Enzimas

Los enzimas son los catalizadores de las reacciones biológicas.

Características:

1. Alto poder catalítico, las enzimas aceleran las reacciones

multiplicando su velocidad por un millón de veces.

2. Especificidad. Altamente específicas tanto la reacción

que catalizan como en la selección de las sustancias
reaccionantes (sustratos).

Enzimas proteolíticas

H O H O H O H O

N C C N C C + H2O N C C + +
H3 N C C

H R1 H R2 H R1 R2

Tripsina Trombina
H O H O
H O H O
N C C N C C
N C C N C C
H H R2
H H
Lisina
o Arginina Glicina
Arginina
 Enzimas

Naturaleza química de las enzimas

1. Casi todas las enzimas son proteínas salvo un pequeño grupo

de moléculas de RNA catalítico.

2. Su actividad catalítica depende de la integridad de su

conformación proteica nativa.

3. Algunas enzimas requieren para ser activas de componente

químicos como:

 Moléculas que se unen de forma débil a la proteína.

 Cofactores: iones inorgánicos como Fe+2, Mg+2, Mn+2 ,

Zn+2.
 Coenzimas: complejos orgánicos o metalorgánicos.

 Moléculas que se unen covalentemente, denominados grupo

protéticos.

4. El enzima completo catalíticamente activo junto con su

coenzima y/o iones metálicos se denomina Holoenzima. Se
denomina apoenzima o apoproteína a la parte proteica de la
enzima.
 Centro activo

Es la región del enzima que se une al sustrato y contiene los

residuos que participan directamente en la producción y ruptura
de en laces.
• Estos residuos se denominan grupos catalíticos.

• El centro activo supone una porción relativamente

pequeña del volumen total del enzima.

• El centro activo es una entidad tridimensional.

• Los sustratos se unen a los enzimas por numerosas

fuerzas débiles.

• Los centros activos son hoyos o hendiduras.

• La especificidad del enlace depende de la posición exacta

de los átomos del centro activo. Un sustrato debe tener
una forma adecuada para introducirse en el centro.

Molécula del sustrato

Centro activo
 Modelos de interacción enzima-sustrato

Modelo de la llave y la cerradura:

El centro activo del enzima por si mismo es complementario a
la forma del sutrato.

Complejo
+ Enzima-sustrato

Enzima

Modelo del ajuste inducido:

El centro activo tiene una forma complementaria a la del
sustrato solamente después de unirse a él.

Sustrato

+ Complejo
Enzima-
sustrato
Enzima
 Cinética enzimática
La conversión de reactivos en productos en cualquier reacción
química está acompañada de un cambio energético.

En el estado inicial, la energía libre es muy baja.

En el estado de transición, el contenido energético es

máximo.

Energía de activación, es la diferencia de energía entre el estado

inicial de los reactivos y el estado de transición
 Cinética enzimática

Las velocidades de reacción pueden aumentarse:

Incrementando la temperatura

Disminuirse la energía de activación añadiendo

catalizadores

Las enzimas al ser un catalizador disminuye la energía de

activación de la reacción para que de esta manera la velocidad
de la reacción sea más rápida.
 Cinética enzimática

La cinética es el estudio de la velocidad de cambio entre el estado

inicial de los reactivos y su estado final productos.

La velocidad inicial de una reacción catalizada por un enzima

depende de la concentración de sustrato.

Si se representa las velocidades iniciales obtenidas a varias

concentraciones de sustrato, manteniendo constante la
concentración de enzima, se obtiene una hipérbola rectangular.

La velocidad máxima (Vmax) es la velocidad de la reacción cuando

todos los centros asequibles están saturados.
 Ecuación de Michaelis y Menten

La forma hiperbólica de esta curva que expresa la relación entre

[S] y Vo se puede expresar algebraicamente mediante la ecuación
de Michaelis -Menten.

