Las bases son hidrofóbicas, e insolubles en agua a pH 7

A pH ácido ó alcalino, adquieren carga y se hacen

solubles

Una de las interacciones importantes en la estructura de

los AN es el apilamiento de bases hidrofóbicas, las bases
se ubican con los planos de sus anillos en paralelo, el
apilamiento involucra también interacciones de van der
Walls y dipolo-dipolo.

El apilamiento de bases minimiza el contacto de las

bases con el agua, y así estabilizan la estructura del
DNA.
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 22
Las bases contienen anillos de nitrógeno, grupos carbonilo, grupos amino
exocíclicos.
La estructura de los AN, se mantiene también debido a los H-H entre
gropos amino y carbonílicos de las BN
Los H-H entre las bases permiten la asociación complementaria entre 2, 3
ó 4 hebras.
Este apareamiento complementario fue descrito por WC.

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 23

Estructura del DNA

F. Nietzsche 1865
Miescher 1869
O. Avery 1944
Hershey y Chase 1952
J. Watson 1953
Shapiro 1976
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 24
 Miescher en 1871 aisló del núcleo de
las células de pus una sustancia ácida
rica en fósforo que llamó "nucleína".

Un año más tarde, en 1872, aisló de la

cabeza de los espermas del salmón
un compuesto que denominó
"protamina" y que resultó ser una
sustancia ácida y otra básica.

El nombre de ácido nucleico procede

del de "nucleína" propuesto por
Miescher.

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La primera evidencia que el DNA era el
material de la herencia se obtuvo de Oswald T.
Avery, Colin MacLeod y Maclyn Mc Carty con
Streptococus pneumoniae

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 26

 1 2

3 4

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 27

Impurezas protéicas

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1952 Hershey y Chase

Evidencia innegable…

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 29

1940 Chargaff
•La composición de bases del DNA varía con la especie
•El DNA aislado de diferentes tejidos de un mismo organismo tiene la misma
composición de bases.
•La composición de bases de un DNA no cambia con el tiempo, nutrición o
medioambiente.
•En todos los DNA A=T y G=C, A+G=T+C

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Rosalind Franklin y Maurice Wilkins 1950
Espectros Difracción de rayos X

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 31

Doble helix, 2 periodicidades a lo largo del eje una a 3.4
Aº y la otra a 34 Aº

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 32

Las bases púricas y pirimidínicas se encuentran unas
sobre otras, apiladas a lo largo del eje del polinucleótido
a una distancia de 3,4 Å. Las bases son estructuras
planas orientadas de forma perpendicular al eje
(Astbury, 1947).

El diámetro del polinucleótido es de 20 Å y está

enrollado helicoidalmente alrededor de su eje. Cada 34
Å se produce una vuelta completa de la hélice.

Existe más de una cadena polinucleotídica enrollada

helicoidalmente (Wilkins et el. 1953, Frankling y
Gosling, 1953).

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 33

El asunto ahora era diseñar una estructura 3D acorde con los patrones
de difracción y las reglas de Chargaff

propusieron su Modelo de estructura para el ADN conocido con el

nombre de Modelo de la Doble Hélice

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 34

•El ADN es una doble hélice enrollada helicoidalmente en sentido
dextrogiro.

•Enrollamiento es de tipo plectonémico: para separar las dos hélices es

necesario girarlas como si fuera un sacacorchos.

Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 35

•Cada hélice es una cadena de nucleótidos unidos por
enlaces fosfodiéster en los que el fosfato forma un
puente entre grupos OH 3’ de un azúcar y 5’ del
siguiente. El esqueleto hidrofílico, alterna P y dR hacia
el exterior.

•Las dos hélices se mantienen unidas mediante

puentes o enlaces de hidrogeno producidos entre las
bases nitrogenadas de cada hélice.

•Siguiendo los datos de Chargaff (1959), la Adenina de

una hélice aparea con la Timina de la hélice
complementaria mediante dos puentes de hidrógeno y
la Guanina de una hélice aparea con la Citosina de la
complementaria mediante tres puentes de hidrógeno.
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 36
 Observar las formas tautoméricas
Apareamiento de bases W y C

Este apareamiento específico, permite la duplicación

de la información genética
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 37
•Las dos hélices por razones de complementaridad de las bases
nitrogenadas son antiparalelas, teniendo secuencias de átomos inversas.
Una hélice lleva la secuencia 5’P → 3’ OH , mientras que la hélice
complementaria sigue la secuencia de átomos 3’OH → 5’P.

• El apareamiento complementario crea 2 surcos.

•El diámetro de la doble hélice es de 20 Å.

•Las bases nitrogenadas son estructuras planas perpendiculares al eje de la

doble hélice y están apiladas unas sobre otras a una distancia de 3,4 Å.
Cada 10 bases, cada 34 Å se produce una vuelta completa de la doble hélice
(360º).

•Las bases se encuentran en sus configuraciones cetónicas, cumpliendo así

las reglas de apareamiento A-T y G-C.

•El anillo de furanosa C-2’ esta en conformación endo.

•La secuencia de bases nitrogenadas puede ser cualquiera, no existe

ninguna restricción.
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 38
 Las dos hebras no son iguales, son
complementarias ?
El duplex se mantiene unido por : H-H
entre las bases complementarias, y
las interacciones por apilamiento de
bases.
La complementaridad se atribuye a los
H-H entre los pares de bases.
El apilamiento no es específico pero
da la mayor contribución a la
estabilidad.
El modelo es apoyado por muchas
evidencias ; rabajos con DNA
polimerasas y análisis de rayos X.
Pero lo más trascendente es que
permite explicar la transmisión de la
información genética.
Estructura secundaria
Mg. Carlos M. Santa Cruz Carpio 39
Trascendencia del modelo

Las reglas de complementaridad de las bases nitrogenadas A-T y G-C

sugieren un forma sencilla de replicación del material hereditario. Esta
forma sencilla de replicación se denomina método Semiconservativo.

Cuando el ADN se replica sus dos hélices se separan y cada una de ellas
sirve de molde para sintetizar una nueva hélice siguiendo las reglas de
apareamiento de las bases nitrogenadas.

La mutación a nivel molecular consistiría en un cambio en la secuencia de

bases nitrogenadas del ADN.

Al no existir ninguna restricción en la secuencia de bases nitrogenadas, el

ADN poseía la suficiente variabilidad como para ser el material
hereditario.

Además, esta estructura sugería la existencia de algún código que

permitiera pasar de la secuencia lineal de bases nitrogenadas en el ADN
a la secuencia lineal de aminoácidos en las proteínas.

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