Filogenia
Pablo I. Alvarez-Romero Ph.D
Filogenia
• Filogenia es el estudio de los linajes evolutivos de una especie o grupos de
especies.
• Antepasado común es un antepasado que comparten dos o más especies
dependientes.
• Árbol filogenético es un diagrama que representa las relaciones evolutivas entre
organismos.
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Filogenia
No todos los árboles filogenéticos se ven iguales. Algunos son de bloques, como el árbol a la izquierda
que se muestra abajo. Otros utilizan líneas diagonales, como el árbol a la derecha que se muestra abajo.
También puedes ver árboles que estén orientados verticalmente o volteados de lado, como se muestra
para el árbol de bloques. La orientación del árbol filogenético no cambia la información en el árbol.
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Árboles filogenéticos
Un árbol filogenético es un diagrama que representa las relaciones evolutivas entre organismos. Los
árboles filogenéticos son hipótesis, no hechos definitivos.
El patrón de ramificación en un árbol filogenético refleja cómo las especies u otros grupos evolucionaron a
partir de una serie de ancestros comunes.
En los árboles, dos especies están más relacionadas si tienen un ancestro común más reciente y menos
relacionadas si tienen un ancestro común menos reciente.
Los árboles filogenéticos pueden dibujarse en varios estilos equivalentes. Rotar un árbol alrededor de sus
puntos de ramificación no cambia la información que contiene.
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Anatomía de un árbol filogenético
Cuando dibujamos un árbol filogenético, estamos representando nuestra mejor hipótesis sobre cómo
evolucionó un conjunto de especies (u otros grupos) a partir de un ancestro común.
En un árbol filogenético, las especies o grupos de interés se encuentran en los extremos de las líneas a las que
consideramos las ramas del árbol. Por ejemplo, el árbol filogenético siguiente representa las relaciones entre cinco
especies A, B, C, D y E, las cuales se ubican en las puntas de las ramas.
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Anatomía de un árbol filogenético
El patrón en el que se conectan ramas representa nuestra comprensión de cómo evolucionaron las especies del árbol a
partir de una serie de ancestros comunes. Cada punto de ramificación (también llamado nodo interno) representa un
evento de divergencia o separación de un grupo en dos grupos descendientes.
En cada punto de ramificación se encuentra el ancestro común más reciente de todos los grupos que descienden de esa
ramificación. Por ejemplo, en el punto de ramificación que conduce a las especies A y B, encontraríamos al ancestro
común más reciente de esas dos especies. En el punto de ramificación que se encuentra justo por arriba de la raíz del
árbol, encontraríamos al ancestro común más reciente de todas las especies en el árbol (A, B, C, D, E).
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Anatomía de un árbol filogenético
En un árbol filogenético, la relación entre dos especies tiene un significado muy específico. Dos especies
están más relacionadas si tienen un ancestro común más reciente y menos relacionadas si tienen un ancestro
común menos reciente.
Podemos usar un método bastante directo para encontrar al ancestro común más reciente de cualquier par o grupo de
especies. En este método, empezamos en la rama en cuyos extremos se encuentran las dos especies de nuestro interés y
"retrocedemos" en el árbol hasta que encontramos el punto donde convergen las líneas de ambas especies.
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Práctica
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Práctica
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Resumen de los árboles filogenéticos
En un árbol filogenético, las especies de interés se muestran en las puntas de las ramas del árbol. Las ramas se conectan
entre sí de manera que representan la historia evolutiva de las especies, esto es, la manera en la que pensamos que
evolucionaron a partir de un ancestro común mediante una serie de eventos de divergencia (separación en dos ramas). En
cada punto de ramificación se encuentra el ancestro común más reciente que comparten todas las especies que
descienden a partir de ese punto de ramificación. Las líneas del árbol representan largas series de ancestros que se
extienden desde una especie hasta la siguiente
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La idea detrás de la construcción de árboles
¿Cómo construimos un árbol filogenético? El principio subyacente es la idea de Darwin de "descendencia con
modificación". Básicamente, al ver el patrón de modificaciones (rasgos nuevos) en los organismos actuales, podemos
determinar —o al menos, proponer hipótesis de— su linaje a partir de un ancestro común.
Como ejemplo, consideremos el árbol filogenético siguiente (que muestra la historia evolutiva de un grupo inventado de
especies parecidas a ratones). Vemos que surgen tres rasgos nuevos en diferentes puntos durante la historia evolutiva
del grupo: una cola esponjada, orejas grandes y bigotes. Cada rasgo nuevo es compartido por todas las especies
descendientes del ancestro en el que apareció la característica (indicado por las marcas con forma de palomita), pero
está ausente de las especies que se separaron antes de que el carácter apareciera.
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¿Cómo construir un árbol filogenético?
Si fuésemos biólogos que construyen un árbol filogenético como parte de nuestra investigación, tendríamos que
elegir qué conjunto de organismos organizar en un árbol. También tendríamos que escoger las características de
esos organismos en las que basaríamos nuestro árbol (a partir de sus diversas características físicas,
conductuales y bioquímicas diferentes).
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¿Cómo construir un árbol filogenético?
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¿Cómo construir un árbol filogenético?
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Sistemas de clasificación modernos
Los sistemas de clasificación más modernos se basan en las relaciones evolutivas entre organismos, esto
es, en su Filogenia. Los sistemas de clasificación basados en la filogenia organizan las especies u otros
grupos de manera que reflejen nuestra comprensión de su proceso evolutivo a partir de sus ancestros
comunes.
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Filogenia Molecular
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Filogenia Molecular
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Filogenia Molecular
Homología: Estructuras (incluyendo los genes) son
homólogos si evolucionaron de alguna estructura en
un antecesor común.
HOMOLOGÍA= ORIGEN COMÚN
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Representación de un árbol
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Relaciones filogenéticas: Ortología y Paralogía
Berdauf SL, Trends Genet 2003, 19(6):345-351. Pablo I. Alvarez-Romero.
Relaciones filogenéticas: “Xenología” (HGT)
Brown JR, Nat Rev Genet. 2003, 4(2):121.32. Pablo I. Alvarez-Romero.
Relaciones filogenéticas: “Xenología” (HGT)
Brown JR, Nat Rev Genet. 2003, 4(2):121.32. Pablo I. Alvarez-Romero.
Relaciones filogenéticas: “Xenología” (HGT)
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Representaciones Filogenéticas
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Representaciones Filogenéticas
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¿Cómo se construye un árbol filogenético?
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Selección de secuencias
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Selección de secuencias
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Selección de secuencias
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Filogenia para el análisis de familias proteínas
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Árboles filogenómicos
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Elaboración y Curación de un alineamiento múltiple
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Elaboración y Curación de un alineamiento múltiple
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Elaboración y Curación de un alineamiento múltiple
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Aplicación de Métodos y Modelos Evolutivos
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Evaluación de los Árboles Filogenéticos
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Evaluación de los Árboles Filogenéticos
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Aplicaciones Filogenia y Árboles Filogenéticos
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Aplicaciones Filogenia y Árboles Filogenéticos
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Aplicaciones Filogenia y Árboles Filogenéticos
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