Definicin: conjunto de reacciones qumicas que se dan
en todas las clulas vivas, reacciones que pueden ser de sntesis (anablicas) o de degradacin (catabolismo). El conjunto de reacciones bioqumicas, tanto de sntesis (anabolismo), como de destruccin (catabolismo) de nutrientes la realizan todos los seres vivos; dichas reacciones son de oxido reduccin; en donde la oxidacin significa perdida de e- (donadora) y reaccin de reduccin significa ganancia de e- o captura de e- (receptora). El anabolismo se caracteriza por reacciones de asimilacin o de sntesis y el catabolismo que se identifica por reacciones degradativas, desarticulacin o desasimilacin. Respiracin: desde el punto de vista biolgico, es el conjunto de reacciones qumicas dentro de una clula. La respiracin celular podra dividirse en dos tipos; segn el papel atribuido al oxigeno. Respiracin Aerbica: hace uso de O2 como aceptor ultimo de electrones desprendidos de las sustancias orgnicas.
Respiracin anaerbicas: no interviene el oxigeno sino que se emplean otros aceptores finales de electrones, muy variado, generalmente minerales y a menudo, subproductos del metabolismo de otros organismos. La respiracin aerbicas y anaerbicas, tambin se denominan: Respiracin metablica. Recordemos que la reacciones anablicas son endoergonicas y las catablicas son exoergonicas y todas necesitan de un intermediador denominado Enzimas. Enzimas: son protenas de alto peso molecular, se utilizan en pequeas cantidades, se reutilizan y son especificas Las enzimas bacterianas, todas se produce al interior de la clula; y de acuerdo a su funcin e ubicacin se dividen en:
Exoenzimas; que se producen en el interior de las clulas, pero actan externamente, tienen funciones catalticas.
Ectoenzimas; estn sobre la pared celular, estas promueven la produccin y el mantenimiento de la estructura de la superficie e igualmente acta como mediadores entre el medio interior y exterior.
Endoenzimas: actan al interior de la clula y tiene funciones anablicas o de sintesis Existen algunas enzimas llamadas incompletas que no pueden mediar una reaccin sin la ayuda de alguien y se le denomina APOENZIMA o enzima incompleta y el factor que ayuda se llama COENZIMA: la unin de los dos elementos se llama HOLOENZIMA o enzima completa
Muchas vitaminas actan como coenzimas, especialmente las de complejo B, al igual que el elemento Fe++. Los olores, sabores y colores, se deben a la accin y presencia de las enzimas Definicin de fermentacin: Es un proceso catablico de oxidacin incompleta, totalmente anaerbico, siendo el compuesto final un compuesto orgnico (la oxidacin completa se forma finalmente O2 y HO2) y es un mecanismo para captar energa, con la degradacin de compuestos carbonados; y existe un fenmeno importante conocido como Gliclisis o el de Embder Meyerhoft; este proceso existe una gran participacin Enzimtica. Destaquemos del ciclo de la glicolisis y en este aspecto que el acido piruvico o piruvato, se considera el compuesto estrella, todos los seres vivos nos parecemos en este aspecto A partir del piruvato, se generan, por mediacin enzimtica una serie de vas fermentativas una serie de compuestos finales, y caracterstica de un determinado tipo de bacterias. Fermentacin Actica: es la fermentacin bacteriana por acetobacter, un genero de bacteria aerbicas, que transforma un alcohol en acido actico. La fermentacin actica del vino proporciona el vinagre Fermentacin Alcohlica: es un proceso anaerbico realizado por las levaduras bsicamente, pero tambin lo pueden realizar algunas bacterias. De la fermentacin alcohlica se obtienen muchos productos como: vino, cerveza, alcohol. Fermentacin lctica: o homo lctica: se llama al proceso celular donde se utilizan glucosas para obtener energa y donde el producto de desecho es el acido lctico, bacterias: Lacrobacillus casei y Estreptococo cremoris y pediococos Fermentacin Heterolctica: se denomina as por que su producto final no es exclusivamente acido lctico, sino: Acido Lctico + etanol + CO2 + ATP. Este proceso lo llevan acabo bacterias