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Al Carbono α se unen:
•Un grupo amino (NH2)
•Un grupo carboxilo (COOH)
•Un hidrógeno (H+)
•Una cadena lateral o grupo R
α
Los α-aminoácidos son los monómeros
que conforman las proteínas
Alifáticos
Polares con
Carga Aromáticos
Negativa
De acuerdo
a sus
Grupos “R”
Polares con
Polares sin
Carga
Carga
Positiva
CLASIFICACIÓN DE LOS
AMINOÁCIDOS
1. AMINOÁCIDOS ALIFÁTICOS O HIDRÓFOBOS
- Se localizan en el
interior de la molécula
- No interactúan con
agua
- Rara vez participan en
la mediación de
reacciones químicas.
CLASIFICACIÓN DE LOS
AMINOÁCIDOS
2. Aromáticos
La Tirosina contiene un
grupo OH, es un
aminoácido hidroxilado.
CLASIFICACIÓN DE LOS
AMINOÁCIDOS
3. POLARES SIN CARGA
La Serina y la Treonina son
aminoácidos hidroxilados
La Asparagina y la Glutamina
son las amidas del Aspartato y el
Glutamato.
La Cisteína contiene azufre.
CLASIFICACIÓN DE LOS
AMINOÁCIDOS
4. POLARES CON CARGA POSITIVA O BASICO
Acido glutámico en la
conjugación glutamato
Acido aspártico en la
conjugación aspartato
AMINOÁCIDOS MODIFICADOS
Cumplen funciones especiales o son
intermediarios importantes.
Algunos aminoácidos se modifican
químicamente una vez que se han
ensamblado en las proteínas.
•4-Hidroxiprolina e 5-Hidroxilisina:
forman parte del colágeno.
•γ-carboxiglutamato: se encuentra en
varias proteínas de la cascada de
coagulación.
El número de estereoisómeros de un
compuesto quiral dependerá del número
de centros quirales, según la fórmula→ 2n
n= número de centros quirales
La Proyección de Fischer NO
hace referencia a la rotación de
la luz polarizada.
Escala de pH
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
Punto Isoeléctrico
H+ + H+
H H+ H+ H+ H+ H+
H+ H+H+ H+ H+
H+ H+ H+
H+
H+ + +
H H H+ H+
H+ H+ H+ H+
H+ H+
H+ H+
H+
H+ H+
H + H+ H+ H+
H+
H+ H+ H+
H+ H+ H+
H+ H+ H+
H + H+ H+
H+
H+
H+ H+ H+ H+ H+
H+ H+ H+ H+ H+
H+ H+
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
AMINOÁCIDOS
Zwitterion
El punto isoeléctrico (pI) de un aminoácido es el pH al cual el aa tiene carga neta 0.
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
Zwitterion
El punto isoeléctrico (pI) de un aminoácido es el pH al cual el aa tiene carga neta 0.
Se coloca una molécula de Glicina cuyo pI es 5,97 en un medio acuoso a pH 7. ¿La molécula migrará
hacia el ánodo (electrodo positivo) o al cátodo (electrodo negativo)?
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
Curvas de Titulación de un Aminoácido
Monoamino y Monocarboxilo
pKa= pH en el cual existe igual
concentración de la especie dadora
de electrones como de la especie
aceptora de electrones. En este caso
igual concentración de la forma
protonada y desprotonada.
Un AA monoamino-monocarboxilo
posee 2 regiones con capacidad
amortiguadora.
Curvas de Titulación de un Aminoácido
Monoamino y Dicarboxilo
pKa= pH en el cual existe igual
concentración de la especie dadora
de electrones como de la especie
aceptora de electrones. En este caso
igual concentración de la forma
protonada y desprotonada.
Un AA monoamino-dicarboxilo
posee 3 regiones con capacidad
amortiguadora.
Curvas de Titulación de un Aminoácido
Diamino y Monocarboxilo
pKa= pH en el cual existe igual
concentración de la especie dadora
de electrones como de la especie
aceptora de electrones. En este caso
igual concentración de la forma
protonada y desprotonada.
Un AA diamino-monocarboxilo
posee 3 regiones con capacidad
amortiguadora.
Zwitterion
2,34 + 9,60
pI= = 5,97
2
Cálculo del pI de un aminoácido
En cualquier aminoácido el “punto isoeléctrico” se calcula con los pKa
vecinos al “zwitterion” (carga eléctrica = cero) y es el resultado de la
semisuma de estos.
Por ejemplo:
pKa vecinos al Zwitterion
2,19 + 4,25
pI= = 3,22
2
PÉPTIDOS
PÉPTIDOS
Enlace Peptídico
Enlace Peptídico
• Es un enlace amida
• Predomina la configuración
trans
Organización jerárquica
CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS
CLASIFICACIÓN
Clasificación de las Proteínas
• Según su Composición química:
• Simples → Albúmina
• Conjugadas
• Nucleoproteínas → Ribosomas
• Lipoproteínas → HDL
• Hemoproteínas → Hemoglobina
• Glicoproteínas → Inmunoglobulinas
• Metaloproteínas → Ceruloplasmina
• Fosfoproteínas → Caseina
CLASIFICACIÓN
Clasificación de las Proteínas
• Según su Forma:
• Fibrosas → Colágeno
• Oligoméricas→ Hemoglobina
CLASIFICACIÓN
Clasificación de las Proteínas
• Según su Función:
• Estructural→ Queratina, Elastina
• Enzimática→ DNA polimerasa III
• Defensa→ Inmunoglobulinas
• Hormonal→ Insulina
• Transporte→ Transferrina
• Reserva→ Ferritina
ESTRUCTURA PRIMARIA
ESTRUCTURA PRIMARIA
Estructura Primaria
“Sucesión de residuos de aminoácidos en la
cadena polipeptídica, que a su vez esta
determinada por la secuencia de bases en el gen”
α- Hélice
Hélice Dextrógira
Grupos R externos
ESTRUCTURA SECUNDARIA
α- Hélice
La estructura es estabilizada por:
•Puentes de hidrógeno
intracatenarios cada 4 residuos
Conformación β (Lámina β)
Cadenas Extendidas en zig-zag, Grupos R adyacentes sobresalen
formando pliegues en direcciones opuestas (180°)
Giros β
Conectan tramos sucesivos de Integrados por 4 residuos que
hélices α o conformaciones β forman un giro de 180°
Estructura Terciaria
Dominios
Parte de una cadena polipeptídica que es estable de manera independiente y que
puede moverse como una entidad única con respecto al resto de la proteína.
