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ESTRUCTURA DEL DNA

Base
nitrogenada
Grupo fosfato

Pentosa Bases
Nitrogenadas
NH2

N C
O O O C N
C
C C
HO P O P O P O - CH 2
O N N
OH OH OH

OH H

Desoxi - Adenosina- Tri-Fosfato ( dATP )


O
N C
O O O C HN
C
C C
HO P O P O P O - CH 2
O N N NH2

OH OH OH

OH H

Desoxi - Guanosina- Tri-Fosfato ( dGTP )


O

C
H3C C N- H
O O O
H -C C
N O
HO P O P O P O - CH2 O

OH OH OH

OH H

Desoxi – Timidina – Tri – Fosfato ( dTTP )


NH2
C
H -C N
O O O
H -C C
O - CH2 O N O
HO P O P O P
OH OH OH

OH H

Desoxi – Citidina – Tri – Fosfato ( dCTP )


Los niveles de organización estructural del DNA :

Estructura Primaria

Estructura Secundaria

Estructura Terciaria

Estructura Cuaternaria
La Estructura Primaria de una cadena de DNA es la secuencia de Nucleotidos tomadas en
dirección 5´P a 3´OH.

¿Pero como se genera


esta cadena de
polinucleótidos?
Formación de un dímero de dNts ( desoxi - NH2
nucleotidos ) C
H- C N
O O O
H- C C
O N O
HO P O P O P O - CH2

OH OH OH

C 3´ OH
NH2
OH H
dCTP C 5´ P O N C
P OH C N
O O O
O C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N

OH OH OH

OH H
dATP
Pirofosfato
Las Cadenas de DNA se elongan con una dirección definida

La Polimerización de una cadena de


DNA se produce desde el extremo 5´P
al 3´OH
EXTREMO 5´ P NH2 EXTREMO 5´ P
C
O O O H-C N
H-C C
HO P O P O P O - CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
C
O
P OH N
O O O O C N
C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N
OH OH OH

OH H
O O
P OH C
O O O O H3C C N-H
H-C C
HO P O P O P
O
CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
O
P OH N C
O O O O C N
C
C C
P O CH2
Pirofosfato HO P
OH
O P
OH
O
OH
O N N

OH H
O O
P OH
C
O O O O H3C C N-H
H-C C
O N
O
HO P O P O P CH2 O
OH OH OH

EXTREMO 3´ OH OH H

EXTREMO 3´ OH
Nomenclatura de la secuencia nucleotídica

HC
NH2
C
N
Esta secuencia se podría representar
así :
O O O
HC C
HO P O P O P O - CH2 O N O
OH OH OH

O H NH2

pCpApTpApT
O
P OH N C
O C N
C
CH2 O C C
N N

O
O
P OH HC
O
H NH2
C
N
En la Práctica se suprimen las “p”
CH2 O
HC
N
C
O
cuando se utilizan metodologías “in
O H NH2
silico” puesto que se representan las
Bases :
O
P OH N C
O C N
C
CH2 O C C
N N

O H NH2
O
P OH HC C N
O CATAT
HC C
CH2 O N O

OH H Manteniendo la dirección 5´P a 3


´OH
Estructura secundaria modelo de Watson y
Crick
• 1950 Chargaff descubre que en todas las moléculas de ADN
presentaban proporciones de purinas idénticas a las de
pirimidinas; la "equimolecularidad" de las bases ([A]=[T],
[G]=[C]).

• 1952, la cristalógrafa británica Rosalind Franklin (1920-1958)


obtuvo una fotografía de difracción de rayos X que reveló, de
manera inconfundible, la estructura helicoidal de la molécula
del ADN.
Estructura secundaria modelo de Watson y
Crick
• 1953 Watson y Crick, basándose en los datos anteriores,
elaboraron un modelo de la doble hélice. Supone que hay dos
cadenas de polinucleotidos enfrentadas entre si y enrolladas
entre sí, con dirección de izquierda a derecha, en forma de
espiral.