del grupo lctico y pertenecientes a los gneros Leuconostoc y Lactobacillus. Industrialmente el proceso es relevante en la produccin de alimentos fermentados. Otra bacteria de este tipo de fermentacin es Lactobacilos acidofhilus que facilita el metabolismo de la leche. Fermentacin del Acido propinico: las bacterias que presentan este tipo de fermentacin pueden utilizar tanto azucares y lactato, como punto de partida para el proceso. La ruta es un proceso complejo en el que genera acetato, CO2 y acido propinico como productos finales Esta ruta fermentativa la presentan las bacterias del tipo Propionibacterium y otras anaerobias estrictas presentes en el rumen de los herbvoros, donde llevan a cavo una fermentacin segundaria de los productos de las fermentaciones lcticas primarias. Industrialmente propionibacterium es importante en la fermentacin del queso para producir el tipo suizo: la fermentacin Propionica utiliza en este caso lactato producido en las fermentaciones lcticas primarias produciendo CO2 responsable de los ojos del queso suizo y acumulacin de los cidos orgnicos de cadena corta responsable de las caractersticas organolepticas, y adems es de gran rendimiento energtico. Fermentacin cido mixta: la fermentacin acido mixta produce acido actico, etanol, H2, CO2 y proporciones diferentes de acido lactico o propionico. Es un tipo de fermentacin que lleva a cabo las entero bacterias, es muy gasgena. Fermentacin Butanodilica: es una variante de la anterior presente en algnas enterobacterias como Klebsiella, Serratia y Erwinia, especies en las que se da una fermentacin cida mixta butanodilica Fermentacin de Butanol: es un tipo de fermentacin llevado a cabo por bacterias anaerobias estrictas del genero Clostridium. En el curso de esta transformacin se producen compuestos orgnicos disolventes de gran importancia industrial y que, histricamente, han sido los primeros productos industriales bacterianos de importancia econmica relevante durante la 1 guerra mundial Fermentacin Butrica: el producto final es el acido butrico, le confiere a los alimentos un olor rancio, ejemplo algunos Clostridium.
El proceso de Fermentacin es poco energtica, se producen durante la glicolisis se producen solo 4ATP, pero se gastan 2 ATP. Ciclo aerbico: Llamado ciclo de Krebs o del acido ctrico o tricarboxilico: Se define como una sucesin de reacciones qumicas que ocurren dentro de una clula mediante las cuales se realiza la descomposicin final de las molculas de los alimentos y en la que se producen dixido de carbono , agua y energa, El descubrimiento del ciclo es obra de Haus Adolf Krebs, bioqumico britnico. Esta es una va eficaz para convertir dentro de una clula los componentes de los alimentos en energa utilizable. Piruvato + acetilcoenzima A Citrato ISO citrato Succinato Malato Fumarato Oxaloacetato Citrato Dentro de una de estas reacciones qumicas puede participar ms de una enzima dependiendo de la complejidad de la molcula a ser catalizada. Recordemos que el ciclo de Krebs es aerbico y altamente energtico Catabolismo de las protenas: Se le llama tambin Protelisis, miremos como ocurre:
Protena pptidos aminocidos
proteasa peptidasa aminasas Los aminocidos (a. a) se pueden descomponer por tres mecanismo 1. Desaminacion enzima desaminasa 2. Descarboxilacion enzima descarboxilosa 3. Degradacin avanzada; ejemplo de esta ltima. Triptfano indol + acido piruvico NH3 Cistena A. piruvico + NH3 + H2S Existen algunas bacterias que tienen gran actividad proteoltica o de protelisis: Ej: Clostridium perfringen, el Proteus vulgaris y Pseudomona aeroginosa = estas bacterias en consecuencia ocasionan olores desagradables producto de la descomposicin de sustratos o productos con alto contenido proteico = a esto se le denomina Putrefaccin, caracterizado por olor, color sabor y curiosamente los Bacterilogos los utiliza como medio de diagnostico. Fermentacin: Es la descomposicin por accin microbiana de sustancia con alto contenido hidratos de carbono la palabra Fermentacin: significa Ferver o Hervir.
