Filogenias
Carolina Ortiz Villa
Febrero 28 de 2016
Clasificación de la biodiversidad
• Humanos han reconocido por mucho tiempo que algunos organismos son más
similares entre si y han tratado de captar esos patrones de similaridad
nombrando y clasificando los seres vivos.
Organización jerárquica de Linneo
Clasificación de la biodiversidad
Después de la aceptación de la teoría de la evolución:
- Todas las especies están relacionadas a través de una historia de ancestría y
descendencia común.
- Similitudes entre tipos de organismos son debidas a la herencia de
características comunes a partir de ancestros comunes.
Desde entonces taxónomos y sistemáticos han desarrollado métodos de
clasificación que reflejen de mejor manera esa historia evolutiva
Clasificación de la biodiversidad
Dos descubrimientos que revolucionaron la sistemática y tuvieron enorme
influencia en la biogeografía histórica:
Willi Hennig
Nuevas estructuras y funciones casi nunca son creadas de novo. Son obtenidas
por modificación de estructuras y funciones ya existentes.
Método lógico para reconstruir la historia de un linaje y evaluar el grado relativo
de relación entre estos taxa.
* Objetivo: Reconstruir el patrón de ramificación que representa la
secuencia evolutiva de ancestría y descendecia (cladograma).
* Cada rama en este árbol representa un grupo monofilético (Todos los
taxa en la rama comparten ancestro en común y la rama incluye todos
los descendientes de un ancestro común).
*Linaje monofilético = clado.
¿Qué es una filogenia?
• Es una hipótesis propuesta para describir la historia de descendencia de un
grupo de organismos a partir de un ancestro común.
• Un árbol filogenético es una forma de representación de esta historia
Árboles filogenéticos
En un árbol cada “nodo” representa un evento de especiación.
Caracteres
Homólogos
• El proceso de decendencia con modificaciones implica que especies con un
ancestro común reciente van a ser similares.
• Van a compartir características que se conocen como caracteres ancestrales
que fueron heredados de su ancestro común.
Caracteres
Homólogos
Caracteres
Derivados
Caracter que difiere de su estado ancestral
Caracteres
Homoplasias
Caracteres similares pero no por ancestría común
Pueden provenir de convergencia evolutiva o de reversiones
evolutivas
Caracteres
Sinapomorfía
Caracteres
Simplesiomorfía
Clasificación refleja relaciones evolutivas
Contiene a todos los Contiene algunos pero Contiene miembros que
descendientes de un no todos los no tienen un ancestros
ancestro particular y descendientes de un común. Grupo
ningún otro ancestros común. discontinuo
Clasificación refleja relaciones evolutivas
Datos necesarios para construir filogenias
• Bibliografía, museos, herbarios son una gran fuente de información.
• Algunas características del desarrollo (notocorda por ejemplo), fósiles
• ADN y ARN secuencias y proteínas. ADNmt, ADNcp y ADN nuclear.
¿Cómo se construye una filogenia?
• El principio de parsimonia:
• Deberíamos preferir la hipótesis más simple capaz de explicar los
datos observados
• Minimizar el número de cambios evolutivos necesarios para todos
los caracteres y grupos en el árbol (menos homoplasias).
• Otros métodos: máxima verosimilitud, inferencia bayesiana
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
En el caso más simple tenemos caracteres con dos estados: presente (+)
/ausente (-)
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
Matriz 2: 0 = Estado Ancestral, 1 = Estado Derivado
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H
Char. 1
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H C F D H
Char. 1 Char. 2
0➙1 0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H C F D H C F H
Char. 1 Char. 2 Char. 4
0➙1 0➙1 0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H C F D H C F H
Char. 1 Char. 2 Char. 4
0➙1 0➙1 0➙1
F B C D H
Char. 5
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H C F D H C F H
Char. 1 Char. 2 Char. 4
0➙1 0➙1 0➙1
A B C D E F G H F B C D H
Char. 6 Char. 5
0➙1
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H C F D H C F H
Char. 1 Char. 2 Char. 4
0➙1 0➙1 0➙1
F B C D H
Char. 5
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H D C F H F B C D H
Char. 1 Char. 4 Char. 5
0➙1 Char. 2 0➙1
A B C D E F G H
Char. 6
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H D C F H F B C D H
Char. 1 Char. 4 Char. 5
0➙1 Char. 2 0➙1
A B C D E F G H
Char. 6
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H B D C F H
Char. 1 Char. 4
0➙1 Char. 2
Char. 5
A B C D E F G H
Char. 6
0➙1
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
A H B D C F H
Char. 1 Char. 4
0➙1 Char. 2
Char. 5
A B C D E F G H
Char. 6
0➙1
Matrix 2: 0 = Estado Ancestral
A H E G B D C F H
Char. 4
Char. 1
0➙1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
A B C D E F GH
Matriz 2: Una posible solución
A H E G B D C F H
Char. 4
Char. 1
0➙1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
A B C D E F GH
Matriz 2: Una posible solución
A H
A H
Char. 1
0➙1
E G B D C F
Char. 1
0➙1
Char. 4 0 ➙ 1
Char. 2 0 ➙ 1
Char. 5 0 ➙ 1
Char. 6 0 ➙ 1
Matriz 2: Una posible solución
A
1➙0 Char. 6
1 ➙ 0 Char. 5
1 ➙ 0 Char. 2
Tree Length = 9 steps 1 ➙ 0 Char. 4 H
EG B D C F
Char. 1
0➙1
Char. 4 0 ➙ 1
Char. 2 0 ➙ 1
Char. 5 0 ➙ 1
Char. 6 0 ➙ 1
Matriz 2: Otra posible solución
A H EG B D C F H
Char. 4
Char. 1
0➙1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
A B C D E F GH
Matriz 2: Una posible solución
A H E G B D C F H
Char. 4
Char. 1
0➙1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
A B C D E F GH
Matriz 2: Otra posible solución
AG E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
Matriz 2: Otra posible solución
AG E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
Tree Length = 6 steps Char. 6
Matriz 2: Y el caracter 3?
A G E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
Longitud árbol= 6 pasos Char. 6
Char. 3 ??
Arbol Preferido: Revisión de la terminología
A G E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
Char. 6
Char. 3
simplesiomorfia
Arbol Preferido: Revisión de la terminología
A G E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
sinapomorfia
Char. 6
Char. 3
simplesiomorfía
Arbol Preferido: Revisión de la terminología
AG E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
sinapormorfía
Caracter homoplástico, Char. 6
reconstruido con dos
cambios de estado de Char. 3
caracter
simplesiomorfía
Arbol Preferido: Revisión de la terminología
politomía
AG E B D C F H
Char. 1
Char. 4
Char. 1 Char. 2
Char. 5
synapomorphy
homoplastic character, Char. 6
reconstructed with 2
autapomorphic changes. Char. 3
symplesiomorphy
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos moleculares
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
¿Cómo se construye una filogenia?
Datos morfológicos
Limitaciones
• Muchas veces y en especial con el ADN los cambios suceden más de una
vez y es posible que tengan reversos evolutivos.
• Diferentes métodos se usan para lidiar con esto:
• Parsimonia
• Máxima verosimilitud
• Métodos bayesianos
Topologías