Reglas de Plegado
En medio acuoso, los aminoácidos
hidrofóbicos se disponen en el interior y
los hidrofílicos en el exterior
Reglas de Plegado
Varios tipos de estructura secundaria
(hélices α y conformaciones β) y estructuras
al azar unidos por varios giros.
Reglas de Plegado
Hélices α y Láminas β separadas en capas
estructurales diferentes
Por tanto para que ΔG sea negativo la entalpia debe disminuir (ΔH –) y/o la entropía
aumentar ΔS+
Interacciones carga-carga
ΔH –
Enlaces de hidrógeno Estructura Estable
Interacciones de van der Waals
ΔS+
Efecto Hidrofóbico
pH
Temperatura
Moléculas orgánicas
─ Alcohol, acetona
─ Urea
─ Cloruro de Guanidino
─ Dtergentes
─ Agentes reductores (mercaptoetanol)
Los enlaces peptidicos y puentes disulfuro
no suelen ser afectados (a menos que se use
un agente reductor en el caso de los
puentes disulfuro)
ESTRUCTURA TERCIARIA
Rutas de Plegado
1. Proceso Jerarquizado
2. Colapso Espontáneo
Chaperonas Moleculares
Proteínas que interaccionan con polipéptidos parcial o incorrectamente plegados, facilitando
rutas de plegado correctas o aportando microentornos donde pueda ocurrir el plegado
Protegen a las proteínas desnaturalizadas por el calor y los péptidos que se están sintetizando
ESTRUCTURA TERCIARIA
Chaperonas Moleculares
• Chaperoninas GroEL/GroEs
Estructura Cuaternaria
Queratinas
α- queratinas
AA Estructura Estructura Funciones
Principales Secundaria Suprasecundaria
Pequeños sin α-hélice •Protofilameneto Estructura de piel,
carga •Protofibrilla pelo, lana, uñas,
Cisteina •Filamneto Intermedio plumas, pinzas, etc
β- queratinas
AA Estructura Estructura Funciones
Principales Secundaria Suprasecundaria
Muy pequeños Conformación Lámina plegada Estructura de seda
sin carga β antiparalela e hilos de araña
No hay
Cisteina
PROTEÍNAS DE IMPORTANCIA FISIOLÓGICA
Colágeno
Glicina = 35% Alanina = 11% Gly – X – Y
Prolina e Hidroxiprolina (Hyp) = 21%
Elastina
La unidad básica se llama tropoelastina, rica en glicina y alanina.
La tropoelastina consiste en segmentos de hélices (no α) ricos en glicina separado por cortas regiones de
lisina y alanina.
Una fibra elástica esta formada por un centro de elastina rodeado de microfibrillas, formadas
fundamentalmente por fibrilina.
Proteínas Plasmáticas
γ 11 A, D, E, G, M Anticuerpos
PROTEÍNAS DE IMPORTANCIA FISIOLÓGICA
Otras Proteínas
Mioglobina → Hemoproteína fijadora de oxígeno en los músculos
Lisozima → Enzima presente en la clara de huevo y las lagrimas capaz de hidrolizar polisacáridos
de las paredes bacterianas
Ribonucleasa → enzima digestiva secretada por el páncreas que hidroliza ácidos nucleicos
MÉTODOS DE ESTUDIO DE LAS PROTEÍNAS
MÉTODOS DE ESTUDIO DE LAS PROTEÍNAS
Centrifugación
Separa las proteínas por masa o densidad utilizando
la fuera centrífuga.
Se forma un sedimento y un sobrenadante.
Uso de detergentes
Permite solubilizar las proteínas
Salting Out
Precipita las proteínas utilizando altas
concentraciones de sales.
Diálisis
Separa las proteínas de otras moléculas como sales
utilizando una membrana semipermeable.
MÉTODOS DE ESTUDIO DE LAS PROTEÍNAS
Electroforesis
Separa las proteínas por masa y carga.
La velocidad de desplazamiento aumentará a mayor
carga y menor masa.
Se realizan en papel o en gel (poliacrilamida,
agarosa)
Se sumerge el soporte en un Buffer y se corre la
corriente electrica.
Se tiñen las fracciones
Se cuantifica por densitometría o elución.
Cromatografía
Utiliza una fase sólida (fase estacionaria o lecho), con la cual
interactuan las proteínas.
Entre más interactuen con el lecho más tardarán en moverse.
Cromatografía de afinidad
Separa proteínas por su unión selectiva
Utiliza lechos especiales como sustratos, enzimas, etc.