Los cidos nucledos: tambin sondesdoblados o catabolisados por accin enzimtica y ellas se abrevian como RNAy DNA ASA, actan respectivamente sobre el DNA y el RNA. Los lpidos se degradan por la accin de enzimas lipoliticas evento que se conoce como: Lipolisis;
Lpidos Glicerina + cidos grasos lipasa Finalmente podemos decir que las bacterias a travs del fenmeno del catabolismo de sustratos complejos (protenas carbohidratos y lpidos) obtienen un gran numero de piezas que posteriormente las utiliza para ensamblar productos complejos, llamado de sntesis o anabolismo. Anabolismo: A diferencia del catabolismo, es una proceso inverso; se inicia con organizar los productos obtenidos del catabolismo, para producir productos benficos y no benficos. Entre los primeros: tenemos Colesterol. Vitaminas protenas de sostn para estructuras bacterianas y protenas de funcionamiento como enzimas y hormonas;, pigmentos, y algunos polisacridos como la Dextrina. Algunas bacterias producen pigmentos o sustancias cromgena o color (verde, rojo, dorado, negro, entre otros), esta caractersticas presentes en algunas de ellas, permite orientacin para su identificacin. Antibitico: Metabolito de carcter Anablico que elaboran algunas bacterias y especialmente los hongos, capaz de paralizar o destruir a otro microorganismo, otros autores definen a esta sustancia como Anti-vida; su uso indiscriminado y sin control a ocasionado mucha resistencia. Dextrina: Carbohidrato producto de sntesis que se emplea o se aprovecha en la elaboracin de la cerveza y como sustituto de la goma arabica, tambin se utiliza comercialmente como adhesivos. Entre los productos de sntesis malficos o perjudcales que producen las bacterias, tenemos las toxinas, capaces de comprometer la vida de los seres; las bacterias pueden originar compuestos txicos de gran letalidad su accin nociva, varan desde un efecto espasmoltico, parlisis flcida, fragilidad capilar, hemorragia y dao nervioso entre otros. Las toxinas se dividen en exotoxinas, se producen al interior de la clula pero son excretadas al medio exterior y endotoxina se elaboran en el medio interno de las bacterias y solo salen al medio exterior cuando la bacteria se muere o su ruptura por cualquier mecanismo. Existen claras diferencias entre los dos tipos de toxinas, veamos. EXOTOXINAS ENDOTOXINAS Generalmente producidas por bacterias Gram positivas Generalmente producidas por bacterias Gram negativa Quimicamente protenas Qumicamente son lipopolisacaridos Producen sntomas clsicos Producen sntomas no clsicos Buenos antgenos Malos antgenos Se ubican en el exterior de la clula Se ubican en el interior de la clula Podemos decir que los organismos estn en un constante reciclaje y siempre con la mediacin de las enzimas y el reciclaje ordenado favorece el proceso de sntesis
Sustrato: se define como aquel compuesto nutricional artificial o no, solido o liquido que utilizan los microorganismos para su desarrollo Albinismo : Se refiere a la ausencia del pigmento melanina en iris, piel y cabello. En seres humanos generalmente se hereda como un caracter autosomal recesivo Ej.genotipo aa = albinismo; AA y Aa = no albino. Por lo tanto se espera que si ambos padres son albinos toda su descendencia son albinos
Anticodon : Es el triplete de nucletidos del tRNA que tiene una secuencia complementaria al codn del mRNA. La interaccin anticodn con codn es antiparelela y fundamental en el proceso de traduccin que ocurre asociado a los ribosomas.
Anticuerpo : Molcula de protena (inmunoglobulina) producida por linfocitos T que reconoce un antgeno especfico y desencadena la respuesta inmune.
Anticuerpo Monoclonal: Molcula que siempre reconoce un solo eptope en la protena que acta de antgeno.
