GOBIERNO CONSTITUCIONAL DEL ESTADO LIBRE Y SOBERANO DE OAXACA INSTITUTO ESTATAL DE EDUCACIN PBLICA DE OAXACA COORDINACIN GENERAL DE PLANEACIN

EDUCATIVA COORDINACIN GENERAL DE EDUCACIN MEDIA SUPERIOR Y SUPERIOR PROGRAMA DE ESTUDIOS NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioinformtica CICLO Sexto semestre CLAVE DE ASIGNATURA IA-01 TOTAL DE HORAS 80

OBJETIVO(S) GENERAL(ES) DE LA ASIGNATURA. El alumno conocer los fundamentos de la bioinformtica se capacitara en su uso y en la aplicacin de proyectos de biotecnologa. TEMAS Y SUBTEMAS 1. INTRODUCCIN. 1.1 Definicin 1.2 Historia 1.3 Conceptos bsicos de biologa molecular 1.4 Principales reas de investigacin 1.5 Institutos y Organizaciones 2. FUNDAMENTOS DE BASES DE DATOS. 2.1 Algoritmos en el anlisis de comparacin de secuencias 2.2 Algoritmos en la prediccin de genes 2.3 Otros algoritmos 2.4 Principales herramientas software 3. BASES DE DATOS. 3.1 Bases de datos de primarias 3.2 Bases de datos secundarias 3.3 Bases de datos especializadas 3.3.1 Bases de datos de secuencias de ADN 3.3.2 Bases de datos de expresin gnica 3.3.3 Bases de datos de genomas 3.3.4 Bases de datos de mapas genmicos 3.3.5 Bases de datos de secuencias de ARN 3.3.6 Bases de datos de protenas y especficas de protenas 3.3.7 Bases de datos de protemica 3.3.8 Bases de datos de estructura de protenas 3.3.9 Bases de datos de mutantes 3.3.10 Bases de datos de plantas 4. COMPARACIN Y ANLISIS DE SECUENCIAS. 4.1 Comparacin y alineamientos mltiples 4.2 Caracterizacin bioinformtica de protenas 4.3 Prediccin de la estructura de protenas

5. FILOGENIA. 5.1 Cladstica y cladogramas 5.2 Filogenia molecular de protenas 5.3 Filogenia molecular de los organismos 5.4 ARN ribosomales en filogenia molecular 5.5 Marcadores molecular 6. EVOLUCIN MOLECULAR. 6.1 Proyectos de secuenciacin de genomas 6.2 Ejemplos ms representativos ACTIVIDADES DE APRENDIZAJE Auxilindose de equipos y materiales didcticos para exposiciones y asesoras, el Profesor-Investigador implementar estrategias para que los estudiantes realicen actividades orientadas a la solucin de problemas, estudios de casos, construccin de modelos y desarrollo de proyectos, en las cuales aplicar acciones para su evaluacin, retroalimentacin y reforzamiento del aprendizaje. CRITERIOS Y PROCEDIMIENTOS RECOMENDADOS PARA LA EVALUACIN Y ACREDITACIN DEL CURSO. Al inicio del curso el profesor indicar al alumno el procedimiento de evaluacin, que debe comprender tres exmenes parciales y uno final. El promedio de las calificaciones de los exmenes parciales se promediar con la calificacin del examen final y se obtendr la calificacin definitiva. Los exmenes sern por escrito. En la evaluacin se considerar el trabajo en grupo, individual e investigaciones realizadas; tambin se tomar en cuenta la participacin en clases y la calidad de ensayos, practicas y trabajos relacionados con la asignatura. Promedio de calificaciones de tres exmenes parciales Calificacin de examen final Calificacin definitiva 50% 50 % 100%

BIBLIOGRAFA (TIPO, TTULO, AUTOR, EDITORIAL, AO Y N DE EDICIN) Textos bsicos: Bioinformatics, a practical guide to the analysis of genes and proteins. Andreas. D. Baxevanis and B. F. a Francis Ouellette. 3 ed. WILEY-INTERSCIENCE. 2005. Essential Bioinformatics. Jin Xiong. Cambridge University Press. 2006. Fundamental concepts of Bioinformatics. Dan E. Krane and Michael L. Raymer. Benjamin Cummings. NY. 2002. 314 pp. Introduction to Bioinformatics. Arthur M. Lesk. Segunda ed. Oxford University Press. 2005. Fleischmann, R., Adams, M., White, O., Clayton, R., Kirkness, E., Kerlavage, A., Bult, C. (1995). Wholegenome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd. Science, Vol. 269, 496-512. Jean-Philippe Vielle-Calzada, Octavio Martnez de la Vega, Gustavo Hernndez-Guzmn, Enrique Ibarra-Laclette, Cesar Alvarez-Meja, Julio C. Vega-Arregun, Beatriz Jimnez-Moraila, Araceli FernndezCorts, Guillermo Corona-Armenta, Luis Herrera-Estrella, Alfredo Herrera-Estrella. (2009). The Palomero Genome Suggests Metal Effects on Domestication.. Science, Vol. 326. No. 5956. P. 1078. DOI: 10.1126/science.1178437. M. P. Skupski, M. Booker, A. Farmer, M. Harpold, W. Huang, J. Inman, D. Kiphart, C. Kodira, S. Root, F. Schilkey, J. Schwertfeger, A. Siepel, D. Stamper, N. Thayer, R. Thompson, J. Wortman, J. J. Zhuang and C. Harger. (1999). The Genome Sequence DataBase: towards an integrated functional genomics resource. Nucleic Acids Research, Oxford University Press, Vol. 27. No. 1. 35-

28 pp. Texto de consulta: Artculos cientficos de revistas reconocidas; PNAS, SCIENCE, CELL, etc. PERFIL PROFESIONAL DEL DOCENTE PERFIL PROFESIONAL DEL DOCENTE Profesionista preferentemente con estudios de maestra y/o doctorado con la especialidad en bioinformtica, experiencia en docencia a nivel licenciatura o postgrado y antecedentes en la generacin y aplicacin del conocimiento, tutoras a estudiantes y gestin acadmica.