• Suponen que frente a una base de A hay una T, y de una G una


C, ya que era la única forma de que la doble cadena mantuviera
el tamaño molecular que correspondía a los análisis hechos por
Rosalind Franklin.
Estructura secundaria modelo de Watson y Crick
Existen 3 tipos de estructura en doble helice del
DNA, las formas : B, A y Z
DNA-B

DNA-Z
DNA-A
Existen 3 tipos de estructura en doble helice del
DNA, las formas : B, A y Z

Forma B: Forma A: Forma Z:


Es la propuesta por También es Es levógira, con
Watson y Crick. Es dextrógira, pero las enrrollamiento
una hélice bases se encuentran irregular y una
dextrógira, con las en planos inclinados
DNA-B

DNA-A configuración en

DNA-Z
bases y el eje de la zig-zag (de ahí su
complementarias molécula no los nombre). Esta zona
situadas en planos atraviesa por el aparece cuando en
horizontales, de centro. Esta forma la secuencia hay
manera que el eje de aparece cuando se más C y G. Se
la molécula atraviesa deseca la forma B. piensa que esta
dichos planos por su No es funcional forma Z constituye
centro. Es la forma señales para las
más frecuente en la proteínas
que se encuentra el
ADN
Estructura Terciaria

DNA circular y DNA lineal

Superenrollamientos del DNA


Estructura 3ria del DNA
• La estructura terciaria se presenta cuando el DNA presenta plegamiendo
sobre si mismo.

• Existe una forma de estructura terciaria que recibe el nombre de estructura en


superhélice, superretorcimiento o superenrollamiento.

• El ADN superenrollado es una molécula de ADN bicatenario que está retorcida o


girada sobre sí misma, de tal modo que el eje de la doble hélice propia del ADN no
sigue una curva plana sino que forma otra hélice, una superhélice.

• El concepto de ADN superenrollado aparece como resultado del análisis topológico


de la molécula de ADN. Una molécula con la misma secuencia puede estar en
estado relajado o en diferentes estados de enrollamiento. Estas moléculas se
conocen como topoisómeros, ya que son idénticas excepto en lo relativo a su
topología.

DOS TOPOISÓMEROS DIFERENTES


Estructura 3ria del DNA

• Las moléculas pueden sufrir superenrollamiento tanto positivo


como negativo, dependiendo del sentido de la torsión.

– Si el superenrollamiento se da hacia la izquierda este será


un superenrrolamiento positivo

– Si el superenrrollamiento se da hacia la derecha será


negatico
Topoisomerasa
s
• Son un grupo de enzimas que convierten una forma topológica
del DNA en otra favoreciendo su enrollamiento o disminuyéndolo
según sea el caso.

Topoisomerasas de tipo I : Topoisomerasas de tipo II :

Enzima generada por una sola También denominada girasa, es


proteína con 4 dominios. capaz de introducir
superenrollamientos negativos.
Cortan una cadena de la doble Cortando una de las dos cadenas
hélice de DNA y permiten el giro del DNA o ambas.
libre de la otra, hasta que se
deshace el superenrollamiento,
disminuyendo con ello el la
tensión del DNA
Topoisomerasa I
Topoisomerasa II
ESTRUCTURA
CUATERNARIA

INTERCCIÓN DEL DNA CON


PROTEINAS
HISTONA
S
• Proteínas más abundantemente asociadas con el DNA.

• Son proteínas ricas en aminoácidos básicos y cargados


positivamente, como la lisina y la arginina.

• Su carga- H1 - H2B interaccionar


positiva les permite - H4 con el DNA que
presenta- una
H2Acarga parcial
- H3negativa.

• Existen diferentes tipos de histonas pero son 5 principlamente


• las
La unión de 8 histonascon
que inetraccionan con DNA
el DNA formara
para a un nucleosomaen
su empaquetamiento
forma de cromatina.
Nucleosom
a
Estructura
solenoide

Se genera de la unión de 6
nucleosomas a través de la
histona H1 para generar a la
vez fibras de 30 nm de
diámetro.
CROMATINA
• Los solenoides a su vez
formaran fibras condensadas.

• Las fibras condesadas


formaran a la cromatina.

• La cromatina es el conjunto
de ADN, histonas y proteínas
no histónicas que se encuentra
en el núcleo de las células
eucariotas y que constituye el
cromosoma eucariótico

• La compactación de la
cromatina formara a los
cromosomas.
NH2
C
O O O H-C N
H-C C
HO P O P O P O - CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
C
O
P OH N
O O O O C N
C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N
OH OH OH

OH H
O O
P OH C
O O O O H3C C N-H
H-C C
HO P O P O P
O
CH2 O N O

OH OH OH

OH H NH2
O
P OH N C
O O O O C N
C
C C
HO P O P O P O CH2 O N N
OH OH OH

OH H
O O
P OH
C
O O O O H3C C N-H
H-C C
O N
O
HO P O P O P CH2 O
OH OH OH

OH H

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