Vo=Velocidad inicial.
Vmax [S] Vmax= Velocidad máxima.
Vo = Km= Constante de Michaelis.
Km + [S] [S]= Concentración de sustrato.
De la ecuación de Mihaelis-Menten emerge una relación numérica
importatnte en el caso especial en que Vo=1/2 Vmax

Vmax [S]
Vmax/2=
Km + [S]

Al dividir por Vmax:

[S]
1/2=
Km + [S]

Despejando Km obtenemos:

Km + [S] = 2 [S]

Km=[S] Cuando Vo=1/2 Vmax

La Km nos da información acerca de la afinidad del enzima por el

sustrato
A mayor Km menor afinidad de la enzima por el
sustrato

A menor Km mayor afinidad.

Forma lineal de la ecuación de Michaelis-Menten
Doble reciproca

1 Km 1
= +
Vo Vmax[S] Vmax

La representación gráfica de 1/V frente a 1/[S] enominda

representación de Lineweaver-Burk es una línea recta con

Una ordenada en el origen igual a 1/Vmax

Una pendiente de Km/Vmax y la intersección con

el eje x es -1/KM
 Factores que afectan la actividad de los enzimas
pH:

Intervalo de pH en que su actividad es máxima  pH óptimo, a

valores superiores o inferiores de pH su actividad disminuye.
Reflejo del ambiente celular

Temperatura: La temperatura donde la actividad del enzima es

máxima se le denomina Tempeartura óptima,

10 30 50 70
ºC
Factores que afectan la actividad de los enzimas

Inhibidores

La inhibición de la actividad ezimática por móleculas

espeíficas es importante porque constituye el principal
mecanismo de control en los sistemas biológicos.

Inhibición irreversible: El inhibidor queda

covalentementeo no, unido al enzima o ligado fuertemente
a él que su disociación es muy lenta.

Inhibición reversible: Se caracteriza por la rápida disociación

del complejo Enzima-sustrato.
 Inhibiciones reversibles

Inhibición competitiva:

El inhibidor (competitivo) se une al centro fijador del sustrato

compitiendo con éste por el enzimas. concentraciones crecientes
del sustrato desplazanal inhibidor.

Con inhibidor competitivo

1/v

La Vmax no
varía en
presencia del 1/Vmax Sin inhibidor
inhibidor La Km aumenta en
competitivo presencia
del inhibidor
competitivo

1/[S]

-1/Km -1/Kmap
 Inhibiciones reversibles
Inhibición no copetitiva:

El inhibidor (no competitivo) se fija en un centro diferente el

centro de fijación del sustrato. Esta inhibición no es
contrarrestada mediante concentraciones crecientes de
sustrato.

Con inhibidor no competitivo

1/v

La Vmax
disminuye en 1/Vmaxap
presencia del
inhibidor no
Sin inhibidor
competitivo
1/Vmax

La Km no varía en
1/[S]
presencia del
inhibidor no -1/Km
competitivo
 Inhibiciones reversibles
Inhibición acompetitiva:

El inhibidor se fija a un sitio diferente al del sutrato, fijandose

sólo al complejo enzima –sustrato y nunca al enzima solo.

Con inhibidor acompetitivo

1/v
La Vmax disminuye
en presencia del
inhibidor 1/Vmaxap
acompetitivo
Sin
inhibidor
1/Vmax
La Km aumenta en
presencia del 1/[S]
inhibidor -1/Kmap -1/Km
acompetitivo
 Nomenclatura de los enzimas

a. Un código de clasificación de 4 cifras

1er término: Clase
2o término: Subclase
3er término: Sub-subclase
4o término: Número serial.

b. Un nombre sistemático consta de dos partes

La primera nombra al sustrato
La segunda indica el tipo de reacción que cataliza
terminada en asa

c. Un nombre recomendado

Ej. La enzima que cataliza la fosforilación de la glucosas

D-glucosa + ATP D-glucosa-6-fosfato+ ADP

Código: EC 2.7.1.2.

Clase 2:Es una reacción de transferencia.