Anticuerpo Policlonal : Molcula que reconoce a diferentes eptopes en la protena que acta de antgeno.
Antigeno : Molcula que desencadena la formacin de anticuerpos.
Autogamia : Proceso de autofecundacin que conduce a la homocigosis.
Autognico: Derivado del mismo individuo.
Bacteriofago (Fago): Virus que infectan bacterias
Biotecnologa : Procesos comerciales y/o industriales que utilizan organismos biolgicos sus productos
Clula F- : Clula bacterial que no posee el factor F de fertilidad . Acta como clula receptora del factor F en cruzamientos F+ x F-; tambin acta como receptora en la conjugacin entre Hfr x F- . Clula F+ : Clula bacterial que posee el factor F de fertilidad libre. Acta como donador del factor F en la conjugacin; todas las exconjugantes sern F+. Clula Hfr : Clula bacterial que posee el factor F de fertilidad incorporado alm DNA cromosomal. Acta como donador del DNA cromosomal; el factor F es traspasado al final de la conjugacin. Para tiempos cortos de conjugacin las exconjugantes sern F- y Hfr.
Cepas Puras : Se refiere a individuos homocigotos. Clon : Conjunto de individuos genticamente idnticos derivados de una clula madre
Codon : Secuencia de 3 nucletidos (Triplete) en la hebra codificadora del DNA en el mRNA que representa a un aminocido especfico en el cdigo gentico y se traduce en su aminocido correspondiente en el proceso de traduccin. Tambin existen codones que no significan aminocidos y funcionan como seales de trmino de la traduccinal mediante mtodos asexuales parasexuales. Ej. Colonias de bacterias. Conjugacin: Mecanismo de recombinacin gentica en bacterias que involucra una fusin transitoria entre una clula Hfr y una F- y la transferencia unidireccional de material gentico Dalton : Unidad de masa molecular. Un dalton = 1.67 x 10-24 gr y corresponde al peso atmico del tomo de hidrgeno DNA Recombinante: Molcula hbrida de DNA formada por la unin covalente de secuencias de DNA de diferentes orgenes que se inserta en un organismo husped Episoma : Elemento gentico extracromosomal circular que se replica de manera independiente al cromosoma bacteriano, que tambin se puede integrar al genoma de la bacteria y replicarse como parte de l. Exon (extron) : Secuencia de DNA que se transcribe y es parte de la molcula funcional
Factor F : Episoma en clulas bacteriales que confiere la caracterstica de actuar como donador en el proceso de conjugacin. Cuando no est integrado al DNA cromosomal (clula F+) transfiere una copia de s mismo a una bacteria que no lo posee (F-). Cuando est integrado al DNA crmosomal (Hfr) es capaz de movilizar el cromosoma bacteriano a una clula F-. En este caso el factor F se transfiere al final
Fenotipo : Propiedades observables del genotipo y en el cual contribuye el medio ambiente Fenotipo : Propiedades observables del genotipo y en el cual contribuye el medio ambiente Gen Letal : Gen que produce la muerte del individuo
Gentica : Disciplina cientfica que estudia el significado, propiedades y funcin del material gentico Genoma : Contenido total de material gentico de una celula u organismo. Incluye la material gentico nuclear y citoplasmtico. Por ejemplo, el tamao del genoma haploide de una clula de cebada es 5.3 x 109 pares de bases y el tamao del genoma humano es 3.5 x 109 pares de bases. Genotipo : Constitucin gentica de un organismo. Generalmente no es observable a nivel del organismo vivo. Excepciones: por ejemplo,en fenotipos recesivos que dependen de un par de genes, como en el caso del albinismo se puede inferir un genotipo homocigoto recesivo aa.
Haploide : Nmero de cromosomas presentes en los gametos. Se simboliza como n para individuos 2n y por ejemplo para la cebada n=7. Para individuos 4n su nmero haploide es 2n. Hbrido : Genotipo producido por el cruzamiento entre un homocigoto dominante con un homocigoto recesivo. Ejemplo: Pp es hbrido, producido por PP x pp. .