Subclase 7: El grupo transferido es un fosfato
Sub-subclase: Un –OH es el aceptor
Número serial 2: Denota al enzima( El enzima que cataliza la
transferencia de un fosfato del ATP al –OH unido en posción
6 de la D-glucosa.

Nombre sistemático: ATP: D-glucosa fosfotransferasa.

Nombre recomendado: Hexoquinasa o Glucoquinasa.

 Clasificación de los enzimas

Clase 1: Oxido reductasa. Catalizan reacciones de oxido reducción

Ej. La alcohol :NAD oxidoreductasa cataliza la oxidación de un alcohol
a aldehido
H O

R C O H + NAD+ R C H + NADH+ H+

Clase 2: Transferasa. Catalizan en las cuales un grupo que contiene

C,N,P o S se transfieren de un sustrato a otro.

2.1 Transaminasa: Transfieren grupos aminos desde un aminoácido

a un cetoácido aceptor
Ej. Aminotrasferasa
Ac. L-glutámico + Ac. Pirúvico  Ac a-cetoglutárico + L-alanina.

2.2. Quinasas: Catalizan reacciones donde se transfiere un grupo

fosfato desde el ATP o nucleósido trifosfato agrupos aceptores
alcohol o amino
Ej. Glucoquinasa
ATP + D-Glucosa  ADP + D-Glucosa-6-Fosfato

2.3 Glucosiltransferasas: Catalizan reacciones de transferencia de

grupos glucosilos activado a un glucógeno iniciador.

UDP-Glucosa + Glucógeno iniciador  Glucógeno prolongado + UDP

 

 
 Clasificación de los enzimas

Clase 3: Hidrolasas. Catalizan reacciones donde el grupo dador se

transfiere al agua, la reacción implica rotura hidrolítica de enlaces
C-O, C-N, O-P, C-S
Ej. Rotura del enlace peptídico(Peptidasa)
O O

R1 C NH R2 + H2O R1 C OH + N R2
H
2

Clase 4: Liasas. Catalizan reacciones de ruptura de dobles enlaces

o formación de dobles enlaces eliminando grupos
4.1 Descarboxilasas: Eliminan los elementos del CO 2 de un  y -
cetoácidos
Ej. Piruvato descarboxilasa
O O O

CH3 C C 0- + H+ CH3 C H + CO2

Piruvato Acetaldehido

4.2 Deshidratasas: Eliminan los elementos de agua en una reacción

de deshidratación.
Ej Citrato deshidratasa.
Citrato  cis-Acanitato + H2O
 Clasificación de los enzimas
Clase 5: Isomerasas. Catalizan arreglos moleculares.

5.1 Epimerasas o racemasas. Catalizan inversión en carbonos

asimétricos
CH2OH CH2OH

C=O C=O

H-C-OH H-C-OH
Epimerasa
H-C-OH HO-C-H

CH2OP CH2OP

D-Ribulosa 5 Fosfato D-Xilulosa 5 Fosfato

5.2 Mutasas: Catalizan la transferencia intramolecular de un

grupo tal como el fosforilo
Ej. Fosfoglicerato mutasa.
2-Fosfoglicerato  3-fosfoglicerato

Clase 6. Ligasas. Catalizan reacciones de formación de enlaces

entre dos moléculas de sustrato a expensas de la hidrólisis de un
enlace fosfato de alta energía
Ej. Piruvato carboxilasa
 
HCO3- + Piruvato + ATP  Oxalacetato + ADP + Pi
Mecanismo de regulación de la actividad enzimática.

1. Cambios en la concentarción del enzima

Enzima
(proteína)

Velocidad Velocidad
de de síntesis
degradaci Aminoácidos
ón
libres

2. Compartimentación
Mecanismo de regulación de la actividad enzimática.
3. Afectado la eficacia catalítica del enzima:
a. Regulación alostérica

Separación subunidades
b. Modificación covalente reversible
Fosforilación/defosforilación