In Vitro : Significa que ocurre fuera del organismo vivo, en un ambiente artificial. Literalmente en vidrio
In Vivo : Significa que ocurre en el organismo vivo.
Ingeniera Gentica : Conocida tambin como Tecnologa del DNA Recombinante y como Clonamiento de Genes
Kilobase (Kb) : Unidad de longitud de cidos nucleicos correspondiente a 1000 nucleotidos. Se abrevia como kb para cidos nucleicos de hebra simple y kbp (kilo par de bases) para cidos nucleicos de doble hebra Mutacin : Cambio en el material gentico
Mutacin Condicional : Organismo mutante que es normal bajo un conjunto de condiciones pero el fenotipo cambia bajo otras condiciones. Ejemplo: mutantes sensibles a la temperatura.
Mutacin Constitutiva : Mutacin que causa que un gen cuya expresin es regualada se exprese sin regulacin.
Mutacin Espontnea : Mutacin no inducida por agente mutagnico
Mutacin Inducida : Mutacin que ocurre por efecto de agentes mutgenos qumicos fsicos Mutacin silenciosa : Mutacin que no se expresa fenotpicamente
Mutacin silenciosa : Mutacin que no se expresa fenotpicamente GENETICA BACTERIANA BREVE HISTORIA 1958: Charles Darwin; hablo sobre el origen de las especies 1866: Gregorio Mendel; leyes bsicas de la herencia 1869: Friedrich and Miescher; descubrieron los cidos nucleicos 1900: Gregorio Mendel Leyes de la herencia 1950: Watson James y Francis Crack; doble hlice del DNA 1961: Ckrick; :Tres bases que se necesitan para codificar un aminocido La Tendencia de los individuos de asemejarse a sus progenitores se llama Herencia. Lo semejante engendra semejante Gentica: Rama de la biologa que se ocupa de los fenmenos de la herencia, que estudia la leyes que rigen la herencia; y estudia igualmente la semejanza y diferencia entre individuos Se afirma que la molcula del DNA, es de suma importancia, debido a que ella rige el comportamiento, de todos los seres vivos, posee los planos de la vida A partir de esta base e inquietudes, naci una nueva ciencia llamada: Ingeniera Gentica, que est permitiendo el estudio de los genes y como ciencia su creacin, no va ms all de los 50 aos; Es una disciplina realmente nueva, a permitido el descubrimiento u origen de muchas enfermedades, pero tambin a permitido el desarrollo de la Biotecnologa y la Bioindustria y hoy se habla de la Ingenioterapia, permitiendo en un futuro mejorar o prevenir enfermedades degenerativas como: Parkinson, Sndrome de Down , Alzheimer y Hemofilia, entre otras . El desarrollo de la ingenieraza gentica empez a ser a ser importante desde que salio fuera de los muros de laboratorio y procedi y a impactar a la sociedad directamente; sin embargo est tecnologa tambin puede convertirse en una amenaza potencial que podra poner en peligro la seguridad del hombre. El siglo XX, se vio marcado por 4 acontecimientos tales como: La ingeniera atmica - el escape del hombre de la gravedad - la informtica y la ingeniera gentica.
Las bacterias por su alta capacidad de multiplicacin y en tan corto tiempo (Capacidad bitica), ha permitido el desarrollo de la ingeniera a gran escala. RECOM BINACION GENETICA BACTERIANA Lo anterior significa intercambio de material gentico entre dos bacterias generalmente relacionadas, originando en consecuencia una mutacin, de carcter heredable. Una bacteria mesofila corriente, en 24 horas forma una colonia compuesta por ms de 20 millones de seres y la frecuencia de reconbinacin es baja va de 1 a 100.000 o de 1 a 1000.000, durante la divisin celular. Que puede ocurrir cuando una bacteria a mutado: Puede cambiar su sensibilidad o resistencia al antibitico Puede ocasionar cambios en la forma de las colonias Cambio en la produccin o no de pigmentos Resistencia o no la accin de los bacterifagos Adaptabilidad o no a un animal de laboratorio Que alternativas y recombinantes presenta la bacteria Tenemos tres: Transformacin Conjugacin y transduccin
En los organismos Eucaroticos, existen 2 gametos uno masculino y otro femenino y la unin de los dos, origina el Cigoto.
Lo anterior no ocurre entre las bacterias, en donde la reproduccin es netamente asexual; sin embargo entre ellas existe la capacidad de donar parte de su material cromosmico sin compromiso entre ellos, y a esto se le denomina Cigote Parcial Los 3 mecanismos recombinante de las bacterias en que en estos fenmenos siempre hay una bacteria donadora y otra receptora; y siempre originaran una mutante; pero el evento de donar y recibir varia entre las 3 alternativas recombinantes, la cual describiremos a medida que detallemos cada uno de ellos Transformacin El evento de transformacin se caracteriza por lo siguiente: Una clula receptora es capaz de captar DNA, libre proveniente de una clula donadora, para que esto ocurra, la clula receptora debe tener receptores especficos de membrana que sirvan de acomodamiento de lo que va a recibir o captar y clula que cumpla con este requisito, se le llama de alta competencia; el DNA liberado durante el proceso se le denomina factor de Avery, en honor a su descubridor. Conjugacin: Este fenmeno recombinante siempre se lleva a cabo con la intermediacin de un puente sexual, llamado tambin puente conjugante, o Pili sexual, el cual emite las clula que hace de donadora, la condicin anterior es heredable y siempre se le denomina F+; la bacteria que no sea F+; se le denomina F-, La clula que tiene la capacidad donadora se debe a que tiene un factor conjugante llamado factor F. Generalmente esta bacterias donadora o F+ o que posee el factor F; entregan a la clula receptora F-, un pedazo de material extra cromosmico que para ella, no es indispensable, para la vida de la bacteria, a este pedazo de Acido nucleico extra se de denomina plsmido o plasmidio o episoma. El plsmido solo identifica a la clula que lo recibe, ya que esta adquiere una caracterstica o propiedades provenientes de la clula donadora y que antes no tenan. Los plasmidos son un grupo, los cuales tienen diferentes denominaciones, veamos algunos. Plsmido Col: Este plsmido le confiere a la bacteria que lo recibe, la capacidad de producir una sustancia de carcter proteico llamada Colicina; esta tiene como funcin estabilizar la flora microbiana a nivel intestinal. Plasmido R: llamado tambin de resistencia; confiere a las bacterias que lo poseen la habilidad de ser resistentes a una o varias molculas entre ellas los antibiticos. Plasmido Penicilinasa: habilidad que posee una bacteria de ser resistentes a la penicilina Plasmido Degradativo: le confiere la bacteria que lo posee la capacidad de degradar mas de un sustrato; ejemplo: accin; proteolitica glucolitica y lipolitica. Evento recombnate caracterizado por la intermediacin de un virus llamado bacterifago o fago Los bacterifagos cuando parasitan a una clula pueden ocurrir en ellas dos cosas: la clula es lisada o destruida o que la clula conviva con el virus, a esta condicin se le denomina estado lisogenico del virus, templado o estado de profago Transduccion Esta convivencia pacifica virus clula bacteriana finalmente se rompe y el virus o fago termina matndola; y en su huida se lleva consigo un pedazo de acido nucleico de la clula, que luego al empezar nuevamente su ciclo parasitario en una nueva clula le introduce a esta el acido nucleico robado a la primera clula este pedazo de acido nucleico se expresa en la clula receptora dndole caractersticas que antes no tenia; estbamos frente a una mutante Los eventos reconbinantes ocurren con mas frecuencia en bacterias gram positiva que en bacterias gram negativas Igualmente los procesos recombinantes han permitido Conocer mejor la fisiologa bacteriana Ha favorecido en forma decisiva el estudio de la ingeniera gentica. Igualmente ha permitido el estudio de la presentacin de la resistencia bacteriana transferible R.B.T